Pedro Daniel Geadas Farias (8E13-7136-F4AF)

Curriculum Vitae

Pedro Daniel Geadas Farias

Pedro Daniel Geadas Farias concluded is Ph.D. in Biosciences in 2022 in Faculty of sciences and Technology - University of Coimbra. He has 8 peer-review papers published in open access journals, morover he has participated in 6 conferences with oral comunications and an additional 10 conferences with posters. He has organized one intenational confeence on the field of microbiology and biotechnology along with smaller conferences, sebinars, webinars and outreach activities. he his a member of the Portuguese Microbiology society and the portuguese genetic society. He has participated as a researcher in 3 distinct hired projects, in a COST Action as an invited researcher and in 4 national and international projects as team member. His work focuses on the fields of Microbiology, Biotechnology, Environmental diversity and Biomaterial production.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Pedro Daniel Geadas Farias

Nomes de citação

Farias, Pedro

Identificadores de autor

Ciência ID: 8E13-7136-F4AF
ORCID iD: 0000-0002-5451-6374

Endereços de correio eletrónico

pfarias@.uc.pt (Profissional)

Telefones

Telefone

239240796 Ext.: 262296 (Profissional)

Moradas

Centre for Mechanical Engineering, Materials and Processes; University of Coimbra Departamento de Engenharia Mecânica Pinhal de Marrocos, 3030-788, Coimbra, Coimbra, Portugal (Profissional)

Domínios de atuação

Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador independente (B2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador independente (B2)

Formação

	Grau	Classificação
2016/09 - 2022/04/18 Concluído	Doutoramento em Biociências (Doutoramento) Especialização em Microbiologia Universidade de Coimbra, Portugal "New bacterial strategies for Tellurium bioleaching and high value nanoparticles production" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2013 Concluído	Mestrado Bioquímica (Mestrado) Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal "Gaining of join resistance to metals and antibiotics in deep sea bacteria " (TESE/DISSERTAÇÃO)	17.2
2011 Concluído	Licenciatura em Bioquímica (Licenciatura) Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal "n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)	13.167

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2023/04/24 - 2026/04/23	Investigador Contratado (Investigação)	Universidade de Coimbra, Portugal
	Universidade de Coimbra, Portugal
2021/10/01 - 2023/03/31	Investigador Contratado (Investigação)	Universidade de Coimbra, Portugal
	Universidade de Coimbra Centro de Engenharia Mecânica, Portugal
2016/11/01 - 2017/04/30	Investigador Contratado (Investigação)	Universidade de Coimbra, Portugal

2013/05/10 - 2016/05/09	Investigador Contratado (Investigação)	Instituto Piaget, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2016/05/15 - 2016/06/15	Organizer and promoter of event	IATV - Instituto do Ambiente Tecnologia e Vida, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2021/10/01 - Atual	UltraBot - Robô para desinfecção por radiação ultravioleta CENTRO-01-0247-FEDER-072644 Bolseiro de Mestrado Universidade de Coimbra, Portugal	Em curso
2016/05/01 - 2020/04/30	New bacterial strategies for Tellurium bioleaching and high value nanoparticles formation 821096 UIBD/0285/2020 Bolseiro de Doutoramento Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal	Concluído
2016/10/01 - 2017/04/30	PtW - Biotools for a sustainable supply of tungsten from biodetection to bioleaching and biorecovery PTDC/AAGREC/3839/2014 Bolseiro de Mestrado	Em curso

Projeto

	Designação	Financiadores
2022/11/01 - Atual	SUSTe - Development of SUStainable and integrative bioprocess for the recovery of TellurIum-based nanoparticles from photovoltaic wastes 706 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Universidade de Coimbra Centro de Engenharia Mecânica, Portugal Universidade de Coimbra Centro de Física, Portugal Universidade de Coimbra Centro de Investigação em Engenharia dos Processos Químicos e dos Produtos da Floresta, Portugal	Em curso
2023/04/19 - 2026/04/18	Agenda Mobilizadora para a inovação empresarial do setor das Duas Rodas C644866475-00000012 \| 7253 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal	Em curso
2015/06 - 2019/12	“BIOCriticalMetals-Recognition of microbial functional communities and assessment of the mineralizing potential (bioleaching) for high-tech critical metals” ERA-MIN/0002/2015 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal	Concluído
2017 - 2019	CRUP – Geomicrobiological tools for the recovery of resources from industrial residual fluxes A-02/17 Investigador	Concluído
2016 - 2019	Superficies antimicrobinas permanentes activadas pela luz"; project member PTDC/CTM-POL/6138/2014 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal	Concluído

Produções

Publicações

Artigo em revista	Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Morais, Paula V.. Autor correspondente: Morais, Paula V.. "Potential of tellurite resistance in heterotrophic bacteria from mining environments". iScience 25 7 (2022): 104566. http://dx.doi.org/10.1016/j.isci.2022.104566. Aceite para publicação • 10.1016/j.isci.2022.104566 Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Maccario, Lorrie; Herschend, Jakob; Piedade, Ana Paula; Sørensen, Søren; Morais, Paula V.. Autor correspondente: Morais, Paula V.. "Impact of Tellurite on the Metabolism of Paenibacillus pabuli AL109b With Flagellin Production Explaining High Reduction Capacity". Frontiers in Microbiology 12 (2021): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2021.718963. Publicado • 10.3389/fmicb.2021.718963 Sapkota, Rumakanta; Santos, Susana; Farias, Pedro; Krogh, Paul Henning; Winding, Anne. "Insights into the earthworm gut multi-kingdom microbial communities". Science of The Total Environment 727 (2020): 138301. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.138301. Publicado • 10.1016/j.scitotenv.2020.138301 Chung, Ana Paula; Coimbra, Carina; Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Branco, Rita; Simão, Francisco V.; Gomes, Elsa; et al. "Tailings microbial community profile and prediction of its functionality in basins of tungsten mine". Scientific Reports 9 1 (2019): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-55706-6. Publicado • 10.1038/s41598-019-55706-6 Coimbra C; Farias, Pedro; Branco R; Morais PV. "Tungsten accumulation by highly tolerant marine hydrothermal Sulfitobacter dubius strains carrying a tupBCA cluster.". Systematic and applied microbiology (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28802743. 10.1016/j.syapm.2017.06.005 Pedro Geadas Farias; Fernando Gama; Diogo Reis; Susana Alarico; Nuno Empadinhas; José Carlos Martins; Ana Figueiredo de Almeida; Paula Vasconcelos Morais. "Hospital microbial surface colonization revealed during monitoring of Klebsiella spp., Pseudomonas aeruginosa, and non-tuberculous mycobacteria". Antonie van Leeuwenhoek 110 7 (2017): 863-876. https://doi.org/10.1007%2Fs10482-017-0857-z. 10.1007/s10482-017-0857-z Farias P; Espírito Santo C; Branco R; Francisco R; Santos S; Hansen L; Sorensen S; Morais PV. "Natural hot spots for gain of multiple resistances: arsenic and antibiotic resistances in heterotrophic, aerobic bacteria from marine hydrothermal vent fields.". Applied and environmental microbiology (2015): http://europepmc.org/abstract/med/25636836. Publicado • 10.1128/aem.03240-14 de Abreu, Pedro; Farias, Pedro; Paiva, Gabriel; Almeida, Ana; Morais, Paula. "Persistence of microbial communities including Pseudomonas aeruginosa in a hospital environment: a potential health hazard". BMC Microbiology 14 1 (2014): 118. http://dx.doi.org/10.1186/1471-2180-14-118. Publicado • 10.1186/1471-2180-14-118
Poster em conferência	Farias, Pedro; Mendonça, Amanda; oliveira paulo v; Paula Maria de Melim Vasconcelos de Vitorino Morais. "Genome mining reveals potential of Pseudomonas sp strains for improved microbial induced calcium precipitation". Trabalho apresentado em Microbiotec23, 2023. Farias, Pedro; Li Xuang Ji; Sorensen, Soren J; Paula Maria de Melim Vasconcelos de Vitorino Morais. "Microbiome of hospital surfaces independent of Human occupation". Trabalho apresentado em FEMS23, 2023. Costa, Inês; Farias, Pedro; Helena Ribeiro; Paixão, José António; Branco, Rita; Pereira, Jorge Fernando Brandão. "Extraction and purification of tellurium nanoparticles from bacterial biomass using biosolvents". Trabalho apresentado em BPP 2022, 2022. Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Maccario, Lorrie; Herschend, Jakob; Piedade, Ana Paula; Sorensen, Soren J; Paula Maria de Melim Vasconcelos de Vitorino Morais. "High value tellurium nanoparticle formation by Paenibacillus pabuli". Trabalho apresentado em Microbiotec21, 2021. Farias, Pedro; Morais, Paula V.; Francisco, Romeu; Sorensen, Soren J. "Metabolic dynamics of Paenibacillus and Bacillus in response to tellurite". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2021, 2021. Farias, Pedro; Morais, Paula V.. "Yce operon arrangements to improve tellurite resistance and reduction in Bacillus strains". Trabalho apresentado em IMPSG2020, 2020. Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Sorensen, Soren J; Morais, Paula V.. "Proteomic to disentail the response to tellurite in highly metal resistant gram-positive bacteria". Trabalho apresentado em Microbiotec19, 2019. Lordelo, Roberta; Farias, Pedro; Branco, Rita; Gama, Fernando; Morais, Paula V.. "Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae traits may determine the presence of these species in the hospital microbiome". Trabalho apresentado em MIcrobiotec19, 2019. Lordelo, Roberta; Farias, Pedro; Gama, Fernando; Morais, Paula V.. "Bacterial Traits Defining the Hospital Microbiome". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2019, 2019. Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Morais, Paula V.. "Metabolic response to tellurite by environmental Bacillus". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2019, 2019. Farias, Pedro; Morais, Paula V.. "Bacterial tools for tellurium recovery and processing". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2018, 2018. Farias, Pedro; Paixão, José; Morais, Paula V.. "Bacterial consortium as a tool for increasing efficiency in tellurium bioleaching". Trabalho apresentado em Microbiotec17, 2017. Pereira, Sara Silva; Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Morais, Paula V.; Coimbra, Carina. "Innovative methodology to track bioleaching potential". Trabalho apresentado em Microbiotec17, 2017. Farias, Pedro; Paixão, José; Morais, Paula V.. "Bacterial consortium effectiveness on tellurium bioleaching". Trabalho apresentado em BioMicroWorld2017, 2017. Coimbra, Carina; Farias, Pedro; Branco, Rita; Paula Vasconcelos Morais. "Characterization of tungsten uptake in marine bacteria from hydrothermal vents". Trabalho apresentado em Microbiotec15, 2015. Farias, Pedro; Gama, Fernando; Reis, Diogo; Alarico, Susana; Empadinhas, Nuno; Martins, José Carlos; Almeida, Ana Maria; Morais, Paula V.. "Microbiome of non-critical hospital surfaces and equipment is an unseen ecosystem". Trabalho apresentado em Microbiotec15, 2015.
Resumo em conferência	Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Morais, Paula Vasconcelos. Autor correspondente: Farias, Pedro. "Bioleaching of mining residues using highly resistant bacterial strains (oral presentation)". Trabalho apresentado em Circular Economy: Make It Happen – Smart Waste Portugal (online), 2021. Publicado Farias, Pedro; Francisco, Romeu; Sorensen, Soren; Morais, Paula Vasconcelos. "Proteomic to disentail the response to tellurite in highly metal resistant gram-positive bacteria (oral and poster)". Trabalho apresentado em Microbiotec'19, University of Coimbra, Coimbra, Polo II., Coimbra, 2019. Publicado Espírito Santo, Christophe; Farias, Pedro; Hansen, Lars; Sorensen, Soren; Francisco, Romeu; Morais, P.V.. "Sequenced mobile elements from submarine hydrothermal vents include simultaneously genetic determinants for heavy metal and antibiotic resistance (oral presentation)". Trabalho apresentado em Microbiotec'13, Aveiro, 2013. Publicado Morais, Paula V.; Farias, Pedro; Santos, C.E; Branco, Rita; Francisco, Romeu. "Natural hotspots for multiple resistances gain: arsenic resistance in heterothrophic aerobic bacteria from marine hydrothermal vents". Trabalho apresentado em Microbiotec'13, Aveiro, 2013. Publicado
Tese / Dissertação	"New bacterial strategies for Tellurium bioleaching and high value nanoparticles production". Doutoramento, Universidade de Coimbra, 2022. http://hdl.handle.net/10316/100334. Farias, Pedro Daniel Geadas. "Gaining of join resistance to metals and antibiotics in deep sea bacteria". Mestrado, 2013. http://hdl.handle.net/10316/26071.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2022/10/11	Bacteria from mining environments: potential of tellurite resistance and reduction	Microbiologia 2022 (Portugal)
2021/07/07	Bioleaching of mining residues using highly resistant bacterial strains	Circular Economy: Make It Happen
2019/12/07	Proteomic to disentail the response to tellurite in highly metal resistant gram-positive bacteria	Microbiotec19 Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2018/05	Biomanufacturing: microbes beat factories	Environmentally sustainable process in critical metals recovery: bio (micro) technologies to support a circular economy of raw materials Universidade de Coimbra (Coimbra, Portugal)
2014/09/18	Microbiota of a Hospital's environment is composed by bacterial species usually not associated with this environments	TEMPH2014 Lisbon School of Health Technology (Lisboa, Portugal)
2013/12/06	Hospitals environmental microbial communities: a survey in two hospitals with different dimensions	Microbiotec13 Universidade Aveiro (Aveiro, Portugal)
2013/12/06	Sequenced mobile elements from submarine hydrothermal vents include simultaneously genetic determinants for heavy metal and antibiotic resistance	Microbiotec13 Universidade Aveiro (Aveiro, Portugal)
2013/12/06	Natural hotspots for multiple resistances gain: arsenic resistance in heterotrophic aerobic bacteria from marine hydrothermal vents	Microbiotec13 Universidade de Aveiro (Aveiro, Portugal)

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2019/12/07 - 2019/12/09	Membro da organização do Congresso internacional Microbiotec19 (2019/12/07 - 2019/12/09) Congresso (Membro da Comissão Organizadora)	Universidade de Coimbra, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2019/03/16 - Atual	Invited speaker - presenting " Metabolismo Microbiano: do genoma ao Fenótipo" Oficina (workshop)	III meet.Lab Universidade de Coimbra, Portugal
2023/03/28 - 2033/03/28	Bactérias como ferramentas para a remediação e recuperação de metais Outro	Semana da Ciência UC 2023 Universidade de Coimbra, Portugal Escola Secundária de Adolfo Portela, Portugal
2023/05/23 - 2023/05/26	Sustainable Value Creation Summit - round table - "How to create value from mining in extreme environments?" Conferência	Sustainable Value Creation Summit Universidade NOVA de Lisboa NOVA School of Business and Economics, Portugal

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2023/09/29	PRODUCTION OF THE RECOMBINANT RETROPEPSINLIKE PROTEASE FROM RICKETTSIA CONORII (APRC) Arguente	Carolina Pagaimo Faim (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal

Entrevista / Programa (rádio / tv)

	Programa	Tema
2019/03/25 - Atual	90 segundos de Ciência	Microbioma Hospitalar

Distinções

Título

2020	Membro Sociedade Portuguesa de Genética

Outra distinção

2016	COST-Short Term Scientific Mission -ES1406-35328
2013	Membro Sociedade Portuguesa de Microbiologia Sociedade Portuguesa de Microbiologia, Portugal