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As a population geneticist with a background in biology, I aim to understand the evolutionary processes that shape observed genomic patterns. In my research I address fundamental evolutionary biology questions from a genomics perspective. Specifically, I am interested in the interplay between recombination, genetic drift, gene flow and natural selection. I combine population genetics theory, statistics and computer programming to develop new bioinformatic tools, with their application to genomic data from natural and experimental populations. I have worked on several population genomics projects, resulting in publications in top journals, e.g. Nature, Science, PLoS Genetics, Molecular Biology and Evolution. These covered several topics in evolutionary biology, ranging from human genomics, speciation (e.g. cichlids, rabbits, Iberian freshwater fish), ecological divergence (e.g. sawfly insects) and genetic basis of adaptation (e.g. deer mice, lizards), to applications in conservation genetics of lemurs and freshwater fish. I regularly present my work at international meetings (SMBE, ESEB), and I am invited to give plenary talks (e.g. Petit Pois Déridé), seminars (e.g. University of Aarhus) and teach at workshops (e.g. Population and Speciation Genomics at Cesky Krumlov). I am also involved in teaching, training, postdoctoral and student supervision (ongoing: 1 postdoc, 4 PhD as main supervisor, 1 PhD as co-supervisor and 2 MSc students; finished: 8 MSc students), as well as in international grant panels (Wellcome Trust, NERC, Swiss National Science Foundation), editorial and reviewing work for more than 20 international journals. I was awarded a Marie Sklodowska-Curie Individual Fellowship from 2018 to 2019, and an Assistant Researcher grant from CEEC2017. Since June 2020 that I am an Assistant Professor at the Department of Animal Biology, Faculdade de Ciências, University of Lisbon. Since 12.2020 that I am a co-PI of a Human Frontier Research Program - Young Research Award (HFSP) project to understand the genomics impact of hybridization, in collaboration with Molly Schumer (Standford University, USA), Chelsea Rochman (University of Toronto, Canada) and Claudia Bank (IEE, University of Bern). Since 01.2022, I am the PI of an FCT project to investigate the response of hybridizing species to climate change. In 12.2023 I was awarded an ERC-Portugal grant. You can find a list of my publications and reviews here: https://publons.com/author/1489534 and a detailed CV here: https://www.dropbox.com/s/29rccbwfsv7ddz4/CienciaVitae_VitorSousa.pdf?dl=1
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Vítor Martins Conde e Sousa

Nomes de citação

  • Sousa, Vitor
  • Sousa, Vitor C

Identificadores de autor

Ciência ID
5E17-4632-C1FF
ORCID iD
0000-0003-3575-0875
Google Scholar ID
dP6FAtMAAAAJ&hl
Researcher Id
P-1871-2016
Scopus Author Id
23989723700

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Conservação da Biodiversidade
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Genética e Hereditariedade

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1)
Espanhol; Castelhano Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B1) Utilizador proficiente (C1)
Catalão Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Formação
Grau Classificação
2010/04/09
Concluído
Biologia (Doutoramento)
Especialização em Especialidade: Biologia Evolutiva
Universidade de Lisboa, Portugal
"Inference of Admixture and Population Size Changes in Structured Populations with Applications to Conservation Genetics" (TESE/DISSERTAÇÃO)
Aprovado com Distinção e Louvor
2005
Concluído
PGBIOINF - Post Graduate FCUL/IGC Bioinformatics course (Pós-Graduação)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
17
2004/02/01
Concluído
Biologia (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2018/07 - Atual Investigador principal (carreira) (Investigação) Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/12/01 - 2020/06/11 Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
2018/03/01 - 2019/11/30 Investigador Contratado (Investigação) Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2020/06/12 - Atual Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/09/01 - 2019/11/30 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Departamento de Biologia Animal, Portugal
2017 - 2019 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa, Portugal
2017 - 2019 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa, Portugal
2017/09/01 - 2018 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa, Portugal
2017 - 2018 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2018/03/01 - 2019/11/30 Research fellow, Marie Sklodowska-Curie Individual Fellowship Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
2016/10/01 - 2018/02/28 Bolsa de Cientista Convidado Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
2013/01/01 - 2016/09/30 Postdoc Researcher Universität Bern Institut für Ökologie und Evolution, Suiça
Swiss Institute of Bioinformatics, Suiça
2010/06/01 - 2012/12/31 Postdoctoral Associate Rutgers University Department of Genetics, Estados Unidos
2006/01/01 - 2010/04/09 PhD. Student Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2022/01/01 - 2024/12/31 HYBRIDOMICS: Can hybridization fuel adaptation and species response to environmental change? Genomics and proteomics of endemic Iberian freshwater fish
PTDC/BIA-EVL/4345/2021
Investigador responsável
Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal

Instituto Universitário de Ciências Psicológicas Sociais e da Vida, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2020/11/01 - 2023/10/31 Chance or curse? The consequences of hybridization in a changing world
RGY0081/2020
Investigador responsável
Human Frontier Science Program
Em curso
2018/12 - 2022/11 Transgenerational acclimation of temperate fish species to climate change.
Provided by PTCRIS: PTDC/BIA-BMA/28647/2017
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2018/10 - 2022/09 Evolution of harmful algae blooms under ocean acidification and the cascading effects on coastal food-web dynamics
Provided by PTCRIS: PTDC/BIA-BMA/28317/2017
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2013/05 - 2016/02 A vertebrate's eye view on habitat loss and fragmentation across time and space in Madagascar
Provided by PTCRIS: PTDC/BIA-BIC/4476/2012
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2012/09 - 2015/12 Genetic basis of adaptive change: the demographic and selective history of camouflaged deer mouse populations
info:eu-repo/grantAgreement/SNSF/Programmes/CRSII3_141940/CH
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
2010/03 - 2013/05 Genetic effects of habitat loss and fragmentation: comparative analysis of several lemur species in two neighbouring regions of Madagascar.
Provided by PTCRIS: PTDC/BIA-BEC/100176/2008
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2008/01 - 2011/04 Evolutionary processes in the origin of “hotspots for biodiversity”: insights from southern Portuguese areas based on novel nuclear multilocus approaches in target freshwater fishes and amphibians
Provided by PTCRIS: PTDC/BIA-BDE/69769/2006
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
2008/01 - 2011/03 GENESTREAM. Landscape genetics of freshwater fishes: the geographical dimension of genetic diversity
Provided by PTCRIS: PTDC/BIA-BDE/66519/2006
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
2006/01/01 - 2009/12/31 ADMIXTURE MODELS AND RECONSTRUCTION OF DEMOGRAPHIC HISTORY OF POPULATIONS BASED ON GENETIC DATA – AN APPROXIMATE BAYESIAN COMPUTATION INFERENCE APPROACH
SFRH/BD/22224/2005
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2020 - Atual Molecular plasticity under climate change: Integrating transcriptomics and quantitative proteomics to better understand the response of two Iberian freshwater fish to heat and pH stress
EPIC-XS 0000238
Investigador
Centro de Ciências do Mar e do Ambiente, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
EU Framework Programme for Research and Innovation Euratom
Em curso
2023/09/01 - 2026/08/31 O impacto das altas temperaturas na adaptação de uma praga agrícola a ambientes com pesticida e novas culturas
2022.04172.PTDC
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31 CHANGE - Instituto para as Alterações Globais e Sustentabilidade
LA/P/0121/2020
Universidade do Algarve, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal

Universidade de Évora, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Centro de Investigação em Ambiente e Sustentabilidade, Portugal

Universidade NOVA de Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/01/15 - 2025/01/14 The role of chromosomal inversions in adaptation and reproductive isolation across the speciation continuum
PTDC/BIA-EVL/1614/2021
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Vigo Facultade de Bioloxía, Espanha

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/01/01 - 2024/12/31 Phenotypic plasticity in multifactorial environments
PTDC/BIA-EVL/0321/2021
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2023/03/01 - 2024/08/31 Interactions between mechanisms of reproductive isolation
2022.03475.PTDC
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/04/15 - 2023 Ecological speciation and heterogeneous genomic differentiation in hybridizing haplodiploids
1750946
Investigador
Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
National Science Foundation
Em curso
2019/01/01 - 2019/12/31 Centro de Ecologia, Evolução e Alterações Ambientais
UID/BIA/00329/2019
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018/03/01 - 2019/11/30 MAPGenome - Mapping migration and adaptation in genomes
799729
Investigador responsável
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal
EU Framework Programme for Research and Innovation Marie Sklodowska-Curie Actions
Concluído
2017/02/01 - 2019/01 Genome Odyssey. To the heart of Aboriginal Australian genes.
info:eu-repo/grantAgreement/SNSF/Science communication/CRAGP3_171636/CH
Investigador
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
2013 - 2016 Investigating the impact of range expansions on functional genomic diversity by modeling and experimental approaches
Investigador Pós-doutorado
Universität Bern Institut für Ökologie und Evolution, Suiça
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
2010/03/01 - 2013/05/31 Genetic effects of habitat loss and fragmentation: comparative analysis of several lemur species in two neighbouring regions of Madagascar.
PTDC/BIA-BEC/100176/2008
Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal

Evolution et diversité biologique, França

Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

University of Reading, Reino Unido
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/05/01 - 2012/12/31 Statistical Inference under Isolation-with-Migration Models
Investigador Pós-doutorado
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
2010/05/01 - 2012/08/31 The Population Genetics of Divergence
info:eu-repo/grantAgreement/NIH/NATIONAL INSTITUTE OF GENERAL MEDICAL SCIENCES/5R01GM078204-08/US
Investigador Pós-doutorado
Rutgers The State University of New Jersey, Estados Unidos
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung
Concluído
2008/01/02 - 2011/12/31 Demographic and genetic responses to habitat fragmentation and habitat loss in large forest mammals
PTDC/BIA-BDE/71299/2006
Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal

Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

Evolution et diversité biologique, França
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/02 - 2011/04/01 Evolutionary processes in the origin of “hotspots for biodiversity”: insights from southern Portuguese areas based on novel nuclear multilocus approaches in target freshwater fishes and amphibians
PTDC/BIA-BDE/69769/2006
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Perea, Silvia; Gama, M; Mendes, Sofia L; Sousa-Santos, Carla; Banha, Filipe; Garcia, Maria; Gonzalez, M; et al. "Sophie's choice: which population to preserve under a scenario of global change and extinction". Trabalho apresentado em World Congress of Malacology 2022, Munich, 2022.
    Publicado
Artigo em revista
  1. João Carvalho; Hernán E. Morales; Rui Faria; Roger K. Butlin; Vítor C. Sousa. "Integrating Pool-seq uncertainties into demographic inference". Molecular Ecology Resources (2023): https://doi.org/10.1111/1755-0998.13834.
    10.1111/1755-0998.13834
  2. João Carvalho; Rui Faria; Roger K. Butlin; Vitor C. Sousa. "poolHelper: An R package to help in designing Pool-Seq studies". Methods in Ecology and Evolution (2023): https://doi.org/10.1111/2041-210X.14185.
    10.1111/2041-210X.14185
  3. Pierre Nouhaud; Simon H. Martin; Beatriz Portinha; Vitor C. Sousa; Jonna Katharina Kulmuni. "Rapid and predictable genome evolution across three hybrid ant populations". PLOS Biology 20 12 (2022): e3001914-e3001914. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.3001914.
    10.1371/journal.pbio.3001914
  4. Perea, S.; Mendes, S. L.; Sousa-Santos, C.; Ondina, P.; Amaro, R.; Castro, J.; San-Miguel, E.; et al. "Applying genomic approaches to delineate conservation strategies using the freshwater mussel Margaritifera margaritifera in the Iberian Peninsula as a model". Scientific Reports 12 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-20947-5.
    Publicado • 10.1038/s41598-022-20947-5
  5. Portinha, Beatriz; Avril, Amaury; Bernasconi, Christian; Helanterä, Heikki; Monaghan, Josie; Seifert, Bernhard; Sousa, Vitor C; Kulmuni, Jonna; Nouhaud, Pierre. "Whole-genome analysis of multiple wood ant population pairs supports similar speciation histories, but different degrees of gene flow, across their European ranges". Molecular Ecology 31 12 (2022): 3416-3431. http://dx.doi.org/10.1111/mec.16481.
    Publicado • 10.1111/mec.16481
  6. Bendall, Emily E.; Bagley, Robin K.; Sousa, Vitor C.; Linnen, Catherine R.. Autor correspondente: Sousa, Vitor C.. "Faster-haplodiploid evolution under divergence-with-gene-flow: simulations and empirical data from pine-feeding hymenopterans". Molecular Ecology (2022): http://dx.doi.org/10.1111/mec.16410.
    10.1111/mec.16410
  7. Sofia L. Mendes; Miguel P. Machado; Maria M. Coelho; Vitor C. Sousa; Mendes, Sofia L.; Machado, Miguel P.; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor C.. "Genomic data and multi-species demographic modelling uncover past hybridization between currently allopatric freshwater species". Heredity (2021): https://doi.org/10.1038/s41437-021-00466-1.
    10.1038/s41437-021-00466-1
  8. Laurent Excofffier; Nina Marchi; David Alexander Marques; Remi Matthey-Doret; Alexandre Gouy; Vitor C Sousa. "fastsimcoal2: demographic inference under complex evolutionary scenarios". Bioinformatics 37 24 (2021): 4882-4885. https://publons.com/publon/49321363/.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAB468
  9. Moreno, João M.; Jesus, Tiago F.; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor C.; Moreno, Joao M.. "Adaptation and convergence in circadian-related genes in Iberian freshwater fish". BMC Ecology and Evolution 21 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1186/s12862-021-01767-z.
    Publicado • 10.1186/s12862-021-01767-z
  10. Clemente, Florian; Unterlaender, Martina; Dolgova, Olga; Amorim, Carlos Eduardo G.; Coroado-Santos, Francisco; Neuenschwander, Samuel; Ganiatsou, Elissavet; et al. "The genomic history of the Aegean palatial civilizations". Cell (2021): https://publons.com/publon/46537631/.
    10.1016/J.CELL.2021.03.039
  11. Marques, David A.; Lucek, Kay; Sousa, Vitor C.; Excoffier, Laurent; Seehausen, Ole; David A. Marques; Kay Lucek; et al. "Reply to "Re-evaluating the evidence for facilitation of stickleback speciation by admixture in the Lake Constance basin"". Nature Communications 12 1 (2021): https://publons.com/publon/47877721/.
    10.1038/S41467-021-23096-X
  12. David A. Marques; Kay Lucek; Vitor C. Sousa; Laurent Excoffier; Ole Seehausen; Marques, David A.; Lucek, Kay; et al. "Admixture between old lineages facilitated contemporary ecological speciation in Lake Constance stickleback". Nature Communications 10 1 (2019): https://doi.org/10.1038/s41467-019-12182-w.
    10.1038/s41467-019-12182-w
  13. Seabra, Sofia G.; Silva, Sara E.; Nunes, Vera L.; Sousa, Vitor C.; Martins, Joana; Marabuto, Eduardo; Rodrigues, Ana S. B.; et al. "Genomic signatures of introgression between commercial and native bumblebees, Bombus terrestris , in western Iberian Peninsula-Implications for conservation and trade regulation". Evolutionary Applications (2019): http://dx.doi.org/10.1111/eva.12732.
    Publicado • 10.1111/eva.12732
  14. Sousa, Vitor C.; Zele, Flore; Rodrigues, Leonor R.; Godinho, Diogo P.; de la Masseliere, Maud Charlery; Magalhaes, Sara. "Rapid host-plant adaptation in the herbivorous spider mite Tetranychus urticae occurs at low cost". Current Opinion in Insect Science (2019): https://publons.com/publon/20788702/.
    10.1016/J.COIS.2019.08.006
  15. Kuhlwilm, Martin; Han, Sojung; Sousa, Vitor C.; Excoffier, Laurent; Marques-Bonet, Tomas; Sousa, Vitor. "Ancient admixture from an extinct ape lineage into bonobos". Nature Ecology & Evolution (2019): https://publons.com/publon/20826037/.
    Aceite para publicação • 10.1038/S41559-019-0881-7
  16. Sikora, Martin* (shared first author); Pitulko, Vladimir V.*; Sousa, Vitor C.*; Allentoft, Morten E.*; Vinner, Lasse; Rasmussen, Simon; Margaryan, Ashot; et al. "The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene". Nature (2019): https://publons.com/publon/17167084/.
    10.1038/S41586-019-1279-Z
  17. Pfeifer, Susanne P* (shared first); Laurent, Stefan*; Sousa, Vitor C*; Linnen, Catherine R*; Foll, Matthieu; Excoffier, Laurent; Hoekstra, Hopi E; et al. "The Evolutionary History of Nebraska Deer Mice: Local Adaptation in the Face of Strong Gene Flow". Molecular Biology and Evolution 35 4 (2018): 792-806. https://doi.org/10.1093/molbev/msy004.
    Publicado • 10.1093/molbev/msy004
  18. Jody Hey; Yujin Chung; Arun Sethuraman; Joseph Lachance; Sarah Tishkoff; Vitor C Sousa; Yong Wang; et al. "Phylogeny Estimation by Integration over Isolation with Migration Models". Molecular Biology and Evolution 35 11 (2018): 2805-2818. https://publons.com/publon/2343830/.
    Publicado • 10.1093/MOLBEV/MSY162
  19. Martin Sikora *(shared first); Andaine Seguin-Orlando*; Vitor C. Sousa; Anders Albrechtsen; Thorfinn Korneliussen; Amy Ko; Simon Rasmussen; et al. "Ancient genomes show social and reproductive behavior of early Upper Paleolithic foragers". Science 358 6363 (2017): 659-662. https://doi.org/10.1126/science.aao1807.
    Publicado • 10.1126/science.aao1807
  20. Seabra, Sofia G; Fragata, Inês; Antunes, Marta A; Faria, Gonçalo S; Santos, Marta A; Sousa, Vitor C; Simões, Pedro; et al. "Different Genomic Changes Underlie Adaptive Evolution in Populations of Contrasting History". Molecular Biology and Evolution 35 3 (2017): 549-563. http://dx.doi.org/10.1093/molbev/msx247.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1093/molbev/msx247
  21. Robin K. Bagley; Vitor C. Sousa; Matthew L. Niemiller; Catherine R. Linnen. "History, geography and host use shape genomewide patterns of genetic variation in the redheaded pine sawfly (Neodiprion lecontei)". Molecular Ecology 26 4 (2017): 1022-1044. https://doi.org/10.1111/mec.13972.
    Publicado • 10.1111/mec.13972
  22. Meier, Joana I.; Sousa, Vitor C.; Marques, David A.; Selz, Oliver M.; Wagner, Catherine E.; Excoffier, Laurent; Seehausen, Ole. "Demographic modelling with whole-genome data reveals parallel origin of similar Pundamilia cichlid species after hybridization". Molecular Ecology 26 1 (2017): 123-141. https://doi.org/10.1111/mec.13838.
    Publicado • 10.1111/mec.13838
  23. Malaspinas, Anna-Sapfo* (*shared first author); Westaway, Michael C.*; Muller, Craig*; Sousa, Vitor C.*; Lao, Oscar*; Alves, Isabel*; Bergström, Anders*; et al. "A genomic history of Aboriginal Australia". Nature 538 7624 (2016): 207-214. http://dx.doi.org/10.1038/nature18299.
    Publicado • 10.1038/nature18299
  24. de Manuel, Marc* (shared first author); Kuhlwilm, Martin; Frandsen, Peter*; Sousa, Vitor C.; Desai, Tariq; Prado-Martinez, Javier; Hernandez-Rodriguez, Jessica; et al. "Chimpanzee genomic diversity reveals ancient admixture with bonobos". Science 354 6311 (2016): 477-481. http://science.sciencemag.org/content/354/6311/477.
    Publicado • 10.1126/science.aag2602
  25. Foote, A.D.; Vijay, N.; ?vila-Arcos, M.C.; Baird, R.W.; Durban, J.W.; Fumagalli, M.; Gibbs, R.A.; et al. "Genome-culture coevolution promotes rapid divergence of killer whale ecotypes". Nature Communications 7 (2016): https://www.nature.com/articles/ncomms11693.
    Publicado • 10.1038/ncomms11693
  26. Alves, I.; Arenas, M.; Currat, M.; Hanulova, A.S.; Sousa, V.C.; Ray, N.; Excoffier, L.. "Long-distance dispersal shaped patterns of human genetic diversity in Eurasia". Molecular Biology and Evolution 33 4 (2016): 946-958. https://doi.org/10.1093/molbev/msv332.
    Publicado • 10.1093/molbev/msv332
  27. Laurent, S.; Pfeifer, S.P.; Settles, M.L.; Hunter, S.S.; Hardwick, K.M.; Ormond, L.; Sousa, V.C.; Jensen, J.D.; Rosenblum, E.B.. "The population genomics of rapid adaptation: Disentangling signatures of selection and demography in white sands lizards". Molecular Ecology 25 1 (2016): 306-323. https://doi.org/10.1111/mec.13385.
    Publicado • 10.1111/mec.13385
  28. Sousa, V. C. ; Peischl, S.; Excoffier, L.. "Impact of range expansions on current human genomic diversity". Current Opinion in Genetics and Development 29 (2014): 22-30. https://doi.org/10.1016/j.gde.2014.07.007.
    Publicado • 10.1016/j.gde.2014.07.007
  29. V. C. Sousa; M. Carneiro; N. Ferrand; J. Hey. "Identifying Loci Under Selection Against Gene Flow in Isolation-with-Migration Models". Genetics 194 1 (2013): 211-233. http://dx.doi.org/10.1534/genetics.113.149211.
    Publicado • 10.1534/genetics.113.149211
  30. Sousa, V. C. ; Hey, J.. "Understanding the origin of species with genome-scale data: Modelling gene flow". Nature Reviews Genetics 14 6 (2013): 404-414. https://www.nature.com/articles/nrg3446.
    Publicado • 10.1038/nrg3446
  31. Excoffier, L.; Dupanloup, I.; Huerta-Sánchez, E.; Sousa, V.C.; Foll, M.. "Robust Demographic Inference from Genomic and SNP Data". PLoS Genetics 9 10 (2013): https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003905.
    Publicado • 10.1371/journal.pgen.1003905
  32. Jordi Salmona; Marc Salamolard; Damien Fouillot; Thomas Ghestemme; Jerry Larose; Jean-François Centon; Vitor C. Sousa; et al. "Signature of a Pre-Human Population Decline in the Critically Endangered Reunion Island Endemic Forest Bird Coracina newtoni". PLoS ONE 7 8 (2012): e43524-e43524. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0043524.
    Publicado • 10.1371/journal.pone.0043524
  33. Rasteiro, R.; Bouttier, P.A.; Sousa, V.C.; Chikhi, L.. "Investigating sex-biased migration during the Neolithic transition in Europe, using an explicit spatial simulation framework.". Proceedings. Biological sciences / The Royal Society 279 1737 (2012): 2409-2416. https://doi.org/10.1098/rspb.2011.2323.
    Publicado • 10.1098/rspb.2011.2323
  34. Sousa, V.C.; Beaumont, M.A.; Fernandes, P.; Coelho, M.M.; Chikhi, L.. "Population divergence with or without admixture: Selecting models using an ABC approach". Heredity 108 5 (2012): 521-530. https://www.nature.com/articles/hdy2011116.
    Publicado • 10.1038/hdy.2011.116
  35. Sousa, V.C.; Grelaud, A.; Hey, J.. "On the nonidentifiability of migration time estimates in isolation with migration models". Molecular Ecology 20 19 (2011): 3956-3962. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2011.05247.x.
    Publicado • 10.1111/j.1365-294X.2011.05247.x
  36. T. C. BRAY *(shared first author); V. C. SOUSA*; B. PARREIRA; M. W. BRUFORD; L. CHIKHI. "2BAD: an application to estimate the parental contributions during two independent admixture events". Molecular Ecology Resources 10 3 (2010): 538-541. http://dx.doi.org/10.1111/j.1755-0998.2009.02766.x.
    Publicado • 10.1111/j.1755-0998.2009.02766.x
  37. V. C. Sousa; F. Penha; I. Pala; L. Chikhi; M. M. Coelho. "Conservation genetics of a critically endangered Iberian minnow: evidence of population decline and extirpations". Animal Conservation 13 2 (2010): 162-171. http://dx.doi.org/10.1111/j.1469-1795.2009.00317.x.
    Publicado • 10.1111/j.1469-1795.2009.00317.x
  38. Chikhi, L.; Sousa, V.C.; Luisi, P.; Goossens, B.; Beaumont, M.A.. "The confounding effects of population structure, genetic diversity and the sampling scheme on the detection and quantification of population size changes". Genetics 186 3 (2010): 983-995. https://doi.org/10.1534/genetics.110.118661.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1534/genetics.110.118661
  39. Henriques, R.; Sousa, V.; Coelho, M.M.. "Migration patterns counteract seasonal isolation of Squalius torgalensis, a critically endangered freshwater fish inhabiting a typical Circum-Mediterranean small drainage". Conservation Genetics 11 5 (2010): 1859-1870. https://link.springer.com/article/10.1007/s10592-010-0078-8.
    Publicado • 10.1007/s10592-010-0078-8
  40. B. PARREIRA; M. TRUSSART; V. SOUSA; R. HUDSON; L. CHIKHI. "SPAms: A user-friendly software to simulate population genetics data under complex demographic models". Molecular Ecology Resources 9 3 (2009): 749-753. http://dx.doi.org/10.1111/j.1755-0998.2009.02533.x.
    Publicado • 10.1111/j.1755-0998.2009.02533.x
  41. V. C. Sousa; M. Fritz; M. A. Beaumont; L. Chikhi. "Approximate Bayesian Computation Without Summary Statistics: The Case of Admixture". Genetics 181 4 (2009): 1507-1519. http://dx.doi.org/10.1534/genetics.108.098129.
    Acesso aberto • Publicado • 10.1534/genetics.108.098129
  42. Mathias Craul; Lounes Chikhi; Vitor Sousa; Gillian L. Olivieri; Andriatahiana Rabesandratana; Elke Zimmermann; Ute Radespiel. "Influence of forest fragmentation on an endangered large-bodied lemur in northwestern Madagascar". Biological Conservation 142 12 (2009): 2862-2871. http://dx.doi.org/10.1016/j.biocon.2009.05.026.
    Publicado • 10.1016/j.biocon.2009.05.026
  43. Gillian L. Olivieri; Vitor Sousa; Lounès Chikhi; Ute Radespiel. "From genetic diversity and structure to conservation: Genetic signature of recent population declines in three mouse lemur species (Microcebus spp.)". Biological Conservation 141 5 (2008): 1257-1271. http://dx.doi.org/10.1016/j.biocon.2008.02.025.
    Publicado • 10.1016/j.biocon.2008.02.025
  44. Sousa, V.; Penha, F.; Collares-Pereira, M.J.; Chikhi, L.; Coelho, M.M.. "Genetic structure and signature of population decrease in the critically endangered freshwater cyprinid Chondrostoma lusitanicum". Conservation Genetics 9 4 (2008): 791-805. https://link.springer.com/article/10.1007/s10592-007-9399-7.
    Publicado • 10.1007/s10592-007-9399-7
Documento de trabalho
  1. Sethuraman, Arun; Sousa, Vitor; Hey, Jody; Sousa, Vitor C. 2019. "Model-based assessments of differential introgression and linked natural selection during divergence and speciation". https://doi.org/10.1101/786038.
    https://doi.org/10.1101/786038
Poster em conferência
  1. Moreno, João M; Grossman, Jonas; Kunz, Laura; Sousa, Vitor; Santos, Romana. "Proteome and phosphoproteome reveal differences in phenotypic plasticity in fish under different scenarios of climate change". Trabalho apresentado em Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) 2023 Meeting, 2023.
  2. Conceição, Andreia; Neves, Maria; Fonseca, Inês; Ribeiro, Vanessa; Martins, Susana G; Luiz, Hugo; Thorsteinsdottir, Solveig; et al. Autor correspondente: Carlos, Ana Rita. "Analyzing the impact of air pollution and changes in ECM in melanoma". Trabalho apresentado em Jornadas Cientificas da ULisboa, 2023.
  3. Moreno, João M; Mendes, Sofia L; Sousa-Santos, Carla; Sousa, Vitor C. "Thermal tolerance in Iberian freshwater fish in face of climate change". Trabalho apresentado em FSBI 2022 Annual Symposium: Fish in a Dynamic World, 2022.
  4. Cruz, Miguel A.; Sousa, Vitor C; Magalhães, Sara; Zélé, Flore. "Evolution in sympatry did not increase avoidance of reproductive interference between closely related spider mites". Trabalho apresentado em XVII ENBE: Annual Meeting of the Portuguese Association for Evolutionary Biology, 2021.
  5. Moreno, João M; Santos, Romana; Sousa, Vitor. "Uncovering the molecular basis of adaptation in species distributed along a climatic gradient: linking genomes and proteins to environment". Trabalho apresentado em EMBO | EMBL Symposium: Multiomics to Mechanisms - Challenges in Data Integration, 2021.
  6. Moreno, João M; Mendes, Sofia L; Sousa, Vitor; Coelho, Maria M.. "Demographic history and molecular adaptation in western Iberian freshwater fish". Trabalho apresentado em 8th Congress of the Italian Society for Evolutionary Biology, 2019.
  7. Ramírez, Carlos R; Moreno, João M; Sousa, Vitor; Coelho, Maria M. "Transcriptomes from four Iberian Squalius fish species indicate stronger positive selection in Mediterranean climate type". Trabalho apresentado em The 2019 Congress of the European Society for Evolutionary Biology, 2019.
  8. Moreno, João M; Sousa, Vitor; Coelho, Maria M. "Protein analysis as a tool to expose signals of evolutionary adaptation". Trabalho apresentado em Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) 2019 Meeting, 2019.
  9. Mendes, Sofia L; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor. "Multi-species demographic modelling uncovers past introgression between currently allopatric freshwater species". Trabalho apresentado em Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) 2019 Meeting, 2019.
  10. Mendes, Sofia L; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor. "Evidence for past introgression between western Iberian freshwater fish species". Trabalho apresentado em Fronteirs in E3: 5th cE3c Annual Meeting, 2019.
  11. Mendes, Sofia L; Coelho, Maria M.; Sousa, Vitor. "Exploring the construction of a SNP dataset based on Genotyping by Sequencing (GBS) for four Iberian freshwater fish species". Trabalho apresentado em Frontiers in E3: 4th cE3c Annual Meeting, 2018.
  12. Carvalho, João; Morales, Hernán; Faria, Rui; Butlin, RK; Sousa, Vitor. "Genomics of ecotype formation in Littorina saxatilis". Trabalho apresentado em Encontro FCT Ciência, 2018.
Pré-impressão
  1. Miguel A. Cruz; Oscar Godoy; Inês Fragata; Vitor C. Sousa; Sara Magalhães; Flore Zélé. "Sex in the kitchen: non-additive effects of competition for food and reproductive interference on coexistence outcomes between closely related species". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.11.09.566372.
    10.1101/2023.11.09.566372
  2. João Carvalho; Rui Faria; Roger K. Butlin; Vítor C. Sousa. "Parallel evolution of local adaptation inLittorina saxatilisinferred with whole-genome pool-seq data". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.09.18.558243.
    10.1101/2023.09.18.558243
  3. Marques, João Pedro; Alves, Paulo Célio; Amorim, Isabel R.; Lopes, Ricardo J.; Moura, Mónica; Meyers, Gene; Sim-Sim, Manuela; et al. "Building a Portuguese Coalition for Biodiversity Genomics". 2023. http://dx.doi.org/10.32942/x20w3q.
    10.32942/x20w3q
  4. João Carvalho; Rui Faria; Roger K. Butlin; Vítor C. Sousa. "poolHelper: an R package to help in designing Pool-Seq studies". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.01.20.524733.
    10.1101/2023.01.20.524733
  5. Pierre Nouhaud; Simon H. Martin; Beatriz Portinha; Vitor C. Sousa; Jonna Kulmuni. "Rapid and repeatable genome evolution across three hybrid ant populations". 2022. https://doi.org/10.1101/2022.01.16.476493.
    10.1101/2022.01.16.476493
  6. João M Moreno; Tiago F Jesus; Maria M Coelho; Vitor C Sousa. "Adaptation and convergence in circadian-related genes in Iberian freshwater fish". 2021. https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-37976/v2.
    10.21203/rs.3.rs-37976/v2
Tese / Dissertação
  1. Sousa, Vítor Martins Conde e, 1981-; Coelho, Maria Manuela, 1954-; Chikhi, Lounès. "Inference of admixture and population size changes in structured populations with applications to conservation genetics". Doutoramento, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2009. http://catalogo.ul.pt/F/?func=item-global&doc_library=ULB01&type=03&doc_number=000578999.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2007 Since 2007, I have been invited to give more than 20 seminars in portuguese and international universities, including City University of New York (USA), Federal University of Rio Grande do Sul (Brazil), Aarhus University (Denmark), University Fribourg (Switzerland), UTAD (Portugal). You can find mdetails in my CV: https://www.dropbox.com/s/29rccbwfsv7ddz4/CienciaVitae_VitorSousa.pdf?dl=1
2007 Since 2007 I had 16 oral communications at national and international conferences, including the meetings of the European Society of Evolutionary Biology (ESEB), Evolution Society (Evolution), and Society of Molecular Biology and Evolution (SMBE). You can find more details in my CV: https://www.dropbox.com/s/29rccbwfsv7ddz4/CienciaVitae_VitorSousa.pdf?dl=1

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2020/02/01 - Atual Uncovering the molecular basis of adaptation in species distributed along a climatic gradient: linking genomes and proteins to environment
Orientador
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/12/01 - Atual The role of hybridization in speciation and adaptation: insights from Iberian freshwater fish species
Orientador
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/09/01 - Atual Genomic map of the past: Reconstructing the demographic history of wood ant species and their hybrids
Orientador
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018 - Atual The impact of ecological specialization, reproductive interference and reproductive isolation on the outcome of competition between spider-mite populations
Coorientador
2022 - 2022 Uncovering the interactions between deleterious mutations, divergent selection and migration
Orientador
Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021 - 2021 Genomic map of the past: Reconstructing the demographic history of wood ant species and their hybrids
Orientador
Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021 - 2021 The role of hybridization in speciation and adaptation: insights from Iberian freshwater fish species
Orientador
Biologia (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2021 - 2021 Uncovering the molecular basis of adaptation in species distributed along a climatic gradient: linking genomes and proteins to environment
Orientador
Biologia (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/09/01 - 2019/03/22 Transcriptome-wide signatures of molecular adaptation in a group of portuguese freshwater fish
Coorientador
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - 2019 Peopling of greek islands: understanding the Bronze Age transition with ancient genomes
Orientador
Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - 2019 The genomic impact of deleterious mutations in isolation with migration models
Orientador
Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/09/01 - 2018/12 The population genomics of Squalius species: a genotyping by sequencing approach
Orientador
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018 - 2018 "Genomics of ecotype formation: interplay between demographic processes and natural selection"
Orientador
Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2023/12/18 - 2023/12/19 XIX ENBE Annual Meeting of the Portuguese Association for Evolutionary Biology (2023/12/18 - 2023/12/19)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
2021/12/16 - 2021/12/17 XVII ENBE Annual Meeting of the Portuguese Association for Evolutionary Biology (2021/12/16 - 2021/12/17)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2010/01 - Atual Outreach Activities: Since 2010 that I have been involved in several outreach activities, targeted for a general audience, children, high school teachers, etc. Please find details here: https://www.dropbox.com/s/29rccbwfsv7ddz4/CienciaVitae_VitorSousa.pdf?dl=1
Outro

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação
Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2024/01/11 Delving into the Depths: Unraveling Cetacean's Evolution through Gene Loss and Population Genomics
Arguente principal
Raul Fonseca Valente (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2022/11/10 Habitat loss and fragmentation: effects on genetic diversity and differentiation
Arguente
Gabriele Maria Sgarlata (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2022/04/19 Using genomic tools to understand species differentiation and admixture in hares and mice
Arguente
João Pedro Nogueira Marques (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2021/03/02 The evolution and molecular bases of seasonal coat color variation in hares: gene expression and the shared contribution of ancestral polymorphism and introgression
Arguente
Ana Mafalda Sousa Ferreira (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2021/02/21 Combining phylogeny, systematics and ecology to advance the conservation of freshwater mussels (Bivalvia: Unionida)
Arguente
Manuel Peixoto de Magalhães Lopes Lima (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/12/17 Evolutionary genetics of balanced polymorphisms in wall lizards
Arguente
Pedro Alexandre de Magalhães e Andrade (Doutoramento)
2019/07/01 Genetic diversity, origin, and conservation of Arabian Native Domestic Ruminants (Goat and Sheep)
Arguente
Nasser Ali Thabit Al Araimi (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/06/04 Stability, Robustness, and Phenotype Accessibility in Boolean Gene Regulatory Networks
Arguente principal
Ricardo Nuno Silva Moura Pinho (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2018/12/19 Gene expression regulation in allopolyploid fish
Arguente
Isa Maria Nunes de Matos (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2018/12/11 Human Migrations and Population Dynamics in the Western Mediterranean: from the Neolithic to the present
Arguente principal
João Carlos Ramos de Azevedo Pimenta (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2018/12/09 Understanding speciation: a multidisciplinary assessment of hybrid zones using a lizard species complex as model
Arguente
Guilherme Miguel Caeiro Dias (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2018/07 Evolutionary history of sympatric Rainbow Skinks from the Australian Monsoonal Tropics
Arguente principal
Ana Catarina Afonso Silva (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/04/05 The role of inter-island gene-flow during colonization and speciation processes on archipelagos: analysis of the Micromeria Benth. (Lamiaceae) on the Canary Islands
Arguente
Manuel António Cardoso Curto (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2011 Responses of congeneric freshwater fish, Squalius carolitertii and Squalius torgalensis, to future climate change. A molecular and physiological approach
Arguente
Tiago Filipe Salgueiro de Jesus (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em conferência

Nome da conferência Local da conferência
2018/05 - 2018/10 XIV National meeting of Evolutionary Biology Museu Nacional de História Natural e da Ciência
2017/05 - 2017/12 A decade integrating biology (in) research and training: 10 years of the Master in Evolutionary and Developmental Biology Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2010 - 2019 Since 2010, I have reviewed more than 50 articles for more than 25 journals. Please check my Publons profile for details: https://publons.com/author/1489534/vitor-sousa#profile

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria
Instituição / Organização Entidade financiadora
2020/04/01 - 2020/04/15 Reviewer for NERC Standard Grants, UK
Avaliador
2019 - 2019 Reviewer for Wellcome Trust Investigator Award in Science
Avaliador
2017 - 2017 Reviewer for project grants of SNSF – Swiss National Science Foundation.
Avaliador
Schweizerischer Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung, Suiça

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2019/10/01 - Atual Population Genomics (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019/09/01 - Atual Experimental Design (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/09 - 2019/09 Introduction to R programming and analyses (Bachelor) Universität Bern, Suiça
2017/02 - 2019/07 Aplicações Avançadas em Biologia Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/02 - 2019/04 Evolutionary Genetics Master in Bioinformatics and Computational Biology (Master) Universität Bern Institut für Ökologie und Evolution, Suiça
2017/09 - 2019/02 Estudos Complementares em Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento I: Genómica populacional Mestrado em Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2017/09 - 2019/02 Estudos Complementares em Biologia Integrativa I: R Mestrado em Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Entrevista / Programa (rádio / tv)

Programa Tema
2016/01/01 - Atual Since 2016 I gave four interviews at generalist radio stations about my research. Please find details here: https://www.dropbox.com/s/29rccbwfsv7ddz4/CienciaVitae_VitorSousa.pdf?dl=1

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2021/01/01 - Atual European Reference Genome Atlas (ERGA) National representative at ERGA council
2018/10 - Atual Associação Portuguesa de Biologia Evolutiva Vice-Presidente da Direção
2013 - Atual Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE)
2010 - Atual European Society for Evolutionary Biology (ESEB)

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2014 - 2016 Mentor of PhD student: Inferring admixture with genomic data (RADseq) David Marques
2014 - 2016 Mentor of PhD student: Modeling speciation with gene flow from genomes. Joana Meier
2014 - 2016 Mentor of PhD student: Human genomics, Model-based inference. Isabel Alves
Distinções

Outra distinção

2023 ERC Consolidator Grant Proposal - Score A after interview but not funded
2019 Research Associate - CEEC (CEECIND/02391/2017)
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2018 Marie Sklodowska-Curie Individual Fellowship (148,000 EUR)
2017 ERC Starting Grant proposal - Score A after interview, but not funded
2006 PhD fellowship SFRH/BD/22224/2005
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal