João Carlos Marques (9F11-7A1E-BEEC)

Curriculum Vitae

João Carlos Marques

Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: João Carlos Marques

Nomes de citação

Marques, João Carlos

Identificadores de autor

Ciência ID: 9F11-7A1E-BEEC
ORCID iD: 0000-0001-8865-8189

Websites

http://www1.ci.uc.pt/imar/unit/people/jcm.php (Profissional)

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão
Espanhol; Castelhano	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)
Francês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)

Formação

	Grau	Classificação
1997 Concluído	n/a (Título de Agregado) Especialização em Ecologia Universidade de Coimbra, Portugal "Zoologia" (TESE/DISSERTAÇÃO)
1989 Concluído	Biologia, especialidade em Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal "**********" (TESE/DISSERTAÇÃO)	00
1985 Concluído	Biologia (Outros) Universidade de Coimbra, Portugal "**********" (TESE/DISSERTAÇÃO)	00
1980 Concluído	Biologia (Licenciatura) Universidade de Lisboa, Portugal	00

Percurso profissional

Docência no Ensino Superior

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2004/09 - Atual	Professor Catedrático (Docente Universitário)	Universidade de Coimbra, Portugal

2000/09 - 2004/08	Professor Associado (Docente Universitário)	Universidade de Coimbra, Portugal

1989/09 - 2000/08	Professor Auxiliar (Docente Universitário)	Universidade de Coimbra, Portugal

Cargos e Funções

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2018/01/01 - Atual	Director of MARE - Marine and Environmental Sciences Centre	Universidade de Coimbra, Portugal

2003/01 - 2007	Vice-Reitor para a Investigação Científica	Universidade de Coimbra, Portugal

Projetos

Projeto

	Designação	Financiadores
2019/04/01 - 2021/09/30	TRIPLE-C - Capitalising Climate Change Projects in Risk Management for a Better Atlantic Area Resilience. EAPA_772/2018 Investigador	Em curso
2018/10/01 - 2020/09/30	OtimO – Otimização dos processos de produção de Ouriço-do-mar. MAR-04.03.01-FEAMP-0008 Investigador responsável	Em curso
2018/10/01 - 2020/09/30	AlgaDepur - Aquacultura Multi-trófica Integrada como veículo de sustentabilidade: Utilização de macroalgas para depuração de efluentes. MAR-04.03.01-FEAMP-0008 Investigador responsável	Em curso
2017 - 2020	E-Infraestrutura Portuguesa de Informação e Investigação em Biodiversidade - PORBIOTA POCI-01-0145-FEDER-022127 Investigador MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal	Em curso
2017 - 2020	SUSpENsE Sustainable built Environment under Natural Hazards and Extreme Events CENTRO-01-0145- FEDER-000006. Investigador MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal	Em curso
2017 - 2019	Centro de Vanguarda em Adaptações às Alterações Climáticas CENTRO-01-0246-FEDER-000014 Investigador responsável MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal	Em curso

Outro

	Designação	Financiadores
1999 - Atual	Compreender a migração das Aves ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
1999 - Atual	Dicionário virtual de Ornitologia ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
1998 - Atual	Aves Virtual – Aprender com as aves na Internet ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Ciência Viva Em curso
2017 - 2018	Programa de Monitorização dos Fatores Biológicos e Ecológicos Aquáticos no Rio Mondego ma Envolvente da Central Termoelétrica de Lares Prestação de Serviços - EDP Investigador MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal	Concluído
2012 - 2016	DEVelopment Of innovative Tools for understanding marine biodiversity and assessing good Environmental Status (DEVOTES) 308392 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal	European Union Em curso
2011 - 2014	CleF - The combined impacts of invasion and climate change on coastal ecosystem functioning PTDC/AAC-AMB/102866/2008 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Centro de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2010 - 2013	Minho, Mondego, and Mira estuaries observatory: Long term variation of ecological status as a response to natural and human induced changes. Implications for management and restoration – 3M RECITAL LTER/BIA-BEC/0019/2009 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal Universidade do Porto Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Portugal Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos (ICETA-UP), Portugal Instituto Português de Investigação das Pescas e do Mar, Portugal Administração da Região Hidrográfica do Norte, I.P., Portugal Administração da Região Hidrográfica do Centro, I.P., Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2011 - 2012	Monitorização das comunidades biológicas costeiras e estuarinas associada à intervenção do prolongamento do molhe norte do porto da Figueira da Foz, no período pós- obra ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal	Sistema Nacional de Informação de Recursos Hídricos Em curso
2010 - 2012	Utilizing the Ecosystem Services Approach for Water Framework Directive Implementation - ESAWADI ERA-IWRM/0001/2009 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Portugal Asconit Consultants, França CREDOC, França Society-Economy-Ecology-Consulting, Alemanha InterSus - Sustainability Services, Germany, Alemanha	Em curso
2010 - 2012	EEMA - Avaliação do estado ecológico das massas de água costeiras e de transição e do potencial ecológico das massas de água fortemente modificadas ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Universidade do Porto, Portugal Centro de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto, Portugal Centro da Zonas Costeira e do Mar, Universidade de Aveiro, Portugal Centro de Oceanografia, Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa, Portugal Instituto Português de Investigação das Pescas e do Mar, Portugal Centro de Ciências do Mar, Universidade do Algarve, Portugal	Instituto da Água, I.P. Em curso
2009 - 2012	Water Bodies in Europe: Integrative systems to assess ecological status and recovery – WISER FP7-ENV-2008-226273 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Norsk Institutt for Vannforskning, Noruega Consiglio Nazionale delle Ricerche, Itália Università del Salento, Itália Instytut Ochrony Srodowiska, Polónia Instituto do Mar, Portugal Eesti Maaulikoolestonian University of Life Sciences, Estónia Stichting Deltares, Países Baixos Fundacion Azti/Azti Fundazioa, Espanha Forschungsverbund Berlin e.v., Alemanha Suomen ympäristökeskus, Finlândia Directorate General Joint Research Centre , Bélgica Universitaet fuer Bodenkultur Wien, Áustria Università degli Studi di Roma La Sapienza, Itália Alterra B.V., Países Baixos Institute of Oceanology - Bulgarian Academy of Sciences, Bulgária CentreNational duMachinisme Agricole du Génie Rural des Eaux et des Forêts, França Bournemouth University, Reino Unido Aarhus Universitet, Dinamarca Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Espanha University of Hull, Reino Unido University College London, Reino Unido Natural Environment Research Council, Reino Unido Sveriges lantbruksuniversitet, Suécia Trinity College, Dublin, Irlanda	Em curso
2008 - 2011	System dynamic response to an ample artificial RE-establishment of the upstream CONNECTion between the two arms of the Mondego estuary (Portugal): Implications for recovery, ecological quality status, and management – RECONNECT PTDC/MAR/64627/2006 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal Insituto de Oceanografia - Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2009 - 2010	Monitorização das comunidades biológicas costeiras e estuarinas associada à intervenção do prolongamento do molhe norte do porto da Figueira da Foz, na fase de obra ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal	Sistema Nacional de Informação de Recursos Hídricos Concluído
2005 - 2008	Effects of natural stress generated by freshwater discharges in the benthic invertebrate estuarine communities and its influence on the assessment of the benthic ecological status – EFICAS POCI/MAR/61324/2004 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal Insituto de Oceanografia - Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2005 - 2008	Sustainable management of Mediterranean coastal fresh and transitional water bodies: a socioeconomic and environmental analysis of changes and trends to enhance and sustain stakeholders benefits - WADI INCO-CT-2005-015226 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Università degli Studi di Firenze, Itália Consiglio Nazionale delle Ricerche, Itália Universitat d'Alacant, Espanha Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal International Environment Institute (University of Malta), Itália Université Mohamed V, Institute Scientifique de Rabat, Marrocos Faculté des Sciences de Tetouan (Univ. Abdelmalek Essaâdi), Marrocos Universidade de Túnis - El Manar, Tunísia Agence de Protection et Amenagement du Littoral , Tunísia Centre for Environment and Development for the Arab Region and Europe , Egipto Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Espanha	Concluído
2005 - 2006	RECITAL - Condições de Referência e Intercalibração nas Águas de Transição e Costeiras Portuguesas ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal IMAR – Universidade do Algarve, Portugal, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal Instituto Português de Investigação das Pescas e do Mar, Portugal	Instituto da Água, I.P. Concluído
2004 - 2006	Estudo piloto do estuário do Mondgo no âmbito da implementação do programa Objectivos de Qualidade Ambiental – Eutrofização (EcoQOs – Eutro – OSPAR). Harmonização dos critérios OSPAR com a Directiva Quadro da Água Europeia ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal	Sistema Nacional de Informação de Recursos Hídricos Concluído
2004 - 2005	MONAE – Monitoring Plan for Water Quality and Ecology for Portuguese Transitional and Coastal Waters ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal IMAR – CME, Universidade Nova de Lisboa, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal IMAR - Grupo de Biogeoquímica, Universidade de Évora, Portugal Laboratório Nacional de Engenharia Civil, Portugal	Instituto da Água, I.P. Concluído
2002 - 2005	From river catchement areas to the sea: a comparative and integrated approach to the ecology of Mediterranean coastal zones for sustainable management - MEDCORE FP5 - ICA3 2001 10028 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Università degli Studi di Firenze, Itália Universitat d'Alacant, Espanha Institute of Marine Biology and Genetics, Grécia Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal Institut Scientifique Charia Ibn Battota, Marrocos Universidade de Túnis - El Manar, Tunísia University of Malta, Malta Centre for Environment and Development for the Arab Region and Europe , Egipto Agence de Protection et Amenagement du Littoral , Tunísia Universitat de Barcelona, Espanha Faculté des Sciences de Tetouan (Univ. Abdelmalek Essaâdi), Marrocos Institute of Graduate Studies and Research (University of Alexandria), Egipto	Concluído
2002 - 2004	Dynamic model of stress induced changes on benthic communities – DYNAMOD POCTI/MGS/37431/2001 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2002 - 2004	Caracterização do estuário do rio Mondego e estabelecimento de cenários de gestão em termos da qualidade da água e da integridade do ecossistema ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal Instituto Superior Técnico, Universidade Técnica de Lisboa, Portugal, Portugal IMAR – CME, Universidade Nova de Lisboa, Portugal Instituto de Sistemas e Robótica, Universidade Técnica de Lisboa, Portugal	Sistema Nacional de Informação de Recursos Hídricos Concluído
2002 - 2003	TICOR – Typology and Reference Conditions for Transitional and Coastal Portuguese Waters ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal	Concluído
2000 - 2003	Ecological adaptation and genetic divergence in changing sandy shores. Concepts and guidelines for beach protection and management POCTI/CTA/36553/00 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal	Concluído
2000 - 2003	Cross-shore processes on contrasting environments PDCTM/MAR/15265/99 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal IMAR – Universidade do Algarve, Portugal, Portugal Universidade de Lisboa, Portugal Universidade de Aveiro, Portugal Instituto Nacional de Meteorologia e Geofísica , Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
1999 - 2001	Human impact on estuarine mater and energy dynamics – bases for the integrated management of estuarine ecosystems PRAXIS / C/ MGS / 11238/ 1998 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal Universidade de Aveiro, Portugal	Concluído
1998 - 2001	Bases for the integrated sustainable management of Mediterranean sensitive coastal ecosystems – MECO FP - 4IC18 CT98 0270 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Università degli Studi di Firenze, Itália Agence de Protection et Amenagement du Littoral , Tunísia Institut Scientifique Charia Ibn Battota, Marrocos International Environment Institute , Malta IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal University of Birmingham, Reino Unido Universidade de Túnis - El Manar, Tunísia Centre for Urban and Regional Studies, University of Birmingham, Reino Unido	Concluído
1996 - 2000	Wetland Ecology and Technology (TMR) FMRX-CT96-0051 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Christian-Albrechts-Universität zu Kiel, Alemanha Freshwater Biological Institute, Dinamarca Royal School of Pharmacy , Dinamarca Università degli Studi di Padova, Itália Universiteit Utrecht, Países Baixos IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal Lunds Universitet, Suécia	Concluído
1997 - 1999	Padrões, processos, e variação em comunidades intertidais rochosas da costa continental Portuguesa: Uma abordagem biogeográfica PRAXIS 2/2.1/MAR/1746/95 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal	Concluído
1997 - 1999	Estrutura da comunidade e variabilidade espaço-temporal dos recursos do talude continental superior no Algarve PRAXIS 2/2.1/MAR/1744/95 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal	Concluído
1996 - 1998	Avaliação da integridade de ecossistemas marinhos por indicadores ecológicos holísticos. Aplicação a um gradiente de eutrofização no estuário do Mondego PBICT/MAR/2253/95 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Instituto do Mar, Centro Interdisciplinar de Coimbra, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
1996 - 1998	Aquacultura extensiva na Ria Formosa: Validação de um modelo ecológico PBICT/MAR/2226/95 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal	Concluído
1995 - 1997	Integrated management of red swamp crayfish populations in rice fields - An application of cleaner technologies and ecotechnology AIR3-CT94-2432 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal	Concluído
1995 - 1997	Caracterização das comunidades bentónicas intertidais e subtidais em substrato rochoso da reserva das Berlengas ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal	Instituto da Conservação da Natureza Concluído
1993 - 1995	Estuário do Mondego: Evolução temporal das comunidades bentónicas e impacto da descarga excessiva de nutrientes PBIC/C/MAR/1301/92 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Departamento de Zoologia, Faculdade de Ciências e Tcnologia, U.C., Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
1993 - 1995	Marine Universal STructural Model (MUST) MAS2-CT92-0036 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Royal School of Pharmacy , Dinamarca Università degli Studi di Padova, Itália Departamento de Zoologia da Universidade de Coimbra, Portugal	Concluído
1993 - 1995	Red swamp crawfish in Portugal: Population control through a non harmful chemical method Stride - STRD/AMB/0008 Investigador Universidade de Coimbra, Portugal HOECHST Portuguesa S.A., Portugal IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal Royal School of Pharmacy , Dinamarca Instituto Florestal , Portugal	Concluído
1992 - 1994	Lagostim Vermelho da Louisiana, Procambarus clarkii (Girard), espécie exótica em Portugal: Bioecologia, impacto e controlo PEAM/C/CNT/106/91 Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Departamento de Zoologia, Faculdade de Ciências e Tcnologia, U.C., Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
1991 - 1993	Ciclo biológico e dinâmica populacional do lagostim vermelho da Louisiana, Procambarus clarkii, na região do Baixo Mondego: Estudo de medidas para controlo da população ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Centro de Sistemática e Ecologia da Universidade de Coimbra, Portugal	Comissão Coordenadora da Região Centro Concluído
1988 - 1991	Rôle des Crustacés Amphipodes dans les cycles d'énergie de l'ecosystème de la marge lusitanienne ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal Centre d'Océanologie de Marseille – Station Marine d’Endoume, França	Concluído
1985 - 1991	Estudo Ambiental do Estuário do Mondego ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Centro de Sistemática e Ecologia da Universidade de Coimbra, Portugal	INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACAO CIENTIFICA Concluído
1988 - 1990	Lançamento de bases para o estudo integrado do estuário do Mondego ************ Investigador responsável Universidade de Coimbra, Portugal Laboratório Nacional de Engenharia Civil, Portugal Institut de Mécanique de Grenoble, França Oregon Health & Science University - West Campus, Estados Unidos	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Direcção Geral de Portos Concluído
1982 - 1982	Projecto de estudo ecológico (estudo de referência) relativo à opção entre Viana do Castelo ou Figueira da Foz para implantação de uma Nova Central Térmica ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Laboratório Marítimo da Guia, FCUL, Portugal	Electricidade de Portugal Concluído
1981 - 1982	Projecto de estudo ecológico (estudo de referência) das condições de implantação da Central Térmica de Sines ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Laboratório Marítimo da Guia, FCUL, Portugal	Electricidade de Portugal Concluído
1981 - 1982	Projecto Estudo Ambiental do Estuário do Tejo ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Laboratório Marítimo da Guia, FCUL, Portugal	Electricidade de Portugal Concluído
1981 - 1982	Projecto de estudo ecológico (estudo de referência) das condições de implantação da Rede de Saneamento Básico da Costa do Estoril ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Laboratório Marítimo da Guia, FCUL, Portugal	Electricidade de Portugal Concluído
1979 - 1980	Projecto de estudo ecológico (estudo de referência) das condições de implantação da Central Nuclear de Ferrel ************ Investigador Universidade de Coimbra, Portugal Laboratório Marítimo da Guia, FCUL, Portugal	Electricidade de Portugal Concluído

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Mantas, V.M.; Marques, J.C.; Pereira, A.J.S.C.. "A data fusion approach for the production of impervious surface area estimates using Sentinel-1A and Landsat-8 data". 2016. Blancher, P.; Vignon, C.; Catalon, E.; Maresca, B.; Dujin, A.; Mordet, X.; Borowski, I.; et al. "Ecosystem services approach for water framework directive implementation". 2011. Publicado • 10.2495/rav110081 Anastasio, P.; Brugnach, M.; Chiew, F.; Filatova, T.; Gray, B.; Holtz, G.; Lindenschmidt, K.-E.; et al. "Workshop 8: Complexity and uncertainty and a new role for models". 2006. M. A. Pardal; J. C. Marques; A. I. Lillebø; J. Neto; Patrícia Cardoso; Susana Ferreira. "Qualidade ambiental no estuário do Mondego: Duas décadas de estudos e futuros cenários". Trabalho apresentado em Jornadas Litoral 03, Figueira da Foz, 2003. Publicado Anastácio, P. M.; S. C. Gonçalves; M. A. Pardal; J. C. Marques. "A comparison of model structures for the simulation of amphipod (Talitrus saltator) population dynamics". Trabalho apresentado em International Environmental Modelling and Software Society, Lugano, 2002. Publicado Adão, H.; J. C. Marques. "Ecologia da Meiofauna dos sedimentos dos povoamentos de Zostera noltii no estário do Mira (Costa Sudoeste de Portugal)". Trabalho apresentado em Seminário “A zona costeira do Alentejo”, ***********, 2000. Publicado Azeiteiro, U. M. M.; J. C. Marques. "Variação espacio-temporal dos parâmetros ambientais (condições físico-químicas da água e nutrientes) no estuário do Mondego (Costa Ocidental Portuguesa)". Trabalho apresentado em IX Simpósio Ibérico de Química Marinha, **********, 2000. Publicado Fonseca, J. C.; V. M. C. Madeira; J. C. Marques. "Oxygen uptake inhibition in Procambarus clarkii, Louisiana crayfish, by biodegradable surfactants: An ecotechnological approach for population control in rice fields". Trabalho apresentado em International Association of Astacology 11th Symposium, **********, 1996. Publicado Cabral, J. A.; P. M. Anastácio; R. Carvalho; J. C. Marques. "A non-harmful chemical method of red swamp crayfish (Procambarus clarkii) population control and non-target organisms’ problematics in the Lower Mondego river valley, Portugal". Trabalho apresentado em International Association of Astacology 11th Symposium, **********, 1996. Publicado Anastácio, P. M.; J. C. Marques. "Crayfish (Procambarus clarkii) effects on initial stages of rice growth in the Lower Mondego river valley (Portugal)". Trabalho apresentado em International Association of Astacology 11th Symposium, **********, 1996. Publicado Maranhão, P.; V. M. C. Madeira; J. C. Marques. "Copper concentrations in soft tissues of the red swamp crayfish Procambarus clarkii (Girard, 1852)". Trabalho apresentado em International Association of Astacology 10th Symposium, **********, 1995. Publicado Marques, J.C.; P. Maranhão; M. A. Pardal. "Influence of dredging and water circulation on the subtidal macrobenthic community structure in the Mondego estuary (Western Portugal)". Trabalho apresentado em Séminaire Franco Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime, Coimbra, 1994. Publicado Santos, T.M.; J. A. Cabral; J. C. Marques. "Effects of intertidal macroalgae blooms on the feeding of the wading birds in the Mondego estuary (West Portugal): a preliminary analysis and its relevance for a future model". Trabalho apresentado em Séminaire Franco Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime, Coimbra, 1994. Publicado Martins, I.; J. C. Marques; S. E. Jørgensen; S. Nielsen. "Cyathura carinata (Crustacea: Isopoda), Enteromorpha spp. (Ulvales: Chlorophyta) and organic matter: top-bottom or bottom-top control? The answer by an ecological model". Trabalho apresentado em Séminaire Franco Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime, Coimbra, 1994. Publicado Anastácio, P. M.; S. N. Nielsen; J. C. Marques; S. E. Jørgensen. "Rice and crayfish production in the Lower Mondego river valley (Portugal): A management model for farmer". Trabalho apresentado em International Congress on Modelling and Simulation, Perth, 1993. Publicado Silveira, S.; A. Nogueira; R. Ribeiro; F. Gonçalves; J. C. Marques; A. M. V. M. Soares. "Crescimento e reprodução de Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) (Crustacea: Mysidacea) no estuário do Mondego". Trabalho apresentado em 2º Encontro de Planctonologistas Portugueses, **********, 1993. Publicado Marques, J.C.; H. Adão; P. Anastácio. "Lagostim vermelho da Louisiana, Procambarus clarkii (Girard), espécie exótica em Portugal: Bioecologia, impacto e controlo". Trabalho apresentado em 3ª Conferência Nacional sobre a Qualidade do Ambiente, Aveiro, 1992. Publicado Adão, H.; J. C. Marques; P. M. Anastácio. "Procambarus clarkii (Girard, 1852) (Crustacea, Decapoda), espécie exótica em Portugal: Situação actual e perspectivas". Trabalho apresentado em 4º Congresso Sobre o Alentejo, Sines, 1991. Publicado Marques, J.C.; L. Guilhermino. "Moluscos do estuário do Mondego (zona intertidal). Inventariação faunística e análise da repartição ecológica das espécies". Trabalho apresentado em Actas Col. Luso-Esp. Bacias Hidrog. e Rec. Zoológicos, Porto, 1988. Publicado Marques, J. C.; A. Nogueira; L. B. Rodrigues. "Crustáceos Peracarídeos do estuário do Mondego (zona intertidal). Inventariação faunística e análise da repartição ecológica das espécies". Trabalho apresentado em Actas Col. Luso-Esp. Bacias Hidrog. e Rec. Zoológicos, Porto, 1988. Publicado Marques, J.C.; J. André; R. Girão; F. Gonçalves; L. Guilhermino; A. Mortágua. "Estudo bionómico dos povoamentos bentónicos do estuário do Mondego (Portugal). Resultados preliminares". Trabalho apresentado em 4º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho, Lisboa*, 1984. Publicado
Artigo em revista	Seena, Sahadevan; Gutiérrez, Irene B.; Barros, Juliana; Nunes, Cláudia; Marques, João Carlos; Kumar, Santosh; Gonçalves, Ana M.M.. "Impacts of low concentrations of nanoplastics on leaf litter decomposition and food quality for detritivores in streams". Journal of Hazardous Materials 429 (2022): 128320. http://dx.doi.org/10.1016/j.jhazmat.2022.128320. Publicado • 10.1016/j.jhazmat.2022.128320 García-Poza, Sara; Morais, Tiago; Leandro, Adriana; Cotas, João; Marques, João Carlos; Pereira, Leonel; Gonçalves, Ana M. M.. "A Comparative Study of the Fatty Acids and Monosaccharides of Wild and Cultivated Ulva sp.". Journal of Marine Science and Engineering 10 2 (2022): 233. http://dx.doi.org/10.3390/jmse10020233. Publicado • 10.3390/jmse10020233 Nielsen, S.N.; Müller, F.; Marques, J.C.. "Humboldt's enigma viewed through the lens of ecosystem theory. Explanation by simple principles.". Environmental and Sustainability Indicators 13 (2022): 100165. http://dx.doi.org/10.1016/j.indic.2021.100165. 10.1016/j.indic.2021.100165 Pais-Costa, Antónia Juliana; Sánchez, Marta I.; Taggart, Mark A.; Green, Andy J.; Hortas, Francisco; Vinagre, Pedro Almeida; Marques, João Carlos; Martinez-Haro, Mónica. "Trace element bioaccumulation in hypersaline ecosystems and implications of a global invasion". Science of The Total Environment 800 (2021): 149349. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.149349. 10.1016/j.scitotenv.2021.149349 Duarte, Bernardo; Feijão, Eduardo; Cruz de Carvalho, Ricardo; Franzitta, Marco; Carlos Marques, João; Caçador, Isabel; Teresa Cabrita, Maria; Fonseca, Vanessa F.. "Unlocking Kautsky’s dark box: Development of an optical toxicity classification tool (OPTOX index) with marine diatoms exposed to emerging contaminants". Ecological Indicators 131 (2021): 108238. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.108238. 10.1016/j.ecolind.2021.108238 Monteiro, Pedro; Lomartire, Silvia; Cotas, João; Pacheco, Diana; Marques, João C.; Pereira, Leonel; Gonçalves, Ana M. M.. "Seaweeds as a Fermentation Substrate: A Challenge for the Food Processing Industry". Processes 9 11 (2021): 1953. http://dx.doi.org/10.3390/pr9111953. 10.3390/pr9111953 Lomartire, Silvia; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M.M.. "The key role of zooplankton in ecosystem services: A perspective of interaction between zooplankton and fish recruitment". Ecological Indicators 129 (2021): 107867. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107867. 10.1016/j.ecolind.2021.107867 Cascais, Miguel; Monteiro, Pedro; Pacheco, Diana; Cotas, João; Pereira, Leonel; Marques, João Carlos; Gonçalves, Ana M. M.. "Effects of Heat Treatment Processes: Health Benefits and Risks to the Consumer". Applied Sciences 11 18 (2021): 8740. http://dx.doi.org/10.3390/app11188740. 10.3390/app11188740 Mesquita, Andreia F.; Gonçalves, Fernando J. M.; Rocha, Carolina P.; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M. M.. "Biochemical Effects of Two Pesticides in Three Different Temperature Scenarios on the Diatom Thalassiosira weissflogii". Processes 9 7 (2021): 1247. http://dx.doi.org/10.3390/pr9071247. 10.3390/pr9071247 Verdelhos, Tiago; Veríssimo, Helena; Marques, João Carlos; Anastácio, Pedro. "Behavioural Responses of Cerastoderma edule as Indicators of Potential Survival Strategies in the Face of Flooding Events". Applied Sciences 11 14 (2021): 6436. http://dx.doi.org/10.3390/app11146436. 10.3390/app11146436 Lomartire, Silvia; Marques, João Carlos; Gonçalves, Ana M. M.. "An Overview to the Health Benefits of Seaweeds Consumption". Marine Drugs 19 6 (2021): 341. http://dx.doi.org/10.3390/md19060341. 10.3390/md19060341 Rocha, Carolina P.; Pacheco, Diana; Cotas, João; Marques, João C.; Pereira, Leonel; Gonçalves, Ana M. M.. "Seaweeds as Valuable Sources of Essential Fatty Acids for Human Nutrition". International Journal of Environmental Research and Public Health 18 9 (2021): 4968. http://dx.doi.org/10.3390/ijerph18094968. 10.3390/ijerph18094968 Silva, Daniela C.C.; Neto, João M.; Nunes, Cláudia; Gonçalves, Fernando J.M.; Coimbra, Manuel A.; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M.M.. "Assessment of seasonal and spatial variations in the nutritional content of six edible marine bivalve species by the response of a set of integrated biomarkers". Ecological Indicators 124 (2021): 107378. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107378. 10.1016/j.ecolind.2021.107378 Lomartire, Silvia; Cotas, João; Pacheco, Diana; Marques, João Carlos; Pereira, Leonel; Gonçalves, Ana M. M.. "Environmental Impact on Seaweed Phenolic Production and Activity: An Important Step for Compound Exploitation". Marine Drugs 19 5 (2021): 245. http://dx.doi.org/10.3390/md19050245. 10.3390/md19050245 Lomartire, Silvia; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M.M.. "Biomarkers based tools to assess environmental and chemical stressors in aquatic systems". Ecological Indicators 122 (2021): 107207. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.107207. 10.1016/j.ecolind.2020.107207 Gonçalves, Ana M.M.; Rocha, Carolina P.; Marques, João C.; Gonçalves, Fernando J.M.. "Fatty acids as suitable biomarkers to assess pesticide impacts in freshwater biological scales – A review". Ecological Indicators 122 (2021): 107299. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.107299. 10.1016/j.ecolind.2020.107299 Gonçalves, Ana M.M.; Rocha, Carolina P.; Marques, João C.; Gonçalves, Fernando J.M.. "Enzymes as useful biomarkers to assess the response of freshwater communities to pesticide exposure – A review". Ecological Indicators 122 (2021): 107303. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.107303. 10.1016/j.ecolind.2020.107303 Duarte, Bernardo; Durante, Lorenzo; Marques, João Carlos; Reis-Santos, Patrick; Fonseca, Vanessa F.; Caçador, Isabel. "Development of a toxicophenomic index for trace element ecotoxicity tests using the halophyte Juncus acutus: Juncus-TOX". Ecological Indicators 121 (2021): 107097. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.107097. 10.1016/j.ecolind.2020.107097 Franzitta, Marco; Feijão, Eduardo; Cabrita, Maria Teresa; Gameiro, Carla; Matos, Ana Rita; Marques, João Carlos; Goessling, Johannes W.; et al. "Toxicity Going Nano: Ionic Versus Engineered Cu Nanoparticles Impacts on the Physiological Fitness of the Model Diatom Phaeodactylum tricornutum". Frontiers in Marine Science 7 (2020): http://dx.doi.org/10.3389/fmars.2020.539827. 10.3389/fmars.2020.539827 Duarte, Bernardo; Feijão, Eduardo; Cruz de Carvalho, Ricardo; Duarte, Irina A.; Silva, Marisa; Matos, Ana Rita; Cabrita, Maria Teresa; et al. "Effects of Propranolol on Growth, Lipids and Energy Metabolism and Oxidative Stress Response of Phaeodactylum tricornutum". Biology 9 12 (2020): 478. http://dx.doi.org/10.3390/biology9120478. 10.3390/biology9120478 Cruz de Carvalho, Ricardo; Feijão, Eduardo; Kletschkus, Elia; Marques, João Carlos; Reis-Santos, Patrick; Fonseca, Vanessa F.; Papenbrock, Jutta; Caçador, Isabel; Duarte, Bernardo. "Halophyte bio-optical phenotyping: A multivariate photochemical pressure index (Multi-PPI) to classify salt marsh anthropogenic pressures levels". Ecological Indicators 119 (2020): 106816. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106816. 10.1016/j.ecolind.2020.106816 Pais-Costa, Antónia Juliana; Sánchez, Marta I.; Vieira, Natividade; Green, Andy J.; Marques, João Carlos; Martinez-Haro, Mónica. "Effect of acute exposure of Hg and Zn on survival of native and invasive Artemia from wild populations exposed to different degrees of environmental contamination". Ecological Indicators 118 (2020): 106739. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106739. 10.1016/j.ecolind.2020.106739 Cruz de Carvalho, Ricardo; Feijão, Eduardo; Matos, Ana Rita; Cabrita, Maria Teresa; Novais, Sara C.; Lemos, Marco F. L.; Caçador, Isabel; et al. "Glyphosate-Based Herbicide Toxicophenomics in Marine Diatoms: Impacts on Primary Production and Physiological Fitness". Applied Sciences 10 21 (2020): 7391. http://dx.doi.org/10.3390/app10217391. 10.3390/app10217391 Silva, Marisa; Feijão, Eduardo; da Cruz de Carvalho, Ricardo; Duarte, Irina A.; Matos, Ana Rita; Cabrita, Maria Teresa; Barreiro, Aldo; et al. "Comfortably numb: Ecotoxicity of the non-steroidal anti-inflammatory drug ibuprofen on Phaeodactylum tricornutum". Marine Environmental Research 161 (2020): 105109. http://dx.doi.org/10.1016/j.marenvres.2020.105109. Publicado • 10.1016/j.marenvres.2020.105109 García-Poza, Sara; Leandro, Adriana; Cotas, Carla; Cotas, João; Marques, João C.; Pereira, Leonel; Gonçalves, Ana M. M.. "The Evolution Road of Seaweed Aquaculture: Cultivation Technologies and the Industry 4.0". International Journal of Environmental Research and Public Health 17 18 (2020): 6528. http://dx.doi.org/10.3390/ijerph17186528. 10.3390/ijerph17186528 Leandro, Adriana; Pacheco, Diana; Cotas, João; Marques, João C.; Pereira, Leonel; Gonçalves, Ana M. M.. "Seaweed’s Bioactive Candidate Compounds to Food Industry and Global Food Security". Life 10 8 (2020): 140. http://dx.doi.org/10.3390/life10080140. 10.3390/life10080140 Caro, Claudia; Marques, João Carlos; Cunha, Pedro P.; Teixeira, Zara. "Ecosystem services as a resilience descriptor in habitat risk assessment using the InVEST model". Ecological Indicators 115 (2020): 106426. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106426. 10.1016/j.ecolind.2020.106426 Nielsen, Søren; Müller, Felix; Marques, Joao; Bastianoni, Simone; Jørgensen, Sven. "Thermodynamics in Ecology—An Introductory Review". Entropy 22 8 (2020): 820. http://dx.doi.org/10.3390/e22080820. 10.3390/e22080820 Feijão, Eduardo; Cruz de Carvalho, Ricardo; Duarte, Irina A.; Matos, Ana Rita; Cabrita, Maria Teresa; Novais, Sara C.; Lemos, Marco F. L.; et al. "Fluoxetine Arrests Growth of the Model Diatom Phaeodactylum tricornutum by Increasing Oxidative Stress and Altering Energetic and Lipid Metabolism". Frontiers in Microbiology 11 (2020): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2020.01803. 10.3389/fmicb.2020.01803 Caro, C.; Cunha, Pedro P.; Marques, J.C.; Teixeira, Z.. "Identifying ecosystem services research hotspots to illustrate the importance of site-specific research: An Atlantic coastal region case study". Environmental and Sustainability Indicators 6 (2020): 100031. http://dx.doi.org/10.1016/j.indic.2020.100031. 10.1016/j.indic.2020.100031 Linares, Marden S.; Callisto, Marcos; Marques, João Carlos. "Assessing biological diversity and thermodynamic indicators in the dam decommissioning process". Ecological Indicators 109 (2020): 105832. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.105832. 10.1016/j.ecolind.2019.105832 Mesquita, Andreia F.; Marques, Sérgio M.; Marques, João C.; Gonçalves, Fernando J. M.; Gonçalves, Ana M. M.. "Copper sulphate impact on the antioxidant defence system of the marine bivalves Cerastoderma edule and Scrobicularia plana". Scientific Reports 9 1 (2019): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-52925-9. 10.1038/s41598-019-52925-9 Duarte, Bernardo; Matos, Ana Rita; Pedro, Sílvia; Marques, João Carlos; Adão, Helena; Caçador, Isabel. "Dwarf eelgrass (Zostera noltii) leaf fatty acid profile during a natural restoration process: Physiological and ecological implications". Ecological Indicators 106 (2019): 105452. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.105452. 10.1016/j.ecolind.2019.105452 Rodrigues, M.O.; Abrantes, N.; Gonçalves, F.J.M.; Nogueira, H.; Marques, J.C.; Gonçalves, A.M.M.. "Impacts of plastic products used in daily life on the environment and human health: What is known?". Environmental Toxicology and Pharmacology 72 (2019): 103239. http://dx.doi.org/10.1016/j.etap.2019.103239. Publicado • 10.1016/j.etap.2019.103239 Bessa, Filipa; Ratcliffe, Norman; Otero, Vanessa; Sobral, Paula; Marques, João C.; Waluda, Claire M.; Trathan, Phil N.; Xavier, José C.. "Microplastics in gentoo penguins from the Antarctic region". Scientific Reports 9 1 (2019): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-50621-2. Publicado • 10.1038/s41598-019-50621-2 Mantas, V.M.; Pereira, A.J.S.C.; Marques, J.C.. "Partitioning the ocean using dense time series of Earth Observation data. Regions and natural boundaries in the Western Iberian Peninsula". Ecological Indicators 103 (2019): 9-21. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2019.03.045. 10.1016/j.ecolind.2019.03.045 Descoteaux, Danielle; Cai, Yanpeng; Su, Meirong; Farina, Almo; Marques, João Carlos. "Editorial – What should papers appearing in the Environmental and Sustainability Indicators Journal contribute to?". Environmental and Sustainability Indicators 1-2 (2019): 100001. http://dx.doi.org/10.1016/j.indic.2019.06.001. Publicado • 10.1016/j.indic.2019.06.001 Antónia Juliana Pais-Costa; Inmaculada Varó; Mónica Martinez-Haro; Pedro Almeida Vinagre; Andy J. Green; Francisco Hortas; João Carlos Marques; Marta I. Sánchez. "Life history and physiological responses of native and invasive brine shrimps exposed to zinc". Aquatic Toxicology 210 (2019): 148-157. https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2019.02.023. 10.1016/j.aquatox.2019.02.023 Gutiérrez, Irene B.; Mesquita, Andreia F.C.; Nunes, Cláudia; Coimbra, Manuel A.; Gonçalves, Fernando J.M.; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M.M.. "Impacts of S-metolachlor and terbuthylazine in fatty acid and carbohydrate composition of the benthic clam Scrobicularia plana". Ecotoxicology and Environmental Safety 173 (2019): 293-304. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecoenv.2019.02.034. 10.1016/j.ecoenv.2019.02.034 Nielsen, S.N.; Marques, J.C.. "Commemorating a true ecological holist". Ecological Indicators 100 (2019): 1-3. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.10.064. 10.1016/j.ecolind.2018.10.064 Marques, João Carlos. "Coastal systems in transition: The game of possibilities for sustainability under global climate change". Ecological Indicators 100 (2019): 11-19. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.10.055. 10.1016/j.ecolind.2017.10.055 Rocha, Carolina P.; Cabral, Henrique N.; Nunes, Cláudia; Coimbra, Manuel A.; Gonçalves, Fernando J. M.; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M. M.. "Biochemical impacts in adult and juvenile farmed European seabass and gilthead seabream from semi-intensive aquaculture of southern European estuarine systems". Environmental Science and Pollution Research 26 13 (2019): 13422-13440. http://dx.doi.org/10.1007/s11356-019-04825-8. 10.1007/s11356-019-04825-8 Duarte, Bernardo; Prata, Diogo; Matos, Ana Rita; Cabrita, Maria Teresa; Caçador, Isabel; Marques, João Carlos; Cabral, Henrique N.; Reis-Santos, Patrick; Fonseca, Vanessa F.. "Ecotoxicity of the lipid-lowering drug bezafibrate on the bioenergetics and lipid metabolism of the diatom Phaeodactylum tricornutum". Science of The Total Environment 650 (2019): 2085-2094. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.09.354. 10.1016/j.scitotenv.2018.09.354 Gutiérrez, Irene B.; Mesquita, Andreia F.; Gonçalves, Fernando J.M.; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M.M.. "Biomarkers’ responses of the benthic clam Scrobicularia plana to the main active ingredients (S-metolachlor and Terbuthylazine) of a common herbicide". Ecological Indicators 96 (2019): 611-619. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.09.044. 10.1016/j.ecolind.2018.09.044 Vieira, R.; Marques, S.M.; Neto, J.M.; Barría, P.; Marques, J.C.; Gonçalves, F.J.M.; Gonçalves, A.M.M.. "Brain as a target organ of climate events: Environmental induced biochemical changes in three marine fish species". Ecological Indicators 95 (2018): 815-824. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.08.019. 10.1016/j.ecolind.2018.08.019 Vinagre, Catarina; Mendonça, Vanessa; Flores, Augusto A.V.; Baeta, Alexandra; Marques, João Carlos. "Complex food webs of tropical intertidal rocky shores (SE Brazil) – An isotopic perspective". Ecological Indicators 95 (2018): 485-491. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.07.065. 10.1016/j.ecolind.2018.07.065 Caro, Claudia; Pinto, Rute; Marques, João Carlos. "Use and usefulness of open source spatial databases for the assessment and management of European coastal and marine ecosystem services". Ecological Indicators 95 (2018): 41-52. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.06.070. 10.1016/j.ecolind.2018.06.070 Souza, Allan T.; Ilarri, Martina I.; Timóteo, Sérgio; Marques, João Carlos; Martins, Irene. "Assessing the effects of temperature and salinity oscillations on a key mesopredator fish from European coastal systems". Science of The Total Environment 640-641 (2018): 1332-1345. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.05.348. 10.1016/j.scitotenv.2018.05.348 Duarte, Bernardo; Cabrita, Maria Teresa; Vidal, Tânia; Pereira, Joana Luísa; Pacheco, Mário; Pereira, Patrícia; Canário, João; et al. "Phytoplankton community-level bio-optical assessment in a naturally mercury contaminated Antarctic ecosystem (Deception Island)". Marine Environmental Research 140 (2018): 412-421. http://dx.doi.org/10.1016/j.marenvres.2018.07.014. 10.1016/j.marenvres.2018.07.014 Rodrigues, M.O.; Abrantes, N.; Gonçalves, F.J.M.; Nogueira, H.; Marques, J.C.; Gonçalves, A.M.M.. "Spatial and temporal distribution of microplastics in water and sediments of a freshwater system (Antuã River, Portugal)". Science of The Total Environment 633 (2018): 1549-1559. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.03.233. 10.1016/j.scitotenv.2018.03.233 Filimonova, Valentina; De Troch, Marleen; Gonçalves, Fernando; Marques, João C.; Marques, Sérgio M.; Gonçalves, Ana M.M.; De Laender, Frederik. "Effects of a herbicide and copper mixture on the quality of marine plankton". Ecotoxicology and Environmental Safety 156 (2018): 9-17. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecoenv.2018.02.038. 10.1016/j.ecoenv.2018.02.038 Duarte, Bernardo; Silva, Helena; Dias, João Miguel; Sleimi, Noomene; Marques, João Carlos; Caçador, Isabel. "Functional and ecophysiological traits of Halimione portulacoides and Sarcocornia perennis ecotypes in Mediterranean salt marshes under different tidal exposures". Ecological Research 33 6 (2018): 1145-1156. http://dx.doi.org/10.1007/s11284-018-1632-y. 10.1007/s11284-018-1632-y Duarte, Bernardo; Martins, Irene; Rosa, Rui; Matos, Ana R.; Roleda, Michael Y.; Reusch, Thorsten B. H.; Engelen, Aschwin H.; et al. "Climate Change Impacts on Seagrass Meadows and Macroalgal Forests: An Integrative Perspective on Acclimation and Adaptation Potential". Frontiers in Marine Science 5 (2018): http://dx.doi.org/10.3389/fmars.2018.00190. 10.3389/fmars.2018.00190 Rodrigues, M.O.; Gonçalves, A.M.M.; Gonçalves, F.J.M.; Nogueira, H.; Marques, J.C.; Abrantes, N.. "Effectiveness of a methodology of microplastics isolation for environmental monitoring in freshwater systems". Ecological Indicators 89 (2018): 488-495. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.02.038. 10.1016/j.ecolind.2018.02.038 Filimonova, Valentina; Nys, Charlotte; De Schamphelaere, Karel A. C.; Gonçalves, Fernando; Marques, João C.; Gonçalves, Ana M. M.; De Troch, Marleen. "Ecotoxicological and biochemical mixture effects of an herbicide and a metal at the marine primary producer diatom Thalassiosira weissflogii and the primary consumer copepod Acartia tonsa". Environmental Science and Pollution Research 25 22 (2018): 22180-22195. http://dx.doi.org/10.1007/s11356-018-2302-x. 10.1007/s11356-018-2302-x Linares, Marden Seabra; Callisto, Marcos; Marques, João Carlos. "Thermodynamic based indicators illustrate how a run-of-river impoundment in neotropical savanna attracts invasive species and alters the benthic macroinvertebrate assemblages’ complexity". Ecological Indicators 88 (2018): 181-189. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2018.01.040. 10.1016/j.ecolind.2018.01.040 Duarte, Bernardo; Matos, Ana Rita; Marques, João Carlos; Caçador, Isabel. "Leaf fatty acid remodeling in the salt-excreting halophytic grass Spartina patens along a salinity gradient". Plant Physiology and Biochemistry 124 (2018): 112-116. http://dx.doi.org/10.1016/j.plaphy.2018.01.007. 10.1016/j.plaphy.2018.01.007 Bessa, Filipa; Barría, Pablo; Neto, João M.; Frias, João P.G.L.; Otero, Vanessa; Sobral, Paula; Marques, J.C.. "Occurrence of microplastics in commercial fish from a natural estuarine environment". Marine Pollution Bulletin 128 (2018): 575-584. http://dx.doi.org/10.1016/j.marpolbul.2018.01.044. 10.1016/j.marpolbul.2018.01.044 Pérez-Romero, Jesús Alberto; Idaszkin, Yanina Lorena; Duarte, Bernardo; Baeta, Alexandra; Marques, João Carlos; Redondo-Gómez, Susana; Caçador, Isabel; Mateos-Naranjo, Enrique. "Atmospheric CO 2 enrichment effect on the Cu-tolerance of the C 4 cordgrass Spartina densiflora". Journal of Plant Physiology 220 (2018): 155-166. http://dx.doi.org/10.1016/j.jplph.2017.11.005. 10.1016/j.jplph.2017.11.005 Linares, M.S.; Callisto, M.; Marques, J.C.. "Compliance of secondary production and eco-exergy as indicators of benthic macroinvertebrates assemblages’ response to canopy cover conditions in Neotropical headwater streams". Science of the Total Environment 613-614 (2018): 1543-1550. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85028728198&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.scitotenv.2017.08.282 Mesquita, A.F.; Gonçalves, F.; Verdelhos, T.; Marques, J.C.; Gonçalves, A.M.M.. "Fatty acids profiles modifications in the bivalves Cerastoderma edule and Scrobicularia plana in response to copper sulphate". Ecological Indicators 85 (2018): 318-328. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85033365193&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2017.10.007 Vinagre, C.; Silva, R.; Mendonça, V.; Flores, A.A.V.; Baeta, A.; Marques, J.C.. "Food web organization following the invasion of habitat-modifying Tubastraea spp. corals appears to favour the invasive borer bivalve Leiosolenus aristatus". Ecological Indicators 85 (2018): 1204-1209. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85036669413&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2017.11.056 Duarte, B.; Carreiras, J.; Pérez-Romero, J.A.; Mateos-Naranjo, E.; Redondo-Gómez, S.; Matos, A.R.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Halophyte fatty acids as biomarkers of anthropogenic-driven contamination in Mediterranean marshes: Sentinel species survey and development of an integrated biomarker response (IBR) index". Ecological Indicators 87 (2018): 86-96. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85039148535&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2017.12.050 Duarte, Bernardo; Neto, João M.; Marques, João C.; Adams, Janine B.; Caçador, Isabel. "Marine angiosperm indices used to assess ecological status within the Water Framework Directive and South African National Water Act: Learning from differences and common issues". Ecological Indicators 83 (2017): 192-200. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.07.032. 10.1016/j.ecolind.2017.07.032 Baeta, Alexandra; Vieira, Luís Russo; Lírio, Ana Virgínia; Canhoto, Cristina; Marques, João C.; Guilhermino, Lúcia. "Use of stable isotope ratios of fish larvae as indicators to assess diets and patterns of anthropogenic nitrogen pollution in estuarine ecosystems". Ecological Indicators 83 (2017): 112-121. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.07.062. 10.1016/j.ecolind.2017.07.062 Ferreira, Ana; Alves, Ana Sofia; Marques, João Carlos; Seixas, Sónia. "Ecosystem response to different management options in Marine Protected Areas (MPA): A case study of intertidal rocky shore communities". Ecological Indicators 81 (2017): 471-480. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.06.028. 10.1016/j.ecolind.2017.06.028 Vinagre, Pedro Almeida; Pais-Costa, Antónia Juliana; Hawkins, Stephen John; Borja, Ángel; Marques, João Carlos; Neto, João Magalhães. "Addressing a gap in the Water Framework Directive implementation: Rocky shores assessment based on benthic macroinvertebrates". Ecological Indicators 78 (2017): 489-501. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.03.044. 10.1016/j.ecolind.2017.03.044 Goodwin, Kelly D.; Thompson, Luke R.; Duarte, Bernardo; Kahlke, Tim; Thompson, Andrew R.; Marques, João C.; Caçador, Isabel. "DNA Sequencing as a Tool to Monitor Marine Ecological Status". Frontiers in Marine Science 4 (2017): http://dx.doi.org/10.3389/fmars.2017.00107. 10.3389/fmars.2017.00107 Duarte, B.; Vaz, N.; Valentim, J.M.; Dias, J.M.; Silva, H.; Marques, J.C.; Sleimi, N.; Caçador, I.. "Revisiting the outwelling hypothesis: Modelling salt marsh detrital metal exports under extreme climatic events". Marine Chemistry 191 (2017): 24-33. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85008516014&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.marchem.2016.12.002 Gonçalves, S.C.; Marques, J.C.. "Assessement and management of environmental quality conditions in marine sandy beaches for its sustainable use—Virtues of the population based approach". Ecological Indicators 74 (2017): 140-146. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84998773588&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.11.024 Gonçalves, A.M.M.; Barroso, D.V.; Serafim, T.L.; Verdelhos, T.; Marques, J.C.; Gonçalves, F.. "The biochemical response of two commercial bivalve species to exposure to strong salinity changes illustrated by selected biomarkers". Ecological Indicators 77 (2017): 59-66. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85012862794&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2017.01.020 Duarte, B.; Pedro, S.; Marques, J.C.; Adão, H.; Caçador, I.. "Zostera noltii development probing using chlorophyll a transient analysis (JIP-test) under field conditions: Integrating physiological insights into a photochemical stress index". Ecological Indicators 76 (2017): 219-229. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85012284454&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2017.01.023 van der Linden, P.; Marchini, A.; Smith, C.J.; Dolbeth, M.; Simone, L.R.L.; Marques, J.C.; Molozzi, J.; Medeiros, C.R.; Patrício, J.. "Functional changes in polychaete and mollusc communities in two tropical estuaries". Estuarine, Coastal and Shelf Science 187 (2017): 62-73. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85009080859&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2016.12.019 Gaspar, R.; Marques, L.; Pinto, L.; Baeta, A.; Pereira, L.; Martins, I.; Marques, J.C.; Neto, J.M.. "Origin here, impact there—The need of integrated management for river basins and coastal areas". Ecological Indicators 72 (2017): 794-802. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84987942244&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.09.013 Bessa da Silva, M.; Abrantes, N.; Patinha, C.; Ferreira da Silva, E.; Marques, J.C.; Gonçalves, F.; Pereira, R.. "Soil ecotoxicological screening (tier 1) for a diffuse-contaminated drainage area surrounding a lacustrine ecosystem in the Centre of Portugal". Journal of Soils and Sediments (2017): 1-16. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85020085189&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s11368-017-1735-z Veríssimo, H.; Verdelhos, T.; Baeta, A.; van der Linden, P.; Garcia, A.C.; Marques, J.C.. "Comparison of thermodynamic-oriented indicators and trait-based indices ability to track environmental changes: Response of benthic macroinvertebrates to management in a temperate estuary". Ecological Indicators 73 (2017): 809-824. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85006757670&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.10.040 Duarte, B.; Cabrita, M.T.; Gameiro, C.; Matos, A.R.; Godinho, R.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Disentangling the photochemical salinity tolerance in Aster tripolium L.: connecting biophysical traits with changes in fatty acid composition". Plant Biology 19 2 (2017): 239-248. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85006337194&partnerID=MN8TOARS. 10.1111/plb.12517 Linares, M.S.; Callisto, M.; Marques, J.C.. "Invasive bivalves increase benthic communities complexity in neotropical reservoirs". Ecological Indicators 75 (2017): 279-285. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85008602583&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.12.046 Vinagre, P.A.; Veríssimo, H.; Pais-Costa, A.J.; Hawkins, S.J.; Borja, Á.; Marques, J.C.; Neto, J.M.. "Do structural and functional attributes show concordant responses to disturbance? Evidence from rocky shore macroinvertebrate communities". Ecological Indicators 75 (2017): 57-72. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85007321970&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.12.023 Ferreira, A.M.; Marques, J.C.; Seixas, S.. "Integrating marine ecosystem conservation and ecosystems services economic valuation: Implications for coastal zones governance". Ecological Indicators 77 (2017): 114-122. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85013052827&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2017.01.036 Marques, J.C.; Zurlini, G.. "Felix Müller stepping down as Editor-in-Chief of ecological indicators". Ecological Indicators 76 (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85013859889&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2017.02.015 Martinez-Haro, M.; Pais-Costa, A.J.; Verdelhos, T.; Marques, J.C.; Acevedo, P.. "Optimising a clearance index based on neutral red as an indicator of physiological stress for bivalves". Ecological Indicators 71 (2016): 514-521. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84979752497&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.07.025 Filimonova, V.; Gonçalves, F.; Marques, J.C.; De Troch, M.; Gonçalves, A.M.M.. "Fatty acid profiling as bioindicator of chemical stress in marine organisms: A review". Ecological Indicators 67 (2016): 657-672. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84962014032&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.03.044 Castro, N.; Félix, P.M.; Neto, J.M.; Cabral, H.; Marques, J.C.; Costa, M.J.; Costa, J.L.. "Fish communities' response to implementation of restoring measures in a highly artificialized estuary". Ecological Indicators 67 (2016): 743-752. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84962905865&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.03.040 Van Der Linden, P.; Borja, A.; Rodríquez, J.G.; Muxika, I.; Galparsoro, I.; Patrício, J.; Veríssimo, H.; Marques, J.C.. "Spatial and temporal response of multiple trait-based indices to natural- and anthropogenic seafloor disturbance (effluents)". Ecological Indicators 69 (2016): 617-628. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84971310881&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.05.020 Nóbrega-Silva, C.; Patrício, J.; Marques, J.C.; Olímpio, M.D.S.; Farias, J.N.B.; Molozzi, J.. "Is polychaete family-level sufficient to assess impact on tropical estuarine gradients?". Acta Oecologica 77 (2016): 50-58. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84987781415&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.actao.2016.08.009 Bessa da Silva, M.; Abrantes, N.; Rocha-Santos, T.A.P.; Duarte, A.C.; Freitas, A.C.; Gomes, A.M.; Carvalho, A.P.; et al. "Effects of dietary exposure to herbicide and of the nutritive quality of contaminated food on the reproductive output of Daphnia magna". Aquatic Toxicology 179 (2016): 1-7. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84982102910&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.aquatox.2016.08.008 Duarte, B.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Ecophysiological response of native and invasive Spartina species to extreme temperature events in Mediterranean marshes". Biological Invasions 18 8 (2016): 2189-2205. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84978525363&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10530-015-0958-4 Vinagre, P.A.; Pais-Costa, A.J.; Hawkins, S.J.; Borja, Á.; Marques, J.C.; Neto, J.M.. "Ability of invertebrate indices to assess ecological condition on intertidal rocky shores". Ecological Indicators 70 (2016): 255-268. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84976588845&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.06.004 Vinagre, P.A.; Pais-Costa, A.J.; Gaspar, R.; Borja, Á.; Marques, J.C.; Neto, J.M.. "Response of macroalgae and macroinvertebrates to anthropogenic disturbance gradients in rocky shores". Ecological Indicators 61 (2016): 850-864. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84949670258&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2015.10.038 Gonçalves, A.M.M.; Mesquita, A.F.; Verdelhos, T.; Coutinho, J.A.P.; Marques, J.C.; Gonçalves, F.. "Fatty acids' profiles as indicators of stress induced by of a common herbicide on two marine bivalves species: Cerastoderma edule (Linnaeus, 1758) and Scrobicularia plana (da Costa, 1778)". Ecological Indicators 63 (2016): 209-218. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84952317923&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2015.12.006 Pinto, R.; Brouwer, R.; Patrício, J.; Abreu, P.; Marta-Pedroso, C.; Baeta, A.; Franco, J.N.; Domingos, T.; Marques, J.C.. "Valuing the non-market benefits of estuarine ecosystem services in a river basin context: Testing sensitivity to scope and scale". Estuarine, Coastal and Shelf Science 169 (2016): 95-105. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84957922001&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2015.11.028 van der Linden, P.; Marchini, A.; Dolbeth, M.; Patrício, J.; Veríssimo, H.; Marques, J.C.. "The performance of trait-based indices in an estuarine environment". Ecological Indicators 61 (2016): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84951879271&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2015.09.039 Teixeira, Z.; Marques, J.C.; Pontius, R.G.. "Evidence for deviations from uniform changes in a Portuguese watershed illustrated by CORINE maps: An Intensity Analysis approach". Ecological Indicators 66 (2016): 282-290. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84958983727&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.01.018 Mantas, V.M.; Marques, J.C.; Pereira, A.J.S.C.. "A geospatial approach to monitoring impervious surfaces in watersheds using Landsat data (the Mondego Basin, Portugal as a case study)". Ecological Indicators 71 (2016): 449-466. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84979900466&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2016.07.013 Martinez-Haro, M.; Acevedo, P.; Pais-Costa, A.J.; Taggart, M.A.; Martins, I.; Ribeiro, R.; Marques, J.C.. "Assessing estuarine quality: A cost-effective in situ assay with amphipods". Environmental Pollution 212 (2016): 382-391. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84960887069&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.envpol.2016.01.071 de Lira Azevêdo, E.; de Lucena Barbosa, J.E.; Vidigal, T.H.D.A.; Marques, J.C.; Callisto, M.; Molozzi, J.. "Potential ecological distribution of alien mollusk Corbicula largillierti and its relationship with human disturbance in a semi-arid reservoir \| Potencial ecológico de distribuição do molusco alienígena Corbicula largillierti e sua relação com perturbação humana em um reservatório no semiárido". Biota Neotropica 16 1 (2016): 1-8. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84962124820&partnerID=MN8TOARS. 10.1590/1676-0611-BN-2015-0109 Filimonova, V.; Gonçalves, F.; Marques, J.C.; De Troch, M.; Gonçalves, A.M.M.. "Biochemical and toxicological effects of organic (herbicide Primextra^®Gold TZ) and inorganic (copper) compounds on zooplankton and phytoplankton species". Aquatic Toxicology 177 (2016): 33-43. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84969945422&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.aquatox.2016.05.008 Verdelhos, T.; Marques, J.C.; Anastácio, P.. "Behavioral and mortality responses of the bivalves Scrobicularia plana and Cerastoderma edule to temperature, as indicator of climate change's potential impacts". Ecological Indicators 58 (2015): 95-103. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolind.2015.05.042. 10.1016/j.ecolind.2015.05.042 Araújo, C.V.M.; Moreira-Santos, M.; Patrício, J.; Martins, I.; Moreno-Garrido, I.; Blasco, J.; Marques, J.C.; Ribeiro, R.. "Feeding niche preference of the mudsnail Peringia ulvae". Marine and Freshwater Research 66 7 (2015): 573-581. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84934272090&partnerID=MN8TOARS. 10.1071/MF14021 Araújo, C.V.M.; Martinez-Haro, M.; Pais-Costa, A.J.; Marques, J.C.; Ribeiro, R.. "Patchy sediment contamination scenario and the habitat selection by an estuarine mudsnail". Ecotoxicology (2015): 1-7. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84949938759&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10646-015-1599-1 Duarte, B.; Santos, D.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Impact of heat and cold events on the energetic metabolism of the C3 halophyte Halimione portulacoides". Estuarine, Coastal and Shelf Science 167 (2015): 166-177. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84949201658&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2015.10.003 Teixeira, Z.; Marques, J.C.. "Relating landscape to stream nitrate-N levels in a coastal eastern-Atlantic watershed (Portugal)". Ecological Indicators 61 (2015): 693-706. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84949633690&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2015.10.021 Duarte, B.; Goessling, J.W.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Ecophysiological constraints of Aster tripolium under extreme thermal events impacts: Merging biophysical, biochemical and genetic insights". Plant Physiology and Biochemistry 97 (2015): 217-228. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84944674893&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.plaphy.2015.10.015 Azevêdo, D.J.S.; Barbosa, J.E.L.; Gomes, W.I.A.; Porto, D.E.; Marques, J.C.; Molozzi, J.. "Diversity measures in macroinvertebrate and zooplankton communities related to the trophic status of subtropical reservoirs: Contradictory or complementary responses?". Ecological Indicators 50 (2015): 135-149. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84913530520&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2014.10.010 Rossi, F.; Baeta, A.; Marques, J.C.. "Stable isotopes reveal habitat-related diet shifts in facultative deposit-feeders". Journal of Sea Research 95 (2015): 172-179. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84921403332&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.seares.2014.07.004 Martinez-Haro, M.; Beiras, R.; Bellas, J.; Capela, R.; Coelho, J.P.; Lopes, I.; Moreira-Santos, M.; et al. "A review on the ecological quality status assessment in aquatic systems using community based indicators and ecotoxicological tools: What might be the added value of their combination?". Ecological Indicators 48 (2015): 8-16. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84906696714&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2014.07.024 Alves, A.S.; Caetano, A.; Costa, J.L.; Costa, M.J.; Marques, J.C.. "Estuarine intertidal meiofauna and nematode communities as indicator of ecosystem's recovery following mitigation measures". Ecological Indicators 54 (2015): 184-196. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84925143369&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2015.02.013 Ferreira, A.; Seixas, S.; Marques, J.C.. ""Bottom-up management approach to coastal marine protected areas in Portugal"". Ocean and Coastal Management (2015): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84929180057&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ocecoaman.2015.05.008 Cabral, H.; Marques, J.C.; Guilhermino, L.; de Jonge, V.; Elliott, M.. "Coastal systems under change: Tuning assessment and management tools". Estuarine, Coastal and Shelf Science 167 (2015): 1-3. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84949231512&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2015.11.022 Duarte, B.; Baeta, A.; Rousseau-Gueutin, M.; Ainouche, M.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "A tale of two spartinas: Climatic, photobiological and isotopic insights on the fitness of non-indigenous versus native species". Estuarine, Coastal and Shelf Science 167 (2015): 178-190. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84949234899&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2015.06.015 Pais-Costa, A.J.; Acevedo, P.; Marques, J.C.; Martinez-Haro, M.. "Addressing the recovery of feeding rates in post-exposure feeding bioassays: Cyathura carinata as a case study". Environmental Research 137 (2015): 222-225. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84920870940&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.envres.2014.12.023 Neves, M.; Castro, B.B.; Vidal, T.; Vieira, R.; Marques, J.C.; Coutinho, J.A.P.; Gonçalves, F.; Gonçalves, A.M.M.. "Biochemical and populational responses of an aquatic bioindicator species, Daphnia longispina, to a commercial formulation of a herbicide (Primextra® Gold TZ) and its active ingredient (S-metolachlor)". Ecological Indicators 53 (2015): 220-230. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84923798744&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2015.01.031 Duarte, B.; Santos, D.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Ecophysiological constraints of two invasive plant species under asaline gradient: Halophytes versus glycophytes". Estuarine, Coastal and Shelf Science (2015): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84929017835&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2015.04.007 Vinagre, P.A.; Pais-Costa, A.J.; Marques, J.C.; Neto, J.M.. "Setting reference conditions for mesohaline and oligohaline macroinvertebrate communities sensu WFD: Helping to define achievable scenarios in basin management plans". Ecological Indicators 56 (2015): 171-183. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84928495323&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2015.04.008 Leite, Nuno; Guerra, Alexandra; Almeida, Alda; Marques, João Carlos; Martins, Irene. "Long term variation of an amphipod species’ population secondary production as indicator of incomplete resilience in a temperate estuary". Ecological Indicators 36 00 (2014): 324-333. Aceite para publicação • 10.1016/j.ecolind.2013.08.001 Pinto, R.; De Jonge, V.N.; Marques, J.C.. "Linking biodiversity indicators, ecosystem functioning, provision of services and human well-being in estuarine systems: Application of a conceptual framework". Ecological Indicators 36 (2014): 644-655. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84886818926&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2013.09.015 Bessa, F.; Baeta, A.; Marques, J.C.. "Niche segregation amongst sympatric species at exposed sandy shores with contrasting wrack availabilities illustrated by stable isotopic analysis". Ecological Indicators 36 (2014): 694-702. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84887159413&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2013.09.026 Guerra, A.; Leite, N.; Marques, J.C.; Ford, A.T.; Martins, I.. "Predicting the variation in Echinogammarus marinus at its southernmost limits under global warming scenarios: Can the sex-ratio make a difference?". Science of the Total Environment 466-467 (2014): 1022-1029. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84883346959&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.scitotenv.2013.07.102 Nourisson, D.H.; Bessa, F.; Scapini, F.; Marques, J.C.; Nourisson, D. H.; F. Bessa; F. Scapini; J. C. Marques. "Macrofaunal community abundance and diversity and talitrid orientation as potential indicators of ecological long-term effects of a sand-dune recovery intervention". Ecological Indicators 36 00 (2014): 356-366. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84884129217&partnerID=MN8TOARS. Aceite para publicação • 10.1016/j.ecolind.2013.08.005 Borja, A.; Prins, T.C.; Simboura, N.; Andersen, J.H.; Berg, T.; Marques, J.-C.; Neto, J.M.; et al. "Tales from a thousand and one ways to integrate marine ecosystem components when assessing the environmental status". Frontiers in Marine Science 1 DEC (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85006722576&partnerID=MN8TOARS. 10.3389/fmars.2014.00072 Souza, A.T.; Dias, E.; Marques, J.C.; Antunes, C.; Martins, I.. "Population structure, production and feeding habit of the sand goby Pomatoschistus minutus (Actinopterygii: Gobiidae) in the Minho estuary (NW Iberian Peninsula)". Environmental Biology of Fishes 98 1 (2014): 287-300. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84912561528&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10641-014-0259-2 Duarte, B.; Freitas, J.; Valentim, J.; Medeiros, J.P.; Costa, J.L.; Silva, H.; Dias, J.M.; et al. "Abiotic control modelling of salt marsh sediments respiratory CO 2 fluxes: Application to increasing temperature scenarios". Ecological Indicators 46 (2014): 110-118. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84904007315&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2014.06.018 Martinez-Haro, M.; Moreira-Santos, M.; Marques, J.C.; Ribeiro, R.. "A short-term laboratory and in situ sediment assay based on the postexposure feeding of the estuarine isopod Cyathura carinata". Environmental Research 134 (2014): 242-250. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84907343536&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.envres.2014.07.013 Pinto, R.; Da Conceição Cunha, M.; Roseta-Palma, C.; Marques, J.C.. "Mainstreaming Sustainable Decision-making for Ecosystems: Integrating Ecological and Socio-economic Targets within a Decision Support System". Environmental Processes 1 1 (2014): 7-19. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84950316490&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s40710-014-0006-x Ceia, F.R.; Paiva, V.H.; Garthe, S.; Marques, J.C.; Ramos, J.A.. "Can variations in the spatial distribution at sea and isotopic niche width be associated with consistency in the isotopic niche of a pelagic seabird species?". Marine Biology 161 8 (2014): 1861-1872. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84926676856&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s00227-014-2468-9 Couto, T.; Martins, I.; Duarte, B.; Caçador, I.; Marques, J.C.. "Modelling the effects of global temperature increase on the growth of salt marsh plants". Applied Ecology and Environmental Research 12 3 (2014): 753-764. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84906824851&partnerID=MN8TOARS. 10.15666/aeer/1203_753764 Duarte, B.; Santos, D.; Silva, H.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Photochemical and biophysical feedbacks of C3 and C4 Mediterranean halophytes to atmospheric CO2 enrichment confirmed by their stable isotope signatures". Plant Physiology and Biochemistry 80 (2014): 10-22. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84897947375&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.plaphy.2014.03.016 Niquil, N.; Baeta, A.; Marques, J.C.; Chaalali, A.; Lobry, J.; Patrício, J.. "Reaction of an estuarine food web to disturbance: Lindeman's perspective". Marine Ecology Progress Series 512 (2014): 141-154. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84907955427&partnerID=MN8TOARS. 10.3354/meps10885 Ceia, F.R.; Paiva, V.H.; Fidalgo, V.; Morais, L.; Baeta, A.; Crisóstomo, P.; Mourato, E.; et al. "Annual and seasonal consistency in the feeding ecology of an opportunistic species, the yellow-legged gull Larus michahellis". Marine Ecology Progress Series 497 00 (2014): 273-284. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84893746037&partnerID=MN8TOARS. Aceite para publicação • 10.3354/meps10586 de Jonge, V.N.; Marques, J.C.. "A flourishing period for Ocean & Coastal Management". Ocean and Coastal Management 89 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84893475470&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ocecoaman.2014.01.005 Teixeira, Z.; Teixeira, H.; Marques, J.C.. "Systematic processes of land use/land cover change to identify relevant driving forces: Implications on water quality". Science of the Total Environment 470-471 (2014): 1320-1335. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84889638794&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.scitotenv.2013.10.098 Ceia, F.R.; Paiva, V.H.; Ceia, R.S.; Hervías, S.; Garthe, S.; Marques, J.C.; Ramos, J.A.. "Spatial foraging segregation by close neighbours in a wide-ranging seabird". Oecologia 177 2 (2014): 431-440. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84922080042&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s00442-014-3109-1 Alves, A.S.; Veríssimo, H.; Costa, M.J.; Marques, J.C.. "Taxonomic resolution and Biological Traits Analysis (BTA) approaches in estuarine free-living nematodes". Estuarine, Coastal and Shelf Science 138 (2014): 69-78. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84893190996&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2013.12.014 Bessa, F.; Marques, J.C.; Scapini, F.. "Behavioural adaptations of two sympatric sandhoppers living on a mesotidal European Atlantic sandy beach". Estuarine, Coastal and Shelf Science 147 (2014): 17-24. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84904613067&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2014.05.016 Duarte, B.; Santos, D.; Silva, H.; Marques, J.C.; Caçador, I.; Sleimi, N.. "Light-dark O2dynamics in submerged leaves of C3and C4halophytes under increased dissolved CO2: Clues for saltmarsh response to climate change". AoB PLANTS 6 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84986601734&partnerID=MN8TOARS. 10.1093/aobpla/plu067 Duarte, B.; Valentim, J.M.; Dias, J.M.; Silva, H.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Modelling sea level rise (SLR) impacts on salt marsh detrital outwelling C and N exports from an estuarine coastal lagoon to the ocean (Ria de Aveiro, Portugal)". Ecological Modelling 289 (2014): 36-44. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84904296273&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolmodel.2014.06.020 Duarte, B.; Santos, D.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Biophysical probing of Spartina maritima photo-system II changes during prolonged tidal submersion periods". Plant Physiology and Biochemistry 77 (2014): 122-132. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84894681461&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.plaphy.2014.01.023 Bessa, F.; Gonçalves, S.C.; Franco, J.N.; André, J.N.; Cunha, P.P.; Marques, J.C.. "Temporal changes in macrofauna as response indicator to potential human pressures on sandy beaches". Ecological Indicators 41 (2014): 49-57. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84894104109&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2014.01.023 Borja, A.; M. Elliot; J. H. Andersen; A. C. Cardoso; J. Carstensen; J. G. Ferreira; A.-S. Heiskanen; et al. "Good Environmental Status of marine ecosystems: What is it and how do we know when we have attained it?". Marine Poluttion Bulletin 76 00 (2013): 16-27. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84886091159&partnerID=MN8TOARS. Aceite para publicação • 10.1016/j.marpolbul.2013.08.042 Borja, A.; J. C. Marques; C. Olabarria; V. Quintino; Marques, J.-C.; Olabarria, C.; Quintino, V.. "Marine research in the Iberian Peninsula: A pledge for better times after economic crisis". Jornal of Sea Research 83 00 (2013): 1-8. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84886393280&partnerID=MN8TOARS. Aceite para publicação • 10.1016/j.seares.2013.07.004 Modesto, V.; Franco, J. N.; Sousa, R.; Patricio, J.; Marques, J. C.; Neto, J. M.. "SPATIAL AND TEMPORAL DYNAMICS OF CORBICULA FLUMINEA (MULLER, 1774) IN RELATION TO ENVIRONMENTAL VARIABLES IN THE MONDEGO ESTUARY (PORTUGAL)". Journal of Molluscan Studies 00 (2013): 00-00. Publicado • 10.1093/mollus/eyt026 Couto, T.; Duarte, B.; Caçador, I.; Baeta, A.; Marques, J.C.. "Salt marsh plants carbon storage in a temperate Atlantic estuary illustrated by a stable isotopic analysis based approach". Ecological Indicators 32 00 (2013): 305-311. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2013.04.004 Losi, V.; T. J. Ferrero; M. Moreno; L. Gaozza; A. Rovere; M. Firpo; J. C. Marques; et al. "The use of nematodes in assessing ecological conditions in shallow waters surrounding a Mediterranean harbour facility". Estuarine Coastal and Sheld Science 130 00 (2013): 209-221. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84883169051&partnerID=MN8TOARS. Aceite para publicação • 10.1016/j.ecss.2013.02.017 Gonçalves, Sílvia C.; Anastácio, Pedro M.; Marques, João C.. "Talitrid and Tylid crustaceans bioecology as a tool to monitor and assess sandy beaches’ ecological quality condition". Ecological Indicators 29 00 (2013): 549-557. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2013.01.035 Couto, Thiago; Duarte, Bernardo; Barroso, Dimitri; Ca¿ador, Isabel; Marques, Jo¿o C.. "Halophytes as sources of metals in estuarine systems with low levels of contamination". Functional Plant Biology 00 (2013): 00-00. Publicado • 10.1071/FP12300 Souza, Allan T.; Dias, Ester; Nogueira, Ana; Campos, Joana; Marques, João C.; Martins, Irene. "Population ecology and habitat preferences of juvenile flounder Platichthys flesus (Actinopterygii: Pleuronectidae) in a temperate estuary". Journal of Sea Research 79 00 (2013): 60-69. Publicado • 10.1016/j.seares.2013.01.005 Bessa, Filipa; Cunha, David; Gonçalves, Sílvia Correia; Marques, João Carlos. "Sandy beach macrofaunal assemblages as indicators of anthropogenic impacts on coastal dunes". Ecological Indicators 30 00 (2013): 196-204. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2013.02.022 Duarte, B.; J. Freitas; T. Couto; J. Valentim; H. Silva; J. Dias; J. C. Marques; et al. "Abiotic modulation of Spartina maritima photobiology in different latitudinal populations". Estuarine Coastal and Shelf Science 130 00 (2013): 127-137. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84883175631&partnerID=MN8TOARS. Aceite para publicação • 10.1016/j.ecss.2013.02.008 Duarte, B.; Santos, D.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Ecophysiological adaptations of two halophytes to salt stress: Photosynthesis, PS II photochemistry and anti-oxidant feedback – Implications for resilience in climate change". Plant Physiology and Biochemistry 67 00 (2013): 178-188. Publicado • 10.1016/j.plaphy.2013.03.004 Duarte, B.; Freitas, J.; Couto, T.; Valentim, J.; Dias, J.M.; Silva, H.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "New multi-metric Salt Marsh Sediment Microbial Index (SSMI) application to salt marsh sediments ecological status assessment". Ecological Indicators 29 00 (2013): 390-397. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2013.01.008 Müller, Felix; Achtziger, Roland; Joergensen, Sven-Erik; Marques, João Carlos. "10 years Ecological Indicators!". Ecological Indicators 28 00 (2013): 1-3. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.12.007 Souza, A. T.; Dias, E.; Campos, J.; Marques, J. C.; Martins, I.. "Structure, growth and production of a remarkably abundant population of the common goby, Pomatoschistus microps (Actinopterygii: Gobiidae)". Environmental Biology of Fishes 00 (2013): 00-00. Publicado • 10.1007/s10641-013-0172-0 Pinna, Maurizio; Marini, Gabriele; Rosati, Ilaria; Neto, João M.; Patrício, Joana; Marques, João Carlos; Basset, Alberto. "The usefulness of large body-size macroinvertebrates in the rapid ecological assessment of Mediterranean lagoons". Ecological Indicators 29 00 (2013): 48-61. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.12.011 Molozzi, Joseline; Feio, Maria João; Salas, Fuensanta; Marques, João Carlos; Callisto, Marcos. "Maximum ecological potential of tropical reservoirs and benthic invertebrate communities". Environmental Monitoring and Assessment 185 8 (2013): 6591-6606. Publicado • 10.1007/s10661-012-3049-3 Molozzi, Joseline; Salas, Fuensanta; Callisto, Marcos; Marques, João Carlos. "Thermodynamic oriented ecological indicators: Application of Eco-Exergy and Specific Eco-Exergy in capturing environmental changes between disturbed and non-disturbed tropical reservoirs". Ecological Indicators 24 00 (2013): 543-551. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.08.002 Caçador, I.; Neto, J.M.; Duarte, B.; Barroso, D.V.; Pinto, M.; Marques, J.C.. "Development of an Angiosperm Quality Assessment Index (AQuA-Index) for ecological quality evaluation of Portuguese water bodies—A multi-metric approach". Ecological Indicators 25 00 (2013): 141-148. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.09.021 Veríssimo, Helena; Lane, Michael; Patrício, Joana; Gamito, Sofia; Marques, João Carlos. "Trends in water quality and subtidal benthic communities in a temperate estuary: Is the response to restoration efforts hidden by climate variability and the Estuarine Quality Paradox?". Ecological Indicators 24 00 (2013): 56-67. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.05.028 Alves, A.S.; Adão, H.; Ferrero, T.J.; Marques, J.C.; Costa, M.J.; Patrício, J.. "Benthic meiofauna as indicator of ecological changes in estuarine ecosystems: The use of nematodes in ecological quality assessment". Ecological Indicators 24 00 (2013): 462-475. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.07.013 Pinto, R.; de Jonge, V.N.; Marques, J.C.; Chainho, P.; Medeiros, J.P.; Patrício, J.. "Temporal stability in estuarine systems: Implications for ecosystem services provision". Ecological Indicators 24 00 (2013): 246-253. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.06.022 Ceia, Filipe R.; Patrício, Joana; Franco, João; Pinto, Rute; Fernández-Boo, Sergio; Losi, Valentina; Marques, João Carlos; Neto, João M.. "Assessment of estuarine macrobenthic assemblages and ecological quality status at a dredging site in a southern Europe estuary". Ocean & Coastal Management 72 00 (2013): 80-92. Publicado • 10.1016/j.ocecoaman.2011.07.009 Mantas, V.M.; Pereira, A.J.S.C.; Neto, J.; Patrício, J.; Marques, J.C.. "Monitoring estuarine water quality using satellite imagery. The Mondego river estuary (Portugal) as a case study". Ocean & Coastal Management 72 00 (2013): 13-21. Publicado • 10.1016/j.ocecoaman.2011.06.013 Bessa, Filipa; Rossano, Claudia; Nourisson, Delphine; Gambineri, Simone; Marques, João Carlos; Scapini, Felicita. "Behaviour of Talitrus saltator (Crustacea: Amphipoda) on a rehabilitated sandy beach on the European Atlantic Coast (Portugal)". Estuarine, Coastal and Shelf Science 117 00 (2013): 168-177. Publicado • 10.1016/j.ecss.2012.11.014 Pinto, R.; de Jonge, V.N.; Neto, J.M.; Domingos, T.; Marques, J.C.; Patrício, J.. "Towards a DPSIR driven integration of ecological value, water uses and ecosystem services for estuarine systems". Ocean & Coastal Management 72 00 (2013): 64-79. Publicado • 10.1016/j.ocecoaman.2011.06.016 Marques, J.C.; Costa, M.J.; de Jonge, V.. "Introducing “Assessing ecological quality in estuarine and coastal systems - Management perspective"". Ocean & Coastal Management 72 00 (2013): 1-2. Publicado • 10.1016/j.ocecoaman.2011.11.005 Duarte, B.; Caçador, I.; Marques, J.C.; Croudace, I.W.. "Tagus estuary salt marshes feedback to sea level rise over a 40-year period: Insights from the application of geochemical indices". Ecological Indicators 34 (2013): 268-276. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84879407921&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2013.05.015 Veríssimo, H.; Patrício, J.; Teixeira, H.; Carriço, A.; Marques, J.C.; Verissimo, H.; J. Patrício; et al. "Testing different ecological scenarios in a temperate estuary: A contribution towards the implementation of the Ecological Potential assessment". Marine Pollution Bulletin 71 1-2 (2013): 168-178. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84878629351&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.marpolbul.2013.03.019 Xavier, J.C.; Barbosa, A.; Agustí, S.; Alonso-Sáez, L.; Alvito, P.; Ameneiro, J.; Ávila, C.; et al. "Polar marine biology science in Portugal and Spain: Recent advances and future perspectives". Journal of Sea Research 83 00 (2013): 9-29. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84886290619&partnerID=MN8TOARS. Aceite para publicação • 10.1016/j.seares.2013.05.013 Veríssimo, Helena; Neto, João M.; Teixeira, Heliana; Franco, J.N.; Fath, Brian D.; Marques, João Carlos; Patrício, Joana. "Ability of benthic indicators to assess ecological quality in estuaries following management". Ecological Indicators 19 00 (2012): 130-143. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2011.06.014 Gamito, Sofia; Patrício, Joana; Neto, João M.; Teixeira, Heliana; Marques, João Carlos. "Feeding diversity index as complementary information in the assessment of ecological quality status". Ecological Indicators 19 00 (2012): 73-78. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2011.08.003 Gamito, Sofia; Patrício, Joana; Neto, João M.; Marques, João Carlos; Teixeira, Heliana. "The importance of habitat-type for defining the reference conditions and the ecological quality status based on benthic invertebrates: The Ria Formosa coastal lagoon (Southern Portugal) case study". Ecological Indicators 19 00 (2012): 61-72. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2011.08.004 Medeiros, J.P.; Chaves, M.L.; Silva, G.; Azeda, C.; Costa, J.L.; Marques, J.C.; Costa, M.J.; Chainho, P.. "Benthic condition in low salinity areas of the Mira estuary (Portugal): Lessons learnt from freshwater and marine assessment tools". Ecological Indicators 19 00 (2012): 79-88. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2011.09.008 Cabral, H.N.; Fonseca, V.F.; Gamito, R.; Gonçalves, C.I.; Costa, J.L.; Erzini, K.; Gonçalves, J.; et al. "Ecological quality assessment of transitional waters based on fish assemblages in Portuguese estuaries: The Estuarine Fish Assessment Index (EFAI)". Ecological Indicators 19 00 (2012): 144-153. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2011.08.005 Neto, João M.; Gaspar, Rui; Pereira, Leonel; Marques, João Carlos. "Marine Macroalgae Assessment Tool (MarMAT) for intertidal rocky shores. Quality assessment under the scope of the European Water Framework Directive". Ecological Indicators 19 00 (2012): 39-47. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2011.09.006 Marques, João Carlos; Costa, Maria José; Müller, Felix. "Assessing ecological quality in estuarine and coastal systems – An introduction". Ecological Indicators 19 00 (2012): 1-4. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2011.11.017 van der Linden, Pieter; Patrício, Joana; Marchini, Agnese; Cid, Núria; Neto, João Magalhães; Marques, João Carlos. "A biological trait approach to assess the functional composition of subtidal benthic communities in an estuarine ecosystem". Ecological Indicators 20 00 (2012): 121-133. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.02.004 Basset, Alberto; Barbone, Enrico; Borja, Angel; Elliott, Michael; Jona-Lasinio, Giovanna; Marques, João Carlos; Mazik, Krysia; et al. "Natural variability and reference conditions: setting type-specific classification boundaries for lagoon macroinvertebrates in the Mediterranean and Black Seas". Hydrobiologia 704 1 (2012): 325-345. Publicado • 10.1007/s10750-012-1273-z Veríssimo, Helena; Bremner, Julie; Garcia, Clément; Patrício, Joana; van der Linden, Pieter; Marques, João Carlos. "Assessment of the subtidal macrobenthic community functioning of a temperate estuary following environmental restoration". Ecological Indicators 23 00 (2012): 312-322. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.04.020 de Jonge, Victor N.; Marques, João C.. "Looking forward by looking back". Ocean & Coastal Management 61 00 (2012): iii-iv. Publicado • 10.1016/S0964-5691(12)00064-6 Duarte, B.; Couto, T.; Marques, J.C.; Caçador, I.. "Scirpus maritimus leaf pigment profile and photochemistry during senescence: Implications on carbon sequestration". Plant Physiology and Biochemistry 57 00 (2012): 238-244. Publicado • 10.1016/j.plaphy.2012.05.019 Gonçalves, C.I.; Pasquaud, S.; Gamito, R.; Fonseca, V.F.; Costa, J.L.; Erzini, K.; Gonçalves, J.M.S.; et al. "Robustness of the Estuarine Fish Assessment Index (EFAI) regarding water body definition criteria". Ecological Indicators 20 00 (2012): 1-8. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2012.02.001 Marques, J.C.; Costa, M.J.; Elliott, M.. "Introducing “Assessing ecological quality in estuarine and coastal systems – a functional perspective"". Estuarine, Coastal and Shelf Science 112 00 (2012): 1-3. Publicado • 10.1016/j.ecss.2011.12.015 Falcão, Joana; Marques, Sónia C.; Pardal, Miguel A.; Marques, João Carlos; Primo, Ana Lígia; Azeiteiro, Ulisses M.. "Mesozooplankton structural responses in a shallow temperate estuary following restoration measures". Estuarine, Coastal and Shelf Science 112 00 (2012): 23-30. Publicado • 10.1016/j.ecss.2011.06.007 Franco, J.N.; Ceia, F.R.; Patrício, J.; Modesto, V.; Thompson, J.; Marques, J.C.; Neto, J.M.. "Population dynamics of Corbicula fluminea (Müller, 1774) in mesohaline and oligohaline habitats: Invasion success in a Southern Europe estuary". Estuarine, Coastal and Shelf Science 112 00 (2012): 31-39. Publicado • 10.1016/j.ecss.2011.07.014 Molozzi, J.; Feio, M.J.; Salas, F.; Marques, J.C.; Callisto, M.. "Development and test of a statistical model for the ecological assessment of tropical reservoirs based on benthic macroinvertebrates". Ecological Indicators 23 (2012): 155-165. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84859933618&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2012.03.023 Patrício, J.; Adão, H.; Neto, J.M.; Alves, A.S.; Traunspurger, W.; Marques, J.C.. "Do nematode and macrofauna assemblages provide similar ecological assessment information?". Ecological Indicators 14 1 (2012): 124-137. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80053176063&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2011.06.027 Teixeira, H.; Weisberg, S.B.; Borja, A.; Ranasinghe, J.A.; Cadien, D.B.; Velarde, R.G.; Lovell, L.L.; et al. "Calibration and validation of the AZTI's Marine Biotic Index (AMBI) for Southern California marine bays". Ecological Indicators 12 1 (2012): 84-95. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80052602364&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2011.05.025 Blancher, P.; Vignon, C.; Catalon, E.; Maresca, B.; Dujin, A.; Mordet, X.; Borowski, I.; et al. "Ecosystem services approach for water framework directive implementation". WIT Transactions on Ecology and the Environment 148 (2011): 75-86. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84865716381&partnerID=MN8TOARS. 10.2495/RAV110081 Baeta, A.; Niquil, N.; Marques, J.C.; Patrício, J.. "Modelling the effects of eutrophication, mitigation measures and an extreme flood event on estuarine benthic food webs". Ecological Modelling 222 6 (2011): 1209-1221. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79951767421&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolmodel.2010.12.010 Souza, A.T.; Ilarri, M.I.; Campos, J.; Marques, J.C.; Martins, I.. "Differences in the neighborhood: Structural variations in the carapace of shore crabs Carcinus maenas (Decapoda: Portunidae)". Estuarine, Coastal and Shelf Science 95 4 (2011): 424-430. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-82955228842&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2011.06.021 Borja, A.; Barbone, E.; Basset, A.; Borgersen, G.; Brkljacic, M.; Elliott, M.; Garmendia, J.M.; et al. "Response of single benthic metrics and multi-metric methods to anthropogenic pressure gradients, in five distinct European coastal and transitional ecosystems". Marine Pollution Bulletin 62 3 (2011): 499-513. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79952194464&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.marpolbul.2010.12.009 Gonçalves, S.C.; Marques, J.C.. "The effects of season and wrack subsidy on the community functioning of exposed sandy beaches". Estuarine, Coastal and Shelf Science 95 1 (2011): 165-177. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-82855178720&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2011.08.036 Gamito, S.; P. Chaínho; J. L. Costa; M. J. Costa; J. C. Marques. "Modelling the effects of extreme events on the dynamics of the amphipod Corophium orientale". Ecological Modelling 221 (2010): 459-466. Publicado Couto, Thiago; Patrício, Joana; Neto, João M.; Ceia, Filipe R.; Franco, João; Marques, João Carlos. "The influence of mesh size in environmental quality assessment of estuarine macrobenthic communities". Ecological Indicators 10 6 (2010): 1162-1173. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2010.03.019 Neto, João Magalhães; Teixeira, Heliana; Patrício, Joana; Baeta, Alexandra; Veríssimo, Helena; Pinto, Rute; Marques, João Carlos. "The Response of Estuarine Macrobenthic Communities to Natural- and Human-Induced Changes: Dynamics and Ecological Quality". Estuaries and Coasts 33 6 (2010): 1327-1339. Publicado • 10.1007/s12237-010-9326-x Ceia, Filipe Rafael; Patrício, Joana; Marques, João Carlos; Dias, João Alveirinho. "Coastal vulnerability in barrier islands: The high risk areas of the Ria Formosa (Portugal) system". Ocean & Coastal Management 53 8 (2010): 478-486. Publicado • 10.1016/j.ocecoaman.2010.06.004 Teixeira, H.; Borja, T.; Weisberg, S.B.; Ananda Ranasinghe, J.; Cadien, D.B.; Dauer, D.M.; Dauvin, J.-C.; et al. "Assessing coastal benthic macrofauna community condition using best professional judgement - Developing consensus across North America and Europe". Marine Pollution Bulletin 60 4 (2010): 589-600. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77951497901&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.marpolbul.2009.11.005 Pinto, R.; Patrício, J.; Neto, J.M.; Salas, F.; Marques, J.C.. "Assessing estuarine quality under the ecosystem services scope: Ecological and socioeconomic aspects". Ecological Complexity 7 3 (2010): 389-402. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77955347845&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecocom.2010.05.001 Adão, Helena; Alves, Ana Sofia; Patrício, Joana; Neto, João Magalhães; Costa, Maria José; Marques, João Carlos. "Spatial distribution of subtidal Nematoda communities along the salinity gradient in southern European estuaries". Acta Oecologica 35 2 (2009): 287-300. http://dx.doi.org/10.1016/j.actao.2008.11.007. 10.1016/j.actao.2008.11.007 Anastácio, P. M.; T. Verdelhos; J. C. Marques; M. A. Pardal; Anastcio, P.M.; Verdelhos, T.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "A validated population dynamics model for Scrobicularia plana (Mollusca, Bivalvia) on a Southwestern European estuary". Marine and Freshwater Research 60 60 (2009): 404-416. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67049115613&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1071/MF08127 J. C. Marques; Basset, A.; T. Brey; M. Elliot; Marques, J.C.; Brey, T.; Elliott, M.. "The ecological sustainability trigon – A proposed conceptual framework 4 for creating and testing management scenarios". Marine Pollution Bulletin 58 58 (2009): 1773-1779. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-71549150915&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.marpolbul.2009.08.020 Teixeira, H.; J. C. Neto; J. Patrício; H. Veríssimo; R.Pinto; F. Salas; J. C. Marques; et al. "Quality assessment of benthic macroinvertebrates under the scope of WFD using BAT, the Benthic Assessment Tool". Marine Pollution Bulletin 58 58 (2009): 1477-1486. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-70349292126&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.marpolbul.2009.06.006 Garel, L.; S. Nunes; J. M. Neto; R. Fernandes; R. Neves; J. C. Marques; O. Ferreira; et al. "The autonomous Simpatico system for real-time continuous water-quality and current velocity monitoring: examples of application in three Portuguese estuaries". Geo-Marine Letters 29 29 (2009): 331-341. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-70349257218&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1007/s00367-009-0147-5 Dolbeth, M.; Teixeira, H.; Marques, J.C.; Pardal, M.Â.. "Feeding guild composition of a macrobenthic subtidal community along a depth gradient". Scientia Marina 73 2 (2009): 225-237. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67649577083&partnerID=MN8TOARS. 10.3989/scimar.2009.73n2225 Gonçalves, S.C.; Anastácio, P.M.; Pardal, M.A.; Cardoso, P.G.; Ferreira, S.M.; Marques, J.C.; Gonçalves, S. C.; et al. "Sandy beach macrofaunal communities on the western coast of Portugal - Is there a steady structure under similar exposed conditions?". Estuarine, Coastal and Shelf Science 81 4 (2009): 555-568. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-59149100909&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.ecss.2008.12.004 Patrício, J.; Neto, J.M.; Teixeira, H.; Salas, F.; Marques, J.C.. "The robustness of ecological indicators to detect long-term changes in the macrobenthos of estuarine systems". Marine Environmental Research 68 1 (2009): 25-36. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67349256154&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.marenvres.2009.04.001 Pinto, R.; Patrício, J.; Baeta, A.; Fath, B.D.; Neto, J.M.; Marques, J.C.. "Review and evaluation of estuarine biotic indices to assess benthic condition". Ecological Indicators 9 1 (2009): 1-25. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-48149087096&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2008.01.005 Adão, H.; Alves, A.S.; Patrício, J.; Neto, J.M.; Costa, M.J.; Marques, J.C.. "Spatial distribution of subtidal Nematoda communities along the salinity gradient in southern European estuaries". Acta Oecologica 35 2 (2009): 287-300. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-60149096062&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.actao.2008.11.007 Martins, I.; A. Marcotegui; J. C. Marques. "Impacts of macroalgal spores on the dynamics of adult macroalgae in a eutrophic estuary: High versus low hydrodynamic seasons and long-term simulations for global warming scenarios". Marine Pollution Bulletin 56 (2008): 984-998. Publicado Patricio, J.; J. M. Neto; H. Teixeira; J. C. Marques. "Opportunistic macroalgae metrics for transitional waters. Testing tools to assess ecological quality status in Portugal". Marine Pollution Bulletin 54 (2008): 1887-1896. Publicado Teixeira, H.; F. Salas; Á. Borja; J. M. Neto; J. C. Marques. "A benthic perspective in assessing the ecological status of estuaries: The case of the Mondego estuary (Portugal)". Ecological indicators 8 (2008): 404-416. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; I. Martins; A. Colaco; P. R. Dando; D. Desbruyeres; P. M. Sarradin; R. Serrão-Santos; et al. "Size-dependent variations on the nutritional pathway of Bathymodiolus azoricus demonstrated by a C-flux model". Ecological Modelling 217 217 (2008): 59-71. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-48349119203&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.ecolmodel.2008.05.008 de Paz, L.; Patrício, J.; Marques, J.C.; Borja, A.; Laborda, A.J.; J. Patrício; J. C. Marques; A. Borja; A. Laborda. "Ecological status assessment in the lower Eo estuary (Spain). The challenge of habitat heterogeneity integration: A benthic perspective". Marine Pollution Bulletin 56 7 (2008): 1275-1283. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-46149100245&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.marpolbul.2008.04.027 Neto, J.M.; Flindt, M.R.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "Modelling nutrient mass balance in a temperate meso-tidal estuary: Implications for management". Estuarine, Coastal and Shelf Science 76 1 (2008): 175-185. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-36849021035&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2007.06.013 Teixeira, H.; Salas, F.; Neto, J.M.; Patrício, J.; Pinto, R.; Veríssimo, H.; García-Charton, J.A.; et al. "Ecological indices tracking distinct impacts along disturbance-recovery gradients in a temperate NE Atlantic Estuary - Guidance on reference values". Estuarine, Coastal and Shelf Science 80 1 (2008): 130-140. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-52149117144&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2008.07.017 Salas, F.; Teixeira, H.; Marcos, C.; Marques, J.C.; Pérez-Ruzafa, A.. "Applicability of the trophic index TRIX in two transitional ecosystems: The Mar Menor lagoon (Spain) and the Mondego estuary (Portugal)". ICES Journal of Marine Science 65 8 (2008): 1442-1448. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-53849096694&partnerID=MN8TOARS. 10.1093/icesjms/fsn123 Borja, A.; Bricker, S.B.; Dauer, D.M.; Demetriades, N.T.; Ferreira, J.G.; Forbes, A.T.; Hutchings, P.; et al. "Overview of integrative tools and methods in assessing ecological integrity in estuarine and coastal systems worldwide". Marine Pollution Bulletin 56 9 (2008): 1519-1537. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-50149108171&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.marpolbul.2008.07.005 Martinho, Filipe; Leitão, R.; Neto, J. M.; Cabral, H. N.; Marques, J. C.; Pardal, M. A.. "The use of nursery areas by juvenile fish in a temperate estuary, Portugal". Hydrobiologia 587 1 (2007): 281-290. http://dx.doi.org/10.1007/s10750-007-0689-3. 10.1007/s10750-007-0689-3 Lillebø A.I.; M. R. Flindt; M. A. Pardal; P. G. Cardoso; S. M. Ferreira; J. C. Marques. "The faunal role in the degradation of the common intertidal salt marsh plant Scirpus maritimus". Hydrobiologia 579 (2007): 369-378. Publicado Leitão, R.; F. Martinho; J. M. Neto; H. Cabral; I. Jorge; J. C. Marques; M. A. Pardal. "The fish assemblage of the Mondego estuary: composition, structure and trends over the past two decades". Hydrobiologia 587 (2007): 269-279. Publicado Ferreira, J. G.; C. Vale; C.V. Soares; F. Salas; P.E. Stacey; S.B. Bricker; M.C. Silva; et al. "Monitoring of coastal and transitional waters under the EU Water Framework Directive.". Monitoring and Assessment 135 137 (2007): 195-216. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-36248978598&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1007/s10661-007-9643-0 Marques, S.C.; Pardal, M.A.; Pereira, M.J.; Gonçalves, F.; Marques, J.C.; Azeiteiro, U.M.. "Zooplankton distribution and dynamics in a temperate shallow estuary". Hydrobiologia 587 1 (2007): 213-223. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34250752720&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10750-007-0682-x Lillebø, A.I.; Coelho, J.P.; Flindt, M.R.; Jensen, H.S.; Marques, J.C.; Pedersen, C.B.; Pardal, M.A.. "Spartina maritima influence on the dynamics of the phosphorus sedimentary cycle in a warm temperate estuary (Mondego estuary, Portugal)". Hydrobiologia 587 1 (2007): 195-204. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34250789237&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10750-007-0679-5 Martins, I.; Lopes, R.J.; Lillebø, A.I.; Neto, J.M.; Pardal, M.A.; Ferreira, J.G.; Marques, J.C.. "Significant variations in the productivity of green macroalgae in a mesotidal estuary: Implications to the nutrient loading of the system and the adjacent coastal area". Marine Pollution Bulletin 54 6 (2007): 678-690. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34249813119&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.marpolbul.2007.01.023 Martinho, F.; Leitão, R.; Neto, J.M.; Cabral, H.N.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "The use of nursery areas by juvenile fish in a temperate estuary, Portugal". Hydrobiologia 587 1 (2007): 281-290. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34250726493&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10750-007-0689-3 Lillebø, A.I.; Teixeira, H.; Pardal, M.A.; Marques, J.C.. "Applying quality status criteria to a temperate estuary before and after the mitigation measures to reduce eutrophication symptoms". Estuarine, Coastal and Shelf Science 72 1-2 (2007): 177-187. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33847053932&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2006.10.012 Dolbeth, M.; Ferreira, Ó.; Teixeira, H.; Marques, J.C.; Dias, J.A.; Pardal, M.A.. "Beach morphodynamic impact on a macrobenthic community along a subtidal depth gradient". Marine Ecology Progress Series 352 (2007): 113-124. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-38949100028&partnerID=MN8TOARS. 10.3354/meps07040 Bouslama, M.F.; Neto, J.M.; Charfi-Cheikhrouha, F.; Marques, J.C.. "Biology, population dynamics, and secondary production of Talitrus saltator (Amphipoda, Talitridae) at Korba beach (east coast of Tunisia)". Crustaceana 80 9 (2007): 1103-1119. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34748856209&partnerID=MN8TOARS. 10.1163/156854007782008595 Lillebø, A.I.; Flindt, M.R.; Pardal, M.A.; Cardoso, P.G.; Ferreira, S.M.; Marques, J.C.. "The faunal role in the degradation of the common intertidal salt marsh plant Scirpus maritimus". Hydrobiologia 579 1 (2007): 369-378. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33846959501&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10750-006-0535-z Patrício, J.; R. Ulanowicz; M. A. Pardal; J. C. Marques. "Ascendency as ecological indicator for environmental quality assessment at the ecosystem level: a case study". Hydrobiologia 555 (2006): 19-30. Publicado Patrício, J.; F. Salas; M. A. Pardal; S. E. Jørgensen; J. C. Marques; Salas, F.; Pardal, M.A.; Jørgensen, S.E.; Marques, J.C.. "Ecological indicators performance during a re-colonisation experiment and its compliance with ecosystem theories". Ecological Indicators 6 6 (2006): 43-57. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-32344431628&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2005.08.016 Vassallo, P.; M. Fabiano; L. Vezzulli; R. Sandulli; J. C. Marques; S. E. Jørgensen; Fabiano, M.; et al. "Assessing the health of coastal marine ecosystems: A holistic approach based on sediment micro and meio-benthic measures". Ecological Indicators 6 6 (2006): 525-542. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33646760652&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.ecolind.2005.07.003 Lopes, R. J.; J. C. Marques; L. Wenerberg; Lopes, R.J.; Marques, J.C.; Wennerberg, L.. "Migratory connectivity and temporal aggregation of Dunlin (Calidris alpina) in Portugal – evidence from morphology, ringing recoveries and mtDNA". Journal of Ornithology 147 147 (2006): 385-394. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33645768491&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1007/s10336-005-0048-y Patricio, J.; J. C. Marques. "Mass balanced models of the food web in three areas along a gradient of eutrophication symptoms in the south arm of the Mondego estuary (Portugal)". Ecological Modelling 197 (2006): 21-34. Publicado Marques S. C.; U. M. Azeiteiro; J. C. Marques; J. M. Neto; M. A. Pardal; Marques, S.C.; Azeiteiro, U.M.; et al. "Zooplankton and ichthyoplankton communities in a temperate estuary: spatial and temporal patterns". Journal of Plankton Research 28 28 (2006): 297-312. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33645123790&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1093/plankt/fbi126 Marques, João Carlos de Sousa; F. Salas; C. Marcos; J. M. Neto; J. Patrício; A. Pérez-Ruzafa; Salas, F.; et al. "User friendly guide for using benthic ecological indicators in coastal and marine quality assessment". Ocean and Coastal Management 49 49 (2006): 308-331. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33646828936&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.ocecoaman.2006.03.001 Dolbeth, M.; I. Viegas; F. Martinho; J. C. Marques; M. A. Pardal. "Population structure and species dynamics of Spisula solida, Diogenes pugilator and Branchiostoma lanceolatum along temporal-spatial gradient in the south coast of Portugal". Estuarine Coastal and Shelf Science 66 (2006): 168-176. Publicado Marques, João Carlos de Sousa. "North-Atlantic estuaries: Problems and perspectives. The Mondego estuary: environmental quality, management, and evolutive scenarios". Seine-Aval Special Issue 00 (2006): 9-12. Publicado Baeta, A.; Cabral, H.N.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "Feeding ecology of the green crab, Carcinus maenas (L., 1758) in a temperate estuary, Portugal". Crustaceana 79 10 (2006): 1181-1193. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33845415120&partnerID=MN8TOARS. 10.1163/156854006778859506 Lopes, R.J.; Pardal, M.A.; Múrias, T.; Cabral, J.A.; Marques, J.C.; Lopes, R. J.; M. A. Pardal; et al. "Influence of macroalgal mats on abundance and distribution of dunlin Calidris alpina in estuaries: A long-term approach". Marine Ecology Progress Series 323 323 (2006): 11-20. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33750612084&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.3354/meps323011 Leitão, R.; Martinho, F.; Neto, J.M.; Cabral, H.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "Feeding ecology, population structure and distribution of Pomatoschistus microps (Krøyer, 1838) and Pomatoschistus minutus (Pallas, 1770) in a temperate estuary, Portugal". Estuarine, Coastal and Shelf Science 66 1-2 (2006): 231-239. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-28844459998&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2005.08.012 Salas, F.; Patrício, J.; Marcos, C.; Pardal, M.A.; Pérez-Ruzafa, A.; Marques, J.C.; J. Patrício; et al. "Are taxonomic distinctness measures compliant to other ecological indicators in assessing ecological status?". Marine Pollution Bulletin 52 2 (2006): 162-174. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33644596792&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.marpolbul.2005.08.014 Lillebø, A.I.; Flindt, M.R.; Pardal, M.A.; Marques, J.C.. "The effect of Zostera noltii, Spartina maritima and Scirpus maritimus on sediment pore-water profiles in a temperate intertidal estuary". Hydrobiologia 555 1 (2006): 175-183. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-29444447285&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10750-005-1114-4 Cardoso, P.; C. Vale; A. M. Ferreira; E. Pereira; M. A. Pardal; J. C. Marques; Pereira, P.; et al. "Seasonal variation on surface sediments composition in Mondego River estuary". Journal of Environmental Science and Health, Part A – Toxic/Hazardous Substances & Environmental Engineering 40 40 (2005): 317-329. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-13144296662&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1081/ESE-200045539 Jørgensen, S. E.; N. Ladegaard; M. Debeljak; J. C. Marques; Jørgensen, S.E.; Ladegaard, N.; Debeljak, M.; Marques, J.C.. "Calculations of Exergy for organisms". Ecological Modelling 185 185 (2005): 165-175. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-17644393178&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.ecolmodel.2004.11.020 Ferreira, S. M.; K. T. Jensen; P. A. Martins; S. F. Sousa; J. C. Marques; M. A. Pardal; Ferreira, S.M.; et al. "Impact of microphallid trematodes on the survivorship, growth, and reproduction of an isopod (Cyathura carinata)". Experimental Marine Biology and Ecology 318 318 (2005): 191-199. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-18144405404&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.jembe.2004.12.018 Verdelhos, T.; J. M. Neto; J. C. Marques; M. A. Pardal. "The effect of eutrophication abatement on the bivalve Scrobicularia plana". Estuarine Coastal and Shelf Science 63 (2005): 261-268. Publicado Martins, I.; Neto, J.M.; Fontes, M.G.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "Seasonal variation in short-term survival of Zostera noltii transplants in a declining meadow in Portugal". Aquatic Botany 82 2 (2005): 132-142. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-20444396190&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.aquabot.2005.03.006 Lillebø, A.I.; Neto, J.M.; Martins, I.; Verdelhos, T.; Leston, S.; Cardoso, P.G.; Ferreira, S.M.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "Management of a shallow temperate estuary to control eutrophication: The effect of hydrodynamics on the system's nutrient loading". Estuarine, Coastal and Shelf Science 65 4 (2005): 697-707. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-27844510475&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2005.07.009 Gonçalves, S.C.; Pardal, M.A.; Cardoso, P.G.; Ferreira, S.M.; Marques, J.C.. "Biology, population dynamics and secondary production of Tylos europaeus (Isopoda, Tylidae) on the western coast of Portugal". Marine Biology 147 3 (2005): 631-641. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-21844479591&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s00227-005-1609-6 Santos, T.M.; Cabral, J.A.; Lopes, R.J.; Pardal, M.; Marques, J.C.; Goss-Custard, J.. "Competition for feeding in waders: A case study in an estuary of south temperate Europe (Mondego, Portugal)". Hydrobiologia 544 1 (2005): 155-166. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-24644471481&partnerID=MN8TOARS. 10.1007/s10750-005-0541-6 Baeta, A.; Cabral, H.N.; Neto, J.M.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "Biology, population dynamics and secondary production of the green crab Carcinus maenas (L.) in a temperate estuary". Estuarine, Coastal and Shelf Science 65 1-2 (2005): 43-52. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-25144481244&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2005.05.004 Salas, F.; Marcos, C.; Pérez-Ruzafa, A.; Marques, J.C.. "Application of the exergy index as ecological indicator of organically enrichment areas in the Mar Menor lagoon (south-eastern Spain)". Energy 30 13 (2005): 2505-2522. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-14644397203&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.energy.2005.01.005 Cardoso, P.G.; Brandão, A.; Pardal, M.A.; Raffaelli, D.; Marques, J.C.. "Resilience of Hydrobia ulvae populations to anthropogenic and natural disturbances". Marine Ecology Progress Series 289 (2005): 191-199. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-18044373911&partnerID=MN8TOARS. Lopes, R.J.; Múrias, T.; Cabral, J.A.; Marques, J.C.; Lopes, R. J.; T. Múrias; J. A. Cabral; J. C. Marques. "A ten year study of variation, trends and seasonality of a shorebird community in the Mondego Estuary, Portugal". Waterbirds 28 1 (2005): 8-18. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-18844453206&partnerID=MN8TOARS. Publicado Patrício, J.; R. Ulanowicz; M. A. Pardal; J. C. Marques. "Ascendency as ecological indcator: A case study on estuarine pulse eutrophication". Estuarine Coastal and Shelf Science 60 (2004): 23-35. Publicado Cardoso, P. G.; M. A. Pardal; D. Raffaelli; A. Baeta; J. C. Marques. "Macroinvertebrate response to different species of macroalgal mats and the role of disturbance history". Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 308 (2004): 207-220. Publicado Ferreira, S. M.; M. A. Pardal; A. I. Lillebø; P. G. Cardoso; J. C. Marques. "Population dynamics of Cyathura carinata (Isopoda) in a eutrophic temperate estuary". Estuarine Coastal and Shelf Science 61 (2004): 669-677. Publicado Fabiano, M.; P. Vassallo; L. Vezzulli; V. S. Salvo; J. C. Marques; Vassallo, P.; Vezzulli, L.; Salvo, V.S.; Marques, J.C.. "Temporal and spatial change of Exergy and Ascendency in different benthic marine ecosystems". Energy 29 29 (2004): 1697-1712. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-3543101407&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/j.energy.2004.03.051 Salas, F.; Neto, J.M.; Borja, A.; Marques, J.C.. "Evaluation of the applicability of a marine biotic index to characterize the status of estuarine ecosystems: The case of Mondego estuary (Portugal)". Ecological Indicators 4 3 (2004): 215-225. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-3142635273&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecolind.2004.04.003 Cardoso, P.G.; Pardal, M.A.; Lillebø, A.I.; Ferreira, S.M.; Raffaelli, D.; Marques, J.C.. "Dynamic changes in seagrass assemblages under eutrophication and implications for recovery". Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 302 2 (2004): 233-248. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-1542403112&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.jembe.2003.10.014 Lillebø, A.I.; Neto, J.M.; Flindt, M.R.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.. "Phosphorous dynamics in a temperate intertidal estuary". Estuarine, Coastal and Shelf Science 61 1 (2004): 101-109. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-4444241494&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2004.04.007 Pardal, M.A.; Cardoso, P.G.; Sousa, J.P.; Marques, J.C.; Raffaelli, D.; Pardal, M. A.; P. G. Cardoso; et al. "Assessing environmental quality: A novel approach". Marine Ecology Progress Series 267 267 (2004): 1-8. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-1542684940&partnerID=MN8TOARS. Publicado M. S. Achouri; F. Charfi-Cheikhrouha; J. C. Marques. "Biology, population dynamics, and field-growth rates of Porcellionides pruinosus (Isopoda, Oniscoidea) at Garat Nâam (Kasserine, Tunisia)". Crustaceana 75 (2003): 1241-1262. Publicado P. Maranhão; Marques, João Carlos de Sousa. "The influence of temperature and salinity on the duration of embryonic development, fecundity, and growth of the amphipod Echinogammarus marinus Leach (Gammaridae).". Acta Oecologica 24 (2003): 5-13. Publicado P. Bacelar-Nicolau; L. B. Nicolau; J. C. Marques; F. Morgado; U. Azeiteiro. "Bacterioplankton dynamics in the Mondego estuary (Portugal).". Acta Oecologica 24 (2003): 67-75. Publicado Vieira, L.; U. Azeiteiro; P. Ré; R. Pastorinho; J. C. Marques; F. Morgado. "Zooplankton distribution in a temperate estuary (Mondego estuary southern arm: Western Portugal).". Acta Oecologica 24 (2003): 163-173. Publicado Vieira, L.; F. Morgado; P. Ré; A. Nogueira; R. Pastorinho; M. Pereira; P. Bacelar-Nicolau; J. C. Marques; U. M. Azeiteiro. "Population dynamics of Acartia clausi from a temperate estuary (Mondego estuary, Western Portugal).". Invertebrate Reproduction and Development 44 (2003): 9-15. Publicado A. I. Lillebø; M. A. Pardal; J. M. Neto; J. C. Marques; Lillebø, A.I.; Pardal, M.A.; Neto, J.M.; Marques, J.C.. "Salinity as the major factor affecting Scirpus maritimus annual dynamics. Evidence from field data and a greenhouse experiment". Aquatic Botany 77 77 (2003): 111-120. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0141788051&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/S0304-3770(03)00088-3 S. Carvalho; Marques, João Carlos de Sousa; M. M. Banha; L. Cancela da Fonseca. "Macrobenthic Crustácea of the Bay of S. Torpes (Portugal)". Revista de Biologia (Lisboa) 21 00 (2003): 57-70. Publicado Gonçalves, S.C.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.; Bouslama, M.F.; El Gtari, M.; Charfi-Cheikhrouha, F.. "Comparison of the biology, dynamics, and secondary production of Talorchestia brito (Amphipoda, Talitridae) in Atlantic (Portugal) and Mediterranean (Tunisia) populations". Estuarine, Coastal and Shelf Science 58 4 (2003): 901-916. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0347447360&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/j.ecss.2003.07.005 Pastorinho, M.R.; Antunes, C.P.; Marques, J.C.; Pereira, M.L.; Azeiteiro, U.M.M.; Morgado, F.M.. "Histochemistry and histology in planktonic ecophysiological processes determination in a temperate estuary (Mondego River estuary, Portugal)". Acta Oecologica 24 SUPPL. 1 (2003): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0038001619&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(03)00007-9 Pastorinho, R.; Vieira, L.; Ré, P.; Pereira, M.; Bacelar-Nicolau, P.; Morgado, F.; Marques, J.C.; Azeiteiro, U.. "Distribution, production, histology and histochemistry in Acartia tonsa (Copepoda: Calanoida) as means for life history determination in a temperate estuary (Mondego estuary, Portugal)". Acta Oecologica 24 SUPPL. 1 (2003): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0038339580&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(03)00018-3 Cruz, S.; Marques, J.C.; Gamito, S.; Martins, I.. "Autecology of the isopod, Cyathura carinata (Krøyer, 1847) in the Ria Formosa (Algarve, Portugal)". Crustaceana 76 7 (2003): 781-802. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0346399796&partnerID=MN8TOARS. 10.1163/15685400360730589 Anastácio, P.M.; Gonçalves, S.C.; Pardal, M.A.; Marques, J.C.. "A model for amphipod (Talitrus saltator) population dynamics". Estuarine, Coastal and Shelf Science 58 SUPPL. (2003): 149-157. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0242659134&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0272-7714(03)00041-6 Marques, J.C.; Gonçalves, S.C.; Pardal, M.A.; Chelazzi, L.; Colombini, I.; Fallaci, M.; Bouslama, M.F.; et al. "Comparison of Talitrus saltator (Amphipoda, Talitridae) biology, dynamics, and secondary production in Atlantic (Portugal) and Mediterranean (Italy and Tunisia) populations". Estuarine, Coastal and Shelf Science 58 SUPPL. (2003): 127-148. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0242574957&partnerID=MN8TOARS. Azeiteiro, U.M.; Fonseca, J.C.; Pastorinho, R.; Morgado, F.; Marques, J.C.. "Patterns of variation in the biochemical composition of Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861) (Crustacea: Mysidacea)". Boletin - Instituto Espanol de Oceanografia 19 1-4 (2003): 433-442. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-26244433728&partnerID=MN8TOARS. Cruz, S.; Gamito, S.; Marques, J.C.. "Spatial distribution of peracarids in the intertidal zone of the Ria Formosa (Portugal)". Crustaceana 76 4 (2003): 411-431. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0042849174&partnerID=MN8TOARS. 10.1163/156854003322033825 Miranda Azeiteiro, U.; Marques, J.C.. "Introducing "plankton responses to environmental variability"". Acta Oecologica 24 SUPPL. 1 (2003): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0347405327&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(03)00041-9 Marques, J.C.; Nielsen, S.N.; Pardal, M.A.; Jørgensen, S.E.. "Impact of eutrophication and river management within a framework of ecosystem theories". Ecological Modelling 166 1-2 (2003): 147-168. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0346186127&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(03)00134-0 Dolbeth, M.; Pardal, M.A.; Lillebø, A.I.; Azeiteiro, U.; Marques, J.C.; M. A. Pardal; A. I. Lillebø; U. Azeiteiro; J. C. Marques. "Short- and long-term effects of eutrophication on the secondary production of an intertidal macrobenthic community". Marine Biology 143 6 (2003): 1229-1238. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0346270498&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1007/s00227-003-1133-5 J. C. Fonseca; J. C. Marques; V. M. C. Madeira; Fonseca, J.C.; Marques, J.C.; Madeira, V.M.C.. "Degradability and sediment sorption of an Alcohol Polyclycol ether surfactant putatively useful for the control of red swamp crayfish in rice fields". Environmental Monitoring and Assessment, 75 75 (2002): 1-10. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0036192811&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1023/A:1014292201540 P. Cardoso; A. I. Lillebø; M. A. Pardal; S. Ferreira; J. C. Marques; Cardoso, P.G.; Lillebø, A.I.; et al. "The effect of different primary producers on Hydrobia ulvae population dynamics. A case study in a temperate intertidal estuary.". Experimental Marine Biology and Ecology 277 277 (2002): 173-195. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0037009912&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/S0022-0981(02)00338-6 T. Múrias; J. A. Cabral; R. J. Lopes; J. D. Goss-Custard; J. C. Marques. "Use of traditional salines by waders in the Mondego estuary (Portugal): A conservation perspective.". Ardeola 49 (2002): 223-240. Publicado L. Vieira; P. Ré; F. M. R. Morgado; M. Pereira; J. C. Marques; U. M. Azeiteiro. "Distribution and production of Acartia bifilosa var. inermis from a temperate estuary (Mondego estuary, Portugal)". Arquivos do Museu Bocage 3 17 (2002): 421-440. Publicado Marques, J.C.; Jørgensen, S.E.. "Three selected ecological observations interpreted in terms of a thermodynamic hypothesis. Contribution to a general theoretical framework". Ecological Modelling 158 3 (2002): 213-221. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0037207026&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(02)00235-1 Fonseca, J.C.; Pardal, M.A.; Azeiteiro, U.M.; Marques, J.C.; J. C. Fonseca; M. A. Pardal; U. M. Azeiteiro; J. C. Marques. "Estimation of ecological exergy using weighing parameters determined from DNA contents of organisms - A case study". Hydrobiologia 475-476 475/476 (2002): 79-90. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-17344378233&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1023/A:1020392604183 Martins, I.; Marques, J.C.. "A model for the growth of opportunistic macroalgae (Enteromorpha sp.) in tidal estuaries". Estuarine, Coastal and Shelf Science 55 2 (2002): 247-257. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0036668938&partnerID=MN8TOARS. 10.1006/ecss.2001.0900 S. E. Jørgensen; Marques, João Carlos de Sousa; Jørgensen, S.E.; Marques, J.C.. "Thermodynamics and ecosystem theory. Case studies from Hydrobiology". Hydrobiologia 445 445 (2001): 1-10. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035864399&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1023/A:1012205918964 P. Bacelar-Nicolau; Marques, João Carlos de Sousa; F. Morgado; R. Pastorinho; L. B. Nicolau; U. M. Azeiteiro. "Tide-induced variations in the bacterial community, and the physical and chemical properties of the water column of the Mondego estuary". Revista de Biologia (Lisboa) 19 00 (2001): 51-62. Publicado U. M. Azeiteiro; J. C. Fonseca; J. C. Marques. "Biometry, estimates of production, and seasonal variation in the biochemical composition of Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) (Crustacea: Mysidacea)". Boletim do Instituto Espanhol de Oceanografia 17 1-2 (2001): 15-25. Publicado U. M. Azeiteiro; J. C. Fonseca; F. Morgado; J. C. Marques. "Production and energetic content of Mesopodopsis slabberi Van Beneden (Crustacea: Mysidacea) in the Mondego estuary (Western Portugal)". Portugaliae Zoologica 5 3 (2001): 17-26. Publicado Marques, João Carlos de Sousa. "Diversity and Biodiversity: What might be their significance in the scope of sustainable development?". Bol. Mus. Mun. Funchal 6 00 (2001): 349-361. Publicado Marques, J.C.; Marques, João Carlos de Sousa. "Diversity, biodiversity, conservation, and sustainability.". TheScientificWorldJournal [electronic resource] 1 00 (2001): 534-543. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-1542573272&partnerID=MN8TOARS. Publicado Mieiro, C.L.; Cabral, J.A.; Marques, J.C.; C. L. Mieiro; J. A. Cabral; J. C. Marques. "Predation pressure of introduced mosquitofish (Gambusia holbrooki Girard), on the native zooplankton community. A case-study from representative habitats in the lower Mondego river Valley (Portugal)". Limnetica 20 2 (2001): 279-292. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-60649101737&partnerID=MN8TOARS. Publicado Maranhão, P.; Bengala, N.; Pardal, M.; Marques, J.C.. "The influence of environmental factors on the population dynamics, reproductive biology and productivity of Echinogammarus marinus Leach (Amphipoda, Gammaridae) in the Mondego estuary (Portugal)". Acta Oecologica 22 3 (2001): 139-152. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0034910282&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(01)01112-2 Cabral, J.A.; Marques, J.C.; Nielsen, S.N.. "Modeling mosquitofish (Gambusia holbrooki) responses to Genapol OXD-080, a non-ionic surfactant, in rice fields". Ecological Engineering 16 4 (2001): 537-544. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035155876&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0925-8574(00)00116-6 Martins, I.; Pardal, M.Â.; Lillebo, A.I.; Flindt, M.R.; Marques, J.C.; I. Martins; M. A. Pardal; et al. "Hydrodynamics as a major factor controlling the occurrence of green macroalgal blooms in a eutrophic estuary: A case study on the influence of precipitation and river management". Estuarine, Coastal and Shelf Science 52 2 (2001): 165-177. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0034957624&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1006/ecss.2000.0708 Anastácio, P.M; Holten Lützhøft, H.-C; Halling-Sørensen, B; Marques, J.C. "Surfactant (Genapol OX-80) toxicity to Selenastrum capricornutum". Chemosphere 40 8 (2000): 835-838. http://dx.doi.org/10.1016/s0045-6535(99)00275-1. 10.1016/s0045-6535(99)00275-1 Fonseca, Júlio C; Marques, João C; Paiva, Artur A; Freitas, Albertina M; Madeira, Vi´tor M.C; Jørgensen, Sven E. "Nuclear DNA in the determination of weighing factors to estimate exergy from organisms biomass". Ecological Modelling 126 2-3 (2000): 179-189. http://dx.doi.org/10.1016/s0304-3800(00)00264-7. 10.1016/s0304-3800(00)00264-7 P. M. Anastácio; A. F. Frias; J. C. Marques. "Impact of crayfish densities on wet seeded rice and the inefficiency of a non-ionic surfactant as an ecotechnological solution". Ecological Engineering 15 (2000): 17-25. Publicado U. M. Azeiteiro; J. C. Marques; P. Ré. "Zooplankton assemblages in a shallow seasonally tidal estuary in temperate Atlantic Ocean (Western Portugal: Mondego estuary)". Arquivos do Museu Bocage 3 12 (2000): 357-376. Publicado Lopes, R.J.; Pardal, M.A.; Marques, J.C.. "Impact of macroalgal blooms and wader predation on intertidal macroinvertebrates: Experimental evidence from the Mondego estuary (Portugal)". Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 249 2 (2000): 165-179. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0034725453&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0022-0981(00)00202-1 Pardal, MA; Marques, JC; Metelo, I; Lillebø, AI; Flindt, MR. "Impact of eutrophication on the life cycle, population dynamics and production of Ampithoe valida (Amphipoda) along an estuarine spatial gradient (Mondego estuary, Portugal)". Marine Ecology Progress Series 196 (2000): 207-219. http://dx.doi.org/10.3354/meps196207. 10.3354/meps196207 Anastácio, P.M.; Frias, A.F.; Marques, J.C.. "CRISP (crayfish and rice integrated system of production): 1. Modelling rice (Oryza sativa) growth and production". Ecological Modelling 123 1 (1999): 17-28. http://dx.doi.org/10.1016/s0304-3800(99)00069-1. 10.1016/s0304-3800(99)00069-1 U. M. Azeiteiro; L. Jesus; J. C. Marques. "Distribution, population dynamics, and production of the suprabenthic mysid Mesopodopsis slabberi Van Beneden in the Mondego estuary (Western Coast of Portugal)". Journal of Crustacean Biology 19 (1999): 498-509. Publicado P. M. Anastácio; S. N. Nielsen; J. C. Marques. "CRISP – Crayfish Rice Integrated System of Production: Modelling crayfish (Procambarus clarkii) population dynamics". Ecological Modelling 123 (1999): 5-16. Publicado P. M. Anastácio; S. N. Nielsen; A. F. Frias; J. C. Marques. "CRISP – Crayfish Rice Integrated System of Production: Modelling water, algae and oxygen dynamics". Ecological Modelling 123 (1999): 29-40. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; A. Noordwijk. "Editorial: Introducing “Processes and Flows in Marine Benthic Ecosystems”". Acta Oecologica 20 4 (1999): 1-2. Publicado A. I. Lillebø; M. R. Flindt; M. A. Pardal; J. C. Marques. "The effect of macrofauna, meiofauna and microfauna on the degradation of Spartina maritima detritus from a salt marsh area". Acta Oecologica 20 (1999): 249-258. Publicado A. I. Lillebø; M. A. Pardal; J. C. Marques. "Population structure, dynamics and production of Hydrobia ulvae (Pennant) (Mollusca: Prosobranchia) along an eutrophication gradient in the Mondego estuary (Portugal)". Acta Oecologica 20 (1999): 289-304. Publicado J. A. Cabral; S. Ávila; J. C. Marques. "Acute and sublethal effects of a non-ionic surfactant, fatty alcohol polyglycol ether, on mosquitofish, Gambusia holbrooki (Girard)". Ecotoxicology 8 (1999): 245-252. Publicado J. A. Cabral; Marques, João Carlos de Sousa. "Life history, population dynamics and production of eastern mosquitofish, Gambusia holbrooki (Pisces, Poeciliidae), in rice fields of the lower Mondego River Valley, western Portugal". Acta Oecologica 20 (1999): 607-620. Publicado U. M. Azeiteiro; Marques, João Carlos de Sousa; P. Ré. "Zooplankton annual cycle in the Mondego river estuary (Portugal)". Arquivos do Museu Bocage 3 8 (1999): 239-263. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; M. A. Pardal; A. I. Lillebø. "Comunidades biológicas do estuário do Mondego: Quinze anos de estudos". Cadernos de Ecologia 2 00 (1999): 46-76. Publicado Flindt, M.R.; Pardal, M.Â.; Lillebø, A.I.; Martins, I.; Marques, J.C.. "Nutrient cycling and plant dynamics in estuaries: A brief review". Acta Oecologica 20 4 (1999): 237-248. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033165570&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(99)00142-3 Nielsen, S.N.; Anastácio, P.M.; Frias, A.F.; Marques, J.C.. "CRISP-crayfish rice integrated system of production. 5. Simulation of nitrogen dynamics". Ecological Modelling 123 1 (1999): 41-52. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0344069678&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(99)00166-0 Marques, J.C.. "Introducing CRISP - Crayfish and rice integrated system of production: Editorial". Ecological Modelling 123 1 (1999): 1-3. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033230924&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(99)00163-5 Martins, I.; Oliveira, J.M.; Flindt, M.R.; Marques, J.C.. "The effect of salinity on the growth rate of the macroalgae Enteromorpha intestinalis (Chlorophyta) in the Mondego estuary (west Portugal)". Acta Oecologica 20 4 (1999): 259-265. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033165675&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(99)00140-X Azeiteiro, U.M.M.; Marques, J.C.. "Temporal and spatial structure in the suprabenthic community of a shallow estuary (western Portugal: Mondego river estuary)". Acta Oecologica 20 4 (1999): 333-342. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033165572&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(99)00133-2 Cabral, J.A.; Pardal, M.Â.; Lopes, R.J.; Múrias, T.; Marques, J.C.. "The impact of macroalgal blooms on the use of the intertidal area and feeding behaviour of waders (Charadrii) in the Mondego estuary (west Portugal)". Acta Oecologica 20 4 (1999): 417-427. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033165577&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S1146-609X(99)00126-5 Maranhao, P.; Marques, J.C.; Madeira, V.M.C.. "Zinc and cadmium concentrations in soft tissues of the red swamp crayfish Procambarus clarkii (Girard, 1852) after exposure to zinc and cadmium". Environmental Toxicology and Chemistry 18 8 (1999): 1769-1771. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0032770424&partnerID=MN8TOARS. 10.1897/1551-5028(1999)018<1769:ZACCIS>2.3.CO;2 Marques, J.C.; Noordwijk, A.. "Introducing 'Processes and Flows in Marine Benthic Ecosystems': Editorial". Acta Oecologica 20 4 (1999): 225-226. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0032717554&partnerID=MN8TOARS. M. A. Pardal; Marques, João Carlos de Sousa. "Impacto das actividades humanas na qualidade ecológica do estuário do Mondego. Possíveis soluções para o futuro". Sociedade e território 27 00 (1998): 62-69. Publicado R. J. Lopes; J. A. Cabral; T. Múrias; J. C. Marques. "Contribuição para o conhecimento da dieta do Pilrito-comum Calidris alpina e da Tarambola-cinzenta Pluvialis squatarola no estuário do Mondego". Airo 9 1-2 (1998): 27-32. Publicado Cabral, J.A.; Mieiro, C.L.; Marques, J.C.. "Environmental and biological factors influence the relationship between a predator fish, Gambusia holbrooki, and its main prey in rice fields of the Lower Mondego River Valley (Portugal)". Hydrobiologia 382 (1998): 41-51. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0032464812&partnerID=MN8TOARS. 10.1023/A:1003480920168 Anastácio, P.M.; Marques, J.C.. "Crayfish (Procambarus clarkii) condition throughout the year in the lower Mondego River valley, Portugal". Crustaceana 71 6 (1998): 593-602. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-18744425796&partnerID=MN8TOARS. Flindt, M.R.; Kamp-Nielsen, L.; Marques, J.C.; Pardal, M.A.; Bocci, M.; Bendoricchio, G.; Salomonsen, J.; Nielsen, S.N.; Jørgensen, S.E.. "Description of the three shallow estuaries: Mondego River (Portugal), Roskilde Fjord (Denmark) and the Lagoon of Venice (Italy)". Ecological Modelling 102 1 (1997): 17-31. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0030773962&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(97)00092-6 Martins, I.; Marques, J.C.; Jørgensen, S.E.; Nielsen, S.N.. "Modelling the effects of green macroalgae blooms on the population dynamics of Cyathura carinata (Crustacea: Isopoda) in an eutrophied estuary". Ecological Modelling 102 1 (1997): 33-53. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0030876196&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(97)00098-7 Marques, J.C.; Pardal, M.Â.; Nielsen, S.N.; Jørgensen, S.E.. "Analysis of the properties of exergy and biodiversity along an estuarine gradient of eutrophication". Ecological Modelling 102 1 (1997): 155-167. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0030799723&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(97)00099-9 Mürias, T.; Cabral, J.A.; Lopes, R.; Marques, J.C.; R. Lopes; T. Múrias; J. A. Cabral; Marques, João Carlos de Sousa. "Low-water use of the mondego estuary (West Portugal) by waders (CharadrII)". Ardeola 44 1 (1997): 79-91. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0002976418&partnerID=MN8TOARS. Publicado Jørgensen, S.E.; Marques, J.C.; Anastácio, P.M.. "Modelling the fate of surfactants and pesticides in a rice field". Ecological Modelling 104 2-3 (1997): 205-213. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0031560382&partnerID=MN8TOARS. 10.1016/S0304-3800(97)00134-8 Múrias, T.; Cabral, J.A.; Marques, J.C.; Goss-Custard, J.D.. "Short-term effects of intertidal macroalgal blooms on the macrohabitat selection and feeding behaviour of wading birds in the Mondego Estuary (West Portugal)". Estuarine, Coastal and Shelf Science 43 6 (1996): 677-688. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0030302952&partnerID=MN8TOARS. 10.1006/ecss.1996.0096 Anastacio, P.M.; Marques, J.C.. "Population biology and production of the red swamp crayfish Procambarus clarkii (Girard) in the Lower Mondego River Valley, Portugal". Journal of Crustacean Biology 15 1 (1995): 156-168. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0029108949&partnerID=MN8TOARS. Anastácio, P.M.; Nielsen, S.N.; Marques, J.C.; Jørgensen, S.E.; M. A. S. Fernandes; S. N. Nielsen; Marques, João Carlos de Sousa; S. E. Jørgensen. "Integrated production of crayfish and rice: a management model". Ecological Engineering 4 3 (1995): 199-210. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0029543531&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1016/0925-8574(94)00059-E M. A. S. Fernandes; Marques, João Carlos de Sousa; & V. M. C. Madeira. "Accurate measurement of triglycerides in crayfish Procambarus clarkii tissues". Ciência Biológica – Ecology and Systematics 14 1-2 (1994): 13-18. Publicado Fernandes, M.A.S.; Mendonca, M.I.R.; Marques, J.C.; Madeira, V.M.C.. "Seasonal changes in the biochemical composition and energy content of the red swamp crayfish Procambarus clarkii (Girard) in the lower Mondego River Valley, Portugal". Journal of Crustacean Biology 14 4 (1994): 736-743. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0028045660&partnerID=MN8TOARS. Marques, J.C.; Martins, I.; Teles-Ferreira, C.; Cruz, S.. "Population dynamics, life history, and production of Cyathura carinata (Kroyer) (Iosopoda: Anthuridae) in the Mondego Estuary, Portugal". Journal of Crustacean Biology 14 2 (1994): 258-272. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0028083469&partnerID=MN8TOARS. Bellan-Santini, D; Marques, João Carlos de Sousa; Lopes, M. F. R. "The Amphipod Fauna (Crustacea) from Azores (Portugal): An up-to-date annotated check-list and some biogeographical considerations". Crustaceana 65 (1993): 204-217. Publicado Marques, J.C.; Maranhao, P.; Pardal, M.A.. "Human impact assessment on the subtidal macrobenthic community structure in the Mondego Estuary (western Portugal)". Estuarine, Coastal & Shelf Science 37 4 (1993): 403-419. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0027870908&partnerID=MN8TOARS. Marques, J.C.; Rodrigues, L.B.; Nogueira, A.J.A.. "Intertidal macrobenthic communities structure in the Mondego Estuary (western Portugal): reference situation". Vie et Milieu 43 2-3 (1993): 177-187. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0027833160&partnerID=MN8TOARS. Adao, H.; Marques, J.C.. "Population biology of the red swamp crayfish Procambarus clarkii (Girard, 1852) in southern Portugal". Crustaceana 65 3 (1993): 336-345. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0027837096&partnerID=MN8TOARS. Pardal, M.A.; Marques, J.C.; Bellan, G.. "Spatial distribution and seasonal variation of subtidal polychaete populations in the Mondego estuary (western Portugal)". CAH.BIOL.MAR. 34 4 (1993): 497-512. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0027146068&partnerID=MN8TOARS. Marques, J.C.; Bellan-Santini, D.; Marques, João Carlos de Sousa; Bellan-Santini, D. "Biodiversity in the ecosystem of the Portuguese continental shelf: distributional ecology and the role of benthic amphipods". Marine Biology 115 4 (1993): 555-564. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0027871861&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.1007/BF00349362 M. A. Pardal; A. M. Caldeira; J. C. Marques. "Contribution to knowledge of the Polychaete fauna of Portugal. Part I. Orbiniida, Cossurida, and Spionida". Ciência Biológica – Ecology and Systematics 12 1-2 (1992): 1-25. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; Bellan-Santini, D. "Gammaridea and Caprellidea (Crustacea, Amphipoda) of the Portuguese South-Western continental shelf: Taxonomy and distributional ecology". Bijdragen tot de Dierkunde 61 (1991): 65-87. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; A. Nogueira. "Life cycle, population dynamics, and production of Echinogammarus marinus (Leach) (Amphipoda) in the Mondego estuary (Portugal)". Oceanologica Acta 11 (1991): 213-223. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; D. Bellan-Santini. "Faune d'Amphipodes des milieux lagunaires du Portugal: Actualisation des données et comparaison avec d'autres systèmes atlantiques et mediterranéens". Mésogée 50 00 (1990): 53-61. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; D. Bellan-Santini. "Benthic Amphipod Fauna (Crustacea) of the Portuguese Coast: Biogeographical considerations". Marine Nature 3 00 (1990): 43-51. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; Bellan-Santini, D. "Crustacés Amphipodes des côtes du Portugal: Faune de l'estuaire du Mira (Alentejo, côte Sud-Ouest)". Cahiers de Biologie Marine 28 (1987): 465-480. Publicado Bellan-Santini, D; Marques, João Carlos de Sousa. "Une nouvelle espèce d'Ampelisca (Crustacea - Amphipoda) des côtes du Portugal (Atlantique Nord-Est): Ampelisca lusitanica n. sp. Cahiers de Biologie Marine". Cahiers de Biologie Marine 27 (1986): 153-162. Publicado P. Cunha; J. Calvário; J. C. Marques; P. Ré. "Estudo Comparativo dos regimes alimentares de Raja brachyura Lafont, 1893, Raja clavata Linné, 1758, Raja montagui Fowler, 1910 e Raja naevus Muller & Henle, 1841 (Pisces, Rajidae), da costa portuguesa". Arquivos do Museu Bocage 3 8 (1986): 137-154. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; D. Bellan-Santini. "Crustacés Amphipodes des côtes du Portugal: Faune du canal de Tavira, des salines de Marim (Ria Formosa) et de la lagune de Santo André". Anais da Faculdade de Ciências do Porto 67 1-4 (1986): 217-243. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; D. Bellan-Santini. "Contribuition à l'étude systématique et écologique des Amphipodes (Crustacea - Amphipoda) des côtes du Portugal. Premier inventaire des espèces (Gammariens et Caprelliens)". Ciência Biológica – Ecology and Systematics 5 4 (1985): 299-353. Publicado D. Bellan-Santini; Marques, João Carlos de Sousa. "Contribution à l'étude des Amphipodes des côtes du Portugal". Ciência Biológica – Ecology and Systematics 5 2-3 (1984): 131-149. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; I. Costa. "Etude d'une collection de Crustacés Decapodes de l'estuaire du Tage (Portugal). Biologie des populations de Carcinus maenas (Decapoda, Brachyura), Crangon crangon, Palaemon longirostris et Palaemon serratus (Decapoda, Caridea)". Ciência Biológica – Ecology and Systematics 5 2-3 (1984): 151-189. Publicado J. Calvário; Marques, João Carlos de Sousa. "Etude systématique et écologique d'une collection d'Amphipodes de la zone intertidale de l'estuaire du Tage (Portugal). Occurrence d'Orchestia kosswigi Ruffo, 1949 et d'Orchestia stephenseni Cecchini, 1928". Ciência Biológica – Ecology and Systematics 5 1 (1983): 79-95. Publicado Marques, João Carlos de Sousa. "Contribuição para o estudo sistemático e ecológico dos Anfípodes do litoral português. Primeiros resultados acerca de uma colecção recolhida na faixa costeira do Cabo Carvoeiro à Ponta do Surdão". Ciência, 4ª ser. 1 2-3 (1981): 45-72. Publicado J. Calvário; Marques, João Carlos de Sousa; A. Pousada. "Occurrence of Sphoeroides cutaneus (Gunther, 1870) (Pisces, Tetrodontidae) off the Portuguese Coast". Arquivos do Museu Bocage, 2ª ser. 7 10 (1980): 131-137. Publicado
Capítulo de livro	Duarte, B.; Matos, A. R.; Marques, J. C.; Ca¿ador, I.. "Lipids in halophytes: stress physiology relevance and potential future applications.". In Halophytes and climate change: adaptive mechanisms and potential uses, 359-371. CABI, 2019. Publicado • 10.1079/9781786394330.0359 Caçador, Isabel; Duarte, Bernardo; Marques, João Carlos. "Climate Change Impacts on Salt Marsh Vegetation Ecophysiology". In Tasks for Vegetation Science, 189-206. Springer International Publishing, 2019. 10.1007/978-3-030-04417-6_12 Duarte, Bernardo; Mateos-Naranjo, Enrique; Goméz, Susana Redondo; Marques, João Carlos; Caçador, Isabel. "Cordgrass Invasions in Mediterranean Marshes: Past, Present and Future". In Histories of Bioinvasions in the Mediterranean, 171-193. Springer International Publishing, 2018. Publicado • 10.1007/978-3-319-74986-0_8 Gonçalves, Ana M.M.; Marques, João C.; Gonçalves, Fernando. "Fatty Acids’ Profiles of Aquatic Organisms: Revealing the Impacts of Environmental and Anthropogenic Stressors". In Fatty Acids. InTech, 2017. Publicado • 10.5772/intechopen.68544 Caçador, Isabel; Duarte, Bernardo; Marques, João Carlos; Sleimi, Noomene. "Carbon Mitigation". In Halophytes for Food Security in Dry Lands, 83-110. Elsevier, 2016. Publicado • 10.1016/b978-0-12-801854-5.00006-6 Pinto, Rute; Marques, João Carlos. "Ecosystem Services in Estuarine Systems: Implications for Management". In Ecosystem Services and River Basin Ecohydrology, 319-341. Springer Netherlands, 2015. Publicado • 10.1007/978-94-017-9846-4_16 Marques, João Carlos. "Commentary: Macrofaunal key species as useful tools in management and assessment practices on sandy beaches". In Beaches: Erosion, Management Practices and Environmental Implications, Series: Environmental Health – Physical, Chemical and Biological Factors, 35-52. NOVINKA, 2014. Publicado I. Martins; Marques, João Carlos de Sousa. "Estuary Ecosystem Models". In Handbook of Ecological Models in Ecosystem and Environmental Management - Applied Ecology and Environmental Management 2, 63-135. ***********: CRC Press, 2011. Publicado Borja, A.; Basset A; Bricker S; Dauvin J-C; Elliott M; Harrison T; J. C. Marques; et al. "Classifying Ecological Quality and Integrity of Estuaries". In Treatise on Estuarine and Coastal Science, 125-162. **********: Waltham: Academic Press, 2011. Publicado • 10.1016/B978-0-12-374711-2.00109-1 Borja, A.; Basset, A.; Bricker, S.; Dauvin, J.-C.; Elliott, M.; Harrison, T.; Marques, J.-C.; Weisberg, S.B.; West, R.. "Classifying Ecological Quality and Integrity of Estuaries". In Treatise on Estuarine and Coastal Science, 125-162. Elsevier, 2011. Publicado • 10.1016/b978-0-12-374711-2.00109-1 Marques, João Carlos de Sousa. "Overview of ecological indicators for coastal and marine environments". In Ecology Encyclopedi, 619-630. ********: Elsevier, 2008. Publicado S. E. Jørgensen; F.-L. Xu, J.; F. Salas; Marques, João Carlos de Sousa. "Application of indicators for the assessment of ecosystem health". In Handbook of ecological indicators for assessment of ecosystem health, 5-66. **********: CRC Press, 2005. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; F. J. Salas; J. M. Patrício; M. A. Pardal. "Application of ecological indicators to assess environmental quality in coastal zones and transitional waters. Two case studies". In S.E. Jørgensen, R. Costanza & X. Fu-Liu (eds) Handbook of ecological indicators for assessment of ecosystem health. Chapter 3, 67-104. ****: CRC Press, 2005. Publicado Marques, João Carlos de Sousa. "Biological framework – Diversity and Biodiversity". In Baseline research for the integrated sustainable management of Mediterranean sensitive coastal ecosystems. A manual for coastal managers, scientists and all those stydying coastal processes and management in the Mediterranean, 33-36. Itália: Instituto Agronomico per l’Oltremare, 2002. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; P. Anastácio. "Integration and interpretation of ecological data at population level". In Baseline research for the integrated sustainable management of Mediterranean sensitive coastal ecosystems. A manual for coastal managers, scientists and all those stydying coastal processes and management in the Mediterranean, 155-164. Itália: Instituto Agronomico per l’Oltremare, 2002. Publicado Anastácio P.M.; J. C. Marques. "Crayfish Procambarus clarkii in the lower Mondego river valley". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 347-362. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Cabral J.A.; C. L. Mieiro; J. C. Marques. "Role assessment of an exotic fish in rice fields of the lower Mondego River Valley: Life history, population dynamics, production and diet of eastern mosquitofish, Gambusia holbrooki (Pisces, Poeciliidae)". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 363-380. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Marques, J.C.; M. A. Pardal; P. Maranhão. "Characterisation of the Echinogammarus marinus (Leach) (Amphipoda) population in the Mondego estuary". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 399-415. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Pardal M.A.; J. C. Marques; S. Ferreira; I. Martins; A. I. Lillebø. "Life cycle, biology and production of an estuarine Isopod (Cyathura carinata)". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 417-434. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado A. I. Lillebø; M. A. Pardal; P. Cardoso; J. C. Marques. "The effect of primary producers dynamics (macrophytes and macroalgae) on Hydrobia ulvae population dynamics, life cycle and production, in the south arm of the Mondego estuary". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 435-455. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Marques, J. C.; M.A.S. Graça; M. A. Pardal. "Introducing the Mondego river basin". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 7-12. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Azeiteiro U.M.; P. Ré; J. C. Marques. "On the structure of the bentho-pelagic fauna from the Mondego estuary southern arm". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 151-168. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Marques, J. C.; M. A. Pardal; P. Maranhão. "Characterisation of macroinvertebrate benthic communities in the Mondego estuary". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 169-197. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Lopes R. J.; J. A. Cabral; T. Múrias; C. Pacheco; J. C. Marques. "Status and habitat use of waders in the Mondego estuary". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 219-230. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Lillebø A.I.; M. A. Pardal; M. R. Flindt; J. M. Neto; F. Macedo; I. Martins; J. C. Marques. "Nutrient dynamics in the intertidal pools of the Mondego estuary. IV – Possible contribution to dissolved inorganic phosphate loading". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 287-300. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Martins, I.; M. A. Pardal; I. Metelo; J. M. Neto; J. M. Oliveira; J. C. Marques. "Enteromorpha spp. (Ulvales: Chlorophyta) growth in the south arm of the Mondego estuary: field growth rates with and without macrofaunal grazer effects". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 301-312. Coimbra, Portugal: . Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Pardal M.A.; J. C. Marques; I. Metelo; A. I. Lillebø; M. R. Flindt. "Impact of eutrophication on amphipods Melita palmata and Ampithoe valida in the Mondego estuary". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 457-472. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado U. Azeiteiro; J. C. Fonseca; J. C. Marques. "The suprabenthic mysid Mesopodopsis slabberi (van Beneden) in the Mondego estuary". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 473-492. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado T. Múrias; J. C. Marques; J. D. Goss-Custard. "Effects of habitat loss on waders (Aves, Charadrii) in the Mondego estuary: a synthesis and future perspectives". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 515-525. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado T. Múrias; J. A. Cabral; R. Lopes; J. C. Marques. "Effects of eutrophication on waders (Aves, Charadrii) in the Mondego estuary: A multi-level approach". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 527-540. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado J. C. Fonseca; J. C. Marques; A. A. Paiva; A. M. Freitas; V. M. C. Madeira; S. E. Jørgensen. "Applied research in the Mondego estuary- exploring the use of DNA content of organisms to estimate ecological exergy". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 565-576. Coimbra, Portugal: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Patten, B. C.; B. D. Fath; J. S. Choi; S. Bastianoni; S. R. Borret; S. Brandt-Williams; M. Debeljak; et al. "Complex Adaptive Hierarchical Systems – chapter 4". In Costanza , B. & S. E. Jorgensen, S. E. (eds) Understanding and Solving Environmental Problems in the 21st Century, 95-99. ****: Elsevier, 2002. Publicado Lillebø A.I.; J. M. Neto; M. A. Pardal; M. R. Flindt; J. C. Marques. "The role of Spartina maritima and Scirpus maritimus to sediment pore-water profiles, and possible implications to the Mondego estuary nutrient dynamics.". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 325-338. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Martins, I.; M. R. Flindt; M. A. Pardal; A. I. Lillebø; J. M. Oliveira; J. C. Marques. "Nutrient dynamics in the intertidal pools of the Mondego estuary. III- The importance of nutrient effluxes to macroalgal growth (Enteromorpha sp)". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 273-286. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado Lillebø A.I.; M. R. Flindt; M. A. Pardal; I. Martins; J. M. Neto; J. C. Marques. "Nutrient dynamics in the intertidal pools of the Mondego estuary. II – Seasonal efflux of PO4-P and NH4-N in bare bottom and vegetated pools". In Aquatic ecology of the Mondego river basin. Global importance of local experience, 257-271. Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2002. Publicado J. S. Antunes do Carmo; Marques, João Carlos de Sousa; Do Carmo, J.S.A.; Marques, J.C.. "River dynamics and restoration: A comprehensive management strategy". In River basin management, 63-72. Southampton: WIT Press, 2001. Publicado Marques, J.C.; M. A. Pardal; S. N. Nielsen; S. E. Jørgensen. "Thermodynamic Orientors: Exergy as a holistic ecosystem indicator: A case study". In Ecotargets, goal functions, and orientors, 87-101. Berlim: Springer-Verlag, 1998. Publicado S. N. Nielsen; S. E. Jørgensen; J. C. Marques. "Case studies: Modelling approaches for the practical application of ecological goal functions". In Ecotargets, goal functions, and orientors, 243-254. Berlim: Springer-Verlag, 1998. Publicado Marques, João Carlos de Sousa; S. N. Nielsen; S. E. Jørgensen. "Applying thermodynamic orientors: The use of Exergy as an indicator in environmental management". In Ecotargets, goal functions, and orientors*, 481-491. Berlim: Springer-Verlag, 1998. Publicado
Edição de livro	E. Tiezzi; J. C. Marques; C. A. Brebbia; S. E. Jørgensen. Ecosystems and sustainable development VI. ***********: Wit. 2007. Azeiteiro, U. M. M.; J. C. Marques. Plankton responses to environmental variability. **********: ELSEVIER. 2003. Marques, J.C.; S. Gamito; P. Ré. Processes and Flows in Marine Benthic Ecosystems - Acta Oecologica. **********: Elsevier. 1999. Marques, J.C.. Crayfish Rice Integrated System of Production (CRISP). ***********: Elsevier. 1999.
Livro	Marques, João Carlos. Nielsen, S. N., B. D. Fath, S. Bastianoni, J. C. Marques, F. Müller, B. Patten, R. E. Ulanowicz, S. E. Jørgensen, E. Tiezzi, 2020. A New Ecology: Systems Perspective. 2nd Edition, © Elsevier Science 2020, 270 pp. ISBN 0444637575 (Paperback ISBN: 9780444637574).. Elsevier. 2020. Publicado Pinto, R.; Carlos Marques, J.. Ecosystem services in estuarine systems: Implications for management. 2015. 10.1007/978-94-017-9846-4_16 Gonçalves, S.C.; Marques, J.C.. Commentary: Macrofaunal key species as useful tools in management and assessment practices on sandy beaches. 2014. Marques, João Carlos de Sousa; F. Salas; J. Patrício; H. Teixeira. Ecological Indicators for Coastal and Estuarine Environmental Assessment - A User Guide. ***********: WIT PRESS. 2009. Publicado S. E. Jørgensen; B. Fath; S. Bastianoni; Marques, João Carlos de Sousa; F. Müller; S. N. Nielsen; B. C. Patten; E. Tiezzi; R. Ulanowicz. A new Ecology. Systems perspective. **********: Elsevier. 2007. Publicado J. G. Ferreira; P. F. Abreu; A. Bettencourt; S. B. Bricker; Marques, João Carlos de Sousa; J. J. Melo; A. Newton; et al. Monitoring plan for water quality ecology of Portuguese transitional and coastal waters. **********: IMAR/INAG. 2006. Publicado F. Salas; J. Patrício; Marques, João Carlos de Sousa. Ecological indicators in coastal and estuarine environmental quality assessment. A user friendly guide for practitioners. ***********: Imprensa da Universidade de Coimbra. 2006. Publicado A. Bettencourt; S.B. Bricker; J. G. Ferreira; A. Franco; Marques, João Carlos de Sousa; J. J. Melo; A. Nobre; et al. Typology and reference conditions for Portuguese transitional and coastal waters. Development of guidelines for the application of the European Union Water Framework Directive. Lisboa: INAG/IMAR. 2004. Publicado
Manual	Marques, João Carlos de Sousa. Hidrobiologia. Portugal. 1997.
Resumo em conferência	Marques, João Carlos de Sousa; M. A. S. Fernandes; M. I. R. Mendonça; V. M. C. Madeira. "Procambarus clarkii energy and nutrient transfer capacities in the Lower Mondego river valley (Portugal)". Trabalho apresentado em International Association of Astacology 10th Symposium, Adelaide, Australia, 1995. Publicado Sousa Reis, C.; V. Monteiro Marques; J. Calvário; J. C. Marques; R. Melo; R. Santos; Monteiro, Marques; V. C. Sousa Reis. "Contribuição para o estudo dos povoamentos bentónicos (substrato móvel) da costa ocidental portuguesa". Trabalho apresentado em 2º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho, ************, 1982. Publicado

Outros

Outra produção

Sven Erik Jørgensen, a whiff of fresh air in environmental science. A very Special Issue of Ecological Modelling, Lieber Amicorum – Sven Erik Jørgensen: 28-29. 2004. Marques, J. C..
Book review of “Integration of ecosystem theories: A pattern”, by Sven Erik Jørgensen, Kluwer Academic Publishers, Dondrecht, Boston, London, Second Revised Edition; In Ecological Modelling 117: 165-167. 1999. Marques, J.C..
Amphipoda (crustacea) bentónicos da costa portuguesa : estudo taxonómico, ecológico e biogeográfico. 1989. Marques, João Carlos de Sousa.
Participação nas missões SEPLAT 10. 1986. Marques, João Carlos de Sousa.
Participação nas missões SEPLAT 9. 1985. Marques, João Carlos de Sousa.
Participação nas missões SEPLAT 4. 1980. Marques, João Carlos de Sousa.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2004	Seasonal variation of chemical composition of surface sediments in the Mondego river estuary	SEDNET Conferences – Monitoring sediment quality at river basin scale. Understanding the behaviour and fate of pollutants (Lisboa , Portugal)
2003	Comparison of Talorchestia brito (Amphipoda, Talitridae) biology, dynamics, and secondary production in Atlantic (Portugal) and Mediterranean (Tunisia) populations	XI International Colloquium on Amphipoda (Tunis, Tunísia)
2003	Ascendency as an ecological indicator: A case study in a temperate eutrophic estuary	38th European Marine Biology Symposium (Aveiro , Portugal)
2003	Dynamic changes in seagrass assemblages under eutrophication and implications for recovery	38th European Marine Biology Symposium (Aveiro, Portugal)
2003	Restoration and management of Zostera noltii meadows in a disturbed shallow temperate estuary	38th European Marine Biology Symposium (Aveiro, Portugal)
2003	Seasonal dynamics of meiofauna in Zostera noltii Hornem sediments in the Mira estuary (SW Portugal)	38th European Marine Biology Symposium (Aveiro, Portugal)
2003	Can biotoc processes in estuarine ecosystems be understood, without knowing the diversity of macroparasites?	38th European Marine Biology Symposium (Aveiro, Portugal)
2003	Intertidal vegetation dynamics. Narural and anthropogenic influences	38th European Marine Biology Symposium (Aveiro , Portugal)
2003	The effect of Zostera noltii, Spartina marítima, and Scirpus maritimus on spring sediment pore-water profiles, in a temperate intertidal estuary	38th European Marine Biology Symposium (Aveiro , Portugal)
2002	Modelling the effects of salinity variation on Echinogammarus marinus Leach (Amphipoda, Gammaridae) density and biomass in the Mondego estuary (Western Portugal)	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Gibraltar – La Línea, Espanha)
2002	The presence of algae mats influences the distribution of waders (Aves, Charadrii) on intertidal mudflats?	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Gibraltar – La Línea, Espanha)
2002	Seasonal growth rates of Zostera noltii Hornem. On the Mondego estuary (Central Portugal)	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Gibraltar – La Línea, Espanha)
2002	Interannual variation in the biochemical composition of Mesopodopsis slabberi (Crustácea: Mysidacea)	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Gibraltar – La Línea, Espanha)
2002	Morphometry, production, biochemistry, and histochemistry of the suprabenthic mysid Mesopodopsis slabberi Van Beneden (Crustácea: Mysidacea) in the Mondego estuary (Western Coast of Portugal)	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Gibraltar – La Línea, Espanha)
2002	Suprabenthos distribution in the Mondego estuary (Western Portugal)	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Gibraltar – La Línea, Espanha)
2002	The effects of eutrophication and macroalgal blooms on the secondary production of a macrobenthic community	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Gibraltar – La Línea)
2001	Dynamics of pelagic environmental parameters, chlorophyll a and bacterioplankton of the Mondego estuary	Plankton Symposium (Espinho, Portugal)
2001	The exergy concept in ecology – an useful instrument for environmental management	Plankton Symposium (Espinho, Portugal)
2001	Biology, population dynamics, and productivity of Talitrus saltator at Cabedelo (Western Coast of Portugal), Ucellina (Western coast of Italy), and Zouaraa (North-Western coast of Tunisia): A comparative study between Atlantic and Mediterranean populations	International Workshop Beaches – What Future? An integrated approach to the ecology and evolution of beahes and sand dunes (Florença, Itália)
2001	A model for Amphipod (Talitrus saltator) population dynamics	International Workshop Beaches – What Future? An integrated approach to the ecology and evolution of beahes and sand dunes (Florença, Itália)
2001	Biochemical analysis in sandy beach Arthropods	International Workshop Beaches – What Future? An integrated approach to the ecology and evolution of beahes and sand dunes (Florença , Itália)
2001	Population dynamics, biometry and production of Acartia tonsa (Crustacea: Copepoda) in the Mondego estuary and trophic pelagic implications	Plankton Symposium (Espinho, Portugal)
2001	Biochemical analysis in the plankton compartment from the Mondego estuary	Plankton Symposium (Espinho, Portugal)
2001	Histochemistry and histology in planktonic ecophysiological processes determination in a temperate estuary (Mondego river estuary, Portugal)	Plankton Symposium (Espinho, Portugal)
2000	Temporal variationin the composition and structure of meiofauna (especially of the free-living nematodes) in the sediments of seagrass beds, Zostera noltii, in the Mira estuary (southwest coast of Portugal)	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga , Espanha)
2000	Nuclear DNA in the determination of weighing factors to estimate exergy from organism’s biomass	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga, Espanha)
2000	Seasonal nutrient efflux in bare bottom and Spartina maritima covered pools in the Mondego estuary (Portugal)	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga, Espanha)
2000	Impact of macroalgae blooms on intertidal macroinvertebrates: Experimental evidente from the Mondego estuary (Portugal)	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga, Espanha)
2000	Impact of macroalgae blooms on the macrobenthic communities of Mondego river (Portugal)	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga, Espanha)
2000	Biology, population dynamics, and production of Echinogammarus marinus (Amphipoda, Gammaridae) in the Mondego estuary (Portugal)	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga, Espanha)
2000	Term evolution (1990 – 1998) of subtidal macrobenthic communities in the Mondego estuary (Portugal)	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga, Espanha)
2000	Impact of macroalgae blooms on the macrobenthic communities of the Mondego estuary (Portugal)	ASLO Aquatic Sciences Meeting – Research Across Boundaries (Copenhagen, Dinamarca)
2000	Environmental data and distribution of N:P ratios in a temperate estuary	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Modelling the pelagic compartment in the Mondego estuary southern arm	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Assessing the bacterial diversity and community composition of the Mondego estuary (Western Portugal)	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Impact of eutrophication on Hydrobia ulvae population dynamics in the Mondego estuary (Western Portugal)	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Impact of macroalgae blooms on the population dynamics, production, and life cycle of Cyathura carinata (Krøyer). Evidence from the Mondego estuary	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Ligth, turbidity, nutrients, and chlorophyll in the water column of the Mondego estuary (Western Portugal)	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Estimation of ecological exergy using weighing parameters determined from DNA contents of organisms. A study case	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Biochemical composition changes in the mysid Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) after fasting and refeeding periods	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao , Espanha)
2000	Changes in total bacteria, and heterotrophyc plate counts in the bacterial community from the Mondego estuary (Portugal)	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Biochemical composition changes in the mysid Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) after fasting and refeeding periods	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Assesing the nutritional condition of the suprabenthic mysid Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) in the Mondego estuary (Western Portugal)	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Assesing the nutritional condition of the suprabenthic mysid Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) in the Mondego estuary (Western Portugal)	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao, Espanha)
2000	Ecoenergetics of Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) (Crustacea Mysidacea) in the Mondego estuary (Wesyern Portugal)	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Málaga, Espanha)
2000	Nuclear DNA in the determination of weighting factors to estimate exergy from organisms biomass	EcoSummit 2000 – Integrating the Sciences (Halifax, Nova Scotia , Canadá)
2000	Impacto humano sobre as condições físico-químicas, nutrientes, clorofila a e ciclo anual do fitoplâncton no estuário do Mondego	Conferência Ibérica sobre protecção ambiental (Viseu, Portugal)
2000	Phytoplankton composition in the Mondego estuary (Western Portugal)	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium (Bilbao)
1998	Distribution, population dynamics, estimates of production, and biochemical composition of Mesopodopsis slabberi Van Benneden (Crustacea: Mysidacea) in relation to its life cycle in a temperate estuary (Western Portugal: Mondego river estuary)	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Impact of macroalgae blooms on the benthic upper trophic levels in the Mondego estuary (Portugal)	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Population structure, dynamics, and production of Hydrobia ulvae (Pennant) (Mollusca: Procobranchia) along an eutrophication gradient in the Mondego estuary (Portugal)	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Temporal mineralization studies of Spartina maritima under mass balance control with and without meio and macrofauna	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Dinâmica anual dos moluscos na Reserva Natural da Berlenga	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Impact of macroalgae blooms in the biology, production, and dynamics of three species of Crustacea (Peracarida) in the Mondego estuary (Western Portugal)	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Community structure and temporal variation of meiofauna of the sediments of seagrass beds, Zostera noltii, in the Mira estuary (South West coast of Portugal)	10th International Meiofauna Conference (Universidade de Plymouth, Reino Unido)
1998	CRISP (Crayfish and Rice Integrated System of Production) – Articulation of several sub-models	49th Anuual Meeting of the American Institute of Biological Sciences, ISEM Conference (Baltimore, Estados Unidos)
1998	Applying thermodynamic orientors as indicators in environmental management: Exergy and its estimation	49th Anuual Meeting of the American Institute of Biological Sciences, ISEM Conference (Baltimore , Estados Unidos)
1998	Importância da Macrofauna bentónica nos processos de degradação das macrófitas de sapal (Spartina maritima e Scirpus maritimus) no estuário do Mondego	3º Encontro Nacional de Ecologia (Faro, Portugal)
1998	Modelo do crescimento de Enteromorpha spp. no estuário do Mondego	Encontro Nacional de Ecologia (Faro, Portugal)
1998	Variação temporal e vertical da meiofauna dos sedimentos associados aos povoamentos de Zostera noltii no estuário do Miro	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Temporal and spatial structure of the hyperbenthic community along an estuarine gradient (Western Portugal: Mondego river estuary) and its relation to environmental variables. Population dynamics and production of Mesopodopsis slabberi Van Benneden	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Amphipods population dynamics on brown seaweed Fucus spp. In the Mondego estuary, Portugal	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro, Portugal)
1998	Variação anual dos Crustáceos na Reserva Natural da Berlenga	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho (Praia do Carvoeiro , Portugal)
1998	Caracterização da biocenose de Poliquetas da Reserva Natural da Berlenga	3º Encontro Nacional de Ecologia (Faro , Portugal)
1998	Dinâmica anual dos Poliplacóforos na Reserva Natural da Berlenga	3º Encontro Nacional de Ecologia (Faro, Portugal)
1998	Estudos de impacto ambiental. Será um ano de amostragem suficiente? Um caso estudado (Cyathura carinata)	3º Encontro Nacional de Ecologia (Faro, Portugal)
1998	Estrutura da comunidade macrobentónica do povoamento de Fucus spp. do estuário do rio Mondego	3º Encontro Nacional de Ecologia (Faro, Portugal)
1998	O estuário do Mondego: Uma década de estudos das comunidades macrobentónicas subtidais. Impactos das dragagens regulares na área do porto comercial	3º Encontro Nacional de Ecologia (Faro, Portugal)
1998	Caracterização das comunidades de Chthamalus sp da Reserva Natural da Berlenga	3º Encontro Nacional de Ecologia (Faro, Portugal)
1997	Avaliação do risco ambiental inerente à utilização de um novo método químico no controlo de uma praga agrícola na região do Baixo Mondego	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra, Portugal)
1997	Growth and decay of Enteromorpha spp. in the Mondego estuary (Western Portugal)	Muddy Coasts’ 97 (Wilhelmshaven, Alemanha)
1997	Physicochemical conditions for plankton in the Mondego river estuary (Western Portugal), a tidal system in a temperate area	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra , Portugal)
1997	Distribution and population dynamics of the Mysid Mesopodopsis slabberi Van Benneden in a temperate estuary (Western Portugal: Mondego river estuary)	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra, Portugal)
1997	Composition and seasonality of crepuscular Peracarid zooplankton from the Mondego river estuary (Western Portugal)	2º Encontro Nacional de Ecologia (, Coimbra , Portugal)
1997	Padrões de actividade de aves limícolas no estuário do Mondego: Variação tidal e temporal	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra, Portugal)
1997	Modelo de um produtor primário importante no estuário do Mondego: Enteromorpha spp – Diagrama conceptual e equações preliminares	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra, Portugal)
1997	Biometrical relationships and temporal variation in biochemical composition of Mesopodopsis slabberi (Van Benneden) from the Mondego river estuary (Western Portugal)	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra, Portugal)
1997	Influência da temperatura e da salinidade na duração do período de desenvolvimento embrionário de Echinogammarus marinus (Amphipoda, Gammaridae)	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra, Portugal)
1997	Potenciais efeitos da aplicação de um surfactante, Genapol OXD – 080, sobre as comunidades de macroinvertebrados em campos agrícolas e valas de irrigação	2º Encontro Nacional de Ecologia (Coimbra, Portugal)
1996	Optimização alimentar como sintoma dos efeitos da eutrofização na eficiência predatória das aves limícolas no estuário do Mondego: Um estudo eco-etológico	II Congresso Nacional de Etologia, Sociedade Portuguesa de Etologia (Lisboa, Portugal)
1996	Analysis of the properties of exergy and biodiversity along an estuarine gradient of eutrophication	IX Simpósio Ibérico de Estudo de Benthos Marinho (Alcalá de Henares , Espanha)
1996	Term evolution of the subtidal macrobenthic community structure in the Mondego estuary (Western Portugal)	IX Simpósio Ibérico de Estudo de Benthos Marinho (Alcalá de Henares , Espanha)
1996	Estrutura trófica dos povoamentos macrobentónicos das Zosteráceas do Estuário do rio Mira (Portugal)	IX Simpósio Ibérico de Estudo de Benthos Marinho (Alcalá de Henares , Espanha)
1996	Usage of Biodiversity and Exergy as ecological indicators of ecosystems integrity. A case study	Ecological Summit 96 (Copenhagen, Dinamarca)
1996	Biology, production and dynamics of Amphithoe ferox along an eutrophication gradient in the Mondego estuary (Western Portugal)	2nd European Crustacean Conference (Liège, Bélgica)
1996	Influence of eutrophication in the biology, production, and dynamics of Cyathura carinata (Krøyer) in the Mondego estuary (Western Portugal)	2nd European Crustacean Conference (Liège, Bélgica)
1996	Influence of macroalgae blooms on the population dynamics of Melita palmata (Amphipoda) along an eutrophication gradient (Mondego estuary, Western Portugal)	2nd European Crustacean Conference (Liège , Bélgica)
1996	Quantificação dos nutrientes ao longo de um gradiente de eutrofização no estuário do Mondego: Influência nos produtores primários	1º Encontro Nacional de Ecologia (Oeiras, Portugal)
1996	Crayfish (Procambarus clarkii) effects on initial stages of rice growth	International Association of Astacology 11th Symposium (Thunder Bay, Ontario , Canadá)
1996	Organic content and physiological condition of crayfish (Procambarus clarkii) throughout the year in the Lower Mondego river valley, Portugal	International Association of Astacology 11th Symposium (Thunder Bay, Ontario , Canadá)
1996	Organic content and physiological condition of crayfish (Procambarus clarkii) throughout the year in the Lower Mondego river valley, Portugal	International Association of Astacology 11th Symposium (Thunder Bay, Ontario , Canadá)
1996	A non-harmful chemical method of red swamp crayfish (Procambarus clarkii) population control and non target organisms’ problematics in the Lower Mondego river valley, Portugal	International Association of Astacology 11th Symposium (Thunder Bay, Ontario , Canadá)
1996	Oxygen uptake inhibition in Procambarus clarkii, Louisiana crayfish by biodegradable surfactants: An ecotechnological approach for population control in rice fields	International Association of Astacology 11th Symposium (Thunder Bay, Ontario , Canadá)
1996	Ecological aspects of egg resorption in red swamp crayfish (Procambarus clarkii)	International Association of Astacology 11th Symposium (Thunder Bay, Ontario, Canadá)
1996	Biology, population dynamics and production of Echinogammarus marinus Leach (Amphipoda) in the intertidal rocky area of the Mondego estuary (Portugal): Impact of water circulation	2nd European Crustacean Conference (Liège, Bélgica)
1996	Modelo da dinâmica populacional de Echinogammarus marinus (Amphipoda, Gammaridae) no estuário do Mondego: Diagrama conceptual	1º Encontro Nacional de Ecologia (Oeiras, Portugal)
1996	Modelo trófico do estuário do Mondego: Diagrama conceptual	1º Encontro Nacional de Ecologia (Oeiras, Portugal)
1995	Eutrophication processes in the Mondego estuary: Growth of Enteromorpha spp. with and without grazing effects	4th International Conference on Aquatic Ecosystem Health: Integrated / Multitrophic Strategies - Microbes to Fish (Coimbra, Portugal)
1995	Spatial and temporal variation of exergy along an estuarine gradient of eutrophication	The 9th International Conference on State of the Art of Ecological Modelling (ISEM’95) (Beiing, China)
1995	Contribuição para o conhecimento da dieta de Calidris alpina e Pluvialis squatarola no estuário do Mondego	Simpósio Sobre Ecologia Alimentar de Aves (Lisboa, Portugal)
1995	Evaluation of profitability on a rice-crayfish double cropping system in Portugal	The 9th International Conference on The State of the Art of Ecological Modelling (ISEM’95) (Bejing, China)
1995	Impacto da eutrofização ao nível do topo da cadeia trófica estuarina: Um estudo no estuário do Mondego	Congresso Nacional de Conservação da Natureza (Lisboa, Portugal)
1995	The impact of macroalgae blooms on the distribution and feeding efficiency of waders in the Mondego Estuary (West Portugal)	10 th International Waterfowl Ecology Symposium and Wader Study Group Conference (Aveiro)
1994	Influence of dredging and water circulation on the subtidal macrobenthic community structure in the Mondego estuary (Western Portugal)	Séminaire Franco - Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime (Coimbra, Portugal)
1994	Some effects of intertidal macroalgae blooms on the feeding of wading birds in the Mondego estuary (Western Portugal)	Séminaire Franco - Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime (Coimbra , Portugal)
1994	Cyathura carinata (Crustacea: Isopoda), Enteromorpha sp. (Ulvales: Chlorophyta) and organic matter: Top-bottom or bottom-top control?. The answer by an ecological model	Séminaire Franco - Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime (Coimbra , Portugal)
1994	The influence of physicochemical environmental factors on the macrobenthic fauna in the Mondego estuary (Portugal)	ECSA 24 Symposium, Northern and Southern estuaries and coastal areas (Aveiro, Portugal)
1994	Sex-ratio of Procambarus clarkii. A comparison with data obtained in central Portugal	International Association of Astacology 10th Symposium (Adelaide (, Austrália)
1994	Population structure of adult Procambarus clarkii throughout the main reproductive period in Central Portugal	International Association of Astacology 10th Symposium (Adelaide, Austrália)
1994	Procambarus clarkii: Energy and nutrient transfer capacities in the Lower Mondego River Valley (Portugal)	International Association of Astacology 10th Symposium (Adelaide, Austrália)
1994	Female crayfish (Procambarus clarkii) fecundity in Central Portugal	International Association of Astacology 10th Symposium (Adelaide , Austrália)
1994	Macroalgae blooms and macrohabitat selection by waders: A study in the Mondego estuary (Western Portugal)	XXI International Ornithological Congress Hofburg (Vienna, Áustria)
1994	Fertility of crayfish (Procambarus clarkii) females over the year in the Lower Mondego river valley, central Portugal	INTECOL, VI International Congress of Ecology (Manchester, Reino Unido)
1994	Adult crayfish (Procambarus clarkii) population structure in the Lower Mondego river valley, central Portugal	INTECOL, VI International Congress of Ecology (Manchester , Reino Unido)
1994	Significance of the salinas as low-water feeding habitats for waders in the Mondego estuary (Western Portugal), as compared to mud flats	XXI International Ornithological Congress Hofburg (Vienna , Áustria)
1994	Biology and production of Hydrobia ulvae (Pennant) in the Mondego estuary (Portugal): Preliminary results	ECSA 24 Symposium, Northern and Southern estuaries and coastal areas (Aveiro, Portugal)
1994	Cyathura carinata (Crustacea: Isopoda), Enteromorpha sp. (Ulvales: Clorophyta) and organic matter: Top-bottom or bottom-top control? The answer by an ecological model	ECSA 24 Symposium, Northern and Southern estuaries and coastal areas (Aveiro , Portugal)
1994	Nutrient loading estimates in the south arm of the Mondego estuary (Portugal)	Relations with eutrophication. ECSA 24 Symposium, Northern and Southern estuaries and coastal areas (Aveiro, Portugal)
1994	Life history, dynamics and production of Amage adspersa (Grube) (Polychaeta) in the Mondego estuary (Portugal), 1994	ECSA 24 Symposium, Northern and Southern estuaries and coastal areas (Aveiro, Portugal)
1993	Rice and crayfish production in the Lower Mondego river valley (Portugal): A management model for farmers	International Congress on Modelling and Simulation (Perth, Austrália)
1993	The MUST Project. MAST days and EUROMAR market, Commission of the European Communities	DG XII, MAST programme (Brussels, Bélgica)
1993	Influence of temperature on the accumulation of essential (Zn) and non-essential (Cd) trace metals by red swamp crayfish Procambarus clarkii (Girard).	International Senckenberg - Symposium on Crustacea Decapoda (Frankfurt , Alemanha)
1993	Population structure and recruitment of the red swamp crayfish (Procambarus clarkii) in wetlands from Central Portugal	International Senckenberg - Symposium on Crustacea Decapoda (Frankfurt, Alemanha)
1993	Controle da hematose no lagostim vermelho por tensioactivos: Controlo populacional	9º Congresso Nacional de Bioquímica - Sociedade Portuguesa de Bioquímica (Albufeira, Portugal)
1992	Ecological distribution and seasonal variation of subtidal polychaetes populations in the Mondego estuary (Portugal)	4TH International Polychaete Conference (Angers, França)
1992	Life history, dynamics and production of Cyathura carinata (Krøyer) (Isopoda) in the Mondego estuary (Portugal)	6TH European Ecological Congress (Marseille, França)
1992	Crescimento e reprodução de Mesopodopsis slabberi (Van Beneden) (Crustacea: Mysidacea) no estuário do Mondego	2º Encontro de Planctonologistas Portugueses (Faro, Portugal)
1992	Lagostim vermelho da Louisiana, Procambarus clarkii (Girard), espécie exótica em Portugal: Bioecologia, impacto e controlo	3ª Conferência Nacional sobre a Qualidade do Ambiente (Aveiro, Portugal)
1992	Structure and seasonal variation of the macrofaunal subtidal communities in an estuary under severe human impact: The Mondego estuary (Portugal)	6TH European Ecological Congress (Marseille , França)
1991	Crustáceos Anfípodes (Gammaridea e Caprellidea) da plataforma continental do sudoeste de Portugal	Simpósio “A Plataforma Continental Portuguesa, evolução e processos condicionantes” (Lisboa, Portugal)
1991	Procambarus clarkii (Girard, 1852) (Crustacea, Decapoda), espécie exótica em Portugal: Situação actual e perspectivas	4º Congresso Sobre o Alentejo (Sines, Portugal)
1990	Life cycle, population dynamics, and production of Echinogammarus marinus (Leach) (Amphipoda) in the Mondego estuary (Portugal)	Epicontinental Seas Environment Colloquium (Lille , França)
1990	Estuário do Mondego: Uma abordagem interdisciplinar	Encontro Nacional de Estuários (Lisboa, Portugal)
1989	Crustáceos Anfípodes da Costa Portuguesa: Considerações Biogeográficas	Colóquio sobre a Conservação dos Recursos Vivos Marinhos (Lisboa, Portugal)
1988	Moluscos do estuário do Mondego (zona intertidal). Inventariação faunística e análise da repartição ecológica das espécies	Colóquio Luso - Espanhol sobre Bacias Hidrográficas e Recursos Zoológicos (Porto, Portugal)
1988	Crustáceos Peracarídeos do estuário do Mondego (zona intertidal). Inventariação faunística e análise da repartição ecológica das espécies	. Colóquio Luso - Espanhol sobre Bacias Hidrográficas e Recursos Zoológicos (Porto, Portugal)
1988	Estuário do Mondego (zona intertidal): Análise quantitativa da repartição espacial dos poliquetas. Inverno e Verão.	Colóquio Luso - Espanhol sobre Bacias Hidrográficas e Recursos Zoológicos (Porto , Portugal)
1984	Estudo bionómico dos povoamentos bentónicos do estuário do Mondego (Portugal). Resultados preliminares	4º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho (Lisboa, Portugal)
1982	Contribuição para o estudo dos povoamentos bentónicos (substrato móvel) da costa ocidental portuguesa	2º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho (Barcelona , Espanha)
1982	Contribuição para o estudo dos povoamentos bentónicos (substrato rochoso) da costa ocidental portuguesa. Zona intertidal	2º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho (Barcelona, Espanha)
1982	Crustáceos Decápodes do Estuário do Tejo: Biologia das populações de Carcinus maenas, Crangon crangon, Palaemon longirostris e Palaemon serratus	Workshop on estuarine processes: An application to the Tagus estuary (Lisboa, Portugal)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2010 - Atual	“Food webs in intertidal ecosystems. A stable isotope approach and trophic network analysis” Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2007 - Atual	Estudo da relevância em avaliação de qualidade ambiental de alterações induzidas por eventos climáticos extremos Orientador	Ecologia (Curso de aperfeiçoamento / especialização) Universidade de Coimbra, Portugal Universidade de Lisboa, Portugal
2004 - Atual	“Ecology of migrating and wintering Dunlins (Calidris alpina) using a south temperate estuary, the Mondego estuary (Portugal)” Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1996 - Atual	Parâmetros populacionais da fauna piscícola e uso do habitat por Salmo trutta L. num rio de montanha (rio Olo, parque natural do Alvão) Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2017/01/01 - 2022/04/04	Biological invasions, pollution, and climate warming in Artemia: ecological and evolutionary responses Orientador	Doutoramento em Bio-Ciências (Doutoramento)
2017/01/01 - 2020/06/01	Analysis and spatial mapping of marine coastal ecosystem services. Integrating biophysical and socioeconomic data at different spatial resolution scales. Orientador	Doutoramento em Bio-Ciências (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2016 - 2019	Impacts of climate change and anthropogenic contaminants on the blue carbon cycle and key marine organisms (BLUE-CHANGE) Coorientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal
2016 - 2018	Ecotoxicological and biochemical impacts of S-Metolachlor and Terbuthylazine in scrobicularia plana Coorientador	Biologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2016 - 2018	Economic potential of marine bivalves of the Portuguese coast: ecological and biochemical characterization Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2015 - 2018	Microplastics contamination and speciation in the Mondego estuary sediments and foodweb Coorientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal
2014 - 2018	Application of biological traits-based approaches in assessing Good Environmental Status in the the scope of the European MSD. Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal
2013 - 2018	Coastal zone integrated management, from theory to practice. Avencas Beach, Cascais Orientador	Biociências - Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2012 - 2018	Evaluation of the Ecological Impact of Contaminants Coorientador	Biologia (Doutoramento) Universidade de Aveiro, Portugal
2012 - 2018	Estudo da influência das pressões naturais e antropogénicas na qualidade dos recursos alimentares em cadeias tróficas estuarinas Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal
2011 - 2018	Impacto de invasões e mudança climática sobre o funcionamento de ecossistemas costeiros Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) Universidade de Coimbra, Portugal
2015 - 2017	Spatial Representation of Biodiversity and Ecosystem Services by Protected Areas in Amazonia Orientador	International Master in Applied Ecology (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2014 - 2017	Exergia como indicador de condição ambiental em bacias hidrográficas na savana neotropical Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade Federal de Minas Gerais, Brasil
2013 - 2017	Remote sensing of oceanic fronts off central Portugal (2003 – 2014). An integrated environmental approach. Coorientador	Ciências do Ambiente (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2013 - 2017	A trait-based approach to investigate macrobenthic community functioning in estuarine and coastal ecosystems Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2013 - 2017	Functions and services of estuaries related to ecosystems’ stability: A comparative case study in the Mondego and Mira estuaries, Portugal Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal
2012 - 2017	Development of tools for the ecological quality status assessment of rocky shore benthic macroinvertebrate communities Orientador	Biociências - Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2014 - 2016	A spatially oriented ecosystem-based model to evaluate ecosystem impacts of fisheries Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2013 - 2016	Climate Change Impacts on Salt Marsh Vegetation Ecophysiology and Dynamics Coorientador	Ecologia Marinha (Doutoramento) MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal
2012 - 2016	“Resilience to land use induced impacts Orientador	Biociências - Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2011 - 2016	Análise custo/benefício da inclusão complementar de linhas de evidência ecotoxicológicas na classificação de estado ecológico de ambientes estuarinos no âmbito da Directiva Quadro da Água Europeia Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) MARE - Marine and Environmental Sciences Centre, Portugal
2012 - 2015	Use of benthic meiofauna in evaluating marine ecosystems’ health: How useful can free-living marine Nematodes be for Ecological Quality Status (EQS) assessment in transitional waters? Orientador	Biociências - Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2011 - 2014	Carbon budget in a temperate estuary salt marsh and the influence of temperature increase in the carbon sequestration Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2011 - 2014	Ecological status and functioning evaluation of sandy beach ecosystems: A macrobenthic community-based approach. (ESSAY) Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2011 - 2013	Intertidal meiofauna communities along the south atm of Mondego estuary: Spatial and temporal variability in relation to Environmental parameters Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011 - 2013	Development and application of ecological indicators for implementing the European Water Framework Directive. Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal
2010 - 2013	The role of individual foraging specialization in the trophic relationships between seabirds and the marine environment Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2013	Abundance, structure, and distributional patterns of core secondary producers in a temperate estuary: Driving factors and climate change scenario simulations Coorientador	Ciências do Mar (Doutoramento) Universidade do Porto, Portugal
2007 - 2013	Estudo da relevância em avaliação de qualidade ambiental de alterações induzidas por eventos climáticos extremos Orientador
2011 - 2012	Efeitos da nutrição de praias na comunidade macrofaunal de uma praia arenosa da costa ocidental Portuguesa Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2009 - 2012	Long term ecological response of subtidal macrobenthic communities to natural and human induced changes in a temperate ne atlantic estuary. Implications for management and restoration Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2009 - 2012	Assessment of ecosystem’s servives and goods in the Mondego river estuary and catchment area Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2008 - 2012	Padrões biogeográficos em comunidades de macroinvertebrados estuarinos: Influência de diferentes escalas espaciais na avaliação do estado ecológico Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização)
2011 - 2011	“The functional composition of the benthic invertebrate community of the Mondego estuary: insights within the functioning of this ecosystem” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011 - 2011	“Population dynamics and productivity of Echinogammarus marinus (Leach) in the Mondego estuary throughout three decades” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011 - 2011	“Spatial and temporal variation of Corbicula flumínea (Müller, 1774) in the Mondego estuary" Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2011	“The rocky shore macrozoobenthic communities of Buarcos Bay” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2008 - 2011	Aplicação da abordagem DPSIR ao estuário do Mondego eelaboração de recomendações para a gestão sustentável do sistema. Orientador	Pós-Doutoramento (Curso de aperfeiçoamento / especialização) IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal
2010 - 2010	Variação temporal da comunidade macrobentónica subtidal do sector polihalino do braço Sul do do estuário do Mondego. Contributo para a avaliação do estado ecológico Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	“Population dynamics of Corbicula flumínea (Muller, 1774) in the mesohaline and oligohaline areas of the Mondego estuary: spatial intrusion and ecological response" Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	“Influence of hydrodynamics and sediment grain sise in environmental quality of estuarine polyhaline sector” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	“Spatial and temporal variability of benthic producers and consumers ¿ 13 C and ¿15 N signatures in the Mondego estuary food web" Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	“Spatial and temporal heterogeneity of macrofauna assemblages in the polyhaline sector of a mesotidal estuary” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	Modelos de dinâmica populacional de Echinogammarus marinus do estuário do Mondego: Calibrações para 3 populações diferentes e análise de cenários referentes a alterações climáticas e flutuações de sex-ration Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	“Do macrofauna assemblages reflect Zostera noltii meadows temporal dynamics associated with natural and anthropogenic disturbances?” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010 - 2010	“Impact assessment of multiple stressors on the Mondego estuary: A multidimensional approach on the Bilvalve Scrobicularia plana” Coorientador
2010 - 2010	“Benthic macroinvertebrates as ecological indicators for estuarine and coastal ecosystems. Assessment and intercalibration” Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2009 - 2009	Avaliação do Estado de Qualidade Ecológica em ecossistemas estuarinos: Qual a influência da malha dos crivos utilizados na amostragem de macroinvertebrados bentónicos ? Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2009 - 2009	“The Mondego estuary mesohaline and oligohaline macrozoobenthic communities. A contribution for their Ecological Quality Status Assessment” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2007 - 2007	“A tentative harmonisation of the OSPAR Convention and the European Water Framework Directive ecological criteria for transitional waters quality assessment. Mondego estuary case study” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2007 - 2007	“Application of multimetric índices and their performance in assessing ecological condition. The Mondego estuary case study” Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2007 - 2007	“Macrofaunal key Crustaceans in Atlantic and Mediterranean exposed sandy beaches. Does knowledge on key species bio-ecology have a role in assessing global changes?”. Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2005 - 2005	“How well do ecological indicators assess environmental status?” Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2004 - 2004	Estudo comparativo da mortalidade induzida pela faca de mariscar e draga de mão na comunidade macrobentónica associada aos bancos de pesca de berbigão (Cerastoderma edule, L. 1758) Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2004 - 2004	Ecologia do regime alimentar e interacções tróficas das principais espécies de peixes do baixo estuário do rio Guadiana e do sapal de Castro Marim e Vila Real de Santo António Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2004 - 2004	“Dynamics of Meiofauna in the Zostera noltii community in the Mira estuary (South-Western Coast of Portugal)” Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2004 - 2004	Ecologia dos Peracarídeos (Crustácea) bentónicos da zona entre marés da Ria Formosa Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2004 - 2004	Predação humana no litoral rochoso Alentejano: Caracterização, impacte ecológico e conservação Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2004 - 2004	Definição de condições de referência para diferentes tipos de águas de transição e costeiras de Portugal: Utilização das comunidades bentónicas de dez sistemas estuarinos da costa Portuguesa no processo de delimitação geral dos sistemas costeiros Portugueses Orientador
2002 - 2004	Caracterização do Pelagos do braço sul do estuário do Mondego Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Aplicação da CUFES (Continuous Underway Fish Egg Sampler) na avaliação de ovos e lervas de Sardina pilchardus (Walbaum, 1792) e outros pelágicos Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Biologia, dinâmica populacional e produção de Talitrus saltator (Crustacea: Amphipoda) numa praia arenosa da costa ocidental Portuguesa Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Padrões espaciais na estrutura da comunidade de Peixes costeiros dos Açores Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Aplicação da Ascendência como indicador ecológico. Um caso estudado Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Resposta ecofisiológica de Echinogammarus marinus (Amphipoda, Gammaridae) a variações ambientais. Desenvolvimento de um modelo ecológico de dinâmica populacional Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Estudo dos perfis de azoto (amónia e nitrato) e de fósforo (fostato) em sedimentos arenoso e lodoso no estuário do Mondego Orientador
2001 - 2001	Ecologia alimentar e relações tróficas de nove espécies de peixes demersais dos Açores Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2001 - 2001	“The effect of salt marshes plants on the nutrient dynamics in the Mondego estuary (Portugal)” Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2001 - 2001	Desenvolvimento de um modelo numérico da produtividade de macroalgas estuarinas sob os efeitos da descarga excessiva de nutrientes, maioritariamente provenientes de fontes antropogénicas. Preparação de um instrumento com uma razoável capacidade de previsão da produtividade de macroalgas à escala do sistema, partindo do conhecimento efectivo dos factores e processos que condicionam o desenvolviment Orientador
2001 - 2001	Avaliação da qualidade das salinas como áreas importantes para a conservação das aves limícolas (ordem Charadrii): Estudo piloto com o Pilrito-de-Peito-Preto Calidris alpina. Orientador
1999 - 2001	Estudo de processos fotossintéticos em populações de macrófitas e respectivas epífitas em ambientes estuarinos e dulçaquícolas. Avaliação da influência de factores fisico-químicos ambientais na eficiência dos processos produtivos, com vista à calibração de modelos de crescimento de macrófitas e de competição macrófitas vs. Macroalgas Orientador
2000 - 2000	Variação espacial e temporal dos moluscos do substrato rochoso da ilha da Berlenga Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000 - 2000	Sistema Integrado de Ecotecnologia – Complexo – Industrial. Tratamento e reutilização das águas residuais Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000 - 2000	Aspectos da reprodução de savelha, Alosa fallax fallax (Lacépède, 1803) nos rios Mira e Guadiana Coorientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000 - 2000	“Green macroalgae and seagrasses in a shallow eutrophic estuary (the Mondego estuary, Portugal): Dynamics, controlling factors and possible evolutionary scenarios” Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	Impacte da macroepifauna sobre as macroalgas Ulvales (Chlorophyta) na Ria Formosa Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	Utilização de conteúdos nucleares de ADN na estimativa de Exergia a partir da biomassa de organismos Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	Factores que influenciam a abundância e a condição nutricional das larvas de peixes nos rios Mira e Guadiana Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	Impacto das aves limícolas sobre os macroinvertebrados nas áreas intertidais do estuário do Mondego (Portugal) Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	Impacto da eutrofização nas comunidades bentónicas do Braço Sul do estuário do Mondego (Portugal) Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	Ecologia pelágica do Braço Sul do estuário do rio Mondego Coorientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	“Quantitative assessment of the environmental impact of an ecotechnological alternative to control crayfish in rice fields” Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1998 - 1998	“Effect of habitat loss on waders (Aves, Charadrii) in the Mondego estuary (Portugal)” Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1998 - 1998	“Ecological engineering of crayfish and rice production: Data and sub-models for CRISP (Crayfish and Rice Integrated System of Production” Orientador	Ecologia (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1998 - 1998	Wetland Ecology and Technology (FMRX-CT96-0051) Orientador	Ecologia (Curso de aperfeiçoamento / especialização) University of Odense, Dinamarca IMAR- Centro do Mar e do Ambiente , Portugal
1995 - 1998	Variação espacial e temporal das populações de Poliquetas no estuário do Mondego. Dinâmica e produção de Amage adspersa (Grube, 1863) Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1997 - 1997	Estrutura populacional, dinâmica e produção de Hydrobia ulvae (Pennant) (Mollusca: Prosobranchia) ao longo de um gradiente de eutrofização no estuário do Mondego (Portugal) Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1996 - 1996	Lagostim vermelho dos pântanos (Procambarus clarkii, Girard): Ecologia e impacto trófico Orientador	Ecologia (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1994 - 1996	Bioacumulação de metais pesados em Procambarus clarkii, lagostim vermelho da Louisiana: Implicações para a sua utilização como recurso alimentar Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995 - 1995	Estrutura trófica da comunidade macrobentónica dos povoamentos de Zostera noltii Hornem. e Zostera marina L. do estuário do rio Mira (Portugal) Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995 - 1995	Modelling the effects of green macroalgae blooms on the population dynamics of Cyathura carinata (Crustacea: Isopoda) in the Mondego estuary (Portugal) Coorientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995 - 1995	Impacto da eutrofização da distribuição e eficiência alimentar das aves limícolas no estuário do Mondego (Portugal). Estudo preliminar Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995 - 1995	Influência de alguns factores abióticos na estrutura das comunidades bentónicas subtidais no estuário do Mondego (Portugal) Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995 - 1995	Variação sazonal da composição bioquímica e conteúdo energético do lagostim vermelho da Louisiana, Procambarus clarkii (Girard), na região do Baixo Mondego (Portugal) Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1993 - 1993	Ciclo biológico e produção do lagostim vermelho da Louisiana (Procambarus clarkii, Girard) na região do Baixo Mondego Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1993 - 1993	Variação temporal nos padrões de ocorrência e tácticas de alimentação de aves limícolas no estuário do Mondego (Portugal). Sua relação com as alterações na disponibilidade de presas Orientador	Ecologia Animal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1993 - 1993	Impacte da exploração comercial na estrutura, dinâmica e produção da população de Marphysa sanguinea (Annelida: Polychaeta) no estuário do Sado Orientador	Biologia (Outra) Universidade de Évora, Portugal
1992 - 1992	ANAMOD - Extracção dos componentes modais de distribuições de frequências de variáveis biométricas Orientador	Biologia (Outra) Universidade de Coimbra, Portugal
1991 - 1991	Procambarus clarkii (Girard, 1852) (Decapoda, Cambaridae) espécie exótica em Portugal: Considerações sobre a bioecologia e aspectos da sua biologia populacional na barragem de Monte Novo (Alentejo, Portugal) Orientador	Biologia (Outra) Universidade de Évora, Portugal

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2010 - 2010	Simpósio ECSA 47 - Integrative tools and methods in assessing ecological quality in estuarine and coastal systems worldwide Simpósio (Presidente da Comissão Organizadora)
2007 - 2007	Simpósio 16: Integrative tools and methods in assessing ecological integrity in estuarine and coastal systems Simpósio (Coorganizador)
2001 - 2001	ECSA 2001 – Estuários e zona costeira do norte de Portugal: Ponto da situação Simpósio (Outra)	Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar (F.C.U.P.), Portugal
1998 - 1998	Fronteiras da Ciência Conferência (Outra)	Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra (FCTUC), Portugal
1998 - 1998	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho Simpósio (Presidente da Comissão Organizadora)

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2011 - 2011	“O conceito de Serviços dos Ecossistemas na gestão de recursos marinhos” Outro	Debate sobre a Economia do Mar
2011 - 2011	“New classes of ecological indicators for environmental quality assessment” Conferência
2011 - 2011	“Biodiversity, Resilience and Sustainability in marine ecosystems management” Oficina (workshop)	“Workshop” sobre Gestão de Bacias Hidrográficas"
2011 - 2011	“New classes of ecological indicators for environmental quality assessment” Conferência
2011 - 2011	“Sustentabilidade ecológica e utilização de recursos marinhos” Encontro	Encontro Mar Português
2011 - 2011	“Biodiversity, Resilience and sustainable management of coastal and estuarine ecosystems” Outro	VII Jornadas Nacionales y V Internacionales Sobre Naturaleza y Medio Ambiente
2010 - 2010	Simpósio ECSA 47 - Integrative tools and methods in assessing ecological quality in estuarine and coastal systems worldwide Simpósio	Simpósio ECSA 47 - Integrative tools and methods in assessing ecological quality in estuarine and coastal systems worldwide pelo IMAR – Instituto do Mar, Centro do Mar e Ambiente, Universidade de Coimbra, e pelo Centro de Oceanografia da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
2010 - 2010	The City and the Sea – Aquatic landscapes Conferência
2010 - 2010	“Ecological research on the Mondego estuary and the Portuguese L-TER Programme” Conferência	University of Vigo e ECIMAT, Espanha
2009 - 2009	XV Simpósio Ibérico de Biologia Marinha Simpósio	XV Simpósio Ibérico de Biologia Marinha Museu Municipal de Funchal, Portugal
2006 - 2006	“Long term development of benthic communities under human impact induced stress. A case study. Applying the ecosystem’s perspective in Ecology” Congresso	AZTI – Tecnalia, Espanha
2006 - 2006	Research in aquatic sciences at the University of Coimbra Conferência
2006 - 2006	Investigação em Ciências Aquáticas na Universidade de Coimbra Outro	Semana Cultural da Universidade de Coimbra
2006 - 2006	Avaliação de Qualidade Ambiental: Águas costeiras e de transição Outro	Semana Cultural da Universidade de Coimbra
2005 - 2005	The Mediterranean coastal areas from watershed to the sea: interactions and changes Conferência	International Conference The Mediterranean coastal areas from watershed to the sea: interactions and changes Universidade de Florença, Itália, em colaboração com a Comissão Europeia, Itália
2005 - 2005	II Congresso Nacional da Ordem dos Biólogos: A Biologia do Futuro Congresso	II Congresso Nacional da Ordem dos Biólogos: A Biologia do Futuro Seminário de Vilar, Portugal
2005 - 2005	Building Portugal – United States ocean science relations Oficina (workshop)	Workshop Building Portugal – United States ocean science relations Fundação Luso-Americana, Portugal
2005 - 2005	Coastal oceans and estuarine research priorities Oficina (workshop)	Workshop Building Portugal – United States ocean science relations Fundação Luso-Americana, Portugal
2005 - 2005	O papel da investigação marinha e ambiental no desenvolvimento dos pequenos países insulares Conferência	Instituto Nacional de Desenvolvimento das Pescas (INDP), Cabo Verde
2005 - 2005	O papel da investigação científica na implementação e desenvolvimento da Universidade de Cabo Verde Conferência	Instituto Superior de Educação (ISE), Cabo Verde
2005 - 2005	Na integrated view on the Mediterranean coastal, transitional, and inland aquatic systems as a resource for the future Conferência	International Conference The Mediterranean coastal areas from watershed to the sea: interactions and changes
2004 - 2004	Encontro de Biólogos da Comunidade de Países de Língua Portuguesa Encontro	Encontro de Biólogos da Comunidade de Países de Língua Portuguesa
2004 - 2004	Long term development of benthic communities under human impact induced stress Simpósio	Interdisciplinary Symposium on Wetlands
2004 - 2004	Long term development of benthic communities under human impact induced stress Conferência	X Taller de la Cátedra del Médio Ambiente
2004 - 2004	Using Exergy in understandig ecosysrtems. MAST experience and later Simpósio	18. Mini-Symposium “A tribute to Sven Erik Jørgensen”
2004 - 2004	Visão geral da investigação científica na Universidade de Coimbra Conferência	Conferência “Investigação, Cultura, Produção e Divulgação do Conhecimento Científico”
2004 - 2004	Ambiente e recursos naturais: O mar e os oceanos Encontro	I Encontro de Biólogos da Comunidade de Países de Língua Portuguesa
2004 - 2004	Long term development of benthic communities under human impact induced stress Conferência	E.C.O.L.E. de la Mer
2004 - 2004	IMAR – Institute of Marine Research, Coimbra Interdisciplinary Centre: Organisation, activities, research team, scientific production, and funding Conferência	22. E.C.O.L.E. de la Mer
2004 - 2004	Ecological indicators behaviour along a recovery experiment and theoretical considerations Conferência	E.C.O.L.E. de la Mer
2003 - 2003	XI International Colloquium on Amphipoda Outro	XI International Colloquium on Amphipoda Universidade de Tunis, Tunísia
2003 - 2003	Past, present and future role of PNPs in science, development, and diffusion. A view to the Portuguese case Congresso	First World Environmental Education Congress
2003 - 2003	Interpretação do impacto da eutrofização e da gestão fluvial à luz de algumas teorias dos ecossistemas Seminário	Ciclo de Seminários Inovação IPN/FCTUC, Ambiente, Energia e Desenvolvimento Sustentável. Seminário 11: Indústria e Impacto Ambiental
2003 - 2003	Interpretation of long term data within a framework of ecosystem theories. A case study on benthic communities Simpósio	II Symposium “Island Ecosystems – A Conservation and Molecular Approach
2003 - 2003	Interpretation of long term data within a framework of ecosystem theories. Further exploitation of data from the EU Project MUST (MAS2-CT92-0036) Outro	Reunião Anual do Instituto do Mar de 2003
2002 - 2002	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho Simpósio	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho Universidade de Sevilha e pelo “Gibraltar Museum”, Espanha
2002 - 2002	Biological effects and health in estuarine animal communities Oficina (workshop)	Workshop Recent development in estuarine and coastal science and management Reserva Natural do Estuário do Tejo e patrocinado por “The British Council”, Portugal
2002 - 2002	Stress induced changes in estuarine benthic communities. Interpreting the impact of eutrophication and river management within a framework of ecosystem theories Simpósio	XII Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho
2001 - 2001	What Future? An integrated approach to the ecology and evolution of beahes and sand dunes Oficina (workshop)	International Workshop Beaches – What Future? An integrated approach to the ecology and evolution of beahes and sand dunes Universidade de Florença, Itália, em colaboração com a Comissão Europeia, Itália
2001 - 2001	I Symposium “Island Ecosystems – A Conservation and Molecular Approach” Simpósio	I Symposium “Island Ecosystems – A Conservation and Molecular Approach”
2001 - 2001	Conferência Ibérica sobre protecção ambiental Conferência	Conferência Ibérica sobre protecção ambiental Instituto Piaget, Portugal
2001 - 2001	Plankton Symposium Simpósio	Plankton Symposium IMAR – Instituto do Mar, Portugal
2001 - 2001	Diversity, Biodiversity, Conservation and Sustainability Simpósio	I Symposium “Island Ecosystems – A Conservation and Molecular Approach
2001 - 2001	Stress induced changes in the Mondego benthic communities. The impact of eutrophication and river management interpreted within the framework of ecosystem theories Conferência	ECSA 2001 – Estuários e zona costeira do norte de Portugal: Ponto da situação
2001 - 2001	Impacto da eutrofização e gestão de caudais num sistema estuarino. Um caso estudado de alteração das comunidades bentónicas por pressão ambiental Congresso	Conferência Ibérica sobre protecção ambiental Instituto Piaget, Portugal
2000 - 2000	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho Simpósio	XI Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho
2000 - 2000	ASLO Aquatic Sciences Meeting – Research across boundaries Encontro	ASLO Aquatic Sciences Meeting – Research across boundaries organisado pela American Society of Limnology and Oceanography (ASLO), Dinamarca
2000 - 2000	EcoSummit 2000 – Integrating the Sciences Outro	EcoSummit 2000 – Integrating the Sciences
2000 - 2000	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium Outro	ECSA 31 – Managing eutrophication in estuaries and coastal waters: a challenge for the millennium
2000 - 2000	Ecological indicators Oficina (workshop)	Workshop on Ecosystem Theory: Application to environmental management of aquatic ecosystems
1999 - 1999	International Conference on Sustainable Management of Coastal Ecosystems Conferência	International Conference on Sustainable Management of Coastal Ecosystems Universidade Fernando Pessoa, Portugal
1999 - 1999	Diversidade e Biodiversidade: Qual poderá ser o seu significado em termos de desenvolvimento sustentável? Outro	Ciclo de Colóquios Universidade Aberta, Portugal
1998 - 1998	Oceans Ecology, Governance and Global Change Oficina (workshop)	Workshop Oceans Ecology, Governance and Global Change FLAD – Fundação Luso Americana para o Desenvolvimento, Portugal
1998 - 1998	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho Simpósio	X Simpósio Ibérico de Estudos de Bentos Marinho IMAR – Instituto do Mar, Portugal
1998 - 1998	1st Interdisciplinary Symposium on Estuarine Processes Simpósio	1st Interdisciplinary Symposium on Estuarine Processes Universidade do Algarve, Portugal
1998 - 1998	49 th Annual Meeting of the American Institute of Biological Sciences Encontro	49 th Annual Meeting of the American Institute of Biological Sciences ISEM Society, Estados Unidos
1997 - 1997	Seminário Mudança Global Seminário	Seminário Mudança Global “International Council of Scientific Unions” (ICSU) no âmbito do “IGBP - Global Change”, Portugal
1997 - 1997	2º Encontro Nacional de Ecologia Encontro	2º Encontro Nacional de Ecologia Sociedade Portuguesa de Ecologia (SPECO), Portugal
1996 - 1996	Unifying Goal Functions Oficina (workshop)	Workshop: Unifying Goal Functions
1996 - 1996	Commemorative Symposium Centennial of Portuguese Oceanography Simpósio	Commemorative Symposium Centennial of Portuguese Oceanography
1996 - 1996	IX Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho Simpósio	IX Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho
1996 - 1996	1º Encontro Nacional de Ecologia Encontro	1º Encontro Nacional de Ecologia Sociedade Portuguesa de Ecologia (SPECO), Portugal
1996 - 1996	Ecological Summit 96 Congresso	Ecological Summit 96 International Society of Ecological Modelling (ISEM) e pela Elsevier, Dinamarca
1996 - 1996	Quantification and usage of exergy as holistic ecological indicator of ecosystems integrity. A case study Oficina (workshop)	Workshop “Unifying Goal Functions”
1996 - 1996	Desenvolvimento de modelos ecológicos: Breve resumo histórico e perspectivas actuais Encontro	1º Encontro Nacional de Ecologia
1995 - 1995	ECOTECHNICS 95 - International Symposium on Ecological Engineering Simpósio	ECOTECHNICS 95 - International Symposium on Ecological Engineering
1995 - 1995	4th International Conference on Aquatic Ecosystem Health: Integrated / Multitrophic Strategies - Microbes to Fish Conferência	4th International Conference on Aquatic Ecosystem Health: Integrated / Multitrophic Strategies - Microbes to Fish
1995 - 1995	The 9th International Conference on the State of the Art of Ecological Modelling (ISEM’95) Conferência	The 9th International Conference on the State of the Art of Ecological Modelling (ISEM’95)
1995 - 1995	Recent development of marine sciences at Coimbra University. Present and future role of the IMAR network Simpósio	Commemorative Symposium Centennial of Portuguese Oceanography
1994 - 1994	MM-ARS, Materials Management and Regional Sustainability Oficina (workshop)	MM-ARS, Materials Management and Regional Sustainability
1994 - 1994	Séminaire Franco - Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime Seminário	Séminaire Franco - Portugais de Modélisation en Hydraulique Maritime
1994 - 1994	ECSA 24 Symposium, Northern and southern estuaries and coastal areas Simpósio	ECSA 24 Symposium, Northern and southern estuaries and coastal areas
1993 - 1993	Workshop on Coastal Oceans Oficina (workshop)	Workshop on Coastal Oceans JNICT/FLAD/USNSF, Portugal
1993 - 1993	Biodiversity and Ecosystem Function in a European Perspective Oficina (workshop)	Workshop: Biodiversity and Ecosystem Function in a European Perspective Universidade de Londres, Wye College, Kent, United Kingdom, Reino Unido
1993 - 1993	Ecosystem Theory Oficina (workshop)	Post-graduate Workshop / Course on Ecosystem Theory Kobenhavns Universitet School of Pharmaceutical Sciences, Dinamarca
1993 - 1993	MAST days and EUROMAR market Outro	MAST days and EUROMAR market Commission of the European Communities, DG XII, MAST programme, Bélgica
1993 - 1993	International Congress on Modelling and Simulation Congresso	International Congress on Modelling and Simulation
1993 - 1993	Eutrophication in portuguese estuaries: A proposal for modelling approach Oficina (workshop)	Workshop on Coastal Oceans JNICT/FLAD/USNSF, Portugal
1992 - 1992	3ª Conferência Nacional Sobre a Qualidade do Ambiente Conferência	3ª Conferência Nacional Sobre a Qualidade do Ambiente Universidade de Aveiro, Portugal
1992 - 1992	Proteccção do Ambiente Marítimo Conferência	Seminário sobre Proteccção do Ambiente Marítimo Fundação Luso Americana para o Desenvolvimento, Portugal
1992 - 1992	Reunião Aquacultura da Comissão Arco Atlântico Outro	Reunião Aquacultura da Comissão Arco Atlântico
1992 - 1992	6TH European Ecological Congress Congresso	6TH European Ecological Congress
1992 - 1992	International Conference on the State of the Art in Ecological Modelling and Ecological Engineering Conferência	International Conference on the State of the Art in Ecological Modelling and Ecological Engineering
1991 - 1991	Biogeochemical processes in estuaries Outro	Intensive Course: Biogeochemical processes in estuaries European Institute for Advanced Studies in Oceanography (EIASO) e European Association for Science and Technology (EAST), Bélgica
1991 - 1991	4º Congresso sobre o Alentejo Congresso	4º Congresso sobre o Alentejo Câmara Municipal de Sines, Portugal
1990 - 1990	Modelling of marine ecosystems Outro	Intensive Course: Modelling of marine ecosystems European Institute for Advanced Studies in Oceanography (EIASO) e European Association for Science and Technology (EAST), França
1990 - 1990	Epicontinental Seas Environment Colloquium Outro	Epicontinental Seas Environment Colloquium IFREMER / Région Nord-Pas de Calais, França
1990 - 1990	Encontro Nacional de Estuários Encontro	Encontro Nacional de Estuários Faculdade de Ciências de Lisboa, Portugal
1990 - 1990	A Plataforma Continental Portuguesa, evolução e processos condicionantes Simpósio	Simpósio A Plataforma Continental Portuguesa, evolução e processos condicionantes JNICT - MAR, Portugal
1989 - 1989	Seminário sobre a situação actual e perspectivas no desenvolvimento da Aquacultura em Portugal Seminário	Seminário sobre a situação actual e perspectivas no desenvolvimento da Aquacultura em Portugal Universidade de Algarve, Portugal
1989 - 1989	Colóquio sobre a Conservação dos Recursos Vivos Marinhos Outro	Colóquio sobre a Conservação dos Recursos Vivos Marinhos INIP / Liga para a Protecção da Natureza, Portugal
1988 - 1988	Sandy beaches ecology: Community structure and population dynamics Seminário	Sandy beaches ecology: Community structure and population dynamics Centro de Sistemática e Ecologia da Universidade de Coimbra, Portugal
1988 - 1988	Ecologia bêntica marinha: Macrobenthos e Meiobenthos Outro	Ecologia bêntica marinha: Macrobenthos e Meiobenthos Serviços Nacionais de Parques e Reservas e Conservação da Natureza (SNPRCN), Portugal
1988 - 1988	Colóquio Luso - Espanhol sobre Bacias Hidrográficas. e Recursos Zoológicos Outro	- Colóquio Luso - Espanhol sobre Bacias Hidrográficas. e Recursos Zoológicos
1987 - 1987	Seminário sobre Software Estatístico Seminário	Seminário sobre Software Estatístico Associação Portuguesa de Informática (API), Portugal
1985 - 1985	VIth International Colloquium on Amphipod Crustaceans Outro	VIth International Colloquium on Amphipod Crustaceans Universidade de Amsterdam, França
1985 - 1985	Seminar on Scientific and Technical Co-Operation in Oceanology in Europe Seminário	Seminar on Scientific and Technical Co-Operation in Oceanology in Europe Conselho da Europa, Portugal
1984 - 1984	4º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho Simpósio	4º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho
1983 - 1983	Colóquio para a protecção das zonas ribeirinhas (litoral marítimo, margens fluviais e lacustres Outro	Colóquio para a protecção das zonas ribeirinhas (litoral marítimo, margens fluviais e lacustres Liga para a Protecção da Natureza, Portugal
1982 - 1982	Workshop on estuarine processes: An application to the Tagus estuary Oficina (workshop)	Workshop on estuarine processes CNA/UNESCO, Portugal
1981 - 1981	2º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho Simpósio	2º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho
1979 - 1979	1º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho Simpósio	1º Simpósio Ibérico de Estudos de Benthos Marinho

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2022/02/01	Provas de Agregação de Isabel Maria Trigueiros de Sousa Pinto Machado Arguente principal	Isabel Maria Trigueiros de Sousa Pinto Machado (Agregação) Universidade do Porto, Portugal
2021/11/23	Provas de Agregação de Sérgio Miguel Franco Martins Leandro Arguente principal	Sérgio Miguel Franco Martins Leandro (Agregação) Universidade de Aveiro, Portugal
2021/02/19	Provas de Agregação de António Miguel Piecho de Almeida Santos Vogal	António Miguel Piecho de Almeida Santos (Agregação) Universidade do Algarve, Portugal
2020/10/14	Provas de Agregação de Maria Cristina Amaral Pena Nabais dos Santos Vogal	Maria Cristina Amaral Pena Nabais dos Santos (Agregação) Universidade de Coimbra, Portugal
2020/10/13	Discussão do Curriculum Vitae. Arguente	Maria Cristina Amaral Pena Nabais dos Santos (Agregação) Universidade de Coimbra, Portugal
2020/09/11	Provas de Agregação de José Pedro Granadeiro Arguente principal	José Pedro Granadeiro (Agregação) Universidade de Lisboa, Portugal
2020/09/10	Discussão da Lição “Ecologia Espacial e conservação de aves marinhas oceânicas”. Arguente	José Pedro Granadeiro (Agregação) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020/05/29	Provas de Agregaçaão de Miguel Alberto Fernandes Machado e Santos Arguente principal	Miguel Alberto Fernandes Machado e Santos (Agregação) Universidade do Porto, Portugal
2020/05/28	Discussão da lição “Efeitos dos disruptores endócrinos no meio ambiente”. Arguente	Miguel Alberto Fernandes Machado (Agregação) Universidade do Porto, Portugal
2020/05/15	Provas de Agregação de Leonel Carlos dos Reis Tomás Pereira Vogal	Leonel Carlos dos Reis Tomás Pereira (Agregação) Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra (FCTUC), Portugal
2020/05/14	Discussão do Curriculum Vitae. Arguente	Leonel Carlos dos Reis Tomás Pereira (Agregação) Universidade de Coimbra, Portugal
2020/05/05	Provas de Agregação de Maria Paula de Oliveira Sobral. Arguente principal	Maria Paula de Oliveira Sobral (Agregação) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2020/05/04	Discussão da Lição “Lixo Marinho: Plásticos e microplásticos”. Arguente	Maria Paula de Oliveira Sobral (Agregação) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2020/04/30	Discussão do Curriculum Vitae. Arguente	Paulo Gama Mota (Agregação) Universidade de Coimbra, Portugal
2020/04/30	Provas de Agregação de Paulo Gama Mota	Paulo Gama Mota (Agregação)
2020/02/28	Global patterns of marine biodiversity and the potential impact of climate change”. Arguente principal	Joana Sousa e Silva Boavida Portugal (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2020/02/28	Global patterns of marine biodiversity and the potential impact of climate change Arguente	Joana Sousa e Silva Boavida-Portugal (Doutoramento)
2019/01/07	Discussão do Curriculum Vitae Vogal	Rui Correia de Oliveira Beja (Agregação)
2018/06/13	Discussão do Curriculum Vitae e do Relatório da Disciplina Vogal	Miguel José Batista Gastar (Agregação) Universidade do Algarve, Portugal
2018/05/07	Discussão do Curriculum Vitae Vogal	Pedro Miguel Raposo Almeida (Agregação) Universidade de Évora, Portugal
2017/10/31	Biodiversity and evolution of the coastal peracaridean fauna of Macaronesia and Northeast Atlantic Arguente	Pedro Emanuel Ferreira dos Reis Vieira (Doutoramento) Universidade de Aveiro, Portugal
2017/01/23	Discussão do Curriculum Vitae Arguente	Cristina Branquinho (Agregação) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016/10/24	Discussão da Lição de Síntese: História da Biologia Marinha Arguente	Gonçalo Jorge Pestana Calado (Agregação) Universidade do Porto, Portugal
2016/07/15	A spatially oriented ecosystem-based model to evaluate ecosystem impacts of fisheries Orientador	Joana Carolina Raposo de Brito (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2016/06/16	Climate change impacts on salt marsh vegetation ecophysiology and dynamics Orientador	Bernardo Afonso de Aranha Alhandra Duarte (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015/06/11	Discussão do Programa da disciplina: Ecossistemas Marinhos Arguente	Maria Alexandra Anica Teodósio (Agregação) Universidade do Algarve, Portugal
2015/05/14	Effectiveness of resilience assessment tools in different case studies Arguente	Noémie Wouters (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015/02/18	Metal cycling in salt marshes and intertidal mudflats: Influence of plants, invertebrates, and fishes. Arguente	Sílvia Susana Ferreira Pedro (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2014/10/02	Biology and ecology of the White prawn Palaemon longirostris H. Milne Edwards, 1837 (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae) in the Mira River, Portugal Arguente principal	Maria Alexandra Sousa Dias Cartaxana (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2014/09/11	Development and application of a process-oriented model for benthic marine systems Arguente	Isabella Ascione (Doutoramento) Instituto Superior Técnico, Universidade Técnica de Lisboa, Portugal, Portugal
2014/06/30	Discussão da Lição de Síntese: Ocean Acidification Arguente	Alice Newton (Agregação) Universidade do Algarve, Portugal
2014/01/14	Environmental conditions and biotic communities in Foz de Almargem and Salgados coastal lagoons, Algarve (South Portugal) Arguente	Susana Isabel Eusébio Coelho (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
2013/11/25	Abundance, structure, and distributional patterns of core secondary producers in a temperate estuary: Driving factors and climate change scenario simulations Arguente principal	Alan Tainá de Souza (Doutoramento)
2013/09/20	Intertidal meiofauna communities along the south arm of Mondego estuary: Spatial and temporal variability in relation to environmental parameters. Orientador	Conceição Alexandra Costa Caetano (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2013/07/25	Marine fish assemblages as indicators of anthropogenic pressures: Identifying sensitive metrics Arguente	Sofia Nunes Henriques Margarido Pires (Doutoramento) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2013/02/28	The Portuguese continental shelf soft-bottom benthic habitats Arguente	Roberto Carlos Domingues Martins (Doutoramento) Universidade de Aveiro, Portugal
2012/12/11	Modélisation du role du biofilm dans le fonctionnement du réseau trophique de la vasière de Brouage (Bassin de Marennes-Oléron): Influence sur les flux de Carbone et consequences sur la stabilité Arguente principal	Blanche Saint-Beat (Doutoramento) Université de La Rochelle, França
2012/12/04	Predicting the distribution of invasive decapods across space and time Arguente principal	César Dinis Santos Capinha (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2012/09/17	The role of breeding experience on the foraging specialization of a pelagic marine predator, the Cory’s sheawater. Presidente do júri	Fredrik Duvholt Haug (Mestrado)
2012	Dispersal and population regulation of the red swamp crayfish Procambarus clarkia	Ricardo Manuel Oliveira Ramalho (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2012	Efeitos da nutrição de praias na comunidade macrofaunal de uma praia arenosa da costa ocidental Portuguesa	José David Costa Cunha (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2012	A cost-effective tool-box to assess ecological receptors at most risk in a potentially pesticide contaminated south European big man-made reservoir	Nadia Ivonne Ordóñez Román (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2012	The role of breeding experience on the foraging specialization of a pelagic marine predator, the Cory’s sheawater	Fredrik Duvholt Haug (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2012	Ecological relevance of molecularand functional alterations induced by pollutants on juvenile seabass (Dicentrarchus labrax L.)	Joana Reis de Almeida (Doutoramento) Universidade do Porto, Portugal
2012	Ecological segregation and competition amongst European robins Erithacus rubecula in Iberian winter quarters: the role of sex, age, and geographic origin	Ana Cristina Reis Campos (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2012	Study of the physical, chemical and biological processes in semi-intensive fishponds: development of a mathematical model as a tool for managing white seabream (Diplodus sargus) production	Dalila do Rosário Encarnação Serpa (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
2012	Mondego basin and estuary management: The role of ecosystem services (e) valuation for human wellbeing endeavour	Rute Isabel da Costa Pinto (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2012	Response of benthic communities to natural and human-induced changes in a temperate estuary. Implications for recovery and management	Helena Leite Veríssimo de Carvalho (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2012	Predicting the distribution of invasive decapods across space and time	César Dinis Santos Capinha (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2012	Modélisation du role du biofilm dans le fonctionnement du réseau trophique de la vasière de Brouage (Bassin de Marennes-Oléron): Influence sur les flux de Carbone et consequences sur la stabilité	Blanche Saint-Beat (Doutoramento) Université de La Rochelle, França
2011/12/13	Discussão do Curriculum Vitae Arguente	Henrique Miguel Leite de Freitas Pereira (Agregação)
2011/05/16	Discussão do Relatório da Disciplina” – Ecological Modelling Arguente	Pedro Manuel da Silva Duarte (Agregação) Universidade Fernando Pessoa, Portugal
2011	Payments for environmental services as a policy for conserving the Portuguese Montado ecosystem. (Opponent)	Thaís de Toledo Ribas (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011	The rocky shore macrozoobenthic communities of Buarcos Bay	Antónia Juliana Pais da Costa (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011	Population dynamics and productivity of Echinogammarus marinus (Leach) in the Mondego estuary throughout three decades	Nuno Januário Figueiredo Leite (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011	Spatial and temporal variation of Corbicula flumínea (Müller, 1774) in the Mondego estuary	Ana Vanessa Pinto Modesto (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011	The functional composition of the benthic invertebrate community of the Mondego estuary: insights within the functioning of this ecosystem	Pieter van der Linden (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011	A short-term sublethal feeding inhibition assay, using zebra fish Danio rerio	Ahmed M. M. Abdel-Moneim (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2011	Mediterranean and Black Sea macrofauna: Comparing sampling strategies	Franca Sangiorgio (Mestrado) Universidade de Aveiro, Portugal
2011	Bluemouth, Helicolenus dactylopterus (Delaroche, 1809) biology and stock structure in Portuguese waters	Vera Lia Oliveira Sequeira (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2011	Spatial and temporal variation of fish assemblages in estuarine systems: Habitat use, dependence, and connectivity	Susana de Oliveira Braga da Silva França (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2010/01/21	Lição de Síntese: As Aves Marinhas como indicadores ecológicos. Arguente	Jaime Albino Ramos (Agregação) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	“ Variação temporal da comunidade macrobentónica subtidal do sector polihalino do braço Sul do do estuário do Mondego”	Augusta da Conceição de Jesus Duarte (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	“Population dynamics of Corbicula flumínea (Muller, 1774) in the mesohaline and oligohaline areas of the Mondego estuary: spatial intrusion and ecological response”	João Nuno dos Reis Franco (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	“Influence of hydrodynamics and sediment grain sise in environmental quality of estuarine polyhaline sector”	Ana Eduarda Saraiva Pereira Campos (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	“Spatial and temporal variability of benthic producers and consumers ¿ 13 C and ¿15 N signatures in the Mondego estuary food web	Dimitri Vilhena Barroso (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	“Spatial and temporal heterogeneity of macrofauna assemblages in the polyhaline sector of a mesotidal estuary”.	Ana Margarida da Graça Carriço (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	“Modelos de dinâmica populacional de Echinogammarus marinus do estuário do Mondego: Calibrações para 3 populações diferentes e análise de cenários referentes a alterações climáticas e flutuações de sex-ration”	Alexandra Maria Martins Guerra (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	“Do macrofauna assemblages reflect Zostera noltii meadows temporal dynamics associated with natural and anthropogenic disturbances?”	Luísa da Costa Marques (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	Ecological state of selected urban streams in Coimbra, Portugal	Ana Isabel Del Arco Ochoa (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	Foraging tactics, activity at-sea and sea area usage by Cory's Shearwaters (Calonectris diomedea borealis) in the North Atlantic. University of Coimbra (concluded February 2010)	Vítor Hugo Rodrigues Paiva (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	Impact assessment of multiple stressors on the Mondego estuary: A multidimensional approach on the Bilvalve Scrobicularia plana	Tiago Gonçalo Martins Verdelhos (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	Benthic macroinvertebrates as ecological indicators for estuarine and coastal ecosystems. Assessment and intercalibration	Heliana Lilita Gonçalves Teixeira (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2010	Food webs in intertidal ecosystems. A stable isotope approach and trophic network analysis	Alexandra Sofia Baptista Vicente Baeta (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2009	“Avaliação do Estado de Qualidade Ecológica em ecossistemas estuarinos: Qual a influência da malha dos crivos utilizados na amostragem de macroinvertebrados bentónicos?”	Thiago Couto (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2009	“The Mondego estuary mesohaline and oligohaline macrozoobenthic communities. A contribution for their Ecological Quality Status Assessment”	Pedro de Almeida Lança Vinagre (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2009	Inter-annual and seasonal variation in feeding ecology of tropical seabirds on Aride Island, Seychelles. University of Coimbra	Teresa Catry (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2009	************	Pedro Afonso A. dos Santos (Outro) Universidade dos Açores, Portugal
2009	************	Telmo Alexandre Morato Gomes (Outro) Universidade dos Açores, Portugal
2009	************	Marina Parra Carreiro e Silva (Outro) Universidade dos Açores, Portugal
2009	Contribution of estuarine nursery areas to be structure and biocontamination of stocks of commercially important fish species along the Portuguese coast	Rita Maria Pina Vasconcelos (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2008/07/07	Discussão do Curriculum Vitae Arguente	Maria Isabel Violante Caçador (Agregação) Universidade de Lisboa, Portugal
2008	“Devenir dês bacteries dans les réseaux trophiques des vasières intertidales : Le cas de Brouage (Baie des Marennes-Oleron)"	Pierre-Yves Pascal (Doutoramento) Université de La Rochelle, França
2008	Indicators selection for the assessment of marine protected areas	Celia Ojeda Martinez (Doutoramento) Universitat d'Alacant, Espanha
2007/10/01	Discussão do Curriculum Vitae Arguente	Maria da Natividade Ribeiro Vieira (Agregação) Universidade do Porto, Portugal
2007/04/19	Discussão da Lição de Síntese: Introdução aos fundamentos básicos do conceito de Integridade Ecológica. Arguente	João Alexandre Ferreira Abel dos Santos Cabral (Agregação) Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
2007	“A tentative harmonisation of the OSPAR Convention and the European Water Framework Directive ecological criteria for transitional waters quality assessment. Mondego estuary case study”	Helena Leite Veríssimo de Carvalho (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2007	Application of multimetric índices and their performance in assessing ecological condition. The Mondego estuary case study	Rute Pinto (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2007	“Primary production in the Tagus estuary – nutrient enrichment and the role of salt marshes”	Maria Teresa Peters Castro Simas (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2007	“AMBI, una herramienta para la evaluación del estado de las comunidades bentónicas: modo de uso y aplicación a la Directiva Marco del Agua”	Iñigo Muxika (Doutoramento) Universidad del País Vasco, Espanha
2007	Comunidades de macroinvertebrados e peixes associadas à pradaria marinha de Halodule wrightii (Ascherson, 1868) na Laguna de Mussulo, Angola	Cármen Ivelize Van-Dúmen do Sacramento Neto dos Santos (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2007	“Macrofaunal key Crustaceans in Atlantic and Mediterranean exposed sandy beaches. Does knowledge on key species bio-ecology have a role in assessing global changes?"	Sílvia Correia Gonçalves (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2007	Discussão do Curriculum Vitae Arguente	Maria Ester Tavares Álvares Serrão (Agregação) Universidade do Algarve, Portugal
2007	“Factors affecting decomposition of submerged litter and associated microbes and invertebrates"	Verónica Jacinta Lopes Ferreira (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2006/12/12	Discussão do Curriculum Vitae e do Programa da Disciplina: Ecotoxicologia. Arguente	Maria Helena Ferrão Ribeiro da Costa (Agregação) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2006/07/12	Discussão do Curriculum Vitae e do Programa da Disciplina: Dinâmica de Populações. Arguente	Karim Erzini (Agregação) Universidade do Algarve, Portugal
2006/06/30	Discussão do Curriculum Vitae Arguente	Leonel Paulo Sul de Serrano Gordo (Agregação) Universidade de Lisboa, Portugal
2006/05/05	Discussão da Lição de Síntese: Ecologia do plâncton em estuários pouco profundos a latitudes temperadas.	Ulisses Manuel de Miranda Azeiteiro (Agregação) Universidade Aberta, Portugal
2006	Aplicação da genética populacional à gestão de recursos silvestres: o caso do javali (Sus scrofa L.)	Eduardo M. S. L. A. Ferreira (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2006	Modelling shrimp population dynamics: Application to Maputo Bay, Mozambique	Andrea Florella Ribeiro Franco (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2006	Mercúrio e amêijoa: Uma relação perigosa?	Manuel Alberto Nogueira Henriques Rosa (Mestrado) Universidade de Aveiro, Portugal
2006	Discussão do Curriculum Vitae e do Programa da Disciplina: Ecologia de Peixes. Arguente	Henrique Manuel Roque Nogueira Cabral (Agregação) Universidade de Lisboa, Portugal
2006	Ecology of the early life-history stages of shad Alosa fallax fallax (Lacépède, 1803) in the river Mira, with a note on Alosa sp larvae in the river Guadiana	Eduardo Bruno Oliveira Esteves (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
2006	A process-oriented biogeochemical model for marine ecosystems: Development, numerical study, and application	Marcos Duarte Mateus (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2005/10/10	Discussão do Curriculum Vitae Arguente	Rui Orlando Pimenta Santos (Agregação) Universidade do Algarve, Portugal
2005	“Macroinvertebrates in the Mondego River basin bioassessment”	Maria João Feio (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2005	“Long-term changes within macrobenthic assemblages of a temperate estuary under eutrophication”	Patrícia Gonçalves Cardoso (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2005	Povoamentos malacológicos de substrato móvel ao longo da plataforma insular sul da ilha da Madeira	António Domingos de Sousa Abreu (Doutoramento) Universidade da Madeira, Portugal
2005	Ecologia da lontra (Lutra lutra L.): Chaves de identificação de peixes consumidos, dieta no Rio Paiva e actividades científicas e investigativas no ensino	Anabela Clara Barreto Marques Novais (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2005	Comportamento territorial do Trigueirão (Miliaria calandra; Aves: Emberezidae): Selecção de habitat, qualidade do território e actividade de canto	Maria Inês Vasconcelos de Albergaria Pinheiro Moreira (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2005	How well do ecological indicators assess environmental status?	Joana Mateus Patrício (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2005	Long-term survey of key macrobenthic species in a temperate eutrophic estuary and the influence of trematode parasites	Susana Margarida de Freitas Ferreira (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2005	Benthic biotopes remote sensing using single beam acoustics	Rosa de Fátima Lopes de Freitas (Doutoramento) Universidade de Aveiro, Portugal
2005	The Cape Verde coastal ecosystem: A study of community structure, trophic interactions, and exploitation pattern	Kim Araújo Stobberup (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
2004/10/14	Discussão da Lição de Síntese: O controlo da dispersão horizontal nas larvas de crustáceos decápodes. Arguente	Henrique José de Barros Brito Queiroga (Agregação) Universidade de Aveiro, Portugal
2004/03/11	Discussão do Curriculum Vitae e do Programa da disciplina: Modelação Ecológica. Arguente	João Pedro Salgueiro Gomes Ferreira (Agregação) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2004	Estudo comparativo da mortalidade induzida pela faca de mariscar e draga de mão na comunidade macrobentónica associada aos bancos de pesca de berbigão (Cerastoderma edule, L. 1758)	Francisco Miguel de Sousa Leitão (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2004	Ecologia do regime alimentar e interacções tróficas das principais espécies de peixes do baixo estuário do rio Guadiana e do sapal de Castro Marim e Vila Real de Santo António	Rita de Sousa Braga e Sá (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2004	Dynamics of meiofauna in association with Zostera noltii seagrass beds in the Mira estuary (SW Portugal)	Maria Helena Soares Martins Adão (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2004	Ecologia dos Peracarídeos (Crustácea) bentónicos da zona entre marés da Ria Formosa	Sandra Paula Mendes da Cruz (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
2004	Biologie, dynamique et génétique dês populations du genre Porcellionides en Tunisie (Crustacé, Isopode Oniscidea)	Mohamed Sghaïer Achouri (Doutoramento) Universidade de Túnis - El Manar, Tunísia
2004	Processos ecológicos que controlam a dinâmica das macroalgas Ulvales (Chlorophyta) na Ria Formosa	Jaime Miguel Costa Aníbal (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
2004	“Ecology of migrating and wintering Dunlins (Calidris alpina) using a south temperate estuary, the Mondego estuary (Portugal)”	Ricardo Jorge da Siulva Pereira Lopes (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2004	“Nutrient enrichment in a temperate macro-tidal system. Scenario analysis and contribution to coastal management)”	João Miguel Magalhães Neto (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	Aplicação da Ascendência como indicador ecológico. Um caso estudado	Joana Mateus Patrício (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	The effects of eutrophication on the secondary production of an intertidal community	Marina Paula Dolbeth Henriques da Silva (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	Influência de factores climáticos e da abundância de tunídeos nas populações reprodutores de garajau-rosado Sterna dougalli e garajau-comum Sterna hirundo e a importância do conteúdo energético da dieta para garajau-rosado	José Manuel da Costa Pereira (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	Variação espacial e temporal de nutrientes no rio Vouga	Ana Teresa Barros Cardoso (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2003	“Validation of a terrestrial model ecosystem”	José Manuel Lopes Rodrigues (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	“Among and within-population variability of metal tolerance by Cladocerans”	Isabel Maria Cunha Antunes Lopes (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	Utilização de cruzamentos controlados e de perfis de AND na investigação da variabilidade genética dos nemátodes-de-quisto da batateira, Globodera spp	Isabel Luci Pisa Mata da Conceição (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	Modulação da libertação de glutamato por mecanismos de sinalização intracelular envolvendo cinases de resíduos de tirosina no hipocampo adulto	Daniela Barroso da Cunha Pereira (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	Cholestasis and hepatic ischemia: Bile acids therapy. Cellular mechanisms with relevance to mitochondrial function	Anabela Pinto Rolo (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	Effects of Eucalyptus globulus plantations on soil Collembola and on fauna mediated soil biological processes. Comparison with autochtonous forests	José Paulo Filipe Afonso de Sousa (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2003	A enguia-europeia, Anguilla anguilla (L., 1758), na bacia hidrográfica do rio Mondego	Isabel Maria Madaleno Domingos (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2002	Aplicação da CUFES (Continuous Underway Fish Egg Sampler) na avaliação de ovos e larvas de Sardina pilchardus (Walbaum, 1792) e outros pelágicos	Maria de Jesus Dias Vicente (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002	Biologia, dinâmica populacional e produção de Talitrus saltator (Crustacea: Amphipoda) numa praia arenosa da costa ocidental Portuguesa	Sílvia Correia Gonçalves (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002	Padrões espaciais na estrutura da comunidade de Peixes costeiros dos Açores	Pedro Afonso (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002	Caracterização do Pelagos do braço sul do estuário do Mondego	Luís Miguel dos Santos Russo Vieira (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2002	“Aperfeiçoamento de sistemas de classificação da vegetação sob a perspectiva do seu interesse faunístico recorrendo a critérios estruturais em sistemas agro-florestais”	Luís Cláudio de Brito Brandão Guerreiro Quinta-Nova (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
2002	“Physical control of biological processes in a coastal upwelling system: Comparison of the effects”	Maria Emília Cunha (Doutoramento) Universidade de Lisboa, Portugal
2002	“Comportamento dinâmico da produtividade primária fitoplanctónica ”	Maria Filomena Meireles Abrantes de Macedo Dinis (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2002	“Valoración y aplicabilidad de los índices e indicadores biológicos de contaminación orgânica en la gestión del médio marino ”.	Fuensanta Salas Herrero (Doutoramento) Universidad de Murcia, Espanha
2002	“Development of retina cells in culture: Ionotropic glutamate receptors and neurosecretion”	Armando Jorge Amaral Matias Cristóvão (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2002	Variabilidade genética de populações portuguesas de nemátodes-de-quisto da batateira	Maria José Moreno da Cunha (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2002	Resposta ecofisiológica de Echinogammarus marinus (Amphipoda, Gammaridae) a variações ambientais. Desenvolvimento de um modelo ecológico de dinâmica populacional	Paulo Jorge de Sousa Maranhão (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2002	“Integrated research on ecology, genetics, and ecotoxicology of Gammarus locusta (L.): The model organism approach”	Filipe José Oliveira Costa (Doutoramento) Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2002	************	Isabel Maria de Oliveira Abrantes (Agregação) Universidade de Coimbra, Portugal
2001	Ecologia alimentar e relações tróficas de nove espécies de peixes demersais dos Açores	Telmo Alexandre Fernandes Morato Gomes (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2001	Sistemática e ecologia dos moluscos (Gastropoda, Bivalvia e Polyplacophora) litorais em São Vicente, Capelas (São Miguel, Açores)	Sérgio Paulo Ávila Campos Marques (Mestrado) Universidade da Madeira, Portugal
2001	“The effect of salt marshes plants on the nutrient dynamics in the Mondego estuary (Portugal)”	Ana Isabel Lillebø Batista (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2001	“Eucalyptus globules leaves: Morphological and chemical barriers to decomposition in streams”	Cristina Maria Moreira (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2001	“Trophic ecology of the Norway lobster Nephrops norvegicus (L.) (Crustacea: Nephropidae) in the Mediterranean and adjacent Atlantic: Diets, evacuation rates, and daily rations”	Margarida de Lurdes de Jesus Bastos de Cristo (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
2000	Variação espacial e temporal dos moluscos do substrato rochoso da ilha da Berlenga	João Miguel Magalhães Neto (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000	Senescência, decomposição e nutrição azotada em Spartina maritima no estuário do rio Mondego	Paula Cristina de Oliveira Castro (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000	Estudo fitossociológico e cartográfico da paisagem vegetal natural e semi-natural do litoral centro de Portugal entre a prais de Mira e a Figueira da Foz	Maria João da Silva Martins (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000	Gammarus locusta e Corophium volutator (Amphipoda) em estudos de ecotoxicologia sedimentar: Biologia e sensibilidade a ambientes sedimentares perturbados	Maria Teresa Carrett Silveirinha Sottomayor Neuparth (Mestrado) Universidade de Lisboa, Portugal
2000	Sistema Integrado de Ecotecnologia – Complexo – Industrial. Tratamento e reutilização das águas residuais	Pedro Agostinho da Silva Baila Madeira Antunes (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000	Aspectos da reprodução de savelha, Alosa fallax fallax (Lacépède, 1803) nos rios Mira e Guadiana	Teresa Alexandra Sousa Pina (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
2000	“Peracaridean Crustacea in Ria de Aveiro (NW Portugal): taxonomic composition and spatio-temporal structure of the assemblages; life history and secondary production of Corophium multisetosum Stock, 1952 (Amphipoda, Corophiidae)”	Maria Marina Pais Ribeiro da Cunha (Doutoramento) Universidade de Aveiro, Portugal
2000	“Quantitative assessment of the environmental impact of an ecotechnological alternative to control crayfish in rice fields”	João Alexandre Ferreira Abel dos Santos Cabral (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
2000	“Green macroalgae and seagrasses in a shallow eutrophic estuary (the Mondego estuary, Portugal): Dynamics, controlling factors and possible evolutionary scenarios”	Irene Isabel da Cruz Martins (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	Impacte da macroepifauna sobre as macroalgas Ulvales (Chlorophyta) na Ria Formosa	Jaime Miguel Costa Aníbal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	Estudos sobre a biologia trófica de Sericostoma vittatum (Trichoptera)	Maria João de Medeiros Brazão Lopes Feio (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	Ectomicorrizas associadas ao sobreiro (Quercus suber L.)	Anabela Marisa de Jesus Rodrigues Azul (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	Utilização de conteúdos nucleares de ADN na estimativa de Exergia a partir da biomassa de organismos	Júlio César Coutinho Fonseca (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	Factores que influenciam a abundância e a condição nutricional das larvas de peixes nos rios Mira e Guadiana	Eduardo Bruno Oliveira Esteves (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	Impacto das aves limícolas sobre os macroinvertebrados nas áreas intertidais do estuário do Mondego (Portugal)	Ricardo Jorge da Silva Pereira Lopes (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	Flora exótica subespontânea de Portugal Continental (plantas vasculares): Catálogo das plantas vasculares exóticas que ocorrem sunespontâneas em Portugal Continental e compilação de informações sobre estas plantas	João Domingues de Almeida (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1999	“Impacto da eutrofização nas comunidades bentónicas do Braço Sul do estuário do Mondego (Portugal)”	Miguel Ângelo do Carmo Pardal (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1998	Integração de medidas de contaminação química, estrutura de comunidades bentónicas e toxicidade sedimentar na comparação de situações de pré e pós-funcionamento do emissário submarino da Guia	Susana Alice Soares da Silva (Mestrado) Universidade de Aveiro, Portugal
1998	“Effect of habitat loss on waders (Aves, Charadrii) in the Mondego estuary (Portugal)”	Tiago Ferrand Múrias dos Santos (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1998	“Ecological engineering of crayfish and rice production: Data and sub-models for CRISP (Crayfish and Rice Integrated System of Production”)	Pedro Manuel Silva Gentil Anastácio (Doutoramento) Universidade de Coimbra, Portugal
1997	Estrutura populacional, dinâmica e produção de Hydrobia ulvae (Pennant) (Mollusca: Prosobranchia) ao longo de um gradiente de eutrofização no estuário do Mondego (Portugal)	Ana Isabel Lillebø Baptista (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1997	Estudo da comunidade de Poliquetas da Plataforma Continental ao largo de Aveiro	Ascenção dos Anjos Alves Ravara (Mestrado) Universidade de Aveiro, Portugal
1996	Parâmetros populacionais da fauna piscícola e uso do habitat por Salmo trutta L. num rio de montanha (rio Olo, parque natural do Alvão)	Maria de La Salete Bernardino Rodrigues (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1996	“Overwintering Euphausiids in the Northern North Sea and their importance in the fish food web”	Mário Jorge Bandeira Correia Lopes (Mestrado) Universidade de Aveiro, Portugal
1996	Lagostim vermelho dos pântanos (Procambarus clarkii, Girard): Ecologia e impacto trófico	Maria Antónia Pacheco Ilhéu (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1996	Povoamentos macrobentónicos de substrato rochoso da região central da Costa Portuguesa: Distribuição, estrutura e funcionamento	Diana Mendes Boaventura (Mestrado) Universidade de Lisboa, Portugal
1996	Estrutura e dinâmica das comunidades macrobênticas da Ria Formosa (Ria Faro - Olhão)	José Rosa de Oliveira Calvário (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
1996	“Anfípodos de los fondos de substratos blandos de las islas Chafarinas (Mar de Alborán): Faunística y ecologia"	Amparo Marti Gil (Doutoramento) Universitat de València, Espanha
1995	Estrutura trófica da comunidade macrobentónica dos povoamentos de Zostera noltii Hornem. e Zostera marina L. do estuário do rio Mira (Portugal)	Carla Maria Teles Ferreira (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995	“Modelling the effects of green macroalgae blooms on the population dynamics of Cyathura carinata (Crustacea: Isopoda) in the Mondego estuary (Portugal).”	Irene Isabel da Cruz Martins (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995	Impacto da eutrofização da distribuição e eficiência alimentar das aves limícolas no estuário do Mondego (Portugal). Estudo preliminar.	João Alexandre Ferreira Abel dos Santos Cabral (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995	Variação espacial e temporal das populações de Poliquetas no estuário do Mondego. Dinâmica e produção de Amage adspersa (Grube, 1863)	Miguel Ângelo do Carmo Pardal (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995	Influência de alguns factores abióticos na estrutura das comunidades bentónicas subtidais no estuário do Mondego (Portugal)	Maria de Fátima Rosa Lopes (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995	Variação sazonal da composição bioquímica e conteúdo energético do lagostim vermelho da Louisiana, Procambarus clarkii (Girard), na região do Baixo Mondego (Portugal)	Maria Isabel Ramos de Mendonça (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1995	“Distribución espaciotemporal de los peracáridos (Crustacea) asociados a Bugula neritina (L., 1758) en la bahía de Algeciras. Aspectos faunísticos y zoogeográficos”	Mercedes Conradi Barrena (Doutoramento) Universidad de Cádiz, Espanha
1994	Bioacumulação de metais pesados em Procambarus clarkii, lagostim vermelho da Louisiana: Implicações para a sua utilização como recurso alimentar.	Paulo Jorge de Sousa Maranhão (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1994	Bio-ecologia de Cardium edule (Lineu, 1767) e de Cardium glaucum (Bruguière, 1789) nos estuários de Odeceixe e de Aljezur (Sudoeste de Portugal)	Ana Manuel Pereira de Almeida Costa (Doutoramento) Universidade de Évora, Portugal
1994	“Estudios biológicos sobre Procambarus clarkii Girard (Decapoda Cambaridae) en las marismas del Bajo Guadalquivir”	Esperanza Cano Sánchez (Doutoramento) Universidad de Sevilla, Espanha
1994	“The benthic ecology of some Ria Formosa lagoons, with reference to the potential for production of the gilthead seabream (Sparus aurata L.)”	Maria Sofia Júdice Gamito Pires (Doutoramento) Universidade do Algarve, Portugal
1993	Ciclo biológico e produção do lagostim vermelho da Louisiana (Procambarus clarkii, Girard) na região do Baixo Mondego	Pedro Manuel Silva Gentil Anastácio (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1993	Variação temporal nos padrões de ocorrência e tácticas de alimentação de aves limícolas no estuário do Mondego (Portugal). Sua relação com as alterações na disponibilidade de presas	Tiago Ferrand Almeira Múrias dos Santos (Mestrado) Universidade de Coimbra, Portugal
1993	Impacte da exploração comercial e estrutura, dinâmica e produção da população de Marphysa sanguinea (Annelida: Polychaeta) no estuário do Sado	João José Roma de Paços Pereira de Castro (Outro) Universidade de Évora, Portugal
1993	“Contribucion al estudio de los Anfipodos de las costas mediterraneas catalanas”	António Jimeno Fernández (Doutoramento) Universitat de Barcelona, Espanha
1992	ANAMOD - Extracção dos componentes modais de distribuições de frequências de variáveis biométricas	António José Arsénia Nogueira (Outro) Universidade de Coimbra, Portugal
1991	Trabalho de Síntese: Procambarus clarkii (Girard, 1852) (Decapoda, Cambaridae) espécie exótica em Portugal: Considerações sobre a bioecologia e aspectos da sua biologia populacional na barragem de Monte Novo (Alentejo, Portugal)	Maria Helena Soares Martins Adão (Outro) Universidade de Évora, Portugal

Arbitragem científica em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2019/01/01 - Atual	Editor in Chief Environmental and Sustainability Indicators Journal	Elsevier
2016/01/01 - Atual	Editor in Chief - Ecological Indicators Journal	Elsevier

Comissão de avaliação

	Descrição da atividade Tipo de assessoria	Instituição / Organização
2001 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao 5º Programa Quadro (2000 2006), no âmbito do Programa Energy, Environment, and Sustainable development, “Key Action Sustainable Marine Ecosystems
2000 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao 5º Programa Quadro (2000 2006), no âmbito do Programa Environment, and Sustainable development, “Key Action” Global Change, Climate and Biodiversity
1999 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao 5º Programa Quadro (2000 2006), no âmbito do Programa Energy, Environment, and Sustainable development, “Key Action” Sustainable Marine Ecosystems
1998 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao Programa Marine Science and Technology, MAST III (1994 1998), no âmbito SME (“Small Medium Enterprises”) – CRAFT (“Cooperative Research Awards”) proposals
1997 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao Programa Marine Science and Technology, MAST III (1994 1998), no âmbito SME (“Small Medium Enterprises”) - TSM (“Technology Stimulation Measures”)
1996 - Atual	Avaliação do projecto “Scavenging marine Amphipods: Food selectivity and carrion availability in temperate vs. tropical ecosystems”	Natural Environment Research Council, Reino Unido
1996 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos em 15 de Outubro de 1996 (Fases I + II) ao Programa Marine Science and Technology, MAST III
1991 - Atual	Membro do painel de avaliação nomeado pela JNICT (Junta Nacional de Investigação Científica e Tecnológica - Portugal) para apreciação dos projectos submetidos ao Programa CIÊNCIA, Medida G, Ciências e Tecnologias do Mar	Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
1999/09 - Atual	Ecologia	Mestrado em Biologia Animal (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Ecologia Animal - Aulas práticas (1987/88	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Hidrobiologia -Aulas práticas (de 1990/91 até ao presente)	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Invertebrados I - Aulas práticas (de 1982/83 a 1985/86)	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Vertebrados - Aulas práticas (1982/83 a 1985/86; 1988/89)	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Invertebrados I - Aulas teóricas (1985/86)	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Ecologia Animal -Aulas teóricas (1986/87 e 1987/88)	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Hidrobiologia -Aulas teóricas (de 1990/91 até ao presente)	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Biologia e Ecologia Marinha - Aulas teóricas (de 2007/08 até presente)	Biologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Comunidades e Ecossistemas	Mestrado em Ecologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Análise Numérica e Modelos Ecológicos	Mestrado em Ecologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Dinâmica de Ecossistemas Aquáticos	Mestrado em Ecologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Estrutura de Populações	Mestrado em Ecologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
1982/09 - Atual	Avaliação de Qualidade Ambiental (2006/07;2007/08;2008/09;2009/10;2010/11;2011/12;2012/13)	Mestrado em Ecologia (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
2013 - 2013	Ecologia de Estuários	Especialização (Curso médio)	Universidade Estadual de Paraíba, Brasil
2013 - 2013	Estuarine Ecology	Especialização (Curso médio)	Universidade Federal de Belo Horizonte, Brasil
2006 - 2006	Environmental management and modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
2005 - 2005	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
2005 - 2005	Course on Ecosystem Theory	Especialização (Curso médio)	Na Danish Pharmaceutical University (DFU), Dinamarca
2005 - 2005	Curso Intensivo de Hidrobiologia	Especialização (Curso médio)	Instituto Superior de Educação (ISE), Cabo Verde
2004 - 2004	Environmental management and modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
2003 - 2003	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Environmental management and modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
2002 - 2002	Principles of pollution abatement	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
2001 - 2001	Principles of pollution abatement	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1996/09 - 2001	Modelação Ecológica	Mestrado em Hidráulica e Recursos Hídricos (Mestrado)	Universidade de Coimbra, Portugal
2000 - 2000	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1999 - 1999	Environmental management and modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1998 - 1998	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1997 - 1997	Environmental management and modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1997 - 1997	Contaminación marina	Especialização (Curso médio)
1995/09 - 1996/08	Aulas teóricas na disciplina de Recursos animais do Mestrado em Gestão de Recursos Biológicos, Universidade de Évora	(Outros)	Universidade de Coimbra, Portugal
1996 - 1996	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1995 - 1995	Ecosystem theory and modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1994 - 1994	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1993 - 1993	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1991/09 - 1992/08	Aulas teóricas e práticas do módulo de Ecologia do Mestrado em Ensino em Biologia -Geologia, Universidade do Minho	(Outros)	Universidade de Coimbra, Portugal
1992 - 1992	Ecological Modelling	Especialização (Curso médio)	Universidade de Coimbra, Portugal
1991 - 1991	Environmental issues and aquaculture development	Especialização (Curso médio)
1990 - 1990	Sampling strategies and methods of numerical analysis in aquatic ecology	Especialização (Curso médio)

Membro de associação

	Nome da associação	Tipo de participação
Atual	Sociedade Portuguesa de Ecologia (SPECO)
Atual	International Society for Ecological Modelling (ISEM)
Atual	International Ecological Engineering Society (IEES)

Membro de comissão

	Descrição da atividade Tipo de participação	Instituição / Organização
2003/01 - Atual	Membro do Grupo de Reflexão e Dinamização da Investigação Científica Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
2001/01 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao 5º Programa Quadro (2000 2006), no âmbito do Programa “Key Action Sustainable Marine Ecosystems Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
2000/01 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao 5º Programa Quadro (2000 2006) no âmbito do Programa “Key Action” Global Change, Climate and Biodiversity Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
1999/01 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao 5º Programa Quadro (2000 2006), no âmbito do Programa Sustainable Marine Ecosystems Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
1998/01 - Atual	Membro da Comissão Oceanográfica Intersectorial Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
1998/01 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao Programa Marine Science and Technology, MAST III (1994 1998), no âmbito SME (“Small Medium Enterprises”) – CRAFT proposals Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
1997/01 - Atual	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos ao Programa Marine Science and Technology, MAST III (1994 1998), no âmbito SME (“Small Medium Enterprises”) - TSM Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
1996/01 - Atual	Avaliação do projecto “Scavenging marine Amphipods: Food selectivity and carrion availability in temperate vs. tropical ecosystems”, submetido para financiamento ao Natural Environment Research Council, Reino Unido Outro	Universidade de Coimbra, Portugal
1991/01 - Atual	Membro do painel de avaliação nomeado pela JNICT (Junta Nacional de Investigação Científica e Tecnológica - Portugal) Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
2013 - 2016	Foundation for the Science and Technology (FCT) - President - Scientific Board - Natural and Environmental Sciences Presidente / Vice-presidente	Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2009 - 2016	General Council - University of Coimbra Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
1999/01 - 2003	Presidente da Comissão Ciêntífica do Dep. de Zoologia da FCTUC Presidente / Vice-presidente	Universidade de Coimbra, Portugal
1994/01 - 1998	Membro do Painel de avaliação nomeado pela Comissão Europeia, Direcção geral XII, para apreciação dos projectos submetidos em 15 de Outubro de 1996 (Fases I + II) ao Programa Marine Science and Technology, MAST III Membro	Universidade de Coimbra, Portugal
1990/01 - 1991	Membro de Comissão de Estudos Graduados do Departamento de Zoologia Membro	Universidade de Coimbra, Portugal

Outro júri / avaliação

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2020/01/24 - Atual	Concurso Professor Coordenador da área de Aquacultura da Escola Superior de Turismo e do Mar (ESTM) do Instituto Politécnico de Leiria (IPL), 24 de janeiro de 2020.	Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
2019/07/29 - Atual	Concurso para provimento de duas vagas de Professor Catedrático, áreas de Biologia Marinha e Ciências das Pescas do grupo de Ciências do Mar e do Ambiente e de Biotecnologia Vegetal, Química Biológica e Engenharia Bioquímica e do grupo de Biotecnologia da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade do Algarve, 29 de julho de 2019. Vogal.	Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/01/25 - Atual	Concurso Professor Coordenador da área de Biotecnologia Marinha da Escola Superior de Turismo e do Mar (ESTM) do Instituto Politécnico de Leiria (IPL), 25 de janeiro de 2019.	Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
2013/01/31 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Auxiliar, área de Aquacultura, da Universidade do Algarve	Centro de Ciências do Mar, Universidade do Algarve, Portugal
2013 - Atual	Concurso Professor Auxiliar	Universidade do Algarve, Portugal
2013 - Atual	Concurso professor Catedrático Biologia Marinha da Universidade de Lisboa	Universidade de Lisboa, Portugal
2013 - Atual	Concurso professor Catedrático Botânica da Universidade de Lisboa	Universidade de Lisboa, Portugal
2013 - Atual	Concurso Professor Coordenador da área de Biologia Molecular da ESM do IPL	Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
2013 - Atual	Concurso Professor Coordenador da área de Biologia Marinha da ESTM do IPL	Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
2012/05/15 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado, área de Ecologia Marinha, da Universidade dos Açores	Universidade dos Açores, Portugal
2012 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Auxiliar, área de Engenharia do Ambiente, Universidade Aberta	Universidade Aberta, Portugal
2012 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado, área de Ecologia, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade Nova de Lisboa	Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2011 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Catedrático do Departamento de Zoologia e Antropologia da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, área de Zoologia
2009 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado do Departamento de Zoologia e Antropologia da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, área de Zoologia	Universidade do Porto, Portugal
2008 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Catedrático do Departamento de Zoologia e Antropologia da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, área de Zoologia	Universidade do Porto, Portugal
2006 - Atual	Concurso para provimento de dois lugares de Professor Catedrático do Departamento de Biologia Vegetal da Faculdade de Ciências de Lisboa, especialidade Ecologia e Biossistemática Vegetal	Universidade de Lisboa, Portugal
2006 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado do Grupo de Disciplinas de Qualidade Ambiental, com a disciplina de Modelação Ecológica, da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa	Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2004 - Atual	Concurso para provimento de um lugar de Investigador Principal no Departamento de Oceanografia e Pescas da Universidade dos Açores na área de Biologia e área afim de Recursos Pesqueiros	Universidade dos Açores, Portugal
2004 - Atual	Concurso para provimento de cinco lugares de Professor Associado da Faculdade de Ciências do Mar e do Ambiente da Universidade do Algarve, área de Ciências do Mar e do Ambiente	Universidade do Algarve, Portugal
2003 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado da Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro na área de Ciências Exactas, Naturais e Tecnológicas: Ecologia Geral e Aplicada	Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
2003 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Adjunto do Instituto Politécnico de Leiria na área Biologia / Ecologia Marinha	Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
2003 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Adjunto do Instituto Politécnico de Leiria na área Biologia / Avaliação de qualidade ambiental e gestão de sistemas costeiros	Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
2002 - Atual	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Adjunto do Instituto Politécnico de Leiria na área Biologia / Sistemática e Morfologia	Instituto Politécnico de Leiria, Portugal
2020/09/14 - 2020/09/14	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Catedrático, área de Biologia Marinha, da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 14 de setembro de 2020. Vogal.	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020/07/17 - 2020/07/17	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado para a área científica disciplinar de Ciências do Mar, Universidade dos Açores, 17 de julho de 2020. Vogal.	Universidade dos Açores - Campus da Horta, Portugal
2020/05/25 - 2020/05/25	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado, na área disciplinar de Ciências do Mar e do Ambiente, nas áreas de Oceanografia, Engenharia do Ambiente ou Geociências, Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade do Algarve, 25 de maio de 2020. Vogal.	Universidade do Algarve, Portugal
2020/05/11 - 2020/05/11	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Catedrático, área de Ciências e Engenharia do Ambiente, da Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, 11 de maio de 2020. Vogal.	Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/05/09 - 2020/05/09	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado, área de Ecologia e Ambiente, do Departamento de Ciências da Vida, Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra, 9 de maio de 2020. Vogal.	Universidade de Coimbra, Portugal
2020/04/21 - 2020/04/21	Concurso para provimento de cinco vagas de Professor Associado, área de Biologia, da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto, 21 de abril de 2020. Vogal.	Universidade do Porto, Portugal
2020/04/15 - 2020/04/15	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado, área de Fisiologia e Genética, da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 15 de abril de 2020. Vogal.	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020/04/15 - 2020/04/15	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado, área de Biologia, da Escola de Ciências e Tecnologia da Universidade de Évora, 15 de abril de 2020. Vogal.	Universidade de Évora, Portugal
2020/04/14 - 2020/04/14	Concurso para provimento de uma vaga de Professor Associado, área de Ecologia, da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 14 de abril de 2020. Vogal.	Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Distinções

Prémio

2017	Prigogine Gold Medal Award
2005	Prémio Estímulo à Excelência Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal

Outra distinção

2019	Menção Honrosa atribuída pela Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra pelo impacto das publicações internacionais, segundo o Web of Science, 2018. Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2018	Honorary Member of the Portuguese Ecological Society for his Academic Career and contribute for the development of Ecology in Portugal
2017	Menção Honrosa atribuída pela Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra pelo impacto das publicações internacionais, segundo o Web of Science, 2016 Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal