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João Pedro Marques is a Postdoctoral Researcher in Evolutionary Genomics with the EVOCHANGE group at Associação BIOPOLIS, Portugal. His background includes a PhD in Biodiversity, Genetics, and Evolution from the University of Porto (co-awarded by Université de Montpellier, 2022), an MSc in Biochemistry specializing in Biomolecular Methods, and a BSc in Biochemistry from Universidade de Aveiro. Since 2014, João’s research has focused on speciation and population genetics, employing genome assembly, SNP calling, and annotation to address evolutionary questions across hares, mice, and other taxa. Research and Academic Metrics: 19 peer-reviewed articles across journals like Molecular Ecology and Proceedings of the National Academy of Sciences. Organized 4 scientific events, including the 7th International Mouse Meeting and the Genome Applications Symposium (BGE-ERGA). Co-supervised 2 PhD and 1 MSc student(s), supervised 1 MSc, and guided 2 undergraduate students. Key Scientific Contributions: Led projects using whole-genome sequencing to study divergence, gene flow, and adaptation in ecological contact zones, with a focus on hybridization and local adaptation. Pioneered approaches in population genomics and transcriptomics, utilizing high-throughput sequencing to generate insights into evolutionary dynamics under climate change. Developed frameworks contributing to conservation efforts and One Health monitoring through genomic surveillance. Professional and outreach engagement: Established an ongoing outreach program with a local high school, guiding students in genomics and wildlife health projects. Serves on committees within ERGA, focusing on data analysis and sequencing strategies. Actively collaborates with institutions across Europe and the USA, such as U. Montpellier and U. Montana. Presented at key international forums, including the World Lagomorph Conference and the World Biodiversity Forum. João’s expertise in evolutionary genomics and conservation genomics uniquely equips him to advance ecosystem health monitoring, aligning with sustainable wildlife disease management and biodiversity preservation.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
João Pedro Nogueira Marques

Nomes de citação

  • Marques, João P.
  • Marques, João Pedro

Identificadores de autor

Ciência ID
9917-41DB-73E5
ORCID iD
0000-0001-9834-1361
AuthenticusID
R-00H-AFE
Google Scholar ID
https://scholar.google.pt/citations?user=g3aEndwAAAAJ&hl=pt-PT
Researcher Id
M-6187-2013
Scopus Author Id
56506389700

Endereços de correio eletrónico

  • joao.marques@cibio.up.pt (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies
  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Genética e Hereditariedade

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Inglês Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2017/10/01 - 2022/04/19
Concluído
Génétique et Génomique (Doctorat)
Université de Montpellier, França
"Utilisation des outils génomiques pour comprendre la différenciation et le mélange des espèces chez les lièvres et les souris" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2016/09 - 2022/04/19
Concluído
Doutoramento em Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Using genomic tools to understand species differentiation and admixture in hares and mice." (TESE/DISSERTAÇÃO)
2015
Concluído
Bioinformatics in Health Sciences (Pós-Graduação)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
18 out of 20
2012
Concluído
Bioquímica, Ramo 1 - Especialização em Métodos Biomoleculares (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Identification of determinants of resistance in P.falciparum - Proteomics approach 17 out of 20" (TESE/DISSERTAÇÃO)
16 out of 20
2009
Concluído
Biochemistry (Licenciatura)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Antioxidant effect of catalase- 16 out of 20" (TESE/DISSERTAÇÃO)
13 out of 20
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2022/05 - Atual Investigador Contratado (Investigação) Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2016/10 - 2022/04 Investigador (Investigação) Institut des sciences de l'évolution, França
2014/01 - 2022/04 Investigador (Investigação) Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2013/05/01 - 2014/01/31 Investigador (Investigação) Centro de Ciências do Mar, Portugal
2010/06/30 - 2010/09/01 Estagiário de Investigação (Investigação) Universität Bremen, Alemanha

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2012/01/21 - 2012/12/31 Science promoter in the environmental educational project "H20 Indaqua - Água limpa para beber dá saúde e faz crescer" INDAQUA, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2023/03/01 - Atual Biodiversity Genomics Europe
101059492
Investigador Pós-doutorado
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
European Commission
Em curso
2021/01/01 - Atual Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology (InBIO)
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2020/01/01 - Atual Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2020/01/01 - Atual Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2021/03/15 - 2022/02/28 HybridChange - The potential of hybridization to promote rapid adaptation during climate change
Investigador Pós-doutorado
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/01/01 - 2019/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
UID/BIA/50027/2019
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade do Minho Laboratório de Paisagens Património e Território, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2015/06 - 2017/02 HybridAdapt - Hybridization, adaptation and historical demography: a population genomics study
FCT-ANR/BIA-EVF/0250/2012
Bolseiro de Mestrado
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Institut des sciences de l'évolution, França
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2014/02 - 2015/05 Molecular and population genetic signatures of cytonuclear interactions: the Podarcis model
EXPL/BIA-EVF/1283/2012
Bolseiro de Mestrado
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2013/05 - 2014/01 Parathyroid hormone-related protein and Stanniocalcin: new metabolic hormones?
Bolseiro de Mestrado
Centro de Ciências do Mar, Portugal
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Marques, João. "Genome-wide patterns of divergence among flat periwinkles: from ecotypes to species". 2015.
Artigo em revista
  1. Miranda, Inês; Melo-Ferreira, José; Marques, João Pedro. Autor correspondente: Marques, João Pedro. "Promoting scientific literacy in high school: insights from short-term collaborative projects". European Journal of STEM Education (2025):
    Acesso aberto • Em revisão
  2. Miranda, Inês; Fernandes, Íris; Ferreira, Tomás; Martins, E.; Mendonça, José; Mota, Francisco; Semblano, Pedro; et al. "A mudança sazonal da cor da pelagem como modelo de estudo da evolução em contexto escolar". Revista de Ciência Elementar 12 4 (2024): https://doi.org/10.24927/rce2024.042.
    Acesso aberto • 10.24927/rce2024.042
  3. Moraga-Fernández, Alberto; de Sousa-Blanco, María; Marques, João Pedro; Queirós, João; Fernández-Melgar, Rubén; García-Álvarez, Olga; Alves, Paulo C.; Contreras, Marinela. "Impact of vaccination with the Anaplasma phagocytophilum MSP4 chimeric antigen on gene expression in the rabbit host". Research in Veterinary Science 178 (2024): 105370. http://dx.doi.org/10.1016/j.rvsc.2024.105370.
    Publicado • 10.1016/j.rvsc.2024.105370
  4. Marques, João P.; Alves, Paulo C.; Amorim, Isabel R.; Lopes, Ricardo J.; Moura, Monica; Myers, Eugene; Sim-sim, Manuela; et al. "Building a Portuguese coalition for biodiversity genomics". npj Biodiversity 3 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1038/s44185-024-00061-7.
    Publicado • 10.1038/s44185-024-00061-7
  5. Mc Cartney, Ann M.; Formenti, Giulio; Mouton, Alice; De Panis, Diego; Marins, Luísa S.; Leitão, Henrique G.; Diedericks, Genevieve; et al. "The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics". npj Biodiversity 3 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1038/s44185-024-00054-6.
    Publicado • 10.1038/s44185-024-00054-6
  6. Sario, Sara; Marques, João P.; Farelo, Liliana; Afonso, Sandra; Santos, Conceição; Melo-Ferreira, José. "Dissecting the invasion history of Spotted-Wing Drosophila (Drosophila suzukii) in Portugal using genomic data". BMC Genomics 25 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1186/s12864-024-10739-8.
    Publicado • 10.1186/s12864-024-10739-8
  7. Schelle, Luca; Côrte-Real, João Vasco; Fayyaz, Sharmeen; del Pozo Ben, Augusto; Shnipova, Margarita; Petersen, Moritz; Lotke, Rishikesh; et al. "Evolutionary and functional characterization of lagomorph guanylate-binding proteins: a story of gain and loss and shedding light on expression, localization and innate immunity-related functions". Frontiers in Immunology 15 (2024): http://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2024.1303089.
    10.3389/fimmu.2024.1303089
  8. Maltseva, A.L.; Lobov, A.A.; Pavlova, P.A.; Panova, M.; Gafarova, E.R.; Marques, João Pedro; Danilov, L.G.; Granovitch, A.I.. Autor correspondente: Granovitch, A.I.. "Orphan gene in Littorina: An unexpected role of symbionts in the host evolution". Gene 824 (2022): 146389. http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2022.146389.
    10.1016/j.gene.2022.146389
  9. Neves, Fabiana; Marques, João Pedro; Areal, Helena; Pinto-Pinho, Patrícia; Colaço, Bruno; Melo-Ferreira, José; Fardilha, Margarida; Abrantes, Joana; Esteves, Pedro José. Autor correspondente: Esteves, Pedro José. "TLR7 and TLR8 evolution in lagomorphs: different patterns in the different lineages". Immunogenetics 74 5 (2022): 475-485. http://dx.doi.org/10.1007/s00251-022-01262-9.
    Publicado • 10.1007/s00251-022-01262-9
  10. João P. Marques; Graciela Sotelo; Juan Galindo; Pragya Chaube; Diana Costa; Sandra Afonso; Marina Panova; et al. "Transcriptomic resources for evolutionary studies in flat periwinkles and related species". Scientific Data (2020): https://doi.org/10.1038/s41597-020-0408-8.
    10.1038/s41597-020-0408-8
  11. Louro, Bruno; Marques, João Pedro; Manchado, Manuel; Power, Deborah M.; Campinho, Marco António. "Sole head transcriptomics reveals a coordinated developmental program during metamorphosis". Genomics 112 1 (2020): 592-602. http://dx.doi.org/10.1016/j.ygeno.2019.04.011.
    Publicado • 10.1016/j.ygeno.2019.04.011
  12. Marques, João P; Seixas, Fernando A; Farelo, Liliana; Callahan, Colin M; Good, Jeffrey M; Montgomery, W Ian; Reid, Neil; et al. "An Annotated Draft Genome of the Mountain Hare (Lepus timidus)". Genome Biology and Evolution 12 1 (2019): 3656-3662. http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evz273.
    10.1093/gbe/evz273
  13. Giska, Iwona; Farelo, Liliana; Pimenta, João; Seixas, Fernando A; Ferreira, Mafalda S.; Marques, João Pedro; Miranda, Inês; et al. "Introgression drives repeated evolution of winter coat color polymorphism in hares". Proceedings of the National Academy of Sciences 116 48 (2019): 24150-24156. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1910471116.
    Publicado • 10.1073/pnas.1910471116
  14. Marques, João Pedro; Ferreira, Mafalda S.; Farelo, Liliana; Callahan, Colin M.; Hackländer, Klaus; Jenny, Hannes; Montgomery, W. Ian; et al. "Mountain hare transcriptome and diagnostic markers as resources to monitor hybridization with European hares". Scientific Data 4 1 (2017): http://dx.doi.org/10.1038/sdata.2017.178.
    Publicado • 10.1038/sdata.2017.178
  15. Ferreira, Mafalda S.; Alves, Paulo C.; Callahan, Colin M.; Marques, João Pedro; Mills, L. Scott; Good, Jeffrey M.; Melo-Ferreira, José. "The transcriptional landscape of seasonal coat colour moult in the snowshoe hare". Molecular Ecology 26 16 (2017): 4173-4185. http://dx.doi.org/10.1111/mec.14177.
    Publicado • 10.1111/mec.14177
  16. Marques, João Pedro; Sotelo, Graciela; Larsson, Tomas; Johannesson, Kerstin; Panova, Marina; Faria, Rui. "Comparative mitogenomic analysis of three species of periwinkles: Littorina fabalis , L. obtusata and L. saxatilis". Marine Genomics 32 (2017): 41-47. http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2016.10.006.
    Publicado • 10.1016/j.margen.2016.10.006
  17. Marques, João Pedro; Farelo, Liliana; Vilela, Joana; Vanderpool, Dan; Alves, Paulo C.; Good, Jeffrey M.; Boursot, Pierre; Melo-Ferreira, José. "Range expansion underlies historical introgressive hybridization in the Iberian hare". Scientific Reports 7 1 (2017): http://dx.doi.org/10.1038/srep40788.
    Publicado • 10.1038/srep40788
  18. Louro, Bruno; Marques, João Pedro; Power, Deborah M.; Canário, Adelino V.M.. "Having a BLAST: Searchable transcriptome resources for the gilthead sea bream and the European sea bass". Marine Genomics 30 (2016): 67-71. http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2016.10.004.
    Publicado • 10.1016/j.margen.2016.10.004
  19. Churcher, Allison M.; Hubbard, Peter C.; Marques, João Pedro; Canário, Adelino V. M.; Huertas, Mar. "Deep sequencing of the olfactory epithelium reveals specific chemosensory receptors are expressed at sexual maturity in the European eelAnguilla anguilla". Molecular Ecology 24 4 (2015): 822-834. http://dx.doi.org/10.1111/mec.13065.
    Publicado • 10.1111/mec.13065
Poster em conferência
  1. Costa, José; Pierre, Boursot; Melo-Ferreira, José; Marques, João Pedro. Autor correspondente: Marques, João Pedro. "MitoCatch: Mitogenome extraction from whole genome sequencing.". Trabalho apresentado em 7th World Lagomorph Conference, 2024.
  2. Borges, J. Ricardo; Esteves, Pedro José; Melo-Ferreira, José; Marques, João Pedro. Autor correspondente: Marques, João Pedro. "Dynamics and evolution of immune multigene families in Lagomorphs: a comparative genomics approach.". Trabalho apresentado em 7th World Lagomorph Conference, 2024.
  3. Marques, João Pedro. "MyxoHares: Unravelling the genomic landscape of myxomatosis susceptibility in Iberian hares". Trabalho apresentado em World Biodiversity Forum, Davos, Switzerland, 2024.
  4. Pires, Rodrigo; Melo-Ferreira, José; Pierre Boursot; Marques, João Pedro. Autor correspondente: Marques, João Pedro. "Using genomics to dissect the underpinnings of behavioural differences in mice". Trabalho apresentado em XIX ENBE Annual Meeting, Lisbon, Portugal, 2023.
  5. Marques, João Pedro; ALVES, Paulo C; Amorim, Isabel R; Lopes, Ricardo Jorge; Moura, Mónica; Sim-Sim, Manuela; Sousa-Santos, Carla; Sousa, Vitor C; Melo-Ferreira, José. Autor correspondente: Marques, João Pedro. "A pilot initiative to sequence the genomes of portuguese species". Trabalho apresentado em GenomePT Symposium 2023, 2023.
  6. Marques, João P.; Melo-Ferreira, J.; Pierre, Boursot. "A genomic view of differentiation and admixture history between subspecies of the house mouse (Mus musculus)". Trabalho apresentado em II Joint Congress on Evolutionary Biology – Montpellier, France, 2018.
  7. Marques, João P.; Melo-Ferreira, José. "The Role of Natural Selection in the Evolution of Lagomorphs". Trabalho apresentado em 5th World Lagomorph Conference 2016, 2016.
  8. Marques, João P.; Ferreira, Mafalda S.; Melo-Ferreira, José. "A guide to reconstruct “true” de novo transcriptomes". Trabalho apresentado em Congenomics 2016, 2016.
Pré-impressão
  1. Souto, João; Marques, João Pedro; Liliana Farelo; Costa, José; João Queirós; Christian Pietri; Fernando Ballesteros; et al. Autor correspondente: Melo-Ferreira, José. "Genome admixture among four hare species in Iberia: focus on the broom hare (Lepus castroviejoi)". 2024. https://doi.org/10.1101/2024.07.23.604737.
    10.1101/2024.07.23.604737
Tese / Dissertação
  1. "Using genomic tools to understand species differentiation and admixture in hares and mice". Doutoramento, Universidade do Porto, 2022. https://hdl.handle.net/10216/141124.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2024/09 MyxoHares: uma perspectiva genómica do impacto da mixomatose em lebres-ibéricas. CICARC 2024 - Congresso Ibérico de Ciência Aplicada aos Recursos Cinegéticos
Estação Biológica de Mértola (Mértola, Portugal)
2024/07 MyxoHares: Unravelling the genomic landscape of myxomatosis susceptibility in Iberian hares 7th World Lagomorph Conference
Queen’s University (Belfast, Reino Unido)
2024/07 Exploring hybridization dynamics in Alpine hare species under climate-driven range shifts. 7th World Lagomorph Conference
Queen’s University (Belfast, Reino Unido)
2024/07 Using sister taxa to unravel the role of demography and adaptation promoting divergence and admixture. 7th World Lagomorph Conference
Queen’s University (Belfast, Portugal)
2024/06 Origins and admixture: The Iranian plateau as a house mouse arena. 7th International Mouse Meeting
Associação BIOPOLIS (Vila do Conde, Portugal)
2022/07 Inference of positive selection in the evolution of major Lagomorph lineages 6th World Lagomorph Conference
Universite Montpellier (Montpellier, França)
2022/06 A successful Y chromosome lineage in regions of admixture between house mouse subspecies. VIth Mouse Symposium
Universite Montpellier (Montpellier, França)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2023/10 - 2027/12 The adaptive potential of sharks in a changing ocean: insights from comparative and population genomics
Coorientador
Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Université de Montpellier, França

Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Centre pour la Biodiversité Marine l'Exploitation et la Conservation, França
2023/03/01 - 2027 The causes and consequences of ancient hybridization among hares (Lepus spp.)
Coorientador
Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2024/01 - 2026/07 The dynamics of immune gene family evolution in Lagomorphs: a comparative genomics approach
Orientador
Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2025 - 2026 The impact of genetic admixture between hare species in the Alps
Orientador de Pedro Lucas Assunção de Sousa
Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2023/09/01 - 2024/07/26 Understanding the genetic determinants of behaviour differences between the sister species Mus spicilegus and Mus macedonicus using whole genome sequencing data
Orientador
Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2023/09/01 - 2024/06/26 Studying the impact of climate change on genetic exchanges between hares across French Alps contact zone
Orientador
Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2021/09 - 2022/11/17 Using genomics to dissect the history of divergence and hybridization in the sister broom and Corsican hares (Lepus spp.).
Coorientador
Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2024/08/27 - Atual XX Encontro Nacional de Biologia Evolutiva (2024/12/19 - 2024/12/20)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2024/09/20 - 2024/10/10 Genome Applications Symposium - BGE and ERGA (2024/09/30 - 2024/10/01)
Simpósio (Outra)
Biodiversity Genomics Europe, Países Baixos

European Reference Genome Atlas, Bélgica
2024/03/03 - 2024/06/16 7th International Mouse Meeting (2024/06/04 - 2024/06/06)
Congresso (Coorganizador)
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade do Porto Departamento de Biologia, Portugal

Université de Montpellier, França

Institut des sciences de l'évolution, França
2023/05 - 2023/06 Workshop: "Introduction to Galaxy and VGP Assembly Pipeline". Part of ERGA-Portugal knowledge transfer activities (2023/05/18 - 2023/06/15)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
European Reference Genome Atlas, Bélgica
2016/05/03 - 2016/05/06 Congenomics (2016/05/03 - 2016/05/06)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2019/06/17 - 2019/06/21 Advanced Python for Biologists - by Dr. Martin Jones
Oficina (workshop)
Advanced Python for Biologists
PR Statistics, Reino Unido
2018/01/21 - 2018/02/03 Workshop on Population and Speciation Genomics (WPSG) - Ceský Krumlov, Czech Republic - The WPSG brings together an international faculty members and participants to study and discuss current ideas and techniques for the analysis of genomic data on the level of populations and closely related species. Consists of a series of lectures, demonstrations and computer laboratories that cover theory and practice of population and speciation genomics Link: https://evomics.org/people/participants/workshop-on-population-and-speciation-genomics/
Oficina (workshop)
Workshop on Population and Speciation Genomics
Universität Basel, Suiça
2017/03/04 - 2017/03/20 Programming for Evolutionary Biology (PEB) - Leipzig. The PEB course brings together scientists broadly interested in applying bioinformatic tools to answer evolutionary and ecological questions. Unlike other courses, it aims to serve as a platform for discussing common programming pitfalls encountered during research and features workshops to further develop participants’ bioinformatic skills. Link: http://evop.bioinf.uni-leipzig.de/?page_id=199
Oficina (workshop)
Programming for Evolutionary Biology
Universität Leipzig Research Academy Leipzig, Alemanha

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação
Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2024/11/21 The evolutionary history of the yellow coat colour in the Iberian wolf
Arguente principal
Catarina Rafaela Magalhães Garcês (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2022/12 Using genomics to dissect the history of divergence and hybridization in the sister broom and Corsican hares (Lepus spp.)
Orientador
João Manuel Meira do Souto (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2018 - Atual Reviewer for 4 journals

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2022 - Atual Associação Portuguesa de Biologia Evolutiva (APBE; Portuguese Society for Evolutionary Biology) Member
2022 - Atual World Lagomorph Society Member
2021 - Atual Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) Member
2021 - Atual The European Reference Genome Atlas (ERGA) initiative Member
2021 - Atual The European Reference Genome Atlas - Portugal (ERGA-PT) Executive coordinatinator
2018 - Atual European Society for Evolutionary Biology (ESEB) Member

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação
Instituição / Organização
2022 - Atual ERGA - Data Analysis Committee (Steering Committee)
Membro
European Reference Genome Atlas, Bélgica
2022 - Atual ERGA - Sequencing and Assembly Committee (Steering Committee)
Membro
European Reference Genome Atlas, Bélgica

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2024/07 - Atual Master Student - Population Genomics - Studying the impact of climate change on genetic exchanges between hares across French Alps contact zone Pedro Lucas Assunção de Sousa
2023 - Atual Visiting Postdoctoral Researcher: Transcriptomics in the Thoropa miliaris group Ariadne Sabbag
2023 - Atual Research Technician Joana Pinto
2016 - Atual Research Technician Liliana Farelo
2023/10 - 2027 PhD Student - Genomics - PomeSafe: Improved sustainable management of Erwinia amylovora through integrative multi-omics, detection and green chemistry approaches Laura Silva Ferreira Regalado
2024 - 2024 Visiting Postdoctoral Researcher: RNA sequencing data analysis - Impact of vaccination with the Anaplasma phagocytophilum MSP4 chimeric antigen on gene expression in the rabbit host Marinela Contreras
2021 - 2024 PhD Student - Population Genomics - DrosuGreen: Controlling the quarantine pest Drosophila suzukii through epidemiological studies and new Green biocontrol techniques (PTDC/ASP-PLA/4477/2020) Sara Judite Pais Sario
2020 - 2021 Master Student - FlexOmics: Flexible Toolkit for Genomic Statistical Analysis Jorge Miguel Gonçalves Simões
Distinções

Outra distinção

2016 PhD grant
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal