Ana Sofia Fonseca Ramos (4912-EC14-A39A)

Curriculum Vitae

Ana Sofia Fonseca Ramos

Ana Sofia Fonseca Ramos. Completed the Mestrado in Engenharia Biotecnológica in 2011/11/07 by Universidade Lusófona, Licenciatura in Engenharia Biotecnológica in 2003/12/31 by Universidade Lusófona, DEA in Pharmaceutical Bionformatics in 2022/10/30 by Uppsala Universitet, DEA in Artificial Intelligence in Drug Discovery in 2023/03/22 by Uppsala Universitet, DEA in The 7th Evidence-Based Research Training School in 2023/03/03 by Høgskulen på Vestlandet, DEA in Applied Pharmaceutical Bioinformatics in 2023/01/06 by Uppsala Universitet, DEA in Applied Pharmaceutical Structural Bioinformatics in 2022/10/13 by Uppsala Universitet, Diplôme d´études supérieures in MOOC Machine Learning y Big Data para la Bioinformática in 2023/04/10 by Universidad de Granada and Diplôme d´études supérieures in Next Generation Sequencing Analysis in 2022/08/18 by Decode Life Bioinformatics training institute. Attends the Doktor (PhD) in Health Sciences by Universidad de Alcalá since 2018/11/26. Is Assistant Professor in Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Ciências e Tecnologias da Saúde. Published 3 articles in journals. Participated in 10 event(s). Co-supervised 2 work(s) of course completion of LSc/BSc. Participates and/or participated as Other in 1 project(s). Works in the area(s) of Exact Sciences with emphasis on Computer and Information Sciences with emphasis on Bioinformatics, Medical and Health Sciences with emphasis on Medical Biotechnology with emphasis on Health-Related Biotechnology, Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Genetics and Heredity and Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Molecular Biology. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific, technological and artistic-cultural output are: Cancer research; survival data platforms; breast cancer; Immune cells; Breast cancer; Oncolobiology; Redox signaling; Bioinformatic; Metastasis mechanisms; Cell migration; Gene expression; miRNA databases; Enrichment analysis; Protein-protein interactions; Genetic disorders; Biological mechanisms; Membrane receptors; Calcium signaling; Oncobiology; Protein-compound interactions; Biomarkers; Immunogenetics; LOXL2; Gene ontology; inhibitors; natural compounds; .

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Ana Sofia Fonseca Ramos

Nomes de citação

Ramos, Sofia
Ramos, A. S.

Identificadores de autor

Ciência ID: 4912-EC14-A39A
ORCID iD: 0000-0001-5846-6194

Endereços de correio eletrónico

sofia.ramos@ulusofona.pt (Profissional)

Telefones

Telemóvel

912635765 (Pessoal)

Domínios de atuação

Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
Ciências Médicas e da Saúde - Biotecnologia Médica - Biotecnologia Aplicada à Saúde
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Genética e Hereditariedade
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador independente (B2)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador independente (B2)	Utilizador independente (B2)
Francês	Utilizador elementar (A2)	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador elementar (A2)	Utilizador independente (B1)

Formação

	Grau	Classificação
2018/11/26 - 2023/09/30 Em curso	Health Sciences (Doktor (PhD)) Especialização em Biomedicine Universidad de Alcalá, Espanha
2023/05/22 - 2023/05/26 Concluído	Molecular Bioinformatics Online Practical Course (Outros) Especialização em Bioinformatica Molecular Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
2023/04/21 - 2023/05/15 Concluído	Epigenetics - Human Health (Outros) Especialização em Genetics Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/04/05 - 2023/04/20 Concluído	Epigenetics - Foundations (Outros) Especialização em Genetics Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/02/06 - 2023/04/10 Concluído	MOOC Machine Learning y Big Data para la Bioinformática (Diplôme d´études supérieures) Especialização em Machine learning and Bioinformatics Universidad de Granada, Espanha
2023/01/16 - 2023/03/22 Concluído	Artificial Intelligence in Drug Discovery (DEA) Especialização em Pharmaceutical Bioinformatics Uppsala Universitet, Suécia
2023/01/15 - 2023/03/03 Concluído	The 7th Evidence-Based Research Training School (DEA) Especialização em Evidence-based Research in Clinical Health Research Høgskulen på Vestlandet, Noruega
2022/11/21 - 2023/01/06 Concluído	Applied Pharmaceutical Bioinformatics (DEA) Especialização em Pharmaceutical Bioinformatics Uppsala Universitet, Suécia
2022/08/29 - 2022/10/30 Concluído	Pharmaceutical Bionformatics (DEA) Especialização em Pharmaceutical Bioinformatics Uppsala Universitet, Suécia
2022/08/29 - 2022/10/13 Concluído	Applied Pharmaceutical Structural Bioinformatics (DEA) Especialização em Pharmaceutical Bioinformatics Uppsala Universitet, Suécia
2022/07/22 - 2022/08/18 Concluído	Next Generation Sequencing Analysis (Diplôme d´études supérieures) Especialização em Bioinformatics applied to Genetics Decode Life Bioinformatics training institute, Índia
2022/04/30 - 2022/07/16 Concluído	Data Science com Python (DESE) Especialização em Data Science Universidade Lusófona, Portugal
2020/03/11 - 2020/05/31 Concluído	Training in Clinical Trial Monitoring (Outros) CBIOS, the Research Center for Biosciences & Health Technologies, Portugal	14
2015/03/18 - 2016/02/28 Concluído	MBA em Gestão de Empresas (Pós-Graduação) Institute of Business Management, Portugal	17
2009/11/02 - 2011/11/07 Concluído	Engenharia Biotecnológica (Mestrado) Especialização em Biotecnologia aplicada à saúde Universidade Lusófona, Portugal "Allogenic Transplantation of Hematopoietic Progenitors - Study of Factors Associated with Graft versus Host Disease in Portuguese context " (TESE/DISSERTAÇÃO)	14
1998/10/11 - 2003/12/31 Concluído	Engenharia Biotecnológica (Licenciatura) Universidade Lusófona, Portugal "Effect of Daclizumab in preventing graft-versus-host disease through selective depletion of alloreactive cells" (TESE/DISSERTAÇÃO)	15

Percurso profissional

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2021/09/01 - Atual	Professor Auxiliar (Docente Universitário)	Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Ciências e Tecnologias da Saúde, Portugal
	Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Ciências e Tecnologias da Saúde, Portugal
2021/09/01 - 2022/07/31	Professor Auxiliar (Docente Universitário)	Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
	Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal

Outras Carreiras

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2004/05/14 - 2004/08/27	Assistente (Técnico Superior de Saúde - Laboratório)	Instituto Clínico e Imunológico de Lisboa, Portugal

Projetos

Projeto

	Designação	Financiadores
2020/11/16 - Atual	Lusophone flora fighting disease: focus on therapeutic lysyl oxidase modulators ILIND/F+/EI/01/2020 PhD student Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro de Investigação em Biociências e Tecnologias da Saúde, Portugal	Em curso

Produções

Publicações

Artigo em revista	Ferreira, Sandra; Ramos, Sofia; Holota, Serhii; Khyluk, Dmytro; Lesyk, Roman; Finyuk, Natalia; dos Santos,Daniel JVA; et al. "P03-18: Lysyl oxidase like 2: an enzyme at the crossroad of Toxicology and Pharmacology". Toxicology Letters 384 1 (2023): S92. Publicado Ramos, Sofia; Ferreira, Sandra; Fernandes, Ana S.; Saraiva, Nuno. "Lysyl Oxidases Expression and Breast Cancer Progression: A Bioinformatic Analysis". Frontiers in Pharmacology 13 (2022): http://dx.doi.org/10.3389/fphar.2022.883998. Acesso aberto • Publicado • 10.3389/fphar.2022.883998 Ramos, Sofia; Fernandes, Ana Sofia; Saraiva, Nuno. "Gene expression and survival analysis in cancer research using online open access platforms: a comparative analysis". Biomedical and Biopharmaceutical Research Journal 17 2 (2020): 1-19. http://dx.doi.org/10.19277/bbr.17.2.247. 10.19277/bbr.17.2.247
Poster em conferência	Ramos, Sofia; Gregório, João; Fernandes, Ana Sofia; Nuno Saraiva. Autor correspondente: Nuno Saraiva. "Crosstalk between Expression of Redox and Calcium Signaling Genes and Its Impact on Breast Cancer Patient Survival.RSGDREAM 2023". Trabalho apresentado em RECOMB/ISCB Conference on Regulatory & Systems Genomics with DREAM Challenges (RSGDREAM) 2023, 2023. Ferreira, Sandra; Ramos, Sofia; Diaz-Lanza Ana María; Fernandes, Ana Sofia; Nuno Saraiva; Rijo, Patricia; Brito Palma, Bernardo. Autor correspondente: Fernandes, Ana Sofia. "Exploring the Multifaceted Potential of EPCU in Targeting Tumorigenesis and Hormone Regulation". Trabalho apresentado em 2nd Asian Council Symposium, 2023. Ramos, Sofia; Gregório, João; Ana Sofia Fernandes; Nuno Saraiva. Autor correspondente: Nuno Saraiva. "The influence of Redox and Calcium signalling-related gene expression profiles on the progression of Breast Cancer". Trabalho apresentado em Encontro de Ciencia 2023, 2023. Ramos, Sofia; Miguel Santana; Nunes, Alexandra. Autor correspondente: Ramos, Sofia. "Bioinformatic analysis of Claudin family as therapeutic targets for pancreatic adenocarcinoma". Trabalho apresentado em ISCB-Latin America SoIBio BioNetMX Conference on Bioinformatics 2022, 2022. Ramos, Sofia; Ana Sofia Fernandes; Saraiva, Nuno. "Expression profile of cellular redox and calcium signalling-related genes: role in breast cancer progression.". Trabalho apresentado em The Biochemistry Global Summit, Lisbon 2022, 2022. Ferreira, Sandra; Ramos, Sofia; Holota, Serhii; Khyluk, Dmytro; Lesyk, Roman; Saraiva, Nuno; Fernandes, Ana Sofia. "Lysyl oxidase like 2 as a therapeutic target for breast cancer: bioinformatics analysis and biochemical evaluation of 4-thiazolidinone derivatives". Trabalho apresentado em The Biochemistry Global Summit, Lisbon 2022, 2022. Ferreira, Sandra; Ramos, Sofia; Serhii Holota; Dmytro Khyluk; Roman Lesyk; Nuno Saraiva; Ana Sofia Gregório Fernandes. Autor correspondente: Ana Sofia Gregório Fernandes. "Targeting lysyl oxidases for breast cancertherapy: bioinformatic analysis and evaluationof 4-thiazolidinone derivatives as LOXL2inhibitors". Trabalho apresentado em The Biochemistry Global Summit, 25th IUBMB Congress, 46th FEBS Congress, 15th PABMB Congress, 2022. Alves, Bárbara; Calado, Rita; Rodrigues, João C.; Jorge, João; Abdul, Sházia; Guerreiro, Íris; Portela, Raquel; et al. Autor correspondente: Nunes, Alexandra. "NiPharmins as efficacious prophylactic options to prevent Staphylococcal infections". Trabalho apresentado em 3rd INSA's Young Researcher Day, Lisbon, Portugal, 8 November, 2022. Ramos, Sofia; Santana, Miguel; Nunes, Alexandra. "Bioinformatic analysis of Claudin genes family as therapeutic targets for pancreatic adenocarcinoma". Trabalho apresentado em ISCB-Latin America SolBio BioNetMX Conference on Bioinformatics 2022, Juriquilla, Mexico, 3-7 November, 2022. Ferreira, Sandra; Ramos, Sofia; Saraiva, Nuno; Fernandes, Ana Sofia. "Lysyl Oxidases in the pathophysiology of breast cancer: a bioinformatics approach". Trabalho apresentado em 56º Congresso Anual da SBFIS Online, 2021. Ramos, Sofia; Ferreira, Sandra; Saraiva, Nuno; Fernandes, Ana Sofia. "Bioinformatics analysis for Lysyl Oxidases as therapeutic targets for breast cancer.". Trabalho apresentado em Molecular Analysis for Precision Oncology Virtual Congress 2021, 2021. Ramos, Sofia; Ferreira, Sandra; Saraiva, Nuno; Fernandes, Ana Sofia. "Lisil Oxidases como possíveis alvos terapêuticos para o cancro da mama: análise baseada na bioinformática.". Trabalho apresentado em 3º Encontro Nacional de Jovens Investigadores em Oncologia. Congresso Híbrido., 2021. Sofia Ramos; Nuno Saraiva; Ana Sofia Fernandes. "Bioinformatic Databases as a tool to analyze alterations in Cell Physiology in Carcinogenesis: A comparative analysis of open access data analysis platforms.". Trabalho apresentado em Fisiologia ainda sob estresse em tempos da COVID-19, 2020.
Resumo em conferência	Ferreira, Sandra; Ramos, Sofia; Holota, Serhii; Khyluk, Dmytro; Lesyk, Roman; Finyuk, Natalia; Santos, Daniel; Nuno Saraiva; Fernandes, Ana Sofia. Autor correspondente: Fernandes, Ana Sofia. "A Novel Lysyl Oxidase Like 2 Inhibitor decreases Breast Cancer cells migration". Trabalho apresentado em 53rd Meeting of the Portuguese Society of Pharmacology, 41st Meeting of Clinical Pharmacology and 22nd Meeting of Toxicology, Coimbra, 2023. Publicado Ramos, Sofia; Fernandes, Ana Sofia; Saraiva, Nuno. "Simultaneous expression dysregulation of redox and calcium signalling-related genes: impact on breast cancer patient survival". Trabalho apresentado em FEBS, Lisbon, 2022. Publicado Ferreira, Sandra; Ramos, Sofia; Holota, Serhii; Khyluk, Dmytro; Lesyk, Roman; Saraiva, Nuno; Fernandes, Ana Sofia. "Lysyl oxidase like 2 as a therapeutic target for breast cancer: bioinformatics analysis and biochemical evaluation of 4-thiazolidinone derivatives". Trabalho apresentado em FEBS, Lisbon, 2022. Publicado Ramos, Sofia; Ferreira, Sandra; Fernandes, Ana Sofia; Garcia Saraiva, Nuno. "Lysyl Oxidases in the pathophysiology of breast cancer: a bioinformatics approach.". Trabalho apresentado em Biomed Biopharm Res, 2021. Publicado Ramos, Sofia; Ferreira, Sandra; Nuno Saraiva; Fernandes, Ana Sofia. Autor correspondente: Ramos, Sofia. "Bioinformatics analysis for Lysyl Oxidases as therapeutic targets for breast cancer". Trabalho apresentado em Molecular Analysis for Precision Oncology Congress 2021, 2021. Publicado

Outros

Outra produção

Human Genetics - Oncobiology (didactic material). 2022. Ramos, Sofia; Nunes, Alexandra.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2023/11/10	Synchronized expression of Redox and Calcium-related genes. implications for breast cancer patient survival	V Jornadas CBIOS CBIOS, Universidade Lusofona (Lisbon, Portugal)
2022/11/03	Online oral presentation of poster entitled "Bioinformatic analysis of Claudin family as therapeutic targets for pancreatic adenocarcinoma"	4th ISCB-Latin America SoIBio BioNetMX Conference on Bioinformatics 2022 ISCB-Latin America SoIBio BioNetMX (Juriquilla, México)
2022/03/14	Presentation of preliminary results of doctoral project: Expression profile of cellular redox and calcium signalling-related genes: role in breast cancer progression	Lab meeting, CBIOS Universidade Lusófona (Lisbon, Portugal)
2020/10/02	Presenting poster "Bioinformatics databases as a tool to analyze alterations in cell phisiology in carcinogenesis: A Comparative analysis of open access data analysis platforms"	55º Congresso anual da SBFIS Sociedade Brasileira de Fisiologia (online event) (São Paulo, Brasil)
2020/02/28	Presentation of Doctoral project: Expression profile of cellular redox and calcium signalling-related genes: role in breast cancer progression	CBIOS Sessions CBIOS - Universidade Lusófona (Lisboa, Portugal)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2022/01/04 - 2022/07/12	Projeto de final de curso - Nph-1 como Opção Profilática Eficaz na Prevenção de Infeções Estafilocócicas Coorientador	Biologia (Licenciatura/Bacharelato) Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
2021/11/05 - 2022/06/15	Projeto de final de curso - Análise bioinformática de perfis de expressão génica das Claudinas em pacientes com adenocarcinoma pancreático Coorientador	Biologia (Licenciatura/Bacharelato) Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2022/11/08 - Atual	Poster participation entitled "NiPharmins as efficacious prophylactic options to prevent Staphylococcal infections" Encontro	3o Dia do Jovem Investigador INSA 2022 Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
2022/09/20 - Atual	Participation in Virtual Ensembl Browser Workshop Congresso	4th Congress in Women in Bioinformatics and Data Science Latin America Women in Bioinformatics and Data Science Latin America, Argentina
2021/02/12 - Atual	Participation in specific formation "Effect of TMBIM family members in glioma" Encontro	CBIOS Sessions Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro de Investigação em Biociências e Tecnologias da Saúde, Portugal
2024/02/13 - 2024/02/14	Coordinated Expression of Genes Related to Redox status and Ca2+ homeostasis: Implications for Breast Cancer Patient Survival Conferência	Virtual Conference on Signaling Circuits in Cancer European Association For Cancer Research, Reino Unido
2023/05/04 - 2023/05/05	Congress participation in the work intitled "Validação Portuguesa da Obsession with COVID-19 Scale (PT-OCS)" Congresso	XI Congresso Iberoamericano de Avaliação Psicológica Universidade do Algarve, Portugal
2021/03/12 - 2021/03/12	Participation in specific formation "Mechanisms of resistance to trastuzumab and pertuzumab in her2-positive breast cancer: preliminary analysis of redox and immune-related biomarker" Encontro	CBIOS Sessions Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro de Investigação em Biociências e Tecnologias da Saúde, Portugal
2021/02/17 - 2021/02/18	Participation in virtual meeting "Advances in Redox Biology and Medicine: From Basic Mechanisms to Clinical Implications" Congresso	"Advances in Redox Biology and Medicine: From Basic Mechanisms to Clinical Implications" Israel Society for Oxygen and Free Radical Research, Israel
2020/11/23 - 2020/11/23	Presenting poster "Bioinformatic Databases as a tool in cancer research: a comparative analysis of gene expression and survival data platforms." Encontro	IV Jornadas CBIOS under the theme “There is research beyond COVID-19” Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro de Investigação em Biociências e Tecnologias da Saúde, Portugal
2020/09/25 - 2020/09/25	Participation in virtual conference "Cancer Biology: From basic to translation research"	Cancer Biology: From basic to translation research Liga Portuguesa Contra o Cancro, Portugal
2019/10/02 - 2019/10/02	Participation in Cell Migration Workshop Oficina (workshop)	Cell Migration Workshop Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro de Investigação em Biociências e Tecnologias da Saúde, Portugal
2018/06/22 - 2018/06/22	Introduction to Meta-analysis Congresso	Introduction to Meta-analysis, 3º Congresso Internacional do Centro de Investigação Interdisciplinar Egas Moniz Centro de Investigação Interdisciplinar Egas Moniz, CiiEM, Research and Innovation in Human & Health Sciences, Portugal

Membro de associação

	Nome da associação	Tipo de participação
2023/11/05 - 2025/11/05	EACR - The European Association for Cancer Research
2023/10/01 - 2025/10/01	ISCB - International Society for Computational Biology