Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- Rui Pedro Pimenta das Neves
Nomes de citação
- Neves, Rui P. P.
Identificadores de autor
- Ciência ID
- 0F17-0547-ADD3
- ORCID iD
- 0000-0003-2032-9308
- Researcher Id
- L-4544-2014
- Scopus Author Id
- 36647716400
Endereços de correio eletrónico
- rui.neves@fc.up.pt (Profissional)
Websites
- https://laqv.requimte.pt/people/491-rui_neves (Profissional)
Domínios de atuação
- Ciências Exatas - Química - Química Física
- Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
- Ciências Exatas - Química - Química Física
Idiomas
Idioma | Conversação | Leitura | Escrita | Compreensão | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Inglês | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C2) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | |
Francês | Utilizador elementar (A1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | |
Espanhol; Castelhano | Utilizador elementar (A1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador elementar (A1) | ||
Português (Idioma materno) |
Formação
Grau | Classificação | |
---|---|---|
2012/01/01 - 2016/04/18
Concluído
|
Chemistry (Doutoramento)
Especialização em Theoretical Chemistry and Computational Biochemistry
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Metals' Data for Biomolecular Force Fields" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
Approved with distinction and by unanimity |
2009 - 2011
Concluído
|
Physics and Chemistry Teacher Education for Middle and Secondary Schools (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Internship Report 2010/2011" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
17/20 (class B in the ECTS grading scale |
2006 - 2009
Concluído
|
Chemisty (Licenciatura)
Especialização em Chemisty (with minor in Physics)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Partial Molar Volume: Microscopic Insight from Macroscopic Results" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
17/20 (class A in the ECTS grading scale |
Percurso profissional
Ciência
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2022/04/01 - Atual | Investigador Contratado (Investigação) | Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal |
REQUIMTE LAQV Porto, Portugal (...) |
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2021/10/01 - 2022/03/31 | Investigador Contratado (Investigação) | REQUIMTE, Portugal |
REQUIMTE LAQV Porto, Portugal (...) |
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2019/04/01 - 2021/09/30 | Investigador Contratado (Investigação) | REQUIMTE, Portugal |
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal (...) |
||
2017/01/01 - 2019/03/31 | Investigador Contratado (Investigação) | Universidade do Porto Instituto de Ciências e Tecnologias Agrárias e Agro-Alimentares, Portugal |
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal (...) |
||
2016/05/15 - 2016/12/31 | Pós-doutorado (Investigação) | Universidade do Porto Instituto de Ciências e Tecnologias Agrárias e Agro-Alimentares, Portugal |
Outros
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2012/01/01 - 2015/12/31 | PhD position in Theoretical Chemistry and Computational Biochemistry group of Professor Maria João Ramos | Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal |
2010/06/28 - 2010/07/23 | Developer and supervisor of UJr's Project: "Química: Uma Ciência sem Fronteiras", 2010 series of Universidade Júnior | Universidade do Porto, Portugal |
Projetos
Bolsa
Designação | Financiadores | |
---|---|---|
2012/01/01 - 2015/12/31 | Metals' Data for Biomolecular Force Fields
SFRH/ BD/78397/2011
Bolseiro de Doutoramento
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
|
Fundação para a Ciência e Tecnologia
Concluído
|
Projeto
Designação | Financiadores | |
---|---|---|
2022/04/01 - Atual | Rational engineering of bacterial sulfur oxidoreductases for the capture and recycling of sulfur-based pollutants
Investigador responsável
REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2021/01/01 - 2025/12/31 | Associated Laboratory for Green Chemistry - Clean Technologies and Processes
LA/P/0008/2020
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal Universidade de Évora, Portugal Unidade de Investigação Vidro e Cerâmica para as Artes, Portugal Universidade de Aveiro, Portugal Universidade NOVA de Lisboa, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2024/06/01 - 2025/05/31 | Atomistic and thermodynamic characterization of the capabilities of bacterial sulfide:quinone reductase on the conversion
of pollutant sulfide to elemental sulfur
2023.10904.CPCA.A2
Investigador responsável
REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2023/09/01 - 2024/03/31 | Modeling a competent complex of a bacterial sulfide:quinone reductase interacting with its membrane counterpart
2023.09563.CPCA.A1
Investigador responsável
REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2023/03/08 - 2024/03/07 | Murderous Venom- An Universal and Affordable Antidote Against Snakebite
EHPC-REG-2022R03-205
Co-Investigador Responsável (Co-IR)
REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
Partnership for Advanced Computing In Europe
Em curso
|
2023/02/02 - 2023/08/02 | Exploring the interactions of a streptogramin B antibiotic to an antibiotic degrading enzyme, to devise new strategies to
tackle antibiotic resistance
2022.15843.CPCA.A1
Co-Investigador Responsável (Co-IR)
REQUIMTE LAQV Porto, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
2019/04/01 - 2021/09/30 | New Biocatalysts for Green Crude Oil Desulfurization
PTDC/QUI-QFI/28714/2017
REQUIMTE 2018-41
Investigador Pós-doutorado
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal
Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
2018/06/01 - 2021/05/31 | Interdisciplinary in silico, organic synthesis, in vitro, and in vivo studies towards new anti-diabetic flavonoid scaffolds
PTDC/MED-QUI/29241/2017
Investigador Pós-doutorado
Universidade de Aveiro, Portugal
Universidade do Porto, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2019/01/01 - 2019/12/31 | Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas
UID/Multi/04378/2019
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
2017/01/01 - 2019/03/31 | New Technologies for three Health Challenges of Modern Societies: Diabetes, Drug Abuse and Kidney Diseases
NORTE-01-0145-FEDER-000024
HEALTH_RL1_CI_GQC_01_3º
Investigador Pós-doutorado
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
|
Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Concluído
|
2016/05 - 2016/12 | New Technologies for three Health Challenges of Modern Societies: Diabetes, Drug Abuse and Kidney Diseases
NORTE-01-0145-FEDER-000024
HEALTH_RL1_PHD_GQC_01_02
Bolseiro de Pós-Doutoramento
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
|
Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Concluído
|
Outro
Designação | Financiadores | |
---|---|---|
2020/04/01 - 2022/09/30 | Biodegrading plastic
2019215204
Investigador Pós-doutorado
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal
|
Partnership for Advanced Computing In Europe
Concluído
|
2019/03 - 2020/02 | Local and collective motions as a gateway to the catalytic power of enzymes
CHM150
Investigador Pós-doutorado
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Oak Ridge National Laboratory
Concluído
|
2019/03 - 2020/02 | Enzyme instantaneous disorder as a key player in the catalytic power of enzymes
CHM151
Investigador Pós-doutorado
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Oak Ridge National Laboratory
Concluído
|
2019/09/20 - 2019/11/20 | Biodegrading plastic
2010PA5065
Investigador Pós-doutorado
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Partnership for Advanced Computing In Europe
Concluído
|
2017/05 - 2017/12 | Assessment of natural compounds as novel anti-diabetic drugs
REQUIMTE/OPO-LIS/NFB2017
Investigador Pós-doutorado
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
|
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas
Concluído
|
Produções
Publicações
Artigo em revista |
|
Capítulo de livro |
|
Poster em conferência |
|
Resumo em conferência |
|
Tese / Dissertação |
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Atividades
Apresentação oral de trabalho
Título da apresentação | Nome do evento Anfitrião (Local do evento) |
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2019/12/02 | Unveiling enzyme reaction mechanisms as means to develop sustainable industrial processes | 3rd International Caparica Christmas Conference on Translational Chemistry 2019
PROTEOMASS BIOSCOPE Team (Costa da Caparica, Portugal)
|
2019/10/11 | Can machine-learning boost enzyme-directed rational drug-design? | I Biomedical Engineering Summit
Associação Nacional de Estudantes de Engenharia Biomédica (Lisbon, Portugal)
|
2019/09 | Computational Biochemistry and Enzyme Reaction Mechanisms | Master course of Computational Biochemistry (Q4003)
University of Porto Faculty of Sciences (Porto, Portugal)
|
2019/05/05 | Enzyme reaction mechanisms | Master course of Bioinformatics (Q4025)
University of Porto Faculty of Sciences (Porto, Portugal)
|
2019/02/27 | Can enzyme reaction mechanisms solve real world problems? | Talks of the Department of Chemistry and Biochemistry
University of Porto Faculty of Sciences (Porto, Portugal)
|
2018/10/11 | Kinetic and Thermodynamic Characterization of Thiol-Disulfide Exchange: From Small Molecules to Molecular Machines | 44th International Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression (QUITEL 2018)
Centro de Extensión UC Pontificia Universidad Católica de Chile (Santiago de Chile, Chile)
|
2018/09/28 | Assessment and optimization of antidiabetic compounds through computational and experimental approaches | UCIBIO Annual Meeting 2018
NOVA University of Lisbon Faculty of Sciences and Technology (Lisboa, Portugal)
|
2018/04/19 | In silico search of novel compounds for the treatment of diabetes | Master course of Bioinformatics (Q4025)
University of Porto Faculty of Sciences (Porto, Portugal)
|
2017/06/26 | Atomistic Study of Enzyme Reaction Mechanisms through Computational Methods | 1st Meeting of Researchers from the Chemistry and Biochemistry Department
University of Porto Faculty of Sciences (Porto, Portugal)
|
2017/04/04 | Determination of Thermodynamic Quantities from MD simulations | Undergraduate course of Molelcular Simulation (Q3023)
University of Porto Faculty of Sciences (Porto, Portugal)
|
2015/04/27 | MD simulations to model Protein:Protein complexes | Undergraduate course of Computational Biological Chemistry (Q254)
University of Porto Faculty of Sciences (Porto, Portugal)
|
Orientação
Título / Tema Papel desempenhado |
Curso (Tipo) Instituição / Organização |
|
---|---|---|
2020/09/01 - 2021/11/11 | Enzymatic Technologies for Cleaning Petroleum with Low CO2 Emissions
Coorientador
|
Biochemistry (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal |
2019/02/01 - 2019/07 | Computational study of L-aromatic amino acid decarboxylase , an enzyme involved in the synthesis of the sleep-regulation hormone
melatonin
Orientador
|
Biochemistry (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal |
Organização de evento
Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação) |
Instituição / Organização | |
---|---|---|
2019/11/13 - 2019/12/31 | 9th Edition of the "Moléculas Magníficas" Art exhibition (2019/11/13 - 2019/12/31)
Exposição (Membro da Comissão Organizadora)
|
University of Porto - Casa Comum, Portugal |
2016/09/05 - 2016/10/01 | 11th Intensive Course of the European Master in Theoretical Chemistry and Computational Modelling (2016/09/05 - 2016/10/01)
Oficina (workshop) (Outra)
|
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
2016/02/17 - 2016/02/19 | 9ª Edição do Encontro de Investigação Jovem da Universidade do Porto (IJUP) (2016/02/17 - 2016/02/19)
Encontro (Outra)
|
Universidade do Porto, Portugal |
2015/05/13 - 2015/05/15 | 8ª Edição do Encontro de Investigação Jovem da Universidade do Porto (IJUP) (2015/05/13 - 2015/05/15)
Encontro (Outra)
|
Universidade do Porto, Portugal |
2012/05/04 - 2012/05/08 | COnvergent Distributed Environment for Computational Spectroscopy – European Cooperation in Science and Technology (CoDECS-COST)
Workshop (2012/05/04 - 2012/05/08)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
|
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal |
2010 - 2010/07/23 | Developer and supervisor of UJr Project: Química: Uma Ciência sem Fronteiras (2010/06/28 - 2010/07/23)
Outro (Outra)
|
Universidade do Porto, Portugal |
Participação em evento
Descrição da atividade Tipo de evento |
Nome do evento Instituição / Organização |
|
---|---|---|
2023/10/15 - 2023/10/18 | Invited general participant in the symposium US-EU Frontiers of Engineering 2023, to discuss cutting-edge developments in
four areas: The Quantum Era Challenge, Computational Era in Life Sciences and chemistry, Green Hydrogen and Future Directions
in Additive Manufacturing.
Simpósio
|
US-EU Frontiers of Engineering 2023
National Academy of Engineering, Estados Unidos
European Council of Applied Sciences, Technologies and Engineering, França Slovenian Academy of Engineering , Eslovénia |
2021/09/30 - 2021/10/01 | Participant in the 2nd TIMB3 Symposium entitled: "The Role of Dynamics in Biocatalysis and the Methods to Study it"
Simpósio
|
TIMB3 Mini Symposium: The Role of Dynamics in Biocatalysis and the Methods to Study it
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
|
2021/04/23 - 2021/04/24 | Participant in the Virtual Workshop entitled "Computer Simulation and Theory of Macromolecules"
Oficina (workshop)
|
Hünfeld 2021: Computer Simulation and Theory of Macromolecules
Max-Planck-Institut für Multidisziplinäre Naturwissenschaften, Alemanha
|
2017/07/09 - 2017/07/14 | Supervisor in the "School of Chemistry and Biochemistry"
Outro
|
School of Chemistry and Biochemistry
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2017/07/12 - 2017/07/12 | Participant in the "Workshop on Innovation and Intelectual Property"
Oficina (workshop)
|
Workshop on Innovation and Intelectual Property
REQUIMTE, Portugal
|
2015/07/06 - 2015/07/10 | Supervisor in the "School of Chemistry and Biochemistry"
Outro
|
School of Chemistry and Biochemistry
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2014/05/21 - 2014/05/23 | Attendant in the "3rd Annual CCP-BioSim Conference: Frontiers of Biomolecular Simulation"
Conferência
|
3rd Annual CCP-BioSim Conference: Frontiers of Biomolecular Simulation
The University of Edinburgh School of Chemistry, Reino Unido
|
2013/03/14 - 2013/03/17 | Participant in the "Science, Teaching and Innovation Fair of University of Porto"
Exposição
|
Science, Teaching and Innovation Fair of University of Porto
Universidade do Porto, Portugal
|
Júri de grau académico
Tema Tipo de participação |
Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização |
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---|---|---|
2024/01/22 | Enzymatic Synthesis of Amphiphilic Polymer-drug Conjugates for Cancer Treatment
Arguente principal
|
Pedro Miguel Reis Figueiredo (Doutoramento)
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
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2023/09/19 | Multiscalar strategies for the characterization of engineered P450 enzymes
Arguente principal
|
Jordi Soler i Parpal (Doutoramento)
Universitat de Girona, Espanha
Universitat de Girona Institut de Quimica Computacional i Catalisi, Espanha |
2018/10/01 | QM/MM Study of DszB Reaction Mechanism for Crude Oil Biodesulphurization
Arguente principal
|
João Pedro Marques de Sousa (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Revisão ad hoc de artigos em revista
Nome da revista (ISSN) | Editora | |
---|---|---|
2023 - Atual | Journal of Biomolecular Structure and Dynamics (1538-0254) | Taylor & Francis Inc |
2023 - Atual | Journal of Chemical Technology and Biotechnology (0268-2575) | John Wiley and Sons Ltd |
2022 - Atual | RSC Advances (2046-2069) | Royal Society of Chemistry |
2021 - Atual | Proteins: Structure, Function and Bioinformatics (1097-0134) | Wiley-Liss Inc. |
2019/01 - Atual | ACS Catalysis (2155-5435) | American Chemical Society |
2019/07 - 2019/09 | The Journal of Physical Chemistry (1541-5740) | American Chemical Society |
2018/12 - 2019/01 | Journal of Chemical Information and Modeling (1549-960X) | American Chemical Society |
2018/08/16 - 2018/09/05 | Chemistry - A European Journal (1521-3765) | Wiley (John Wiley & Sons) |
Tutoria
Tópico | Nome do aluno | |
---|---|---|
2022/10/01 - Atual | Development of new chiral stationary phases for liquid chromatography based on xanthone and polysaccharide derivatives by a rational approach | Rita Alexandra Ferreira Alves de Lima |
2022/06/01 - Atual | Computational study of the PET-degrading PE-H enzyme with QM/MM simulations | Samah Nassir |
2024/02/12 - 2024/05/28 | Modeling the interaction and the reaction mechanism of quinone reduction by bacterial sulfide:quinone reductase | Ana Luísa de Sousa Rocha |
2019/10 - 2022/09 | Computational Study of the Hydrolysis of PET catalysed by the enzyme PETase | Fanny Carola Jerves Vázquez |
2020/09/01 - 2021/11/11 | Enzymatic Technologies for Cleaning Petroleum with Low CO2 Emissions | Filipa Pinto de Barros Miranda |
2019/01 - 2021/05/19 | Understanding and Optimizing Extremozymes for Industrial Processes | Matilde Freitas Viegas |
2019/09 - 2019/12 | Development of novel bacterial transglycosylase inhibitors through computational chemistry | Kenneth Goossens |
2015/04 - 2018 | Fatty acid synthase enzyme - Catalytic mechanisms, | Fabiola Medina |
2017/09 - 2017/12 | Modified nucleosides as nucleoside kinases substrates. QM/MM studies on enzymatic activity | Samanta Makurat |
2016/09 - 2017/07 | QM/MM study of the reaction mechanism of glutredoxin | Sodiq Waheed |
2015/08 - 2016/12/31 | Reaction Mechanism of the oxidation of DBT by DszC studied by QM/MM calculations | Ana Catarina Barbosa |
2016/09 - 2016/12 | Computational Studies of the Mechanisms of Catalysis and Inhibition of Cysteine Proteases | Kemel Arafet |
2016/02 - 2016/05 | Rational design of tubulin binding agents with potential anticarcinogenic action | Matías Zuñiga |
2015/09 - 2015/12 | Computational studies on cytochrome P450 | Elisa Bernes |
2014/01 - 2014/07 | Estudo computacional da estabilidade de carbocatiões com métodos ab Initio | Maria Madalena Silva, Nádia Figueiredo, Olívia de Castro |
Distinções
Prémio
2008 | Prémio Doutor Mendonça Monteiro
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Outra distinção
2011 | PhD grant SFRH/BD/78397/2011
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|
2007 | Bolsa de mérito referente ao ano letivo 2006/2007
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|