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Passionate, determined, and enthusiastic from an early age, I realised that curiosity and eagerness for knowledge are my fuel. Scientific Questions: Yes/No Why/Why not With my background in biotechnology and biochemistry, I am able to know if works experimentally, allying my knowledge in Computational Chemistry I can now determine why, make predictions, and design solutions. I seek to combine my strengths in collaboration with a dynamic team that allows me to grow and be part of the world's evolution.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Sónia Filipa Gomes dos Santos

Nomes de citação

  • Santos, Sónia
  • Sónia F G Santos
  • Sónia F Santos

Identificadores de autor

Ciência ID
BE17-4192-3F2B

Endereços de correio eletrónico

  • sonia.santos@northumbria.ac.uk (Profissional)
  • soniafgsantos@gmail.com (Profissional)
  • sonia17051989@gmail.com (Pessoal)

Moradas

  • 10 Longhorn Close, NE6-1XJ, Newcastle upon Tyne, Newcastle upon Tyne, Reino Unido (Profissional)

Websites

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Alemão Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Francês Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A2) Utilizador independente (B2) Utilizador elementar (A2) Utilizador independente (B2)
Formação
Grau Classificação
2020/10 - 2023/09
Em curso
 Computational Chemistry (Doctor of Philosophy)
Northumbria University, Reino Unido

Hub for Biotechnology in the Built Environment , Portugal
2020/04/14 - 2020/07/06
Em curso
 Introduction to Java programming (Outros)
Universidade de Coimbra, Portugal
2017/10/06 - 2019/09/13
Concluído
 Biochemistry (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"Estudos de dinâmica molecular em endonucleases de restrição do tipo 2 de raro corte- Estudo da enzima SgrAI " (TESE/DISSERTAÇÃO)
2017/02 - 2017/04
Concluído
 Introduction to Computers in Chemistry (Outros)
Universidade de Coimbra, Portugal
2007 - 2012/10/18
Concluído
 Biotechnology (Licenciatura)
Instituto Politécnico de Coimbra Escola Superior Agrária de Coimbra, Portugal
"Extraction of RNA from Triticum aestivum L., Introduction to ereal-time PCR with Triticum aestivum L., Tissue culture in Bog Pine, Somatic embryogenesis in conifers, Immunolocalization of PIN proteins in Pisum saticum L. and SSR Markers PCR. " (TESE/DISSERTAÇÃO)
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2020/06/01 - 2020/09/30 Investigador (Investigação) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2012/02/12 - 2013/05/15 Estagiário de Investigação (Investigação) Centro de Estudos de Recursos Naturais Ambiente e Sociedade, Portugal
Centro de Estudos de Recursos Naturais Ambiente e Sociedade, Portugal
2012/07/01 - 2012/09/30 Estagiário de Investigação (Investigação) Mendelova Univerzita v Brne, República Checa
Mendelova Univerzita v Brne, República Checa

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015/08/10 - 2020/01/27 Technique of complementary diagnostic exams in Ophthalmology Centro Cirurgico de Coimbra, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2020/10/01 - 2023/09/30 Computational Enzyme design for the development of biotechnology to create a new generation of living buildings
ET20/HLS/APP/SINGH
Bolseiro de Doutoramento
Northumbria University Faculty of Health and Life Sciences, Reino Unido
 UK Research and Innovation
Em curso
2020/06/01 - 2020/09/30 Rational design of endonucleases
IF/01272/2015
Bolseiro de Investigação
CNC.IBILI, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Outro

Designação Financiadores
2012/02 - 2013/05 Geranium Robertianum L. antioxidant properties
PTDC/AAC-CLI/098308/2008
PTDC/AAC-CLI/118092/2010
PEst-OE/AGR/UI0681/CNC/CEF/2011
Extracurricular Internship
Centro de Estudos de Recursos Naturais Ambiente e Sociedade, Portugal

Universidade de Coimbra Departamento de Química, Portugal

Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Centro de Investigação e de Tecnologias Agro-Ambientais e Biologicas, Portugal
2011/03 - 2011/05 Cannabinoid effect on an increased intraocular pressure model
x
Extracurricular Internship
Associação para a Investigação Biomédica e Inovação em Luz e Imagem, Portugal
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Sónia F. G. Santos; Rajesh Reddy Bommareddy; Gary Black; Warispreet Singh; Meilan Huang. "The substrate specificity in the O-demethylation of 4-alkylguaiacols by cytochrome P450 AgcAP450". Catalysis Science & Technology 13 7 (2023): 2070-2079. http://dx.doi.org/10.1039/d3cy00123g.
    10.1039/d3cy00123g
  2. Sónia Filipa Gomes dos Santos; Warispreet Singh; Santos SFG; Paul James; Gary Black; Meilan Huang; Kshatresh Dutta Dubey. "Single-Site Mutation Induces Water-Mediated Promiscuity in Lignin Breaking Cytochrome P450GcoA.". ACS omega (2022): https://europepmc.org/articles/PMC9219061.
    10.1021/acsomega.2c00524
  3. Figueiredo, Pedro R.; Santos, Sónia F. G.; Almeida, Beatriz C.; Simões, Isaura; Carvalho, Alexandra T. P.. "Introduction of a Glycine Linker Connecting the Heavy and Light Chains in Synthetic Cardosin B-Derived Rennet Changes the Specificity of Subpocket S3'". The Journal of Physical Chemistry B 125 17 (2021): 4368-4374. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c01826.
    10.1021/acs.jpcb.1c01826
  4. Helena Ramos; Juliana Calheiros; Joana Almeida; Valentina Barcherini; ´Sónia Santos; Alexandra T. P. Carvalho; Maria M. M. Santos; Lucília Saraiva. "SLMP53-1 Inhibits Tumor Cell Growth through Regulation of Glucose Metabolism and Angiogenesis in a P53-Dependent Manner". International Journal of Molecular Sciences (2020): https://www.mdpi.com/1422-0067/21/2/596.
    10.3390/ijms21020596
Poster em conferência
  1. Santos, Sónia. "The O-Demethylation of 4-alkylguaiacols by Cytochrome P450 AgcAEP4". Trabalho apresentado em 8th Annual CCPBiosim Conference- Frontiers in Biomolecular Simulations 2022, 2022.
  2. Santos, Sónia; Singh, Warispreet. Autor correspondente: Singh, Warispreet. "The O-Demethylation of 4-alkylguaiacols by Cytochrome P450 AgcAEP4". Trabalho apresentado em NextGenBiocat- Next Generation Biocatalysis an International Young Investigator Symposium, 2022.
  3. Santos, Sónia; Singh, Warispreet. "Reaction mechanism of Mevalonate diphosphate decarboxylases using QM/MM". Trabalho apresentado em MGMS Young Modellers Forum 2021, 2021.
Pré-impressão
  1. Sónia Filipa Gomes dos Santos; Warispreet Singh; Sonia F Santos; Shalini Yadav; Gary Black; Vera Krewald; Kshatresh Dutta Dubey. "Substrate Conformation Masquerades Two different Oxidants in Aromatic C-H and C-F bond activation by Heme-dependent Tyrosine Hydroxylase". 2022. http://dx.doi.org/10.26434/chemrxiv-2022-25g47.
    10.26434/chemrxiv-2022-25g47
Resumo em conferência
  1. Septiyani, Retnosyari; Wibowo, Condro. "Antioxidant properties of Geranium robertianum L.". Trabalho apresentado em European Journal of Clinical Investigation, 2019.
    10.1063/1.5097503
Tese / Dissertação
  1. Santos, Sónia. "Estudos de Dinâmica Molecular em endonucleases de restrição do tipo 2 de raro corte". Mestrado, 2019.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2022/11/25 QM/MM study on aromatic hydroxylation performed by the P450 Cinnamate-4-Hydroxylase MGMS Young Modellers Forum 2022
Molecular Graphics and Modelling Society (Oxford, Reino Unido)
2022/07/15 The O-demethylation of 4-alkylguaiacols by Cytochrome P450 AgcAEP4
Chemistry and Biochemistry Department of Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa (FCUL) (Lisbon, Portugal)
2021/02/10 Breakdown of biomass using enzyme engineering PhD talks
HBBE (Newcastle upon Tyne, Reino Unido)
2020/02/27 “Hands-on session: Molecular Dynamics” PDBEB Courses 2019/2020 - Computational Biology
(Portugal)

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2018/10/01 - Atual 2018 MIT Portugal Annual Conference
Conferência
 Annual Conference of the MIT Program
2011/11/15 - Atual Cell/Tissue Culture Workshop
Conferência
2010/04/15 - Atual Animal testing Workshop
Conferência
2022/09/10 - 2023/01/10 Programming with Python
Oficina (workshop)
 Programming with Python
2022/06/09 - 2022/06/10 Using MD Analysis and ML in real-life MD workflows
Oficina (workshop)
 MD Analysis and Machine Learning workshop
The University of Edinburgh, Reino Unido

CCPBioSim- Collaborative Computational Project for Biomolecular Simulation, Reino Unido
2020/10/02 - 2020/10/09 Biomolecular simulations workshops and seminars
Oficina (workshop)
 CCPBiosim Training Week 2020
CCPBioSim- Collaborative Computational Project for Biomolecular Simulation, Reino Unido
2020/09/19 - 2020/09/19 Latest advances in innovative therapies
Conferência
 2nd CIBB Innovative Therapies Retreat 2020
Universidade de Coimbra, Portugal
2012/09/11 - 2012/09/13 Applied Plant Biotechnology Conference

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2021 - Atual IChemE -Advancing Chemical Engineering Worldwide Affiliate member/ Postgraduate student

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2022/06/01 - 2022/09/15 Master's Project- Unspecific Peroxydases in Lignin Breakdown Kaustubh Mane
Distinções

Prémio

2022 Best oral communication- "The O-demethylation of 4-alkylguaiacols by Cytochrome P450 AgcAEP4"