Ricardo Filipe Serrote Ramiro (4A14-602C-71EC)

Curriculum Vitae

Ricardo Filipe Serrote Ramiro

Ricardo Ramiro obtained a PhD in Evolutionary biology in 2012 from the University of Edinburgh (UK). He has authored a total of 17 articles, 1 editorial, 2 reviews and 14 research papers in international peer-reviewed journals. Of these he has been the first author in 6, being the corresponding author in all of these. He has an h-index of 13, with an average of 39 citations per publication (Google Scholar, February 2023). He has been attributed 2 competitive fellowships, 2 competitive projects and collaborated in multiple projects as a team member. He has given 2 invited oral presentations, received 3 awards; peer-reviewed for 14 journals; taught 5 courses and co-organized 6 international research conferences. Throughout his career, he has applied ecological and evolutionary approaches to understand host-microbe interactions. He has studied how the ecological context, both in vitro and in vivo, affects the adaptation and phenotypic strategies of malaria parasites (Plasmodium) and commensal bacteria (Escherichia coil). Throughout his career, he has generally used a multidisciplinary approach and worked at the interaction between experimental, bioinformatic and theoretical approaches. This has allowed him to acquire a diverse set of skills in statistics (eg. (generalized) linear mixed models); programming (R/bash) and bioinformatics. Over the past 8 years, Ricardo has focused on developing his skills in bioinformatics, which led to his recruitment as a post-doc within the ONEIDA project (in 2020), where he focused on microbiome analysis and comparative genomics. Currently, Ricardo is the director of the Data Management and Risk Analysis department at the InnovPlantProtect CoLab, where he coordinates a team of PhD and MSc researchers applying bioinformatics, machine learning and mathematical modelling to plant-pathogen interactions. His research interests lie in the host-pathogen and host-microbiome interactions, from the individual to the population scale. His main aim is to create knowledge and develop tools that can help increase agricultural productivity in concert with environmental sustainability.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Ricardo Filipe Serrote Ramiro

Nomes de citação

Ramiro, Ricardo S

Identificadores de autor

Ciência ID: 4A14-602C-71EC
ORCID iD: 0000-0002-4834-6997

Endereços de correio eletrónico

ricardo.ramiro@iplantprotect.pt (Profissional)

Domínios de atuação

Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)
Espanhol; Castelhano	Utilizador elementar (A1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador elementar (A1)	Utilizador elementar (A1)

Formação

	Grau	Classificação
2008/04/01 - 2012/11/30 Concluído	PhD in Evolutionary Biology (Doctor of Philosophy) Especialização em Evolutionary Biology The University of Edinburgh School of Biological Sciences, Reino Unido "Evolution and ecology of malaria parasites: from mating to mixed-species infections" (TESE/DISSERTAÇÃO)	Approved
2002/09 - 2007/08/02 Concluído	Licenciatura em Biologia (Licenciatura) Especialização em Biology Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias, Portugal "Evolutionary ecology of transmission in rodent malaria parasites: how social and environmental factors influence sexual reproduction?" (TESE/DISSERTAÇÃO)	16 (0-20)

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2020/01/01 - 2020/12/31	Pós-doutorado (Investigação)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

2017/04/01 - 2019/12/31	Pós-doutorado (Investigação)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

2016/01/01 - 2017/03/31	Pós-doutorado (Investigação)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

2012/09/01 - 2015/12/31	Pós-doutorado (Investigação)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2007/09/01 - 2007/10/31	Investigador Contratado (Investigação)	The University of Edinburgh, Reino Unido
	The University of Edinburgh Institute of Evolutionary Biology, Reino Unido
2006/11/01 - 2007/05/01	Estagiário de Investigação (Investigação)	The University of Edinburgh, Reino Unido
	The University of Edinburgh Institute of Evolutionary Biology, Reino Unido

Cargos e Funções

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2021/01/01 - Atual	Director de Unidade Orgânica	InnovPlantProtect CoLab, Portugal
	InnovPlantProtect CoLab, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2023/09/01 - 2026/08/31	AlmondProtect: Diagnóstico, epidemiologia, monitorização e previsão das principais doenças que afetam o amendoal: Uma proposta sustentável e integrada PD23-00014 InnovPlantProtect CoLab, Portugal Universidade de Évora, Portugal	Fundação 'la Caixa' Fundação para a Ciência e Tecnologia Em curso
2023/01/01 - 2025/12/31	Pacto da Bioeconomia Azul C64491566400000026 Investigador	Governo da República Portuguesa European Union Em curso
2023/01/01 - 2025/12/31	InsectERA C64491739300000032 Investigador	Governo da República Portuguesa European Union Em curso
2023/01/01 - 2025/12/31	SNM_XylellaVt - Sistema Nacional de Monitorização de Insetos Vetores da Xylella fastidiosa NA Investigador	European Union Governo da República Portuguesa Em curso
2022/09/01 - 2025/08/31	AlViGen: Creation of a genomic surveillance hub for diseases in agriculture in Alentejo (Portugal) PD21-00081 Investigador responsável InnovPlantProtect CoLab, Portugal Universidade de Évora, Portugal	BPI Fundação para a Ciência e Tecnologia Em curso
2023/01/01 - 2023/12/31	MoniTREEng – Monitorização da saúde, produtividade e regeneração natural dos Quercus sp. 181575 Investigador InnovPlantProtect CoLab, Portugal	European Union Concluído
2022/12/01 - 2023/12/31	ABC - AgriBioCircular ABC_065 Investigador InnovPlantProtect CoLab, Portugal	Concluído
2021/09/01 - 2022/05/31	DIMAP: A digital ecosystem for integrated disease management in pear orchards 818182 Investigador responsável InnovPlantProtect CoLab, Portugal	European Union Em curso
2017/01/01 - 2020/12/31	An OMICS Network to Prevent and Control Infectious Diseases and Antimicrobial Resistance (ONEIDA) SAICTPAC/0015/2015 Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal	Concluído
2017/04 - 2020/03	Causes and consequences of high mutation rates within the gut microbiota SFRH/BPD/119110/2016 Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal	Fundação para a Ciência e Tecnologia
2008/04 - 2012/04	Evolution and Ecology of Malaria Parasites: from Mating to Mixed-Species Infections SFRH/BD/39960/2007	Fundação para a Ciência e Tecnologia

Projeto

	Designação	Financiadores
2019 - 2020	In vivo Long Term Evolution of a commensal in the Gut Microbiota 623877 Bolseiro de Pós-Doutoramento Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal	The Global Grants for Gut Health (by Yakult and Nature Research)
2016/01/31 - 2017/03/31	Predictability in Evolution CRC 1310 Bolseiro de Pós-Doutoramento Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal	German Science Foundation: COOPERATION AGREEMENT COLOGNE; Fundação Calouste Gulbenkian/ Universidade de Colónia
2012/09/01 - 2015/12/31	Microbial adaptation within ecosystems ECOADAPT-260421 Bolseiro de Pós-Doutoramento Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal	European Research Council
2008 - 2012	Understanding phenotypic plasticity in the reproductive strategies of malaria parasites WT082234MA Bolseiro de Doutoramento The University of Edinburgh, Reino Unido	Wellcome Trust
2007/09/01 - 2007/10/31	Evolution of mating tactics and reproductive strategies in protozoan parasites NE/E000886/1 Investigador The University of Edinburgh, Reino Unido	Natural Environment Research Council

Produções

Publicações

Artigo em revista	Manisha Sanjay Sirsat; Paula Rodrigues Oblessuc; Ricardo S. Ramiro. "Genomic Prediction of Wheat Grain Yield Using Machine Learning". Agriculture (2022): https://doi.org/10.3390/agriculture12091406. 10.3390/agriculture12091406 Debanjan Mukherjee; Ângelo Ferreira Chora; Jean-Christophe Lone; Ricardo S. Ramiro; Birte Blankenhaus; Karine Serre; Mário Ramirez; et al. "Host lung microbiota promotes malaria-associated acute respiratory distress syndrome". Nature Communications (2022): https://doi.org/10.1038/s41467-022-31301-8. 10.1038/s41467-022-31301-8 Dapa, Tanja; Ramiro, Ricardo S; Pedro, Miguel F; Gordo, Isabel; Xavier, Karina. "Diet leaves a genetic signature in a keystone member of the gut microbiota". Cell Host & Microbe 30 2 (2022): 183-199.e10. http://dx.doi.org/10.1016/j.chom.2022.01.002. 10.1016/j.chom.2022.01.002 André A. Santos; Marta B. Afonso; Ricardo S. Ramiro; David Pires; Madalena Pimentel; Rui E. Castro; Cecília M.P. Rodrigues. "Host miRNA-21 promotes liver dysfunction by targeting small intestinal Lactobacillus in mice". Gut Microbes 12 1 (2020): 1840766-1840766. https://doi.org/10.1080/19490976.2020.1840766. 10.1080/19490976.2020.1840766 Durão, Paulo; Ramiro, Ricardo S; Cátia Pereira; Jernej Juric; Delfina Pereira; Gordo, Isabel. "Radial expansion facilitates the maintenance of double antibiotic resistances". Antimicrobial Agents and Chemotherapy (2020): http://dx.doi.org/10.1128/aac.00668-20. 10.1128/aac.00668-20 Ricardo S. Ramiro; Paulo Durão; Claudia Bank; Isabel Gordo. "Low mutational load and high mutation rate variation in gut commensal bacteria". PLOS Biology (2020): https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3000617. 10.1371/journal.pbio.3000617 Ana Sousa; Ricardo S. Ramiro; João Barroso-Batista; Daniela Güleresi; Marta Lourenço; Isabel Gordo. "Recurrent Reverse Evolution Maintains Polymorphism after Strong Bottlenecks in Commensal Gut Bacteria". Molecular Biology and Evolution 34 11 (2017): 2879-2892. https://doi.org/10.1093%2Fmolbev%2Fmsx221. 10.1093/molbev/msx221 Sousa, A.; Frazão, N.; Ramiro, R.S.; Gordo, I.. "Evolution of commensal bacteria in the intestinal tract of mice". Current Opinion in Microbiology 38 (2017): 114-121. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85020043148&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.mib.2017.05.007 Ricardo S. Ramiro; Henrique Costa; Isabel Gordo. "Macrophage adaptation leads to parallel evolution of genetically diverse Escherichia coli small-colony variants with increased fitness in vivo and antibiotic collateral sensitivity". Evolutionary Applications 9 8 (2016): 994-1004. https://doi.org/10.1111/eva.12397. 10.1111/eva.12397 Ramiro, R.S.; Pollitt, L.C.; Mideo, N.; Reece, S.E.. "Facilitation through altered resource availability in a mixed-species rodent malaria infection". Ecology letters 19 9 (2016): 1041-1050. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84981524620&partnerID=MN8TOARS. 10.1111/ele.12639 Lourenço, M.; Ramiro, R.S.; Güleresi, D.; Barroso-Batista, J.; Xavier, K.B.; Gordo, I.; Sousa, A.. "A Mutational Hotspot and Strong Selection Contribute to the Order of Mutations Selected for during Escherichia coli Adaptation to the Gut". PLoS Genetics 12 11 (2016): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85000644795&partnerID=MN8TOARS. 10.1371/journal.pgen.1006420 Ramiro, R.S.; Khan, S.M.; Franke-Fayard, B.; Janse, C.J.; Obbard, D.J.; Reece, S.E.. "Hybridization and pre-zygotic reproductive barriers in Plasmodium". Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 282 1806 (2015): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84929497732&partnerID=MN8TOARS. 10.1098/rspb.2014.3027 Miskinyte, M.; Sousa, A.; Ramiro, R.S.; de Sousa, J.A.M.; Kotlinowski, J.; Caramalho, I.; Magalhães, S.; Soares, M.P.; Gordo, I.. "The Genetic Basis of Escherichia coli Pathoadaptation to Macrophages". PLoS Pathogens 9 12 (2013): 1-15. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84892897486&partnerID=MN8TOARS. 10.1371/journal.ppat.1003802 Ramiro, R.S.; Reece, S.E.; Obbard, D.J.. "Molecular evolution and phylogenetics of rodent malaria parasites". BMC Evolutionary Biology 12 1 (2012): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84868712208&partnerID=MN8TOARS. 10.1186/1471-2148-12-219 Ramiro, R.S.; Alpedrinha, J.; Carter, L.; Gardner, A.; Reece, S.E.. "Sex and death: The effects of innate immune factors on the sexual reproduction of malaria parasites". PLoS Pathogens 7 3 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79953277575&partnerID=MN8TOARS. 10.1371/journal.ppat.1001309 Reece, S.E.; Ramiro, R.S.; Nussey, D.H.. "Plastic parasites: Sophisticated strategies for survival and reproduction?". Evolutionary Applications 2 1 (2009): 11-23. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-66049091891&partnerID=MN8TOARS. 10.1111/j.1752-4571.2008.00060.x
Artigo em revista (magazine)	Ana Sousa; Ramiro, Ricardo; Isabel Gordo. "Ecology and evolution of the host-microbiota duet", REVISTA do GRUPO INFECÇÃO E SEPSIS, 2017
Poster em conferência	Dapa, Tanja; Ramiro, Ricardo S; Miguel F. Pedro; Gordo, Isabel; Karina B. Xavier. "Nutritional regimes leave genetic signature in keystone member of gut microbiota". Trabalho apresentado em World Microbe Forum, an ASM & FEMS Collaboration, 2021.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2023/10/27	Microbiome analysis as a service in agriculture: challenges and opportunities	2nd Microbiome PT Summit (Portugal)
2018	Insisting on the error: On the emergence and maintenance of high mutation rates within the gut microbiota	Annual Meeting of the Portuguese Genetics Society Portuguese Genetics Society (Porto, Portugal)
2017	Insisting on the error: On the emergence and maintenance of high mutation rates within the gut microbiota	Post-doc seminar at Instituto Gulbenkian de Ciência Instituto Gulbenkian de Ciência (Oeiras, Portugal)
2015	Small but mighty: genetic and phenotypic basis of Escherichia coli small-colony variants	Post-doc seminar at Instituto Gulbenkian de Ciência Instituto Gulbenkian de Ciência (Oeiras, Portugal)
2015	Small but mighty: genetic and phenotypic basis of Escherichia coli small-colony variants	EMBO Workshop: Measuring intraspecies diversity using highthroughput sequencing European Molecular Biology Organization (Oeiras, Portugal)
2012	Sex and species recognition in Plasmodium	50th Spring Meeting of the British Society for Parasitology British Society for Parasitology (Glasgow, Reino Unido)
2011	Facilitation through altered resource availability in a mixed-species rodent malaria infection	Evolution of Infectious Diseases: Integrating Empirical Data and Modeling Approaches National Evolutionary Synthesis Center (Durham, Estados Unidos)
2010	Sex in Malaria Parasites: the Ecology and Evolution of Species Recognition	12th International Congress of Parasitology World Federation of Parasitology (Melbourne, Austrália)
2009	Sexual reproduction in malaria parasites: hybridization and the effects of innate immune factors	Luso-American Development Foundation Malaria Conference Luso-American Development Foundation (Lisbon, Portugal)
2008	Sexual reproduction in malaria parasites: hybridization and the effects of innate immune factors	XIV European Meeting for PhD Students in Evolutionary Biology (Einsiedeln, Suiça)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2023/09/01 - 2024/06/30	Desenvolvimento de um grafo de conhecimento para um sistema de recomendação de agentes de controle biológico contra patógenos de plantas Coorientador	Mestrado em Engenharia Informática (Mestrado) Universidade de Lisboa, Portugal
2021/09/01 - 2022/12/01	Modeling the dynamics of leafhopper pest in vineyards Orientador	Mestrado em Estatística para Ciência de Dados (Mestrado) Universidade do Minho, Portugal
2018 - 2018	Effect of phages on mutation rate	IGC Undergraduate Summer School (Curso de aperfeiçoamento / especialização) Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2012 - 2013	Macrophage adapted Escherichia coli Small Colony Variants are Genetically Diverse and Present Antagonistic Pleiotropy for Antibiotic Resistance Orientador	Masters in Evolutionary Biology and Development (Mestrado) Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2011 - 2011	Competition and red blood cell preference in malaria parasites Coorientador	Biology honors (Licenciatura/Bacharelato) The University of Edinburgh, Reino Unido
2011 - 2011	Competition and red blood cell preference in malaria parasites Coorientador	Biology honors (Licenciatura/Bacharelato) The University of Edinburgh, Reino Unido
2010 - 2010	Competition and life-history evolution in malaria parasites Coorientador	Biology Honors (Licenciatura/Bacharelato) The University of Edinburgh, Reino Unido
2009 - 2009	Effect of nitric oxide on the fertility of malaria parasites Coorientador	Biology Honors (Licenciatura/Bacharelato) The University of Edinburgh, Reino Unido

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2017 - 2018	IGC symposium 2018: Microbial Eco-Evolutionary Dynamics (2018/10/22 - 2018/10/24) Conferência (Coorganizador)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2016 - 2018	Evolution club: I organized a journal club, involving 5 research groups from Instituto Gulbenkian de Ciência that are working in evolutionary biology (the different groups have expertise in different areas, from experimental work to the development of theory and bioinformatics methods). (2016 - 2018) Encontro (Coorganizador)
2014 - 2014	X national Meeting in Evolutionary Biology (2014/12 - 2014/12) Conferência (Coorganizador)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2013 - 2013	IX national Meeting in Evolutionary Biology (2013/12 - 2013/12) Conferência (Coorganizador)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2013 - 2013	IGC Post-doctoral meeting (2013/10 - 2013/10) Conferência (Coorganizador)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2012 - 2012	VIII National Meeting in Evolutionary Biology (2012/12 - 2012/12) Conferência (Coorganizador)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2018 - 2018	ONEIDA Genomics Workshop Oficina (workshop)	ONEIDA Genomics Workshop Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2015 - 2015	EMBO Workshop: Measuring Intra-Species Diversity Using High-Throughput Sequencing Oficina (workshop)	EMBO Workshop: Measuring Intra-Species Diversity Using High-Throughput Sequencing European Molecular Biology Organization, Alemanha
2015 - 2015	Forecasting Evolution? conference Conferência	Forecasting Evolution? conference Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2013 - 2013	XIV European Society of Evolutionary Biology Meeting Conferência	XIV European Society of Evolutionary Biology Meeting
2012 - 2012	XII European Society of Evolutionary Biology Meeting Conferência
2011 - 2011	Silwood Statistics R language Course Oficina (workshop)	Silwood Statistics R language Course Imperial College London Department of Life Sciences, Reino Unido
2011 - 2011	VII National Meeting in Evolutionary Biology Conferência	VII National Meeting in Evolutionary Biology
2011 - 2011	Jacques Monod Conference: Coevolutionary arms race between parasite virulence and host immune defence: challenges from state of the art research Conferência
2011 - 2011	VII BioMalPar: Biology and Pathology of the Malaria Parasite Conferência	European Molecular Biology Laboratory, Itália
2009 - 2009	47th Spring Meeting of the British Society for Parasitology
2009 - 2009	Centre for Immunity, Infection and Evolution winter symposium: What limits host range? Conferência	Centre for Immunity, Infection and Evolution winter symposium: What limits host range? The University of Edinburgh, Reino Unido
2009 - 2009	Summer Meeting of the Association for the Study of Animal Behaviour Conferência	Summer Meeting of the Association for the Study of Animal Behaviour University of Oxford, Reino Unido
2008/04 - 2008/04	Animal Handling Course Oficina (workshop)	Animal Handling Course The University of Edinburgh, Reino Unido
2008 - 2008	Winter Meeting of the Association for the Study of Animal Behaviour Conferência	The University of Edinburgh, Reino Unido

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2015	Helicobacter hepaticus colonization in mice: newborn tolerance properties and distribution throughout the gut Arguente principal	Masters in Evolutionary Biology and Development (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2018 - Atual	Scientific Reports (2045-2322)	Springer Nature
2018 - Atual	Nature Microbiology (2058-5276)	Springer Nature
2018 - Atual	Cell Host & Microbe (1931-3128)	Elsevier
2016 - Atual	Infectious Diseases of Poverty (2049-9957)	Springer (Biomed Central Ltd.)
2016 - Atual	Molecular and Biochemical Parasitology (0166-6851)	Elsevier
2015 - Atual	Biology Letters (1744-957X)	The Royal Society
2013 - Atual	Malaria Journal (1475-2875)	Springer (Biomed Central Ltd.)
2012 - Atual	Evolution
2011 - Atual	Parasitology (1469-8161)	Cambridge University Press
2011 - Atual	Infection Genetics and Evolution (1567-1348)	Elsevier
2010 - Atual	Behavioral Ecology and Sociobiology (1432-0762)	Springer-Verlag
2010 - Atual	Ecological Entomology (1365-2311)	Wiley (Blackwell Publishing)
2010 - Atual	Parasitology International (1383-5769)	Elsevier
2018 - 2018	PLoS Biology (1545-7885)	Public Library of Science

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2018 - 2018	Taught a class (1h) on the course: Genomics Microbiomes and Parasites	Masters in molecular Technologies in Health	Instituto Politécnico de Lisboa Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa, Portugal
2015 - 2015	Taught a class (2h) on the Instituto Gulbenkian de Ciência PhD programme.	(Doutoramento)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2014 - 2014	I was involved in the development and teaching of the workshop: “Inspirar a ciência: ensinar biologia evolutiva a professores do ensino secundário”. In this workshop, we created a series of theoretical and pratical classes to demonstrate several key principles of evolutionary biology to high school biology teachers.	(Outros)	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2011 - 2011	Taught a class (1.5h) on the course: Evolutionary Ecology of Hosts and Parasites (4th year biology students)		The University of Edinburgh, Reino Unido
2009 - 2011	Evolution in Action	Biology (Bachelor (1.º ciclo de estudos))	The University of Edinburgh, Reino Unido

Entrevista (jornal / revista)

	Descrição da atividade	Jornal / Forum
2016	Resistência de bactérias aos antibióticos e ao sistema imunitário está interligada	SIC Notícias
2016	Ratinhos explicam por que resistem as bactérias	TVI24
2016	Resistência de bactérias aos antibióticos e ao sistema imunitário está interligada	SAPO
2016	Resistência de bactérias aos antibióticos e ao sistema imunitário está interligada	Diário de Notícias
2016	Investigação confirma relação entre resistência de bactérias a antibióticos e ao sistema imunitário	Jornal do Enfermeiro
2016	Macrophages Induce Antibiotic Resistance	BioTechniques
2016	Cuando los parásitos de malaria trabajan en equipo, las consecuencias son peores	Scientific American

Membro de associação

	Nome da associação	Tipo de participação
2018 - Atual	European Society for Evolutionary Biology
2012 - Atual	Portuguese Association for Evolutionary Biology

Membro de comissão

	Descrição da atividade Tipo de participação	Instituição / Organização
2012/10 - 2013/10	Comité de pós-doutorandos do Instituto Gulbenkian de CiÊncia Membro
2008 - 2011	“Press Gang”: a group of researchers whose aim was to help other researchers writing press releases Membro	The University of Edinburgh, Reino Unido

Outro júri / avaliação

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2020/06/01 - 2021/06/30	Research Topic Invited Editor for Frontiers in Genetics and Frontiers in Microbiology. Topic title: Eco-evolutionary Processes within Microbial Communities

Distinções

Prémio

2011	James Rennie Bequest Travel Grant The University of Edinburgh, Reino Unido
2010	British Society for Parasitology Travel Grant
2010	Silver Sponsorship Primerdesign Ltd, Reino Unido