Identification
Personal identification
- Full name
- Paulo José Martel
Citation names
- Martel, Paulo
Author identifiers
- Ciência ID
- AD16-8C2A-26CE
- ORCID iD
- 0000-0001-8237-1267
Email addresses
- pmartel@ualg.pt (Professional)
Addresses
- Faculdade de Ciências Bd.8, Universidade do Algarve, 8005-139, Faro, Faro, Portugal (Professional)
Knowledge fields
- Natural sciences - Biological Sciences - Biophysics
- Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Bioinformatics
Languages
Language | Speaking | Reading | Writing | Listening | Peer-review |
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Portuguese (Mother tongue) | |||||
English | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) | Proficiency (C2) |
Spanish; Castilian | Intermediate (B1) | Advanced (C1) | Elementary (A2) | Advanced (C1) | Intermediate (B1) |
French | Elementary (A2) | Upper intermediate (B2) | Elementary (A2) | Elementary (A2) | Elementary (A2) |
Education
Degree | Classification | |
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1989/11/01 - 2006/06/01
Concluded
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Protein Electrostatics: Theory, Methods and Applications (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
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1995 - 1999
Concluded
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Molecular modelling of electron transfer in redox proteins (Pós-doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
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1982 - 1988
Concluded
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Bioquímica (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
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16 |
Affiliation
Science
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2021/01/01 - Current | Principal Investigator (Research) | Centro de Investigação em Tecnologias e Serviços de Saúde, Portugal |
Universidade do Algarve, Portugal |
Teaching in Higher Education
Category Host institution |
Employer | |
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1999/03/01 - Current | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal |
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal |
Positions / Appointments
Category Host institution |
Employer | |
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2013 - 2017 | Conselho Geral | Universidade do Algarve, Portugal |
Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal | ||
2004 - 2014 | Director, CBME | Universidade do Algarve, Portugal |
Centro de Biomedicina Molecular e Estrutural, Portugal |
Projects
Grant
Designation | Funders | |
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2023/03 - 2033/09 | Search for molecular modulators of Foxo3a activity
2022.28046.CPCA.A0
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Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2024 - 2024 | Implementation of a Constant-pH Molecular Dynamics Simulation Protocol for proteins and its application to the study of the
binding of the SARS-CoV-2 S S-protein to the ACE2 human protein receptor
2023.14302.CPCA.A0
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2023/03/01 - 2023/09/30 | Search for molecular modulators of Foxo3a activity
2022.28046.CPCA.A0
Principal investigator
Universidade do Algarve - Campus de Gambelas, Portugal
Centro de Investigação em Tecnologias e Serviços de Saúde, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia Rede Nacional de Computação Avançada Concluded
|
2012/02 - 2015/10 | Alternative splicing and its impact on molecular networks during stem cell differentiation | Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2012/02 - 2015/04 | A Biophysical Approach to Oxidative Protein Folding in the ER: Relative Importance of Ero1 and Prdx4 alternative pathways | Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2009/01 - 2012/12 | Thermodynamic Signature of the Pregnane Xenobiotic Receptor Activation by Quartz Crystal Microbalance with Heat Conduction Calorimetry | Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2009/01 - 2012/06 | Biomolecular Engineering Approches for in vitro Production of Self Assembly Viral Nanoparticles | Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2005/04 - 2008/06 | Theoretical and Experimental Studies of Enzyme Conformation, Energetics and Dynamics of CYP3A4 | Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2003 - 2005 | Relationship between CYP3A4 gene polymorphisms, protein structure and activity in disease setting
POCTI/MGI/48417/2002
|
Ministério da Ciência Tecnologia Inovações e Comunicações |
2002 - 2004 | Structure and function of elicitins and their role in the infection of the cork oak by Phytophthora cinnamomi
POCTI/BME/34701/99
|
Ministério da Ciência Tecnologia Inovações e Comunicações |
2001 - 2003 | Molecular modelling of bacterial redox proteins: methodology and applications
POCTI/BME/32789/99
|
Ministério da Educação |
2000 - 2002 | Structure-function relationships of serine hydrolases in non-conventional solvents
PRAXIS/P/BIO/14314/1998
|
Ministério da Educação |
1996 - 1998 | Molecular modelling of electron-transfer proteins
PBIC/C/BIO/2037/95,
|
Ministério da Educação |
Contract
Designation | Funders | |
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2025/01/01 - 2027/12/31 | expressCDx - Identification of RNA Biomarkers for the Development of New Personalized Cancer Diagnostic Methods
Principal investigator
Universidade do Algarve, Portugal
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2011/01/01 - 2012/12/31 | Projecto Estratégico - LA 23 - 2011-2012
PEst-OE/EQB/LA0023/2011
PEst-C/SAU/LA0026/2011
Universidade do Algarve, Portugal
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal Instituto de Biotecnologia e Bioengenharia, Portugal Universidade do Minho, Portugal Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal Universidade dos Açores, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
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2009/01/01 - 2012/12/31 | Caracterização Termodinâmica da Activação do Receptor de Pregnanos PXR através da Técnica da Microbalança de Cristal de Quartzo
com Calorimetria de Condução de Calor
PTDC/QUI/72631/2006
Universidade do Algarve, Portugal
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2005/04/01 - 2008/06/30 | Estudos Teóricos e Experimentais sobre Conformação, Energética e Dinâmica Enzimática do Citocromo CYP3A4
POCI/QUI/63166/2004
Universidade do Algarve, Portugal
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
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Outputs
Publications
Book |
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Book chapter |
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Conference abstract |
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Conference poster |
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Journal article |
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Activities
Supervision
Thesis Title Role |
Degree Subject (Type) Institution / Organization |
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2020/03 - 2022/12/15 | Descoberta de moléculas moduladoras da interação Foxo3-DNA
Supervisor
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Ciências Farmacêuticas (Master)
Universidade do Algarve, Portugal
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2010 - 2015 | Optimization of Molecular Dynamics Simulation Code and Applications to Biomolecular Systems
Supervisor of David Malcolm Bowman
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Computational Biochemisry (PhD)
Universidade do Algarve Centro de Investigação em Biomedicina, Portugal
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Event organisation
Event name Type of event (Role) |
Institution / Organization | |
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2022/10/10 - 2022/10/13 | 11th IBERGRID Iberian Grid Computation Conference (2022/10/10 - 2022/10/13)
Conference (Co-organisor)
|
Infraestrutura Nacional de Computação Distribuída, Portugal Universidade do Algarve, Portugal Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Spain Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas, Portugal |
Event participation
Activity description Type of event |
Event name Institution / Organization |
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2024/01/24 - 2024/01/25 | Running GROMACS molecular modelling software on the LUMI supercomputer.
Workshop
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Running GROMACS efficiently on LUMI workshop 2024
EuroHPC Joint Undertaking, Luxembourg
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2023/12/06 - 2023/12/09 | EMBO Workshop: Computational structural biology
Conference
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EMBO Workshop: Computational structural biology
European Molecular Biology Laboratory, Germany
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2021/11/02 - 2021/11/04 | 3D-BioInfo 2021 Annual Meeting: Structural bioinformatics
Conference
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3D-BioInfo 2021 Annual Meeting
ELIXIR, Wellcome Genome Campus, United Kingdom
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2021/05/04 - 2021/05/05 | PDB50: A special symposium celebrating the 50th anniversary of the Protein Data Bank
Conference
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PDB50: A special symposium celebrating the 50th anniversary of the Protein Data Bank
World Wide Protein Databank, United States
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Jury of academic degree
Topic Role |
Candidate name (Type of degree) Institution / Organization |
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2023/07/03 | Bis-ureias derivadas de benzo[b]tiofeno para a inibição de agregados Aß-LilrB2 na Doença de Alzheimer: uma investigação in
silico
(Thesis) Main arguer
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Joel José Pereira Santos (Master)
Universidade de Aveiro, Portugal
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2023/05/16 | A new generation of user-friendly and machine learning-accelerated methods for protein pKa calculations
(Thesis) Main arguer
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Pedro de Brito Pires Santos Reis (PhD)
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
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2023/04/14 | Interacções proteína-proteína e proteína-RNA na proteína não-estrutural 1 (NS1) do vírus Influenza
(Thesis) Main arguer
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Nícia Filipa Rosário Ferreira (PhD)
Universidade de Coimbra, Portugal
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Committee member
Activity description Role |
Institution / Organization | |
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2013 - Current | Member of the Scientific Committee for Neurosciences Scientific Prizes of Santa Casa da Misericórdia de Lisboa. Duties including
evaluatio of grant progress reports and counselling an all issues related with prize regulations and management of applications.
Advisor / Consultant
|
Santa Casa da Misericórdia de Lisboa, Portugal |
Course / Discipline taught
Academic session | Degree Subject (Type) | Institution / Organization | |
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2014/09/22 - Current | Molecular modelling and Computational Drug Design | Ciências Farmacêuticas (Mestrado integrado) | Universidade do Algarve, Portugal |
2013 - Current | Computational Biology | Ciências Biomédicas (Mestrado integrado) | Universidade do Algarve, Portugal |
2004/10/01 - Current | Bioinformática | Bioquímica | Universidade do Algarve, Portugal |
2004/02/01 - Current | Bioquímica Estrutural | Bioquímica (Licenciatura) | Universidade do Algarve, Portugal |
1999/03/01 - Current | Enzymology | Bioquímica (Licenciatura) | Universidade do Algarve, Portugal |
Other jury / evaluation
Activity description | Institution / Organization | |
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2018 - Current | Member of evaluation panel for Agência Nacional de Informação (ANI) research grants. | Agência Nacional de Inovação SA, Portugal |