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Sofia G. Seabra completed a PhD in Biology (Evolutionary Biology) from the Faculty of Sciences, University of Lisbon (FCUL) in 2007. Since April 2020 she has an institutional CEEC contract (https://doi.org/10.54499/CEECINST/00102/2018/CP1567/CT0040) as Assistant Researcher at the Global Public Health Teaching and Research Unit of Institute of Hygiene and Tropical Medicine at NOVA University of Lisbon (IHMT-NOVA). Her research on genomics and bioinformatics at IHMT-NOVA integrates the field of public health. She was Principal Investigator in the internally GHTM funded project 'WasteWaterVir - Integrating metavirome analysis of wastewaters into tools for surveillance of infectious diseases', and is a team member in the ongoing We'Search program (FCG/La Caixa) funded project "Airway colonization and microbiome in relation to asthma and atopy in children from Cabo Verde- RESPIRA-CV", in the ongoing FCT project "Minimizing the emergence and dissemination of HIV-1 drug resistance in PALOPs through an evidence-based portable high-throughput sequencing and computational approach" and on the European Project "EuCARE: European Cohorts of Patients and Schools to Advance Response to Epidemics". Previously she was a postdoctoral researcher at FCUL where her research focused on understanding evolutionary patterns and processes in studies of phylogenetics, phylogeography, population structure, detection of selection, introgression and genotype/phenotype association in several insect species. These studies involved the analyses of high throughput genomics data and the application of several bioinformatics tools, including de novo genome assemblies, resequencing, and genome-wide association studies. She has 35 publications, 9 of which in the last 5 years. She participated in 10 scientific projects, including 2 as Principal Investigator, 1 as Co-Principal Investigator, and 4 as responsible for project tasks. She supervised several post-graduate students and participated in evaluation committees in PhD and Master theses. She teaches Biostatistics in the IHMT Doctoral Programs 'Biomedical Sciences' and 'International Health' and Molecular Epidemiology in the NOVA Masters 'Computational Biology and Bioinformatics'. She was a member of organizing and scientific committees of several scientific meetings and carried out scientific reviewing for scientific journals. Outreach activities included participation in the European Researchers Night events and Ciência Viva program.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Sofia Gonçalves Seabra

Nomes de citação

  • Seabra, Sofia
  • Sofia G. Seabra

Identificadores de autor

Ciência ID
BA13-DAD2-4698
ORCID iD
0000-0003-1413-2349

Endereços de correio eletrónico

  • sgseabra@ihmt.unl.pt (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B2)
Francês Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2007/06/22
Concluído
 Biologia (Doutoramento)
Especialização em Especialidade: Biologia Evolutiva
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
"Patterns of Divergence in Populations of Two Mediterranean Species of Genus Cicada L. (hemiptera, Cicadidae) Based on Microsatellite Genetic Markers and Acoustic Data" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Distinção e Louvor
1998
Concluído
 Biologia Aplicada aos Recursos Animais - ramo Terrestres (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
 17/20
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2020/04/01 - Atual Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação) Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
2019/07/01 - 2020/03/31 Investigador (Investigação) Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015/12/01 - 2019/06/30 Pós-doutorado (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2014/02/01 - 2015/11/30 Pós-doutorado (Investigação) Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2007/09/01 - 2013/12/31 Pós-doutorado (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2016 - 2018 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2005/03/01 - 2007/06/01 PhD student/Associate member of Centro de Biologia Ambiental Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2000/11/01 - 2005/02/01 PhD grant (SFRH/BD/1027/2000) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
1999/11/01 - 2000/10/01 Grant from Fundação da Faculdade de Ciências de Lisboa Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
1999/02/01 - 1999/10/01 Research Technician grant (PRAXIS XXI/BTI/17239/98) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2024/01 - Atual Respira-CV - Airway colonization and microbiome in relation to asthma and atopy in children from Cabo Verde
Respira-CV
Investigador
Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal

Fundação 'la Caixa', Portugal
Em curso
2021/11/01 - Atual EuCARE: European Cohorts of Patients and Schools to Advance Response to Epidemics
HORIZON-HLTH-2021-CORONA-01
Investigador
2022/01/01 - 2024/01/01 Minimizing the emergence and dissemination of HIV-1 drug resistance in PALOPs through an evidence-based portable high-throughput sequencing and computational approach
PTDC/SAU-PUB/4018/2021
Investigador
Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Saúde Global e Medicina Tropical, Portugal
Em curso
2022/05 - 2023/08 WasteWaterVir - Integrating metavirome analysis of wastewaters into tools for surveillance of infectious diseases
GHTM funding
Investigador responsável
Universidade Nova de Lisboa Saúde Global e Medicina Tropical, Portugal
 Universidade Nova de Lisboa Saúde Global e Medicina Tropical
Em curso
2020/01/01 - 2022/12/31 Ecosystem services on horticulture: value of native mirid species
PTDC/ASP-PLA/29110/2017
Investigador
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018 - 2021 Effect of EUtrophication and CLimate on POllinators and ecosystem service provision (EUCLIPO)
PTDC/BIA-ECO/28360/2017
Investigador
Em curso
2014/02 - 2015/11 History, chance and selection during local adaptation: a genome-wide analysis
Provided by PTCRIS: 127792
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/04 - 2013/09 Mealybug reproductive biology and pheromone-mediated interactions: a basis to develop ecological sound management tactics for pest mealybugs
Provided by PTCRIS: 99560
Investigador
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/03 - 2013/08 FLYPRED - Has tiger-fly a role in biological control of protected crops?
Provided by PTCRIS: 99723
Investigador
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/01 - 2013/06 Adaptive significance and genetic basis of a balanced colour-polymorphism
Provided by PTCRIS: 98783
PTDC/BIA-BEC/098783/2008
Investigador responsável
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2023/01/01 - 2024/06/30 Explorando a inibição de efluxo para o combate à resistência aos antimicrobianos e a biofilmes em estafilococos
2022.07931.PTDC
Universidade Nova de Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Seabra, Sofia G.; Merca, Francisco; Pereira, Bernardo; Fonseca, Ivo; Carvalho, Ana Cláudia; Brito, Vera; Alves, Daniela; et al. "Serological screening in a large-scale municipal survey in Cascais, Portugal, during the first waves of the COVID-19 pandemic: lessons for future pandemic preparedness efforts". Frontiers in Public Health 12 (2024): 1326125. http://dx.doi.org/10.3389/fpubh.2024.1326125.
    Publicado • 10.3389/fpubh.2024.1326125
  2. Mafalda N. S. Miranda; Victor Pimentel; Perpétua Gomes; Maria do Rosário O. Martins; Sofia G. Seabra; Rolf Kaiser; Michael Böhm; et al. "The Role of Late Presenters in HIV-1 Transmission Clusters in Europe". Viruses (2023): https://doi.org/10.3390/v15122418.
    10.3390/v15122418
  3. Eduardo Marabuto; Miguel S. Nunes; Renata Martins; Raquel Mendes; Tatiana C. Moreira-Pinhal; João Raimundo; Sofia G. Seabra; Octávio S. Paulo. "Integrative analysis reveals the divergence and speciation between sister Sooty Copper butterflies Lycaena bleusei and L. tityrus". Molecular Phylogenetics and Evolution 180 (2023): https://novaresearch.unl.pt/en/publications/8a9d965d-8e60-467c-bb1a-fd9a0be6f4f2.
    10.1016/j.ympev.2022.107699
  4. Miranda, Mafalda N. S.; Pingarilho, Marta; Pimentel, Victor; Torneri, Andrea; Seabra, Sofia G.; Libin, Pieter J. K.; Abecasis, Ana B.. "A Tale of Three Recent Pandemics: Influenza, HIV and SARS-CoV-2". Frontiers in Microbiology 13 (2022): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.889643.
    10.3389/fmicb.2022.889643
  5. Sofia G Seabra; Pieter J K Libin; Kristof Theys; Anna Zhukova; Barney I Potter; Hanna Nebenzahl-Guimaraes; Alexander E Gorbalenya; et al. "Genome-Wide Diversity of Zika Virus: Exploring Spatio-Temporal Dynamics to Guide a New Nomenclature Proposal". Virus Evolution (2022): https://doi.org/10.1093/ve/veac029.
    10.1093/ve/veac029
  6. Sofia G. SEABRA; Joana MARTINS; Patrícia BRÁS; Ana M. TAVARES; Inês FREITAS; António BARATA; Maria Teresa REBELO; et al. "PCR-based detection of prey DNA in the gut contents of the tiger-fly, Coenosia attenuata (Diptera: Muscidae), a biological control agent in Mediterranean greenhouses". European Journal of Entomology (2021): https://doi.org/10.14411/eje.2021.035.
    10.14411/eje.2021.035
  7. Sofia G. Seabra; Ana S.B. Rodrigues; Sara E. Silva; Ana Carina Neto; Francisco Pina-Martins; Eduardo Marabuto; Vinton Thompson; et al. "Population structure, adaptation and divergence of the meadow spittlebug, Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae), revealed by genomic and morphological data". PeerJ 9 (2021): http://dx.doi.org/10.7717/peerj.11425.
    10.7717/peerj.11425
  8. Silva, Sara E; Seabra, Sofia G; Carvalheiro, Luísa G; Nunes, Vera L; Marabuto, Eduardo; Mendes, Raquel; Rodrigues, Ana S B; et al. "Population genomics of Bombus terrestris reveals high but unstructured genetic diversity in a potential glacial refugium". Biological Journal of the Linnean Society 129 2 (2019): 259-272. http://dx.doi.org/10.1093/biolinnean/blz182.
    Publicado • 10.1093/biolinnean/blz182
  9. Sofia G. Seabra; Sara E. Silva; Vera L. Nunes; Vitor C. Sousa; Joana Martins; Eduardo Marabuto; Ana S. B. Rodrigues; et al. "Genomic signatures of introgression between commercial and native bumblebees, Bombus terrestris , in western Iberian Peninsula—Implications for conservation and trade regulation". Evolutionary Applications 12 4 (2019): 679-691. https://doi.org/10.1111/eva.12732.
    10.1111/eva.12732
  10. BORGES, PAULO A.V.; RODRIGUES, ANA S.B.; SILVA, SARA E.; SEABRA, SOFIA G.; PAULO, OCTÁVIO S.; QUARTAU, JOSÉ A.. "New data on polymorphism of the meadow spittlebug Philaenus spumarius (L.) (Hemiptera: Aphrophoridae) from the island of São Miguel (Azores)". Zootaxa 4369 1 (2018): 144-150. http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4369.1.9.
    Publicado • 10.11646/zootaxa.4369.1.9
  11. Seabra SG; Fragata I; Antunes MA; Faria GS; Santos MA; Sousa VC; Simões P; Matos M. "Different genomic changes underlie adaptive evolution in populations of contrasting history.". Molecular biology and evolution (2017): http://europepmc.org/abstract/med/29029198.
    10.1093/molbev/msx247
  12. Simões, P.; Fragata, I.; Seabra, S.G.; Faria, G.S.; Santos, M.A.; Rose, M.R.; Santos, M.; Matos, M.. "Predictable phenotypic, but not karyotypic, evolution of populations with contrasting initial history". Scientific Reports 7 1 (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85018423716&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/s41598-017-00968-1
  13. Rodrigues, Ana S. B.; Silva, Sara E.; Pina-Martins, Francisco; Loureiro, João; Castro, Mariana; Gharbi, Karim; Johnson, Kevin P.; et al. "Assessing genotype-phenotype associations in three dorsal colour morphs in the meadow spittlebug Philaenus spumarius (L.) (Hemiptera: Aphrophoridae) using genomic and transcriptomic resources". (2016): http://hdl.handle.net/10400.3/4718.
    10.1186/s12863-016-0455-5
  14. Fragata, Ines; Lopes-Cunha, Miguel; Barbaro, Margarida; Kellen, Barbara; Lima, Margarida; Faria, Goncalo S.; Seabra, Sofia G.; et al. "Keeping your options open: Maintenance of thermal plasticity during adaptation to a stable environment". Evolution 70 1 (2016): 195-206. http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=WOS:000368249200016&KeyUID=WOS:000368249200016.
    10.1111/evo.12828
  15. Pina-Martins, Francisco; Vieira, Bruno M.; Seabra, Sofia G.; Batista, Dora; Paulo, Octavio S.. "4Pipe4-A 454 data analysis pipeline for SNP detection in datasets with no reference sequence or strain information". Bmc Bioinformatics 17 (2016): http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=WOS:000368414800002&KeyUID=WOS:000368414800002.
    10.1186/s12859-016-0892-1
  16. Silva, Sara E.; Rodrigues, Ana S. B.; Marabuto, Eduardo; Yurtsever, Selçuk; Borges, Paulo A. V.; Quartau, José A.; Paulo, Octávio S.; Seabra, Sofia G.. "Differential survival and reproduction in colour forms of Philaenus spumarius give new insights to the study of its balanced polymorphism". (2015): http://hdl.handle.net/10400.3/4237.
    10.1111/een.12252
  17. Seabra, S.G.; Satar, I.; Paulo, O.S.. "Microsatellite loci isolated from Chamaeleo chamaeleon". Journal of Genetics 94 (2015): 144-147. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84920545999&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s12041-014-0463-z
  18. Seabra, Sofia G.; Bras, Patricia G.; Martins, Joana; Martins, Renata; Wyatt, Nigel; Shirazi, Jalal; Rebelo, Maria Teresa; et al. "Phylogeographical patterns in Coenosia attenuata (Diptera: Muscidae): a widespread predator of insect species associated with greenhouse crops". Biological Journal of the Linnean Society 114 2 (2015): 308-326. http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=WOS:000348733700007&KeyUID=WOS:000348733700007.
    10.1111/bij.12419
  19. Matos, Margarida; Simoes, Pedro; Santos, Marta A; Seabra, Sofia G; Faria, Goncalo S; Vala, Filipa; Santos, Josiane; Fragata, Ines. "History, chance and selection during phenotypic and genomic experimental evolution: replaying the tape of life at different levels.". Frontiers in genetics 6 (2015): 71-71. http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=MEDLINE&KeyUT=MEDLINE:25767479&KeyUID=MEDLINE:25767479.
    10.3389/fgene.2015.00071
  20. Simões, P.C.; Nunes, V.L.; Mendes, R.; Seabra, S.G.; Paulo, O.S.; Quartau, J.A.. "Tettigettalna josei (Boulard, 1982) (Hemiptera: Cicadoidea): First record in Spain, with notes on the distribution, genetic variation and behaviour of the species". Biodiversity Data Journal 2 1 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85018193872&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/BDJ.2.e1045
  21. Rodrigues, Ana S. B.; Silva, Sara E.; Marabuto, Eduardo; Silva, Diogo N.; Wilson, Mike R.; Thompson, Vinton; Yurtsever, Selcuk; et al. "New Mitochondrial and Nuclear Evidences Support Recent Demographic Expansion and an Atypical Phylogeographic Pattern in the Spittlebug Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae)". Plos One 9 6 (2014): http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=WOS:000336911400046&KeyUID=WOS:000336911400046.
    10.1371/journal.pone.0098375
  22. Seabra, S.G.; Brás, P.G.; Zina, V.; Borges da Silva, E.; Rebelo, M.T.; Figueiredo, E.; Mendel, Z.; Paulo, O.S.; Franco, J.C.. "Molecular Evidence of Polyandry in the Citrus Mealybug, Planococcus citri (Hemiptera: Pseudococcidae)". PLoS ONE 8 7 (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84879758410&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0068241
  23. Nunes, V.L.; Mendes, R.; Marabuto, E.; Novais, B.M.; Hertach, T.; Quartau, J.A.; Seabra, S.G.; Paulo, O.S.; Simões, P.C.. "Conflicting patterns of DNA barcoding and taxonomy in the cicada genus Tettigettalna from southern Europe (Hemiptera: Cicadidae)". Molecular Ecology Resources (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84883510309&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/1755-0998.12158
  24. Martins, R.F.; Zina, V.; Da Silva, E.B.; Rebelo, M.T.; Figueiredo, E.; Mendel, Z.; Paulo, O.S.; et al. "Isolation and characterization of fifteen polymorphic microsatellite loci for the citrus mealybug, Planococcus citri (Hemiptera: Pseudococcidae), and cross-amplification in two other mealybug species.". Journal of genetics 91 2 (2012): 75-78. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84872238608&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s12041-012-0162-6
  25. Seabra, S.G.; Pina-Martins, F.; Marabuto, E.; Yurtsever, S.; Halkka, O.; Quartau, J.A.; Paulo, O.S.. "Molecular phylogeny and DNA barcoding in the meadow-spittlebug Philaenus spumarius (Hemiptera, Cercopidae) and its related species". Molecular Phylogenetics and Evolution 56 1 (2010): 462-467. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77953132324&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ympev.2010.03.023
  26. Pereira, C.M.; Rosado, J.; Seabra, S.G.; Pina-Martins, F.; Paulo, O.S.; Fonseca, P.J.. "Conus pennaceus: A phylogenetic analysis of the Mozambican molluscan complex". African Journal of Marine Science 32 3 (2010): 591-599. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78650463656&partnerID=MN8TOARS.
    10.2989/1814232X.2010.538157
  27. Seabra, S.G.; Quartau, J.A.; Bruford, M.W.. "Spatio-temporal genetic variation in sympatric and allopatric Mediterranean Cicada species (Hemiptera, Cicadidae)". Biological Journal of the Linnean Society 96 2 (2009): 249-265. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-58549083753&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/j.1095-8312.2008.01116.x
  28. Pinto-Juma, G.A.; Seabra, S.G.; Quartau, J.A.. "Patterns of acoustic variation in Cicada barbara Stål (Hemiptera, Cicadoidea) from the Iberian Peninsula and Morocco". Bulletin of Entomological Research 98 1 (2008): 1-14. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-38549153728&partnerID=MN8TOARS.
    10.1017/S0007485307005561
  29. Seabra, S.G.; André, G.; Quartau, J.A.. "Variation in the acoustic properties of the calling songs of cicada barbara and C. orni (Hemiptera: Cicadidae) at the individual and population levels". Zoological Studies 47 1 (2008): 1-10. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-72149134601&partnerID=MN8TOARS.
  30. Seabra, S.G.; Pinto-Juma, G.; Quartau, J.A.. "Calling songs of sympatric and allopatric populations of Cicada barbara and C. orni (Hemiptera: Cicadidae) on the Iberian Peninsula". European Journal of Entomology 103 4 (2006): 843-852. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33750287704&partnerID=MN8TOARS.
    10.14411/eje.2006.115
  31. Pinto-Juma, G.; Simões, P.C.; Seabra, S.G.; Quartau, J.A.. "Calling song structure and geographic variation in Cicada orni Linnaeus (Hemiptera: Cicadidae)". Zoological Studies 44 1 (2005): 81-94. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-21244449195&partnerID=MN8TOARS.
  32. Sueur, J.; Puissant, S.; Simões, P.C.; Seabra, S.; Boulard, M.; Quartau, J.A.. "Cicadas from Portugal: Revised list of species with eco-ethological data (Hemiptera: Cicadidae)". Insect Systematics and Evolution 35 2 (2004): 177-187. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-3242665181&partnerID=MN8TOARS.
  33. Filipe, A.F.; Marques, T.A.; Seabra, S.; Tiago, P.; Ribeiro, F.; Moreira Da Costa, L.; Cowx, I.G.; Collares-Pereira, M.J.. "Selection of Priority Areas for Fish Conservation in Guadiana River Basin, Iberian Peninsula". Conservation Biology 18 1 (2004): 189-200. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-1242288074&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/j.1523-1739.2004.00620.x
  34. Seabra, S.G.; Wilcock, H.R.; Quartau, J.A.; Bruford, M.W.. "Microsatellite loci isolated from the Mediterranean species Cicada barbara (Stål) and C. orni L. (Hemiptera, Cicadoidea)". Molecular Ecology Notes 2 2 (2002): 173-175. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0036284358&partnerID=MN8TOARS.
    10.1046/j.1471-8286.2002.00184.x
  35. Seabra, S.; Simões, P.C.; Drosopoulos, S.; Quartau, J.A.; Sofia G. Seabra; Paula Simões; S. Drosopoulos; J. A. Quartau. "Genetic variability and differentiation in two allopatric species of the genus Cicada L. (Hemiptera, Cicadoidea) in Greece". Mitteilungen aus dem Museum fur Naturkunde in Berlin - Deutsche Entomologische Zeitschrift 47 2 (2000): 143-145. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-1542739324&partnerID=MN8TOARS.
    10.1002/mmnd.4800470203
  36. José A. Quartau; Sofia G. Seabra; A. Sanborn. "Effect of ambient air temperature on the calling song of Cicada orni Linnaeus, 1758 (Hemiptera: Cicadidae) in Portugal". Acta Zoologica Cracoviensia 43 (2000): 193-198. https://pdfs.semanticscholar.org/6c4a/c63d21fa0a842664c4cbf7b908d4b9c0b036.pdf?_ga=2.106668227.1587614516.1581499623-510441550.1566379210.
    Publicado
Poster em conferência
  1. Pimentel, Victor; Pingarilho, Marta; Cruz Sebastião; Mafalda Miranda; Seabra, Sofia; GOMES, Perpetua; Abecasis, Ana. "Transmissão do subtipo A de VIH-1 em Portugal: Aborgagens genéticas, clínicas e epidemiológicas.". Trabalho apresentado em 14ªs Jornadas de Atualização de Doenças Infeciosas do Hospital Curry Cabral (CHLC), 25 e 26 janeiro de 2024, 2024.
  2. Pingarilho, Marta; Pimentel, Victor; Miranda, Mafalda; Seabra, Sofia; GOMES, Perpetua; Abecasis A. "Construção de uma base de dados sociodemográficos, clínicos e genómicos para estudar a epidemia do VIH em Portugal.". Trabalho apresentado em 14ªs Jornadas de Atualização de Doenças Infeciosas do Hospital Curry Cabral (CHLC), 25 e 26 janeiro de 2024, 2024.
  3. Sofia G. Seabra; Pimentel, Victor; Da Moura, Aires; Tomaz, Filipe; Seixas, Gonçalo; Miranda, Mafalda; Ana Gonçalves Domingos; et al. "Towards a simple and cost-effective protocol for viral surveillance in wastewaters". Trabalho apresentado em Microbiotec23, 2023.
  4. André F. Santos; Mónica Nunes; Andreia Silva; Teresa Crespo; Victor Pimentel; Marta Sofia Pereira Pingarilho; Mafalda Miranda; et al. "Viral detection in wastewaters". 2023.
  5. Sofia G. Seabra; Pimentel, Victor; Tomaz, Filipe; Seixas, Gonçalo; Ana Gonçalves Domingos; Pingarilho, Marta; Abecasis, Ana; Parreira, Ricardo. "Viral surveillance in wastewaters: improving sample processing steps and bioinformatic protocols". Trabalho apresentado em 2nd Egas Moniz One Health Symposium, 2023.
  6. Sofia G. Seabra; Mónica Nunes; Andreia Silva; Teresa Crespo; Victor Pimentel; Marta Sofia Pereira Pingarilho; Pieter Libin; Abecasis AB; Ricardo Parreira. "Virome approach to pathogen surveillance of wastewaters". 2023.
  7. Sofia G. Seabra; Kristof Theys; Pieter Libin; Anna Zhukova; Barney I Potter; Hanna Nebenzahl-Guimaraes; Alexander E Gorbalenya; et al. "Geographic dispersion of Zika virus: a phylodynamic approach". 2021.
  8. Simões, Pedro; Fragata, Ines; Antunes, Marta; Sofia G. Seabra; Faria, Gonçalo; Marta A. Santos; Matos, Margarida. "How predictable is evolution of populations with contrasting history? A study across biological levels.". Trabalho apresentado em II Evolution Joint Meeting, 2018.
  9. Simões, Pedro; Fragata, Ines; Sofia G. Seabra; Faria, Gonçalo; Marta A. Santos; Matos, Margarida. "Predictability of evolution of populations with contrasting initial history varies across biological levels.". Trabalho apresentado em XVI Congress of the European Society for Evolutionary Biology (ESEB), 2017.
  10. Simões, Pedro; Sofia G. Seabra; Fragata, Inês; Gonçalo Silva Faria; Santos, MA; Miguel Lopes-Cunha; Matos, Margarida. "Unravelling the genomic content of inversions: a RADseq approach in Drosophila subobscura". Trabalho apresentado em Conference on Conservation Genomics, 2016.
  11. Simões, Pedro; Fragata, Ines; Seabra, Sofia; Faria, Gonçalo; Marta A. Santos; Matos, Margarida. "How much is adaptive evolution contingent on space and time? A meta-analysis in Drosophila subobscura". Trabalho apresentado em XV Congress of the European Society for Evolutionary Biology (ESEB), 2015.
  12. Matos, Margarida; Fragata, Inês; Santos, Josiane; Santos, MA; Margarida Bárbaro; Barbara Kellen; Gonçalo Silva Faria; et al. "Predicting Convergent Evolution? A Multi-level Experiment in Drosophila subobscura,". Trabalho apresentado em Forecasting Evolution, 2014.
  13. Pina-Martins, Francisco; Vieira, BM; Seabra, Sofia; Batista, Dora; Paulo, Octavio. "The 4Pipe4 analysis pipeline¿ how to exploit the hidden SNPs in your 454 dataset: a testcase with a Quercus suber dataset.". Trabalho apresentado em XIII Congresso Luso-Espanhol de Fisiologia Vegetal (FV2013), 2013.
Pré-impressão
  1. Mafalda N.S. Miranda; Marta Sofia Pereira Pingarilho; Victor Pimentel; Perpétua Gomes; Maria do Rosário O. Martins; Sofia G. Seabra; Rolf Kaiser; et al. "The role of Late Presenters on HIV-1 transmission clusters in Europe". 2023. http://dx.doi.org/10.1101/2023.03.14.23287098.
    10.1101/2023.03.14.23287098
Resumo em conferência
  1. Sofia G. Seabra; Pieter J.K. Libin; Kristof Theys; Anna Zhukova; Barney I. Potter; Hanna Nebenzahl-Guimaraes; Alexander E. Gorbalenya; et al. "Viral genomic surveillance: phylodynamic analysis of Zika virus and proposal of a nomenclature system". 2022.
  2. Sofia G. Seabra; Kristof Theys; Pieter J.K. Libin; Anna Zhukova; Barney I. Potter; Hanna Nebenzahl-Guimaraes; Alexander E. Gorbalenya; et al. "Molecular epidemiology of Zika virus: a worldwide characterization". 2021.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2023/04/20 WasteWaterVir: Surveillance of viral genetic diversity in wastewaters from urban areas 6º Congresso Nacional de Medicina Tropical
Instituto de Higiene e Medicina Tropical (Lisbon, Portugal)
2021/11/23 Molecular epidemiology of Zika virus: a worldwide characterization MICROBIOTEC 21 - Congress of Microbiology and Biotechnology 2021
NOVA University (online, Portugal)
2019/07/14 Demographic history and population structure of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae), an insect vector of Xylella fastidiosa Satellite meeting Dynamics and Mechanism of Insect-Transmitted, XVIII IS-MPMI Congress
(Glasgow, Reino Unido)
2019/07/12 Geographic distributions and population genetics of the spittle bug Philaenus spumarius, the insect vector of X. fastidiosa in Europe BRIGIT, 2nd consortium meeting
SASA (Edinburgh, Reino Unido)
2019/05/20 Ocorrência de hibridação entre abelhões comerciais e nativos – potenciais riscos e medidas de gestão World Bee Day: A Ciência das Abelhas
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal)
2018/09/18 Genomic signatures of introgression between commercial and native bumblebees, Bombus terrestris, in the Iberian Peninsula – implications for conservation and trade regulation EurBee 2018 – 8th Congress of Apidology
(Ghent, Bélgica)
2017/08/20 Adaptive significance and genetic basis of the dorsal colour polymorphism of Philaenus spumarius XVI Congress of the European Society for Evolutionary Biology
(Groningen, Países Baixos)
2017/06/05 The colour polymorphic meadow spittlebug as an ecological model species for the study of genomics of adaptation Frontiers in E3: cE3c 2017 Annual Meeting
Complexo Científico do Campus de Ponta Delgada da Universidade dos Açores (Ponta Delgada, Açores, Portugal)
2016/09/05 Using genomics to understand environmental adaptation of Iberian bumblebees and assess the impact of the use of commercial lineages for crop pollination Super-B Meeting (5 – 6 September 2016) and 7th EURBEE Congress of Apidology (7 – 9 September 2016)
(Cluj – Napoca, Roménia)
2016/09/05 Genomic approaches to assess environmental adaptation and detect signatures of introgression between commercial and native pollinators in the Iberian Peninsula XVII Congresso Ibérico de Entomologia
LNEC (Lisbon, Portugal)
2016/06/27 Genomics of laboratory adaptation in clinal populations of Drosophila subobscura 2nd Annual Meeting 2016 – Frontiers in E3
Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal)
2016/05/03 Evolve and reseq: tracking genomic changes during adaptation of clinal populations ConGenomics – Conference on Conservation Genomics
(Vairão, Portugal)
2013/08/19 Experimental and genomic approaches in the study of the balanced colour-polymorphism of the meadow spittlebug (Philaenus spumarius) XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology
Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal)
2013/07/07 Differential survival and reproduction of the colour morphs of the meadow spittlebug, Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) 14th International Auchenorrhyncha Congress
(Yangling, China)
2013/03/22 An ecological model species for the study of balanced colour polymorphism: use of genomic tools and experimental approaches Population Genomics Retreat, Doctoral Program in Population Genomics funded by SNSF
(Gruyère, Suiça)
2011/12/21 Adaptive significance of a muti-allelic balanced colour-polymorphism – Experiments in captivity and population genomics approach Encontro Nacional Biologia Evolutiva
(Coimbra, Portugal)
2010/08/31 Adaptive significance and genetic basis of a balanced colour polymorphism 2nd UK RAD Sequencing meeting
(Edinburgh, Reino Unido)
2007/12/21 Padrões de divergência genética e acústica em espécies mediterrânicas do género Cicada L. (Hemiptera, Cicadidae) III Encontro Nacional de Biologia Evolutiva
IGC (Oeiras, Portugal)
2002/10/07 Microsatellite study on allopatric and sympatric populations of Cicada barbara and Cicada orni (Hemiptera, Cicadoidea) VIIth European Congress of Entomology
(Thessaloniki, Grécia)
1998/12/11 Actividade de canto, características morfológicas e sucesso reprodutivo no Trigueirão (Miliaria calandra) III Congresso Nacional da Sociedade Portuguesa de Etologia
(Coimbra, Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2021 - 2022 Fatores sociodemográficos e comportamentais associados à infeção por SARS-CoV-2 no Concelho de Cascais
Orientador
 Saúde Pública e Desenvolvimento (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
2021 - 2022 Fatores clínicos associados à serologia positiva ou autoreporte de teste PCR positivo para SARS-CoV-2 na população de Cascais
Coorientador
 Saúde Pública e Desenvolvimento (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
2016 - 2017 Analysis of genomic changes during adaptive evolution in Drosophila subobscura populations of contrasting biogeographical history
Coorientador de Marta Antunes
 Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2012 - 2017 Evolutionary history of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) and the adaptive significance and genetic basis of its dorsal colour polymorphism (Formal supervisor in FCT grant, informal supervisor in FCUL)
Coorientador de Ana Sofia Rodrigues
 Biologia - Especialidade Biologia Evolutiva (Doutoramento)
2009 - 2010 Estudo dos padrões filogenéticos e filogeográficos em Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) e espécies próximas
Coorientador de Ana Sofia Rodrigues
 Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2008 - 2009 Caracterização de microssatélites em espécies de ambientes humanizados. Master thesis in Human and Environmental Biology
Coorientador de Inês Satar
 Biologia Humana e Ambiente (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2018/10/11 - 2018/10/12 Member of Organizing Committee of the XIV Encontro Nacional de Biologia Evolutiva, Museu Nacional de História Natural e da Ciência, Lisboa, Portugal, 11– 12 October 2018. (2018/10/11 - 2018/10/12)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
2018/09/04 - 2018/09/07 Member of Organizing Committee of the 14th Meeting of the IOBC-WPRS Working Group, INIAV, Oeiras, Portugal "Integrated control in protected crops, Mediterranean climate" (4 – 7 September 2018). (2018/09/04 - 2018/09/07)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
2013/08/19 - 2013/08/24 Member of the Organising Committee of XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology, FCUL, Lisbon, Portugal (19 – 24 August 2013). (2018/08/19 - 2018/08/24)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2019 African marine invertebrate data analysis and imaging: a dataset and digital platform for research, education and outreach
Arguente principal
 Henrique Niza (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2019 Biodiversity informatics – Entomological data processing, analysis and visualization
Arguente principal
 Leonor Venceslau (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2018 Employment of whole genome resequencing to reveal the evolutionary history and to develop molecular tools for Western European honey bees (Apis mellifera subspecies)
Arguente
 Dora Henriques (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
2018 Black seabream, Spondyliosoma cantharus: stock structure in the eastern Atlantic and characterisation of the biology and fishery in the Portuguese coast
Arguente
 Ana Neves (Doutoramento)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2017 Evolutionary history of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) and the adaptive significance and genetic basis of its dorsal colour polymorphism
Vogal
 Ana Sofia Rodrigues (Doutoramento)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2017 Diversity patterns of honey bee (Apis mellifera L.) populations from the archipelago of Azores: insights from mtDNA and wing geometric morphometrics
Arguente principal
 Helena Ferreira (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2017 Analysis of genomic changes during adaptive evolution in Drosophila subobscura populations of contrasting biogeographical history
Orientador
 Marta Antunes (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2011 Morphological and genetic divergence of the mangrove gastropod Cerithidea decollata along the eastern coast of Africa
Arguente principal
 Sara Madeira (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2011 On the evolutionary history of the iberian Sooty Copper butterflies
Vogal
 Renata Martins (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2010 Estudo dos padrões filogenéticos e filogeográficos em Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) e espécies próximas
Orientador
 Ana Sofia Rodrigues (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
2009 Caracterização de microssatélites em espécies de ambientes humanizados
Orientador
 Inês Satar (Mestrado)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em conferência

Nome da conferência Local da conferência
2023/12/18 - 2023/12/19 XIX ENBE - Annual meeting of Portuguese Association for Evolutionary Biology Instituto Superior de Agronomia / Universidade Lisboa
2019/07/10 - 2019/07/13 XVIII Congreso Ibérico de Entomologia
2016/09/05 - 2016/09/08 XVII Congresso Ibérico de Entomologia LNEC
2015/12/21 - 2015/12/21 XI Encontro Nacional de Biologia Evolutiva Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria 		Instituição / Organização Entidade financiadora
2018 - 2018 Project evaluation as a scientific expert
Avaliador
 National Research Agency (ANR)

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2023/12 - Atual Associação Portuguesa de Biologia Evolutiva (APBE)
2023/01 - Atual Sociedade Portuguesa de Entomologia
2013/07 - Atual International Auchenorrhyncha Society Member of Board of Administrators

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2021/07/12 - 2021/07/23 Tutoring in internship "Curtos Estágios Científicos em Férias" organized by ANEM Carolina Almeida
2018 - 2018 Training of students in Molecular Genetics in the laboratory of Genetics of DBA, FCUL: Diogo Couceiro (graduate student in Biochemistry); Martina Panisi (PhD student in BIODIV)
2010 - 2013 Co-supervision of research technicians in several projects - field work, laboratory work and data analysis Eduardo Marabuto; Sara Ema Silva; João Silva; Renata Martins; Patricia Brás; Ana Maria Tavares
Distinções

Outra distinção

1993 Menção Honrosa aos alunos caloiros que concluiram o 1º ano com melhores classificações
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal