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Eugénio C. Ferreira is a Full Professor at the Department of Biological Engineering at the University of Minho. From December 2019 to February 2025, he served as Vice-Rector for Research & Innovation, overseeing the university’s research strategy, innovation ecosystem, and international collaborations. He also acted as President of the Board of Directors of TECMINHO (2020-25) and Vice-President of the Board of Directors of CENTI – Centre for Nanotechnology and Smart Materials (2022-2025). Previously, he was Director of the Centre of Biological Engineering (CEB) (2016-2020) where he also led the BIOSYSTEMS research group, focusing on Bioprocess Engineering and Computational Biosystems. His research expertise relates to Process Systems Engineering in Biotechnological, Chemical and Environmental Applications with particular emphasis in the following areas of activity: Modelling, Monitoring, and Control of Bioprocesses; Systems Biology, Bioinformatics, and Metabolic Engineering; Image Analysis and Chemometrics in (Environmental) Biotechnology. He also served as Director of the PhD Program in Bioengineering under the MIT Portugal Program. His leadership roles extend to governance and academic management, including serving as a member of Portuguese Academy of Engineering and Counselor Member at the General Council of the University of Minho (2017-2019), Associate Dean for Research at the School of Engineering (2010-2013), Associate Director of the Department of Biological Engineering (2004-2010), and Director of the Master’s Program in Environmental Management. At the national level, Professor Ferreira has been actively involved in shaping research and education policies. He served as Chair of the Chemical & Biological Engineering Section at the Portuguese Engineers Institution (2010-2013) and as General Secretary of the Portuguese Society of Biotechnology (2004-2019). He was the Portuguese Delegate at the Board of the European Federation of Chemical Engineering (2010-13) and is a member of the IFAC Technical Committee on Biosystems and Bioprocesses and the National Representative to the Technical Committee on Modelling, Monitoring, Measurement, and Control of the European Society of Biochemical Engineering Sciences. He was the Chair of the organization committee of the CHEMPOR2008 - International Chemical Engineering Congress. In addition, he integrated the organizing committees of several conferences (CAC2004, ESCAPE14, ESBES2) and the international program committees of more than 60 Congresses. He performed as Coordinator of the PhD Fellowship Review Panel for Bioengineering and Biotechnology at the Portuguese Foundation for Science and Technology (FCT) and a Member of the Assessment Panel for Biotechnology and Bioengineering Academic Programs at the National Agency for the Assessment and Accreditation of Higher Education (A3ES). Additionally, he has contributed as an expert reviewer for the Agência Nacional de Inovação (ANI), European Science Foundation (ESF), and the European Commission. Professor Ferreira has published 13 books and is the author of more than 200 international refereed papers and book chapters. In addition, more than 325 papers and communications in conferences have been published by him. Professor Ferreira holds a degree (1986) and a PhD (1995) in Chemical Engineering from the Faculty of Engineering of the University of Porto. His international academic trajectory includes doctoral research at Université Catholique de Louvain (Belgium), a postdoctoral fellowship at Universitat Autònoma de Barcelona (Spain), and a sabbatical at the University of California, San Diego (USA).
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Eugénio Campos Ferreira
Género
Masculino

Nomes de citação

  • E. C. Ferreira
  • Ferreira, Eugénio C.
  • Ferreira, E.C.

Identificadores de autor

Ciência ID
CA10-0F06-E2A0
ORCID iD
0000-0002-5400-3333
Google Scholar ID
FXPpP8UAAAAJ
Researcher Id
B-5417-2009
Scopus Author Id
7103157456

Endereços de correio eletrónico

  • ecferreira@deb.uminho.pt (Profissional)

Moradas

  • Universidade do Minho. Departamento de Engenharia Biológica, Campus de Gualtar, 4710-057, Braga, Braga, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Química
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia do Ambiente
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Ambiental
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
Formação
Grau Classificação
2004/07/23
Concluído
Habilitation (Título de Agregado)
Universidade do Minho, Portugal
"Agregação em Engenharia Química e Biológica " (TESE/DISSERTAÇÃO)
1997 - 1998
Concluído
Supervision and Control of Biological Wastewater Treatment Plants (Pós-doutoramento)
Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha
1995/07/11
Concluído
Doutoramento em Engenharia Química (Doutoramento)
Universidade do Porto, Portugal
"Identificação e Controlo Adaptativo de Processos Biotecnológicos" (TESE/DISSERTAÇÃO)
1981 - 1986/07
Concluído
Engenharia Química (Licenciatura)
Universidade do Porto, Portugal
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
1986/09/01 - 1990/01/31 Investigador (Investigação) LNETI - Laboratório Nacional de Engenharia e Tecnologia Industrial, Portugal
LNETI - Laboratório Nacional de Engenharia e Tecnologia Industrial, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2010/11/11 - Atual Professor Catedrático (Docente Universitário) Universidade do Minho Departamento de Engenharia Biológica, Portugal
2004/08 - 2010/11 Professor Associado (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal
2001/07 - 2004/07 Professor Associado (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal
2000/08 - 2001/06 Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal
1991/03 - 1995/06 Assistente (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal

Cargos e Funções

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2022/03 - 2025/02/11 Vice-Presidente Centitvc Centro de Nanotecnologia e Materiais Técnicos Funcionais e Inteligentes, Portugal
Centitvc Centro de Nanotecnologia e Materiais Técnicos Funcionais e Inteligentes, Portugal
2020/01/06 - 2025/02/11 Presidente TecMinho Associação Universidade-Empresa para o Desenvolvimento, Portugal
TecMinho Associação Universidade-Empresa para o Desenvolvimento, Portugal
2019/12/11 - 2025/02/11 Vice-Reitor Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho, Portugal
2011 - 2021 Diretor do Programa Doutoral em Bioengenharia Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2020/03 - 2020/12 Presidente Spinpark – Centro de Incubação de Base Tecnológica, Portugal
Spinpark – Centro de Incubação de Base Tecnológica, Portugal
2016/01/26 - 2020/01/26 Director de Unidade Orgânica Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2017/09 - 2019/12/31 Membro da Comissão Diretiva do curso de Mestrado em Bioinformática Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2017/04/06 - 2019/12/10 Membro do Conselho Geral Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho, Portugal
2013/01/01 - 2019/12/10 Conselho Científico Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2010/03/03 - 2013/05/03 Vice-Presidente da Unidade Orgânica Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2004/09 - 2010/10 Diretor do curso de Mestrado em Gestão Ambiental Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2001/09 - 2003/09 Diretor de Curso da Licenciatura em Engenharia Biológica Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2025/01/02 - 2027/12/31 MarUMinho - Programa de investigação multidisciplinar em Ciência e Tecnologia Marinha da Universidade do Minho
Investigador responsável
Universidade do Minho, Portugal
Fundação Calouste Gulbenkian
Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31 Laboratório Associado em Biotecnologia, Bioengenharia e Sistemas microELetromecânicos
LA/P/0029/2020
Universidade do Minho, Portugal

Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Universidade do Minho Labbels, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/10/01 - 2025/09/30 GIATEX - Intelligent Water Management at ITV
C644943052-00000050
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Agência para a Competitividade e Inovação IP
Em curso
2021/07/01 - 2023/06/30 PortAberta - Portal de Investigação para a Ciência Aberta
Investigador
Universidade do Minho, Portugal
AMA - Agência para a Modernização Administrativa
Em curso
2021/07/01 - 2023/06/30 Portal da Inovação da Universidade do Minho
POCI-01-0246-FEDER-181310
Investigador responsável
Universidade do Minho, Portugal
Agência Nacional de Inovação SA
Em curso
2021/01/01 - 2022/12/31 MarPlas - Evaluation and valorization of plastics and microplastics in marine environment
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2020/01/01 - 2022/12/31 PAMWater - Predictive and Analytic Models for the Optimization of Multi-municipal Water Systems / Modelos Analíticos e Predictivos para Optimização de Sistemas Multimunicipais de Água
DSAIPA/AI/0099/2019
Investigador
Universidade do Minho, Portugal

Universidade do Minho Centro ALGORITMI, Portugal

Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/07/01 - 2022/06/30 DEEPBIO - Machine learning and deep learning approaches to industrial biotechnology applications
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Silicolife Lda., Portugal

Universidade Nova de Lisboa, Portugal
Agência Nacional de Inovação SA
Em curso
2018/07/01 - 2021/06/30 AGeNT - Aerobic granule technology combined with selected microbial agents for the degradation of toxic wastewater pollutants / Tecnologia de grânulos aeróbios combinada com agentes microbianos selecionados para a degradação de poluentes tóxicos de águas residuais
PTDC/BTA-BTA/31264/2017
Investigador responsável
Universidade Católica Portuguesa, Portugal

Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/07/01 - 2021/06/30 Easy Ride - Experience is Everything
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Agência para o Investimento e Comércio Externo de Portugal, E.P.E.

Agência Nacional de Inovação SA
Em curso
2017/01/01 - 2020/12/31 Biomass and Bioenergy Research Infrastructure
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Laboratório Nacional de Energia e Geologia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/10/01 - 2020/09/30 Programa Doutoral em Bioengenharia
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2016/10/01 - 2020/09/30 Doctoral Program in Chemical and Biological Engineering
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2017/01/01 - 2020/06/30 MultiBiorefinery - Multi-purpose strategies for broadband agro-forest and fisheries by-products valorisation: a step forward for a truly integrated biorefinery
SAICTPAC/0040/2015
Investigador responsável
Universidade de Aveiro, Portugal

Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal

Universidade Católica Portuguesa, Portugal

Universidade do Minho, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/07/01 - 2020/06/30 BIOTECNORTE - Underpinning Biotechnology to foster the north of Portugal bioeconomy
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2017/06/01 - 2020/05/31 Biodata.pt - Portuguese Biological Data Network
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/03/01 - 2020/02/29 Bioinformatics Services for Data-Driven Design of Cell Factories and Communities
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
UK Research and Innovation
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 Centre of Biological Engineering - University of Minho
UID/BIO/04469/2019
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2016/01/01 - 2018/12/31 SISBI - Intelligent decision support system for Industrial Biotechnology
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Silicolife Lda., Portugal
Agência Nacional de Inovação SA
Concluído
2015/01/01 - 2018/12/31 Centre of Biological Engineering - University of Minho
UID/BIO/04469/2013
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2015/04 - 2018/03 DYNAMICS: Analysis and optimization of industrial microorganisms under dynamic process conditions
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2014/03 - 2017/02 DeYeast Library - Designer yeast strain library optimized for metabolic engineering applications
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2016/03/01 - 2016/05/31 Genome-scale Constraint-based Modeling of Metabolic and Microbial Community Interactions
SFRH/BSAB/114310/2016
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2012/07/01 - 2015/06/30 PEM - Plataforma tecnológica de suporte à Engenharia Metabólica / Platform for Metabolic Engineering
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Silicolife Lda., Portugal
Agência Nacional de Inovação SA
Concluído
2010/05 - 2015/04 CamCon - Campylobacter control - novel approaches in primary poultry production
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
European Commission
Concluído
2010/10 - 2014/03 Study of the operation of SBRs for enhanced phosphorous removal and for PHA production by image analysis and multivariable statistical techniques
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2010/05 - 2013/11 SYNBIOBACTHER - Synthetic biology approaches to engineer "therapeutic" bacteria / Construção de bactérias "terapêuticas" usando uma abordagem de biologia sintética
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2010/04 - 2013/09 AshByofactory - Ashbya gossypii: a systems metabolic engineered cell factory / Ashbya gossypii: uma fábrica celular manipulada por engenharia metabólica de sistemas
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2010/04 - 2013/09 HeliSysBio - Molecular Systems Biology Helicobacter pylori / Biologia Molecular de Sistemas em Helicobacter pylori
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2011/01/01 - 2012/12/31 Projecto Estratégico - LA 23 - 2011-2012
PEst-OE/EQB/LA0023/2011
PEst-C/SAU/LA0026/2011
Universidade do Minho, Portugal

Instituto de Biotecnologia e Bioengenharia, Portugal

Universidade do Algarve, Portugal

Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Universidade dos Açores, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2009/04 - 2012/09 Bridging Systems and Synthetic Biology for the development of Improved Microbial Cell Factories
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2008/12 - 2011/11 Systems Biology as a Driver for Industrial Biotechnology
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
European Commission
Concluído
2007/01 - 2010/01 SuperETAR: Supervision and Intelligent Control of Wastewater Treatment Plants
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/05 - 2008/10 PHAGEVET-P - Veterinary phage therapies as alternatives to antibiotics in poultry production
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
European Commission
Concluído
2005/07 - 2008/06 MOBioPro-Nature-based computation in the modeling and optimization of biotechnological processes / Computação inspirada na natureza para a modelação e optimização de processos biotecnológicos
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/05 - 2008/06 recSysBio - A Systems Biology approach for optimization of recombinant fermentation processes
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/10 - 2008/03 Monitoring of a Wastewater Treatment Plant by Image Analysis Techniques
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/01 - 2006/12 Online control of fixed-bed reactors applied to aerobic wastewater treatment
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
European Commission
1998/07 - 2003/07 Optimal management of wastewater systems
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
European Commission
Concluído
1997/12 - 2001/11 BioToBio - Biological Removal of Nitrogen: from Biofilms to Bioreactors
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
European Commission
Concluído
1998/10/01 - 2001/09/01 Simulação Modular e Optimização Integrada de Processos Industriais
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
JNICT - Junta Nacional de Investigação Científica e Tecnológica
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Dourado, Fernando; Forte, Ana Cristina Figueiras; Mota, André; Neto, Belmira; Ferreira, Eugénio C.; Silva, Francisco Almeida Garrett Soares; Oliveira, João Vítor; et al. "Bacterial cellulose production: valorization of wastewater and life cycle assessment". 2022.
  2. Forte, Ana Cristina Figueiras; Dourado, Fernando; Gama, F. M.; Ferreira, Eugénio C.. "Economic & environmental assessment of bacterial cellulose production". 2021.
  3. Lima, Diogo Batista; Lagoa, Davide Rafael Santos; Cruz, Fernando João Pereira da; Bastos, José; Capela, João; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Miguel; Dias, Oscar. "merlin v4: an updated platform for reconstructing genome-scale metabolic models". 2020.
  4. Melo, A. R. B.; Padrão, Jorge; Nicolau, Ana; Quintelas, Cristina; Ferreira, Eugénio C.; Mesquita, D. P.. "Toxicity assessment of ibuprofen on activated sludge by respirometric technique". 2019.
  5. Ferreira, Eugénio C.. "Biotecnologia para o desenvolvimento sustentado da bioeconomia do Norte de Portugal". 2019.
  6. Paulo, Ana M. S.; Costa, Joana; Amorim, Catarina L.; Mesquita, Daniela P.; Ferreira, Eugénio C.; Castro, Paula M.L.; Costa, Joana Sofia Gomes; Mesquita, D. P.; Castro, Paula M. L.. "Impact of industrial wastewater on aerobic granules morphology and nitrification process in bioreactors". 2019.
  7. Quintelas, Cristina Maria Catalão; Melo, António Renê Benevides de; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.; Amaral, António Luís Pereira do. "Rapid method for the quantification and identification of emerging compounds in wastewater based in nir spectroscopy and chemometrics". 2019.
  8. Forte, Ana Cristina Figueiras; Dourado, Fernando; Gama, F. M.; Ferreira, Eugénio C.. "Life cycle assessment (cradle-to-gate) of bacterial cellulose production". 2019.
  9. Soares da Silva, F. A. G.; Dourado, Fernando; Ferreira, Eugénio C.; Poças, F.; Gama, F. M.. "Optimization of bacterial nanocellulose fermentation using lignocellulosic residues and development of novel BNC-starch composites". 2019.
  10. Forte, Ana; Dourado, Fernando; Gama, F. M.; Ferreira, Eugénio C.. "Cradle-to-gate assessment of bacterial cellulose production". 2019.
  11. Leal, Cristiano; Val, Angeles; Zlatkova, Anastasiya; Araújo, Bárbara; Mesquita, D. P.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.. "Density and sludge volume index estimation in mature aerobic granular sludge by quantitative image analysis and chemometrics tools". 2018.
  12. Lagoa, D.; Liu, Filipe; Ferreira, Eugénio C.; Faria, J.; Henry, C.; Dias, Oscar. "Towards a genome-wide transport systems encoding genes tracker". 2018.
  13. Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.; Amaral, A. Luís. "Quantification of pharmaceuticals contaminants in wastewaters by NIR spectroscopy". 2018.
  14. Ferreira, V.; Cortez, Susana; Padrão, Jorge; Mesquita, D. P.; Dias, Nicolina M.; Duarte, Maria Salomé; Ferreira, Eugénio C.; et al. "Impact of professional cleaning agent used in fish-canning industry in wastewater treatment". 2018.
  15. Ferreira, Eugénio C.. "CEB: Centro de Engenharia Biológica [da] Universidade do Minho". 2018.
  16. Santos, Sílvio Roberto Branco; Brandão, Ana Catarina; Oliveira, A.; Melo, Luís Daniel Rodrigues; Pinto, Graça; Oliveira, Hugo Alexandre Mendes; Ferreira, Eugénio C.; Azeredo, Joana. "New bacterial biorecognition elements from phage origin". 2017.
  17. Mesquita, D. P.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.. "Quantitative Image Analysis: a monitoring tool in wastewater treatment". 2017.
  18. Amaral, A. Luís; Genisheva, Zlatina; Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.; Oliveira, José Maria. "Wine chemical characterization by near infrared spectroscopy and chemometric analysis". 2017.
  19. Quintelas, Cristina Maria Catalão; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.. "Application of near infrared spectroscopy as a process analytical technology". 2017.
  20. Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.. "Removal of paracetamol by an activated sludge bioreactor". 2017.
  21. Mesquita, D. P.; Quintelas, Cristina; Ferreira, Eugénio C.. "Characterization of the effects of pharmaceuticals in activated sludge using quantitative image analysis". 2017.
  22. Oliveira, Emanuel; Ferreira, Eugénio C.; Dias, Oscar. "Modelling interspecies interactions of syntrophic communities". 2017.
  23. Oliveira, Ana; Mesquita, Daniela P.; Amorim, Catarina L.; Amaral, A. L.; Ferreira, Eugénio C.; Loosdrecht, Mark V.; Castro, Paula M. L.. "Extraction and characterization of extracellular polymeric substances from aerobic granular sludge from a full-scale sequencing batch reactor in Portugal". 2017.
  24. Dias, Oscar; Santos, Sophia Torres; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "Towards an improved version of Kluyveromyces lactis genome-scale metabolic model". 2016.
  25. Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.. "Remoção de ibuprofeno por um sistema aeróbio de lamas ativadas". 2016.
  26. Sargo, Cíntia R .; Silva, Adilson J.; Giordano, Roberto C; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.; Zangirolami, Teresa C.. "Produção e consumo de acetato em cultivos de Salmonella typhimurium em condições aeróbias". 2015.
  27. Amaral, A. L.; Mesquita, D. P.; Braga, Adelaide; Belo, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evaluation of dimorphic Yarrowia lipolytica strains growth in different culture media by quantitative image analysis". 2015.
  28. Dias, Oscar; Saraiva, João; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "Towards a genome-scale metabolic model of the Streptococcus pneumoniae R6 avirulent strain". 2015.
  29. Santos, Sílvio Roberto Branco; Martins, Ivone M.; Costa, Ana Rita Martins; Nóbrega, Franklin Luzia; Lavigne, Rob; Ferreira, Eugénio C.; Azeredo, Joana. "Exploiting the proteins encoded in the genome of the broad host range Salmonella phage PVP-SE1". 2015.
  30. Quintelas, C.; Mesquita, D. P.; Lopes, João A.; Ferreira, Eugénio C.; Sousa, Clara Cecília Santana. "Near-infrared spectroscopy for the detection and quantification of bacterial contaminations in pharmaceutical products". 2015.
  31. Belo, I.; Braga, A.; Mesquita, D.; Amaral, A.L.; Ferreira, E.C.. "Comparison of aroma production from castor oil by Yarrowia lipolytica in airlift and STR bioreactors". Trabalho apresentado em EUROPEAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 2015.
    Publicado
  32. Silva, A.; Sargo, Cintia Regina; Zangirolami, Teresa Cristina; Giordano, Roberto de Campos; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Metabolic profiling of secreted fermentative byproducts by Salmonella typhimurium". 2014.
  33. Dias, Oscar; Liu, Filipe; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.; Rocha, Isabel. "Prediction of protein subunits using KEGG BRITE". Trabalho apresentado em COBRA 2014 - 3rd Conference on Constraint-Based Reconstruction and Analysis, Charlottesville, 2014.
  34. Portela, C.; Villas-Bôas, S.; Rocha, I.; Ferreira, E.C.. "Genome scale metabolic network reconstruction of the pathogen Enterococcus faecalis". 2013.
    10.3182/20131216-3-IN-2044.00067
  35. Ferreira, Eugénio C.. "Bio-engineering Systems at MIT Portugal Program". 2013.
  36. Gomes, Daniel Gonçalves; Dias, Oscar; Ferreira, Eugénio C.; Domingues, Lucília; Rocha, I.. "Reconstruction of a genome-scale metabolic model for the filamentous fungus Ashbya gossypii". 2013.
  37. Dias, Oscar; Gombert, Andreas Karoly; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "iOD962 - the first genome-scale metabolic model of Kluyveromyces lactis". 2013.
  38. Dias, Oscar; Gomes, Daniel Gonçalves; Ferreira, Eugénio C.; Domingues, Lucília; Rocha, I.. "Reconstructing genome-scale metabolic models with merlin: the Ashbya gossypii case study". 2012.
  39. Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "Assembling genome-wide transporter system annotations". 2012.
  40. Gomes, Daniel; Dias, Oscar; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Reconstruction of a genome-scale metabolic model for the riboflavin producer fungus Ashbya gossypii". Trabalho apresentado em EMBO Conference Series - From Functional Genomics to Systems Biology, Heidelberg, 2012.
    Publicado
  41. Carneiro, S.; Carreira, Rafael; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "Investigating metabolic responses in recombinant E. coli cultures using metabolomics and fluxomics data". 2012.
  42. Gomes, Daniel Gonçalves; Dias, Oscar; Domingues, Lucília; Rocha, I.; Gomes, Daniel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Revealing new biotechnological potentialities of the riboflavin producer fungus Ashbya gossypii by means of the construction and analysis of its metabolic network". Trabalho apresentado em MicroBiotec'11, Braga, 2011.
    Publicado
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    Publicado
Artigo em revista
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  2. Melo, Antonio; Costa, Joana; Quintelas, Cristina; Amaral, António L.; Ferreira, Eugénio C.; Mesquita, Daniela P.. Autor correspondente: Mesquita, Daniela P.. "Quantitative image analysis for assessing extracellular polymeric substances in activated sludge under atrazine exposure". Separation and Purification Technology 349 (2024): 127831. http://dx.doi.org/10.1016/j.seppur.2024.127831.
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  3. E. C. Ferreira. "Nova Formação em Gestão Ambiental na Universidade do Minho", Ambiente Magazine, 2004, http://hdl.handle.net/1822/3487.
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  5. E. C. Ferreira. "A Internet como Fonte de Informação para Engenharia", Engenharia e Construção, 1998
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Capítulo de livro
  1. Eugénio Campos Ferreira. "Publicação Científica, Ciência Aberta e Avaliação de Investigação — Breve Análise Crítica". 2023.
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  2. Mesquita, Daniela P.; Quintelas, Cristina; Amaral, Antonio; Ferreira, Eugénio C.. "Quantitative Image Analysis as a Valuable Tool to Assess Aerobic Wastewater Treatment Systems". In Emerging Technologies in Wastewater Treatment, 227-249. CRC Press, 2023.
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  6. Veloso, A.C.; Ferreira, E.C.. "Online Analysis for Industrial Bioprocesses". In Current Developments in Biotechnology and Bioengineering, editado por Christian Larroche, Maria Angeles Sanroman, Guocheng Du, Ashok Pandey, 679-704. Elsevier, 2017.
    Publicado • 10.1016/b978-0-444-63663-8.00023-9
  7. Mesquita, Daniela P.; Selvaggio, Gianluca; Cunha, Jorge R.; Leal, Cristiano S.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.. "Image Analysis for Automatic Characterization of Polyhydroxyalcanoates Granules". In Lecture Notes in Computer Science, 790-797. Springer Berlin Heidelberg, 2013.
    10.1007/978-3-642-39094-4_91
  8. Carvalho, Carla A. O. C. M.; Santos, Sílvio; Kropinski, Andrew M.; Ferreira, Eugénio C.; Azeredo, Joana. "Phages as Therapeutic Tools to Control Major Foodborne Pathogens: Campylobacter and Salmonella". In Bacteriophages. Rijeka, Croácia: InTech, 2012.
    Publicado • 10.5772/33473
  9. Carneiro, Sónia; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "A Systematic Modeling Approach to Elucidate the Triggering of the Stringent Response in Recombinant E. coli Systems". In 5th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics (PACBB 2011), 313-320. Springer Berlin Heidelberg, 2011.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-19914-1_41
  10. Lourenço, Anália; Carneiro, Sónia; Pinto, José P.; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Interpreting the Regulatory Interplay in E. coli Metabolic Pathways". In 5th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics (PACBB 2011), 303-312. Springer Berlin Heidelberg, 2011.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-19914-1_40
  11. Rocha, O.; Nobre, C.; Dominguez, A.; Torres, D.; Faria, N.; Rodrigues, L.; Teixeira, J.A.; Ferreira, E.C.; Rocha, I.. "A Dynamical Model for the Fermentative Production of Fructooligosaccharides". In 10th International Symposium on Process Systems Engineering: Part A, 1827-1832. Elsevier, 2009.
    Publicado • 10.1016/s1570-7946(09)70695-9
  12. Pinto, José P.; Dias, Oscar; Lourenço, Anália; Carneiro, Sónia; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel; Rocha, Miguel. "Data Integration Issues in the Reconstruction of the Genome-Scale Metabolic Model of Zymomonas Mobillis". In 2nd International Workshop on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics (IWPACBB 2008), 92-101. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-85861-4_12
  13. Machado, Daniel; Costa, Rafael S.; Rocha, Miguel; Rocha, Isabel; Tidor, Bruce; Ferreira, Eugénio C.. "A Critical Review on Modelling Formalisms and Simulation Tools in Computational Biosystems". In Distributed Computing, Artificial Intelligence, Bioinformatics, Soft Computing, and Ambient Assisted Living, 1063-1070. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-02481-8_161
  14. Evangelista, Pedro; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Miguel. "A Software Tool for the Simulation and Optimization of Dynamic Metabolic Models". In Distributed Computing, Artificial Intelligence, Bioinformatics, Soft Computing, and Ambient Assisted Living, 1071-1078. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-02481-8_162
  15. Lourenço, Anália; Carneiro, Sónia; Ferreira, Eugénio C.; Carreira, Rafael; Rocha, Luis M.; Glez-Peña, Daniel; Méndez, José R.; et al. "Biomedical Text Mining Applied to Document Retrieval and Semantic Indexing". In Distributed Computing, Artificial Intelligence, Bioinformatics, Soft Computing, and Ambient Assisted Living, 954-963. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-02481-8_146
  16. Dias, Ana M. A.; Ferreira, Eugénio C.. "Computational Intelligence Techniques for Supervision and Diagnosis of Biological Wastewater Treatment Systems". In Computational Intelligence Techniques for Bioprocess Modelling, Supervision and Control, 127-162. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-01888-6_5
  17. Evangelista, Pedro; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Miguel. "Evolutionary Approaches for Strain Optimization Using Dynamic Models under a Metabolic Engineering Perspective". In Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics, 140-151. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-01184-9_13
  18. Costa, Rafael S.; Machado, Daniel; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Large Scale Dynamic Model Reconstruction for the Central Carbon Metabolism of Escherichia coli". In Distributed Computing, Artificial Intelligence, Bioinformatics, Soft Computing, and Ambient Assisted Living, 1079-1083. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-02481-8_163
  19. Valente, Eduardo; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Modelling of Biotechnological Processes – An Approach Based on Artificial Neural Networks". In Computational Intelligence Techniques for Bioprocess Modelling, Supervision and Control, 311-332. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-01888-6_11
  20. R. Mendes; I. Rocha; J. P. Pinto; E. C. Ferreira; M. Rocha. "Differential evolution for the offline and online optimization of fed-batch fermentation processes". In Advances in Differential Evolution, 299-317. Vienna, Áustria: Springer, 2008.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-68830-3_13
  21. E. Herrera; B. Castillo; J. Ramírez; E. C. Ferreira. "Takagi-Sugeno Fuzzy Controller for a Switching Bioprocess: Sector Nonlinearity Approach". In New Developments in Robotics, Automation and Control, 155-180. Vienna, Áustria: In-Tech Education and Publishing, 2008.
    Publicado
  22. E. C. Ferreira; S. Feyo de Azevedo. "Modelação, monitorização e controlo de reactores biológicos". In Reactores Biológicos - Fundamentos e Aplicações, 193-230. Lisboa, Portugal: Lidel, 2007.
    Publicado
  23. Rocha, Miguel; Pinto, José P.; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evaluating Evolutionary Algorithms and Differential Evolution for the Online Optimization of Fermentation Processes". In Evolutionary Computation,Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics, 236-246. Alemanha: Springer Berlin Heidelberg, 2007.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-71783-6_23
  24. Rocha, Miguel; Mendes, Rui; Maia, Paulo; Pinto, José P.; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evaluating Simulated Annealing Algorithms in the Optimization of Bacterial Strains". In Progress in Artificial Intelligence, 473-484. Alemanha: Springer Berlin Heidelberg, 2007.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-77002-2_40
  25. Espírito-Santo, I. A. C. P.; Fernandes, Edite M. G. P.; Araújo, M. M.; Ferreira, E. C.. "How Wastewater Processes can be Optimized Using LOQO". In Lecture Notes in Economics and Mathematical Systems, 435-455. Springer-Verlag, 2006.
    Publicado • 10.1007/3-540-28258-0_26
  26. A. C. Veloso; I. Rocha; E. C. Ferreira. "Identification of yield coefficients in an E. coli model - An optimal experimental design using genetic algorithms". In Computer Applications in Biotechnology, 43-48. London: Elsevier, 2005.
    Publicado
  27. Rocha, Miguel; Neves, José; Veloso, Ana C.A.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Evolutionary Algorithms for Static and Dynamic Optimization of Fed-batch Fermentation Processes". In Adaptive and Natural Computing Algorithms, 288-291. Springer-Verlag, 2005.
    10.1007/3-211-27389-1_69
  28. Rocha, Miguel; Neves, José; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evolutionary Algorithms for Optimal Control in Fed-Batch Fermentation Processes". In Applications of Evolutionary Computing, 84-93. Springer Berlin Heidelberg, 2004.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-24653-4_9
  29. E. C. Ferreira; J. A. Teixeira. "Biorreactores". In Biotecnologia: Fundamentos e Aplicações, 165-194. Lisboa, Portugal: Lidel Edições Técnicas, 2003.
    Publicado
  30. I. Rocha; E. C. Ferreira. "An integrated system for advanced monitoring and control of fed-batch fermentations of recombinant E. coli". In Computer Applications in Biotechnology, 349-354. Oxford: Pergamon Press, 2002.
    Publicado
  31. M. da Motta; A. L. Amaral; M. Casellas; M. N. Pons; C. Dagot; N. Roche; E. C. Ferreira; H. Vivier. "Characterisation of Activated Sludge By Automated Image Analysis: Validation on Full-Scale Plants". In Computer Applications in Biotechnology, 427-431. Oxford: Pergamon Press, 2002.
    Publicado
  32. E. C. Ferreira; M. Mota; M. N. Pons; J. M. S. Cabral; J. Tramper. "Image Analysis and Multiphase Bioreactors". In Multiphase Bioreactor Design, 25-52. London, Reino Unido: Taylor & Francis, 2001.
    Publicado
  33. S. Feyo de Azevedo; P. Pimenta; F. R. Oliveira; E. C. Ferreira. "Computer-Based Studies on Bioprocess Engineering, II - Tools for Process Operation". In Computer and Information Science Applications in Bioprocess Engineering, 27-49. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1996.
    Publicado
  34. R. Oliveira; E. C. Ferreira; S. Feyo de Azevedo. "Model-based estimation of reaction rates in stirred tank bioreactors". In Computer Applications in Biotechnology, 259-263. Oxford: Elsevier Science Publishers, 1996.
    Publicado
  35. S. Feyo de Azevedo; P. Pimenta; F. R. Oliveira; E. C. Ferreira; de Azevedo, S.Feyo; Pimenta, P.; Oliveira, F.; Ferreira, E.. "Studies on on-line state and parameter estimation through a real-time process simulator". In Modeling and Control of Biotechnical Processes 1992 (2nd IFAC Symposium) and Computer Applications to Fermentation Technology (5th International Conference), 453-458. Oxford: Pergamon Press, 1992.
    Publicado
  36. E. C. Ferreira; J. C. Duarte. "Dynamic modelling of complex enzymatic reactions". In Scientific Computing and Automation (Europe) 1990, 211-220. Amsterdam: Elsevier Science Publishers, 1990.
    Publicado
  37. Ferreira, E.C.; Duarte, J.C.. "Chapter 18 Dynamic Modelling of Complex Enzymatic Reactions". In Data Handling in Science and Technology, 211-220. Amsterdam: Elsevier, 1990.
    Publicado • 10.1016/S0922-3487(08)70168-0
  38. E. C. Ferreira; L. M. Pereira; S. Feyo de Azevedo; J. C. Duarte. "Parameter estimation of kinetics and modelling in methanogenic fermentation of Methanosarcina barkeri". In Computer Applications in Fermentation Technology: Modelling and Control of Biotechnological Processes, 217-220. London, Reino Unido: Elsevier Applied Science Publishers, 1989.
    Publicado
Edição de livro
  1. Ferreira, Eugénio C.; Paiva, Sandra. 2030 Sustainable Development Goals - UMinho Research and Innovation Open Days. Braga: UMinho Editora. 2025.
    Publicado • 10.21814/uminho.ed.195
  2. Ferreira, Eugénio C.; Pereira, Guilherme; Paiva, Sandra; Ruão, Teresa. Research and Innovation 2020.2021.2022. Braga, Portugal: UMinho Editora. 2025.
    Publicado • 10.21814/uminho.ed.143 • Editor
  3. E. C. Ferreira. BOOK OF ABSTRACTS OF CEB ANNUAL MEETING 2017. Braga, Portugal: Universidade do Minho. 2017.
    Publicado • 10.21814/cebsam2017 • Editor
  4. E. C. Ferreira. Metabolic Pathway Analysis 2015 - Programme and Abstracts. Braga, Portugal. 2015.
    Publicado • Editor
  5. E. C. Ferreira. Book of Abstracts of the 2nd Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering. Braga, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2010.
    Publicado • Editor
  6. Teixeira, J.A.; Sanches, I.; Ferreira, E.C.; Fonseca, A.; Vicente, A.A.; Venâncio, A.; Oliveira, D.; et al. Book of Abstracts of MICROBIOTEC09. Braga; Vilamoura, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2009.
    Publicado • Editor
  7. Ferreira, E.C.; Mota, M.. Book of Abstracts of the 10th International Chemical and Biological Engineering Conference - CHEMPOR 2008. Braga: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2008.
    Publicado • Editor
  8. E. C. Ferreira. Proceedings of the 10th International Chemical and Biological Engineering Conference - CHEMPOR 2008 (CD-ROM). Braga, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2008.
    Publicado • Editor
  9. E. C. Ferreira. Engenharia Biológica – 20 Anos (1986-2006). Braga, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2006.
    Publicado
  10. E. C. Ferreira; M. Mota. BIOTEC'98 - Book of Abstracts (IV Iberian Congress on Biotechnology, I Ibero-American Meeting on Biotechnology). Braga, Portugal: Universidade do Minho. Departamento de Engenharia Biológica. 1998.
  11. E. C. Ferreira; S. Feyo de Azevedo; K. Ch. A. M. Luyben; P. Osseweijer. Proceedings of the 2nd European Symposium on Biochemical Engineering Science. Porto, Portugal: Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto. 1998.
    Publicado • Editor
Livro
  1. Ferreira, Eugénio C.; Sessão Comemorativa "20 anos da Licenciatura em Engenharia Biológica da Universidade do Minho", Braga, 2006. Passado, presente e futuro da Engenharia Biológica. Universidade do Minho. Departamento de Engenharia Biológica (DEB). 2006.
  2. E. C. Ferreira; E. Rodrigues. Fontes de Informação em Ambiente. Famalicão, Portugal: Edições Centro Atlântico. 2002.
    Publicado
Poster em conferência
  1. Sargo, C. R.; Correia, Daniela M; Giordano, R. C.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel; Silva, Adilson J.; Zangirolami, T. C.. "Analysis of Salmonella typhimurium pathways and metabolic model improvement". Trabalho apresentado em MPA2015 - Metabolic Pathway Analysis, 2015.
  2. Nóbrega, F.L.; Oliveira, H.; Melo, Luís; Santos, S.B.; Cerca, N.; Ferreira, E.C.; Azeredo, J.; Kluskens, L.D.. "Insights into phage endolysins". Trabalho apresentado em ioinformatics Open Days 2013, Braga, Portugal, 2013.
  3. Oliveira, H.; Melo, Luís; Nóbrega, F.L.; Santos, S.B.; Cerca, N.; Ferreira, E.C.; Azeredo, J.; Kluskens, L.D.. "Unraveling the insights into phage endolysin association". Trabalho apresentado em Viruses of Microbes -­- EMBO Conference, Brussels, Belgium, 2012.
  4. Nobre, Clarisse; Dominguez, Ana; Torres, D.; Rocha, Orlando; Rocha, Isabel; Ferreira, E.C.; José António Couto Teixeira; Rodrigues, L.R.. "Optimization of a fructooligosaccharides purification method using activated charcoal". Trabalho apresentado em MicroBiotec09, 2009.
  5. Nobre, Clarisse; Dominguez, Ana; Torres, D; Rocha, O.; Rocha, I.; José António Couto Teixeira; Ferreira, E.C.; Rodrigues, L.R.. "Determination of fructo-oligosaccharides adsorption parameters using ion-exchange resins". Trabalho apresentado em 21st International Ion Chromatography Symposium (IICS 2009), 2009.
  6. A. Paulo; A. Dias; Mafalda Sarraguca; Joao A. Lopes; M. Alves; E. C. Ferreira. "Surveying an activated sludge reactor using online UV-visible and NIR spectroscopy and chemometrics". Trabalho apresentado em SIDISA 08 - Proceedings of the International Symposium on Sanitary and Environmental Engineering, 2008.
  7. Nobre, Clarisse; Santos, Maria João; Dominguez, A.; Torres, D.; Rodrigues, L.R.; Rocha, I.; Teixeira, J.A.; Ferreira, E.C.. "Fractionation of fructo-oligosaccharides by gel filtration". Trabalho apresentado em CHEMPOR 2008: Book of Abstracts of the 10th International Chemical and Biological Engineering Conference, 2008.
  8. Nobre, Clarisse; Dominguez, Ana; Torres, D.; Rocha, O.; Rodrigues, L.; Rocha, I.; Teixeira, J.A.; Ferreira, E.C.. "Purification of fructo-oligosaccharides by adsorption onto charcoal filters". Trabalho apresentado em 4th Probiotics, Prebiotics and New Foods jointly with XXX International Congress on Microbial Ecology And Disease, 2007.
  9. Torres, D.; Dominguez, A.; Rodrigues, L.R.; Rocha, I.; Cardoso, S.M; Silva, A.M.S.; Dominguez, M.R.M.; et al. "Experimental approach for prebiotic oligosaccharides fractionation and chemical characterization". Trabalho apresentado em International Symposium on “Functional Foods in Europe – International Developments in Science and Health Claims", 2007.
  10. Dominguez, A.; Nobre, Clarisse; Torres, D.; Rocha, Orlando; Rodrigues, L.R.; Rocha, Isabel; Teixeira, J.A.; Lima, Nelson; Ferreira, E.C.. "Production of Fructooligosaccharides by Aureobasidium sp. and Aspergillus sp.". Trabalho apresentado em IFT Annual Meeting – Food Smarts, 2007.
  11. Nobre, Clarisse; Dominguez, A.; Torres, D.; Rocha, O.; Rodrigues, L.; Rocha, I.; Teixeira, J.A.; Ferreira, E.C.. "Purification of fructo-oligosaccharides by nanofiltration". Trabalho apresentado em , XIIIth World Congress of Food science and technology, Food is life, (IUFOST2006/1242), 2006.
  12. Dominguez, A.; Nobre, Clarisse; Torres, D.; Rodrigues, L.; Rocha, I.; Teixeira, J.A.; Lima, Nelson; Ferreira, E.C.. "Optimization of fermentation conditions for fructooligosaccharides production by Aureobasidium". Trabalho apresentado em , World Congress on Industrial Biotechnology and Bioprocessing, Toronto, Canada, 2006.
  13. Vicente, A.A.; Dluhý, M.; Ferreira, E.C.; Mota, M.; Teixeira, J.A.. "Determination of diffusion coefficients of glucose and O2 in flocs of Saccharomyces cerevisiae". Trabalho apresentado em Proceedings of the 2nd ESBES, 1998.
  14. Vicente, A.A.; Ferreira, E.C.; Teixeira, J.A.. "Kinetics and Stoichiometry of a batch fermentation using a highly flocculent strain of Saccharomyces cerevisiae for different aeration rates and initial sugar concentrations". Trabalho apresentado em Comunicaciones del III Congreso Ibérico de Biotecnología, 1996.
Pré-impressão
  1. Alexandre Oliveira; Joana Rodrigues; Eugénio Ferreira; Lígia Rodrigues; Oscar Dias. "A kinetic model of the central carbon metabolism for acrylic acid production inEscherichia coli". 2020. https://doi.org/10.1101/2020.05.13.093294.
    10.1101/2020.05.13.093294
Relatório
  1. Ferreira, Eugénio C.; Araújo, Emília Rodrigues; Ramos, Isabel; Gomes, Manuela E.; Maciel, P.; Jerónimo, Patrícia; Ramada, José António Seara Salgado; Isaías, Margarida. 2021. Proposta de plano para a igualdade de género da Universidade do Minho (IGUM 2022-2024). http://hdl.handle.net/1822/75031.
  2. Reis, R. L.; Rodrigues, Eloy; Ferreira, Eugénio C.; Palha, Joana Almeida; González-Méijome, José Manuel; Gomes, Manuela E.; Gonçalves, Miguel M.; et al. 2017. Estratégia institucional para a gestão dos dados de investigação: estudo e recomendações. http://hdl.handle.net/1822/63930.
Resumo em conferência
  1. Costa, Mariana; Mesquita, Daniela P.; Salvador, Andreia F.; Silva, Ana Rita; Ferreira, Eugénio C.; Quintelas, Cristina. "Treating synthetic wastewater contaminated with carbamazepine using aerobic granular sludge in a sequential batch reactor". Trabalho apresentado em 21º Encontro de Engenharia Sanitária e Ambiental - ENaSB, Braga, 2024.
    Publicado
  2. Silva, S.A.; Duarte, M.S.; Amaral, A.L.; Ferreira, E.C.; Alves, M.M.; Mesquita, D.P.. "Assessing the influence of long-chain fatty acids on aerobic granular sludge stability in a sequencing batch reactor (oral presentation)". Trabalho apresentado em International Chemical and Biological Engineering Conference (CHEMPOR), Bragança, 2023.
  3. Melo, A.; Costa, J.; Quintelas, C.; Ferreira, E.C.; Mesquita, D.P.. "EPS and aggregates changes on activated sludge under atrazine exposure (oral presentation)". Trabalho apresentado em International Chemical and Biological Engineering Conference (CHEMPOR), Bragança, 2023.
  4. Silva, S.A.; Duarte, M.S.; Amaral, A.L.; Ferreira, E.C.; Lucas, M.S.; Alves, M.M.; Mesquita, D.P.. "The effect of oleate in the biological nitrogen removal (oral presentation)". Trabalho apresentado em PYCheM 2023 - 8th Portuguese Young Chemists Meeting, Vila Real, 2023.
    Publicado
  5. Silva, S.A.; Duarte, M.S.; Amaral, Antonio; Ferreira, E.C.; Lucas, M.S.; Alves, M.M.; Mesquita, D.P.. Autor correspondente: Silva, S.A.. "The effect of oleate in the biological nitrogen removal". Trabalho apresentado em 8th Portuguese Young Chemists Meeting PYChem2023, Vila Real, 2023.
  6. Silva, S.A.; Duarte, M.S.; Amaral, Antonio; Ferreira, E.C.; Alves, M.M.; Mesquita, D.P.. "Assessing the influence of long-chain fatty acids on aerobic granular sludge stability in a sequencing batch reactor". Trabalho apresentado em 14th International Chemical Engineering Conference CHEMPOR2023, Bragança, 2023.
  7. Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel; Rocha, I.. "MEtabolic models Reconstruction using genome scaLe INformation (merlin) - assessment and validation". Trabalho apresentado em Copenhagen Biosciences Conferences - 7th Conference: Cell Factories and Biosustainability, Copenhagen, 2015.
    Publicado
  8. Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel; Rocha, I.. "Merlin Latest Developments for Pathways Analysis". Trabalho apresentado em MPA2015 - Metabolic Pathway Analysis 2015, Braga, 2015.
    Publicado
  9. Mucha, Ângela; Nobrega, Franklin L.; Santos, Sílvio B.; Ferreira, Eugénio C.; Kluskens, Leon D.; Azeredo, Joana. "RecFinder – a new tool to find phage proteins responsible for host recognition". Trabalho apresentado em BOD 2013 - Bioinformatics Open Days 2013, Braga, 2013.
  10. A.L Amaral; D.P. Mesquita; C. Leal; M.Carvalheira ; A. Oehmen; M. A. Reis; E. C. Ferreira. "Intracelular Poly-P assessment by DAPI staining and image analysis (poster communication)". Trabalho apresentado em Microbiotec 2013, Aveiro, 2013.
    Publicado
  11. Dias, Oscar; Gombert, Andreas K.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Towards a genome-scale metabolic model for the Kluyveromyces lactis yeast.". Trabalho apresentado em 9th European Congress of Chemical Engineering / 2nd European Congress of Applied Biotechnology, The Hague, 2013.
    Publicado
  12. D. P. Mesquita; C. Leal; A. Oehmen; A. L. Amaral; M. A. Reis; E. C. Ferreira. "Polyphosphates and poly-ß-hydroxybutyrate granules identification through quantitative image analysis in enhanced biological phosphorus removal systems (Poster communication)". Braga, 2011.
    Publicado
  13. Rocha, I.; Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.. "Genome-scale metabolic models reconstruction of less characterized organisms with Merlin". Trabalho apresentado em Metabolic Engineering VIII: Metabolic Engineering for Green Growth, Jeju Island, 2010.
    Publicado
  14. Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Metabolic reconstruction of less characterized microorganisms: a new methodology for reaction identification from genome sequencing data.". Trabalho apresentado em JORNADAS DE BIOINFORMÁTICA, Lisboa, 2009.
    Publicado
  15. Carneiro, S.; Lourenço, Anália; Mendes, Rui; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "Network analysis of an integrated metabolic/regulatory model of Escherichia coli". Trabalho apresentado em FPBC’08 - Fórum Português de Biologia Computacional, Oeiras, 2008.
    Publicado
  16. Lourenço, Anália; Carreira, Rafael; Carneiro, Sónia; Maia, Paulo; Ferreira, Eugénio C.; Glez-Peña, D.; Fdez-Riverola, F.; Rocha, Miguel; Rocha, I.. "The @Note biomedical text mining workbench". Trabalho apresentado em FPBC’08 - Forum Português de Biologia Computacional, Oeiras, 2008.
    Publicado
  17. S. Carneiro; P: Maia; M. Rocha; E. C. Ferreira; I. Rocha. "Constraint-based approach for in silico Escherichia coli combined regulatory/metabolic modelling". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  18. J. C. Costa; I. Moita; A. A. Abreu; E. C. Ferreira; M. M. Alves. "Use of morphological and physiological information to identify changes in anaerobic granular sludge during organic overloads". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  19. R. S. Costa; S. Carneiro; I. Rocha; E. C. Ferreira. "Effect of pH variation on the acetate “switch” and biomass growth in an Escherichia coli aerobic fermentation: global gene expression profiles analysis". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  20. A. Lourenço; A. Simões; J. J. Almeida; M. Rocha; I. Rocha; E. C. Ferreira. "Literature mining applied to systems biology information retrieval". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  21. D. P. Mesquita; O. Dias; E. C. Ferreira; A. L. Amaral. "Monitoring activated sludge systems from wastewater treatment plants: automated image analysis procedures and their relation with operating parameters". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  22. A. Nicolau; S. Santos; C. Carvalho; E. C. Ferreira; J. Azeredo. "Pitfalls and successes in phage therapy: the involvement of the UMinho Team in the European Project Phagevet-P". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  23. Belo, Isabel; Ferreira, Eugénio C.; Pinheiro, Rita; Coutinho, J.A.P.; Coelho, M.A.Z.; Mota, Manuel. "Comparison of yeast response to increased pressure at aerobic and anaerobic conditions". Trabalho apresentado em ECB11 - 11th European Congress on Biotechnology, Basel, 2003.
    Publicado
  24. Oliveira, José M.; Ferreira, Eugénio C.; Mota, Manuel. "Tanques de Percolação". Trabalho apresentado em Jornadas sobre Tratamento de Efluentes Vinícolas, Braga, 1994.
    Publicado
  25. P. Pimenta; S. Feyo de Azevedo; E. C. Ferreira; F. R. Oliveira. "Model-based identification and control on baker's yeast fed-batch fermentation". Trabalho apresentado em 6th European Congress on Biotechnology, Firenze, 1993.
    Publicado
Tese / Dissertação
  1. Fonseca, André Paço da. "A digital image based method to quantify intracellular polyphosphates in microbial aggregates". Mestrado, 2018. http://hdl.handle.net/1822/66151.
  2. Mota, Elisiária Maria Dias da. "Segurança no trabalho: riscos ambientais". Mestrado, 2017. http://hdl.handle.net/1822/54741.
  3. Miragaia, Ricardo Júdice. "Immune tolerance dissected by single-cell transcriptomics". Doutoramento, 2017. http://hdl.handle.net/1822/48631.
  4. Oliveira, Daniel Filipe Braga de. "Plataforma online para caracterizar comunidades microbianas de estações de tratamento de água e efluentes". Mestrado, 2017. http://hdl.handle.net/1822/57384.
  5. Souto, Maria Amélia Moreira. "Implementação do referencial BRC Food Safety versão 7 numa empresa transformadora de carne". Mestrado, 2016. http://hdl.handle.net/1822/47435.

Outros

Outra produção
  1. BioISO: an objective-oriented application for assisting the curation of genome-scale metabolic models. 2021. Fernando Cruz; João Capela; Eugénio C. Ferreira; Miguel Rocha; Oscar Dias. https://doi.org/10.1101/2021.03.07.434259.
    10.1101/2021.03.07.434259
  2. El título de ingeniero químico en el espacio europeo de educación superior. I Workshop de Ingeniería Química. 2013. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59530.
  3. A Comunidade do CEB no RepositóriUM. Intervenção convidada proferida por ocasião do 10º Aniversário do RepositóriUM. 2013. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59528.
  4. A Indústria Química Portuguesa. 12as Jornadas de Engenharia Química da Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto. 2012. Ferreira, Eugénio C.; Araújo, Luís. http://hdl.handle.net/1822/59531.
  5. Biologia de Sistemas para o desenvolvimento de fábricas celulares microbianas. Palestra no CTBE Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol. 2011. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59524.
  6. Correlation between sludge settleability and image analysis information using Partial Least Squares. CAC2008 - Proceedings of the 11th International Conference on Chemometrics in Analytical Chemistry. 2008. Mesquita, D. P.; Dias, Oscar; Dias, A. M. A.; Amaral, A. L.; Ferreira, Eugénio C.; Mesquita, Daniela P.; Amaral, António L.. https://hdl.handle.net/1822/8280.
  7. Biotecnologia. Introdução, Editorial. 2007. E. C. Ferreira.
  8. A alternativa energética. Introdução, Editorial. 2007. E. C. Ferreira.
  9. Potencial da Biotecnologia na Região. Palestra convidada no âmbito do seminário Vale do Ave, região do Conhecimento: Perspectivas e Realidades. 2007. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59548.
  10. Eco-Eficiência e Sustentabilidade Empresarial. Palestra para dirigentes de topo de empresas participantes no Projeto Valor Humano - Qualificação Avançada de Recursos Humanos. 2007. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59552.
  11. The BioProcess Systems Engineering group (BioPSEg) @ The Institute for Biotechnology and Bioengineering. Palestra convidada no Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco (CIATEJ). 2007. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59544.
  12. Specific growth rate regulation in a fed-batch E. coli fermentation. Invested Lecture at Automatic Control Unit of Cinvestav - Centro de Investigación y Estudios Avanzados. 2007. Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59534.
  13. Parabéns EQ!. Introdução, Editorial. 2006. E. C. Ferreira.
  14. Propostas de Leitura. Introdução, Editorial. 2006. E. C. Ferreira.
  15. A Pensar nos Leitores. Introdução, Editorial. 2005. E. C. Ferreira.
  16. Tendências Recentes no Ensino da Engenharia Química. 4º Encontro da Associação para o Ensino de Laboratórios de Engenharia Química. 2005. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59554.
  17. Image analysis applications in biological wastewater treatment processes. Palestra na Gheorge Asachi Technical University of Iasi, Faculdade de Química Industrial. 2005. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59532.
  18. Formação em Ambiente no Ensino Superior. 1.º Fórum Nacional de Estudantes de Engenharia do Ambiente. 2004. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59543.
  19. A Engenharia de Sistemas Processuais em Biotecnologia, Química e Ambiente. 2.º Workshop Anual de Engenharia de Processos e Sistemas. 2004. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59545.
  20. Proposta de reformulação do plano de estudos da Licenciatura em Engenharia Biológica da Universidade do Minho. VI Jornadas de Engenharia Biológica e IV Encontro de Jovens Biotecnólogos. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59458.
  21. Tratamento de efluentes por via anaeróbia. Palestra no Laboratório de Saneamento Ambiental do Departamento de Engenharia Civil da Universidade Federal de Pernambuco. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59457.
  22. Application of image analysis techniques in environmental biotechnology. IV Curso Internacional de Biotecnologia Industrial Tópicos de Biotecnologia Ambiental. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/58773.
  23. Análise de Imagem e Biotecnologia. Palestra no Departamento de Engenharia Química da Universidade Federal de Pernambuco. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59460.
  24. Tratamentos biológicos de efluentes e emissões gasosas. Semana Universidade Empresas: Como Valorizar a Inovação, Painel "Novas Oportunidades de Negócio A Bio-Economia. 2002. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/58695.
  25. Fontes de informação para ambiente. Acção de Formação em Qualidade e Ambiente no âmbito do Programa Operacional Emprego, Formação e Desenvolvimento Social Região Norte, Medida 3.3.1.4 Especialização Profissional de Quadros Superiores Desempregados. 2001. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59088.
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2017/10 - 2022 The role of extracellular polymeric substances during the biodegradation of contaminants.
Coorientador de Antônio Renê Benevides de Melo
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2013/10/01 - 2017/09/23 Immune Tolerance Dissected by Single-Cell Transcriptomics
Coorientador de Ricardo Júdice Miragaia
Bioengenharia (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2017/01 - 2017/06/12 Segurança no trabalho - Riscos ambientais
Orientador de Elisiária Maria Dias da Mota
Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2017/01 - 2017/05/31 Desenvolvimentos em engenharia de produto de cremes abrasivos e produtos de detergência
Orientador de Cristina da Silva Rodriguez
Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2016/10 - 2017/02/27 Plataforma online para caracterizar comunidades microbianas de estações de tratamento de água e efluentes
Orientador de Daniel Filipe Braga de Oliveira
Bioinformática (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2016/01 - 2016/12/12 Implementação do referencial BRC food safety versão 7 numa empresa transformadora de carne
Orientador de Maria Amélia Moreira Souto
Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2014/01 - 2014/12/04 Implementação de um Sistema de Gestão da Qualidade e Segurança Alimentar numa adega de vinhos verdes segundo os referenciais ISO 9001:2008, ISO 22000:2005 e BRC Food Issue 6
Orientador de Mariana Isabel Pimentel Antunes
Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2014 - 2014/11/20 Image analysis of Saccharomyces cerevisiae cells : development of a plugin for IMAGEJ
Orientador de Vitor Damião Baixinho da Silva
Bioinformática (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2009/01 - 2013/12/11 In vivo metabolic pathway analysis of Enterococcus faecalis for uncovering key pathogenicity factors
Coorientador de Carla Andreia Freixo Portela
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2009/01 - 2013/06/25 Reconstruction of the Genome-scale Metabolic Network of Kluyveromyces lactis
Orientador de Óscar Manuel Lima Dias
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2008/11 - 2012/01/23 Novel modeling formalisms and simulation tools in Computational Biosystems
Orientador de Carlos Daniel Moutinho Machado
Bioengenharia (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/01 - 2011/12/21 Systems analysis and metabolic network modeling in Escherichia coli
Orientador de Rafael Sousa Costa
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/11 - 2011/03/24 Image analysis and chemometric techniques as monitoring tools to characterize aggregated and filamentous organisms in activated sludge processes
Orientador de Daniela Patrícia Bernardino Mesquita
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/01 - 2010/12/30 A Systems Biology approach for the characterization of metabolic bottlenecks in recombinant protein production processes
Orientador de Sónia Madalena Azevedo Carneiro
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/11 - 2010/12/10 Characterization of a salmonella phage using omic tools and mathematical models to predict host-phage interaction
Orientador de Sílvio Roberto Branco dos Santos
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2004/04 - 2008/11/07 Supervision of Transient Anaerobic Granular Sludge Process Through Quantitive Image Analysis and Multivariate Statistical Techniques
Orientador de José Carlos Gomes da Costa
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2001/01 - 2008/02/26 Sistemas Inteligentes para Monitorização e Controlo de Processos Integrados de Tratamento Biológico de Efluentes
Orientador de Olga Cristina Pereira Pires
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2001/10 - 2007/02/12 Optimização de Estratégias de Alimentação para a Identificação de Parâmetros de um Modelo de E.coli. Utilização do Modelo em Monitorização e Controlo
Orientador de Ana Cristina Araújo Veloso
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2003 - 2006/07/07 Técnicas de Análise de Imagem no Monitoramento de Sistemas de Tratamento por Lodos Activos
Coorientador de Yovanka Pérez Ginoris
Tecnologia de Processos Químicos e Bioquímicos (Doutoramento)
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Brasil
1999/10 - 2003/09/29 Image Analysis in Biotechnological Processes: Applications to Wastewater Treatment
Orientador de António Luís Pereira do Amaral
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
1998/04 - 2003/04/17 Model-based Strategies for Computer-Aided Operation of Recombinant E. coli Fermentation
Orientador de Isabel Cristina de Almeida Pereira da Rocha
Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2023 - 2023 CHEMPOR 2023 - 3th International Chemical and Biological Engineering Conference (2023 - 2023)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2023 - 2023 CISPEE 2023 - 5th International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education (2023 - 2023)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2021 - 2021 MicroBiotec 2021 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology (2021 - 2021)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2021 - 2021 ICEER 2021 - The 8th International Conference on Energy and Environment Research (2021 - 2021)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2017/07/06 - 2017/07/06 CEB Scientific Annual Meeting 2017, Braga, Conference Chair (2017/07/06 - 2017/07/06)
Encontro (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2017 - 2017 CEB Talk 2017, GNRation, Braga (2017/11/23 - 2017/11/23)
Mesa-redonda (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2016/07/06 - 2016/07/06 Sessão “Biotecnologia para uma Bioeconomia Sustentável” no CIÊNCIA’16 – Encontro com a Ciência e Tecnologia em Portugal, Lisboa (2016/07/06 - 2016/07/06)
Seminário (Coorganizador)
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2016/06/30 - 2016/06/30 2016 MIT Portugal Annual Conference, Braga, Conference Chair (2016/06/30 - 2016/06/30)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho, Portugal
2015/06/08 - 2015/06/12 MPA2015 - Metabolic Pathway Analysis, Braga (2015/06/08 - 2015/06/12)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho, Portugal
2012 - 2012 “As Engenharias Química e Biológica - Que Futuro?”, Porto (2012/02/10 - 2012/02/10)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
Ordem dos Engenheiros, Portugal
2011/01/01 - 2011/09/07 CHEMPOR 2011 - 11th International Chemical and Biological Engineering Conference, Caparica (2011/09/05 - 2011/09/07)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2011/01/01 - 2011/06/06 5th Annual Workshop on the Business-Government Interface: Systems and Synthetic Biology, Braga (2011/06/06 - 2011/06/06)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2010/01/01 - 2010/11/06 XVIII Congresso da Ordem dos Engenheiros - “A Engenharia no Século XXI - Qualificação – Inovação – Empreendedorismo”, Aveiro (2010/11/04 - 2010/11/06)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
Ordem dos Engenheiros, Portugal
2010/01/01 - 2010/10/24 2nd Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering. Braga - www.ceb.uminho.pt/2nd_Meeting_IBB (2010/10/23 - 2010/10/24)
Encontro (Coorganizador)
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2008/10/01 - 2009/11/30 MicroBiotec09. Vilamoura, Portugal - www.deb.uminho.pt/microbiotec09 (2009/11/28 - 2009/11/30)
Congresso (Coorganizador)
Sociedade Portuguesa de Biotecnologia, Portugal
2007/01/01 - 2008/12/31 CHEMPOR 2008 - 10 th International Chemical Engineering Conference, Braga, Conference Chair - www.deb.uminho.pt/chempor2008 (2008/09/04 - 2008/09/06)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho, Portugal
2008/07/11 - 2008/07/11 Session “Nonlinear Control and Estimation in Bioprocesses” at 17th Triennial World Congress of the International Federation of Automatic Control (IFAC) (2008/07/11 - 2008/07/11)
Seminário (Coorganizador)
International Federation of Automatic Control, Áustria
2008/01/01 - 2008/05/31 Semana da Biotecnologia, Braga: eventos “Encontros para a Competitividade: prioridades para a indústria da biotecnologia”; “BioEmpreenda’08 – Feira de Ideias e Financiamento para o sector das biotecnologias”; “Seminário Caminhos para a Inovação – o bioempreendedorismo”; apresentação do estudo ‘Global Entrepreneurship Monitor Portugal 2007’; Industrial Biotech Forum; Exposição ‘Dispositivos Médicos’; Conferência ’Estratégias de eficiência colectiva no sector agro-alimentar da região do Norte’; Workshop on Medical Devices. (2008/05/26 - 2008/05/31)
Exposição (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho, Portugal
2006/09/01 - 2007/07/27 REV 2007 - International Conference Remote Engineering and Virtual Instrumentation, Porto (2007/06/25 - 2007/06/27)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2007 - 2007 Workshop “Introdução ao REACH – Registration, Evaluation, Authorization and Restriction of Chemicals”, Lisboa (2007/12/05 - 2007/12/05)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
Ordem dos Engenheiros, Portugal
2006 - 2006 Comemorações dos 20 anos do curso de Engenharia Biológica, Braga, - www.deb.uminho.pt/20anos (2006/10/20 - 2006/10/21)
Outro (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Departamento de Engenharia Biológica, Portugal
2004/09/01 - 2005/09/18 CHEMPOR 2005 - 9th International Chemical Engineering Conference, Coimbra (2005/09/14 - 2005/09/18)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade de Coimbra, Portugal

Ordem dos Engenheiros, Portugal
2005 - 2005 Special session "Natural-computing Algorithms to Modeling and Optimization of Bioprocesses" (NAMOB-2005) at 7th International Conference on Adaptive and Natural Computing Algorithms (ICANNGA), Coimbra (2005/03/21 - 2005/03/21)
Seminário (Coorganizador)
Universidade de Coimbra, Portugal
2003/06/01 - 2004/09/30 CAC-2004 - 9th Chemometrics in Analytical Chemistry Conference, Lisboa (2004/09/20 - 2004/09/23)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2003/01/01 - 2004/05/31 ESCAPE-14 - European Symposium on Computer Aided Process Engineering, Lisboa - www.deb.uminho.pt/escape14 (2004/05/16 - 2004/05/19)
Simpósio (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
1999/06/01 - 2000/10/10 CONTROLO’2000 - 4th Portuguese Conference on Automatic Control, Guimarães - www.deb.uminho.pt/controlo2000 (2000/10/06 - 2000/10/09)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
1997/06/01 - 1998/09/19 ESBES2 - 2nd European Symposium on Biochemical Engineering Science. Porto - www.deb.uminho.pt/esbes2 (1998/09/16 - 1998/09/19)
Simpósio (Coorganizador)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1997/01/01 - 1998/07/31 BIOTEC'98 - IV Iberian Congress on Biotechnology, I Ibero-American Meeting on Biotechnology Guimarães - www.deb.uminho.pt/biotec98 (1998/07/12 - 1998/07/15)
Congresso (Coorganizador)
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
1996/03/01 - 1996/09 2nd General Meeting of Network in Chemical Process Control (Human Capital and Mobility Program), Porto (1996/09/27 - 1996/09/28)
Encontro (Coorganizador)
Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Arbitragem científica em conferência

Nome da conferência Local da conferência
2020/09/14 - 2020/09/18 CISPEE 2020 - 4th International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education Porto
2020/01/01 - 2020/09/18 ICEER 2020 - The 7th International Conference on Energy and Environment Research
2019/12/05 - 2019/12/07 MicroBiotec’19 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Universidade de Coimbra
2019/10/14 - 2019/10/19 FOSBE 2019 - 8th International Conference Foundations of Systems Biology in Engineering Valencia
2019/07/22 - 2019/07/25 ICEER 2019 - The 6th International Conference on Energy and Environment Research Universidade de Aveiro
2018/07/27 - 2018/07/29 CISPEE 2018 - 3rd International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education Aveiro
2018/07/23 - 2018/07/27 ICEER 2018 - The 5th International Conference on Energy and Environment Research Praga, Czech Republic
2017/12/07 - 2017/12/09 MicroBiotec’17 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Universidade Católica Portuguesa, Porto
2017/06/17 - 2017/06/20 ICEER 2017 - The 4th International Conference on Energy and Environment Research Porto
2016/10/20 - 2016/10/21 CISPEE 2016 - 2nd International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education: Thinking Higher Engineering Education UTAD, Vila Real
2016/06/30 - 2016/06/30 2016 MIT Portugal Annual Conference Universidade do Minho, Braga
2016/06/05 - 2016/06/08 Bio.Iberoamérica 2016 Salamanca, Spain
2015/12/10 - 2015/12/12 MicroBiotec’15 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Évora, Portugal
2015/11/10 - 2015/11/13 AD14 - 14th World Congress on Anaerobic Digestion Viña del Mar, Chile
2015/06/08 - 2015/06/12 MPA2015 - Metabolic Pathway Analysis Braga
2015/06/09 - 2015/06/09 5th MIT Portugal Program Conference - Light: Designed by Nature, Transformed by Science Lisboa
2014/09/10 - 2014/09/12 CHEMPOR 2014 - 12th International Chemical and Biological Engineering Conference Porto
2014/06/27 - 2014/06/27 4th MIT Portugal Program Conference - New Frontiers for a Sustainable Prosperity Coimbra
2014/02/26 - 2014/02/28 REV 2014 - 11th International Conference on Remote Engineering and Virtual Instrumentation Porto, Portugal
2013/12/16 - 2013/12/18 CAB 2013 - 12th International IFAC Symposium on Computer Applications in Biotechnology Mumbai, India
2013/12/06 - 2013/12/08 MicroBiotec’13 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Aveiro
2013/10/31 - 2013/11/01 CISPEE 2013 - 1st International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education Porto (ISEP)
2012/09/26 - 2012/09/27 EES 2012 - 1st International Conference on Energy, Environment and Sustainability Porto (ISEP)
2011/12/01 - 2011/12/03 MicroBiotec’11 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Universidade do Minho, Braga

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2020 - Atual Frontiers in Chemical Engineering (2673-2718) Frontiers Media S.A.
2015 - Atual Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (2296-4185) Frontiers Media S.A.
2014 - Atual Procedia Environmental Science, Engineering and Management National Society of Environmental Science and Engineering (Roménia)
2011/09/28 - Atual Brazilian Journal of Chemical Engineering Springer
2008/07/01 - Atual Chemical Product and Process Modeling De Gruyter
2005/09/01 - Atual Engenharia Química - Indústria, Ciência e Tecnologia Publindústria
2004/10/01 - Atual Environmental Engineering and Management Journal
2012/01/02 - 2022/03/31 BioMed Research International Hindawi

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria
Instituição / Organização Entidade financiadora
2017 - 2020 Coordinator of the review panel for PhD fellowships in Bioengineering and Biotechnology
Avaliador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2020/03 - 2020/07 Controlo e Instrumentation de Processos / Process Control and Instrumentation Engenharia Biológica (Mestrado integrado) Universidade do Minho, Portugal

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2005/01 - Atual ESBES - European Society of Biochemical Engineering Sciences National Delegate to the Technical Committee on Modelling, Monitoring, Measurement, and Control
2004/01 - Atual Associação Portuguesa de Engenharia Sanitária e Ambiental
2000/01 - Atual IWA - International Water Association
1998/06 - Atual Associação Portuguesa de Controlo Automático
1998/01 - Atual Federação Europeia de Biotecnologia
1995/01 - Atual IFAC - International Federation of Automatic Control National Delegate to the Technical Committee on Biosystems and Bioprocesses
1986/09 - Atual Ordem dos Engenheiros
2004/01 - 2019/12 Sociedade Portuguesa de Biotecnologia Secretário-Geral
2010/03 - 2013/04 Ordem dos Engenheiros Presidente do Conselho Nacional do Colégio de Engenharia Química e Biológica
2004/01 - 2010/03 Ordem dos Engenheiros
2002/01 - 2007/12 International Association of Science and Technology for Development
1999/01 - 2004/12 Society for Industrial Microbiology.
2000/01 - 2003/12 Sociedade Portuguesa de Biotecnologia
1993/01 - 2002/12 SCI - Society of Chemical Industry

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação
Instituição / Organização
2018 - Atual Committee on Publication Ethics
Membro
Committee on Publication Ethics, Reino Unido

Outro júri / avaliação

Descrição da atividade Instituição / Organização
2020/05/11 - 2020/05/11 Vogal do Júri do Concurso Documental para para recrutamento de um Professor Associado, de área disciplinar de Biomedicina, Edital n.º 1603/2019, de 27 de dezembro Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020/05/11 - 2020/05/11 Vogal do Júri do Concurso Documental para para recrutamento de um Professor Associado, de área disciplinar de Bioquímica, Edital n.º 1639-S/2019, de 30 de dezembro Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Distinções

Título

2024 Membro
Academia de Engenharia, Portugal
2017 Membro Conselheiro
Ordem dos Engenheiros, Portugal

Outra distinção

2020 Medalha de Mérito Municipal
Câmara Municipal de Esposende, Portugal
2004 Melhor Tese de Doutoramento no país em Engenharia Química e Biológica (Orientador)
Companhia União Fabril Consultadoria e Serviços SA, Portugal