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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Joana Maria Jorge Pereira de Castro Paupério

Identificadores de autor

Ciência ID
B11C-5407-77C3
ORCID iD
0000-0003-2569-0768

Endereços de correio eletrónico

  • joanapcastro@cibio.up.pt (Profissional)

Telefones

Telefone
  • 252660400 (Profissional)

Moradas

  • Centro de Investigação em Biodiversidade em Recursos Genéticos (CIBIO/InBIO Laboratório Associado) - Universidade do Porto. Campus Agrário de Vairão - Rua Padre Armando Quintas - Crasto, 4485-661, Vairão, Vila do Conde, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Ecologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Conservação da Biodiversidade

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A2)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Português Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Formação
Grau Classificação
2012/11/09
Concluído
 Doutoramento em Biologia (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Cryptic speciation in the field vole (Microtus agrestis): insights from genetic, karyotypic and morphometric data" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Aprovado com Distinção
2003/10/13
Concluído
 Mestrado em Ecologia Aplicada (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Ecologia de Lebre-ibérica (Lepus granatensis) num ecossistema de montanha - Distribuição espacial, abundância e dieta de duas populações do Parque Natural da Serra da Estrela" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Muito Bom
1999/09/17
Concluído
 Biologia (Licenciatura)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Estudo da população de javali (Sus scrofa Linnaeus, 1758) no Parque Natural da Serra da Estrela" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2021/10/04 - Atual Gestão de Ciência e Tecnologia European Bioinformatics Institute, Reino Unido
European Bioinformatics Institute, Reino Unido
2016/11/01 - 2020/08/31 Investigador Contratado (Investigação) Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2015/07/01 - 2016/10/31 Pós-doutorado (Investigação) Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2013/06/01 - 2015/06/30 Pós-doutorado (Investigação) Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2019/09/01 - Atual Medição do impacto do rato-doméstico nas plantas de Cabo Verde usando sequenciação de nova geração
SCT
Investigador
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Universidade de Cabo Verde, Cabo Verde
Cabo Verde Ministério do Ensino Superior Ciência e Inovação
Em curso
2019/07/25 - Atual Confirmação genética para preenchimento de lacunas de informação
21/2019
Investigador
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
 Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa
Em curso
2018/07/01 - Atual AGRIVOLE - O papel dos roedores em ecossistemas agrícolas: articulando a gestão de pragas e a conservação da biodiversidade sob as alterações ambientais
PTDC/BIA-ECO/31728/2017
Investigador responsável
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/11/01 - Atual EnvMetaGen - Capacity Building at InBIO for Research and Innovation Using Environmental Metagenomics
668981
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
 EU Framework Programme for Research and Innovation Spreading Excellence and Widening Participation
Em curso
2016/07/11 - 2019/10/11 ‘MateFrag’ – Impacts of habitat fragmentation on social and mating systems: testing ecological predictions for a monogamous vole through non-invasive genetics
Provided by PTCRIS: 145224
PTDC/BIA-BIC/6582/2014
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Em curso
2016/01 - 2019/01 POPCONNECT – combining genetic and field-based data to access the effects of roads on landscape functional connectivity and population viability
Provided by PTCRIS: 138968
PTDC/AAG-MAA/0372/2014
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2013/07 - 2015/06 NETPERSIST. NETwork analysis of critical connectivity thresholds for metapopulation PERSISTence in complex agricultural landscapes
129435
Provided by PTCRIS: 129435
PTDC/AAG-MAA/3227/2012
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2012/06/15 - 2013/05/31 PERSIST - The role of matrix permeability for metapopulation PERSISTence in complex agricultural landscapes. The cases of Cabrera (Microtus cabrerae) and southern water voles (Arvicola sapidus).
info:eu-repo/grantAgreement/FCT/5876-PPCDTI/105110/PT
PTDC/BIA-BEC/105110/2008
Bolseiro de Investigação
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Sonia Ferreira; José Manuel Tierno de Figueroa; Filipa Martins; Joana Verissimo; Lorenzo Quaglietta; José Manuel Grosso-Silva; Pedro Lopes; et al. "The InBIO Barcoding Initiative Database: contribution to the knowledge on DNA barcodes of Iberian Plecoptera". Biodiversity Data Journal (2020): https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e55137.
    10.3897/BDJ.8.e55137
  2. Ferreira, Sónia; Andrade, Rui; Gonçalves, Ana Rita; Sousa, Pedro; Paupério, Joana; Fonseca, Nuno; Beja, Pedro; et al. "The InBIO Barcoding Initiative Database: DNA barcodes of Portuguese Diptera 01". Biodiversity Data Journal (2020): https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e49985.
    No prelo • 10.3897/BDJ.8.e49985
  3. Moutinho, Ana Filipa; Serén, Nina; Paupério, Joana; Silva, Teresa Luísa; Martínez-Freiría, Fernando; Sotelo, Graciela; Faria, Rui; et al. "Evolutionary history of two cryptic species of northern African jerboas". BMC Evolutionary Biology 20 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1186/s12862-020-1592-z.
    Publicado • 10.1186/s12862-020-1592-z
  4. Nicholas K. Fletcher; Pelayo Acevedo; Jeremy S. Herman; Joana Paupério; Paulo C. Alves; Jeremy B. Searle. "Glacial cycles drive rapid divergence of cryptic field vole species". Ecology and Evolution (2019): https://doi.org/10.1002/ece3.5846.
    10.1002/ece3.5846
  5. Paupério, Joana; Martin, Luis; Ferreira, Sónia; Martinez, Jesus; Gonzalez, MA; Martins, Filipa MS; Veríssimo, Joana; et al. "DNA Barcoding of Iberian Trichoptera: Documenting biodiversity for freshwater biomonitoring in a Mediterranean hotspot in Scientific abstracts from the 8th International Barcode of Life Conference". Genome 62 6 (2019): 417-417. http://dx.doi.org/10.1139/gen-2019-0083.
    Publicado • 10.1139/gen-2019-0083
  6. Ferreira, Sónia; Andrade, Rui; Oosterbroek , P; Starý , J; Puppo, Pamela; Sousa, Pedro; Pinto, Joana Correia; et al. "Filling the gap: DNA barcode of Portuguese Dipterans. in Scientific abstracts from the 8th International Barcode of Life Conference". Genome 62 6 (2019): 373-373. http://dx.doi.org/10.1139/gen-2019-0083.
    Publicado • 10.1139/gen-2019-0083
  7. Oliveira, Daniel; Ferreira, Sónia; Paupério, Joana; Chaves, Cátia; Pinto, Joana Correia; Beja, Pedro. "DNA barcoding of Portuguese Neuroptera. In Scientific abstracts from the 8th International Barcode of Life Conference". Genome 62 6 (2019): 414-414. http://dx.doi.org/10.1139/gen-2019-0083.
    Publicado • 10.1139/gen-2019-0083
  8. Ferreira, Sónia; Paupério, Joana; Martins, Filipa MS; Veríssimo, Joana; Chaves, Cátia; Pinto, Joana Correia; Sousa, Pedro; et al. "DNA barcoding Portuguese terrestrial invertebrate biodiversity. In Scientific abstracts from the 8th International Barcode of Life Conference". Genome 62 6 (2019): 373-373. http://dx.doi.org/10.1139/gen-2019-0083.
    Publicado • 10.1139/gen-2019-0083
  9. Paupério, Joana; Grosso-Silva, José Manuel; Martins, Filipa MS; Filipe, Ana Filipa; Penado, Andreia; Mata, Vanessa A.; Rebelo, Hugo; Alves, Paulo Célio; Beja, Pedro. "BARCODING.MED: building a high taxonomic resolution database for the Mediterranean basin. In Scientific abstracts from the 6th International Barcode of Life Conference.". Genome 58 (2019): 265-265. http://dx.doi.org/10.1139/gen-2019-0083.
    Publicado
  10. Filipa M. S. Martins; Mafalda Galhardo; Ana F. Filipe; Amílcar Teixeira; Paulo Pinheiro; Joana Paupério; Paulo C. Alves; Pedro Beja. "Have the cake and eat it: Optimizing nondestructive DNA metabarcoding of macroinvertebrate samples for freshwater biomonitoring". Molecular Ecology Resources (2019): https://doi.org/10.1111/1755-0998.13012.
    10.1111/1755-0998.13012
  11. Sónia Ferreira; Joana Paupério; José Manuel Grosso-Silva; Pedro Beja. "DNA barcoding of Sialis sp. (Megaloptera) in Portugal: the missing tool to species identification". Aquatic Insects (2019): 1-12. https://doi.org/10.1080/01650424.2019.1571612.
    10.1080/01650424.2019.1571612
  12. António Proença-Ferreira; Clara Ferreira; Inês Leitão; Joana Paupério; Helena Sabino-Marques; Soraia Barbosa; Xavier Lambin; et al. "Drivers of survival in a small mammal of conservation concern: An assessment using extensive genetic non-invasive sampling in fragmented farmland". Biological Conservation 230 (2019): 131-140. https://doi.org/10.1016/j.biocon.2018.12.021.
    10.1016/j.biocon.2018.12.021
  13. Herman, J.S.; Stojak, J.; Paupério, J.; Jaarola, M.; Wójcik, J.M.; Searle, J.B.. "Genetic variation in field voles (Microtus agrestis) from the British Isles: Selective sweeps or population bottlenecks?". Biological Journal of the Linnean Society 126 4 (2019): 852-865. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85064161841&partnerID=MN8TOARS.
    10.1093/biolinnean/bly213
  14. Soraia Barbosa; Frederico Mestre; Thomas A. White; Joana Paupério; Paulo C. Alves; Jeremy B. Searle. "Integrative approaches to guide conservation decisions: Using genomics to define conservation units and functional corridors". Molecular Ecology 27 17 (2018): 3452-3465. https://doi.org/10.1111/mec.14806.
    10.1111/mec.14806
  15. Quaglietta, L.; Paupério, J.; Martins, F.M.S.; Alves, P.C.; Beja, P.. "Recent range contractions in the globally threatened Pyrenean desman highlight the importance of stream headwater refugia". Animal Conservation 21 6 (2018): 515-525. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85058073313&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/acv.12422
  16. Ferreira, C.M.; Sabino-Marques, H.; Barbosa, S.; Costa, P.; Encarnação, C.; Alpizar-Jara, R.; Pita, R.; et al. "Genetic non-invasive sampling (gNIS) as a cost-effective tool for monitoring elusive small mammals". European Journal of Wildlife Research 64 4 (2018): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85050187576&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10344-018-1188-8
  17. Sabino-Marques, H.; Ferreira, C.M.; Paupério, J.; Costa, P.; Barbosa, S.; Encarnação, C.; Alpizar-Jara, R.; et al. "Combining genetic non-invasive sampling with spatially explicit capture-recapture models for density estimation of a patchily distributed small mammal". European Journal of Wildlife Research 64 4 (2018): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85050210290&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10344-018-1206-x
  18. Barbosa, S.; Paupério, J.; Pavlova, S.V.; Alves, P.C.; Searle, J.B.. "The Microtus voles: Resolving the phylogeny of one of the most speciose mammalian genera using genomics". Molecular Phylogenetics and Evolution 125 (2018): 85-92. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85044508213&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ympev.2018.03.017
  19. S. Barbosa; J. Paupério; J. S. Herman; C. M. Ferreira; R. Pita; H. M. Vale-Gonçalves; J. A. Cabral; et al. "Endemic species may have complex histories: within-refugium phylogeography of an endangered Iberian vole". Molecular Ecology 26 3 (2017): 951-967. https://doi.org/10.1111/mec.13994.
    10.1111/mec.13994
  20. Gargan, L.M.; Cornette, R.; Yearsley, J.M.; Montgomery, W.I.; Paupério, J.; Alves, P.C.; Butler, F.; et al. "Molecular and morphological insights into the origin of the invasive greater white-toothed shrew (Crocidura russula) in Ireland". Biological Invasions 18 3 (2016): 857-871. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84958042434&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10530-016-1056-y
  21. Barros, P.; Vale-Gonçalves, H.M.; Paupério, J.; Cabral, J.A.; Rosa, G.. "Confirmation of European snow vole Chionomys nivalis (Mammalia: Rodentia: Cricetidae) occurrence in Portugal". Italian Journal of Zoology 83 1 (2016): 139-145. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84958836091&partnerID=MN8TOARS.
    10.1080/11250003.2015.1103320
  22. Silva, S.M.; Ferreira, C.; Paupério, J.; Silva, R.M.; Alves, P.C.; Lemos, A.. "Coccidiosis in European rabbit (Oryctolagus cuniculus algirus) populations in the Iberian Peninsula". Acta Parasitologica 60 2 (2015): 350-355. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84926293966&partnerID=MN8TOARS.
    10.1515/ap-2015-0049
  23. Mestre, F.; Pita, R.; Paupério, J.; Martins, F.M.S.; Alves, P.C.; Mira, A.; Beja, P.. "Combining distribution modelling and non-invasive genetics to improve range shift forecasting". Ecological Modelling 297 (2015): 171-179. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84913580443&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ecolmodel.2014.11.018
  24. Barbosa, S.; Pauperio, J.; Searle, J.B.; Alves, P.C.. "Genetic identification of Iberian rodent species using both mitochondrial and nuclear loci: Application to noninvasive sampling". Molecular Ecology Resources 13 1 (2013): 43-56. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84870945637&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/1755-0998.12024
  25. Paupério, J.; Herman, J.S.; Melo-Ferreira, J.; Jaarola, M.; Alves, P.C.; Searle, J.B.. "Cryptic speciation in the field vole: A multilocus approach confirms three highly divergent lineages in Eurasia". Molecular Ecology 21 24 (2012): 6015-6032. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84870945760&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/mec.12024
  26. Giménez, M.D.; Paupério, J.; Alves, P.C.; Searle, J.B.. "Giant sex chromosomes retained within the Portuguese lineage of the field vole (Microtus agrestis)". Acta Theriologica 57 4 (2012): 377-382. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84866443492&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s13364-012-0087-8
  27. Ferreira, C.; Paupério, J.; Alves, P.C.. "The usefulness of field data and hunting statistics in the assessment of wild rabbit (Oryctolagus cuniculus) conservation status in Portugal". Wildlife Research 37 3 (2010): 223-229. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77952615953&partnerID=MN8TOARS.
    10.1071/WR09137
  28. Paupério, J.; Alves, P.C.. "Diet of the Iberian hare (Lepus granatensis) in a mountain ecosystem". European Journal of Wildlife Research 54 4 (2008): 571-579. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-52449091348&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10344-008-0181-z
Capítulo de livro
  1. Bencatel, Joana; Álvares, Grancisco; Moura, André; Barbosa, Ana Márcia. "Altas de mamíferos de Portugal. Cap. Insetívoros". Portugal: Universidade de Évora,
  2. Bencatel, Joana; Álvares, Francisco; Moura, André; Barbosa, Ana Márcia. "Altas de mamíferos de Portugal. Cap. Roedores". Portugal: Universidade de Évora,
  3. Herman, J.S.; Paupério, J.; Alves, P.C.; Searle, J.B.. "Land bridge calibration of rates of molecular evolution in a widespread rodent". 2014.
    10.1007/978-3-319-07623-2_4
  4. Paupério, Joana; Ferreira, Catarina; Alves, Paulo Célio. "Aspectos gerais da biologia do coelho-bravo". In Gestão de populações de coelho-bravo (Oryctolagus cuniculus algirus). Portugal, 2006.
    Publicado
  5. Tarroso, Pedro; Ferreira, Catarina; Paupério, Joana. "Métodos de monitorização das populações de coelho-bravo". In Gestão de populações de coelho-bravo (Oryctolagus cuniculus algirus), editado por Federação Alentejana de Caçadores. Portugal, 2006.
    Publicado
Livro
  1. Ferreira, Catarina; Rodrigues, Tiago; Leitão, M; Paupério, Joana; Moutinho, C; Gonçalves, David; Alves, Paulo Célio. Gestão de recursos cinegéticos no arquipélago dos Açores: o coelho-bravo.. Porto, Portugal: CIBIO-UP / Direcção Regional dos Recursos Florestais. 2012.
    Publicado
Relatório
  1. Ferreira, Sónia; Fonseca, Nuno; Egeter, Bastian; Paupério, Joana; Galhardo, Mafalda; Oxelfelt, Fredrik; Aresta, Sandra; et al. 2018. EnvMetaGen Deliverable 4.2 (D4.2) Protocol for building and organising reference collections of DNA sequences. https://zenodo.org/record/3515967.
    10.5281/zenodo.3515967
  2. Egeter, Bastian; Fonseca, Nuno; Paupério, Joana; Galhardo, Mafalda; Ferreira, Sónia; Oxelfelt, Fredrik; Aresta, Sandra; et al. 2018. Deliverable 4.3 (D4.3): Protocol for field collection and preservation of eDNA samples, EnvMetaGen project (Grant Agreement No 668981).. https://zenodo.org/record/2598129.
    10.5281/zenodo.2598129
  3. Paupério, Joana; Fonseca, Nuno; Egeter, Bastian; Galhardo, Mafalda; Ferreira, Sónia; Oxelfelt, Fredrik; Aresta, Sandra; et al. 2018. Deliverable 4.4 (D4.4): Protocol for next-gen analysis of eDNA samples, EnMetaGen project (Grant Agreement No 668981). https://zenodo.org/record/2586885.
    10.5281/zenodo.2586885
  4. Galhardo, Mafalda; Fonseca, Nuno; Egeter, Bastian; Paupério, Joana; Ferreira, Sónia; Aresta, Sandra; Oxelfelt, Fredrik; et al. 2018. Deliverable 4.5 (D4.5): Protocol for the processing of DNA sequence data generated by next-gen platforms, EnMetaGen project (Grant Agreement No 668981). https://zenodo.org/record/2586889.
    10.5281/zenodo.2586889
Tese / Dissertação
  1. Faculdade de Ciências. "Cryptic Speciation in the Field Vole (Microtus agrestis): Insights from Genetic, Karyotypic and Morphometric data". Doutoramento, 2012. http://hdl.handle.net/10216/73940.
  2. Paupério, Joana Maria Jorge Pereira de Castro. "Ecologia de Lebre-ibérica (Lepus granatensis) num ecossistema de montanha : Distribuição espacial, abundância e dieta de duas populações do Parque Natural da Serra da Estrela". Mestrado, 2003. http://hdl.handle.net/10216/10517.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2019/12/05 Biodiversidad y servicios de ecosistemas: el caso de estudio de la comunidad de pequeños mamíferos en los agroecosistemas del NE de Portugal XIV Congreso SECEM
Sociedad Española para a Conservación y Estudio de los Mamíferos (Jaca, Espanha)
2019/10/28 Barcoding biodiversity: From species detection to freshwater biomonitoring using eDNA metabarcoding XXIII Congreso de la Sociedad Mesoamericana de la Biología de la Conservación
Sociedad Mesoamericana de la Biología de la Conservación (Antigua, Guatemala)
2019/10/01 Effects of habitat fragmentation in the social behaviour of the Cabrera vole: insights from genetic non-invasive sampling Wildlife Research and Conservation 2019
(Berlin, Alemanha)
2019/09/23 Linking biodiversity with ecosystem services: The small mammal community of Northeastern Portugal agroecosystems 8th European Congress of Mammalogy
(Warsaw, Polónia)
2019/09/23 Effects of habitat fragmentation in the social behaviour of the Cabrera vole: insights from genetic non-invasive sampling 8th European Congress of Mammalogy
(Warsaw, Polónia)
2019/09/04 The role of voles in agroecosystems: Using metabarcoding to link voles’ trophic niche with ecosystem structure Seminar
University of Natural Resources and Life Sciences (Vienna, Áustria)
2019/08/23 Genomic insights into the phylogeny of voles Vole Meeting 2019
(Austin, Estados Unidos)
2019/06/20 InBIO Barcoding Initiative: DNA barcoding Portuguese terrestrial invertebrate biodiversity 8th International Barcode of Life Conference
(Trondheim, Noruega)
2018/07/28 Estimating vole population densities in patchy environments using SECR models: A comparison of live trapping and non-invasive genetic sampling 14th Rodens et Spatium
(Lisboa, Portugal)
2018/07/28 Mating system and dispersal in a Cabrera vole metapopulation as revealed by non-invasive genetic sampling 14th Rodens et Spatium
(Lisboa, Portugal)
2018/06/24 Improving freshwater biodiversity assessment: Application of molecular tools on preservative ethanol from macroinvertebrate bulks. XIX Congresso da Associação Ibérica de Limnologia
(Coimbra, Portugal)
2018/06/24 Delineating freshwater monitoring networks using eDNA metabarcoding. XIX Congresso da Associação Ibérica de Limnologia
(Coimbra, Portugal)
2017/12/06 Hacia un conocimiento más completo de la distribución de mamíferos en la Península Ibérica: el atlas preliminar de los mamíferos de Portugal XIII Congresso SECEM
(Guadalajara, Espanha)
2017/11/20 Large-scale barcoding of Portuguese moths: accelerating species inventories while revealing exotic species, sexual dimorphism and cryptic diversity 7th International Barcode of Life Conference
(Kruger National Park, África do Sul)
2017/11/15 Range contraction and the importance of stream headwater refugia for the endangered Pyrenean desman in Northeast Portugal 17º Encontro Nacional de Ecologia, Seminário LIFE-RELICT
(Évora, Portugal)
2017/11/01 Collaboration for conservation: collaborative research in the conservation of small mammals XXI Congreso de la Sociedad Mesoamericana para la Biología y la Conservación
Sociedad Mesoamericana para la Biología y la Conservación (San José, Costa Rica)
2017/07/09 Demography of a near-threatened vole in Mediterranean farmland assessed from non-invasive genetics International Mammalogical Congress
(Perth, Austrália)
2017/07/02 From riverscapes to lab and back again: delineating monitoring networks of biotic indices using new genetic tools under multiple stressors 10th Symposium for European Freshwater Sciences
(Olomouc, República Checa)
2016/10/09 Barcoding LTER Biodiversity: A case study and applications in LTER Sabor (Portugal) ILTER 1st Open Science Meeting 2016
(Kruger National Park, África do Sul)
2016/09/05 InBIO Barcoding Initiative: moth reference database using Next Generation Sequencing XVII Congresso Ibérico de Entomologia
(Lisboa, Portugal)
2016/07/17 Non-invasive genetic sampling in conservation: how far have we got and how far can we go? North American Congress for Conservation Biology
(Madisson, Wisconsin, Estados Unidos)
2016/06/13 Muestreos genéticos no invasivos para la conservación de micromamíferos IX Encuentro Nacional sobre Biología de la Conservación “Genética de la Conservación: acciones futuras para Costa Rica
Universidade Nacional de Costa Rica (Heredia, Costa Rica)
2016/05/03 Using genomics to define functional corridors and management units: an integrative approach to guide conservation decisions Congenomics – Conference on Conservation Genomics
(Vairão, Portugal)
2016/02/04 Genomics informing conservation practices: how to define conservation units and determine connectivity in an endangered rodent? Cornell University Evo-Group
(Ithaca, Estados Unidos)
2015/12/12 DNA barcoding of Portuguese terrestrial and freshwater Arthropods using Next Generation Sequencing Encontro sobre Biodiversidade e Conservação de Invertebrados em Portugal
(Seia, Portugal)
2015/10/03 Os micromamíferos em Serralves Há vida No Parque
Fundação de Serralves (Porto, Portugal)
2015/08/17 Fewer markers, similar accuracy? Cost-effective selection of genetic markers for parentage analysis based on non-invasive genetic sampling 7th European Congress of Mammalogy
(Stockholm, Suécia)
2015/08/02 Genomics informing conservation strategies: which populations should be reconnected in an endangered rodent 27th International Congress for Conservation Biology / 4th European Congress of Conservation Biology
(Montpellier, França)
2015/07/28 The Eurasian field vole (Microtus agrestis) as a model for cryptic speciation 14th Rodens et Spatium
(Lisboa, Portugal)
2014/09/21 Micromamíferos - ferramentas moleculares como fonte de conhecimento e conservação Café com Ciência
Fundação de Serralvez (Porto, Portugal)
2014/07/28 Forescasting species range shifts combining ecological niche modelling and non-invasive genetic sampling: an example with the Cabrera vole (Microtus cabrerae) 14th Rodens et Spatium
(Lisboa, Portugal)
2013/12/05 El topillo agreste (Microtus agrestis) como un complejo de espécies: patrones de variación genética, morfométrica y cariotípica XI Jornadas SECEM
(Avilés, Espanha)
2013/12/05 Hacia la conservación del topillo de Cabrera (Microtus cabrerae): filogeografía y estrutura genética poblacional en la Península Ibérica XI Jornadas SECEM
(Avilés, Espanha)
2013/08/11 The field vole (Microtus agrestis) species complex: secondary contact in the Iberian Peninsula revealed by noninvasive genetic sampling 11th International Mammalogical Congress
(Belfast, Reino Unido)
2013/08/11 New perspectives on European phylogeography from field voles 11th International Mammalogical Congress
(Belfast, Reino Unido)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2021/10/01 - Atual Trophic niche of rodent communities in agroecosystems in Northeastern Portugal
Coorientador
 Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2019/10/01 - Atual Linking vole diversity and abundance with agroecosystems of Northeastern Portugal: understanding the role of olive groves structure and intensification
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/10/01 - Atual The small mammal community of North Eastern Portugal: how agroecosystem structure shapes species diversity and abundances
Coorientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/10/01 - Atual DNA barcoding of Iberian small mammals
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2017/10/01 - Atual Effects of habitat fragmentation on demographic and sociobehavioural traits of small mammals: inferences from noninvasive genetics of a near-threatened species
Coorientador
 Biologia (Doutoramento)
Universidade de Évora, Portugal
2015/03/01 - Atual Genetic composition and distribution of small mammals along altitudinal gradients to estimate possible effects of climate change in Costa Rica
Coorientador
 Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2020/10/01 - 2022/01/17 Fatores que influenciam a ocupação de pequenos mamíferos em ecossistemas agrícolas no nordeste de Portugal
Coorientador
 Mestrado em Biologica da Conservação (Mestrado)
Universidade de Évora, Portugal
2019/09/01 - 2020/12 Feeding ecology of the Pyrenean desman in NW Iberia revealed by DNA metabarcoding: the role of habitat suitability
Orientador
 Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2018/09/01 - 2019/12/12 Cryptic diversity in rodents from Costa Rica
Orientador
 Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2018/09/01 - 2019/12/10 Os mamíferos do Rio Febros: situação actual e medidas de conservação das espécies vulneráveis
Orientador
 Ecologia e Ambiente (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2018/10/01 - 2019/06/01 Diversidade e abundância de micromamíferos na bacia do Rio Febros
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2017/10/01 - 2018/06/01 Genetic diversity of small mammals of Costa Rica
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade de Aveiro, Portugal
2016/09/01 - 2017/11 Indexing population size of elusive species from sign surveys: an evaluation using non-invasive genetics of Cabrera voles
Coorientador
 Biologia da Conservação (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016/10/01 - 2017/06 Variação morfológica em Bradypus variegatus nos biomas Mata Atlântica e Amazónia
Coorientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2016/10/01 - 2017/06 Genetic Diversity of the Pyrenean Desman (Galemys pyrenaicus) in Northeastern Iberia: High-throughput microsatellite sequencing and mitochondrial markers analysis
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2016/10/01 - 2017/06 Os Micromamíferos de Portugal: Contribuição das bases de dados abertas para a compilação de dados de distribuição
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2015/10/01 - 2016/06 Estudo da dieta de toupeira-de-água, Galemys pyrenaicus, na região nordeste de Portugal através de metabarcoding
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade de Aveiro, Portugal
2015/10/01 - 2016/06 Morphometric variability in a speciating small mammal: the Microtus agrestis (L.) species complex
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2014/10/01 - 2015/06 Phylogeography of two shrew species (Sorex granarius and Sorex coronatus) in the Iberian Peninsula, using a multiplocus approach
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2012/10/01 - 2013/06 Barn owl pellets in phylogeographic studies of endangered small mammals: the case of the Cabrera vole (Microtus cabrerae)
Orientador
 Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2018/07/01 - 2018/10/05 Workshop - Biology and management of Iberian voles: Progresses, challenges and prospects (2018/10/03 - 2018/10/05)
Oficina (workshop)
 Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2011/10/05 - 2019/10/06 “Há vida no Parque - Micromamíferos”. Short seminar and demonstration of methods for the study of small mammals directed to the general public. Porto, Portugal.
Outro
 Há vida no Parque - Micromamíferos
Fundação Serralves, Portugal
2013/10/06 - 2019/09/29 “Festa do Outono – Onde vivem os micromamíferos na cidade”. Yearly activity for the demonstration of methods for the study of small mammals directed to the general public.
Festival
 Festa do Outono
Fundação Serralves, Portugal
2019/05/18 - 2019/05/19 “Biodiversidade a 100 por censo”. Demonstration session of the methods for the study of small mammals directed to the general public, while inventorying the diversity of the surveyed area.
Outro
 Biodiversidade a 100 por censo
ALDEIA, Portugal
2014/05/03 - 2019/04/07 “Serralves Bioblitz”. Yearly event where biological surveys are performed in an attempt to identify as many species as possible in Serralves park. With sessions for school groups (1 to 5 days) and for the general public (weekend).
Outro
 Serralves Bioblitz
Fundação Serralves, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2018/05/19 - 2018/05/20 “Biodiversidade a 100 por censo”. Demonstration session of the methods for the study of small mammals directed to the general public, while inventorying the diversity of the surveyed area.
Outro
 Biodiversidade a 100 por censo
ALDEIA, Portugal
2016/12/05 - 2016/12/05 "Barcoding da Biodiversidade: Aplicações na Monitorização e Conservação" - seminar given in Rodrigues de Freitas Highschool in the scope of the celebration of Darwin Day. "Barcoding da Biodiversidade: Aplicações na Monitorização e Conservação"
Câmara Municipal do Porto, Portugal
2016/08/10 - 2016/08/10 "Small mammals conservation: using molecular tools for diversity assessments and management" - seminar in outreach session for international students in a protected area in northern Portugal
Seminário
Centro de Educação e Interpretação Ambiental da Paisagem Protegida do Corno do Bico, Portugal
2016/07/01 - 2016/07/02 “Bioblitz no Jardim Botânico”. Demonstration session of the methods for the study of small mammals directed to the general public, while inventorying the diversity of Jardim Botânico.
Outro
 Bioblitz no Jardim Botânico
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2014/05/21 - 2014/05/22 “Biodiversidade a 100 por censo”. Demonstration session of the methods for the study of small mammals directed to the general public, while inventorying the diversity of the surveyed area.
Outro
 Biodiversidade a 100 por censo
ALDEIA, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2019/12/12 Cryptic diversity in rodents from Costa Rica
Orientador
 Sara María Cáceres Valdés (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2019/12/11 Towards a Novel Pipeline for Microsatellite Screening in Population Genomics
Arguente
 Filipe da Costa Alves (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/12/09 Os mamíferos do Rio Febros: situação actual e medidas de conservação das espécies vulneráveis
Orientador
 Bruna Oliveira (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2018/12/03 Metabarcoding analysis of endemic lizards’ diet for guiding reserve management in Macaronesia Islands
Arguente
 Catarina de Jesus Covas Silva Pinho (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2017/12/15 A metabarcoding approach to assess the diet of lacertid lizards from the High Atlas Mountains
Arguente
 Ana Isabel Antunes Pereira (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2015/11/11 Biogeography and phylogenetic position of a Sahara Sahel mountain endemic , Felovia vae (Ctenodactylidae)
Arguente
 Fábio Alberto Vieira Sousa (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2020/10/22 - Atual Marine Pollution Bulletin (0025-326X) Elsevier
2020/09/04 - Atual Turkish Journal of Zoology (1300-0179) Tubitak
2020/02/28 - Atual Ecosphere (2150-8925) Wiley (John Wiley & Sons)
2020/01/03 - Atual Evolutionary Applications (1752-4571) Wiley (Blackwell Publishing)
2018/01/08 - Atual Ecology and Evolution (2045-7758) Wiley (John Wiley & Sons)
2016/07/01 - Atual Mammalia (1864-1547) Walter de Gruyter GmbH
2016/02/12 - Atual Animal Biodiversity and Conservation (2014-928X) Consorci del Museu de Ciencies Naturals de Barcelona
2015/10/12 - Atual Hystrix
2015/03/02 - Atual Mammal Research (2199-241X) Springer-Verlag
2015/01/16 - Atual Mammalian Biology (1616-5047) Elsevier
2014/11/21 - Atual Heredity (0018-067X) Springer Science and Business Media LLC
2014/02/10 - Atual BMC Evolutionary Biology (1471-2148) Springer (Biomed Central Ltd.)
2013/08/09 - Atual Biological Journal of the Linnean Society (1095-8312) Oxford University Press
2013/06/18 - Atual Journal of Biogeography (1365-2699) Wiley (Blackwell Publishing)
2013/01/01 - Atual European Journal of Wildlife Research (1439-0574) Springer-Verlag
2011/08/01 - Atual Molecular Ecology (1365-294X) Wiley (Blackwell Publishing)
2013/10/08 - 2014/08/08 ACTA THERIOLOGICA (2190-3743) Mammal Research Institute

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2019/10/01 - 2020/02 Population Genetics and Phylogeography Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado integrado) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/10/25 - 2019/10/26 Introductory course on Conservation Genetics Museo Nacional de Costa Rica, Costa Rica
2017/10/26 - 2017/10/28 Introductory course on Conservation Genetics Universidad Nacional de Costa Rica, Costa Rica
2016/06/14 - 2016/06/16 Introductory course on Conservation Genetics Universidad Nacional de Costa Rica, Costa Rica

Entrevista (jornal / revista)

Descrição da atividade Jornal / Forum
2015/11/06 Several articles in the media covering the results of paper Barros et al. (2015) Italian Journal of Zoology, 83: 139-145 Sic noticias

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2016/08/02 - Atual Órgão responsável pelo bem estar animal
Membro
 Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
Distinções

Outra distinção

2016 Best poster in Congress
2013 Best oral communication