Elza Sofia Silva Fonseca (061C-C624-BDAA)

Curriculum Vitae

Elza Sofia Silva Fonseca

ELZA SOFIA SILVA FONSECA (ESSF) holds a BSc in Biochemistry (2010) and an MSc in Bioengineering (2013) from the University of Minho, and a PhD in Biology (2020) awarded by the Faculty of Sciences, University of Porto. ESSF is currently a Researcher at CIIMAR - Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research, collaborating on the Blue Bioeconomy Pact project (2023_068_IJ_BioeconomiaAzul). ESSF works in Biological Sciences, using multidisciplinary approaches from Molecular & Cellular Biology, Comparative & Functional Genomics, and Evolutionary Biology. ESSF has been involved in 13 national and internationally funded projects, 1 as a Ph.D. Student Fellow, 3 as a Research Fellow, 7 as a Researcher, and recently has earned 2 competitive internal funding projects as Principal Investigator and Research Team Member. ESSF published 28 articles in international peer-reviewed journals and 1 Book Chapter with 105 co-authors (h-index 13, Total Citations 472 according to GoogleScholar). ESSF mentored 9 LSc students, supervised 5 LSc students, co-supervised 2 MSc students, and collaborated on the supervision of PhD students and Post-doc Researchers on topics related to isolation, cloning, and functional characterization of nuclear receptors, syntenic and phylogenetic analyses, and gene expression. ESSF has participated in international scientific conferences (as author or co-author of over 20 oral and poster presentations) and outreach activities. ESSF has also been an active reviewer for several journals (e.g. J Hazard Mater and J Steroid Biochem Mol Biol), attended scientific meetings and workshops, and composed evaluation panels in scientific committees and for technician and researcher grants. ESSF has received 6 awards: "Prémio Caixa Geral de Depósitos" (Best student of BSc in Biochemistry in 2008/2009); Scientific Initiation Scholarship; Merit Scholarship (Best student of MSc in Bioengineering 2013); FCT PhD Studentship (2015); BTC2024 Best Poster (Principal investigator of the project); Mobility Scholarship (2024).

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Elza Sofia Silva Fonseca

Nomes de citação

Fonseca, Elza
Fonseca, ESS
Fonseca, E

Identificadores de autor

Ciência ID: 061C-C624-BDAA
ORCID iD: 0000-0001-8955-2108
Google Scholar ID: https://scholar.google.com/citations?user=0rKYfPYAAAAJ&hl=pt-PT
Scopus Author Id: 57193743894

Endereços de correio eletrónico

efonseca@ciimar.up.pt (Profissional)

Telefones

Telefone

223401800 Ext.: 31 (Profissional)

Moradas

Centro de Investigação Interdisciplinar Marinha e Ambiental. Av. General Norton de Matos S/N, 4450-208, Matosinhos, Matosinhos, Portugal (Profissional)

Domínios de atuação

Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies
Ciências Naturais - Ciências da Terra e do Ambiente - Ciências do Ambiente

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão
Português (Idioma materno)
Francês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador independente (B1)	Utilizador proficiente (C1)
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)

Formação

	Grau	Classificação
2015/02/05 - 2020/06/01 Concluído	PhD in Biology (Doutoramento) Especialização em Biology Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal "Nuclear Receptors in Metazoan lineages: the cross-talk between Evolution and Endocrine Disruption" (TESE/DISSERTAÇÃO)	Aprovado
2015/07/22 - 2015/07/29 Concluído	9th Advanced Study Course on Optical Chemical Sensors and Biosensors (ASCOS) (Outros) Especialização em Optical Chemical Sensors and Biosensors Universidade do Porto Faculdade de Desporto, Portugal INESC Microsistemas e Nanotecnologias, Portugal
2011/09 - 2013/12 Concluído	MSc in Bioengineering (Mestrado) Especialização em Bioengineering Universidade do Minho Departamento de Engenharia Biológica, Portugal "Resistance mechanisms of Candida glabrata biofilmes to fluconazole" (TESE/DISSERTAÇÃO)	17/20
2010/01 - 2010/06 Concluído	(ERASMUS Program) Licence en Sciences du vivant (Bachelor) Especialização em Parcours Chimie Université de Paris UFR des Sciences Fondamentales et Biomédicales, França
2007/09 - 2010/06 Concluído	BSc in Biochemistry (Licenciatura) Especialização em Biochemistry Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal "n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)	17/20

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2023/09/01 - 2025/02/28	Investigador (Investigação)	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2022/05/03 - 2023/08/31	Investigador (Investigação)	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2020/01/01 - 2022/04/30	Investigador (Investigação)	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2014/10/01 - 2014/12/31	Estagiário de Investigação (Investigação)	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2014/06/01 - 2014/09/30	Investigador (Investigação)	Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2011/02/15 - 2011/08/31	Investigador (Investigação)	Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
	Universidade do Minho Centro de Biologia Molecular e Ambiental, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2015/02/05 - 2020/06/01	PhD Studentship	Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2008/11/01 - 2009/10/31	Scientific Initiation Scholarship	Universidade do Minho Centro de Química, Portugal
	Universidade do Minho Centro de Química, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2015/03/01 - 2019/02/28	Nuclear Receptors in basal Metazoan lineages: the cross-talk between Evolution and Endocrine Disruption SFRH/BD/100262/2014 Provided by PTCRIS: SFRH/BD/100262/2014 Bolseiro de Doutoramento Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Projeto

	Designação	Financiadores
2023/09/01 - Atual	Blue Bioeconomy Pact (Vertical BIVALVES - Effectiveness of green antifouling agents in biofouling prevention) C644915664-00000026 Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Em curso
2023/05/01 - 2024/04/30	2DED - 2DBD nuclear receptors as targets for Effective Drugs UIDB_SEED - 2DED Investigador responsável Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental Em curso
2023/05/01 - 2024/04/30	SafeNano - New approaches to assess aquatic toxicity of nanomaterials resulting from trophic transfer UIDB/UIDP - SafeNano Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental Em curso
2022/05/01 - 2023/10/31	EdgeOmics - Freshwater Bivalves at the edge: Adaptation genomics under climate-change scenarios PTDC/CTA-AMB/3065/2020 Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT Em curso
2020/01/01 - 2022/05/31	ACUINANO - Impacto de nanopartículas metálicas en ecosistemas acuáticos y en productos de acuicultura; desarrollo de métodos para su detección 0712_ACUINANO_1_E Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Interreg Europe Concluído
2018/07/26 - 2022/05/25	CY-SENSORS - Biosensor and biomimetic recognition element based devices for detection and separation of cyanobacteria metabolites with ecotoxicological and therapeutical applications PTDC/BTA-GES/32359/2017 Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal Universidade de Coimbra, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2020/01/01 - 2022/04/30	NanoCulture - Risk assessment and mitigation of the presence of engineered Nanomaterials in Atlantic aquaculture EAPA_590/2018 Bolseiro de Investigação Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Interreg Europe Concluído
2018/07/02 - 2021/07/01	EvoDis - The Metazoan Endocrine System in the Anthropocene Epoch: from EVOlution to DISruption PTDC/CTA-AMB/31342/2017 Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2020/01/01 - 2021/05/31	MOREBIVALVES - Molecular strategies to be applied in the depuration of commercial bivalves for elimination of toxic compounds PTDC/ASP-PES/31762/2017 Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31	Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental UID/Multi/04423/2019 Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2016/01/01 - 2018/12/31	CORAL - Sustainable ocean exploitation: tools and sensors NORTE-01-0145-FEDER-000036 Investigador Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte Concluído
2014/06/01 - 2014/09/30	The modulation of retinoid and thyroid signalling pathways by endocrine disrupting chemicals: invertebrate insights PTDC/MAR/115199/2009 Bolseiro de Investigação Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2011/02/15 - 2011/08/31	PhenoMet - Integrative Pheno-Metabolomic and Genomic Approaches for Saccharomyces cerevisiae winemaking yeasts PTDC/AGR-ALI/103392/2008 Bolseiro de Investigação Universidade do Minho Centro de Biologia Molecular e Ambiental, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Rodrigues, Célia Fortuna; Fonseca, Elza Sofia Silva; Gonçalves, Bruna; Bogas, Diana Margarida Ferraz; Silva, Sónia Carina; Azeredo, Joana; Henriques, Mariana. "Antifungal agents induces alteration in the matrix composition of candida glabrata biofilms". 2014.
Artigo em revista	Araújo, Mário Jorge; Vazquez, María; Rodriguez-Lorenzo, Laura; Moreda-Piñeiro, Antonio; Fonseca, Elza; Mallo, Natalia; Pinheiro, Ivone; et al. "Diving into the metabolic interactions of titanium dioxide nanoparticles in “Sparus aurata” and “Ruditapes philippinarum”". Environmental Pollution 360 (2024): 124665. http://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2024.124665. Publicado • 10.1016/j.envpol.2024.124665 Antonio Casas-Rodríguez; Concepción Medrano-Padial; Angeles Jos; Ana M. Cameán; Alexandre Campos; Elza Fonseca. "Characterization of NR1J1 Paralog Responses of Marine Mussels: Insights from Toxins and Natural Activators". International Journal of Molecular Sciences (2024): https://doi.org/10.3390/ijms25126287. 10.3390/ijms25126287 Gomes-dos-Santos, André; Fonseca, Elza; Riccardi, Nicoletta; Hinzmann, Mariana; Lopes-Lima, Manuel; Froufe, Elsa. "The transcriptome assembly of the European freshwater mussel Unio elongatulus C. Pfeiffer, 1825". Scientific Data 11 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1038/s41597-024-03226-y. 10.1038/s41597-024-03226-y Gomes-dos-Santos, André; Domingues, Marcos; Ruivo, Raquel; Fonseca, Elza; Froufe, Elsa; Deyanova, Diana; Franco, João N.; C. Castro, L. Filipe. "An historical "wreck": A transcriptome assembly of the naval shipworm, Teredo navalis Linnaeus, 1978". Marine Genomics 74 (2024): 101097. http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2024.101097. Publicado • 10.1016/j.margen.2024.101097 Angelica Miglioli; Elza Fonseca; Lydia Besnardeau; Laura Canesi; Michael Schubert; Rémi Dumollard. "First characterization of the nuclear receptor superfamily in the Mediterranean mussel Mytilus galloprovincialis : developmental expression dynamics and potential susceptibility to environmental chemicals". Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences (2024): https://doi.org/10.1098/rstb.2022.0500. 10.1098/rstb.2022.0500 Pinto, Bernardo; Machado, André M.; Cordeiro, J. Miguel; Kolbadinezhad, Salman Malakpour; Fonseca, Elza; Andrade, José Pedro; Palma, Jorge; et al. "Extensive gene loss parallels kidney aglomerulism in Syngnathidae". Current Biology 33 20 (2023): R1044-R1046. http://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2023.08.045. 10.1016/j.cub.2023.08.045 Elza Fonseca; María Vázquez; Laura Rodriguez-Lorenzo; Natalia Mallo; Ivone Pinheiro; Maria Lígia Sousa; Santiago Cabaleiro; et al. "Getting fat and stressed: Effects of dietary intake of titanium dioxide nanoparticles in the liver of turbot Scophthalmus maximus". Journal of Hazardous Materials (2023): https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.131915. 10.1016/j.jhazmat.2023.131915 Araújo, Mário J.; Sousa, Maria L.; Fonseca, Elza; Felpeto, Aldo Barreiro; Martins, José Carlos; Vázquez, María; Mallo, Natalia; et al. "Proteomics reveals multiple effects of titanium dioxide and silver nanoparticles in the metabolism of turbot, Scophthalmus maximus". Chemosphere 308 (2022): 136110. http://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2022.136110. 10.1016/j.chemosphere.2022.136110 Inês Páscoa; Elza Fonseca; Renato Ferraz; André M. Machado; Francisca Conrado; Raquel Ruivo; Isabel Cunha; Luís Filipe C. Castro. "The Preservation of PPAR¿ Genome Duplicates in Some Teleost Lineages: Insights into Lipid Metabolism and Xenobiotic Exploitation". Genes (2022): https://doi.org/10.3390/genes13010107. 10.3390/genes13010107 Mário Jorge Araújo; Maria Lígia Sousa; Aldo Barreiro Felpeto; Maria V. Turkina; Elza Fonseca; José Carlos Martins; Vítor Vasconcelos; Alexandre Campos. "Comparison of Sample Preparation Methods for Shotgun Proteomic Studies in Aquaculture Species". Proteomes (2021): https://doi.org/10.3390/proteomes9040046. 10.3390/proteomes9040046 Fonseca, Elza; Machado, André M.; Vilas-Arrondo, Nair; Gomes-dos-Santos, André; Veríssimo, Ana; Esteves, Pedro; Almeida, Tereza; et al. "Cartilaginous fishes offer unique insights into the evolution of the nuclear receptor gene repertoire in gnathostomes". General and Comparative Endocrinology 295 (2020): 113527. http://dx.doi.org/10.1016/j.ygcen.2020.113527. Publicado • 10.1016/j.ygcen.2020.113527 Capitão, Ana; Lopes-Marques, Mónica; Páscoa, Inês; Ruivo, Raquel; Mendiratta, Nicolau; Fonseca, Elza; Castro, L. Filipe C.; Santos, Miguel Machado. "The Echinodermata PPAR: Functional characterization and exploitation by the model lipid homeostasis regulator tributyltin". Environmental Pollution 263 (2020): 114467. http://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2020.114467. Publicado • 10.1016/j.envpol.2020.114467 Machado, André M.; Muñoz-Merida, Antonio; Fonseca, Elza; Veríssimo, Ana; Pinto, Rui; Felício, Mónica; da Fonseca, Rute R.; Froufe, Elsa; Castro, L. Filipe C.. "Liver transcriptome resources of four commercially exploited teleost species". Scientific Data 7 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41597-020-0565-9. Publicado • 10.1038/s41597-020-0565-9 Fonseca, Elza; Raquel Ruivo; Débora Borges; João N. Franco; Miguel M. Santos; L. Filipe C. Castro. "Of Retinoids and Organotins: The Evolution of the Retinoid X Receptor in Metazoa". Biomolecules 10 4 (2020): 594. https://doi.org/10.3390/biom10040594. Publicado • 10.3390/biom10040594 Elza S. S. Fonseca; Youhei Hiromori; Yoshifumi Kaite; Raquel Ruivo; João N. Franco; Tsuyoshi Nakanishi; Miguel M. Santos; L. Filipe C. Castro. "An Orthologue of the Retinoic Acid Receptor (RAR) Is Present in the Ecdysozoa Phylum Priapulida". Genes 10 12 (2019): 985-985. https://doi.org/10.3390/genes10120985. 10.3390/genes10120985 Barbosa, Mélanie Audrey Gomes; Capela, Ricardo; Rodolfo, Jorge; Fonseca, Elza; Montes, Rosa; André, Ana; Capitão, Ana; et al. "Linking chemical exposure to lipid homeostasis: A municipal waste water treatment plant influent is obesogenic for zebrafish larvae". Ecotoxicology and Environmental Safety 182 (2019): 109406. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecoenv.2019.109406. Publicado • 10.1016/j.ecoenv.2019.109406 Lee MC; Fonseca E; Park JC; Yoon DS; Choi H; Kim M; Han J; et al. "Tributyltin Affects Retinoid X Receptor-Mediated Lipid Metabolism in the Marine Rotifer Brachionus koreanus.". Environmental science & technology (2019): http://europepmc.org/abstract/med/31244070. 10.1021/acs.est.9b01359 Fonseca, Elza S. S.; Ruivo, Raquel; Machado, André M.; Conrado, Francisca; Tay, Boon-Hui; Venkatesh, Byrappa; Santos, Miguel M.; Castro, L. Filipe C.. "Evolutionary Plasticity in Detoxification Gene Modules: The Preservation and Loss of the Pregnane X Receptor in Chondrichthyes Lineages". International Journal of Molecular Sciences 20 9 (2019): 2331. http://dx.doi.org/10.3390/ijms20092331. Publicado • 10.3390/ijms20092331 André, Ana; Ruivo, Raquel; Fonseca, Elza; Froufe, Elsa; Castro, L. Filipe C.; Santos, Miguel M.. "The retinoic acid receptor (RAR) in molluscs: Function, evolution and endocrine disruption insights". Aquatic Toxicology 208 (2019): 80-89. http://dx.doi.org/10.1016/j.aquatox.2019.01.002. Publicado • 10.1016/j.aquatox.2019.01.002 Capitão AMF; Lopes-Marques MS; Ishii Y; Ruivo R; Fonseca ESS; Páscoa I; Jorge RP; et al. "Evolutionary Exploitation of Vertebrate Peroxisome Proliferator-Activated Receptor ¿ by Organotins.". Environmental science & technology 52 23 (2018): 13951-13959. http://europepmc.org/abstract/med/30398865. 10.1021/acs.est.8b04399 Machado AM; Tørresen OK; Kabeya N; Couto A; Petersen B; Felício M; Campos PF; et al. ""Out of the Can": A Draft Genome Assembly, Liver Transcriptome, and Nutrigenomics of the European Sardine, Sardina pilchardus.". Genes (2018): http://europepmc.org/abstract/med/30304855. 10.3390/genes9100485 Santos, M.M.; Ruivo, R.; Capitão, A.; Fonseca, E.; Castro, L.F.C.. "Identifying the gaps: Resources and perspectives on the use of nuclear receptor based-assays to improve hazard assessment of emerging contaminants". Journal of Hazardous Materials 358 (2018): 508-511. http://dx.doi.org/10.1016/j.jhazmat.2018.04.076. Publicado • 10.1016/j.jhazmat.2018.04.076 Lopes-Marques, Mónica; Machado, André M.; Ruivo, Raquel; Fonseca, Elza; Carvalho, Estela; Castro, L. Filipe C.. "Expansion, retention and loss in the Acyl-CoA synthetase "Bubblegum" ( Acsbg ) gene family in vertebrate history". Gene 664 (2018): 111-118. http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2018.04.058. Publicado • 10.1016/j.gene.2018.04.058 Machado, André M.; Felício, Mónica; Fonseca, Elza; da Fonseca, Rute R.; Castro, L. Filipe C.. "A resource for sustainable management: De novo assembly and annotation of the liver transcriptome of the Atlantic chub mackerel, Scomber colias". Data in Brief 18 (2018): 276-284. http://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2018.03.013. Publicado • 10.1016/j.dib.2018.03.013 Lopes-Marques, Mónica; Ruivo, Raquel; Fonseca, Elza; Teixeira, Ana; Castro, L. Filipe C.. "Unusual loss of chymosin in mammalian lineages parallels neo-natal immune transfer strategies". Molecular Phylogenetics and Evolution 116 (2017): 78-86. http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2017.08.014. Publicado • 10.1016/j.ympev.2017.08.014 Fonseca, Elza; Ruivo, Raquel; Lopes-Marques, Mónica; Zhang, Huixian; Santos, Miguel M.; Venkatesh, Byrappa; Castro, L. Filipe C.. "LXRa and LXRß nuclear receptors evolved in the common ancestor of gnathostomes". Genome Biology and Evolution 9 1 (2017): 222-230. http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evw305. Publicado • 10.1093/gbe/evw305 Fonseca, Elza; Silva, Sónia; Rodrigues, Célia Fortuna; Alves, Carlos Tiago; Azeredo, Joana; Henriques, Mariana. "Effects of fluconazole onCandida glabratabiofilms and its relationship with ABC transporter gene expression". Biofouling 30 4 (2014): 447-457. http://dx.doi.org/10.1080/08927014.2014.886108. Publicado • 10.1080/08927014.2014.886108 Mendes, Inês; Franco-Duarte, Ricardo; Umek, Lan; Fonseca, Elza; Drumonde-Neves, João; Dequin, Sylvie; Zupan, Blaz; Schuller, Dorit. "Computational Models for Prediction of Yeast Strain Potential for Winemaking from Phenotypic Profiles". PLoS ONE 8 7 (2013): e66523. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0066523. Publicado • 10.1371/journal.pone.0066523
Capítulo de livro	Fonseca, Elza; Ruivo, Raquel; Santos, Miguel; C. Castro, L. Filipe. "Endocrine-disrupting chemicals and their mode of action: The case of nuclear receptors and the evolution of the Metazoa". In Environmental Contaminants and Endocrine Health, editado por Oliana Carnevali; Gary Hardiman, 55-62. Academic Press, 2023. No prelo
Poster em conferência	Ferreira, Bárbara; Graciliana Luísa Lino Lopes; Neuparth, Teresa; Gomes-dos-Santos, André; Ruivo, Raquel; Fonseca, Elza. Autor correspondente: Fonseca, Elza. "The 2DBD-nuclear receptors as targets for the development of antischistosomal drugs". Trabalho apresentado em Blue Think Conference 2024, 2024. Mário Jorge Araújo; Fonseca, Elza; Vasconcelos, Vitor; Campos, Alexandre. "Metabolic, Inflammatory and Oxidative Effects Induced by Dietary Exposure of Titanium Dioxide Nanoparticles in Turbot "Scophthalmus maximus"". Trabalho apresentado em Ciência 23, 2023. Fonseca, E; Silva, Beatriz; Gomes-dos-Santos, André; Machado, André; Pinto, Rui; Lopes-Lima, Manuel; C. Castro, L. Filipe; Froufe, Elsa. "Genomic Adaptations Associated with Climate Change and Biological Changes in the unionid mussel Unio delphinus (Spengler, 1793)". Trabalho apresentado em SMBE23, 2023. Froufe, Elsa; Lopes-Lima, Manuel; Teixeira, Amílcar; Gomes-dos-Santos, André; Fonseca, E; Österling, Martin; Riccardi, Nicoletta; et al. "Genomics in a Changing World: Conservation, Invasive Species, and Climate Change". Trabalho apresentado em SMBE Everywhere series, 2023. Elsa Froufe; Lopes-Lima, Manuel; Teixeira, Amilcar; Gomes-dos-Santos, André; Fonseca, Elza; Martin Österling; Riccardi, Nicoletta; et al. "EdgeOmics - Freshwater Bivalves at the edge: Adaptation genomics under climate-change scenarios". Trabalho apresentado em GS8: Genomics in a Changing World: Conservation, Invasive Species, and Climate Change, 2023. Sapkota, Sworaj; Fonseca, Elza; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Rodriguez-Lorenzo, Laura; Espiña, Begoña; Vasconcelos, Vitor; Campos, Alexandre. "The effect of particles size in the cytotoxicity of titanium oxide and silver nanoparticles". Trabalho apresentado em Nanoculture Final Event, 2022. Bigorra-Ferré, Elizabeth; Matos, Ana; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Fonseca, Elza; Rodriguez-Lorenzo, Laura; Espiña, Begoña; Vasconcelos, Vitor; Campos, Alexandre. ""In vitro" and "in vivo" study of the effects of different nanoparticle coatings in trout cell lines and embryos of zebrafish". Trabalho apresentado em Nanoculture Final Event, 2022. Espina, Begona; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Barros, Nuria; Bermejo-Barrera, P; Cabaleiro, S; Campos, Alexandre; Correa-Duarte, MA; et al. "Nanoparticles in aquaculture: is it something to worry about?". Trabalho apresentado em EuroNanoForum 2021, 2021. Fonseca, ESS; Sousa, Maria Lígia; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Vázqueza, M; Cabaleiro, S; Rodriguez-Lorenzo, Laura; Quarato, M; et al. "Proteomic and Transcriptomic Effects of Commercial Polyvinylpyrrolidone-coated Silver Nanoparticles on Turbot Liver (Scophthalmus maximus)". Trabalho apresentado em EuroNanoForum 2021, 2021. Fonseca, Elza; Ruivo, Raquel; Corado, Francisca; Machado, André; Santos, Miguel; C. Castro, L. Filipe. "Preservation and loss of the Pregnane X Receptor in chondrichthyans sheds light into the early evolution of detoxification mechanisms in gnathostomes.". Trabalho apresentado em 31st ESCPB congress - European Society of Comparative Physiology and Biochemistry, 2018. Corado, Francisca; Ruivo, Raquel; Machado, André; Fonseca, Elza; Santos, Miguel; C. Castro, L. Filipe. "PPARg evolution in teleosts: gene duplication, retention, and loss.". Trabalho apresentado em 31st ESCPB congress - European Society of Comparative Physiology and Biochemistry, 2018. Ana Capitão; MónicaLopes-Marques; Raquel Ruivo; Nicolau Mendiratta; Fonseca, ESS; Filipe Castro (941D-C777-CC18). "The sea urchin Paracentrotus lividus is a target of the model obesogen tributyltin: an in vitro and in vivo study.". Trabalho apresentado em 31st ESCPB congress - European Society of Comparative Physiology and Biochemistry, 2018. Fonseca, Elza; Ruivo, Raquel; Lopes-Marques, Mónica; Fonseca, Miguel; Machado, André; Santos, Miguel; C. Castro, L. Filipe. "The "Neglected": the "insightful" repertoire of nuclear receptors in Protostomes". Trabalho apresentado em 7th meeting of the European Society for Evolutionary Developmental Biology (EED), 2018. Lopes-Marques, Mónica; CAPITÃO, ANA; Ruivo, Raquel; Fonseca, Elza; Santos, Miguel; C. Castro, L. Filipe. "Structural and Molecular Underpinnings of Variable Obesogen Sensitivity in Vertebrates". Trabalho apresentado em 18º Portugaliae Genetica, 2018. Inês Mendes; Ricardo Franco Duarte; Lan Umek; Fonseca, ESS; João Drumonde Neves; Sylvie Dequin; Blaz Zupan; Dorit Elisabeth Schuller. "The phenotypic landscape of a Saccharomyces cerevisiae strain collection". Trabalho apresentado em 13th International Congress on Yeasts “Yeasts for Sustainable Future”, 2012. 10.13140/2.1.4568.4488
Resumo em conferência	Fonseca, Elza; Mário Jorge Araújo; Maria Ligia Sousa; Maria Vazquez; Rodriguez-Lorenzo, Laura; Ivone Pinheiro; Mallo, Natalia; et al. "Dietary exposure with titanium dioxide nanoparticles induces metabolic alterations and oxidative stress in turbot "Scophthalmus maximus"". Trabalho apresentado em Nano 2023 - ICEEN 2023: 16th International Conference on the Environmental Effects of Nanoparticles and Nanomaterials, Plymouth, 2023. Fonseca, E; Silva, Beatriz; Gomes-dos-Santos, André; Machado, André; Pinto, Rui; C. Castro, L. Filipe; Froufe, Elsa. "Genomic Adaptations Associated with Climate Change and Biological Changes in the unionid mussel Unio delphinus (Spengler, 1793)". Trabalho apresentado em SMBE23, Ferrara, 2023. No prelo Pinheiro, João; Gomes-dos-Santos, André; C. Castro, L. Filipe; Froufe, Elsa; Fonseca, Elza. "Nuclear receptors and the mussels that "don't get better with butter"". Trabalho apresentado em IJUP 2023, Porto, 2023. No prelo Pinto, Bernardo; Malakpourkolbadinezhad, Salman; Cordeiro, Miguel; Machado, André; Ruivo, Raquel; Fonseca, Elza; Andrade, José Pedro; et al. "Sans Glomeruli: the recurrent origin of aglomerular kidneys in teleosts". Trabalho apresentado em IJUP 2023, 2023. No prelo Lago, Íris; Fonseca, Elza; Gasnier, Bruno; C. Castro, L. Filipe; Ruivo, Raquel. "MiT/TFE Family of Transcription Factors in Invertebrates: from nutrient sensing to environmental markers?". Trabalho apresentado em IJUP 2023, Porto, 2023. No prelo ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Fonseca, E; Bigorra-Ferré, Elizabeth; Oliveira, Miguel. Autor correspondente: Oliveira, Miguel. "Assessing the Effects of Titanium Dioxide Nanoparticles in Fish: What Do We Know So Far?". Trabalho apresentado em SETAC Europe 33rd Annual Meeting, Dublin, 2023. Publicado Bigorra-Ferré, Elizabeth; Matos, Ana; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Fonseca, E; Rodriguez-Lorenzo, Laura; Espiña, Begoña; Vasconcelos, Vitor; Campos, Alexandre. ""In vitro" and "in vivo" study of the effects of different nanoparticle coatings in trout cell lines and embryos of zebrafish". Trabalho apresentado em Blue Think Conference 2022, Matosinhos, 2022. Publicado Sapkota, Sworaj; Fonseca, E; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Rodriguez-Lorenzo, Laura; Espiña, Begoña; Vasconcelos, Vitor; Campos, Alexandre. "The effect of particles size in the cytotoxicity of titanium oxide and silver nanoparticles". Trabalho apresentado em Blue Think Conference 2022, Matosinhos, 2022. Publicado Bigorra-Ferré, Elizabeth; Matos, Ana; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Fonseca, Elza; Campos, Alexandre. "Study of the effects of different nanoparticle coatings on zebrafish". Trabalho apresentado em IJUP 2022, Porto, 2022. Publicado Sousa, Diogo; Fonseca, Elza; Sousa, João; Ruivo, Raquel; Santos, Miguel; C. Castro, L. Filipe. "Evolution of endocrine systems in Lophotrochozoans". Trabalho apresentado em IJUP 2022, Porto, 2022. Publicado ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Sousa, Maria Lígia; Fonseca, E; Campos, Alexandre. "New frontiers in aquatic contamination: nanocontaminants and their adverse effects". Trabalho apresentado em Simpósio Ibérico sobre a Bacia Hidrográfica do rio Minho, Vila Nova de Cerveira, 2021. Publicado Fonseca, ESS; ARAÚJO, MÁRIO JORGE FARIA DOS SANTOS; Sousa, Maria Lígia; Vázquez, M; Mallo, Natalia; Cabaleiro, Santiago; Rodriguez-Lorenzo, Laura; et al. "Does size matter? The effect of titanium dioxide nanoparticle size over time on gene expression in turbot liver". Trabalho apresentado em Aquaculture Europe 2021, Funchal, 2021. Publicado Santo, Miguel; Lyssimachou, Angeliki; Lopes-Marques, Mónica; CAPITÃO, ANA; Fonseca, Elza; Ruivo, Raquel; C. Castro, L. Filipe. "Obesogens: molecular signaling pathways in fish". Trabalho apresentado em XV European Congress of Ichthyology, Porto, 2015. Publicado Rodrigues, Célia; Fonseca, Elza; Gonçalves, Bruna; Bogas, Diana; Silva, Sónia; Azeredo, Joana; Henriques, Mariana. "Antifungal agents induce alteration in the matrix composition of Candida glabrata biofilms". Trabalho apresentado em Biofilms 6 - International Conference on Microbial Biofilms, Viena, 2014. Publicado
Tese / Dissertação	Fonseca, Elza. "Nuclear Receptors in Metazoan lineages: the cross-talk between Evolution and Endocrine Disruption". 2020. https://hdl.handle.net/10216/129419. Fonseca, Elza. "Resistance mechanisms of Candida glabrata biofilmes to fluconazole". Mestrado, 2013. http://hdl.handle.net/1822/28653.

Outros

Outra produção

Expansion, retention and loss in the Acyl-CoA Synthetase “Bubblegum” (Acsbg) gene family in vertebrate history. 2018. Lopes-Marques, M.; Machado, A.M.; Ruivo, R.; Fonseca, E.; Carvalho, E.; Castro, L.F.. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85095519139&partnerID=MN8TOARS.
10.1101/288530

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2023/09/07	Dietary exposure to titanium dioxide nanoparticles induces metabolic alterations and oxidative stress in turbot, "Scophthalmus Maximus"	16 th International Conference on Environmental Effects of Nanoparticles and Nanomaterials University of Plymouth (Plymouth, Reino Unido)
2023/05/12	Nuclear receptors and the mussels that “don’t get better with butter”	Investigação Jovem da Universidade do Porto (IJUP2023) Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (Porto, Portugal)
2021/02/18	Molecular effects of Titanium and Silver nanoparticles in turbot (In Portuguese)	NANOCULTURE project Webinar: "As nanopartículas em aquacultura: devemos preocupar-nos?" CIIMAR & INL (Online, Portugal)
2019/10/04	Nuclear Receptors in Metazoan lineages: When Evolution meets Disruption (In English)	Neptune Seminar Series CIIMAR (Matosinhos, Portugal)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2023/12/06 - 2024/07/17	The 2DBD-Nuclear Receptors as Targets for the Development of Antischistosomal Drugs Orientador	Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2022/09 - 2023/12/05	Expression of the nuclear receptors NR1J1, CYP and ABCB1 genes in marine mussel Mytilus galloprovincialis, mediated by food regime and Okadaic Acid exposure Coorientador	Contaminação e Toxicologia Ambientais (Mestrado) Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
2022/09/14 - 2023/07	Nuclear Receptors at Evolutionary crossroads: from phylogeny to physiology Orientador	Licenciatura em Biologia (Licenciatura/Bacharelato) Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2022/02/09 - 2022/07/10	Toxicity assessment of silver nanoparticles using in vitro models Orientador	Bachelor of Technology in Biotechnology (Licenciatura/Bacharelato) Vellore Institute of Technology Periyar Central Library, Índia
2021/10/20 - 2022/07/04	Expression and molecular function of xenobiotic nuclear receptors (XNR) in Mytilus galloprovincialis Orientador	Licenciatura em Biologia (Licenciatura/Bacharelato) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2021/10/20 - 2022/07/04	Expression and molecular function of xenobiotic nuclear receptors (XNR) in Ruditapes decussatus Orientador	Licenciatura em Biologia (Licenciatura/Bacharelato) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2022/01/11 - 2022/06/22	Ecotoxicology of nanoparticles in aquatic organisms Coorientador	Master in Sciences, Technologies and Health mention Biotechnologies parcours Applied Blue Technology (Mestrado) La Rochelle Université, França

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2024/12/03 - 2024/12/06	Workshop "Principles of High-throughput Proteomics Research Course" (3ECTS) Oficina (workshop)	Principles of High-throughput Proteomics Research Course Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal Linköpings universitet Institutionen för klinisk och experimentell medicin, Suécia Instituto Politécnico do Porto, Portugal
2024/11/21 - 2024/11/21	Lecture on "Women in Science: Profile and Research". Public: Highschool teachers and students from the Agrupamento de Escolas D. Maria II (Braga, Portugal) Festival	Science and Technology Culture Week 2024 Ciência Viva, Portugal Agrupamento de Escolas D. Maria II, Portugal
2024/09/22 - 2024/09/22	CIIMAR Open Day: development and demonstration of outreach activities for the general public, with a focus on children, on the topics of evolution, phylogeny, and environmental toxicology. CIIMAR Open Day, held on September 22nd 2024, is a science communication and outreach event with over 20 000 participants. Exposição	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2023/10/28 - 2023/10/28	Participation in Traversing European Ecosystems (TREC) expedition outreach activities (volunteer). Exposição	Traversing European Ecosystems (TREC) expedition Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2023/09/17 - 2023/09/17	CIIMAR Open Day: development and demonstration of outreach activities for the general public, with a focus on children, on the topics of evolution, phylogeny, and environmental toxicology. CIIMAR Open Day, held on September 17th 2023, is a science communication and outreach event with over 20 000 participants. Exposição	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2023/09/12 - 2023/09/12	International Conference in Marine Biotechnology; Attendance Conferência	International Conference in Marine Biotechnology Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2023/09/05 - 2023/09/08	Attendance and oral presentation Conferência	16 th International Conference on Environmental Effects of Nanoparticles and Nanomaterials University of Plymouth, Reino Unido
2023/04/20 - 2023/04/23	20ª Mostra da Universidade do Porto; Dissemination of CIIMAR mission to the general public: research activities, training, technological development at the Pavilhão Multiusos de Gondomar, Porto, Portugal. Exposição	20ª Mostra da UP Universidade do Porto, Portugal
2023/01/13 - 2023/01/13	Oral presentation; Title: "Os mexilhões de água doce (The freshwater mussels)"; Target public: children between 8 and 9 years old and their teachers. Outro	Encontro com o Cientista na Escola Ciência Viva Gaia Escola Ciência Viva, Portugal
2022/11/28 - 2022/12/02	Workshop "RNAseq in non-model organisms"; Participation (30 hours, 1 ECTS) Oficina (workshop)	Physalia Courses - RNAseq in non-model organisms
2022/10/06 - 2022/10/06	Fire Safety Training; Participation	Fire Safety Training Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2022/09/18 - 2022/09/18	CIIMAR Open Day: development and demonstration of outreach activities for the general public, with a focus on children, on the topics of evolution, phylogeny, and environmental toxicology. CIIMAR Open Day, held on September 18th 2022, is a science communication and outreach event with over 20 000 participants. Exposição	Dia Aberto do CIIMAR 2022 Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2022/06/20 - 2022/06/24	Workshop "Summer school in Bioinformatics", Participation (30 hours, 1 ECTS) Oficina (workshop)	Physalia Courses - Summer school in Bioinformatics
2021/10/04 - 2021/10/07	Aquaculture Europe 2021; Participation Conferência	Aquaculture Europe 2021 European Aquaculture Society, Bélgica
2020/01/15 - 2020/01/15	BOGA Biosafety Initial Training (FIB-BOGA); Participation Oficina (workshop)	BOGA Biosafety Initial Training (FIB-BOGA) Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2018/09/09 - 2018/09/12	31st Congress of the New European Society of Comparative Biochemistry and Physiology; Participation	31st ESCPB Congress Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2017/07/19 - 2017/07/22	¿S¿ummer ¿S¿chool on Marine Sampling; Participation This ¿S¿ummer ¿S¿chool is open to ¿members of ¿¿the BLUEandGREEN project that are interested in learning about field sampling¿ ¿strategies in marine biotechnology. ¿The Summer School programme include¿s¿ both Lectures ¿and Practical Lessons on: legal¿ ¿aspects of marine sampling¿;¿ ¿biodiversity, ¿techniques used for field-work, sampling¿ ¿through ¿Scientific ¿¿D¿iving¿. Oficina (workshop)	¿S¿ummer ¿S¿chool on Marine Sampling Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental da Madeira, Portugal Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2016/03/17 - 2016/03/20	14ª Mostra da Universidade do Porto Exposição	14ª Mostra UP Universidade do Porto, Portugal
2015/07/22 - 2015/07/29	Advanced Course: 9th Advanced Study Course on Optical Chemical Sensors and Biosensors; Participation (3 ECTS) Oficina (workshop)	ASCOS 2015 Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência, Portugal
2011/07/20 - 2011/07/27	44th World Congress of Vine and Wine; Attendance Congresso	XXXIV World Congress of Wine and Vine Organisation Internationale de la Vigne et du Vin, França
2011/05/30 - 2011/06/01	XXXVI Jornadas Portuguesas de Genética; Attendence Congresso	XXXVI Jornadas Portuguesas de Genética Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal

Comissão de avaliação

	Descrição da atividade Tipo de assessoria	Instituição / Organização	Entidade financiadora
2024/09/10 - 2024/09/11	The Blue Think Conference 2024 BTC is an annual meeting organised by the Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR) PhD Students’ Committee. Our aim is to gather all students affiliated with our institute in a casual and relaxed environment to share the outputs of our works. We welcome everyone to attend, hear and discuss the work developed by CIIMAR students. Avaliador	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2022/09/27 - 2022/09/27	The Blue Think Conference 2022 BTC is an annual meeting organised by the Interdisciplinary Centre of Marine and Environmental Research (CIIMAR) PhD Students Committee. Our aim is to gather all students affiliated with our institute in a casual and relaxed environment to share the outputs of our works. We welcome everyone to attend, hear and discuss the work developed by CIIMAR students. Avaliador	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal

Outro júri / avaliação

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2022/09/14 - 2022/10/10	Evaluation of candidates for a fellowship (BI) vacancy within the project EdgeOmics - Freshwater Bivalves at the edge: Adaptation genomics under climate-change scenarios (Ref: PTDC/CTA-AMB/3065/2)	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2021/10/08 - 2021/10/09	Evaluation of candidates for a researcher contract vacancy within the project CIGUA - The rise of toxic tropical and subtropical marine dinoflagellates Gambierdiscus spp: distribution, ciguatoxins trophic transfer and risk of ciguatera fish poisoning (Ref: PTDC/CTA-AMB/30557/2017)	Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal

Revisão ad hoc de artigos em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2024/07/08 - 2024/07/08	Toxics (2305-6304)
2023/10/06 - 2024/07/04	Journal of Hazardous Materials (1873-3336)	Elsevier
2024/05/27 - 2024/05/27	Marine Pollution Bulletin (0025-326X )
2024/05/02 - 2024/05/02	General and Comparative Endocrinology (1095-6840)
2024/03/06 - 2024/04/02	Aquaculture Reports (2352-5134)
2022/09/19 - 2023/06/12	Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology (0960-0760)	Elsevier

Distinções

Prémio

2024	BTC2024 Best Poster in Biology, Aquaculture ans Seafood Quality Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2023	CIIMAR Nautilus Awards – The most cited article in the media Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal
2015	Bolsa de estudo por mérito (2011-2013) Universidade do Minho, Portugal
2010	Prémio Caixa Geral de Depósitos (2008/2009) Caixa Geral de Depositos, Portugal

Outra distinção

2024	Mobility Scholarship to France, Institut de la Mer de Villefranche (IMEV) Instituto Francês de Portugal, Portugal