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Filipe Gouveia is an Invited Assistant Professor at the Faculty of Sciences of the University of Lisbon. From 2024 to 2025, Filipe was a Software Engineer at SISCOG, in the Department of Innovation, applying Boolean Satisfiability to the generation of non-periodic train schedules. From 2023 to 2024, Filipe was a Research Associate at the Department of Computer Science of the University of Oxford in the Logic and Learning (LOL) group, in the field of Inductive Logic Programming. From 2016 to 2023, Filipe was a researcher at INESC-ID Lisboa in the Automated Reasoning and Software Reliability (ARSR) group. Filipe obtained an MSc in Information Systems and Computer Engineering from IST - Universidade de Lisboa in 2012. Then, he worked in the private sector, as a software developer. In 2021, he obtained a Ph.D. in Computer Science and Engineering from IST - Universidade de Lisboa, being approved with distinction. During his Ph.D., he was awarded a doctoral grant from Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT). His Ph.D. work focused on the application of logic-based approaches and algorithms to revise Boolean logical models of biological regulatory networks. His research interests are included in the field of artificial intelligence, such as algorithms for computational logic, constraint solving, and optimization. He enjoys addressing practical problems with logic-based approaches, namely problems in the biology field. Other research interests include program synthesis, machine learning, and natural language processing. From 2017 to 2023, Filipe was a teaching assistant at IST - Universidade de Lisboa, in the Department of Computer Science, in several courses of the areas of algorithms, and artificial intelligence, being awarded IST Excellent Teacher for four years.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
João Filipe Rosado Gouveia

Nomes de citação

  • Filipe Gouveia
  • Gouveia, Filipe

Identificadores de autor

Ciência ID
FF10-8917-D9E9
ORCID iD
0000-0003-1852-2782
Google Scholar ID
h0orKuoAAAAJ
Researcher Id
AAA-7225-2022

Endereços de correio eletrónico

  • jfgouveia@ciencias.ulisboa.pt (Profissional)
  • filipe.gouveia@tecnico.ulisboa.pt (Profissional)

Moradas

  • Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa. Rua Alves Redol, nº 9, 1000-029, Lisboa, Lisboa, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Ciências da Computação
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática
Formação
Grau Classificação
2016/02 - 2021/09/17
Concluído
 Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Model Revision of Boolean Logical Models of Biological Regulatory Networks" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Pass with Distinction
2012
Concluído
 Mestrado em Engenharia Informática e de Computadores (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Protein Design using Answer Set Programming" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 18/20
2010
Concluído
 Licenciatura em Engenharia Informática e de Computadores (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 15/20
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2023/09/01 - 2024/06/28 Investigador Contratado (Investigação) University of Oxford - Department of Computer Science, Reino Unido
2022/01/01 - 2023/06/30 Investigador Contratado (Investigação) Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
2018/01 - 2021/02 Investigador (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
2016/01 - 2017/12 Investigador (Investigação) Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
2011/09 - 2013/02 Estagiário de Investigação (Investigação) Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2025/09/02 - Atual Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Outras Carreiras

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2024/09/02 - 2025/09/01 Carreiras / Categorias Subsistentes SISCOG - Sistemas Cognitivos, S.A., Portugal
2013/03 - 2015/10 Técnico Superior (Técnico Superior) Altice Portugal, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2018/01/01 - 2021/02/28 PhD Grant - Inference and Revision of Models of Biological Regulatory Networks
SFRH/BD/130253/2017
Bolseiro de Doutoramento
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2016/01 - 2016/06 DataStorm - Large scale management in cloud environments
EXCL/EEI-ESS/0257/2012
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2011/09 - 2012/09 ASPEN - Answer Set Programming with BoolEaN Satisfiability
PTDC/EIA-CCO/110921/2009
Bolseiro de Mestrado
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Projeto

Designação Financiadores
2022/01 - Atual GOLEM: Automated Programming to Revolutionize App Development
ANI 045917
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

European Regional Development Fund
Em curso
2016/07/01 - 2019/06/30 ERGODiC - Métodos formais para a análise da dinâmica de redes modulares de regulação genética
PTDC/EEI-CTP/2914/2014
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2023/03/12 - Atual Reasoning over Indirect Discrimination
2022.03537.PTDC
Co-Investigador Responsável (Co-IR)
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Minghao Liu; David M. Cerna; Filipe Gouveia; Andrew Cropper. "Scalable Knowledge Refactoring Using Constrained Optimisation". 2025.
    10.1609/aaai.v39i14.33650
Artigo em revista
  1. Lemos, Alexandre; Gouveia, Filipe; Monteiro, Pedro T.; Lynce, Inês. "Iterative Train Scheduling under Disruption with Maximum Satisfiability". Journal of Artificial Intelligence Research 79 (2024): 1047-1090. http://dx.doi.org/10.1613/jair.1.14924.
    Publicado • 10.1613/jair.1.14924
  2. Filipe Gouveia; Inês Lynce; Pedro T. Monteiro. "Revision of Boolean Models of Regulatory Networks Using Stable State Observations". Journal of Computational Biology 27 2 (2020): 144-155. http://dx.doi.org/10.1089/cmb.2019.0289.
    10.1089/cmb.2019.0289
  3. Filipe Gouveia; Inês Lynce; Pedro T. Monteiro. "Model Revision of Logical Regulatory Networks Using Logic-Based Tools". (2018): http://drops.dagstuhl.de/opus/volltexte/2018/9889/.
    10.4230/oasics.iclp.2018.23
Capítulo de livro
  1. Filipe Gouveia; Luís Albino; Ricardo L. Saldanha. "A MaxSAT Approach for the Train Timetabling Problem with Route Choice and Other Features". 2026.
    10.1007/978-3-032-05179-0_14
  2. Rafael Gonçalves; Filipe Gouveia; Inês Lynce; José Fragoso Santos. "Proxy Attribute Discovery in Machine Learning Datasets via Inductive Logic Programming". 2025.
    10.1007/978-3-031-90653-4_17
  3. Filipe Gouveia; Inês Lynce; Pedro T. Monteiro. "ModRev - Model Revision Tool for Boolean Logical Models of Biological Regulatory Networks". 339-348. Springer International Publishing, 2020.
    10.1007/978-3-030-60327-4_18
  4. Filipe Gouveia; Inês Lynce; Pedro T. Monteiro. "Model Revision of Boolean Regulatory Networks at Stable State". 2019.
    10.1007/978-3-030-20242-2_9
  5. Filipe Gouveia; Pedro T. Monteiro; Manquinho, Vasco; Inês Lynce. "Logic-Based Encodings for Ricochet Robots". 2017.
    10.1007/978-3-319-65340-2_54

Outros

Outra produção
  1. Semi-automatic model revision of Boolean regulatory networks: confronting time-series observations with (a)synchronous dynamics. 2020. Filipe Gouveia; Inês Lynce; Pedro T. Monteiro. https://doi.org/10.1101/2020.05.10.086900.
    10.1101/2020.05.10.086900
Atividades

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2022/11 - 2023/02 Analysis and Synthesis of Algorithms (Análise e Síntese de Algoritmos) Ciências de Engenharia - Engenharia Informática e de Computadores (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico Campus Taguspark, Portugal
2022/09 - 2022/11 Algorithms for Computational Logic (Algoritmos para Lógica Computacional) Engenharia Informática e de Computadores (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2020/09 - 2021/02 Natural Language (Língua Natural) Engenharia Informática e de Computadores (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2020/02 - 2020/07 Analysis and Synthesis of Algorithms (Análise e Síntese de Algoritmos) Engenharia Informática e de Computadores (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico Campus Taguspark, Portugal
2019/09 - 2020/02 Natural Language (Língua Natural) Engenharia Informática e de Computadores (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2019/02 - 2019/07 Analysis and Synthesis of Algorithms (Análise e Síntese de Algoritmos) Engenharia Informática e de Computadores (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2018/02 - 2018/07 Analysis and Synthesis of Algorithms (Análise e Síntese de Algoritmos) Engenharia Informática e de Computadores (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2017/02 - 2017/07 Introduction to Algorithms and Data Structures (Introdução a Algoritmos e Estrutura de Dados) Engenharia Informática e de Computadores (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico Campus Taguspark, Portugal
Distinções

Outra distinção

2022 IST Excellent Teachers 2020/2021 (IST Docentes Excelentes 2020/2021)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2021 IST Excellent Teachers 2019/2020 (IST Docentes Excelentes 2019/2020)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2020 IST Excellent Teachers 2018/2019 (IST Docentes Excelentes 2018/2019)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2011 Diploma of Merit
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal