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Nuno S. Osório graduated in Applied Biology at the University of Minho in 2003. He started his research work at Wageningen University, Holland, where he did an internship on the study of virulence factors of pathogenic microorganisms with Prof. Willem van Schaik. In 2009, he concluded his PhD at the University of Minho, Portugal, under the supervision of Prof. Fernando Rodrigues. His doctoral research was developed in part as a Research Fellow at the Rochester University Medical Center, USA. Nuno's PhD work advanced the knowledge on the pathological mechanisms of Batten disease going from microbial to animal model systems (Osório et al. Mol. Bio. Cell. 2007). He went then to do a postdoctoral fellow under the supervision of Prof. Margarida Saraiva and obtained pioneering evidence regarding the evolution of Mycobacterium tuberculosis (Osório et al. Mol. Biol. Evo. 2013). In 2015, he got an Assistant Investigator position at ICVS/3B's Government Associate Laboratory and afterwords co-created and become a PI in the research team (PEvoGen) focusing on the study of the genetic diversity and evolution of human pathogens. In all career, Nuno published more than 40 international peer-reviewed papers, including several publications in top-tier journals (Osório et al. Lancet Infect. Dis. 2021, Thomson-Luque et al. Nat. Commun. 2021, Andrade et al. Nat. Med. 2020, Gonçalves et al. Nat. Commun. 2020, Sousa et al. Nat Commun. 2020). He volunteered as Editor in international scientific journals and is regularly invited to review scientific articles. He also evaluates research project grants for the Graduate Women in Science Fellowship Program. To date, he successfully supervised 1 postdoctoral fellow, 2 PhD students, 12 MSc students and currently mentors 4 PhD and 2 MSc students. He integrated more than 20 funded research projects, 5 as responsible researcher. He was invited more than 15 times as arguer in Academic Jury for PhD and MSc degrees at different Portuguese Universities. He has 16 years of experience in teaching at the University level, yearly coordinates the "Bioinformatics in Health Sciences" international postgraduate course at University of Minho and was teaching staff in the EMBO Practical Course "Single Cell Genomics: get started!". He was also invited to lecture in teaching sessions of Bioinformatics Masters in other Portuguese universities and post-graduate courses in developing countries. He received 12 awards or distinctions, including "Best Article" of the Portuguese Society of Immunology (2021), the "Young Researcher Award" from the Portuguese Society of Microbiology (2010), or the "Academic Merit Award" from the University of Minho (2003). In the area of innovation and entrepreneurship, he received the award for "Best Business Idea of the Year" from the Business Innovation Centre of Minho (2006) and co-founded the technology-based spinoff Petridish Software (2010), which develops laborders.com and has clients in Portugal and internationally. In 2011, he participated in UTEN Portugal (University Technology Enterprise Network) and received training in Technology Transfer at the IC2 Institute of the University of Texas, United States of America. Nuno is a proud father of an ten-year-old boy that also loves scientific questions and discoveries.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Nuno Miguel Sampaio Osório

Nomes de citação

  • Osório, Nuno S.

Identificadores de autor

Ciência ID
0F11-6B43-930D
ORCID iD
0000-0003-0949-5399
Google Scholar ID
c3dHD0sAAAAJ
Researcher Id
AAF-4307-2020

Endereços de correio eletrónico

  • nosorio@med.uminho.pt (Profissional)

Domínios de atuação

  • Ciências Médicas e da Saúde - Ciências da Saúde - Doenças Infeciosas

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B2)
Formação
Grau Classificação
2009
Concluído
PhD in Health Sciences (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
"Uncovering pathological mechanisms underlying Batten disease : from yeast to more complex models systems" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2003
Concluído
Applied Biology (Licenciatura)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
"“Role of the transcription factor sigma-B in the stress response of the pathogenic micro-organism Bacillus cereus” Classification: 19" (TESE/DISSERTAÇÃO)
15
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2015 - Atual Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2009/11/02 - Atual Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2023 - Atual The development of synergistic ozone and light-emitting diode activation system for the disinfection of fiber-based materials
SFRH/BD/15386/2022
Orientador
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2022 - Atual Artificial intelligence approaches to foster the development of novel antibiotics
SFRH/BD/07462/2021
Orientador
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2017 - 2022 Characterization of Lineage Specific Epitopes in Mycobacterium tuberculosis: selection of molecular targets for effective healthcare tools in tuberculosis | TB-LiSE
SFRH/BD/132797/2017
Orientador
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2017 - 2021 Molecular determinants of antimicrobial resistance emergence: the evolutionary model of streptomycin resistant tuberculosis
SFRH/BD/135422/2017
Orientador
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2016 - 2021 Impact of HIV-1 genetic diversity on the interaction with host cells
PD/BD/127827/2016
Orientador
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2015 - 2019 Molecular epidemiology and identification of clinically relevant biomarkers in HIV-1
PDE/BDE/113599/2015
Orientador
Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2003 - 2004 Isolation of molecules involved in high-affinity iron uptake systems of Leishmania infantum
POCTI/ESP/41982/2001
Bolseiro de Iniciação Científica
Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Projeto

Designação Financiadores
2021 - Atual Host-microbiome interactions in the quest for Fibrosing ILD Biomarkers that Rule Acceleration (FIBRA-Lung)
PTDC/MEC-RES/0158/2020
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021 - Atual MC4COVID - microcapsule systems for coronavirus inactivation
nº 69944
Responsible at ICVS (Industry led project)
2021 - Atual Characterization of adaptive immune response on COVID-19 recovered patients (COVID-AIR)
CCA234
Investigador
Centro Clínico Académico – Braga, Associação (2CA-Braga)
Em curso
2020 - Atual ReCOVMi .: Reforço da resposta à pandemia de COVID-19 através do desenvolvimento de ferramentas de diagnóstico e aumento da capacidade
NORTE-01-0145-FEDER-072555
Investigador
European Regional Development Fund
Em curso
2020 - 2021 Develop fast, highly accurate, low-cost PCR-based protocol to test SARS-CoV-2
208_596865986
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018 - 2021 The host-microbiota interaction in fungal diseases: towards biomarker discovery and therapy - FUNBIOMICS
PTDC/SAU-SER/29635/2017
Investigador
Universidade do Porto, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018 - 2020 Translating Mechanisms of Mycobacterium tuberculosis Evolution into Threapeutic Insights
FCT-IF/00474/2014/CP1212/CT0011
Investigador responsável
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018 - 2020 Impact of HIV-1 Genetic Diversity on the Acquired Immunodeficiency
ID1206
Investigador responsável
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
Gilead Sciences Europe Ltd
Concluído
2017 - 2019 Keep Lab Safety Keep You Healthy
2017-1-TR01-KA202-046148
Investigador
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
European Commission
Em curso
2017 - 2018 Validation of a Cancer Immunotherapy Strategy Applying Artificial Peptides Designed by HABIT
NORTE – 01 – 0246 – FEDER – 000005
Investigador responsável
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
European Regional Development Fund
Concluído
2014 - 2017 Deregulation of hematopoiesis by Interleukin-10 over-expression: implications for the development of hematological disorders
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2015 - 2016 Universal vaccine for tuberculosis based on liposomal delivery of hypervariable antigens.
LAICVS3Bs2014
Investigador responsável
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
Laboratório Associado ICVS 3B's
Concluído
2015 - 2016 Deciphering the candidate Mycobacterium tuberculosis molecular signatures of TLR2 vs TLR4 activation
35984
Investigador
Universidade do Porto Instituto de Biologia Molecular e Celular, Portugal
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
Concluído
2014 - 2015 The ATP-binding cassette transporters Plasmodium falciparum multidrug resistance proteins (pfMRPs) and their relevance in antimalarial drug resistance.
ESCMID/FEMS2014
Investigador
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
Concluído
2014 - 2015 Os Exames de Competencias Laboratoriais Objectivos como Metodologia Inovadora de Avaliação de Competencias.
107/ID/2014
Investigador
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2014 - 2015 Impact of Mycobacterium tuberculosis phylogeny in clinical heterogeneity
Fundação Amélia de Mello
Investigador
José de Mello Saúde
2011 - 2012 Criação de um Centro de Simulação de Competências Científicas Laboratoriais
FCG-DESEDU2011
Investigador
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
Fundação Calouste Gulbenkian
Concluído
2010 - 2011 Unraveling the specific involvement of the small Rho-like GTPase Cdc42 in the highly polymorphic nature of Paracoccidioides brasiliensis yeast cells
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2008 - 2011 NanoMeDiag-Nanobioanalytical platforms for improved medical diagnosis of infections caused by pathogen microorganisms
Investigador
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2007 - 2010 UNCOVERING PATHOLOGICAL MECHANISM UNDERLYING JUVENILE NEURONAL CEROID LIPOFUSCINOSES: FROM YEAST TO MORE COMPLEX MODEL SYSTEMS
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Azevedo, Maria Manuel; Gonçalves, Ana; Osório, Nuno S.; Baltazar, Fátima. Autor correspondente: Osório, Nuno S.. "Antibiotic resistance: Assessing knowledge and misconceptions among Portuguese students and science teachers". Biochemistry and Molecular Biology Education (2024): http://dx.doi.org/10.1002/bmb.21849.
    10.1002/bmb.21849
  2. Gallego-García, Pilar; Estévez-Gómez, Nuria; De Chiara, Loretta; Alvariño, Pilar; Juiz-González, Pedro M.; Torres-Beceiro, Isabel; Poza, Margarita; et al. "Dispersal history of SARS-CoV-2 in Galicia, Spain". Journal of Medical Virology 96 7 (2024): http://dx.doi.org/10.1002/jmv.29773.
    10.1002/jmv.29773
  3. Barbosa-Matos, Catarina; Borges-Pereira, Caroline; Libório-Ramos, Sofia; Fernandes, Raquel; Oliveira, Marcela; Mendes-Frias, Ana; Silvestre, Ricardo; et al. "Deregulated immune cell recruitment orchestrated by c-MET impairs pulmonary inflammation and fibrosis". Respiratory Research 25 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1186/s12931-024-02884-1.
    10.1186/s12931-024-02884-1
  4. Martins, Eduarda P.; Gonçalves, Céline S.; Peixoto, Joana; Ferreira, Joana M.; Longatto-Filho, Adhemar; Costa, Pedro M.; Osório, Nuno S.; Granja, Sara; Costa, Bruno M.. "A transcriptomic profiling reveals novel roles of Cadherin-3 in metabolic programming of glioblastoma". (2024):
    Submetido
  5. Daniela Casanova; Vitoria Baptista; Magda Costa; Bruno Freitas; Maria Pereira; Carla Calçada; Paula Mota; et al. "Artemisinin resistance-associated gene mutations in Plasmodium falciparum: A case study of severe malaria from Mozambique". Travel Medicine and Infectious Disease (2023): http://dx.doi.org/10.1016/j.tmaid.2023.102684.
    10.1016/j.tmaid.2023.102684
  6. Leonardo D. Garma; Nuno S. Osório. "Demystifying dimensionality reduction techniques in the ‘omics’ era: A practical approach for biological science students". Biochemistry and Molecular Biology Education (2023): https://doi.org/10.1002/bmb.21800.
    10.1002/bmb.21800
  7. Costa, Tiago; Veiga, Maria I.; Osório, Nuno S.; Neves, Nuno M.; Aguilar, Helena; Fraga, Alexandra G.. "Development of polyurethane antimicrobial coatings by composition with phenolic-, ionic- and copper-based agents". Journal of Materials Research and Technology 24 (2023): 6942-6957. http://dx.doi.org/10.1016/j.jmrt.2023.04.243.
    10.1016/j.jmrt.2023.04.243
  8. David Ferreiro; Ruqaiya Khalil; María J Gallego; Nuno S Osorio; Miguel Arenas. "The evolution of the HIV-1 protease folding stability". Virus Evolution (2022): https://doi.org/10.1093/ve/veac115.
    10.1093/ve/veac115
  9. Geraldes, Inês; Fernandes, Mónica; Fraga, Alexandra G.; Osório, Nuno S.. Autor correspondente: Osório, Nuno S.. "The impact of single-cell genomics on the field of mycobacterial infection". Frontiers in Microbiology 13 (2022): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.989464.
    Publicado • 10.3389/fmicb.2022.989464
  10. Thomson-Luque, Richard; Votborg-Nove´l, Lasse; Oso´rio, Nuno S.; Portugal, Silvia. "Reply to: Relationship of circulating Plasmodium falciparum lifecycle stage to circulating parasitemia and total parasite biomass". Nature Communications 13 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-022-32998-3.
    Publicado • 10.1038/s41467-022-32998-3
  11. Sousa, Vânia I.; Parente, Joana F.; Marques, Juliana F.; Calçada, Carla; Veiga, Maria I.; Osório, Nuno S.; Tavares, Carlos J.. "PMMA Microcapsules for the Inactivation of SARS-CoV-2". ACS Omega 7 26 (2022): 22383-22393. http://dx.doi.org/10.1021/acsomega.2c01446.
    10.1021/acsomega.2c01446
  12. Nuno S. Osório. "Tuberculosis caused by Mycobacterium africanum: Knowns and unknowns.". PLoS pathogens (2022): https://europepmc.org/articles/PMC9135246.
    10.1371/journal.ppat.1010490
  13. Nuno S. Osório. "Development of an Ultraviolet-C Irradiation Room in a Public Portuguese Hospital for Safe Re-Utilization of Personal Protective Respirators". International Journal of Environmental Research and Public Health 19 8 (2022): 4854-4854. http://dx.doi.org/10.3390/ijerph19084854.
    10.3390/ijerph19084854
  14. Deisy M. G. C. Rocha; Miguel Viveiros; Margarida Saraiva; Nuno S. Osório. "The Neglected Contribution of Streptomycin to the Tuberculosis Drug Resistance Problem". Genes (2021): https://doi.org/10.3390/genes12122003.
    10.3390/genes12122003
  15. Souto, B.; Triunfante, V.; Santos-Pereira, A.; Martins, J.; Araújo, P. M. M; Osório, Nuno S.. "Evolutionary dynamics of HIV-1 subtype C in Brazil". Scientific Reports 11 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-02428-3.
    10.1038/s41598-021-02428-3
  16. Carvalho-Correia, E.; Calçada, C.; Branca, F.; Estévez-Gómez, N.; De Chiara, L.; Varela, N.; Gallego-García, P.; et al. "OmniSARS2: A Highly Sensitive and Specific RT-qPCR-Based COVID-19 Diagnostic Method Designed to Withstand SARS-CoV-2 Lineage Evolution". Biomedicines 9 10 (2021): 1314-1314. http://dx.doi.org/10.3390/biomedicines9101314.
    10.3390/biomedicines9101314
  17. George A. Yendewa; Sulaiman Lakoh; Sahr A. Yendewa; Khadijah Bangura; Andrés Tabernilla; Lucia Patiño; Darlinda F. Jiba; et al. "Characterizing HIV-1 Genetic Subtypes and Drug Resistance Mutations among Children, Adolescents and Pregnant Women in Sierra Leone". Genes 12 9 (2021): 1314-1314. https://doi.org/10.3390/genes12091314.
    10.3390/genes12091314
  18. Thomson-Luque, Richard; Votborg-Novél, Lasse; Ndovie, Wanangwa; Andrade, Carolina M.; Niangaly, Moussa; Attipa, Charalampos; Lima, Nathalia F.; et al. "Plasmodium falciparum transcription in different clinical presentations of malaria associates with circulation time of infected erythrocytes". Nature Communications 12 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-25062-z.
    10.1038/s41467-021-25062-z
  19. Rocha, Deisy M. G. C.; Magalhães, Carlos; Cá, Baltazar; Ramos, Angelica; Carvalho, Teresa; Comas, Iñaki; Guimarães, João Tiago; et al. "Heterogeneous Streptomycin Resistance Level Among Mycobacterium tuberculosis Strains From the Same Transmission Cluster". Frontiers in Microbiology 12 (2021): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2021.659545.
    Publicado • 10.3389/fmicb.2021.659545
  20. Ana Santos-Pereira; Vera Triunfante; Pedro M. M. Araújo; Joana Martins; Helena Soares; Eva Poveda; Bernardino Souto; Nuno S. Osório. "Nationwide Study of Drug Resistance Mutations in HIV-1 Infected Individuals under Antiretroviral Therapy in Brazil". International Journal of Molecular Sciences 22 10 (2021): 5304-5304. https://doi.org/10.3390/ijms22105304.
    10.3390/ijms22105304
  21. Ana Santos-Pereira; Carlos Magalhães; Pedro M. M. Araújo; Nuno S. Osório. "Evolutionary Genetics of Mycobacterium Tuberculosis and HIV-1: "The Tortoise and the Hare"". Microorganisms 9 1 (2021): 147-147. https://doi.org/10.3390/microorganisms9010147.
    10.3390/microorganisms9010147
  22. Andrade, Carolina M.; Fleckenstein, Hannah; Thomson-Luque, Richard; Doumbo, Safiatou; Lima, Nathalia F.; Anderson, Carrie; Hibbert, Julia; et al. "Increased circulation time of Plasmodium falciparum underlies persistent asymptomatic infection in the dry season". Nature Medicine (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41591-020-1084-0.
    10.1038/s41591-020-1084-0
  23. Gonçalves, Samuel M.; Duarte-Oliveira, Cláudio; Campos, Cláudia F.; Aimanianda, Vishukumar; ter Horst, Rob; Leite, Luis; Mercier, Toine; et al. "Phagosomal removal of fungal melanin reprograms macrophage metabolism to promote antifungal immunity". Nature Communications 11 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-020-16120-z.
    10.1038/s41467-020-16120-z
  24. Osório, Nuno S.; Correia-Neves, Margarida. "Implication of SARS-CoV-2 evolution in the sensitivity of RT-qPCR diagnostic assays". The Lancet Infectious Diseases (2020): http://dx.doi.org/10.1016/s1473-3099(20)30435-7.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1016/s1473-3099(20)30435-7
  25. Sousa, Jeremy; Cá, Baltazar; Maceiras, Ana Raquel; Simões-Costa, Luisa; Fonseca, Kaori L.; Fernandes, Ana Isabel; Ramos, Angélica; et al. "Mycobacterium tuberculosis associated with severe tuberculosis evades cytosolic surveillance systems and modulates IL-1ß production". Nature Communications 11 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-020-15832-6.
    10.1038/s41467-020-15832-6
  26. Ferreira, Carolina; Mesquita, Inês; Barbosa, Ana Margarida; Osório, Nuno Sampaio; Torrado, Egídio; Beauparlant, Charles-Joly; Droit, Arnaud; et al. "Glutamine supplementation improves the efficacy of miltefosine treatment for visceral leishmaniasis". PLOS Neglected Tropical Diseases 14 3 (2020): e0008125. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0008125.
    Acesso aberto • 10.1371/journal.pntd.0008125
  27. Araújo, Pedro M M; Martins, Joana S; Osório, Nuno S. "SNAPPy: A snakemake pipeline for scalable HIV-1 subtyping by phylogenetic pairing". Virus Evolution 5 2 (2019): http://dx.doi.org/10.1093/ve/vez050.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1093/ve/vez050
  28. Araújo, Pedro M. M.; Carvalho, Alexandre; Pingarilho, Marta; Abecasis, Ana B.; Osório, Nuno S.. "Characterization of a large cluster of HIV-1 A1 infections detected in Portugal and connected to several Western European countries". Scientific Reports 9 1 (2019): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-43420-2.
    Publicado • 10.1038/s41598-019-43420-2
  29. Meira, L.; Chaves, C.; Araújo, D.; Almeida, L.; Boaventura, R.; Ramos, A.; Carvalho, T.; et al. "Predictors and outcomes of disseminated tuberculosis in an intermediate burden setting". Pulmonology (2019): http://dx.doi.org/10.1016/j.pulmoe.2018.11.001.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1016/j.pulmoe.2018.11.001
  30. Martins, Joana; Magalhães, Carlos; Rocha, Miguel; Osório, Nuno S. "Machine Learning-Enhanced T Cell Neoepitope Discovery for Immunotherapy Design". Cancer Informatics 18 (2019): http://dx.doi.org/10.1177/1176935119852081.
    Publicado • 10.1177/1176935119852081
  31. Bastos, Helder Novais; Osório, Nuno S.; Gagneux, Sebastien; Comas, Iñaki; Saraiva, Margarida. "The Troika Host–Pathogen–Extrinsic Factors in Tuberculosis: Modulating Inflammation and Clinical Outcomes". Frontiers in Immunology 8 (2018): http://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2017.01948.
    Acesso aberto • Publicado • 10.3389/fimmu.2017.01948
  32. Bhatt, Kiranmai; Machado, Henrique; Osorio, Nuno S; Sousa, Jeremy; Cardoso, Filipa; Magalhaes, Carlos; Chen, Bing; et al. "A Nonribosomal Peptide Synthase Gene Driving Virulence in Mycobacterium tuberculosis.". mSphere 3 5 (2018):
    Publicado • 10.1128/mSphere.00352-18
  33. Yruela, Inmaculada; Contreras-Moreira, Bruno; Magalhães, Carlos; Osório, Nuno S.; Gonzalo-Asensio, Jesús. "Mycobacterium tuberculosisComplex Exhibits Lineage-Specific Variations Affecting Protein Ductility and Epitope Recognition". Genome Biology and Evolution (2017): evw279. http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evw279.
    Publicado • 10.1093/gbe/evw279
  34. Bastos, Helder Novais; Osório, Nuno S.; Castro, António Gil; Ramos, Angélica; Carvalho, Teresa; Meira, Leonor; Araújo, David; et al. "A Prediction Rule to Stratify Mortality Risk of Patients with Pulmonary Tuberculosis". PLOS ONE 11 9 (2016): e0162797. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0162797.
    Publicado • 10.1371/journal.pone.0162797
  35. Carvalho, Alexandre; Costa, Patrício; Triunfante, Vera; Branca, Fernando; Rodrigues, Fernando; Santos, Catarina L.; Correia-Neves, Margarida; et al. "Analysis of a Local HIV-1 Epidemic in Portugal Highlights Established Transmission of Non-B and Non-G Subtypes". Journal of Clinical Microbiology 53 5 (2015): 1506-1514. http://dx.doi.org/10.1128/jcm.03611-14.
    Publicado • 10.1128/jcm.03611-14
  36. Veiga, Maria Isabel; Osório, Nuno S.; Ferreira, Pedro Eduardo; Franzén, Oscar; Dahlstrom, Sabina; Lum, J. Koji; Nosten, Francois; Gil, José Pedro. "Complex Polymorphisms in the Plasmodium falciparum Multidrug Resistance Protein 2 Gene and Its Contribution to Antimalarial Response". Antimicrobial Agents and Chemotherapy 58 12 (2014): 7390-7397. http://dx.doi.org/10.1128/aac.03337-14.
    Publicado • 10.1128/aac.03337-14
  37. Osório, Nuno S; Rodrigues, Fernando; Garcia, Eduardo A; Costa, Manuel J. "Drawings as snapshots of student cellular anatomy understanding". Medical Education 47 11 (2013): 1120-1121. http://dx.doi.org/10.1111/medu.12320.
    Publicado • 10.1111/medu.12320
  38. Carmona, Jenny; Cruz, Andrea; Moreira-Teixeira, Lucia; Sousa, Carole; Sousa, Jeremy; Osorio, Nuno S.; Saraiva, Ana L.; et al. "Mycobacterium tuberculosis Strains Are Differentially Recognized by TLRs with an Impact on the Immune Response". PLoS ONE 8 6 (2013): e67277. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0067277.
    Acesso aberto • 10.1371/journal.pone.0067277
  39. Osório, Nuno S.; Rodrigues, Fernando; Gagneux, Sebastien; Pedrosa, Jorge; Pinto-Carbó, Marta; Castro, António G.; Young, Douglas; Comas, Iñaki; Saraiva, Margarida. "Evidence for Diversifying Selection in a Set of Mycobacterium tuberculosis Genes in Response to Antibiotic- and Nonantibiotic-Related Pressure". Molecular Biology and Evolution 30 6 (2013): 1326-1336. http://dx.doi.org/10.1093/molbev/mst038.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1093/molbev/mst038
  40. Menino, João F.; Osório, Nuno S.; Sturme, Mark H. J.; Barros, Diana; Gomes-Alves, Ana G.; Almeida, Agostinho J.; Ludovico, Paula; et al. "Morphological heterogeneity ofParacoccidioides brasiliensis: relevance of the Rho-like GTPasePbCDC42". Medical Mycology 50 7 (2012): 768-774. http://dx.doi.org/10.3109/13693786.2012.665614.
    Acesso aberto • 10.3109/13693786.2012.665614
  41. Carvalho, Agostinho; Osório, Nuno S.; Saraiva, Margarida; Cunha, Cristina; Almeida, Agostinho J.; Teixeira-Coelho, Maria; Ludovico, Paula; et al. "The C Allele of rs5743836 Polymorphism in the Human TLR9 Promoter Links IL-6 and TLR9 Up-Regulation and Confers Increased B-Cell Proliferation". PLoS ONE 6 11 (2011): e28256. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0028256.
    Acesso aberto • 10.1371/journal.pone.0028256
  42. Carvalho, A; Cunha, C; Almeida, A J; Osório, N S; Saraiva, M; Teixeira-Coelho, M; Pedreiro, S; et al. "The rs5743836 polymorphism in TLR9 confers a population-based increased risk of non-Hodgkin lymphoma". Genes & Immunity 13 2 (2011): 197-201. http://dx.doi.org/10.1038/gene.2011.59.
    Publicado • 10.1038/gene.2011.59
  43. Osório, N. S.; Sampaio-Marques, B.; Chan, C.-H.; Oliveira, P.; Pearce, D. A.; Sousa, N.; Rodrigues, F.. "Neurodevelopmental delay in theCln3¿ex7/8mouse model for Batten disease". Genes, Brain and Behavior 8 3 (2009): 337-345. http://dx.doi.org/10.1111/j.1601-183x.2009.00478.x.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1111/j.1601-183x.2009.00478.x
  44. Almeida, B.; Buttner, S.; Ohlmeier, S.; Silva, A.; Mesquita, A.; Sampaio-Marques, B.; Osorio, N. S.; et al. "NO-mediated apoptosis in yeast". Journal of Cell Science 120 18 (2007): 3279-3288. http://dx.doi.org/10.1242/jcs.010926.
    Acesso aberto • 10.1242/jcs.010926
  45. Osório, Nuno S.; Carvalho, Agostinho; Almeida, Agostinho J.; Padilla-Lopez, Sérgio; Leão, Cecília; Laranjinha, João; Ludovico, Paula; Pearce, David A.; Rodrigues, Fernando. "Nitric Oxide Signaling Is Disrupted in the Yeast Model for Batten Disease". Molecular Biology of the Cell 18 7 (2007): 2755-2767. http://dx.doi.org/10.1091/mbc.e06-11-1053.
    Acesso aberto • 10.1091/mbc.e06-11-1053
Capítulo de livro
  1. Maria Isabel Veiga; Nuno S. Osório. "Investigação ao serviço da sociedade". 310-330. {UMinho, 2020.
    10.21814/uminho.ed.24.14
  2. Ludovico, P.; Sampaio-Marques, B.; Osório, N S; Rodrigues, F.. "The role of nitric oxide signalling in yeast stress response and cell death.". In The handbook of microbial metabolism of amino acids, 128-141. CABI, 2017.
    Publicado • 10.1079/9781780647234.0128
  3. Osório, Nuno S.; Osório, D. "Batten disease: overview and current research topics". L.A.Publishing isbn: 978-3-8383-6147-5, 2010.
    Publicado
Poster em conferência
  1. Velosa da Fonseca, Beatriz; Baptista, Vitória; Osório, Nuno S.; Maria Isabel Mendes Veiga. "Engenharia de Parasitas da Malária Humana para triagem de drogas em múltiplas etapas de alto rendimento". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2024, 2024.
  2. Velosa da Fonseca, Beatriz; Baptista, Vitória; Pernaute-Lau, Leyre; Calçada, Carla; Freitas, Bruno; Osório, Nuno S.; Maria Isabel Mendes Veiga. Autor correspondente: Maria Isabel Mendes Veiga. "Enginnering a Transgenic Human Malaria Parasite Reporter Line for Multistage Drug Screening". Trabalho apresentado em 2nd Edition "Malária nos PALOP" Conference (2024), 2024.
  3. Velosa da Fonseca, Beatriz; Baptista, Vitória; Pernaute-Lau, Leyre; Calçada, Carla; Osório, Nuno S.; Veiga, Maria Isabel. Autor correspondente: Veiga, Maria Isabel. "Breaking Boundaries in Malaria Research: Design of a Genetic Tool for High-Throughput Gametocidal Drug Screening". Trabalho apresentado em SCI (Semana da Ciência e Inovação), 2024.
  4. Velosa da Fonseca, Beatriz; Freitas, Bruno; Baptista, Vitória; Osório, Nuno S.; Veiga, Maria Isabel. Autor correspondente: Veiga, Maria Isabel. "Engineering Human Malaria Parasites for Highthroughput Gametocidal Drug Screening". Trabalho apresentado em XVI Jornadas Ibéricas de Genética e Biotecnologia, 2024.
  5. Federo, Claudia; Baptista, Vitória; Freitas, Bruno; Osório, Nuno S.; Veiga, Maria Isabel. Autor correspondente: Veiga, Maria Isabel. "Enhancing malaria elimination strategies in the Dominican Republic: Evaluating rapid diagnostic test accuracy and unraveling parasite genetic diversity". Trabalho apresentado em UMinho Research & Innovation Open Days, 2024.
  6. Federo, Claudia; Francisco Cuevas; Miguel, Isaac; Baptista, Vitória; Mariagiulia Conte; Freitas, Bruno; Osório, Nuno S.; Modesto Cruz; Veiga, Maria Isabel. "Assessing malaria rapid diagnostic test accuracy and genetic diversity in the Dominican Republic: Implications for elimination efforts". Trabalho apresentado em ICVS retreat, 2023.
  7. Marcela Oliveira; Gonçales, Relber Aguiar; Ana Baptista; Daniela Antunes; Osório, Nuno S.; Hélder Novais e Bastos; Cristina Cunha; Agostinho Carvalho. "Spatiotemporal profiling of gene expression during sarcoid granuloma formation". Trabalho apresentado em XVLIII SPI Annual Meeting, 2023.
Recurso online
  1. Silva M; Calçada C; Osório, N. S.; Baptista V; Thathy V; Teixeira M; Reid AJ; et al. Transcriptome datasets for Plasmodium falciparum 3D7 and Dd2: high throughput sequencing data. 2022. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE195649.
  2. Rocha, D. M. G. C.; Magalhães, C.; Cá, B.; Ramos, A.; Carvalho, T.; Comas, I.; Guimarães, J. T.; et al. Transmission of streptomycin resistance in Mycobacterium tuberculosis infections. Dataset: high throughput sequencing data.. 2021. https://www.ncbi.nlm.nih.gov//bioproject/PRJNA698233.
  3. Carvalho-Correia, E.; Calçada, C.; Estévez-Gómez, N.; De Chiara, L.; Varela, N.; Gallego-García, P.; Posada, D.; et al. SARS-CoV-2 genome sequences from samples isolated at ICVS. Dataset: high throughput sequencing metadata. 2021. http://www.evobiomed.com/sars-cov-2.
  4. Gonçalves, S. M.; Duarte-Oliveira, C.; Campos, C. F.; Osório, N. S.; Carvalho, A.. Transcriptome of human macrophages infected with Aspergillus fumigatus. Dataset: high throughput sequencing data. 2020. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE195649.
  5. Souto, Bernardino; Santos, Joana; Santos-Pereira, Ana; Triunfante, Vera; Araújo, Pedro; Osório, Nuno S.. HanDBr: A relational database with data from 50k HIV-1 infections detected in Brazil from 2008 to 2017. 2018. http://handbr.evobiomed.com.
  6. Santos-Pereira, Ana; Correia, João; Rocha, Miguel; Osório, Nuno S.. SPINET: Syndemic Protein Interaction NETworks. 2018. http://spinet.evobiomed.com.
  7. Araújo, Pedro M.M.; Osório, Nuno S.. SNAPPy: a snakemake pipeline for pathogen subtyping by phylogenetic pairing. 2018. http://snappy.evobiomed.com.
  8. Martins, Joana dos Santos; Magalhães, Carlos André Rodrigues; Vieira, Vítor; Rocha, Miguel; Osório, Nuno S.. HABIT - a web server for interactive T cell neoepitope discovery. 2017. https://doi.org/10.1101/535716.
Resumo em conferência
  1. Velosa da Fonseca, Beatriz; Baptista, Vitória; Freitas, Bruno; Osório, Nuno S.; Veiga, Maria Isabel. Autor correspondente: Veiga, Maria Isabel. "Red Fluorescent & Luminescent Malaria Parasites: A Novel Tool for High-Throughput Gametocidal Drug Screening". Trabalho apresentado em VII iBiMED Symposium, Aveiro, 2024.
    Submetido
  2. Padrão, Jorge; Felgueiras, Helena P.; Osório, Nuno S.; Zille, Andrea. Autor correspondente: Padrão, Jorge. "Assessing textile antiviral properties". Trabalho apresentado em MicroSummit 2022, Porto, 2022.
    Publicado
  3. Novais E Bastos, Helder; Machado, Henrique; Sousa, Jeremy; Veiga, Maria Isabel; Ramos, Angélica; Carvalho, Teresa; Rodrigues, Fernando; et al. "Tuberculosis severity and its association with pathogen phylogeny and properties". Trabalho apresentado em European Respiratory Journal. http://dx.doi.org/10.1183/1393003.congress-2017.pa3046, 2017.
    10.1183/1393003.congress-2017.pa3046
  4. Novais e Bastos, Helder; Osório, Nuno; Castro, António Gil; Ramos, Angélica; Carvalho, Teresa; Meira, Leonor; Araújo, David; et al. "A prediction rule to stratify mortality risk of patients with pulmonary tuberculosis". Trabalho apresentado em European Respiratory Journal. http://dx.doi.org/10.1183/13993003.congress-2016.oa4825, 2016.
    10.1183/13993003.congress-2016.oa4825
  5. Araújo, David; Meira, Leonor; Almeida, Leonor; Boaventura, Rita; Osório, Nuno S.; Ferreira, Ivo; Magalhães, Sara; et al. "HIV and tuberculosis co-infection: A 7 year retrospective cohort study". Trabalho apresentado em European Respiratory Journal. http://dx.doi.org/10.1183/13993003.congress-2015.pa2728, 2015.
    Publicado • 10.1183/13993003.congress-2015.pa2728
  6. Carmona, Jenny; Cruz, Andrea; Sousa, Carole; Osório, Nuno S.; Saraiva, Ana L.; Svenson, Stefan; Kallenius, Gunilla; et al. "Mycobacterium tuberculosis strains are differentially recognized by TLRs with an impact on innate immune responses and the outcome of infection: P1313". Trabalho apresentado em Immunology Journal, 2012.
    Publicado
  7. Osório, Nuno S.; Sampaio-Marques, B.; Pearce, David A.; Oliveira, Rui; Laranjinha, João; Sousa, Nuno; Rodrigues, Fernando. "Studying the role of nitric oxide in the pathological mechanism of Batten disease". Trabalho apresentado em The FEBS Journal, 2008.
    Publicado
  8. Almeida, B.; Buttner, S.; Ohlmeier, S.; Silva, A.; Mesquita, A.; Sampaio-Marques, B.; Osório, N. S.; et al. "Evidence of NO-mediated apoptosis in yeast". Trabalho apresentado em Yeast. Jul 24;(S1):S105, 2007.
    Publicado

Outros

Empresa spin-off
  1. 2010. LabOrders / PetriDish Software Lda.. Software. laborders.com.
Outra produção
  1. The Plasmodium falciparum protein PfMRP1 functions as an influx ABC transporter. 2022. Miguel Silva; Carla Calçada; Nuno Osório; Vitória Baptista; Vandana Thathy; Miguel Teixeira; Adam Reid; et al. https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1210682/v1.
    10.21203/rs.3.rs-1210682/v1
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2019 Epidemiology of HIV-1 antiretroviral resistance in Brazil between 2008 and 2017 XII Congresso da Sociedade Brasileira de DST / VIII Congresso Brasileiro de AIDS / III Congresso Latino Americano IST/HIV/AIDS
da Sociedade Brasileira de DST (Foz do Iguaçu, Brasil)
2018 Immunoinformatics to investigate varying adaptive immune responses by different Mycobacterium tuberculosis lineages MycoNET meeting 2018
CIC bioGUNE (Bilbao, Espanha)
2018 Genetic diversity of the obligate human pathogens Mycobacterium tuberculosis and HIV-1 Global Health & Tropical Medicine Seminars
Instituto de Higiene e Medicina Tropical (Lisbon, Portugal)
2017 Phylogenetic Characterization of HIV-1 subtype A1 in the Portuguese region of Minho: increasing number of new infections 4.º Congresso Nacional de Medicina Tropical e 1.º Encontro Lusófono de Sida, Tuberculose e Doenças Oportunistas
(Lisbon, Portugal)
2016 Genome-wide patterns of genetic differentiation in low vs. high immune-activating M. tuberculosis strains MycoNET meeting 2016
Palau Macaya, "La Caixa" (Barcelona, Espanha)
2016 Pathogenomics as a tool to understand the major human infectious diseases. Bioinformatics Open Days 2016
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2016 Lineage-specific CD4+ T cell-driven diversifying selection in Mycobacterium tuberculosis pinpoints targets of co-evolution with humans Bioinformatics Open Days 2016
Universidade do Minho (Braga, Portugal)
2015 Uncovering genetic and antigenic diversity among tuberculosis-causing bacteria MycoNET Meeting 2015
Universidad Complutense de Madrid (Madrid, Espanha)
2015 Effects of Pathogen Genetic Diversity on Major Human Infectious Diseases Bioinformatics Open Days 2015
(Braga, Portugal)
2015 Relevance of pathogen intraspecific genetic diversity for the control of human infectious diseases IBMC/INEB Seminars - Summer Series
(Porto, Portugal)
2015 Evidence for T cell-driven diversifying selection in Mycobacterium tuberculosis XI Congreso Internacional de Investigación Científica
(Santo Domingo, República Dominicana)
2015 Relevance of pathogen intraspecies diversity for the control of human infectious diseases XII Congreso Centroamericano y del Caribe de Parasitología y Medicina Tropical
(Punta Cana, República Dominicana)
2015 Evidence for T-cell driven diversifying selection in Mycobacterium tuberculosis in vivo expressed genes Bioinformatics Open Days 2015
(Braga, Portugal)
2014 Tuberculosis: how to fight a bacteria with millenia of co-evolution with humans. XV Jornadas de Biologia Aplicada.
(Braga, Portugal)
2014 Investigating diversifying selection in Mycobacterium tuberculosis. MycoNET meeting 2014
Foundation for the Promotion of Health and Biomedical Research of Valencia Region, FISABIO (Valencia, Espanha)
2014 Tuberculosis in the 2.0 post-genomic era CEB Seminars in Omic Techniques for Biotechnology and Bioengineering
(Braga, Portugal)
2013 The Objective Laboratory Skills Examination (OLSE) for the assessment of laboratory skills 17th Annual IAMSE Meeting
(St. Andrews, Reino Unido)
2013 Evidence for diversifying selection in Mycobacterium tuberculosis Bioinformatics Open Days 2013
University of Minho (Braga, Portugal)
2010 Conferência jovem investigador - Uncovering pathological mechanisms underlying Batten disease: from yeast to more complex models systems XVIII Jornadas de Biologia de Leveduras Professor Nicolau Van Uden
(Lisboa, Portugal)
2007 Arginine related nitric oxide synthesis defect in btn1-D: possible implications for JNCL pathogenesis. 11th International Congress on Neuronal Ceroid Lipofuscinoses
(Rochester, Estados Unidos)
2007 Defective nitric oxide production in Batten disease. XV Jornadas de Biologia de Leveduras Professor Nicolau van Uden
(Porto, Portugal)
2005 Deletion of BTN1, the yeast orthologue of the gene responsible for juvenile NCL, leads to disruption of oxidative stress related pathways. 10th International Congress on Neuronal Ceroid Lipofuscinoses
(Helsínquia, Finlândia)
2005 A genética da doença de Batten. Jornadas Nacionais de Bioquímica
Universidade da Beira Interior (Covilhã, Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2023 - Atual The development of synergistic ozone and light-emitting diode activation system for the disinfection of fiber-based materials
Coorientador
Engenharia - Tecnologia e Química Têxtil (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2022 - Atual Artificial intelligence approaches to foster the development of novel antibiotics
Coorientador
Informática (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2017 - Atual Characterization of Lineage Specific Epitopes in Mycobacterium tuberculosis: selection of molecular targets for effective healthcare tools in tuberculosis
Orientador de Carlos André Rodrigues Magalhães
Health Sciences (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2015 - Atual Molecular epidemiology and identification of clinically relevant biomarkers in HIV-1.
Orientador de Pedro Miguel Miranda Araújo
Health Sciences (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2022 - 2023 Single cell genomics in the host/pathogen interaction in Buruli Ulcer
Orientador de Inês Gonçalves Geraldes
Integrated Master’s in Biomedical Engineering (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2022 - 2023 From the choroid plexus to the (sub)ventricular cells for oligodendrocyte (re)generation
Coorientador
Bioinformática (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2016 - 2022 Impact HIV-1 genetic diversity on host cell interactions
Orientador de Ana Alexandra de Portugal dos Santos Pereira
Health Sciences (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2017 - 2021 Molecular determinants of antimicrobial resistance emergence: the evolutionary model of streptomycin resistant tuberculosis
Orientador de Deisy Mara Gomes da Cruz Rocha Silva
Health Sciences (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2019 - 2020 Desenvolvimento de um algoritmo baseado em Deep Learning para prever casos de pneumonia a partir de radiografias torácicas
Orientador de NUNO RAFAEL BOTO CARLOS
Bioinformática (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2018 - 2018 SPINET (Syndemic Protein Interaction NETwork): a web server for HIV, M. tuberculosis and host protein-protein interaction networks
Orientador de Rui Santos
Bioinformatics (Outra)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2017 - 2018 HIV-1/Host/M.tuberculosis Protein Interaction Network
Orientador de João Filipe Silva Correia
Bioinformatics (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2017 - 2018 Insights on the transmission of HIV-1 drug resistance mutations in a cohort of 367 patients from the Portuguese region of Minho.
Orientador de Miguel António Rezende Falcão
Medicine (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2017 - 2018 Characterization of antiretroviral therapy resistance mutations in HIV-1 virus isolated in the region of Minho, Portugal.
Orientador de Sara Sofia Costa Ferreira
Biochemistry (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
2017 - 2018 Whole genome sequencing analysis of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates and associations with the severity of pulmonary tuberculosis
Orientador de Miguel Braga Liz da Cruz Mendes
Medicine (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2016 - 2017 Genomic and immunoinformatic analysis of human Dengue virus serotypes
Orientador de Francisco Javier Cuevas Araujo
Health Sciences (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2016 - 2017 Clinical isolate versus clinical phenotype: multidisciplinary analysis of Mycobacterium tuberculosis
Coorientador de Joana Raquel Alves Pereira
Medicine (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2015 - 2015 Improving bladder cancer treatment: a new formulation containing an environmental mycobacterium.
Coorientador de Estela Noguera Ortega
Microbiology (Doutoramento)
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal

Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha
2014 - 2015 Genome-wide analysis of within-strain genetic variability in BCG
Orientador de Hélder Badim
Applied Biology (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
2014 - 2014 Exploring methods for the computational molecular evolution analysis of the Mycobacterium tuberculosis complex
Orientador de João Miguel Ferreira Balão da Silva
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2014 - 2014 Variability in the immune recognition of different Mycobacterium tuberculosis strains and the genetic diversity of phthiocerol dimycocerosate (PDIM)
Orientador de Luís Miguel Neves Da Silva
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2014 - 2014 Diversity in the genes involved in the synthesis and transport of PDIMs
Orientador de Nuno Malheiro
Medicine (Iniciação científica)
2013 - 2014 Ambiguous Sites in Routine Diagnostic HIV-1 Sequences: Markers of Age and Duality of Infection
Orientador de João Francisco da Mota Louro
Medicine (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2013 - 2013 Evidences for positive selection in specific genes encoding PPE family proteins of Mycobacterium tuberculosis
Orientador de Carlos André Rodrigues Magalhães
Biochemistry (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
2013 - 2013 Understanding the variability within Mycobacterium tuberculosis complex
Orientador de Eulália Catarina Pereira Antunes
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2012 - 2012 Variability and evolution of Mycobacterium tuberculosis mammalian cell entry operons
Orientador de Luís Silva
Applied Biology (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
2011 - 2011 Detection of positive selection associated with MDR and XDR phenotypes in Mycobacterium tuberculosis by Maximum Likelihood estimate
Orientador de Nuno Araújo
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2010 - 2010 Characterizing Jen1 trafficking in the yeast model for Batten Disease
Orientador de Sofia Silva Mendes
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2009 - 2010 Evaluation of the expression levels of Nitric Oxide Synthase in brain regions of mice models for Batten disease
Coorientador de Bruno Daniel Nunes Serra
Medicine (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2008 - 2010 Uncovering pathological mechanism underlying juvenile neuronal ceroid lipofuscinoses: from yeast to more complex model systems
Coorientador de Sandra Xavier
Health Sciences (Outra)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2009 - 2009 The Laboratory as a Teaching Science Tool : "Optimizing protocols for DNA extraction in the classroom"
Orientador de Francisco Figueiredo de Brito
Education (Outra)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2009 - 2009 The Laboratory as a Teaching Science Tool : "Optimizing protocols for DNA extraction in the classroom"
Orientador de José Júlio Oliveira Giesteira
Education (Outra)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2008 - 2008 Characterization of novel yeast models for the study of Batten disease
Orientador de Célia Marques
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2007 - 2008 Uncovering pathological mechanism underlying juvenile neuronal ceroid lipofuscinoses: from yeast to more complex model systems
Coorientador de Ana Rita Caldas
Health Sciences (Outra)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2007 - 2007 Use of simple models for the study of Batten disease
Orientador de Andreia Vilas Boas
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2007 - 2007 Overdeveloping the yeast model for Batten disease
Orientador de Nuno Costa
Medicine (Iniciação científica)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2021/08/30 - 2021/09/05 "Single cell genomics: Get started!" EMBO practical Course (2021/08/30 - 2021/09/05)
Outro (Outra)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2019 - 2019 "MycoPorto meeting 2019": Scientific Meeting on Mycobacteria (2019/09/19 - 2019/09/19)
Encontro (Membro da Comissão Científica)
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
2019 - 2019 "University of Open Doors/ Universidade Portas Abertas – UPA-UMinho": Science Festival (2019/05/02 - 2019/05/04)
Festival (Membro da Comissão Científica)
Universidade do Minho, Portugal
2018 - 2018 "Health Olympics / Olimpíadas da Saúde VIII": A round table scientific discussion and competition to award students with high levels of knowledge and skills in Health-related scientific areas (2018/05/18 - 2018/05/18) Colégio Dom Diogo de Sousa, Portugal

Universidade do Minho, Portugal
2017 - 2017 UMinho Open Weekend 2017 - Laboratory visits for the community (2017/03/24 - 2017/03/27) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2017 - 2017 "ECS / ICVS open day for Msc and PhD candidates 2017" - Seminars and site-visits. (2017/03/29 - 2017/03/29) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2017 - 2017 "Best students at UMinho 2017": Scientific Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2017/04/05 - 2017/04/07) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2017 - 2017 "Health Olympics / Olimpíadas da Saúde VII": A round table scientific discussion and competition to award students with high levels of knowledge and skills in Health-related scientific areas (2017/04/28 - 2017/04/28) Colégio Dom Diogo de Sousa, Portugal

Universidade do Minho, Portugal
2017 - 2017 "ICVS 15 YEARS" - Seminars, Poster Sessions, Technology and Spin-off Showcasing (2017/06/02 - 2017/06/02)
Conferência (Membro da Comissão Científica)
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2017 - 2017 "Summer in the Campus 2017": Science Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2017/07/20 - 2017/07/24) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2016 - 2016 "ECS / ICVS open day for Msc and PhD 2016" - seminars and site-visits (2016/03/21 - 2016/03/21)
Seminário (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2016 - 2016 "Best students at UMinho 2016": Scientific Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2016/03/29 - 2016/03/31) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2016 - 2016 "Science Outbreak Week 2016": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2016/04/11 - 2016/04/15) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2016 - 2016 "Health Olympics / Olimpíadas da Saúde VI": A round table scientific discussion and competition to award students with high levels of knowledge and skills in Health-related scientific areas (2016/04/24 - 2016/04/24)
Outro (Membro da Comissão Científica)
Universidade do Minho, Portugal

Colégio Dom Diogo de Sousa, Portugal
2016 - 2016 "Summer in the Campus 2016": Science Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2016/07/25 - 2016/07/29) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2015 - 2015 "Best students at UMinho 2015": Scientific Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2015/03/23 - 2015/03/26) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2015 - 2015 "ECS / ICVS open day for Msc and PhD 2015": Scientific seminars and site-visits (2015/03/25 - 2015/03/25)
Seminário (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2015 - 2015 "Science Outbreak Week 2015": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2015/04/13 - 2015/04/18) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2015 - 2015 "Summer in the Campus 2015": Science Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2015/07/27 - 2015/07/31) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2015 - 2015 "Science and Technology Week 2015": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2015/11/26 - 2015/11/30) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2014 - 2014 "Best students at UMinho 2014": Scientific Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2014/04/16 - 2014/04/18)
Outro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2014 - 2014 "Science Outbreak Week 2014": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2014/04/28 - 2014/05/02) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2014 - 2014 "Science and Technology Week 2014": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2014/11/22 - 2014/11/27) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2013 - 2013 "Science Outbreak Week 2013": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2013/04/08 - 2013/04/13)
Outro (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2013 - 2013 "Science and Technology Week 2013": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2013/11/18 - 2013/11/23)
Outro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2012 - 2012 "Science Outbreak Week 2012": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2012/03/19 - 2012/03/23)
Outro (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2012 - 2012 "Summer in the Campus 2012": Science Outreach Hands-on Activities for Pre-University Students (2012/07/23 - 2012/07/27)
Outro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2012 - 2012 "Science and Technology Week 2012": Scientific Outreach Hands-on Activities and Seminars for the Community (2012/11/19 - 2012/11/24) Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2002 - 2002 “IV Jornadas de Biologia Aplicada” - Scientific conference organized by students (2002/11/11 - 2002/11/11)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação
Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2023/05/18 Systems-level modelling of the cancer and immune metabolome to improve immunotherapeutic outcomes
Arguente
Sara Manso de Sousa Cardoso (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2023/01/18 Novel phenotypic features of the malaria parasite through time-domain Nuclear Magnetic Resonance
Arguente
Ruth Victoria Esho (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2022/11/14 Understanding the impact of Mycobacterium tuberculosis complex diversity in tuberculosis
Arguente principal
Ana Raquel Maceiras de Oliveira (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2022/06/21 Translational Applications in Emerging Viruses: Understanding the Disease Mechanisms to Improve Diagnosis and Treatment
Arguente principal
Ana Cristina Freitas Magalhães (Doutoramento)
Universidade do Porto, Portugal
2022/02/24 Characterization of the choroid plexus cells transcriptome during development
Arguente principal
Miguel Monteiro Pacheco (Mestrado)
2021/11/23 A Docker-oriented Pipeline for the analysis of Protein-Protein Interactions
Arguente principal
Paula Sofia Vilares Gouveia (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2021/10/27 HIV-1 infection among pregnant women in Angola: Molecular epidemiology and test of novel AZT triazole derivatives
Arguente principal
Cruz dos Santos Sebastião (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Médicas, Portugal
2020/12/15 The genes from the pseudoautosomal region 1 (PAR1) of the mammalian sex chromosomes: synteny, phylogeny and selection
Arguente principal
Carla Sofia Ribeiro dos Santos (Mestrado)
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
2020/11/05 Desenvolvimento de um algoritmo baseado em Deep Learning para prever casos de pneumonia a partir de radiografias torácicas
Orientador
NUNO RAFAEL BOTO CARLOS (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2020/09/24 DECODING TUBERCULOSIS TRANSMISSION AND DRUG RESISTANCE IN VALENCIA REGION USING WHOLE GENOME SEQUENCING
Vogal
IRVING NORBERTO CANCINO MUÑOZ (Doutoramento)
Universitat de València, Espanha
2020/06/01 Bioinformatics Applications for Optimizing Downstream Analyses in Evolutionary Genomics
Arguente principal
Emanuel Filipe Escaleira Maldonado (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2020/01/28 Understanding host-pathogen interactions in tuberculosis: lessons from Mycobacterium africanum
Arguente principal
Baltazar Cá (Doutoramento)
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
2019/12/04 Predict immune responses to neoantigens using Machine Learning
Arguente principal
Ana Carolina Dias Silva (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2019/07/25 Connecting the dots through RNA-seq: a transcriptomics approach to the immune response in tuberculosis
Arguente principal
Ana Luísa Simões Costa (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019 Deciphering the microbiome and metabolic factors contributing to protection against ulcerative colitis
Vogal
Joana Filipa Madureira Gaifem (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2016 Descoberta de novos genes e vias envolvidas no desenvolvimento de cancro
Arguente principal
Adrien Fernandes Machado (Mestrado)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2021 - Atual Genes MDPI
2021 - Atual Frontiers in Microbiology (1664-302X) Frontiers
2021 - Atual Frontiers in Genetics (1664-8021) Frontiers
2021 - Atual Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (2235-2988) Frontiers
2017 - Atual Molecular Biology and Evolution (1537-1719) Oxford University Press
2017 - Atual Biomedical and Environmental Sciences (0895-3988) Elsevier

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria
Instituição / Organização Entidade financiadora
2021 - Atual Reviewer for the Graduate Women In Science (GWIS) Fellowship Program Graduate Women In Science (GWIS) Fellowship Program

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2014 - Atual Bioinformatics in Health Sciences Health Sciences (Doutoramento) Universidade do Minho, Portugal
2014 - Atual Bioinformatics in Health Sciences Health Sciences (Mestrado) Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2009 - Atual Introduction to Medicine Medicine (Mestrado integrado) Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2009 - Atual Molecules and Cells Medicine (Mestrado integrado) Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2019 - 2019 Speaker in the seminars / open classes - "Genetic diversity of the obligate human pathogens M. tuberculosis: and HIV-1: "The Tortoise and the Hare" Bioinformática e Aplicações às Ciências da Vida (Mestrado integrado) Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Escola de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017/06/12 - 2017/06/16 Immune Chronic Diseases Programa de Pós-graduação Ciência para o Desenvolvimento (Doutoramento) Universidade de Cabo Verde, Cabo Verde
2017/01/20 - 2017/01/20 Estratégias eficazes de ensino para turmas grandes Formação Pedagógica para o corpo docente da UTAD. https://www.utad.pt/wp-content/uploads/2017/02/Programa-Final.pdf (Outros) Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
2016 - 2016 Estratégias eficazes de ensino para turmas grandes Programa Inovação Pedagógica (Outros) Universidade do Porto, Portugal
2016 - 2016 Bioinformatics for Health Sciences (Doutoramento) Universidade de Coimbra Faculdade de Medicina, Portugal
2016 - 2016 Bioinformatics for Health Sciences Health Sciences (Outros) Universidad Autonoma de Santo Domingo, República Dominicana
2007 - 2009 Human Biology Safety and hygiene in the workplace (Licenciatura) Instituto Universitário da Maia, Portugal
2007 - 2009 Molecules and Cells (laboratory classes) Medicine (Mestrado integrado) Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
2006 - 2009 Molecular and Cellular Biology (laboratory classes) Enfermagem (Licenciatura) Universidade do Minho Escola Superior de Enfermagem, Portugal

Entrevista (jornal / revista)

Descrição da atividade Jornal / Forum
2021/11/30 Entrevista sobre HIV/SIDA Agência Lusa
2021/09/30 Entrevista sobre a malária Jornal I
2021/07/31 Entrevista sobre HIV/SIDA Jornal do Brasil
2020/06/03 Explaining the impact of SARS-CoV-2 evolution on the sensitivity of the RT-PCR-based CODIV-19 diagnostic methods. Correio do Minho, Regional Newspaper, Portugal

Entrevista / Programa (rádio / tv)

Programa Tema
2021/12/01 - Atual Entrevista sobre HIV/SIDA - Ciência UFSCar
2021/10/21 - Atual Entrevista TV, Porto Canal, "Mentes que Brilham" Combate à malária avança com contributo de bioinformática
2021/06/29 - Atual Entrevista TV sobre HIV/SIDA - EPTV1 rede Globo
2020/11/02 - Atual "Os dias do Futuro" , Antena 1, national radio, Portugal Interview in the follow-up of the publication on Nature Medicine explaining how the malaria parasite survives during the dry season. https://www.youtube.com/watch?v=MSfcrZSTovQ&ab_channel=EscoladeMedicinaUMinho
2018/05/07 - 2018/05/07 News, TSF, National Radio, Portugal Explaining the relevance of HIV-1 subtypes and the basis of the research project funded by Gilead.
2016/04/03 - 2016/04/03 "Bom dia Portugal", RTP Notícias, National TV, Portugal Dissemination of Science Outreach Activities, "Melhores Alunos". https://is.gd/XIoflN
2014/04/29 - 2014/04/29 "UM em Antena", RUM, Regional Radio, Portugal Dissemination of Science Outreach Activities "Science Outbreak Week"
2014/04/10 - 2014/04/10 News, TSF, National Radio, Portugal Dissemination of Science Outreach Activities "Melhores Alunos"
2014/01/09 - 2014/01/09 "Maratona da Saúde", RTP 1, National TV, Portugal Relevance of Research to Improve Health - http://youtu.be/adHu3aqSajE
2013/04/16 - 2013/04/16 "Ciência", LocalVisão TV, Web TV Dissemination of Science Outreach Activity, "Science Outbreak Week 2013" - http://videos.sapo.pt/bYKsoZOcGY2I0dZrlahF
2013/04/09 - 2013/04/09 "UM em antena", RUM, Regional Radio, Portugal Dissemination of Scientific Outreach Activities.
2013/04/08 - 2013/04/08 "Notícias", RUM, Regional Radio, Portugal Dissemination of Scientific Outreach Activities
2012/11/21 - 2012/11/21 "Portugal em Directo", RTP 1, National TV, Portugal Dissemination of Science Outreach Activities "Semana da Ciência e Tecnologia" - https://streamable.com/s/jzary
2012/11/21 - 2012/11/21 "Portugal em Direto", RTP 1, National TV, Portugal Dissemination of Science Outreach Activities "Verão no Campus". https://streamable.com/ccc3l
2012/07/27 - 2012/07/27 "UM em Antena", RUM, Regional Radio, Portugal. Dissemination of Science Outreach Activities "Science Outbreak Week".
2012/07/25 - 2012/07/25 "Jornal da Tarde", RTP 1, National TV, Portugal Dissemination of Science Outreach Activities, "Verão no Campus". https://is.gd/jm2TdW
2012/03/22 - 2012/03/22 "Tarde Informativa", RTP Informação, National TV, Portugal Dissemination of Science Outreach Activities: "Science Outbreak Week"

Outro júri / avaliação

Descrição da atividade Instituição / Organização
2023 - Atual Member of the Juri for the attribution of Research Grant for a candidate with Master in Health Sciences with the reference: ICVS_BI_2023_012(1) Universidade do Minho, Portugal
2022 - Atual Member of the Juri for the attribution of Research Grant for a candidate with Master in Health Sciences with the reference: ICVS_BI_2022_024(1) Universidade do Minho, Portugal
2013 - Atual Juri in the selection of candidates for management of science and technology "Vogal no Juri de Bolsas de Gestão de Ciência e Tecnologia (BGCT)" Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2009 - 2018 Juri for the selection of researchers for research projects (Vogal em Juri de selecção de bolsas de investigação par projectos financiados pela FCT) Universidade do Minho Instituto de Investigação em Ciências da Vida e Saúde, Portugal
2013 - 2017 Juri for the selection of students (with a previous degree) for the integrated Master in Medicine - "Concurso especial para acesso, por titulares do grau de licenciado, ao curso de medicina da Escola de Medicina da Universidade do Minho. DR n.º 25/2016, Série II " Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
Distinções

Prémio

2022 IACOBUS PAPERS IV
Xunta de Galicia, Espanha
2021 Best Paper Award
Portuguese Society for Immunology, Portugal
2017 Prémio Thomé Villar
Sociedade Portuguesa de Pneumologia, Portugal
2015 Prémio Robalo Cordeiro
Sociedade Portuguesa de Pneumologia, Portugal
2010 Young Investigator Award - "Prémio Jovem Investigador, Isabel Spencer-Martins" 2010
Sociedade Portuguesa de Microbiologia, Portugal
2003 Prize of Academic Merit
Universidade do Minho, Portugal

Outra distinção

2020 Support for Innovation and Development Projects for Teaching and Learning
Universidade do Minho, Portugal
2011 Best Poster - MicroBiotec`11
Sociedade Portuguesa de Biotecnologia, Portugal
2009 Posdoc Grant
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2009 Grant for a Technology Transfer Internship at University of Texas at Austin IC2 institute
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2008 Business Plan Development Grant
Instituto do Emprego e Formação Profissional, Portugal
2006 Best Business Ideia of the Year
2005 PhD Grant
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2003 Erasmus Grant
European Union, Bélgica