Ana Rita da Silva Santos (5816-8DC2-2397)

Curriculum Vitae

Ana Rita da Silva Santos

Ana Rita da Silva Santos completed her PhD in Biotechnology and Biosciences in 2023 and the Integrated Master's in Biological Engineering in 2015 by Instituto Superior Técnico, University of Lisbon. Is a Contracted Researcher in Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento. Published 7 articles in journals. Has 2 section(s) of books. Organized 1 event(s). Participated in 4 event(s). Supervised 5 MSc dissertation(s) and 4 Integrated Projects of Biological Engineering for the completion of bachelor. Has received 2 awards and/or honors. Participates and/or participated as Other in 4 project(s). Works in the area(s) of Engineering and Technology with emphasis on Industrial Biotechnology, Fermentation and Engineering and Bioprocessing Technologies. In their professional activities interacted with 41 collaborator(s) co-authorship of scientific papers.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Ana Rita da Silva Santos

Nomes de citação

A. Rita Silva-Santos

Identificadores de autor

Ciência ID: 5816-8DC2-2397
ORCID iD: 0000-0001-6025-0114

Domínios de atuação

Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial - Fermentação
Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial - Tecnologias de BioProcessamento

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)

Formação

	Grau	Classificação
2017/09/01 - 2023/03/01 Concluído	Biotecnologia e Biociências (Doutoramento) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal "Biomanufacturing of DNA-origami nanostructures for bio-imaging" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2015 Concluído	Engenharia Biológica (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal "A multimodal approach in the downstream processing of plasmid DNA" (TESE/DISSERTAÇÃO)	17
2013 Concluído	Ciências da Engenharia - Engenharia Biológica (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal "n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)	15

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2023/04/01 - Atual	Investigador Contratado (Investigação)	Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
	iBB - Institute for Bioengineering and Biosciences, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Portugal
2016/04/15 - 2017/08/31	Estagiário de Investigação (Investigação)	iBB - Institute for Bioengineering and Biosciences, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Portugal

Projetos

Projeto

	Designação	Financiadores
2025/01/01 - Atual	Biomanufacturing of DNA-origami nanostructures for image-guided drug delivery 2023.11117.PEX Investigador responsável iBB - Institute for Bioengineering and Biosciences, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2024 - Atual	DIG4BIO - Digitalization of Biomanufacturing of Plasmids for the development of Advanced Therapy Modalities 101159993	European Research Executive Agency Em curso
2023/01 - Atual	Enabling worldwide vaccination by improving the mRNA quality in the manufacturing process FE174/012023/47901 Fellow	ModernaTX Em curso
2023/03/01 - 2026/02/28	A Gold Nanosensor for Single-Molecule Detection of RNA Biomarkers in a Miniaturized Microscope 2022.04076.PTDC Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2018/09/01 - 2021/08/31	Funcionalização de Materiais à Base de Celulose com Biomoléculas e Nanoestruturas Utilizando Estratégias de Reconhecimento Biomolecular PTDC/CTM-CTM/30790/2017 Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31	Institute for Bioengineering and Biosciences UID/BIO/04565/2019 Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Ulpiano, C.; Alves, C.A.P.; Silva-Santos, A.R.; Serra, J.; Da Silva, C.L.; Monteiro, G.A.; Santos, Ana. "RNAi as a tool to inhibit the angiogenic potential of human Mesenchymal Stem/Stromal Cells in malignancy". 2019. 10.1109/ENBENG.2019.8692558
Artigo em revista	Coutinho, Gonçalo; Warlitz, Philipp; Silva-Santos, Ana R.; Prazeres, Duarte M.; Moita, Ana; Kriegseis, Jochen; Moreira, António; Rossi, Massimiliano. "Enhanced three-dimensional particle detection in microcirculation experiments with defocus particle tracking and ghost red blood cells". Experiments in Fluids 65 11 (2024): http://dx.doi.org/10.1007/s00348-024-03897-8. 10.1007/s00348-024-03897-8 Coutinho, Gonçalo; Warlitz, Philipp; Silva-Santos, A. Rita; Silva, Ricardo M.; Moita, Ana; Prazeres, Duarte Miguel F.; Kriegseis, Jochen; Moreira, António L. N.; Rossi, Massimiliano. "Ghost Red Blood Cells For Enhanced Particle Detection With Defocusing PTV In Microcirculation Experiments". Proceedings of the International Symposium on the Application of Laser and Imaging Techniques to Fluid Mechanics 21 (2024): 1-11. http://dx.doi.org/10.55037/lxlaser.21st.114. 10.55037/lxlaser.21st.114 Silva-Santos, A. Rita; Rosa, Sara Sousa; Marques, Marco P. C.; Azevedo, Ana M.; Prazeres, Duarte Miguel F.. "Quantification of ssDNA Scaffold Production by Ion-Pair Reverse Phase Chromatography". ACS Omega (2024): https://publons.com/wos-op/publon/68364837/. 10.1021/ACSOMEGA.3C10533 Silva-Santos, A. Rita; Paulo, Pedro M.R.; F. Prazeres, Duarte Miguel. "Scalable purification of single stranded DNA scaffolds for biomanufacturing DNA-origami nanostructures: Exploring anion-exchange and multimodal chromatography". Separation and Purification Technology 298 (2022): 121623. http://dx.doi.org/10.1016/j.seppur.2022.121623. 10.1016/j.seppur.2022.121623 Behler, Karl L.; Honemann, Maximilian N.; Silva-Santos, Ana R.; Dietz, Hendrik; Weuster-Botz, Dirk. "Phage-free production of artificial ssDNA with Escherichia coli". Biotechnology and Bioengineering 119 10 (2022): 2878-2889. http://dx.doi.org/10.1002/bit.28171. 10.1002/bit.28171 A. Rita Silva-Santos; Oliveira-Silva, Rui; Rosa, Sara; Pedro Miguel Neves Ribeiro Paulo; Prazeres, Duarte Miguel F.. Autor correspondente: Prazeres, Duarte Miguel F.. "Affinity-Based Magnetic Particles for the Purification of Single-Stranded DNA Scaffolds for Biomanufacturing DNA-Origami Nanostructures". ACS Applied Nano Materials 4 12 (2021): 14169-14177. http://dx.doi.org/10.1021/acsanm.1c03623. 10.1021/acsanm.1c03623 Silva-Santos, A. Rita; Alves, Cláudia P.A.; Monteiro, Gabriel; Azevedo, Ana M.; Prazeres, Duarte Miguel F.. "Multimodal chromatography of supercoiled minicircles: A closer look into DNA-ligand interactions". Separation and Purification Technology 212 (2019): 161-170. http://dx.doi.org/10.1016/j.seppur.2018.11.015. 10.1016/j.seppur.2018.11.015 Campos-Pinto, Isabel; Capela, Emanuel V; Silva-Santos, A Rita; Rodríguez, Miguel Arévalo; Gavara, Poondi Rajesh; Fernandez-Lahore, Marcelo; Aires-Barros, M Raquel; Azevedo, Ana M. "LYTAG-driven purification strategies for monoclonal antibodies using quaternary amine ligands as affinity matrices". Journal of Chemical Technology & Biotechnology 93 7 (2017): 1966-1974. http://dx.doi.org/10.1002/jctb.5460. 10.1002/jctb.5460 Silva-Santos, A.R.; Alves, C.P.A.; Prazeres, D.M.F.; Azevedo, A.M.. "A process for supercoiled plasmid DNA purification based on multimodal chromatography". Separation and Purification Technology 182 (2017): 94-100. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85016519878&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.seppur.2017.03.042 Silva-Santos, A.R.; Alves, C.P.A.; Prazeres, D.M.F.; Azevedo, A.M.. "Separation of plasmid DNA topoisomers by multimodal chromatography". Analytical Biochemistry 503 (2016): 68-70. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84964681172&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ab.2016.03.012
Capítulo de livro	Wagner, A.; Silva-Santos, A.R.; Rosa, S.S.; Gierak, S.; Azevedo, A.M.; Prazeres, D.M.F.. "Primary Purification of Plasmid DNA Using Differential Isopropanol Precipitation". 151-165. 2021. 10.1007/978-1-0716-0872-2_8 Silva-Santos, A.R.; Rosa, S.S.; Prazeres, D.M.F.; Azevedo, A.M.. "Purification of Plasmid DNA by Multimodal Chromatography". 193-205. 2021. 10.1007/978-1-0716-0872-2_10
Poster em conferência	José Santos; A. Rita Silva-Santos; Serra, Vanda Vaz; Duarte Miguel F Prazeres; Zijlstra, Peter; Sílvia M B Costa; Pedro M.R. Paulo. "Single-molecule fluorescence enabled by nanogap gold antennas toward imaging and biosensing". Trabalho apresentado em S3IC 2024 – Single-Molecule Sensors and nanoSystems International Conference, 2024. José Santos; Serra, Vanda Vaz; A. Rita Silva-Santos; Prazeres, Duarte Miguel F.; Zijlstra, Peter; Silvia MB Costa; Pedro Miguel Neves Ribeiro Paulo. "Single-molecule fluorescence enabled by nanogap gold antennas toward imaging and biosensing". Trabalho apresentado em NanoSeries2024 – 3rd Edition NanoSeries Conference on Global Nanotechnology, 2024. A. Rita Silva-Santos; Oliveira-Silva, Rui; Pedro Miguel Neves Ribeiro Paulo; Prazeres, Duarte Miguel F.. "Single-step purification of ssDNA scaffolds using affinity magnetic beads for DNA-origami biomanufacturing". Trabalho apresentado em ISPPP 2021, 2021. A. Rita Silva-Santos; Cláudia P. A. Alves; Michaela Šimciková; Gabriel A. Monteiro; Ana M. Azevedo; Duarte Miguel F. Prazeres. "Multimodal chromatography of supercoiled minicircles: a closer look into DNA-ligand interactions". Trabalho apresentado em ESBES2018, 2018. Emanuel V. Capela; A. Rita Silva-Santos; Isabel Campos-Pinto; Miguel A. Rodríguez; Poondi R. Gavara; Marcelo Fernandez-Lahore; M Raquel Aires-Barros; Ana M. Azevedo. "LYTAG- driven purification strategies as a key to integrate and intensify the downstream processing of monoclonal antibodies". Trabalho apresentado em MicroBiotec'17, 2017. A. Rita Silva-Santos; Cláudia P. A. Alves; Ana M. Azevedo; Duarte Miguel F Prazeres. "Separation of plasmid DNA topoisomers by multimodal chromatography". Trabalho apresentado em MicroBiotec'15, 2015.
Tese / Dissertação	"Biomanufacturing of DNA-origami nanostructures for bio-imaging". Doutoramento, Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, 2024. Santos, Ana. "A multimodal approach in the downstream processing of plasmid DNA". Mestrado, Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, 2015.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2024/10	Enhancement of mRNA quality for improved vaccine development	ESBES 2024 (Copenhaga, Dinamarca)
2024/06	3-D printed matrices for the purification of plasmid DNA via steric exclusion chromatography	RXX – Recovery of Biological Products XX (Sunriver, Oregon, Estados Unidos)
2023/09	Towards industrial manufacturing of DNA-origami nanostructures: scalling up ssDNA scaffold purification	ISPPP 2023 (Viena, Áustria)
2022/09	Quantification of ssDNA scaffold production by ion-pair reverse phase chromatography	BPP2022 - Biopartitioning & Purification Conference (Aveiro, Portugal)
2021/11	DNA-origami nanostructures: exploring chromatography for the purification of single stranded DNA scaffolds	ISPPP 2021 (Porto, Portugal)
2021/09	Chromatographic isolation of single stranded DNA scaffolds for biomanufacturing scale-up of DNA-origami nanostructures	ECAB 2021
2021/09	Magnetic particles as affinity-based ligands: purification of single stranded DNA scaffolds for biomanufacturing DNA-origami nanostructures	ECAB 2021
2021/06	Magnetic particles as affinity-based ligands: purification of single stranded DNA scaffolds for biomanufacturing DNA-origami nanostructures	Affinity 2021
2021/05	Magnetic particles as affinity-based ligands for the purification of single stranded DNA scaffolds for biomanufacturing DNA-origami nanostructures	ESBES2021
2021/05	Chromatographic isolation of single stranded DNA scaffolds for biomanufacturing of DNA-origami nanostructures	SBCN 2021
2019/12	Chromatographic purification of single stranded DNA scaffolds for biomanufacturing DNA-origami nanostructures	MicroBiotec'19 (Coimbra, Portugal)
2017/12	Multimodal chromatography of supercoiled minicircles: a closer look into DNA-ligand interactions	MicroBiotec'17 (Porto, Portugal)
2017/11	Tandem precipitation and enzymatic digestion for intermediate recovery of nucleic acids	ABC2 – Anything But Conventional Chromatography Workshop (Lisboa, Portugal)
2017/05	Combining enzymatic topology modification and multimodal chromatography for minicircle purification	II International Congress in Health Sciences Research (Covilhã, Portugal)
2017/03	Purification of Minicircles by Combined Enzymatic Modification of Miniplasmid Topology and Multimodal Chromatography	ECI Separation Technology IX: New Frontiers in Media, Techniques, and Technologies (Albufeira, Portugal)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2024/09/01 - Atual	Obtenção de vacinas de RNA mensageiro por tecnologias emergentes de produção e purificação Coorientador de Alice Aline Lima Fermino	Biotecnologia (Mestrado) Universidade da Beira Interior, Portugal
2023/09 - Atual	Development of a downstream platform for the purification of mRNA vaccines Orientador de Dalila Margarida Tiago Pedro	Biotecnologia (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2024/02 - 2024/11	Continuous alkaline lysis of plasmid-containing E. coli cells using an oscillatory flow reactor Orientador de Carla Cristina dos Reis Lopes	Engenharia Farmacêutica (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2024/02 - 2024/06	An eventual role of using the peptide apitoxin as anti-Candida agent Orientador de Maria de Almeida Rodrigues Miguens	Engenharia Biológica (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2024/02 - 2024/06	Steric exclusion chromatography of plasmid DNA: effect of plasmid size Orientador de Diogo Jorge Cardoso Pereira Beirão Oneto	Engenharia Biológica (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2024/02 - 2024/06	Towards industrial manufacturing of DNA-origami nanostructures: scalling-up scaffold production Orientador de Gonçalo Nuno Parreira Ribeiro	Engenharia Biológica (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2024/02 - 2024/06	Enhancing product quality of monoclonal antibody streams by multimodal chromatography Orientador de Rita Bastos de Albuquerque	Engenharia Biológica (Licenciatura/Bacharelato) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/09 - 2024/02	Linearization and Purification of Plasmid DNA for in vitro transcription reactions Coorientador de Alessandro Abbate	Sustainable Technologies and Biotechnologies for Energy and Materials (Mestrado) Alma Mater Studiorum-Università di Bologna, Itália
2023/02 - 2024/01	Enhancement of mRNA quality for improved vaccine development Orientador de Vanessa Xinyi Ji	Engenharia Biológica (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/03 - 2023/11	3D-Printed Matrices for the Purification of Plasmid DNA Orientador de Joana da Costa Silva	Engenharia Farmacêutica (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/02 - 2023/11	Scalling-up ssDNA scaffold purification for DNA-origami nanostructures assembly Orientador de Joana Silva Mendes	Engenharia Farmacêutica (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2017/09 - 2018/10	12TH SYMPOSIUM OF THE EUROPEAN SOCIETY OF BIOCHEMICAL ENGINEERING SCIENCES - ESBES 2018 (2018/09) Conferência (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2024/10/21 - 2024/10/24	Model-based techniques (DIG4BIO project) Oficina (workshop)	Danmarks Tekniske Universitet, Dinamarca
2024/09/10 - 2024/09/12	Introduction to Python (DIG4BIO Project) Oficina (workshop)	iBB - Institute for Bioengineering and Biosciences, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Portugal
2023/10/10 - 2023/10/10	Global Fellowship Meeting Encontro	ModernaTX, Estados Unidos
2018/09/30 - 2018/10/03	Drug Development course - 3rd edition Oficina (workshop)	European Society for Animal Cell Technology, Alemanha
2018/09/18 - 2018/09/22	Cell Culture-based Viral Vaccines Course, 4th Edition Oficina (workshop)	European Society for Animal Cell Technology, Alemanha
2018/08/15 - 2018/08/25	BIOPRO World Talent Campus Oficina (workshop)	Danmarks Tekniske Universitet, Dinamarca Novo Nordisk Fonden, Dinamarca

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2024/12	Optimization of microfluidic systems for chromatography applications in PDMS and COC structures Arguente	Rafael Santos Batista (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2024/11	Production and purification of tagged proteins Arguente	Mariana Gonçalves Tomé Fidalgo (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/12	RNA Binding of the MYC oncoproteins Arguente	Rita Videira Tomás (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/12	Exploring the anti-Candida properties of recombinant and purified melittin Arguente	Ana Luísa Louro de Oliveira (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/11	Scalable production of bacteriophages preparations Arguente	João Pedro Prinas de Almeida Saavedra (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2023/11 - 2024/01	Integrated Biological Engineering Laboratory (supervision of 2 Independent Laboratory Projects)	Engenharia Biológica (Mestrado integrado)	Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2023/12/05 - 2023/12/05	Biomolecular Engineering (Teaching an invited seminar on DNA-origami technology)	Master in Bioengineering and Nanosystems (MBioNano); Master in Biotechnology; Biological Engineering; Biomedical Engineering (Mestrado) (Mestrado)	Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2022/12/20 - 2022/12/20	Biomolecular Engineering (Teaching an invited seminar on DNA-origami technology)	Master in Bioengineering and Nanosystems (MBioNano); Master in Biotechnology; Biological Engineering; Biomedical Engineering (Mestrado) (Mestrado)	Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2022/01/19 - 2022/01/19	Biomolecular Engineering (Teaching an invited seminar on DNA-origami technology)	Master in Bioengineering and Nanosystems (MBioNano); Master in Biotechnology; Biological Engineering; Biomedical Engineering (Mestrado) (Mestrado)	Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2021/05/25 - 2021/05/25	Biomolecular Engineering (Teaching an invited seminar on DNA-origami technology)	Master in Bioengineering and Nanosystems (MBioNano); Master in Biotechnology; Biological Engineering; Biomedical Engineering (Mestrado)	Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2020/05/19 - 2020/05/19	Biomolecular Engineering (Teaching an invited seminar on DNA-origami technology)	Master in Bioengineering and Nanosystems (MBioNano); Master in Biotechnology; Biological Engineering; Biomedical Engineering (Mestrado) (Mestrado)	Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Revisão ad hoc de artigos em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2023 - Atual	Computational and Structural Biotechnology Journal	Elsevier
2023 - Atual	Frontiers in Molecular Biosciences	Frontiers
2023 - Atual	Journal of Chromatography A	Elsevier
2022 - Atual	Journal of Chromatography B	Elsevier

Distinções

Prémio

2021	Bronze VIJI award at SBCN 2021
2021	Best Poster Prize at ISPPP 2021