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Ricardo Oliveira is currently a PhD student at UCIBIO, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa. He completed the BSc in Biochemistry in 2020 (16/20) and the MSc in Biochemistry in 2022 (18/20), at the same institution. He developed his master dissertation under the supervision of Dr. Sofia Pauleta, at Microbial Stress Research Lab@UCIBIO, with his dissertation receiving a grade of 19/20. His research is focused on metalloproteins, namely with heme and copper cofactors, involved in respiratory and oxidative stress-related pathways. Ricardo has a total of 11 posters and 12 abstracts in conferences and 3 oral communications. Ricardo also has 3 published articles and 1 article under preparation.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Ricardo Lima Navarro Silva de Oliveira

Nomes de citação

  • Oliveira, Ricardo N. S.

Identificadores de autor

Ciência ID
9615-29FA-D3A1
ORCID iD
0000-0003-4002-5205

Moradas

  • Departamento de Química, FCT-UNL, 2829-516, Caparica, Almada, Portugal (Profissional)

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1) Utilizador independente (B2) Utilizador proficiente (C1)
Português (Idioma materno)
Formação
Grau Classificação
2023 - 2027
Em curso
 PhD in Biochemistry (Doutoramento)
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
"The non-classical bacterial peroxidase from E.coli - using hydrogen peroxidase for anaerobic respiration" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2023/03 - 2023/09
Concluído
 Iniciação à Investigação em Ciências Biomoleculares (Pós-Graduação)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020 - 2022
Concluído
 Bioquímica (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Biochemical and Spectroscopic characterization of YhjA, a Bacterial Peroxidase from Escherichia coli (19/20)" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18
2017 - 2020
Concluído
 Bioquímica (Licenciatura)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Caracterização bioquímica da redutase de nitrito de Neisseria gonorrhoeae (19/20)" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/03 - Atual Investigador (Investigação) Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/07 - 2022/12 Investigador (Investigação) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/08 - 2020/10 Investigador (Investigação) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2023/10 - Atual The non-classical bacterial peroxidase from E.coli - using hydrogen peroxidase for anaerobic respiration
2023.00208.BD
Bolseiro de Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2023/03 - 2023/09 Unique copper center involved in greenhouse gas mitigation
2022.01152.PTDC
Bolseiro de Investigação
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/05 - 2022/09 Hydrogen Peroxide detoxification by pathogenic bacteria - tri-hemic peroxidase from E. coli as a model
PTDC/BIA-BQM/29442/2017
Bolseiro de Investigação
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2020/08 - 2020/10 Caracterização cinética da nitrito reductase de Neisseria gonorrhoeae
Verão com Ciência
Bolseiro de Investigação
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2021/01/01 - 2025/12/31 Institute for Health and Bioeconomy
LA/P/0140/2020
10.54499/LA/P/0140/2020
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal

Universidade Nova de Lisboa, Portugal

INESC Microsistemas e Nanotecnologias, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2020/01/01 - 2023/12/31 Applied Molecular Biosciences Unit
UIDB/04378/2020
10.54499/UIDB/04378/2020
Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Universidade do Porto, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2020/01/01 - 2023/12/31 Applied Molecular Biosciences Unit
UIDP/04378/2020
10.54499/UIDP/04378/2020
Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Universidade do Porto, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2021/07 - 2022/12 PathG_CCP - Detoxification of hydrogen peroxide by pathogenic bacteria -Three-haem peroxidases from E.coli as a model
PTDC/BIA-BQM/29442/2017
Bolseiro de Mestrado
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Oliveira, Ricardo N. S.; Pauleta, Sofia R.. "Kinetic characterization and inhibition mechanism of azide and imidazole towards YhjA wild-type and M125A variant". (Under Preparation) (2024):
  2. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical Characterization of the Copper Nitrite Reductase from Neisseria gonorrhoeae". Biomolecules 13 8 (2023): 1215. http://dx.doi.org/10.3390/biom13081215.
    10.3390/biom13081215
  3. Oliveira, Ricardo N. S.; de Aguiar, Sara R. M. M.; Pauleta, Sofia R.. "Coordination of the N-Terminal Heme in the Non-Classical Peroxidase from Escherichia coli". Molecules 28 12 (2023): 4598. http://dx.doi.org/10.3390/molecules28124598.
    10.3390/molecules28124598
  4. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N.S.; Pauleta, Sofia R.. "Bacterial peroxidases – Multivalent enzymes that enable the use of hydrogen peroxide for microaerobic and anaerobic proliferation". Coordination Chemistry Reviews 485 (2023): 215114. http://dx.doi.org/10.1016/j.ccr.2023.215114.
    10.1016/j.ccr.2023.215114
Poster em conferência
  1. Oliveira, Ricardo N. S.; Mordido, Vítor; Carepo, Marta; Zhang, Lin; Einsle, Oliver; Pauleta, Sofia R.; Moura, Isabel. "Heterologous production and characterization of nitrous oxide reductase from Pseudomonas stutzeri". Trabalho apresentado em XXVIII Encontro Nacional SPQ, 2023.
  2. Oliveira, Ricardo N. S.; Portela, Raquel; Pauleta, Sofia R.. "Quinol-dependent peroxidase from Escherichia coli proposed to be involved in anaerobic respiration". Trabalho apresentado em 2nd Chemistry and Biochemistry Students Meeting, 2022.
  3. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical Characterization of metalloproteins involved in Neisseria gonorrhoeae proliferation in the host". Trabalho apresentado em 1st MOSBRI Scientific Conference, 2022.
  4. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Pauleta, Sofia R.. "Bacterial Nitric Oxide Reductase - Solubilization and Purification of an integral inner-membrane metalloprotein". Trabalho apresentado em mPEPC2, 2022.
  5. Pauleta, Sofia R.; Nóbrega, Claudia; Oliveira, Ricardo N. S.; Portela, Raquel; Sara R. M. M. de Aguiar. "YhjA, a quinol peroxidase from Escherichia coli proposed to be involved in anaerobic respiration". Trabalho apresentado em 1st MOSBRI Scientific Conference, 2022.
  6. Oliveira, Ricardo N. S.; Aguiar, Sara; Portela, Raquel; Pauleta, Sofia R.. "Insights into YhjA, a quinol peroxidase from Escherichia coli proposed to be involved in anaerobic respiration". Trabalho apresentado em IV International Conference NOVAhealth Chronic Disease and Infection, 2021.
  7. Oliveira, Ricardo N. S.; Aguiar, Sara; Portela, Raquel; Pauleta, Sofia R.. "Elucidating the role of the third heme in the bacterial peroxidase from Escherichia coli". Trabalho apresentado em Perspectives in Bioenergetics, 2021.
  8. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Romão, Margarida; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical characterization of Neisseria gonorrhoeae proteins involved in anaerobic proliferation". Trabalho apresentado em Perspectives in Bioenergetics, 2021.
  9. Portela, Raquel; Oliveira, Ricardo N. S.; Tostão, Alicia; Gonçalves, Bárbara V.; Rita G. Sobral; Pauleta, Sofia R.. "Detoxification of toxic intermediates produced by oxygen reduction in human pathogens". Trabalho apresentado em MicroBioTec, 2021.
  10. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Incorvaia, Simona; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical characterization of Neisseria gonorrhoeae cytochrome c2 and nitrite reductase involved in denitrification and peroxide detoxification". Trabalho apresentado em III International Conference NOVAhealth Chronic Disease and Infection, 2020.
  11. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Gonçalves, Bárbara; Sobral, Rita G.; Pauleta, Sofia R.. "Copper Proteins form Pathogenic Bacteria – Metal Homeostasis and Denitrification". Trabalho apresentado em International Workshop on Chemistry of Group 11 Elements, 2020.
Pré-impressão
  1. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical characterization of AniA, a nitrite reductase involved in anaerobic proliferation". 2022. https://doi.org/10.1101/2022.04.07.487406.
Resumo em conferência
  1. Oliveira, Ricardo N. S.; Mordido, Vitor; Carepo, Marta; Zhang, Lin; Einsle, Oliver; Pauleta, Sofia R.; Moura, Isabel. "Heterologous production and characterization of nitrous oxide reductase from Pseudomonas stutzeri". Trabalho apresentado em XXVIII Encontro Nacional SPQ, 2023.
  2. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical Characterization of metalloproteins involved in Neisseria gonorrhoeae proliferation in the host". Trabalho apresentado em 1st MOSBRI Scientific Conference, 2022.
  3. Oliveira, Ricardo N. S.; Portela, Raquel; Pauleta, Sofia R.. "Quinol-dependent peroxidase from Escherichia coli proposed to be involved in anaerobic respiration". Trabalho apresentado em 2nd Chemistry and Biochemistry Students Meeting, 2022.
  4. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Pauleta, Sofia R.. "Bacterial Nitric Oxide Reductase - Solubilization and Purification of an integral inner-membrane metalloprotein". Trabalho apresentado em mPEPC2, 2022.
  5. Pauleta, Sofia R.; Nóbrega, Cláudia; Oliveira, Ricardo N. S.; Portela, Raquel; Sara R. M. M. de Aguiar. "YhjA, a quinol peroxidase from Escherichia coli proposed to be involved in anaerobic respiration". Trabalho apresentado em 1st MOSBRI Scientific Conference, 2022.
  6. Oliveira, Ricardo N. S.; Barreiro, Daniela S.; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical characterization of AniA from Neisseria gonorrhoeae". Trabalho apresentado em Digital Colloquium of Chemistry Students in Portugal, 2021.
  7. Oliveira, Ricardo N. S.; Aguiar, Sara; Portela, Raquel; Pauleta, Sofia R.. "Elucidating the role of the third heme in the bacterial peroxidase from Escherichia coli". Trabalho apresentado em Perpectives in Bioenergetics, (Online), 2021.
  8. Oliveira, Ricardo N. S.; Aguiar, Sara; Portela, Raquel; Pauleta, Sofia R.. "Insights into YhjA, a quinol peroxidase from Escherichia coli proposed to be involved in anaerobic respiration". Trabalho apresentado em IV International Conference NOVAhealth Chronic Disease and Infection, (Online), 2021.
  9. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Romão, Margarida; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical characterization of Neisseria gonorrhoeae proteins involved in anaerobic proliferation". Trabalho apresentado em Perspectives in Bioenergetics, 2021.
  10. Portela, Raquel; Oliveira, Ricardo N. S.; Tostão, Alicia; Gonçalves, Bárbara V.; Rita G. Sobral; Pauleta, Sofia R.. "Detoxification of toxic intermediates produced by oxygen reduction in human pathogens". Trabalho apresentado em MicroBioTec, 2021.
  11. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Incorvaia, Simona; Pauleta, Sofia R.. "Biochemical characterization of Neisseria gonorrhoeae cytochrome c2 and nitrite reductase involved in denitrification and peroxide detoxification". Trabalho apresentado em III International Conference NOVAhealth Chronic Disease and Infection, 2020.
  12. Barreiro, Daniela S.; Oliveira, Ricardo N. S.; Gonçalves, Bárbara; Sobral, Rita G.; Pauleta, Sofia R.. "Copper Proteins form Pathogenic Bacteria – Metal Homeostasis and Denitrification". Trabalho apresentado em International Workshop on Chemistry of Group 11 Elements, Caparica, 2020.
Tese / Dissertação
  1. "Biochemical and Spectroscopic characterization of YhjA, a Bacterial Peroxidase from Escherichia coli (19/20)". Mestrado, Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, 2022.
  2. "Caracterização bioquímica da redutase de nitrito de Neisseria gonorrhoeae (19/20)". Licenciatura, Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, 2020.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2022/02 YhjA, a quinol peroxidase from Escherichia coli proposed to be involved in anaerobic respiration Jornadas Intercalares de Mestrados do DQ e DCV
Nova School of Science and Technology | NOVA (Portugal)
2021/03 Biochemical characterization of AniA from Neisseria gonorrhoeae Digital Colloquium of Chemistry Students in Portugal
ANEQUIMICA
2020/10 Kinetic characterization of a nitrite reductase from Neisseria gonorrhoeae Simpósio das Escolas de Verão do LAQV e do UCIBIO
Nova School of Science and Technology | NOVA (Caparica, Portugal)

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2023/09/29 - 2023/09/29 The European Researchers' Night (NEI) is a Science Communication event that takes place annually in several cities in Europe, with the purpose of promoting the population's awareness and involvement in Science, bringing together researchers and civil society.
Oficina (workshop)
 NEI - Noite Europeia dos Investigadores
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/04/19 - 2023/04/19 EXPO FCT is the open day of FCT - NOVA that allows high-school students to learn more about Science and Engineering and the different Departments and Research Centers of the university. EXPO FCT 2023
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/09/30 - 2022/09/30 The European Researchers' Night (NEI) is a Science Communication event that takes place annually in several cities in Europe, with the purpose of promoting the population's awareness and involvement in Science, bringing together researchers and civil society.
Oficina (workshop)
 NEI - Noite Europeia dos Investigadores
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/04/27 - 2022/04/27 EXPO FCT is the open day of FCT - NOVA that allows high-school students to learn more about Science and Engineering and the different Departments and Research Centers of the university.
Oficina (workshop)
 EXPO FCT 2022
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2020/11 - 2021/08 Collaborator (for the first 7 months) and then member (for the last 4 moths) of the Biochemistry Student Association at FCT-NOVA. Involved in the organization of several events like seminars, workshops, student's meetings and others, with the target audience being the students of the BSc in Biochemistry, and MSC in Biochemistry and Biotechnology. Collaborator/Member

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2020/11 - 2022/09 Students' Representative at MSc in Biochemistry's Pedagogic Committee. Responsible for making the connection between students and teachers/MSc coordinator. Also responsible for resolving any conflicts during the stated period, as well as collect students' evaluation and considerations of all curricular units. Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
Distinções

Prémio

2022 Best MSc Student to Graduate from MSc in Biochemistry in 2022
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal