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Luana Afonso has a degree in Bioprocess Engineering (2017) and a Master's in Biological Sciences (2019). She is currently doing a Ph.D. in Biosciences at the University of Coimbra in a project related to network biology and artificial intelligence in drug discovery. Luana has experience with bioinformatics, such as genomics and transcriptomics analysis and data science projects.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Luana Ferreira Afonso

Nomes de citação

  • Afonso, Luana
  • Afonso LF

Identificadores de autor

Ciência ID
B61E-1382-AC71
ORCID iD
0000-0002-8895-3011

Endereços de correio eletrónico

  • luana.afonso213@gmail.com (Pessoal)

Telefones

Telemóvel
  • (+351) 915900287 (Pessoal)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial - Biotecnologia Industrial
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Formação
Grau Classificação
2023/02/01 - 2027/02/01
Em curso
 Biociências (Doutoramento)
Universidade de Coimbra, Portugal
2017/08/01 - 2019/11/12
Concluído
 Biological Sciences (Biophysics) (Master)
Especialização em Molecular and Structural Biology and Cell Biology
Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Brasil
"Transcriptomic Analysis of Gonads of the Invasive Golden Mussel Limnoperna fortunei and Identification of Potential Genes of its Sexual Development" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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2010/08/16 - 2017/08/16
Concluído
 Bioprocess Engineering (Bachelor)
Especialização em Biotechnology and Industrial Ecology
Universidade Federal do Rio de Janeiro Escola de Química, Brasil
"Evaluation of Physical-Chemical and Biological Treatment Technologies for Wastewater Reuse in the Biodiesel Industry" (TESE/DISSERTAÇÃO)
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Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2014/08/01 - 2016/08/01 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Universidade Federal do Rio de Janeiro Escola de Química, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro Escola de Química, Brasil
2013/07/01 - 2013/12/01 Investigador visitante (Investigação) University of Hull, Reino Unido
University of Hull Department of Chemistry and Biochemistry, Reino Unido
2011/08/01 - 2012/08/01 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Química, Brasil
Laboratório de Catálise em Química Ambiental (LaCQuA), Brasil

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2018/08/09 - 2018/12/06 Assistente (Docente Universitário) Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Brasil

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/02/01 - Atual PhD Scholarship - 2022.12975.BD Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade de Coimbra, Portugal
(...)
2017/01/01 - 2022/12/23 Bioinformatics Scientist Bio Bureau Biotecnologia, Brasil
2016/10/17 - 2017/01/30 Supervised internship Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Brasil
Laboratório de Biologia Molecular Ambiental (BioMA), Brasil
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2012/02/01 - 2012/08/01 Synthesis and Characterization of Metal-Organic Hybrid Structures
n/a
Bolseiro de Iniciação Científica
Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Química, Brasil

Laboratório de Catálise em Química Ambiental (LaCQuA), Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro Fundação COPPETEC
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2020/05 - 2022/12 Control of golden mussel infestation through genetic induction of infertility - Phase 3
PD-10381-0419/2019
Investigador
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Brasil

Bio Bureau Biotecnologia, Brasil
Agência Nacional de Energia Elétrica
Em curso
2018/07/01 - 2020/06/01 Control of golden mussel infestation through genetic induction of infertility - Phase 2
PD-07514-0118/2018
Investigador
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Brasil

Bio Bureau Biotecnologia, Brasil

SENAI Rio, Brasil
Agência Nacional de Energia Elétrica

China Three Gorges
Concluído
2018/04/01 - 2019/05/01 Control of golden mussel infestation through genetic induction of infertility
PD-07514-0002/2017
Investigador
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Brasil

Bio Bureau Biotecnologia, Brasil
Agência Nacional de Energia Elétrica
Concluído
2014/06/01 - 2016/06/30 Applied Research to Wastewater Treatment of Biodiesel Production
Fundação Coppetec - Processo 2012/00323-1
Número SAP N4600.424892
Termo de Cooperação 0050.0082753.13.9
Bolseiro de Investigação
Universidade Federal do Rio de Janeiro Escola de Química, Brasil

Laboratório de Tecnologia Ambiental (LTA), Brasil
Agência Nacional do Petróleo, Gás Natural e Biocombustíveis (ANP)

Petróleo Brasileiro S.A.
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Sales, Adones; Afonso, Luana; Americo, Juliana Alves; de Freitas Rebelo, Mauro; Pastore, Glaucia Maria; Bicas, Juliano Lemos. Autor correspondente: Sales, Adones. "Monoterpene biotransformation by Colletotrichum species". Biotechnology Letters 40 3 (2017): 561-567. http://dx.doi.org/10.1007/s10529-017-2503-2.
    10.1007/s10529-017-2503-2
Poster em conferência
  1. Afonso, Luana; Americo, Juliana Alves; Soares-Souza, Giordano Bruno; Torres, André Luiz Quintanilha; Wajsenzon, Inês Julia Ribas; de Freitas Rebelo, Mauro. "Transcriptomic Analysis of Male and Female Gonads of the Invasive Golden Mussel Limnoperna fortunei". Trabalho apresentado em 65th Brazilian Congress of Genetics, 2019.
Pré-impressão
  1. Juliana Alves Americo; Luana Tatiana Albuquerque Guerreiro; Tayssa Santos Gondim; Yasmin Rodrigues da Cunha; Inês Julia Ribas Wajsenzon; Luana Ferreira Afonso; Giordano Bruno Soares-Souza; Mauro de Freitas Rebelo. "Identification of suitable reference genes for qPCR expression analysis on the gonads of the invasive mussel Limnoperna fortunei". 2019. https://doi.org/10.1101/835447.
    10.1101/835447
  2. Luana Ferreira Afonso; Juliana Alves Americo; Giordano Bruno Soares-Souza; André Luiz Quintanilha Torres; Inês Julia Ribas Wajsenzon; Mauro de Freitas Rebelo. "Gonad transcriptome of golden musselLimnoperna fortuneireveals potential sex differentiation genes". 2019. https://doi.org/10.1101/818757.
    10.1101/818757
Resumo em conferência
  1. Afonso, Luana; do Amaral, Danielle Luciana Aurora Soares; Uliano-Silva, Marcela; Torres, André Luiz Quintanilha; Simas, Daniel Reis; de Freitas Rebelo, Mauro. "First Draft Genome of a Brazilian Atlantic Rainforest Burseraceae reveals commercially-promising genes involved in terpenic oleoresins synthesis". Trabalho apresentado em 7th Brazilian Conference on Natural Product, Rio de Janeiro, 2019.
    Publicado

Outros

Outra produção
  1. Identification of suitable reference genes for qPCR expression analysis on the gonads of the invasive mussel Limnoperna fortunei. The study identifies reference genes to perform gene expression analysis in the gonads of the invasive golden mussel (Limnoperna fortunei) in South America. The stability of five candidate genes (RPS3, EF1a, HS6ST3B, NAPA, and UBE2F) in the gonads of male and female mussels was evaluated using two algorithms: Bestkeeper and Genorm.. 2019. Americo, Juliana Alves; Guerreiro, Luana Tatiana Albuquerque; Gondim, Tayssa Santos; da Cunha, Yasmin Rodrigues; Wajsenzon, Inês Julia Ribas; Afonso, Luana; Soares-Souza, Giordano Bruno; de Freitas Rebelo, Mauro.
  2. Gonad transcriptome of golden mussel Limnoperna fortunei reveals potential sex differentiation genes. The study performs transcriptomic analysis of male and female golden mussel gonads and reveals differentially expressed transcripts in the species. In addition, families of genes relevant to sexual development in various organisms, from mammals to invertebrates, such as Dmrt ('doublesex and mab3-related-transcription factor'), Sox ('SRY-related HMG-box'), and Fox (' forkhead box') were identified.. 2019. Afonso, Luana; Americo, Juliana Alves; Soares-Souza, Giordano Bruno; Torres, André Luiz Quintanilha; Wajsenzon, Inês Julia Ribas; de Freitas Rebelo, Mauro.
  3. First Draft Genome of a Brazilian Atlantic Rainforest Burseraceae reveals commercially-promising genes involved in terpenic oleoresins synthesis. This study presents the first version of the genome of a tree endemic to the Brazilian Atlantic Forest, Protium kleinii Cuatrec., the first characterization of its genes involved in terpene synthesis pathways and the composition of the volatile fraction of the resin of this plant.. 2018. Afonso, Luana; do Amaral, Danielle Luciana Aurora Soares; Uliano-Silva, Marcela; Torres, André Luiz Quintanilha; Simas, Daniel Reis; de Freitas Rebelo, Mauro. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/467720v1.
  4. A sustainable synthetic biology approach for the control of the invasive golden mussel (Limnoperna fortunei). The paper discusses the technical and economic feasibility of using a synthetic biology-based approach to control the invasive mussel Limnoperna fortunei in South American rivers and reservoirs.. 2018. de Freitas Rebelo, Mauro; Afonso, Luana; Americo, Juliana Alves; da Silva, Lucas; Neto, José Lavaquial Biosca; Dondero, Francesco; Zhang, Qiaoying. https://peerj.com/preprints/27164/.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2019/07/03 A sustainable synthetic biology approach for the control of the invasive golden mussel (Limnoperna fortunei) 8th International conference on Energy and Sustainability
Wessex University (Coimbra, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2015/01/19 - 2015/01/20 Assistance in organizing the event "Summer School in Environmental Engineering." (2015/01/19 - 2015/01/27)
Outro (Coorganizador)
 Universidade Federal do Rio de Janeiro Escola Politécnica, Brasil

Universidade Federal do Rio de Janeiro Escola de Química Programa de Engenharia Ambiental, Brasil

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2021/09/22 - 2021/09/24 Participation in Workshop: Metagenomics in the Study of Microbial Communities.
Conferência
 2nd Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference
2021/03/01 - 2021/06/11 Online course entitled "Fundamentals of Python for Data Analysis" with theoretical classes and practical exercises. Content: python for data analysis, file handling, object-oriented programming, databases, machine learning.
Outro
Data Science Academy, Brasil
2020/02/02 - 2020/12/07 Participation in an entrepreneurship program lasting ten months, with weekly workshops, consulting, and business plan development for a biotechnology company in monitoring aquatic biodiversity from environmental DNA.
Outro
 Shell Iniciativa Jovem 2020
Shell Iniciativa Jovem, Brasil
2019/03/16 - 2019/03/22 Course attendance with theoretical and practical classes and taking a test to complete the course. Content: Introduction to Linux and R, R for bioinformatics, workflow for transcriptome analysis.
Outro
 Transcriptome and MicroRNA Analysis
Laboratório Nacional de Computação Científica, Brasil
2018/12/03 - 2019 Participation in the 'Program for Acceleration and Internationalization of High Impact Businesses of the Bioeconomy Macrosegment' of Sebrae (Brazilian Service of Support to Micro and Small Enterprises) with a project to develop a platform for automatic curation of scientific articles, using knowledge of bioinformatics and artificial intelligence domains.
Outro
 Prointer Bio 2018
Serviço Brasileiro de Apoio às Micro e Pequenas Empresas, Brasil
2018/10/30 - 2018/11/01 Lectures, poster presentations, and mini-courses on bioinformatics and computational biology attendance. Courses: Bioinformatics tools for high-performance sequencing. Metagenome analysis using the Galaxy platform.
Simpósio
 11th Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB 2018)
Sociedade Brasileira de Computacao, Brasil

Universidade Federal Fluminense, Brasil

Universidade Federal Fluminense Instituto de Computação, Brasil
2017/10/02 - 2017/10/06 Participation in the event with the work "Evaluation of treatment technologies for wastewater reuse in the biodiesel industry".
Congresso
 29th Congress ABES/FENASAN 2017
Brazilian Association of Water, Sanitation and Environmental Engineering (ABES), Brasil
2014/09/15 - 2014/09/18 Participation in the "Professional of the Future" Program. Attendance in lectures and project presentations from the oil & gas and biofuels sector.
Conferência
 Rio Oil & Gas 2014
Instituto Brasileiro de Petróleo e Gás (IBP), Brasil

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2019/08/06 Participation in the evaluation panel of the final project to conclude a bachelor's degree in Chemical Engineering, entitled 'Study of the Use of Blockchain Technology for Tracking Production Chains of Natural Products.'
Arguente
 Bárbara Shorchit Nogueira (Outro)
Universidade Federal do Rio de Janeiro Escola de Química, Brasil

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2023/06/16 - Atual Presentation of the lecture "Deep Learning for protein sequence and structure" as part of the 3D-BioInfo-PT. Universidade de Coimbra, Portugal
2023/03/18 - Atual Presentation of the lecture "The importance of machine learning in structural biology" as part of the XII Edition of the Bioinformatics Open Days event. Universidade do Minho Biblioteca Pública de Braga, Portugal
2018/08/09 - 2018/12/06 Biodiversity Biophysics (Bachelor) Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Brasil

Entrevista / Programa (rádio / tv)

Programa Tema
2020/03/11 - 2020/03/11 Participation as a speaker at the 3rd Edition of the "Incredible Women" event on the theme of Technology, Innovation and Sustainability at Globosat in Rio de Janeiro, Brazil. Tecnologia, Inovação e Sustentabilidade
Distinções

Outra distinção

2019 English volunteer teacher
Cidadão Pró-Mundo, Brasil
2017 Master's degree scholarship
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, Brasil

Universidade Federal do Rio de Janeiro Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Brasil
2012 Visiting Undergraduate Student Scholarship
Ministério da Ciência Tecnologia e Inovações, Brasil

Ministério da Educação, Brasil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Brasil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, Brasil
2001 Full Academic Merit Scholarship
Centro Educacional da Lagoa, Brasil