Paulo Jorge Ferreira de Matos Costa (1A1B-A2B9-8D44)

Curriculum Vitae

Paulo Jorge Ferreira de Matos Costa

Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Paulo Jorge Ferreira de Matos Costa

Nomes de citação

Costa, Paulo J.

Identificadores de autor

Ciência ID: 1A1B-A2B9-8D44
ORCID iD: 0000-0002-0492-6666
Google Scholar ID: fYNyPJwAAAAJ
Researcher Id: B-4623-2008
Scopus Author Id: 7201895725

Endereços de correio eletrónico

pjcosta@ciencias.ulisboa.pt (Profissional)

Websites

https://ccmi.rd.ciencias.ulisboa.pt/ (Profissional)
https://bioisi.pt/laboratories/36 (Profissional)

Domínios de atuação

Ciências Exatas - Química

Formação

	Grau	Classificação
2007/02/23 Concluído	Química (Doutoramento) Especialização em Especialidade: Química Inorgânica Universidade de Lisboa, Portugal "Estudos Teóricos da Reactividade de Compostos de Elementos de Transição" (TESE/DISSERTAÇÃO)	Louvor e distinção
2002 Concluído	Química (Licenciatura) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal "Theoretical Studies of the Electronic Structure of Organometallic Complexes " (TESE/DISSERTAÇÃO)	16 (0-20)

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2021/11 - 2024/12	Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação)	Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
	Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
2020/05/01 - 2021/10	Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação)	FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
	Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
2015/05/02 - 2020/04/30	Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2013/04/01 - 2015/03/30	Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação)	Universidade de Aveiro Unidade de Investigação de Química Orgânica Produtos Naturais e Agroalimentares, Portugal
	Universidade de Aveiro Unidade de Investigação de Química Orgânica Produtos Naturais e Agroalimentares, Portugal
2007/04/01 - 2013/03/31	Pós-doutorado (Investigação)	Universidade de Aveiro CICECO, Portugal
	Universidade de Aveiro CICECO, Portugal
2003 - 2003	Estagiário de Investigação (Investigação)	Université de Strasbourg, França
	Université de Strasbourg, França
2001/09/01 - 2002/06/30	Estagiário de Investigação (Investigação)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2002 - 2002	Estagiário de Investigação (Investigação)	Istituto di Chimica dei Composti OrganoMetallici, Itália
	Istituto di Chimica dei Composti OrganoMetallici, Itália

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2025/01 - Atual	Professor Auxiliar (Docente Universitário)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
	Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
2021/09/01 - 2024/12/30	Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
	Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2003/01/01 - 2007/02/01	PhD student (Grant)	Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
	Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2024/01 - Atual	TAMUK - TArgeting MUtated KRAS TAMUK Co-Investigador Responsável (Co-IR)	Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências Em curso

Projeto

	Designação	Financiadores
2024/10 - Atual	Expanding the “toolbox” of medicinal chemists: the role of halogen bonds in membrane permeability 2023.10475.CPCA.A2 Investigador responsável Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal	Em curso
2022 - 2024	Structure-based database screening to support decision-making for endocrine disruptor identification 2021.09731.CPCA Co-Investigador Responsável (Co-IR) Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2022 - 2023	Development of novel nucleotide and sugar diphosphate mimetics as potential antibacterial agents targeting the peptidoglycan biosynthetic pathway EXPL/MED-QUI/1017/2021 Investigador FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2018/06 - 2021/12	Uncovering blind spots in halogen bonding applications PTDC/QUI-QFI/28455/2017 LISBOA-01- 0145-FEDER-028455 Investigador responsável Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2018 - 2020/04	Deal with PAINS: strategies to spot membrane modulators PTDC/BIA-BFS/28419/2017 Investigador	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2018 - 2020/04	INSILNANOBIOSOL - In Silico nanobiosolutions: computational design of bioactive Metal complexes and polyoxometalates for medical applications PTDC/QUI-QFI/29236/2017 Investigador	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2015/05 - 2020/04	Halogen bonds in (bio)chemical systems: a theoretical approach for ‘real world’ applications IF/00069/2014/CP1216/CT0006 Investigador responsável Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2019/01/01 - 2019/12/31	Instituto de Biosistemas & Ciências Integrativas UID/Multi/04046/2019 Investigador Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal Universidade do Minho, Portugal Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2017 - 2019	Study of Metal-catalyzed C–H functionalization FCT/CHINA-BILATERAL Investigador
2014/01 - 2014/12	Phosphorylation-induced conformational switch of the amyloid precursor protein intracellular domain: a new approach using molecular dynamics simulations Provided by PTCRIS: 133845 133845 EXPL/QEQ-COM/0821/2013 Investigador responsável Universidade de Aveiro Unidade de Investigação de Química Orgânica Produtos Naturais e Agroalimentares, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2010/06 - 2013/12	Development of azacalix(hetero)arene transporters for mediated anionic flux across membranes: a novel approach for studying ionic passive diffusion 101022 Provided by PTCRIS: 101022 PTDC/QUI-QUI/101022/2008 Investigador	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2008/01 - 2011/12	Molecular design of novel aza-bridged calixarene receptors for medicinal chemistry: encapsulation of lanthanide ions and chiral resolution of drugs. Provided by PTCRIS: 68582 68582 PTDC/QUI/68582/2006 Investigador	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2009 - 2010	Self-assembled Redox and Photochemically Active Metallomacrocycles as Molecular Devices. Programa Luso-Britânico de Investigação Conjunta Investigador	Concluído
2007/01 - 2009/12	Modelling the reactivity of transition metal complexes Provided by PTCRIS: 58925 58925 POCI/QUI/58925/2004 Investigador Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2006 - 2007	Photochemical and photophysical properties of organometallic compounds involved in molecular devices Bilateral Program PESSOA Investigador	Concluído
2005 - 2006	Reaction mechanisms catalyzed by organometallic complexes with industrial relevance Acção nº A-3/05 Investigador	Concluído
2005 - 2006	Computational study of the hydrogen activation by transition metal complexes Program GRICES/CNR Investigador
2003 - 2004	Excited State Dynamics in Polymetallic Clusters GRICES/CNRS Investigador	Concluído
2002 - 2003	Acções Integradas Luso-Espanholas Acção E-16/01 Acção E-16/01 Investigador	Concluído

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Costa, Paulo J.; Bernardo Henriques. "Targeting acetylcholinesterase with halogenated ligands: finding halogen bonding hotspots". Trabalho apresentado em Meeting of Young Researchers in Structural Computational Biology, 2019. 10.3390/mol2net-05-06777 Rafael Nunes; Nuno M. Xavier; Paulo J. Costa. "In silico design of halogenated carbohydrate mimetics as potential halogen-bonding ligands". Trabalho apresentado em Young Researchers in Structural Computational Biology (EJIBCE2018), 2018. 10.3390/mol2net-04-06125 Rafael Nunes; Paulo J. Costa; Diogo Vila-Viçosa; Miguel Machuqueiro. "T4 Lysozyme/Halobenzene: A Test System for Modeling Biomolecular Halogen Bonds". Trabalho apresentado em Young Researchers in Structural Computational Biology (EJIBCE2017), 2017. 10.3390/mol2net-03-05075
Artigo em revista	Pais, João P.; Antoniuk, Olha; Pires, David; Delgado, Tiago; Fortuna, Andreia; Costa, Paulo J.; Anes, Elsa; Constantino, Luis. "Synthesis, Activity, Toxicity, and In Silico Studies of New Antimycobacterial N-Alkyl Nitrobenzamides". Pharmaceuticals 17 5 (2024): 608. https://doi.org/10.3390/ph17050608. Acesso aberto • Publicado • 10.3390/ph17050608 Franco Machado, João; Cordeiro, Sandra; Duarte, Joana N.; Costa, Paulo J.; Mendes, Paulo J.; Garcia, Maria Helena; Baptista, Pedro V.; Fernandes, Alexandra R.; Morais, Tânia S.. "Exploiting Co(III)-Cyclopentadienyl Complexes To Develop Anticancer Agents". Inorganic Chemistry 63 13 (2024): 5783-5804. http://dx.doi.org/10.1021/acs.inorgchem.3c03696. Publicado • 10.1021/acs.inorgchem.3c03696 Veiros, Luis F.; Costa, Paulo J.; Martins, Frederico F.; Pi, Chao; Cui, Xiuling; Calhorda, Maria José. "The Challenging Reaction of Cyclopropenones with Benzamide Catalyzed by Rh(III): A Computational Study". Organometallics 43 6 (2024): 653-664. http://dx.doi.org/10.1021/acs.organomet.3c00499. Publicado • 10.1021/acs.organomet.3c00499 Fortuna, Andreia; Suzano, Pedro M. S.; Machuqueiro, Miguel; Costa, Paulo J.. "Influence of Iodine Merz–Singh–Kollman Radius on the Calculated Charges and Hydration Free Energies of Iodinated Molecules". Journal of Computational Biophysics and Chemistry (2024): 1-11. http://dx.doi.org/10.1142/s2737416523500722. No prelo • 10.1142/s2737416523500722 Teixeira, Ricardo G.; Stefanelli, Alessia; Pilon, Adhan; Warmers, Rebecca; Fontrodona, Xavier; Romero, Isabel; Costa, Paulo J.; et al. "Paraptotic Cell Death as an Unprecedented Mode of Action Observed for New Bipyridine-Silver(I) Compounds Bearing Phosphane Coligands". Journal of Medicinal Chemistry (2024): http://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.3c01036. No prelo • 10.1021/acs.jmedchem.3c01036 Fortuna, Andreia; Costa, Paulo J.. "Assessment of Halogen Off-Center Point-Charge Models Using Explicit Solvent Simulations". Journal of Chemical Information and Modeling 63 23 (2023): 7464-7475. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.3c01561. Publicado • 10.1021/acs.jcim.3c01561 Šivickyte, Ona; Costa, Paulo J.. "Intrinsic bond strength index as a halogen bond interaction energy predictor". Physical Chemistry Chemical Physics 25 26 (2023): 17535-17546. http://dx.doi.org/10.1039/d2cp04786a. Publicado • 10.1039/d2cp04786a Realista, Sara; Costa, Paulo J.; Maia, Luisa B.; Calhorda, Maria José; Martinho, Paulo N.. "Mechanistic insights into the electrochemical reduction of CO₂ to CO on Ni(salphen) complexes". Inorganic Chemistry Frontiers 10 14 (2023): 4175-4189. http://dx.doi.org/10.1039/d3qi00424d. Publicado • 10.1039/d3qi00424d Costa, Paulo J.; Martins, Frederico F.; Pi, Chao; Cui, Xiuling; Calhorda, Maria José. "C–H functionalization of quinoline N-oxides catalyzed by Pd(ii) complexes: a computational study". Physical Chemistry Chemical Physics 25 34 (2023): 22755-22767. http://dx.doi.org/10.1039/d3cp02445h. Publicado • 10.1039/d3cp02445h Gomes, André M.M.; Costa, Paulo J.; Machuqueiro, Miguel. "Recent advances on molecular dynamics-based techniques to address drug membrane permeability with atomistic detail". BBA Advances 4 (2023): 100099. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbadva.2023.100099. Publicado • 10.1016/j.bbadva.2023.100099 Fortuna, Andreia; Gonçalves-Pereira, Rita; Costa, Paulo J.; Jorda, Radek; Vojácková, Veronika; Gonzalez, Gabriel; Heise, Niels V.; et al. "Synthesis and Exploitation of the Biological Profile of Novel Guanidino Xylofuranose Derivatives". ChemMedChem 17 14 (2022): e202200180. http://dx.doi.org/10.1002/cmdc.202200180. Publicado • 10.1002/cmdc.202200180 Máximo, Patrícia; Colaço, Miriam; Pauleta, Sofia R.; Costa, Paulo J.; Pischel, Uwe; Parola, A. Jorge; Basílio, Nuno. "Photomodulation of ultrastable host–guest complexes in water and their application in light-controlled steroid release". Organic Chemistry Frontiers 9 (2022): 4238-4249. http://dx.doi.org/10.1039/d2qo00423b. Publicado • 10.1039/d2qo00423b Fortuna, Andreia; Costa, Paulo J.. "Optimized Halogen Atomic Radii for PBSA Calculations Using Off-Center Point Charges". Journal of Chemical Information and Modeling 61 7 (2021): 3361-3375. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00177. 10.1021/acs.jcim.1c00177 Santos, Filipa C.; Costa, Paulo J.; Garcia, M. Helena; Morais, Tânia S.. "Binding of RuCp complexes with human apo-transferrin: fluorescence spectroscopy and molecular docking methods". BioMetals 34 5 (2021): 1029-1042. http://dx.doi.org/10.1007/s10534-021-00325-w. 10.1007/s10534-021-00325-w Nunes, Rafael Santana; Vila-Viçosa, Diogo; Costa, Paulo J.. "Halogen Bonding: An Underestimated Player in Membrane–Ligand Interactions". Journal of the American Chemical Society 143 11 (2021): 4253-4267. http://dx.doi.org/10.1021/jacs.0c12470. 10.1021/jacs.0c12470 Brown, Ryan K.; Hooper, Thomas N.; Rekhroukh, Feriel; White, Andrew J. P.; Costa, Paulo J.; Crimmin, Mark R.. "Alumination of aryl methyl ethers: switching between sp2 and sp3 C–O bond functionalisation with Pd-catalysis". Chemical Communications 57 88 (2021): 11673-11676. http://dx.doi.org/10.1039/d1cc05408b. 10.1039/d1cc05408b Andreia Fortuna; Paulo J. Costa; M. Fátima M. Piedade; M. Conceição Oliveira; Nuno M. Xavier. "Synthesis of Triazole-Containing Furanosyl Nucleoside Analogues and Their Phosphate, Phosphoramidate or Phoshonate Derivatives as Potential Sugar Diphosphate or Nucleotide Mimetics". ChemPlusChem 85 8 (2020): 1676-1691. https://doi.org/10.1002/cplu.202000424. 10.1002/cplu.202000424 Pilon, Adhan; Brás, Ana Rita; Côrte-Real, Leonor; Avecilla, Fernando; Costa, Paulo J.; Preto, Ana; Garcia, M. Helena; Valente, Andreia. "A New Family of Iron(II)-Cyclopentadienyl Compounds Shows Strong Activity against Colorectal and Triple Negative Breast Cancer Cells". Molecules 25 7 (2020): 1592. http://dx.doi.org/10.3390/molecules25071592. Acesso aberto • 10.3390/molecules25071592 Thomas N. Hooper; Ryan K. Brown; Feriel Rekhroukh; Martí Garçon; Andrew J. P. White; Paulo J. Costa; Mark R. Crimmin; et al. "Catalyst control of selectivity in the C–O bond alumination of biomass derived furans". Chemical Science 11 30 (2020): 7850-7857. https://doi.org/10.1039/D0SC01918F. 10.1039/D0SC01918F Nunes, Rafael; Vila-Viçosa, Diogo; Costa, Paulo J.. "Tackling Halogenated Species with PBSA: Effect of Emulating the s-Hole". Journal of Chemical Theory and Computation 15 7 (2019): 4241-4251. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.9b00106. 10.1021/acs.jctc.9b00106 Costa, Paulo J.; Nunes, Rafael; Vila-Viçosa, Diogo. "Halogen bonding in halocarbon-protein complexes and computational tools for rational drug design". Expert Opinion on Drug Discovery 14 8 (2019): 805-820. http://dx.doi.org/10.1080/17460441.2019.1619692. 10.1080/17460441.2019.1619692 Ana I. Vicente; Xinwey Wu; Yannick Ortin; Liliana P. Ferreira; Maria de Deus Carvalho; Sara Realista; Andrew Barker; et al. "Directing self-assembly in solution towards improved cooperativity in Fe(iii) complexes with amphiphilic tridentate ligands". Dalton Transactions 48 13 (2019): 4239-4247. https://doi.org/10.1039/C9DT00032A. 10.1039/C9DT00032A Nunes, Rafael; Vila-Viçosa, Diogo; Machuqueiro, Miguel; Costa, Paulo J.. "Biomolecular Simulations of Halogen Bonds with a GROMOS Force Field". Journal of Chemical Theory and Computation 14 10 (2018): 5383-5392. http://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.8b00278. 10.1021/acs.jctc.8b00278 Hartl, František; Bakker, Maarten J.; Santos, Vanessa F.; Costa, Paulo J.; Calhorda, Maria José. "Accurate Description of Low-Lying Excited States in a Series of Photoreactive Clusters [Os3(CO)10(a-diimine)] by DFT Calculations". Inorganic Chemistry 57 18 (2018): 11704-11716. http://dx.doi.org/10.1021/acs.inorgchem.8b01847. 10.1021/acs.inorgchem.8b01847 Gonçalves-Pereira, Rita; Pereira, Margarida P.; Serra, Sofia G.; Loesche, Anne; Csuk, René; Silvestre, Samuel; Costa, Paulo J.; Oliveira, M. Conceição; Xavier, Nuno M.. "Furanosyl Nucleoside Analogues Embodying Triazole or Theobromine Units as Potential Lead Molecules for Alzheimer's Disease". European Journal of Organic Chemistry 2018 20-21 (2018): 2667-2681. http://dx.doi.org/10.1002/ejoc.201800245. 10.1002/ejoc.201800245 Cabrita, Ivânia R.; Florindo, Pedro R.; Costa, Paulo J.; Oliveira, M. Conceição; Fernandes, Ana C.. "Hydrophosphonylation of aldehydes catalyzed by cyclopentadienyl ruthenium(II) complexes". Molecular Catalysis 450 (2018): 77-86. http://dx.doi.org/10.1016/j.mcat.2018.03.001. 10.1016/j.mcat.2018.03.001 Costa, Paulo J.. "The halogen bond: Nature and applications". Physical Sciences Reviews 2 11 (2017): 20170136. http://dx.doi.org/10.1515/psr-2017-0136. 10.1515/psr-2017-0136 Calhorda, Maria José; Costa, Paulo J.. "Structure, bonding and reactivity of seven-coordinate allylic Mo(II) and W(II) complexes". Coordination Chemistry Reviews 344 (2017): 83-100. http://dx.doi.org/10.1016/j.ccr.2016.12.010. 10.1016/j.ccr.2016.12.010 Pedro R. Florindo; Paulo J. Costa; M. F. M. Piedade; M. Paula Robalo. "pH-Switchability and Second-Order Nonlinear Optical Properties of Monocyclopentadienylruthenium(II)/iron(II) Tetrazoles/Tetrazolates: Synthesis, Characterization, and Time-Dependent Density Functional Theory Calculations". Inorganic Chemistry 56 12 (2017): 6849-6863. https://doi.org/10.1021%2Facs.inorgchem.7b00138. 10.1021/acs.inorgchem.7b00138 Lopes, João; Alves, David; Morais, Tânia S.; Costa, Paulo J.; Piedade, M. Fátima M.; Marques, Fernanda; Villa de Brito, Maria J.; Helena Garcia, M.. "New copper(I) and heteronuclear copper(I)–ruthenium(II) complexes: Synthesis, structural characterization and cytotoxicity". Journal of Inorganic Biochemistry 169 (2017): 68-78. http://dx.doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2017.01.007. 10.1016/j.jinorgbio.2017.01.007 Nunes, Rafael; Costa, Paulo J.. "Ion-Pair Halogen Bonds in 2-Halo-Functionalized Imidazolium Chloride Receptors: Substituent and Solvent Effects". Chemistry - An Asian Journal 12 5 (2017): 586-594. http://dx.doi.org/10.1002/asia.201601690. Publicado • 10.1002/asia.201601690 Batista, Daniela; Schwarz, Stefan; Loesche, Anne; Csuk, René; Costa, Paulo J.; Oliveira, M. Conceição; Xavier, Nuno M.. "Synthesis of glucopyranos-6'-yl purine and pyrimidine isonucleosides as potential cholinesterase inhibitors. Access to pyrimidine-linked pseudodisaccharides through Mitsunobu reaction". Pure and Applied Chemistry 88 4 (2016): 363-379. http://dx.doi.org/10.1515/pac-2016-0102. Publicado • 10.1515/pac-2016-0102 Pedro R. Florindo; Diane M. Pereira; Pedro M. Borralho; Paulo J. Costa; M. F. M. Piedade; Cecília M. P. Rodrigues; Ana C. Fernandes. "New [(¿5-C5H5)Ru(N–N)(PPh3)][PF6] compounds: colon anticancer activity and GLUT-mediated cellular uptake of carbohydrate-appended complexes". Dalton Trans. 45 30 (2016): 11926-11930. https://doi.org/10.1039%2Fc6dt01571a. 10.1039/c6dt01571a Ahmed Zubi; Ashley Wragg; Simon Turega; Harry Adams; Paulo J. Costa; Vítor Félix; Jim A. Thomas. "Correction: Modulating the electron-transfer properties of a mixed-valence system through host–guest chemistry". Chemical Science 6 7 (2015): 4373-4374. https://doi.org/10.1039%2Fc5sc90026c. 10.1039/c5sc90026c Ahmed Zubi; Ashley Wragg; Simon Turega; Harry Adams; Paulo J. Costa; Vítor Félix; Jim A. Thomas. "Modulating the electron-transfer properties of a mixed-valence system through host–guest chemistry". Chemical Science 6 2 (2015): 1334-1340. https://doi.org/10.1039%2Fc4sc02799j. 10.1039/c4sc02799j Baratta, Walter; Baldino, Salvatore; Calhorda, Maria José; Costa, Paulo J.; Esposito, Gennaro; Herdtweck, Eberhardt; Magnolia, Santo; et al. "CNN Pincer Ruthenium Catalysts for Hydrogenation and Transfer Hydrogenation of Ketones: Experimental and Computational Studies". Chemistry – A European Journal 20 42 (2014): 13603-13617. http://dx.doi.org/10.1002/chem.201402229. 10.1002/chem.201402229 Costa, Paulo J.; Marques, Igor; Félix, Vítor. "Interaction of a calix[4]arene derivative with a DOPC bilayer: Biomolecular simulations towards chloride transport". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes 1838 3 (2014): 890-901. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2013.11.021. 10.1016/j.bbamem.2013.11.021 Marques, Igor; Colaço, Ana R.; Costa, Paulo J.; Busschaert, Nathalie; Gale, Philip A.; Félix, Vítor. 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Capítulo de livro	Costa, Paulo J.. "Transmembrane Anion Transport Mediated by Halogen Bonds: Using Off-Center Charges". In Computational Design of Membrane Proteins, 273-284. Springer US, 2021. 10.1007/978-1-0716-1468-6_16 Costa, Paulo J.. "3. The Halogen bond: Nature and Applications". In Chemical Synergies, 81-106. Alemanha: De Gruyter, 2018. 10.1515/9783110482065-003 Costa, Paulo J.; Nunes, Rafael. "Advances in the Computational Modeling of Halogen Bonds in Biochemical Systems". In Frontiers in Computational Chemistry: Volume 4, 144-183. BENTHAM SCIENCE PUBLISHERS, 2018. Publicado • 10.2174/9781681084411118040006 Calhorda, M.J.; Costa, P.J.. "Weak Hydrogen Bonding". In Comprehensive Inorganic Chemistry II, 341-357. Oxford, Reino Unido: Elsevier, 2013. Publicado • 10.1016/B978-0-08-097774-4.00912-8
Edição de número de revista	Costa, Paulo J.. "Special Issue "Halogen Bonding: Insights from Computational Tools"". Molecules (2020): https://www.mdpi.com/journal/molecules/special_issues/halogen_bonding. Publicado • Editor
Pré-impressão	Fortuna, Andreia; Costa, Paulo J.. Autor correspondente: Costa, Paulo J.. "Impact of the halogen PB radii in the estimation of protein-ligand binding energies using MM-PBSA calculations". 2024. https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2024-l32nf. 10.26434/chemrxiv-2024-l32nf
Resumo em conferência	Paulo J. Costa; D. Vila-Vicosa; Rafael Nunes. "Tackling halogenated species in biomolecular systems with force field methods: MD sampling and PBSA solvation energies". Trabalho apresentado em JOINT 12th EBSA congress and 10th ICBP – IUPAP congress, Madrid, 2019. Publicado • https://doi.org/10.1007/s00249-019-01373-4 Rafael Nunes; Diogo Vila-Viçosa; Miguel Machuqueiro; Paulo J. Costa. "Improved modeling of halogen-protein interactions in biomolecular simulations using a GROMOS force field". Trabalho apresentado em JOINT 12th EBSA congress 10th ICBP – IUPAP congress, Madrid, 2019. Publicado Costa, Paulo J.. "Folding of cyclic peptides stabilized by halogen bonds". Trabalho apresentado em JOINT 12th EBSA congress 10th ICBP – IUPAP congress, Madrid, 2019. Publicado
Tese / Dissertação	Costa, Paulo J.. "Estudos Teóricos da Reactividade de Compostos de Elementos de Transição". Doutoramento, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2007. Costa, Paulo J.. "Theoretical Studies of the Electronic Structure of Organometallic Complexes". Licenciatura, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2002.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2024/10/20	How Halogen Anisotropy Modulates the Membrane Permeability of Halogenated Drugs	International Symposium on Halogen Bonding (ISXB6) ISXB6 (Dubrovnik, Croácia)
2024/07/17	Halogen bonds: A journey using "simple" force field methods	3rd International Conference on Noncovalent Interactions ICNI (Belgrade, Sérvia)
2024/01/19	Tackling halogen bonds with “simple” force field methods: are we there yet?	Universität Duisburg-Essen Theorie-Kolloquium WS 2023/24 Universität Duisburg-Essen (Duisburg, Alemanha)
2023/01/26	Studying molecular recognition phenomena using computational tools: the case of halogenated drugs	First Meeting of the European Network for diagnosis and treatment of antibiotic-resistant bacterial infections (EURESTOP) (Lisbon, Portugal)
2020/11/02	Can membrane-drug interactions be mediated by halogen bonds?	4th International Symposium on Halogen Bonding (ISXB-4) Stellenbosch University (Stellenbosch, África do Sul)
2019/11/15	Phosphonate - Phosphite Tautomerization: a Key Step in the Hydrophosphonylation of Aldehydes Catalyzed by Ruthenium(II) Complexes	4th International Symposium on Frontiers of Organic Synthesis Wang Yanxing International Conference Center, Huaqiao University (Xiamen, China)
2019/09/02	Molecular Dynamics simulations of halogen bond-mediated biomolecular recognition events	1st International Conference on Noncovalent Interactions (ICNI-2019) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências (Lisbon, Portugal)
2019/09/02	Tackling halogen bonds with computational methods: from anion binding affinity to solvation free energies	1st International Conference on Noncovalent Interactions (ICNI-2019) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências (Lisbon, Portugal)
2018/07	In silico design of halogenated carbohydrate mimetics as potential halogen-bonding ligands	ICS Iberian Day – satellite event of the 29th International Carbohydrate Symposium (ICS 2018) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências (Lisbon, Portugal)
2018/06	Halogen Bonds in (Bio)molecular Systems: A Deeper Look into Force Field Methods	3rd International Symposium on Halogen Bonding (ISXB-3) Clemson University (Greenville, South Carolina, Estados Unidos)
2017/12	T4 Lysozyme/Halobenzene: A Test System for Modeling Biomolecular Halogen Bonds	5º Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural (EJIBCE 2017) Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2017/11	Challenges in the computational modelling of halogen bonds	2nd International Symposium on Frontiers of Organic Synthesis Wang Yanxing International Conference Center, Huaqiao University (Xiamen, China)
2017/11	Challenges in the computational modelling of halogen bonds	Zhengzou University Seminars Zhengzou University (Zhengzou, China)
2017/07	Modeling Halogen Bonds: Relevance in (Bio)Chemical Systems	XXV edição do Encontro Nacional da SPQ (XXV-EN) Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia (Lisbon, Portugal)
2016/03	Homogeneous Electroreduction of CO2 with Ni(II) Schiff-Base Complexes: Insights From DFT Calculations	4th CARISMA Meeting – Catalytic Routines for Small Molecule Activation (Ljubljana, Eslovénia)
2014/12	From ‘simple’ anion recognition phenomena to ‘complex’ biological systems	EJIBCE 2014 - Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural Faculdade de Ciências Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal)
2012/04	Exploring halogen bonds: from "simple" supramolecular chemistry applications to biological systems	X Jornadas CICECO / IX CICECO Meeting Aveiro University (Aveiro, Portugal)
2007/12	DFT mechanistic studies on the catalytic activity of MoO2Cl2: the story of an oxidant performing reductions!	7th Inorganic Chemistry Conference (Fátima, Portugal)
2005/09	DFT study of Olefin-Type Bonding on Ruthenium Complexes	COST D24 Project Number: D24/0014/02 Working Group Meeting (Budapest, Hungria)
2005/04	TD-DFT study of Au(I) and mixed Au(I)-Au(III) polynuclear complexes	COST D14/0001/99 Working Group Workshop - Functional Transition Metal Complexes: Theory and Experiment (Presqu'ile de Giens 'La Badine', França)
2005/01	Luminescense of Au(I) and mixed Au(I)-Au(III) complexes: a TD-DFT study	Meeting of the COST Working Group D29/0012/24 (Lisbon, Portugal)
2004/07	Ni-Fe hydrogenase: a DFT study of the activation step	Meeting of the COST Working Group D24/0014/02 (Munich, Alemanha)
2004/04	Theoretical study of photochemical reactivity of MeReO3	Meeting of the COST Working Group D14/0001/99 (Stuttgart, Alemanha)
2003/01	Can theoretical studies help to elucidate the [NiFe] Hydrogenases enzymatic mechanism?	ITQB Lunch Time Seminar Institute of Chemical and Biological Technology (ITQB) (Oeiras, Portugal)
2002/06	The H...H interaction in the crystal structure of HMn(CO)5	Meeting of the COST Working Group D14/0001/99 Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências (Lisbon, Portugal)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2024/09/01 - Atual	An in silico protocol to evaluate and optimize cyclodextrins for drug delivery Coorientador	MSc in Chemistry (Mestrado) Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
2023 - Atual	Tunning the balance between the affinity and selectivity in DNA-G4-targeting molecules using a multidisciplinary approach Coorientador de Bárbara Bahls Bruni	PhD in Pharmacy - Pharmaceutical and Therapeutic Chemistry (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2021/02 - Atual	Towards a framework to unify in silico methods to support decision-making for chemical risk assessments: application in endocrine disruptors Coorientador de Bruno Emanuel de Sá Calçada	PhD in Computational Biochemistry (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - Atual	Charge-assisted halogen bonds: new computational methodologies towards applications in drug-design Orientador de Rafael de Santana Nunes	PhD in Chemistry (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020/03/01 - 2024/11	Tackling solvation and permeability using computational methods: the role of noncovalent interactions Orientador de Andreia Jesus Lopes Fortuna	PhD in Chemistry (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2022/09/01 - 2024/01/29	What drives the membrane permeability of drugs? A study on untackled effects Orientador de André Miguel Miranda Gomes	Master in Medicinal and Biopharmaceutical Chemistry (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2021/09 - 2024/01	Improved drug discovery: towards an energy-based criterion to characterize ligand interactions with biomolecular targets Orientador de Tiago Gonçalves Dias	Master Programme in Biochemistry and Biomedicine (Mestrado) Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
2020/09 - 2022/01/06	New perspectives for halogen bonding: insights from computational tools Orientador de Ona Sivickyte	MSc in Chemistry (Mestrado) Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
2019/09 - 2021/01	Targeting proteins with halogenated drugs: new strategies to probe halogen-bonding hotspots Orientador de Bernardo Miguel Vagarinho Henriques	MSc in Chemistry (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/12 - 2020/02/29	blindspotsXBapps - Uncovering blind spots in halogen bonding applications Orientador de Andreia Jesus Lopes Fortuna	BIM student under the project PTDC/QUI-QFI/28455/2017) (Outra) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/05 - 2020/01	A Catalytic Method to Form Carbon-Carbon Bonds by Coupling of Two Carbon-Fluorine Bonds Orientador de Dr. Feriel Rekhroukh	Secondment of a Marie-Curie Post-doc Fellow from Imperial College London (Outra) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - 2020	blindspotsXBapps - Uncovering blind spots in halogen bonding applications Orientador de Diogo Vila-Viçosa	Post-Doc researcher under the project PTDC/QUI-QFI/28455/2017 (Outra) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - 2020	Xbonds4biochem - Halogen bonds in (bio)chemical systems: a theoretical approach for ‘real world’ applications Orientador de Ona ¿Sivickyte	Bachelor student under the project IF/00069/2014 (Outra)
2018 - 2018	Xbonds4biochem - Halogen bonds in (bio)chemical systems: a theoretical approach for ‘real world’ applications Orientador de Diogo Vila-Viçosa	Post-Doc researcher under the project IF/00069/2014 (Outra) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - 2018	Síntese e design racional de guanidine açúcares como novos potenciais inibidores de cinases com interesse terapêutico Coorientador de Andreia Jesus Lopes Fortuna	MSc in Chemisty (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - 2018	Modeling C-Br...pi interactions in halogenated sugar mimetics Orientador de Ona ¿Sivickyte	BSc in Chemistry (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - 2017	Previsão das propriedades espectroscópicas de clusters de Os Orientador de Vanessa Farelo dos Santos	Exchange with Universidade Federal do Rio de Janeiro (Iniciação científica) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - 2017	Metal to pi-ligand migration: Computational studies of C-C coupling reactions Orientador de Alexandra Miskizak	Bilateral FCUL - Université Pierre et Marie Curie (Paris VI) (UPMC) (Iniciação científica) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016 - 2017	Xbonds4biochem - Halogen bonds in (bio)chemical systems: a theoretical approach for ‘real world’ applications Orientador de Rafael de Santana Nunes	BIM student under the project IF/00069/2014 (Outra) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016 - 2016	Interacções proteína:ligando via ligações de halogéneo: uma nova abordagem com vista a aplicações em design de fármacos Coorientador de Ricardo João de Melo Rosa	BSc (“Licenciatura”) final project (Licenciatura/Bacharelato) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2016 - 2016	Diretos ao alvo: Virtual Screening de potenciais fármacos usando uma biblioteca de compostos com interesse terapêutico Orientador de Carla Filipa Duarte Antunes	BSc (“Licenciatura”) final project (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2014 - 2014	Phosphorylationinduced conformational switch of the amyloid precursor protein intracellular domain: a new approach using molecular dynamics simulations Orientador de João Ramiro Alavedra Mendes Robalo	BIM student under the project EXPL/QEQ-COM/0821/2013 (Outra) Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2014	Phosphorylationinduced conformational switch of the amyloid precursor protein intracellular domain: a new approach using molecular dynamics simulations Orientador de Cátia Sofia Ribeiro Sousa	BIM student under the project EXPL/QEQ-COM/0821/2013 (Outra) Universidade de Aveiro, Portugal
2014 - 2014	Phosphorylationinduced conformational switch of the amyloid precursor protein intracellular domain: a new approach using molecular dynamics simulations Orientador de Pedro Miguel Rocha Cardoso Nunes da Costa	BIM student under the project EXPL/QEQ-COM/0821/2013 (Outra) Universidade de Aveiro, Portugal
2010 - 2010	Desenvolvimento de protocolos de docking para complexos droga:DNA-quadruplexos Coorientador de Soraia Mascarenhas	Universidade de Aveiro, Portugal
2010 - 2010	Desenvolvimento de protocolos de docking para complexos droga:DNA-quadruplexos Coorientador de Vânia Filipa Martins Faustino	Universidade de Aveiro, Portugal
2009 - 2010	Estudo Computacional dos Mecanismos de Transporte de Aniões por Receptores Sintéticos Através de Membranas Coorientador de Sara Ferreira Carvalho	Bolsas de Integração na Investigação - BII (Outra) Universidade de Aveiro, Portugal
2009 - 2010	Estudo Computacional dos Mecanismos de Transporte de Aniões por Receptores Sintéticos Através de Membranas Coorientador de Manuela Ermelinda Lopes Lago	Bolsas de Integração na Investigação - BII” (Outra) Universidade de Aveiro, Portugal

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2024/12/20 - 2024/12/20	Member of the Organizing Committee of the 3D-BioInfo-PT 3rd Annual Meeting (2024/12/20 - 2024/12/20) Encontro (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/04/12 - 2024/04/12	Co-organizer of and member of the Organizing Committee of the 3D-BioInfo-PT Advanced Workshop, FCUL, Lisbon, April 12th, 2024 (2024/04/12 - 2024/04/12) Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/02/28 - 2024/02/28	Química Divertida: Demo of funny experiments for children, focusing on the concept of atoms and molecules, aiming at seeding the interest in science and highlighting that everything we see is made by chemical compounds. (2024/02/28 - 2024/02/28) Exposição	Escola EB1/JI de Casal dos Apréstimos, Portugal
2019/12/20 - 2020/12/20	Co-organizer of "Encontro de Jovens Investigadores de Biologia Computacional Estrutural" (EJIBCE) 2019 (http://ejibce.github.io/) (2019/12/20 - 2019/12/20) Simpósio (Coorganizador)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2006/02/21 - 2006/02/23	Local Organizing Committee of Stereocat 06 Annual Workshop – COST Chemistry Action D24, Sustainable Chemical Processes: Stereoselective Transition Metal-Catalyzed Reactions (2006/02/21 - 2006/02/23) Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2024/09/27 - 2024/09/27	Co-Promoter and Participant in the Activity “(Bio)chemical Laboratory in a computer” Exposição	Researcher’s Night – Noite Europeia dos Investigadores 2024 Museu Nacional de História Natural e da Ciência , Portugal
2024/05/08 - 2024/05/08	Co-Promotor of the Activity “From structure to function - 3D visualization of the molecules of life” Exposição	Dia Aberto FCUL Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023/09/29 - 2023/09/29	From structure to function - 3D visualization of the molecules of life Exposição	Researcher’s Night – Noite Europeia dos Investigadores 2023 Museu Nacional de História Natural e da Ciência , Portugal
2023/05/03 - 2023/05/03	From structure to function - 3D visualization of the molecules of life Exposição	FCUL Open Day Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2022/05/04 - 2022/05/04	From structure to function - 3D visualization of the molecules of life Exposição	Dia Aberto FCUL Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/10/27 - 2021/10/27	Computational Chemistry Festival	CIÊNCIAS Research Day, OPEN LABS Initiative Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016/04/27 - 2016/04/27	Simulação computacional em Química e Bioquímica Exposição	FCUL Open Day Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015/11/27 - 2015/11/27	Simulação Computacional em Química e Bioquímica Exposição	Semana da C&T Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015/09/25 - 2015/09/25	Simulação Computacional em Química e Bioquímica Exposição	Researcher’s Night – Noite Europeia dos Investigadores Museu Nacional de História Natural e da Ciência , Portugal
2013/04 - 2013/04	2nd Workshop on Lipidomics Oficina (workshop)	2nd Workshop on Lipidomics Universidade de Aveiro, Portugal
2012/05 - 2012/05	1st Workshop on Lipidomics Oficina (workshop)	1st Workshop on Lipidomics Universidade de Aveiro, Portugal
2010/09 - 2010/09	Short course "Lipid dynamics in bilayers and membranes: a primer” and "Why lipids are structured the way they are" lectured at the Faculty of Sciences, University of Lisbon by Prof. Thomas H. Haines of the Rockefeller University in New York, USA Outro	Short course "Lipid dynamics in bilayers and membranes: a primer” and "Why lipids are structured the way they are" Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2006/06 - 2006/06	Post-graduation Course “Transition Elements of Biological Importance – Survey II” lectured at the Faculty of Sciences, University of Lisbon by Prof. R. Keese, Professor Emeritus of the Department of Chemistry and Biochemistry, University of Bern Outro	Post-graduation Course “Transition Elements of Biological Importance – Survey II” Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2004/10 - 2004/11	Post-graduation Course “Biological Oxidants and Antioxidants: a Chemical Perspective”, lectured at the Faculty of Sciences, University of Lisbon by Prof. Keith U. Ingold, Fellow of the Royal Society (London) and Scientist of the National Research Council of Canada Outro	Post-graduation Course “Biological Oxidants and Antioxidants: a Chemical Perspective” Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2024/12/18	Tackling solvation and permeability using computational methods: the role of noncovalent interactions Orientador	Andreia Jesus Lopes Fortuna (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/09/18	Computational modeling of the HIV-1 integrase enzyme Arguente principal	Inês dos Santos André (Mestrado) Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2024/05/24	Targeting cancer with ruthenium compounds Arguente	Ricardo Jorge Gonçalves Teixeira (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/01/29	What drives the membrane permeability of drugs? A study on untackled effects Orientador	André Miguel Miranda Gomes (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2024/01/29	Improved drug discovery: towards an energy-based criterion to characterize ligand interactions with biomolecular targets Orientador	Tiago Gonçalves Dias (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2024/01/22	Characterization of protein-protein interactions involving G protein-coupled receptor 143 by computational and pharmacological methods Arguente	Beatriz Theresa Ruth Büschbell (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2023/08/21	A Deep Learning Approach for Protein-Ligand Binding Motifs Prediction using Sequence Derived Information Arguente principal	Ana Catarina Almeida Carregado e Martins Marques Pereira (Mestrado) Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2023/07/25	Rational Development of New Biocatalysts for the Production of Parkinson Disease Drugs Arguente principal	Juliana Ferreira Rocha (Doutoramento) Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
2022/12/22	Complexos de Ruténio(II) como plataforma para o desenvolvimento de PROTACs multivalentes Arguente principal	Filipe André Jesus Silva (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2022/01/06	New perspectives for halogen bonding: insights from computational tools Orientador	Ona Sivickyte (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021/03/04	Development of metal-linked proteolysis targeting chimeras Arguente principal	Beatriz Marto Vieira (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2021/02/26	Decoding partner specificity in opioid receptor family Arguente principal	Daniel José Vasconcelos Silvério (Mestrado) Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
2021/01/15	Targeting proteins with halogenated drugs: new strategies to probe halogen-bonding hotspots Orientador	Bernardo Miguel Vagarinho Henriques (Mestrado) Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
2014/11/21	Cyclodextrins as anti-asthmatic drug carriers: an in silico study Arguente principal	Bruno Emanuel de Sá Calçada (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2013/12/19	Transmembrane transport of chloride by squaramides: an in silico study Arguente principal	Ana Rita Freitas Colaço (Mestrado) Universidade de Aveiro, Portugal
2013/12/13	Theoretical investigation of the energy of olefin-and sila -olefin insertion/ß-H elimination reactions of two late transition metals - DFT MO calculations Arguente principal	Rita Leonor Veiga da Silva e Veiga Ferro (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Comissão de avaliação

	Descrição da atividade Tipo de assessoria	Instituição / Organização	Entidade financiadora
2024 - 2024	Evaluator for ESPRIT Programme (Early-Stage Programme: Research, Innovation, Training) Avaliador	Fonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung, Áustria	Fonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
2021 - 2021	Evaluator of the "BBSRC Discovery Fellowship 2021" Avaliador	Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), Reino Unido	Biotechnology and Biological Sciences Research Council
2018 - 2018	Evaluator of “Proyectos de Investigación Científica y Tecnológica” (Scientific and Technological Research Projects ) Avaliador	Ministerio de Ciencia, Tecnologia e Innovacion Productiva, Argentina, Argentina	Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica
2017 - 2017	Evaluator of “Proyectos de Investigación Científica y Tecnológica” (Scientific and Technological Research Projects ) Avaliador	Ministerio de Ciencia, Tecnologia e Innovacion Productiva, Argentina, Argentina	Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica
2016 - 2017	Evaluator of “Proyectos de Investigación Científica y Tecnológica” (Scientific and Technological Research Projects ) Avaliador	Ministerio de Ciencia, Tecnologia e Innovacion Productiva, Argentina, Argentina	Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2024/02 - Atual	Computational Chemistry	BSc in Chemistry	Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
2024/04/12 - 2024/04/12	Alchemical free energy perturbation	3D-BioInfo-PT Advanced Workshop	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023/06/15 - 2023/06/16	MM/PBSA to estimate ligand-binding affinities	3D-BioInfo-PT Advanced Workshop (Outros)	Universidade de Coimbra, Portugal
2022/12/20 - 2022/12/20	Compound Databases and Computational Virtual Screenings	Intermediate Workshop - 3D- BioInfo-PT	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2022/09/21 - 2022/09/22	Molecular Docking Course	Introductory Workshop - 3D-BioInfo-PT (Outros)	Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2021/02 - 2021/03	Chemical Systems and Reactivity - Halogen bonds and other unusual noncovalent interactions	Mestrado em Química (Mestrado)	Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
2020 - 2020	Docking methodologies module, Medicinal Chemistry of Nucleotides and Nucleosides Course	Mestrado em Química (Mestrado)	Universidade de Lisboa Departamento de Química e Bioquímica, Portugal
2018 - 2018	Exercises Classes of Inorganic Biochemistry	Inorganic Biochemistry (Mestrado)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - 2017	Exercises Classes of Inorganic Biochemistry	Inorganic Biochemistry (Mestrado)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017 - 2017	Docking methodologies module, Medicinal Chemistry of Nucleotides and Nucleosides Course	Medicinal Chemistry of Nucleotides and Nucleosides (Mestrado)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016 - 2016	Docking methodologies module, Medicinal Chemistry of Nucleotides and Nucleosides Course	Medicinal Chemistry of Nucleotides and Nucleosides (Mestrado)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015 - 2015	Laboratory Classes of General Chemistry	General Chemistry (Mestrado)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015 - 2015	Laboratory Classes of Chemistry	Chemistry (Licenciatura)	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015 - 2015	Exercises Classes of Inorganic Biochemistry	Inorganic Biochemistry (Mestrado)
2011 - 2011	Electronic Structure Methods module, Computational Chemistry Course	Computational Chemistry (Mestrado)	Universidade de Aveiro Departamento de Química, Portugal
2008 - 2008	Electronic Structure Methods module, Computational Chemistry Course	Computational Chemistry (Mestrado)	Universidade de Aveiro Departamento de Química, Portugal

Entrevista (jornal / revista)

	Descrição da atividade	Jornal / Forum
2025/01/03	Opinion article on the future of science for 2025 featured in Diário de Notícias	Diário de Notícias
2024/10/09	Opinion/interview on the Chemistry Nobel Prize 2024 featured on Observador	Observador
2024/10/09	Opinion/interview on the Chemistry Nobel Prize 2024 featured on Diário de Notícias (Newspaper)	Diário de Notícias
2021/03	Press release on the interaction of halogenated drugs with membranes	Info Ciências
2013/10/21	Opinion article on the Chemistry Nobel Prize 2013	Online Journal, University of Aveiro

Membro de associação

	Nome da associação	Tipo de participação
2015/01/01 - Atual	Co-Founder of the Computational Chemistry Group of the Portuguese Chemical Society (https://computacional.spq.pt/)	Co-Founder
2000/01/01 - Atual	Member of the Portuguese Chemical Society	Member

Membro de comissão

	Descrição da atividade Tipo de participação	Instituição / Organização
2019 - Atual	Vice-Coordinator of the Biological Chemistry thematic line Outro	Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal

Outro júri / avaliação

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2007 - Atual	Referee in the following peer-reviewed journals: Journal of the American Chemical Society, Journal of Chemical Theory and Computation, Dalton Transactions, Organic & Biomolecular Chemistry, RSC Advances, European Journal of Inorganic Chemistry, Journal of Organometallic Chemistry, Journal of Molecular Structure, Computational and Theoretical Chemistry, International Journal of Quantum Chemistry, PCCP, Chem, Crystals, Molecules.