José Marques Andrade (2717-8393-67F5)

Curriculum Vitae

José Marques Andrade

José Marques Andrade works in the fields of Microbiology and Molecular Biology, focused on RNA Biology. He has a solid background in RNA biology and protein manipulation and extensive knowledge on RNA-binding proteins and different RNA substrates, from the more labile mRNA to the more stable non-coding RNA. Dr. Andrade is dedicated to different aspects of RNA metabolism and in particularly, to the study of non-coding RNAs and their regulators in different bacteria. The main topic of Dr. Andrade's research has been the RNA metabolism, finding novel players and expanding the functions of RNA-binding proteins and non-coding RNAs, including rRNA and sRNA. For that, he studied both the Gram-negative Escherichia coli and the Gram-positive pathogen Listeria monocytogenes. Currently his work follows 2 main lines of interest: 1. Ribosomal RNA metabolism and Ribosome biogenesis His team has identified a novel function for the RNA chaperone Hfq as ribosome assembly factor. This expanded the regulatory spectrum of this RNA-binding protein beyond the most widely known function in promoting sRNA-mRNA basepairing. Hfq was found to bind to immature 30S ribosomal subunits, enriched in precursor 17S rRNA in what may constitute a checkpoint for ribosome assembly. Furthermore, recently we found that Hfq is involved in a novel RNA Quality control mechanism, together with RNase R, for the elimination of defective rRNA fragments. Hfq-like enzyme exist in human cells and may constitute a novel therapeutic target for ribosome-associated diseases, known as ribosomopathies. 2. RNA-binding proteins and ncRNAs in infection Dr. Andrade is also interested in the study of two important RNA-binding proteins involved in pathogenicity: the exoribonuclease PNPase and the RNA chaperone Hfq. We have demonstrated that knockout mutants of each of these factors result in the strong attenuation of virulence in the intracellular bacterial pathogen Listeria monocytogenes. We aim to use these mutants to identify new targets involved in infection pathways. This level of knowledge can ultimately be used to develop new antimicrobial strategies to tackle bacterial pathogens. Since 2015, José Andrade was Principal Investigator of 3 FCT funded projects. With an h-index of 15, José Andrade has over 1100 citations and a total of 18 published articles in leading journals in the fields of RNA biology, Molecular Biology and Microbiology, including The EMBO Journal, mBio and npj Biofilms and Microbiomes. At present, he is first author in 8 publications and signs as corresponding author in 6 articles and 3 book chapters, has over 30 oral comunications and 50 posters in international and national meetings. He was Guest Editor for a Special issue on "Analysis of Bacterial Ribosomes and interacting factors" in the Journal "Microorganisms" (2021-2022) and reviewer of several journals like PNAS, RNA, JBC, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology and Scientific Reports. José Andrade is committed to the advanced training of young scientists, and his supervisor activity includes the mentoring of 2 Postdoc, 6 Doctoral and 5 Master students, along several undergraduates. Dr Andrade and his team enjoy taking part in educational outreach programs, like the science events "ITQB Open Day", "Scientist goes to School", or the "Oeiras International Science Festival".

Ler resumo completo ↓

Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: José Marques Andrade

Nomes de citação

Andrade, José
José Marques Andrade
Andrade, J. M.
Andrade, José M.
Andrade, José Marques

Identificadores de autor

Ciência ID: 2717-8393-67F5
ORCID iD: 0000-0002-3716-2615

Telefones

Telefone

214469548 Ext.: 1548 (Profissional)

Moradas

ITQB NOVA, Av. da República, 2780-157, Oeiras, Oeiras, Portugal (Profissional)

Websites

https://www.itqb.unl.pt/labs/cge (Profissional)

Domínios de atuação

Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
Ciências Médicas e da Saúde - Ciências da Saúde - Doenças Infeciosas

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Francês	Utilizador elementar (A2)	Utilizador elementar (A2)	Utilizador elementar (A2)	Utilizador elementar (A2)	Utilizador elementar (A1)

Formação

	Grau	Classificação
2023/03/14 - 2023/03/16 Concluído	Professional Training Course in Radiological Protection and Safety - Level 3 (Outros) Especialização em Utilization of sealed sources and X-radiation generating devices AJL Testing Laboratory and Services , Portugal	16/20
2020/07/07 - 2020/10/23 Concluído	Team management and Emotional Inteligence (Outros) Instituto do Emprego e Formação Profissional, Portugal	Approved
2018/03/02 - 2018/03/14 Concluído	Certificate Felasa, Cat B - Animal Experimentation (Outros) Sociedade Portuguesa de Ciências em Animais de Laboratório, Portugal
2017/01/05 - 2017/01/06 Concluído	NOVA Doctoral School - Developing Supervisory Skills Course (Outros) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2008/01/01 - 2014/12/31 Concluído	FCT Postdoctoral fellowship - SFRH/BPD/48321/2008 (Pós-doutoramento) Especialização em Molecular Biology Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	n/a
2008/10/15 - 2008/12/31 Concluído	Posdoctoral fellowship - Project PTDC/SAL-MII/71454/2006 (Pós-doutoramento) Especialização em Biology Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal	n/a
2003/11/01 - 2008/10/03 Concluído	Biologia (Doutoramento) Especialização em Biology Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal "The role of exoribonucleases in growth phase control and their function in the degradation of RNA" (TESE/DISSERTAÇÃO)	Approved, unanimously
1996/09/15 - 2001/10/17 Concluído	Biologia Microbiana e Genética (Licenciatura) Especialização em Biology and Genetics Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal "Post-transcriptional control: the role of RNase R" (TESE/DISSERTAÇÃO)	16

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2022/01/01 - Atual	Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação)	Universidade Nova de Lisboa, Portugal
	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/01/15 - 2021/12/31	Pós-doutorado (Investigação)	Universidade Nova de Lisboa, Portugal
	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2015/01/15 - 2020/01/14	Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2015/11/30 - 2015/12/18	Investigador Auxiliar Convidado (carreira) (Investigação)	University of Hamburg - Institut for Biochemistry and Molecular Biology, Alemanha
	University of Hamburg - Institut for Biochemistry and Molecular Biology, Alemanha
2009/01/01 - 2014/12/31	Pós-doutorado (Investigação)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2010/08/16 - 2010/08/29	Investigador visitante (Investigação)	Institut Pasteur, França
	Institut Pasteur, França
2008/10/15 - 2008/12/31	Pós-doutorado (Investigação)	Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal
	Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal
2003/10/01 - 2003/12/31	Investigador (Investigação)	Institut de Biologie Physico-Chimique, França
	Institut de Biologie Physico-Chimique, França
2001/10/01 - 2003/10/31	Investigador (Investigação)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2018/10/03 - 2022/10/02	The RNA-binding protein Hfq interactome in the human pathogen Listeria monocytogenes PTDC/BIA-MIC/32525/2017 Investigador responsável Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2017/01/01 - 2020/12/31	An OMICS Network to Prevent and Control Infectious Diseases and Antimicrobial Resistance (ONEIDA) SAICTPAC/0015/2015 Investigador Pós-doutorado Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal	Concluído
2016/06/01 - 2020/02/29	An RNA-based approach to bacterial infection: The function of PNPase and regulatory noncoding RNAs in Listeria virulence PTDC/IMI-MIC/4463/2014 Investigador responsável Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2009/01/01 - 2014/12/31	Advances in the post-transcriptional control of bacterial non-coding RNAs SFRH/BPD/48321/2008 Bolseiro de Pós-Doutoramento Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2008/01/01 - 2011/03/31	Biochemical and Structural Studies of UDP-Glucose Dehydrogenases info:eu-repo/grantAgreement/FCT/3599-PPCDT/67925/PT Outra Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2008/01/01 - 2011/03/31	Elucidação do papel fundamental dos enzimas da família da RNase II no Metabolismo do RNA: Estudos Funcionais e Estruturais PTDC/BIA-MIC/71453/2006 Bolseiro de Pós-Doutoramento Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2008/10/15 - 2008/12/31	Enzimas como a RNase II e RNAs não codificantes e o seu papel na patogénese de Streptococcus pneumoniae PTDC/SAL-MIC/71454/2006 Bolseiro de Pós-Doutoramento Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2003/11/01 - 2008/10/14	The role of Exoribonucleases in growth phase control and their function in the degradation of RNA SFRH/BD/14382/2003 Bolseiro de Doutoramento Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Projeto

	Designação	Financiadores
2017/01/01 - 2020/12/31	ONEIDA: An Omics Network to Prevent and Control Infectious Diseases and Antimicrobial Resistance. SAICTPAC/0015/2015 LISBOA-01-0145-FEDER-016417 Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2015/01/15 - 2020/01/14	AN RNA-BASED APPROACH TO BACTERIAL INFECTION IF/00961/2014/CP1244/CT0012 Investigador responsável Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal	FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2011/01/01 - 2012/12/31	Strategic Project - LA 4 - 2011-2012 PEst-OE/EQB/LA0004/2011 Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal Universidade NOVA de Lisboa NOVA Medical School, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2008/01/01 - 2011/03/31	Estudos Bioquímicos e Estruturais em UDP-Glucose Desidrogenases PTDC/QUI/67925/2006 Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Produções

Publicações

Artigo em revista	Seixas, A. F.; Silva, Alda F. Q.; Arraiano, Cecília M.; Andrade, J. M.. "The RNA chaperone Hfq is critical for the oxidative stress response of Listeria monocytogenes through regulation of catalase expression". (2024): Submetido Quendera, Ana Patrícia; Pinto, Sandra Nunes; Pobre, Vânia; Antunes, Wilson; Bonifácio, Vasco D. B.; Arraiano, Cecília Maria; Andrade, José Marques. "The ribonuclease PNPase is a key regulator of biofilm formation in Listeria monocytogenes and affects invasion of host cells". npj Biofilms and Microbiomes 9 1 (2023): http://dx.doi.org/10.1038/s41522-023-00397-1. Acesso aberto • Publicado • 10.1038/s41522-023-00397-1 Seixas, André F.; Quendera, Ana P.; Sousa, João P.; Silva, Alda F. Q.; Arraiano, Cecília M.; Andrade, José M.. Autor correspondente: Andrade, José M.. "Bacterial Response to Oxidative Stress and RNA Oxidation". Frontiers in Genetics 12 (2022): http://dx.doi.org/10.3389/fgene.2021.821535. Publicado • 10.3389/fgene.2021.821535 dos Santos, Ricardo F.; Andrade, José M.; Pissarra, Joana; Deutscher, Murray P.; Arraiano, Cecília M.; Ricardo F. dos Santos; José M. Andrade; et al. "Hfq and RNase R Mediate rRNA Processing and Degradation in a Novel RNA Quality Control Process". mBio 11 5 (2020): http://dx.doi.org/10.1128/mbio.02398-20. Publicado • 10.1128/mbio.02398-20 Quendera, Ana P.; Seixas, André F.; dos Santos, Ricardo F.; Santos, Inês; Silva, João P. N.; Arraiano, Cecília M.; Andrade, José M.. "RNA-Binding Proteins Driving the Regulatory Activity of Small Non-coding RNAs in Bacteria". Frontiers in Molecular Biosciences 7 (2020): http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2020.00078. Publicado • 10.3389/fmolb.2020.00078 dos Santos, Ricardo F.; Arraiano, Cecília M.; Andrade, José M.. "New molecular interactions broaden the functions of the RNA chaperone Hfq". Current Genetics 65 6 (2019): 1313-1319. http://dx.doi.org/10.1007/s00294-019-00990-y. Publicado • 10.1007/s00294-019-00990-y Andrade, José M; Santos, Ricardo F; Chelysheva, Irina; Ignatova, Zoya; Arraiano, Cecília M. "The RNA-binding protein Hfq is important for ribosome biogenesis and affects translation fidelity". The EMBO Journal 37 11 (2018): http://dx.doi.org/10.15252/embj.201797631. Publicado • 10.15252/embj.201797631 dos Santos, Ricardo F.; Quendera, Ana P.; Boavida, Sofia; Seixas, André F.; Arraiano, Cecília M.; Andrade, José Marques. "Major 3'-5' Exoribonucleases in the Metabolism of Coding and Non-coding RNA". Progress in Molecular Biology and Translational Science 159 (2018): 101-155. Publicado • 10.1016/bs.pmbts.2018.07.005 Domingues, Susana; Moreira, Ricardo N.; Andrade, José M.; dos Santos, Ricardo F.; Bárria, Cátia; Viegas, Sandra C.; Arraiano, Cecília M.. "The role of RNase R in trans-translation and ribosomal quality control". Biochimie 114 (2015): 113-118. http://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2014.12.012. Publicado • 10.1016/j.biochi.2014.12.012 Saramago, Margarida; Bárria, Cátia; dos Santos, Ricardo F; Silva, Inês J; Pobre, Vânia; Domingues, Susana; Andrade, José M; Viegas, Sandra C; Arraiano, Cecília M. "The role of RNases in the regulation of small RNAs". Current Opinion in Microbiology 18 (2014): 105-115. http://dx.doi.org/10.1016/j.mib.2014.02.009. Publicado • 10.1016/j.mib.2014.02.009 Sesto, Nina; Touchon, Marie; Andrade, José Marques; Kondo, Jiro; Rocha, Eduardo P. C.; Arraiano, Cecilia Maria; Archambaud, Cristel; et al. "A PNPase Dependent CRISPR System in Listeria". PLoS Genetics 10 1 (2014): e1004065. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1004065. Publicado • 10.1371/journal.pgen.1004065 Andrade, José Marques; Pobre, Vânia; Arraiano, Cecília Maria. "Small RNA Modules Confer Different Stabilities and Interact Differently with Multiple Targets". PLoS ONE 8 1 (2013): e52866. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0052866. Acesso aberto • Publicado • 10.1371/journal.pone.0052866 Andrade, J.M.; Pobre, V.; Matos, A.M.; Arraiano, C.M.. "The crucial role of PNPase in the degradation of small RNAs that are not associated with Hfq". RNA 18 4 (2012): 844-855. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84858670765&partnerID=MN8TOARS. 10.1261/rna.029413.111 Matos, R.G.; Bárria, C.; Pobre, V.; Andrade, J.M.; Arraiano, C.M.. "Exoribonucleases as modulators of virulence in pathogenic bacteria.". Frontiers in cellular and infection microbiology 2 (2012): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84877836531&partnerID=MN8TOARS. Arraiano, Cecília M.; Andrade, José M.; Domingues, Susana; Guinote, Inês B.; Malecki, Michal; Matos, Rute G.; Moreira, Ricardo N.; et al. "The critical role of RNA processing and degradation in the control of gene expression". FEMS Microbiology Reviews 34 5 (2010): 883-923. http://dx.doi.org/10.1111/j.1574-6976.2010.00242.x. Publicado • 10.1111/j.1574-6976.2010.00242.x Andrade, José M.; Pobre, Vânia; Silva, Inês J.; Domingues, Susana; Arraiano, Cecília M.. "The Role of 3'-5' Exoribonucleases in RNA Degradation". Progress in Molecular Biology and Translational Science 85 (2009): 187-229. Publicado • 10.1016/s0079-6603(08)00805-2 Andrade, J.M.; Hajnsdorf, E.; Régnier, P.; Arraiano, C.M.. "The poly(A)-dependent degradation pathway of rpsO mRNA is primarily mediated by RNase R". RNA 15 2 (2009): 316-326. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-58249102413&partnerID=MN8TOARS. 10.1261/rna.1197309 Andrade, J.M.; Arraiano, C.M.. "PNPase is a key player in the regulation of small RNAs that control the expression of outer membrane proteins". RNA 14 3 (2008): 543-551. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-40449098228&partnerID=MN8TOARS. 10.1261/rna.683308 Andrade, Jose Marques; Cairrao, Fatima; Arraiano, Cecilia Maria. "RNase R affects gene expression in stationary phase: regulation of ompA". Molecular Microbiology 60 1 (2006): 219-228. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2958.2006.05092.x. Publicado • 10.1111/j.1365-2958.2006.05092.x
Artigo em revista (magazine)	Andrade, J. M.; Viegas, S. C.; Barbas, A.; Furtado, A-R.; Mesquita, F. S.; Abrantes, M. C.; Amblar, M.; Arraiano, C. M.. "RNAs, RNases e Controlo Pós-Transcricional da Expressão Génica", Boletim de Biotecnologia, 2005
Capítulo de livro	Sousa, João Pedro; Silva, Alda Filipa Queirós; Arraiano, Cecília Maria; Andrade, J. M.. Autor correspondente: Andrade, J. M.. "Bacterial Small RNAs: Diversity of Structure and Function". In RNA Structure and Function, editado por Barciszewski, J., 259-277. Springer International Publishing, 2023. Publicado • 10.1007/978-3-031-36390-0_12 Andrade, José M.; dos Santos, Ricardo F.; Arraiano, Cecília M.. "RNA Structure Analysis by Chemical Probing with DMS and CMCT". In Methods in Molecular Biology, editado por Tilman Heise, 209-223. New York, Estados Unidos: Springer US, 2020. Publicado • 10.1007/978-1-0716-0231-7_13 dos Santos, Ricardo F.; Bárria, Cátia; Arraiano, Cecília M.; Andrade, J. M.. Autor correspondente: Arraiano, Cecília M.. "Isolation and Analysis of Bacterial Ribosomes Through Sucrose Gradient Ultracentrifugation". In Methods in Molecular Biology, editado por Tilman Heise, 299-310. New York, Estados Unidos: Springer US, 2020. Publicado • 10.1007/978-1-0716-0231-7_19 Matos, Rute G.; Pobre, Vânia; Reis, Filipa P.; Malecki, Michal; Andrade, José M.; Arraiano, Cecília M.. "Structure and Degradation Mechanisms of 3' to 5' Exoribonucleases". In Nucleic Acids and Molecular Biology, editado por Allen W. Nicholson, 193-222. Springer Berlin Heidelberg, 2011. Publicado • 10.1007/978-3-642-21078-5_8 Barbas, A; Andrade, J. M.; Fialho, A. M.; Arraiano, C. M.. "Ribonucleases e Controlo Pós-Transcricional da Expressão Génica, Chapter 7". In O Mundo do RNA, Novos desafios e Perspectivas futuras, editado por Arsénio Fialho; Cecília Arraiano, 119-139. Lisboa, Portugal: LIDEL, 2007. Publicado
Poster em conferência	Pereira, Laura; Ana P. Quendera; Andrade, José M.; Marta M. Alves; Vasco D.B. Bonifácio; Pinto, Sandra. "Polycationic Core-shell Dendrimers are potential key players against planktonic and biofilm infections caused by Foodborne Pathogens". Trabalho apresentado em X Congresso Iberoamericano de Ciências Farmacêuticas, 2023. Alda Filipa Queirós Silva; André F. Seixas; Cecilia M. Arraiano; Andrade, José Marques. "Identification of novel functions of the RNA-binding protein Hfq in a human bacterial pathogen". Trabalho apresentado em 13th ITQB NOVA PhD Students’ Meeting, 2023. Pereira, Laura; Ana P. Quendera; Andrade, José M.; Marta M. Alves; Vasco D.B. Bonifácio; Pinto, Sandra. "Anti-biofilm and Anti-Adhesive effect of polycationic polyurea dendrimers (PURE) against Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em I International Meeting Molecules 4Life, 2023. Pereira, Laura; Ana P. Quendera; Andrade, José M.; Marta M. Alves; Vasco D.B. Bonifácio; Pinto, Sandra. "Core–shell polycationic polyurea pharmadendrimers are a potential alternative to fight planktonic and biofilm infections caused by Foodborne Pathogens.". Trabalho apresentado em XXVIII Encontro Nacional da SPQ, 2023. Silva, Alda Filipa Queirós; André F. Seixas; Cecilia M. Arraiano; Andrade, José M.. "Identification of novel functions of the RNA-binding protein Hfq in a human bacterial pathogen". Trabalho apresentado em SymbNET Summer School 2023, 2023. Pereira, Laura; Ana P. Quendera; Andrade, José M.; Marta M. Alves; Vasco D.B. Bonifácio; Sandra N. Pinto. "Combating biofilms of foodborne pathogens with antimicrobial dendrimers (Abstract selected for poster presentation)". Trabalho apresentado em 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 2023. Arraiano, Cecilia M.; Andrade, José M.; Bárria, Cátia; Costa, Susana M.; Costa, Vanessa G.; Cunha, Marta V.; Domingues, Susana; et al. Autor correspondente: Arraiano, Cecilia M.. "RNAs, RNA-binding Proteins and RNases: A World still Full of Surprises". Trabalho apresentado em LS4Future 1st General Meeting, 2023. Pereira, Laura; Ana P. Quendera; Andrade, José M.; Mil-Homens, Dalila; Marta M. Alves; Vasco D.B. Bonifácio; Sandra N. Pinto. "Fighting Biofilms of Foodborne Pathogens with Polycationic Core-shell Dendrimers". Trabalho apresentado em 2nd iBB Workshop, 2022. João Pedro Sousa; Silva, Alda Filipa Queirós; Arraiano, Cecília Maria; Andrade, José Marques. "A novel regulator of the bacterial oxidative stress response identified in a human pathogen". Trabalho apresentado em IUBMB-FEBS-PABMB Congress, 2022. Quendera, Ana Patrícia; Pinto, Sandra N.; Antunes, Wilson; Pobre, Vânia; Arraiano, Cecília Maria; Andrade, José Marques. "The RNA-binding protein PNPase regulates biofilm formation and virulence in Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em IUBMB-FEBS-PABMB Congress, 2022. André F. Seixas; Alda Filipa Queirós Silva; Arraiano, Cecília M.; Andrade, J. M.. "The oxidative stress response of Listeria monocytogenes is mediated by the RNA chaperone Hfq.". Trabalho apresentado em XXI National Congress of Biochemistry "Tunning Biochemistry with Life and Society", 2021. André F. Seixas; Silva, Alda F. Q.; Arraiano, Cecília M.; Andrade, José Marques. "The oxidative stress response of Listeria monocytogenes is mediated by RNA chaperon Hfq". Trabalho apresentado em XXI Congresso Sociedade Portuguesa de Bioquímica, 2021. Quendera, Ana Patrícia; Arraiano, Cecília M; Andrade, J. M.. "The RNA-binding protein PNPase is a novel regulator of biofilm formation and virulence in Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em The 45th FEBS Congress, 3-8 July 2021 (Virtual), 2021. Seixas, A. F.; Arraiano, Cecília M; Andrade, J. M.. "The RNA chaperone Hfq is involved in the oxidative stress response of Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em The 45th FEBS Congress, 3-8 July 2021 (Virtual), 2021. Quendera, Ana Patrícia; Sousa, Joao Pedro; Arraiano, Cecília M; Andrade, J. M.. "The RNA-binding protein PNPase is a novel regulator of biofilm formation and virulence in Listeria monocytogenes.". Trabalho apresentado em CIÊNCIA’21 - Encontro com a Ciência e Tecnologia em Portugal (Presencial/Virtual), 2021. André F. Seixas; Silva, AFQ; Arraiano, Cecilia; Andrade, J. M.. "The bacterial RNA chaperone Hfq is involved in the oxidative stress response of Listeria monocytogenes.". Trabalho apresentado em CIÊNCIA’21 - Encontro com a Ciência e Tecnologia em Portugal (Presencial/Virtual), 2021. André F. Seixas; Silva, Alda Filipa Queirós; Arraiano, Cecília M.; Andrade, José Marques. "The bacterial RNA chaperon Hfq is involved in the oxidative stress response of Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em Encontro Ciência e Tecnologia Portugal, 2021. Quendera, Ana Patrícia; Arraiano, Cecília M; Andrade, J. M.. "The RNA-binding protein PNPase is a novel regulator of biofilm formation and virulence in Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em Microbiology Society Annual Conference Online 2021 (Virtual), 2021. Seixas, A. F.; Arraiano, Cecília M; Andrade, J. M.. "The RNA chaperone Hfq is involved in the oxidative stress response of Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em Microbiology Society Annual Conference Online 2021 (Virtual), 2021. André F. Seixas; Arraiano, Cecília Maria; Andrade, J. M.. "The bacterial RNA chaperone Hfq is involved in the oxidative stress response of a human pathogen". Trabalho apresentado em 11th ITQB NOVA PhD Students´ Meeting, 2021. Quendera, Ana Patrícia; André F. Seixas; Inês Santos; dos Santos, Ricardo F.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.; Quendera, A. P.; Seixas, A. F.; Santos, I.. "A novel regulator of biofilm formation and virulence in the foodborne pathogen Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em 10th ITQB NOVA PhD Students´ Meeting, 2020. Seixas, A. F.; Quendera, A. P.; Silva, J. P. N.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.. "Elusive roles of an RNA chaperone in the membrane damage stress response". Trabalho apresentado em Congress of Microbiology and Biotechnology - MICROBIOTEC 2019 (Coimbra, Portugal), 2019. Andrade, J. M.; dos Santos, R. F.; Chelysheva, I.; Ignatova, Z.; Arraiano, C. M.. "The RNA-binding protein Hfq is important for ribosome biogenesis and affects translation fidelity". Trabalho apresentado em 24th Annual meeting of the RNA Society (Krakow, Poland), 2019. Quendera, A. P.; Seixas, A. F.; dos Santos, R. F.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.. "A genetic tool to boost the identification of non-coding RNAs". Trabalho apresentado em IV Genetics Workshop - Universidade NOVA de Lisboa (Lisboa, Portugal), 2019. Boavida, S.; dos Santos, R. F.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.. "A new toxin/antitoxin system involved in the stress response of Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em IV Genetics Workshop - Universidade NOVA de Lisboa (Lisboa, Portugal), 2019. Boavida, S.; dos Santos, R. F.; Quendera, A. P.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.. "Characterization of new stress response genes in Listeria monocytogenes.". Trabalho apresentado em 19th Biennial Meeting Society for Free Radical Research International/SFRRI (Lisboa, Portugal), 2018. dos Santos, R. F.; Andrade, J. M.; Chelysheva, I.; Ignatova, Z.; Arraiano, C. M.. "The RNA-binding protein Hfq is a novel assembly factor in ribosome biogenesis". Trabalho apresentado em 5th Meeting of Regulating with RNA in Bacteria & Archaea (Seville, Spain), 2018. Quendera, A. P.; Boavida, S.; dos Santos, R. F.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.. "Inactivation of PNPase as a genetic tool to identify non-coding RNAs". Trabalho apresentado em VIII National RNA Meeting: ptRNA2019 (Porto, Portugal), 2018. Boavida, S.; dos Santos, R. F.; Garcia, A. S.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.. "A new toxin-antitoxin system identified in the pathogen Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em XLI Jornadas Portuguesas de Genética (Aveiro, Portugal), 2017. dos Santos, R. F.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "The RNA chaperone Hfq is involved in ribosome biogenesis.". Trabalho apresentado em 7th ITQB NOVA PhD Meeting (Oeiras, Portugal), 2016. dos Santos, R. F.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "The RNA chaperone Hfq is involved in ribosome biogenesis.". Trabalho apresentado em EMBO Practical Course: Non-coding RNA in Infection (Wurzburg, Germany), 2016. Andrade, J. M.; Sesto, N.; Becavin, C.; Gouin, E.; Levy, A.; Sorek, R.; Cabanes, D.; Arraiano, C. M.; Cossart, P.. "PNPase controls iron metabolism and virulence in Listeria through regulation of Fur expression". Trabalho apresentado em Problems of Listeriosis ISOPOL XIX (Paris, France), 2016. Saramago, M.; Apura, P.; Barahona, S.; dos Santos, R. F.; Bárria, C.; Bravo, A. M.; Casinhas, J.; et al. "The role of RNases in the regulation of small RNAs.". Trabalho apresentado em Regulating with RNA in Bacteria and Archaea Conference (Cancun, Mexico), 2015. dos Santos, R. F.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "A novel protein complex involved in ribosome biogenesis and rRNA quality control". Trabalho apresentado em ERASMUS INTENSIVE PROGRAM "Towards a Scientific Career: Research in Biomedicine and Biotechnology – BIOMED-TECH" Second Edition (Granada, Spain), 2014. Quendera, A. P.; Seixas, A. F.; dos Santos, R. F.; Arraiano, C. M.; Andrade, J. M.. "PNPase as a tool to boost the identification of non-coding RNAs". Trabalho apresentado em Cell Symposia - Regulatory RNAs (Berlin, Germany), 2014. Pobre, V.; Andrade, J. M.; dos Santos, R. F.; Arraiano, C. M.. "The role of Hfq and RNA determinants in the degradation pathways of small non-coding RNAs". Trabalho apresentado em FEBS-ASM Workshop on Biology of RNA in host-pathogen interactions (Tenerife, Spain), 2014. Sesto, N.; Touchon, M.; Andrade, J. M.; Kondo, J.; Rocha, E. P. C.; Arraiano, C. M.; Archambaud, C.; et al. "Cas independent and PNPase dependent CRISPR processing in Listeria.". Trabalho apresentado em 3th Conference on “Regulating RNA in Bacteria (Wurzburg, Germany), 2013. Andrade, José Marques; Pobre, Vânia; Matos, A. M.; Arraiano, C.M.. "Important factors in small RNA degradation: contrasting roles of PNPase and Hfq in the regulation of non-coding RNAs". Trabalho apresentado em 4th EMBO meeting, 2012. Pobre, Vânia; Andrade, José Marques; Arraiano, C.M.. "Small RNA modules confer different stabilities and selectively choose among different targets". Trabalho apresentado em 2012 FEBS RNA Satellite Meeting, 2012. Pobre, V.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "The role of Hfq and RNA determinants in the degradation pathways of small non-coding RNAs". Trabalho apresentado em MICROBIOTEC 11 (Braga, Portugal), 2011. Pobre, V.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "Stability determinants of the regulatory small non-coding MicA RNA". Trabalho apresentado em 1st ITQB PhD Students’ Meeting (Oeiras, Portugal), 2010. Andrade, J. M.; Pobre, V.; Arraiano, C. M.. "Stability determinants of a small non-coding RNA". Trabalho apresentado em FASEB Post-transcriptional control of gene expression: Mechanisms of mRNA decay (Carefree, USA), 2010. Andrade, J. M.; Hajnsdorf, E.; Regnier, P.; Arraiano, C. M.. "RNase R is the main enzyme involved in the Poly(A)-dependent degradation of rpsO mRNA". Trabalho apresentado em 34th FEBS Congress (Prague, Czech Republic), 2009. Pobre, V.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "Characterization of the non-coding MicA RNA in Escherichia coli: mutational analysis shows that 3’ end controls stability of this sRNA". Trabalho apresentado em 34th FEBS Congress (Prague, Czech Republic), 2009. Andrade, J. M.; Matos, A. M.; Pobre, V.; Arraiano, C. M.. "PNPase is a key player in regulation of small non-coding RNAs that control omp expression". Trabalho apresentado em FASEB Research Conference: Post-Transcriptional Control of Gene Expression: Mechanisms of mRNA Decay (Lucca, Italy), 2008. Andrade, J. M.; Matos, A. M.; Pobre, V.; Arraiano, C. M.. "PNPase is a key player in the regulation of small non-coding RNAs". Trabalho apresentado em MICRO’07 BIOTEC’07 XXXIII JPG (Lisboa, Portugal), 2007. Andrade, J. M.; Matos, A. M.; Pobre, V.; Arraiano, C. M.. "PNPase is a key player in the regulation of small non-coding RNAs". Trabalho apresentado em RNA 2007 (Vimeiro, Portugal), 2007. Pobre, V.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "DEAD-box RNA Helicases: a role in non-coding RNA metabolism". Trabalho apresentado em RNA 2007 (Vimeiro, Portugal), 2007. Matos, A. M.; Andrade, J. M.; Pobre, V.; Arraiano, C. M.. "The RNA chaperone Hfq controls the stability of the non-coding MicA RNA". Trabalho apresentado em RNA 2007 (Vimeiro, Portugal), 2007. Matos, A.M.; Andrade, José Marques; Pobre, Vânia; Arraiano, C.M.. "The RNA Chaperone Hfq controls the stability of the small non-coding MicA". Trabalho apresentado em IV Encontro Nacional de RNA, 2007. Pobre, Vânia; Andrade, José Marques; Barbas, A.; Arraiano, C.M.. "RNA Helicases and non-coding RNA metabolism". Trabalho apresentado em IV Encontro Nacional de RNA, 2007. Mesquita, F. S.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "RNase R-affects the expression of deo operon involved in the nucleotide salvage pathway". Trabalho apresentado em Micro’05/Biotec’05 (Póvoa do Varzim, Portugal), 2005. Andrade, J. M.; Mesquita, F. S.; Régnier, P.; Arraiano, C. M.. "RNase R-Dependent Pathways of mRNA Turnover". Trabalho apresentado em EMBO – Workshop on Mechanisms and Regulation of mRNA turnover (Arolla, Switzerland), 2005. Andrade, J. M.; Freitas, R. A.; Tavares, R. M.; Arraiano, C. M.. "RNA processing by RNase R and Control of Gene Expression in Escherichia coli". Trabalho apresentado em XXXI Jornadas Portuguesas de Genética (Oeiras, Portugal), 2004. Andrade, J. M.; Cairrão, F.; Arraiano, C. M.. "The Role of RNase R in RNA processing and quality control in E. coli". Trabalho apresentado em Structure, function and dynamics of RNA-protein complexes (Gottingen, Germany), 2003. Arraiano, C. M.; Cairrão, F.; Andrade, J. M.. "RNase R and RNA metabolism: RNase R is a cold shock protein and is involved in the maturation of the quality control mediator SsrA/tmRNA". Trabalho apresentado em 8th Annual Meeting of the RNA Society (Vienna, Austria), 2003. Cairrão, F.; Amblar, M.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "The role of exoribonucleases in the control of mRNA decay in E. coli". Trabalho apresentado em 27th Meeting of the Federation of European Biochemical Societies in collaboration with the Pan-American Association for Biochemical Molecular Biology (Lisboa, Portugal), 2001.
Resumo em conferência	dos Santos, R. F.; Andrade, J. M.; Chelysheva, I.; Ignatova, Z.; Arraiano, C. M.. "Proceedings, FEBS Bio OPen - The RNA-binding protein Hfq is important for ribosome biogenesis and affects translation fidelity". Trabalho apresentado em 44th FEBS Congress, Krakow, 2019. Publicado • https://doi.org/10.1002/2211-5463.12674 Boavida, Sofia; dos Santos, Ricardo; Quendera, Ana; Arraiano, Cecilia; Andrade, José. "Proceedings, Journal of Free Radical Biology & Medicine: Characterization of new stress response genes in Listeria monocytogenes". Trabalho apresentado em 19th Biennial Meeting of Society for Free Radical Research International / Portuguese Biochemical Society, Lisboa, 2018. Publicado • 10.1016/j.freeradbiomed.2018.04.498 Andrade, J. M.; Pobre, V.; dos Santos, R. F.; Arraiano, C. M.. "Proceedings, FEBS J: Guard and protect versus seek and destroy the antisense: contrasting roles of Hfq and PNPase in the regulation of non-coding RNAs". Trabalho apresentado em 38th FEBS Congress, Saint Petersburg, 2013. Publicado • https://doi.org/10.1111/febs.12340 Pobre, V.; Andrade, J. M.; Arraiano, C. M.. "Proceedings, FEBS J: Characterization of the non-coding MicA RNA in Escherichia coli: mutational analysis shows that 3' end controls stability of this sRNA". Trabalho apresentado em 34th FEBS Congress, Prague, 2009. Publicado • https://doi.org/10.1111/j.1742-4658.2009.07049.x Andrade, J. M.; Hajnsdorf, E.; Régnier, P.; Arraiano, C.M.. "Proceedings, FEBS J: RNase R is the main enzyme involved in the poly(A)-dependent degradation of rpsO mRNA". Trabalho apresentado em 34th FEBS Congress, Prague, 2009. https://doi.org/10.1111/j.1742-4658.2009.07049.x
Tese / Dissertação	Andrade, J. M.. "The role of Exoribonucleases in Growth Phase Control and their function in the degradation of RNA". Doutoramento, Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, 2008. Andrade, J. M.. "Post-transcriptional control: The role of RNase R". Licenciatura, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2001.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2023/10/18	Expanding the functions of Hfq in Gram-positive bacteria - Role in the oxidative stress response of Listeria monocytogenes	13th ITQB NOVA PhD Student’s Meeting ITQB NOVA (Oeiras, Portugal)
2023/02/08	Riboregulators and virulence in the human pathogen Listeria monocytogenes	LS4Future (Associated Laboratory – Life Sciences for a Healthy & Sustainable Future) 1st General Meeting LS4FUTURE (Oeiras, Portugal)
2023/01/26	RNAs, RNA-binding Proteins and RNases: A World still Full of Surprises!	RNA in Disease - RiboMed Institute of Molecular Medicine (IMM) (Lisboa, Portugal)
2022/07/20	RNAs and RNases: A World still full of surprises	FASEB meeting - The Post-transcriptional Control of Gene Expression Conference: Mechanisms of RNA Decay, FASEB (Jupiter, Florida, Estados Unidos)
2022/07/13	Regulation of Catalase and PerR expression by the RNA chaperone Hfq unveils a novel pathway of the bacterial oxidative stress response	The 46th FEBS CONGRESS FEBS (Lisboa, Portugal)
2022/06/22	Expanding the roles of the bacterial RNA chaperone Hfq	FASEB meeting - The Post-transcriptional Control of Gene Expression Conference: Mechanisms of RNA Decay FASEB (Jupiter, Florida, Estados Unidos)
2022/05/12	The RNA-binding protein Hfq in rRNA metabolism and ribosome assembly	CBI RNA Biology Program (PICS RNA) Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III (Toulouse)
2022/04/22	The RNA-binding protein PNPase regulates biofilm formation and virulence in Listeria monocytogenes	12th ITQB NOVA PhD Students' Meeting ITQB NOVA (Oeiras, Portugal)
2021/10/14	The RNA-binding protein PNPase is a novel regulator of biofilm formation and virulence in Listeria monocytogenes.	XXI National Congress of Biochemistry "Tunning Biochemistry with Life and Society" Sociedade Portuguesa de Bioquimica (Évora)
2021/02/19	Seixas, A., Arraiano, C.M. & Andrade, J.M. The bacterial RNA chaperone Hfq is involved in the oxidative stress response of a human pathogen. 11th ITQB Nova PhD Students' Meeting (Virtual), 19 February 2021, Oeiras, Portugal.	11th ITQB Nova PhD Students' Meeting (Virtual) ITQB NOVA (Oeiras)
2021/01/12	The bacterial RNA chaperone Hfq is involved in the oxidative stress response of a human pathogen	DOCTORAL PROGRAM IN APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY Student's seminar Doctoral Program in Applied and Environmental Microbiology (online event, Portugal)
2020/02/12	An RNA-based approach to bacterial infection: PNPase controls iron metabolism and virulence in the human pathogen Listeria	SCAN Seminar series ITQB NOVA (Oeiras, Portugal)
2020/02/10	The Interactome of Hfq in the Human Pathogen Listeria monocytogenes	8 th WORKSHOP OF THE DOCTORAL PROGRAM IN APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2019/12/05	Quality control of stable RNA mediated by Hfq and RNase R	Congress of Microbiology and Biotechnology - MICROBIOTEC 2019 Sociedade Portuguesa de Microbiologia (Coimbra, Portugal)
2019/07/06	An RNA chaperone in the control of ribosome biogenesis and translation	Ciência 2019 – Encontro de Ciência e Tecnologia em Portugal Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Lisboa, Portugal)
2019/07/06	The RNA-binding protein Hfq is important for ribosome biogenesis and affects translation fidelity	44th FEBS Congress Federation of European Biochemical Societies (Krakow, Polónia)
2019/01/24	New roles for sRNAs, ribonucleases and RNA chaperones	VIII National RNA Meeting: ptRNA2019 i3S (Porto, Portugal)
2018/07/02	Dis3L2 and other RNase II-like proteins in Health and Disease	Encontro Ciência 2018 Fundação para a Ciência e a Tecnologia (Lisboa, Portugal)
2017/06/08	An RNA chaperone controlling ribosome biogenesis and translation fidelity	XLI Jornadas Portuguesas de Genética Sociedade Portuguesa de Genética (Aveiro, Portugal)
2016/12/08	The Sm-like protein Hfq is important for ribosome biogenesis and affects translational fidelity	XIX National Congress of Biochemistr Sociedade Portuguesa de Bioquímica (Guimarães, Portugal)
2016/07/10	The Sm-like protein Hfq is important for ribosome biogenesis and affects translational fidelity	Post-Transcriptional Control of Gene Expression: mRNA Decay FASEB - Federation of American Societies for Experimental Biology (Lisboa, Portugal)
2016/02/10	A novel CRISPR system found in the human pathogen Listeria	SCAN Seminar series ITQB NOVA (Oeiras, Portugal)
2015/05/25	A novel protein complex involved in ribosome biogenesis and rRNA quality control	XXXIX Jornadas Portuguesas da Genética Sociedade Portuguesa de Genética (Braga, Portugal)
2014/07/27	Regulating the regulators: Ribonucleases and the control of sRNAs	International Union of Microbiological Societies (IUMS 2014) International Union of Microbiological Societies (Montréal, Canadá)
2014/06/02	The non-coding genome and regulatory RNAs	EU Action Lifelong Learning Programme - ERASMUS INTENSIVE PROGRAMME: BIOMED-TECH Universidad de Granada (Granada, Espanha)
2013/07/03	Guard and protect versus Seek and destroy the antisense: contrasting roles of Hfq and PNPase in the regulation of non-coding RNAs	Young Scientists' Forum (YSF) 2013 Federation of European Biochemical Societies (St. Petersburg, Rússia)
2012/09/22	Important factors in small RNA degradation: contrasting roles of PNPase and Hfq in the regulation of small RNAs	The 4th EMBO Meeting European Molecular Biology Organization (Nice, França)
2011/05/09	Stability determinants of a small non-coding RNA: from computer to bench	RNA Bioinformatics (RNA11) – The Gulbenkian Training Programme in Bioinformatics Instituto Gulbenkian de Ciência (Oeiras)
2010/07/05	Stability determinants of the regulatory small non-coding MicA RNA	RNA Bioinformatics (RNA10) – The Gulbenkian Training Programme in Bioinformatics Instituto Gulbenkian de Ciência (Oeiras, Portugal)
2010/05/31	Stability determinants of the regulatory small non-coding MicA RNA	XXXV Portuguese Genetics Conference Sociedade Portuguesa de Genética (Braga, Portugal)
2009/11/05	RNase R is the main enzyme involved in the Poly(A)-dependent degradation of rpsO mRNA	RNA2009 - V Encontro Nacional de RNA Sociedade Portuguesa de Bioquímica (Carcavelos, Portugal)
2009/04/21	Escherichia coli RNase R degradation of mRNA	Workshop RNA degradation from prokaryotes to eukaryotes Professor Sarah Newbury, Brighton and Sussex Medical University (Brighton, Reino Unido)
2007/11/30	PNPase is a key player in the regulation of small non-coding RNAs	MICRO’07 BIOTEC’07 XXXIII Sociedade Portuguesa de Microbiologia (Lisboa, Portugal)
2007/11/11	Regulation of small non-coding RNAs by Ribonucleases in Escherichia coli	SCAN Seminar series ITQB NOVA (Oeiras, Portugal)
2004/06/26	RNR family and RNA metabolism: RNA processing, small RNAs and quality control	XXIX FEBS Congress Federation of European Biochemical Societies (Warsaw, Polónia)
2004/04/22	RNase R and RNA metabolism: RNA processing, small RNAs and quality control	EMBO Conference on Molecular Microbiology: Exploring Prokaryotic Diversity European Molecular Biology Organization (Heidelberg, Alemanha)
2003/11/24	The Role of RNase R in RNA processing and quality control in E. coli	The New Frontier of RNA Science RNA Society (Kyoto, Japão)
2002/12/05	The Role of RNase R in Post-transcriptional Control in Escherichia coli	XIII Congresso Nacional de Bioquímica Sociedade Portuguesa de Bioquímica (Lisboa, Portugal)
2002/07/06	Regulation of exonucleases and RNA stability in Escherichia coli	FASEB meeting on Post-transcriptional Control of Gene Expression: Effectors of mRNA Decay Federation of American Societies for Experimental Biology (Tucson, Estados Unidos)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2023/10/15 - Atual	Non-coding genome in bacterial virulence: characterization of regulatory RNAs in the human pathogen Listeria monocytogenes Orientador de Mariyana Todorova Vatova	Medical Microbiology (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2022/11/01 - Atual	The role of PNPase in the oxidative stress response of the human pathogen Listeria monocytogenes Orientador de João Pedro Abreu de Sousa	Molecular Biosciences (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2021 - Atual	Identification of novel functions of the RNA-binding protein Hfq in a human bacterial pathogen Orientador de Alda Filipa Queirós Oliveira e Silva	Molecular Biosciences (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2019 - Atual	The interactome of Hfq in the human pathogen Listeria monocytogenes Orientador de André Filipe Coimbra e Seixas	Biociências Moleculares (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2018 - 2023/11	Dechipering the role of ribonuclease PNPase in the human pathogen Listeria monocytogenes: Regulation of biofilms, cell invasion and stress response Orientador de Ana Patrícia Páscoa Quendera	Biociências Moleculares (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2021/10/01 - 2022/01/11	The RNA-binding protein Hfq is a new regulator of bacterial autoaggregation Orientador de João Carlos Guerreiro Rede	Master in Medical Microbiology (Universidade Nova de Lisboa) (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2018 - 2019	Project: Characterization of stress response genes in Listeria monocytogenes Orientador de Ana Sofia da Encarnação Boavida Paulo	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2018 - 2019	Project: Characterization of new stress response genes in Listeria monocytogenes Orientador de André Filipe Coimbra e Seixas	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2017 - 2018	Characterization of new genes involved in the stress response in Listeria monocytogenes Orientador de Ana Sofia da Encarnação Boavida Paulo	Microbiologia Médica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2017 - 2018	Project: Characterization of new stress response genes in Listeria monocytogenes Orientador de Ana Patrícia Páscoa Quendera	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2014 - 2018	More than a RNA matchmaker: expanding the roles of Hfq to ribosome biogenesis Coorientador de Ricardo Filipe da Cruz Duarte dos Santos	Biociências Moleculares (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2017 - 2017	Cloning and expression of a toxin-antitoxin system of Listeria monocytogenes Orientador de Beatriz Silva	Biologia Celular e Molecular (Outra) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017 - 2017	ITQB NOVA Summer Science Orientador de Ana Sofia Marques	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2017 - 2017	ITQB NOVA Summer Science Orientador de Margarida Trindade	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2016 - 2016	ITQB NOVA Summer Science Orientador de Ana Isidro	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2016 - 2016	ITQB NOVA Summer Science Orientador de Beatriz Silva	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2012 - 2013	New insights on ribosome biogenesis: The critical role of Hfq and RNase R on rRNA quality control Coorientador de Ricardo Filipe da Cruz Duarte dos Santos	Microbiologia Médica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2010 - 2012	Project: rRNA quality control Orientador de Joana Pissarra	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2008 - 2012	Interplay of exoribonucleases, Hfq and small RNAs structural determinants in the control of gene expression Coorientador de Vânia Sofia Fidalgo Pobre	Biociências Moleculares (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2006 - 2007	Characterization of the role of Hfq in the stability of the small RNA MicA Coorientador de Ana Margarida Matos	Microbiologia Médica (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2002 - 2003	RNase R post-transcriptional control of the deo operon Coorientador de Rui Freitas	Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2002 - 2003	The role of RNase R in the stationary phase of growth Coorientador de Rita Tavares	Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2015 - 2015	ITQB NOVA Alumni Wine & Cheese (2015 - 2015) Encontro (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2013 - 2013	ITQB NOVA OPen Day (2013 - 2013) Exposição (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2012 - 2012	FEBS RNA Satellite Meeting (2012 - 2012) Congresso (Membro da Comissão Organizadora)	Federation of European Biochemical Societies, Reino Unido
2007 - 2007	National RNA congress (2007 - 2007) Congresso (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2023/05/13 - 2023/05/13	Organizer and demonstrator of the stand 'Bacteria in stress' in the ITQB NOVA Open Day 2023 Aim: Talk about common stresses that bacteria face. Demonstrate the oxidative stress with hydrogen peroxide and present the catalase assay. Aimed to general public, all ages. Exposição	ITQB NOVA Open Day Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2021/11/26 - 2021/11/26	Science communication outreach event: "A Scientist goes to School" Outro	Science communication outreach event: "A Scientist goes to School" (EB1/JI Narcisa Pereira, Queijas, Oeiras) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/10/13 - 2021/10/17	Science communication outreach event: "Oeiras International Science Festival - FIC.A" Outro	Science communication outreach event: "Oeiras International Science Festival - FIC.A", Oeiras, Portugal Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2011 - 2011	Wellcome Trust Advanced course Oficina (workshop)	Protein Interactions and Networks Wellcome Sanger Institute, Reino Unido
2010/07/05 - 2010/07/07	RNA Bioinformatics Course Oficina (workshop)	The Gulbenkian Training Programme in Bioinformatics 11th edition Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2021/01/19	Interaction of Legionella pneumophila VipA effector protein with components of host cell endocytic pathway Arguente principal	Joana Isabel Freitas Saraiva (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Arbitragem científica em conferência

	Nome da conferência	Local da conferência
2017 - 2017	Lisbon area Postdoc Symposium	Postdoctoral associations ITQB/IGC/CEDOC

Arbitragem científica em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2021 - Atual	Microorganisms (Guest Editor: Analysis of Bacterial Ribosomes and interacting factors) (2076-2607)	MDPI
2021 - Atual	Non-coding RNA (reviewer) (2311-553X)	MDPI
2020 - Atual	Microorganisms (reviewer) (2076-2607)	MDPI
2020 - Atual	International Journal of Molecular Sciences (reviewer) (1422-0067)	MDPI
2014 - Atual	PLoS ONE (reviewer) (1932-6203)	Public Library of Science
2013 - Atual	RNA (reviewer) (1469-9001)	Cold Spring Harbor Laboratory

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2014 - Atual	The non-coding genome and regulatory RNAs	Biociências Moleculares (Doutoramento)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2013 - Atual	Introduction to Microbiology, Microbial Genetics and Recombinant DNA Technology	Microbiologia Médica (Mestrado)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2016 - 2018	Summer Science	ITQB NOVA Summer School (Outros)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2014 - 2014	ERASMUS Intensive Programme: BIOMED-TECH	Lifelong Learning Programme - ERASMUS (Postgraduate Certificate)	Universidad de Granada, Espanha

Membro de associação

	Nome da associação	Tipo de participação
2012/07/01 - Atual	RNA Society
2012 - Atual	Portuguese Biochemical Society

Membro de comissão

	Descrição da atividade Tipo de participação	Instituição / Organização
2015 - 2020	Selection Committee in the Doctoral Program in Applied and Environmental Microbiology; Institutional representant of ITQB NOVA. Membro	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2018 - 2018	NOVAHealth - promotion of Health related research; Institutional representant of ITQB NOVA Membro	Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2013 - 2013	Organizer: ITQB NOVA OPen Day - Science communication to the general public Coordenador	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Outro júri / avaliação

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2021/09/01 - 2021/09/21	Invited Grant Evaluator of the National Science Centre Poland. Funding scheme: PRELUDIUM-20	Narodowe Centrum Nauki, Polónia
2018 - 2018	Chairperson: 3rd Joint Biotecnico/AEM PhD Programs workshop	Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2017 - 2017	Chairperson: 8th ITQB NOVA PhD Students' Meeting - Session 1: Human diseases	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2017 - 2017	Chairperson: Career Opportunities for PostDoctoral Researchers in Life Sciences	Postdoctoral associations ITQB NOVA/IGC/CEDOC, Portugal
2016 - 2016	Chairperson: 7th ITQB NOVA PhD Students' Meeting - Session 5: Pathogenesis	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal

Revisão ad hoc de artigos em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2024 - Atual	Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS)	National Academy of Sciences (NAS)
2023 - Atual	Biochemical Society Transactions	Biochemical Society
2023 - Atual	Frontiers in Microbiology	Frontiers
2022 - Atual	mBio	ASM
2021 - Atual	Scientific Reports	Nature Group
2020 - Atual	Journal of Biological Chemistry (JBC)	American Society for Biochemistry and Molecular Biology
2020 - Atual	Frontiers in Cellular and Infection Microbiology	Frontiers

Tutoria

	Tópico	Nome do aluno
2016 - Atual	Doctoral thesis advisory committee	Moritz Sorg
2018 - 2023	Doctoral Thesis advisory committee	Patrícia Sequeira

Distinções

Prémio

2007	Best oral communication - MICROBIOTEC 2007 Sociedades Portuguesas de Microbiologia, Biotecnologia e Genética, Portugal
2001	PRODEP III Grant Governo da República Portuguesa, Portugal European Social Fund, Bélgica

Outra distinção

2013	Travel Grant - YSF/FEBS Young Scientist Forum / Federation of European Biochemical Societies, Reino Unido
2012	Travel Grant - EMBO European Molecular Biology Organization, Alemanha
2011	Travel Grant - Wellcome Trust Wellcome Trust, Reino Unido
2010	Travel Grant - Gulbenkian Foundation Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal
2006	Travel Grant - Luso-American Foundation Fundação Luso-Americana, Portugal