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JOSÉ MARIA FERNANDES received the B.Sc. and M.Sc. degrees in computer science from the University of Porto, Porto, in 1996 and 1998 respectively, and the Ph.D. degree in electrical engineering in 2010 from the University of Aveiro, Aveiro, Portugal. He is currently an Assistant Professor in programming and software engineering at the University of Aveiro, Aveiro, Portugal, and a Senior Researcher at IEETA (http://www.ieeta.pt), Aveiro, Portugal. His current interest is focused on the use of IT solutions for pervasive and distributed monitoring real-world scenarios to support decision/action. Currently, he has been focus on helping spatiotemporal characterization of human behavioral responses in real world (gait analysis, stress scenarios) and better understand city-wide patterns (traffic and environment) supported on data from buses telemetry & distributed sensors in the city of Porto.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
José Maria Fernandes

Nomes de citação

  • Fernandes, José

Identificadores de autor

Ciência ID
5B14-7FA6-5767
ORCID iD
0000-0002-0681-9354

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2007
Concluído
 PhD Programme in Electric Engineering (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal
"EpiGauss: spatio-temporal characterization of brain activity in Epilepsy" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Muito Bom
1998
Concluído
 Mestrado em Ciência de Computadores / Master in Computer Science (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"“MAGOO – Metodologia baseada em Agentes e Orientada por Objectos para resolução de Problemas Distribuídos: uma aplicação à gestão de trânsito" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Muito Bom
1996
Concluído
 N/A (Licenciatura)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"N/A" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 15
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
1998/09/01 - Atual Investigador (Investigação) Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2008/02/01 - Atual Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade de Aveiro, Portugal
2010/08/15 - 2011 Professor Visitante (Docente Universitário) Carnegie Melon University, Estados Unidos
2007/01/01 - 2008 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Aveiro, Portugal
2001 - 2007 Assistente Convidado (Docente Universitário) Universidade de Aveiro, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2011/10/12 - 2013 Local coordinator - CMU-Portugal program Universidade de Aveiro, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2013/07 - 2015/10 Movement Disorders in Autistic Spectrum Disorders
Provided by PTCRIS: 125388
PTDC/NEU-SCC/0767/2012
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Desporto, Portugal

Centro Hospitalar Universitário do Porto EPE, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2007/11 - 2010/11 Neural correlates of object recognition: structure-function correlations within the visual ventral stream, striatal and limbic circuits in health and disease
Provided by PTCRIS: 67381
PTDC/PSI/67381/2006
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade do Algarve Centro de Investigação Tecnológica do Algarve, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2007/04 - 2010/03 BING -Brain Imaging Network Grid
Provided by PTCRIS: 81833
GRID/GRI/81833/2006
Universidade de Aveiro, Portugal

Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal

Universidade do Minho, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2005/09 - 2008/09 EpilBI - Epileptogenic focus localization in a 3D multimodal Brain Imaging system.
Provided by PTCRIS: 60977
POSC/EEA-CPS/60977/2004
Universidade de Aveiro, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2002/01 - 2005/01 Topo3D: Statistical Topographic Analysis of 3D Spatial and Temporal Distribution of Epileptic Spikes and its Sources in Realistic Brain Models
Provided by PTCRIS: 39758
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2000/10 - 2003/09 Movement Quantification in Epilepsy: A new contribution for epileptic seizures classification
Provided by PTCRIS: 33802
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2001/05 - 2002/05 Functional and Morphologic Data Fusion for Epileptogenic Foci Localisation in Severe Epilepsies: Development and validation of a non-invasive methodology
Provided by PTCRIS: 1200
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Projeto

Designação Financiadores
2021/01/01 - 2025/12/31 Health Research Network: From Lab to Community Health
10.54499/LA/P/0053/2020
Universidade do Porto Unidade de Investigação e Desenvolvimento Cardiovascular, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal

Instituto Português de Oncologia do Porto Francisco Gentil EPE, Portugal

Universidade do Algarve, Portugal

Universidade da Madeira, Portugal

Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Instituto Português de Oncologia do Porto Francisco Gentil Centro de Investigação, Portugal

Universidade de Lisboa Centro Cardiovascular da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Centro de Investigação em Tecnologias e Serviços de Saúde, Portugal

Associação para a Investigação e Desenvolvimento da Faculdade de Medicina, Portugal

Escola Superior de Enfermagem do Porto, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31 Intelligent Systems Associate Laboratory
LA/P/0104/2020
10.54499/LA/P/0104/2020
Universidade do Minho, Portugal

Universidade do Minho Centro ALGORITMI, Portugal

Universidade do Porto Centro de Matemática, Portugal

Universidade do Porto Laboratório de Inteligência Artificial e Ciência de Computadores, Portugal

Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Unidade de Investigação e Desenvolvimento em Engenharia Mecânica e Industrial, Portugal

Instituto Politécnico do Cávado e do Ave, Portugal

Instituto Politécnico do Porto Instituto Superior de Engenharia do Porto, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Centro de Tecnologias e Sistemas, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade de Aveiro Centro de Tecnologia Mecânica e Automação, Portugal

Universidade de Coimbra Centro de Informatica e Sistemas, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Universidade do Minho Instituto de Polímeros e Compósitos, Portugal

Instituto Politécnico do Porto Grupo de Investigação em Engenharia e Computação Inteligente para a Inovação e o Desenvolvimento, Portugal

Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal

Instituto Politécnico do Porto Centro de Investigação em Sistemas Computacionais Embebidos e de Tempo-Real, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2023/03/01 - 2024/08/31 Emotional Modulation in Pain Assessment
2022.05005.PTDC
Universidade de Aveiro, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2020/06/15 - 2023/06/14 Comprehensive safety solution for people with Aphasia
AAL/0006/2019
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/03/01 - 2021/02/28 S2MovingCity: Sensing and Serving a Moving City
CMUP-ERI/TIC/0010/2014
Provided by PTCRIS: 138564
Instituto de Telecomunicações Lisboa, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 Institute of Electronics and Informatics Engineering of Aveiro
UID/CEC/00127/2019
Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade de Aveiro Instituto de Engenharia Eletrónica e Informática de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2014/07/15 - 2019/06/30 VR2Market: Towards a Mobile Wearable Health Surveillance Product for First Response and other Hazardous Professions
CMUP-ERI/FIA/0031/2013
Provided by PTCRIS: 135791
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Portugal

Instituto de Telecomunicações Lisboa, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013/07/01 - 2015/09/30 VitalResponder 2.0: Intelligent management of critical events of stress, fatigue and smoke intoxication in forest firefighting
PTDC/EEI-ELC/2760/2012
Provided by PTCRIS: 128713
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Instituto de Telecomunicações Lisboa, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2011/01/01 - 2013/12/31 Projecto Estratégico - UI 127 - 2011-2012
PEst-C/EEI/UI0127/2011
Universidade de Aveiro, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2009/07/01 - 2012/12/31 MISC - Massive Information Scavenging with Intelligent Transportation Systems
MIT-Pt/TS-ITS/0059/2008
Provided by PTCRIS: 83944
Instituto de Telecomunicações Lisboa, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2009/07/01 - 2012/12/31 Vital Responder: Monitoring Stress among First Responder Professionals
CMU-PT/CPS/0046/2008
Provided by PTCRIS: 83886
Universidade de Aveiro, Portugal

Instituto de Telecomunicações Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2007/10/01 - 2010/12/31 MovEpil3D - 3D movement quantification in epilepsy
PTDC/SAU-BEB/72305/2006
Provided by PTCRIS: 72305
Universidade de Aveiro, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2007/09/01 - 2010/08/31 GERES-med: Grid-Enabled REpositorieS for medical applications
GRID/GRI/81819/2006
Provided by PTCRIS: 81819
Universidade de Aveiro, Portugal

Instituto Nacional de Engenharia Biomédica, Portugal

Centro Hospitalar Universitário do Porto EPE, Portugal

Centro Hospitalar de Vila Nova de Gaia Espinho EPE, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
1999/10/01 - 2002/02/28 ANÁLISE DE COMPLEXIDADE EM CRISES EPILÉPTICAS
PRAXIS XXI/BD/19676/99
Universidade de Aveiro, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
1997/02/01 - 1999/01/31 SISTEMA DE APOIO À DECISÃO PARA A HIPOCOAGULAÇÃO ORAL
PRAXIS XXI/BIC/12256/96
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Diogo Martins; Martim Neves; Bernardo Marques; Susana BráS; José Maria Fernandes. "Immerse Yourself in a Fight Against your Fears: A Vision for using Virtual Reality Serious Games and Physiology Assessment in Phobia Treatment". 2023.
    10.1145/3626705.3631781
  2. Jose Maria Fernandes. "Toward Supporting Communication for People with Aphasia: The In-Bed Scenario". 2022.
    10.1145/3528575.3551431
  3. De Matos, F.L.; Fernandes, J.M.; Sampaio, C.; MacEdo, J.; Coelho, M.C.; Bandeira, J.. "Development of an information system for cycling navigation". 2021.
    10.1016/j.trpro.2021.01.012
  4. Guimaraes, A.; Rocha, A.P.; Santana, L.; Oliveira, I.C.; Fernandes, J.M.; Silva, S.; Teixeira, A.. "Enhanced Communication Support for Aphasia Using Gesture Recognition: The Bedroom Scenario". 2021.
    10.1109/ISC253183.2021.9562810
  5. Cruz, R.; Bandeira, J.; Vilaça, M.; Rodrigues, M.; Fernandes, J.M.; Coelho, M.. "Introducing new criteria to support cycling navigation and infrastructure planning in flat and hilly cities". 2020.
    10.1016/j.trpro.2020.03.081
  6. Carvalho, J.; Oliveira, I.C.; Fernandes, J.M.. "PhisioStream: On the use of general-purpose log management and streams processing software stacks for first-responders monitoring". 2019.
    10.1109/ENBENG.2019.8692491
  7. Vilas-Boas, M.D.C.; Rocha, A.P.; Choupina, H.M.P.; Cardoso, M.; Fernandes, J.M.; Coelho, T.; Cunha, J.P.S.. "TTR-FAP Progression Evaluation Based on Gait Analysis Using a Single RGB-D Camera". 2019.
    10.1109/EMBC.2019.8857354
  8. Pereira, J.; Sargento, S.; Fernandes, J.M.. "Decision support dashboard for traffic and environment analysis of a smart city". 2018.
  9. Areias, B.; Humberto, N.; Guardalben, L.; Fernandes, J.M.; Sargento, S.. "Towards an automated flying drones platform". 2018.
  10. Rupino, P.; Fernandes, J.M.. "Foreword to the 6th Portuguese Software Engineering Doctoral Symposium (SEDES 2016)". 2017.
    10.1109/QUATIC.2016.055
  11. Vilas-Boas, M.D.C.; Rocha, A.P.; Choupina, H.M.P.; Fernandes, J.M.; Coelho, T.; Cunha, J.P.S.. "The first Transthyretin Familial Amyloid Polyneuropathy gait quantification study - Preliminary results". 2017.
    10.1109/EMBC.2017.8037087
  12. Sebastião, R.; Sorte, S.; Valente, J.; Miranda, A.I.; Fernandes, J.M.. "Inhalation during fire experiments: An approach derived through ECG". 2016.
    10.1145/2968219.2968284
  13. Cunha, J.P.S.; Rocha, A.P.; Choupina, H.M.P.; Fernandes, J.M.; Rosas, M.J.; Vaz, R.; Achilles, F.; et al. "A novel portable, low-cost kinect-based system for motion analysis in neurological diseases". 2016.
    10.1109/EMBC.2016.7591199
  14. Rocha, A.P.; Choupina, H.; Fernandes, J.M.; Rosas, M.J.; Vaz, R.; Cunha, J.P.S.. "Kinect v2 based system for Parkinson's disease assessment". 2015.
    10.1109/EMBC.2015.7318601
  15. Cruz, T.; Bras, S.; Soares, S.C.; Fernandes, J.M.. "Monitoring physiology and behavior using Android in phobias". 2015.
    10.1109/EMBC.2015.7319206
  16. Silva, L.M.; Fernandes, J.M.; Oliveira, I.C.. "LIMBus: A lightweight remote monitoring system powered by iOS and BLE". 2015.
    10.4108/icst.mobiquitous.2015.260249
  17. Santos, P.; Sargento, S.; Fernandes, J.M.. "VANESS: DNS for nomadic users in vehicular networks". 2015.
    10.4108/icst.mobiquitous.2015.260262
  18. Magalhães, T.; Oliveira, I.C.; Fernandes, J.M.. "Message based integration in Cyber-Physical System: Firefighters in the field". 2015.
    10.4108/icst.mobiquitous.2015.260246
  19. Aguiar, A.; Soares, E.; Brandão, P.; Magalhães, T.; Fernandes, J.M.; Oliveira, I.. "Demo: Wireless IP mesh on Android for fire-fighters monitoring". 2014.
    10.1145/2645672.2645692
  20. Oliveira, F.; Sargento, S.; Fernandes, J.M.; Cardote, A.. "REINVENT: Accessing vehicular networks in mobile applications". 2014.
    10.1109/ISCC.2014.6912606
  21. Brás, S.; Fernandes, J.M.; Cunha, J.P.S.. "ECG delineation and morphological analysis for firefighters tasks differentiation". 2013.
    10.1109/CBMS.2013.6627856
  22. Rocha, A.P.; Pereira, O.; Ribeiro, D.; Fernandes, J.M.; Cunha, J.P.S.. "MonitorMe: Online video monitoring for first responders using a smartphone". 2013.
    10.1109/HealthCom.2013.6720774
  23. Marques, F.; Azevedo, P.; Cunha, J.P.S.; Cunha, M.B.; Brás, S.; Fernandes, J.M.. "FIREMAN: Firefighter team breathing management system using android". 2013.
    10.1145/2493988.2494339
  24. Colunas, M.F.M.; Amaral Fernandes, J.M.; Oliveira, I.C.; Silva Cunha, J.P.. "DroidJacket: An android-based application for first responders monitoring". 2011.
  25. Colunas, M.F.M.; Fernandes, J.M.A.; Oliveira, I.C.; Silva Cunha, J.P.. "Droid Jacket: Using an Android based smartphone for team monitoring". 2011.
    10.1109/IWCMC.2011.5982868
  26. Ribeiro, D.M.D.; Colunas, M.F.M.; Marques, F.A.F.; Fernandes, J.M.; Cunha, J.P.S.. "A real time, wearable ECG and continous blood pressure monitoring system for first responders". 2011.
    10.1109/IEMBS.2011.6091736
  27. Pedrosa, M.; Alves, L.; Oliveira, I.; Femandes, J.M.; Cunha, J.P.S.. "A system architecture for the bing brain image network grid". 2009.
  28. Al-Rawi, M.S.; Fernandes, J.M.; Tafula, S.; Cunha, J.P.S.. "Association analysis of biosignals using self organizing maps". 2009.
    10.1007/978-3-642-03882-2-576
  29. Fernandes, J.M.; Tafula, S.M.; Brandão, S.; Bastos-Leite, A.J.; Ramos, I.; Cunha, J.P.S.. "Video-EEG-fMRI: Contribution of in-bore video for the analysis of motor activation paradigms". 2009.
    10.1007/978-3-642-03882-2-209
  30. Silva Cunha, J.P.; Vollmar, C.; Fernandes, J.M.; Noachtar, S.. "Automated epileptic seizure type classification through quantitative movement analysis". 2009.
    10.1007/978-3-642-03882-2-380
  31. Kustra, J.L.; Fernandes, J.M.; Cunha, J.P.S.. "EEG-fMRI ballistocardiogram removal: A new non-linear dynamic time warping approach". 2008.
    10.1007/978-3-540-69367-3-75
  32. Andrade, R.; Oliveira, I.; Fernandes, J.M.; Cunha, J.P.S.. "A grid framework for non-linear brain fMRI analysis". 2007.
  33. Silva Cunha, J.P.; Vollmar, C.; Li, Z.; Fernandes, J.; Feddersen, B.; Noachtar, S.. "Movement quantification during epileptic seizures: A new technical contribution to the evaluation of seizure semiology". 2003.
Artigo em revista
  1. Maria do Carmo Vilas-Boas; Ana Patrícia Rocha; Hugo Miguel Pereira Choupina; Márcio Neves Cardoso; José Maria Fernandes; Teresa Coelho; João Paulo Silva Cunha. "Portable RGB-D Camera-Based System for Assessing Gait Impairment Progression in ATTRv Amyloidosis". Applied Sciences (2022): https://doi.org/10.3390/app122010203.
    10.3390/app122010203
  2. Vilas-Boas, M.D.C.; Rocha, A.P.; Cardoso, M.N.; Fernandes, J.M.; Coelho, T.; Cunha, J.P.S.. "Corrigendum: Clinical 3-D gait assessment of patients with polyneuropathy associated with hereditary transthyretin amyloidosis (Front. Neurol., (2020), 11, 605282, 10.3389/fneur.2020.605282)". Frontiers in Neurology 13 (2022): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85137265755&partnerID=MN8TOARS.
    10.3389/fneur.2022.980597
  3. Raquel Sebastião; Sandra Sorte; José M. Fernandes; Ana I. Miranda. "Classification of Critical Levels of CO Exposure of Firefigthers through Monitored Heart Rate". Sensors (2021): https://doi.org/10.3390/s21051561.
    10.3390/s21051561
  4. Fernandes, José. "Supporting the Assessment of Hereditary Transthyretin Amyloidosis Patients Based On 3-D Gait Analysis and Machine Learning". IEEE Transactions on Neural Systems and Rehabilitation Engineering (2021): 1-1. http://dx.doi.org/10.1109/tnsre.2021.3096433.
    10.1109/tnsre.2021.3096433
  5. Vilas-Boas, M.D.C.; Rocha, A.P.; Cardoso, M.N.; Fernandes, J.M.; Coelho, T.; Cunha, J.P.S.. "Clinical 3-D Gait Assessment of Patients With Polyneuropathy Associated With Hereditary Transthyretin Amyloidosis". Frontiers in Neurology 11 (2020): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85097304023&partnerID=MN8TOARS.
    10.3389/fneur.2020.605282
  6. Maria do Carmo Vilas-Boas; Ana Patrícia Rocha; Hugo Miguel Pereira Choupina; Márcio Neves Cardoso; José Maria Fernandes; Teresa Coelho; João Paulo Silva Cunha. "Validation of a Single RGB-D Camera for Gait Assessment of Polyneuropathy Patients". Sensors 19 22 (2019): 4929-4929. https://doi.org/10.3390/s19224929.
    10.3390/s19224929
  7. Vilas-Boas, Maria do Carmo; Choupina, Hugo Miguel Pereira; Rocha, Ana Patrícia; Fernandes, José Maria; Cunha, João Paulo Silva. "Full-body motion assessment: Concurrent validation of two body tracking depth sensors versus a gold standard system during gait". Journal of Biomechanics (2019): http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiomech.2019.03.008.
    10.1016/j.jbiomech.2019.03.008
  8. Brás, Susana; Soares, Sandra C.; Cruz, Telmo; Magalhães, Tiago; Marques, Bernardo; Dantas, Cláudia; Fernandes, Nuno; Fernandes, José Maria. "The feasibility of an augment reality system to study the psychophysiological correlates of fear-related responses". Brain and Behavior 8 9 (2018): e01084. http://dx.doi.org/10.1002/brb3.1084.
    10.1002/brb3.1084
  9. Rocha, Ana Patrícia; Choupina, Hugo Miguel Pereira; Vilas-Boas, Maria do Carmo; Fernandes, José Maria; Cunha, João Paulo Silva. "System for automatic gait analysis based on a single RGB-D camera". PLOS ONE 13 8 (2018): e0201728. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0201728.
    10.1371/journal.pone.0201728
  10. Sebastião, Raquel; Sorte, Sandra; Valente, Joana; Miranda, Ana I.; Fernandes, José Maria. "Detecting changes in the heart rate of firefighters to prevent smoke inhalation and health effects". Evolving Systems (2018): http://dx.doi.org/10.1007/s12530-018-9241-0.
    10.1007/s12530-018-9241-0
  11. Cunha, J.P.S.; Choupina, H.M.P.; Rocha, A.P.; Fernandes, J.M.; Achilles, F.; Loesch, A.M.; Vollmar, C.; Hartl, E.; Noachtar, S.. "NeuroKinect: A novel low-cost 3Dvideo-EEG ystem for epileptic seizure motion quantification". PLoS ONE 11 1 (2016): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84958211363&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0145669
  12. Brás, S.; Soares, S.C.; Moreira, R.; Fernandes, J.M.. "BeMonitored: Monitoring psychophysiology and behavior using Android in phobias". Behavior Research Methods 48 3 (2016): 1100-1108. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84984620370&partnerID=MN8TOARS.
    10.3758/s13428-015-0633-9
  13. Rocha, A.P.; Choupina, H.; Fernandes, J.M.; Rosas, M.J.; Vaz, R.; Silva Cunha, J.P.. "Parkinson's disease assessment based on gait analysis using an innovative RGB-D camera system". Conference proceedings : ... Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual Conference 2014 (2014): 3126-3129. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84946005382&partnerID=MN8TOARS.
    10.1109/EMBC.2014.6944285
  14. Donnet, S.; Bartolo, R.; Fernandes, J.M.; Cunha, J.P.S.; Prado, L.; Merchant, H.. "Monkeys time their pauses of movement and not their movement-kinematics during a synchronization-continuation rhythmic task". Journal of Neurophysiology 111 10 (2014): 2138-2149. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84896765298&partnerID=MN8TOARS.
    10.1152/jn.00802.2013
  15. Silva Cunha, J.P.; Rémi, J.; Vollmar, C.; Fernandes, J.M.; Gonzalez-Victores, J.A.; Noachtar, S.. "Upper limb automatisms differ quantitatively in temporal and frontal lobe epilepsies". Epilepsy and Behavior 27 2 (2013): 404-408. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84876150519&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.yebeh.2013.02.026
  16. Ribeiro, D.M.; Colunas, M.F.; Marques, F.A.; Fernandes, J.M.; Cunha, J.P.. "A real time, wearable ECG and continous blood pressure monitoring system for first responders.". Conference proceedings : ... Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Conference (2011): 6894-6898. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84055224132&partnerID=MN8TOARS.
  17. Fernandes, J.M.; Da Silva, A.M.; Huiskamp, G.; Velis, D.N.; Manshanden, I.; De Munck, J.C.; Lopes Da Silva, F.; Silva Cunha, J.P.. "What does an epileptiform spike look like in MEG? Comparison between coincident EEG and MEG spikes". Journal of Clinical Neurophysiology 22 1 (2005): 68-73. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-13244272143&partnerID=MN8TOARS.
    10.1097/01.WNP.0000150999.67749.6D
Capítulo de livro
  1. Cunha, J.P.S.; Rodrigues, S.; Dias, D.; Brandão, P.; Aguiar, A.; Oliveira, I.; Fernandes, J.M.; et al. "VitalResponder®: Wearable wireless platform for vitals and body-area environment monitoring of first response teams". 387-416. 2019.
Livro
  1. Santana, L.; Rocha, A.P.; Guimarães, A.; Oliveira, I.C.; Fernandes, J.M.; Silva, S.; Teixeira, A.. Radar-Based Gesture Recognition Towards Supporting Communication in Aphasia: The Bedroom Scenario. 2022.
    10.1007/978-3-030-94822-1_30
  2. Rocha, A.P.; Fernandes, J.M.; Choupina, H.M.P.; Vilas-Boas, M.C.; Cunha, J.P.S.. Subject Identification Based on Gait Using a RGB-D Camera. 2020.
    10.1007/978-3-030-17065-3_8
  3. Choupina, H.M.P.; Rocha, A.P.; Fernandes, J.M.; Vollmar, C.; Noachtar, S.; Cunha, J.P.S.. NeuroKinect 3.0: Multi-bed 3Dvideo-EEG system for epilepsy clinical motion monitoring. 2018.
    10.3233/978-1-61499-852-5-46
  4. Sebastião, R.; Fernandes, J.M.. Supporting the page-hinkley test with empirical mode decomposition for change detection. 2017.
    10.1007/978-3-319-60438-1_48
  5. Velasco-Elizondo, P.; Dwivedi, V.; Garlan, D.; Schmerl, B.; Fernandes, J.M.. Resolving data mismatches in end-user compositions. 2013.
    10.1007/978-3-642-38706-7_10
  6. Teles, D.C.; Colunas, M.F.M.; Fernandes, J.M.; Oliveira, I.C.; Cunha, J.P.S.. iVital: A real time monitoring system for first response teams. 2012.
    10.1007/978-3-642-30422-4_29
  7. Fernandes, J.M.; Tafula, S.; Cunha, J.P.S.. 3D-video-fMRI: 3D motion tracking in a 3T MRI environment. 2011.
    10.1007/978-3-642-21596-4_7
  8. Dwivedi, V.; Velasco-Elizondo, P.; Maria Fernandes, J.; Garlan, D.; Schmerl, B.. An architectural approach to end user orchestrations. 2011.
    10.1007/978-3-642-23798-0_39
  9. Oliveira, I. C.; Alves, L.; Dias, E.; Pacheco, D.; Lima, S.; Barros, J.; Monteiro, M. P.; et al. Automated endoscopic capsule analysis using a Grid computing environment. 2010.
  10. Moreira, M.; Dias, P.; Cordeiro, M.; Santos, G.; Fernandes, J.M.. A framework for cerebral CT perfusion imaging methods comparison. 2010.
    10.1007/978-3-642-13775-4_15
  11. Pacheco, D.; Oliveira, I.; Fernandes, J. M.; Cunha, J. P. S.. MAGI: A Medical Application Grid Interfacing portal for eScience. 2009.
  12. Oliveira, I. C.; Fernandes, J. M.; Alves, L.; Pereira, A. S.; Cunha, J. P. S.. GERES-med: An Architecture for Grid-Enabled scientific REpositorieS for medical applications. 2008.
  13. Cunha, J. P. S.; Oliveira, I.; Fernandes, J. M.; Campilho, A.; Castelo-Branco, M.; Sousa, N.; Pereira, A. S.. BING: The Portuguese Brain Imaging Network Grid. 2007.
  14. Fernandas, J.M.; Leal, A.; Cunha, J.P.S.. EpiGauss: Spatio-temporal characterization of epiletogenic activity applied to hypothalamic hamartomas. 2006.
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2018/12 - 2019/12 ThermoDroid: Android based solution for temperature physiological assessment / TermoDroid: Android based solution for temperature physiological assessment / Solução baseada em Android para avaliação fisiológica através da temperatura
Orientador
 Mestrado integrado em Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018/10 - 2019/12 Explorar Kubernetes E Devops Num Contexto De Iot / Exploring Kubernetes And Devops In An Iot Context
Orientador
 Mestrado em Engenharia Informática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018/09 - 2019/12 Eyempact: a low cost system for integrated eye tracking physiology analysis / Eyempact: um sistema de baixo custo para análise do olhar e fisiologia
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014/09/01 - 2019/07/01 System for Automated Motion Analysis during Gait Using a RGB-D Camera / Sistema para Análise Automatizada de Movimento durante a Marcha Usando uma Câmara RGB-D
Orientador
 MAP-i Programa Doutoral em Informática das Universidades do Minho, de Aveiro e do Porto (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018 - 2018 PhisioStream: Um Sistema de Monitorização Fisiológica Baseado em Ferramentas de Processamento de Streams
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2018 - 2018 Solução Baixo Custo para Avaliação de Desempenho em Futebol de Formação
Orientador
 Engenharia Eletrónica e Telecomunicações (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2017 - 2018 PhisioStream: A physiology monitoring system using off-the-shelf stream processing frameworks
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2017 - 2018 Low cost solution for assessing performance in football teaching
Orientador
 MIEET (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2017 - 2018 Towards a profile of emotions: a Psychophysiological data mining proof of concept
Coorientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2017 - 2018 Plataforma Modular de Controlo de Veículos Aéreos Não Tripulados Baseado em Evento
Coorientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2017 - 2018 Sistema Móvel para Apoiar a Realização de Estudos de Psicofisiologia
Coorientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2017 - 2017 VR-Banway: Implementação de um Agregador Local de Dados de Sensores em Computadores de Placa Única e Redes de Malha
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2017 - 2017 Driver Personal Trainer - Aplicação Móvel Veícular de Suporte a Condutores
Orientador
 Engenharia Informática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2017 - 2017 Consegue sentir as Aranhas: Feedback Háptico em Realidade Virtual
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016 - 2017 Can you feel the spiders: haptic feedback on virtual reality
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2016 - 2017 Driver Personal Trainer – Aplicação móvel veicular de suporte a condutores
Orientador
 MEI (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2016 - 2017 VR-Banway: deploying a body area network gateway on single-board computers and mesh networks
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2016 - 2017 Decision Support Dashboard for Traffic and Environment Analysis of a Smart City
Coorientador
 MEI (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2016 - 2017 Are you looking at me? Monitoring classrooms
Coorientador
 MIEET (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2016 - 2017 Avaliação experimental da influência do condutor no desempenho energético-ambiental de um veículo
Coorientador
Universidade de Aveiro Departamento de Engenharia Mecânica, Portugal
2016 - 2016 Veracity – Ferramenta de Baixo Custo para Avaliação Fisiologica Utilizando Realidade Virtual
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016 - 2016 Estimação do Rítmo Cardíaco Recorrendo a Vídeo no Âmbito de Experiências em Psicologia
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2015 - 2016 Heart rate estimation using video in psychology experiments
Orientador
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2015 - 2016 Veracity -Low cost physiology assessment tool using Virtual Reality
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2015 - 2016 VNMS: Vehicular Network Messaging System
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2015 - 2015 LIMBUS: Sistema de Monitorização com iOS e BLE
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2015 LIMBus: Lightweight monitoring system powered by iOS and BLE
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2014 - 2014 DNS em Redes Veiculares para Suporte a Utilizadores Itinerantes
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2014 Monitorização Psicológica com Realidade Aumentada em Smartphone
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2014 Desenvolvimento de Aplicações Móveis em iOS
Orientador
 Sistemas de Informação (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2014 VitalRemote: Solução in Loco para Gestão de Sistemas Ciber-Físicos
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2014 Strive: Partilha de Informação de Trânsito Citadino com Smartphones
Coorientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2014 NEArBy:Normalização Lexical na Pesquisa de Imagens Cerebrais com Atlas
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2014 AWARE: Context-Aware Augmented Reality Psychological Assessment Tool
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2013 - 2014 VitalRemote: in loco Solution for Management of Cyber-Physical Systems
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2013 - 2014 STRIVE: using Smartphone to share TRaffic Information in citywide VanEt
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2013 - 2014 VANESS: DNS for nomadic users in vehicular networks
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2013 - 2014 NEArBy: lexical normalization for Atlas enabled CBR System for Neuroimaging
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2013 - 2013 An Integrated System for Parkinson´s Disease Patient Management and Follow Up
Orientador
 Informática (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2013 FIREMAN: Sistema Androíd para Monitorização Respiratória de Bombeiros
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2013 Transmissão e apresentação de conteúdos de sensores médicos
Coorientador
 Sistemas de Informação (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2013 NEArBy: Pesquisa em imagens Cerebrais Suportadas em Atlas
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2013 MyDoid: Ensinar o meu Robô com o Android
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2013 - 2013 BeMonitored: Monitorização Psicofisiológica Usando Dispositivos Móveis
Orientador
 Engenharia de Computadores e Telemática (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
2012 - 2013 NEArBy: Neuroimaging Atlas Based Q/R
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2012 - 2013 MyDroid: Teaching my Robot with Android
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2012 - 2013 FIREMAN: Sistema Android para Gestão Respiratória de Bombeiros em Equipa
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2012 - 2013 BeMonitored: Psycho-Physiological Monitoring Using Mobile Devices
Orientador
 MIECT
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2012 - 2013 BeMonitored: Psycho-Physiological Monitoring Using Mobile Devices
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2012 - 2013 REINVENT: accessing Vehicular Networks in Mobile Application
Coorientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2012 - 2013 VitalAir: Suporte à monitorização online da respiração em Bombeiros
Coorientador
 MIEET (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2011 - 2012 MonitorMe: Android-based online activity recognition system
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2011 - 2012 AudioNavigator: using audio cues to support GPS-enabled guidance system
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2011 - 2012 DroidShark: Android Telemetry System for the HammerShark vehicle
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2011 - 2012 KinectMotion: activity monitoring using Kinect's skeleton generator
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2007 - 2012 SWORD – An intelligent vibratory wearable device to improve rehabilitation in stroke patients
Coorientador
 Doutoramento em Engenharia Electrotécnica (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal
2010 - 2011 GPU Power for Medical Imaging
Orientador
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2009 - 2010 Droid Jacket: a mobile monitoring system for a team
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2009 - 2010 Diagnosis support in stroke
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2008 - 2009 Science 2.0: Sharing Scientific Data on the Grid
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2008 - 2009 Quantificação tridimensional de movimento em epilepsia
Coorientador
 MIEET (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2007 - 2008 Multimodal methods of visualization and manipulation of Electrocorticography data
Orientador
 MIECT (Mestrado)
Universidade de Aveiro Departamento de Electrónica Telecomunicações e Informática, Portugal
2007 - 2008 Multimodal EEG-fMRI system for the study of epileptogenic focus
Coorientador
 MEB (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2015 Refinement and Variability Techniques in Model Transformation of Software Requirements
Arguente
 Sofia Manuela Fevereiro de Azevedo (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2014 Neural substrates of 2D/3D object perception: a combinedEEG/fMRI approach
Arguente
 João Miguel Seabra Castelhano (Doutoramento)
Universidade de Coimbra, Portugal
Distinções

Outra distinção

2016 2nd Prize MSc Category ( as adviser of Bernardo Marques with work "Physiology assessment tool using Virtual Reality" )
2009 Best paper award (co-author)