Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- Ana Usié Chimenos
Nomes de citação
- Usié, Ana
- Usié, A.
Identificadores de autor
- Ciência ID
- 0514-DE42-4619
- ORCID iD
- 0000-0002-3364-9434
Endereços de correio eletrónico
- ana.usie@cebal.pt (Profissional)
Telefones
- Telefone
-
- 284314399 Ext.: 01107 (Profissional)
Moradas
- CEBAL -Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-alimentar do Alentejo. Rua Pedro Soares, s.n. - Campus IPBeja / ESAB. Apartado 6158, 7801-908, Beja, Beja, Portugal (Profissional)
Websites
- www.cebal.pt (Profissional)
Domínios de atuação
- Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
- Ciências Agrárias - Agricultura, Silvicultura e Pescas
- Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Eletrotécnica, Eletrónica e Informática
Idiomas
Idioma | Conversação | Leitura | Escrita | Compreensão | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Espanhol; Castelhano (Idioma materno) | |||||
Catalão (Idioma materno) | |||||
Português | Utilizador independente (B2) | Utilizador independente (B2) | Utilizador independente (B2) | Utilizador independente (B2) | Utilizador independente (B2) |
Inglês | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador independente (B2) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) |
Formação
Grau | Classificação | |
---|---|---|
2023/03/03 - 2023/03/31
Concluído
|
Train the trainer (Outros)
Elixir UK , Reino Unido
|
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2022/02/21 - 2022/11/17
Concluído
|
Ready for BioData Management?: Data Stewardship for Life Sciences Training Program (Outros)
Especialização em Data stewerdship
BioData.pt, Portugal
|
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2014/01/28
Concluído
|
Programa de Doutoramento em Ciências da Saúde. (Doutoramento)
Especialização em Bioinformática
Universitat de Lleida, Espanha
"Development of computational tools to assist in the reconstruction of molecular networks" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
Cum Laude |
2010 - 2011
Concluído
|
Teacher of leisure activities for children and young people (Outros)
Escola de formació de minyons escoltes i guies de Catalunya, Espanha
|
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2010
Concluído
|
Master's degree in Engineering of Free Software (Master)
Universitat de Lleida, Espanha
"Biblio-MetReS: A bibliometric network reconstruction application and server" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
8.44 over 10 |
2010
Concluído
|
Senior Computer Engineering degree (Master)
Universitat de Lleida, Espanha
"Aproximaciones distribuidas para problemas de satisfactibilidad" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
8.08 over 10 |
2007/09 - 2008/01
Concluído
|
Certificate of Pedagogical Aptitude (CAP) (Outros)
Especialização em Docência
Institut de Ciencies de l'Educació (ICE), Universitat de Lleida, Espanha
|
|
2007
Concluído
|
Technical Engineering in Computer Management degree (Graduado)
Universitat de Lleida, Espanha
"Diseño e implementación de una aplicación para informatizar la empresa Tot Hivern S.L." (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
6.9 over 10 |
Percurso profissional
Ciência
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2022/04/01 - Atual | Investigador Contratado (Investigação) | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2020/09/01 - 2022/03/31 | Investigador Contratado (Investigação) | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2020/02/01 - 2020/08/31 | Pós-doutorado (Investigação) | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2016/09/01 - 2020/01/31 | Pós-doutorado (Investigação) | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2015/11/01 - 2016/08/31 | Pós-doutorado (Investigação) | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2014/03/01 - 2015/10/31 | Pós-doutorado (Investigação) | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
Outros
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2020/01/01 - Atual | Integrated Researcher | MED - Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development, Portugal |
2017 - Atual | Collaborative Research Member | Lleida Biomedical Research Institute (IRBLleida), Espanha |
Systems biology and statistical methods for biomedical research, Espanha | ||
2014/03 - Atual | Administration and management of the website of CEBAL | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2014/03 - Atual | Administration and management of the technical computer service | Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2016/12/20 - 2019/12/31 | Integrated Researcher | Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal |
2008/01/01 - 2015/04/30 | Administration and management of the website for the Master of Integrated Production of Crops (PIC) | Universitat de Lleida, Espanha |
2009/10/15 - 2014/01/31 | Ph.D Student in Bioinformatics. | Universitat de Lleida, Espanha |
2011/07/01 - 2011/12/31 | Short Stay as a Ph. D student. | Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Espanha |
Projetos
Projeto
Designação | Financiadores | |
---|---|---|
2023/12 - Atual | SOS Prodehesa Montado - MODELOS DE SOSTENIBILIDAD INTEGRAL Y RESILENCIA DE LA DEHESA-MONTADO FRENTE A LAS AMENAZAS CLIMÁTICAS.
0086_SOS_Prodehesamontado_4_E
Investigador
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
España Ministerio de Ciencia e Innovación
Em curso
|
2022/04 - Atual | CEEC Institucional - Contrato Programa
CEECINST/00100/2021/CP2774/CT0001
Investigador
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2023/03/01 - 2026/02/28 | ARIES - The variation of Iberian sheep under domestication: an archaeogenetics study
2022.04843.PTDC
Investigador
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2021/01/01 - 2025/12/31 | CHANGE - Instituto para as Alterações Globais e Sustentabilidade
LA/P/0121/2020
Universidade do Algarve, Portugal
Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal Universidade de Évora, Portugal Universidade Nova de Lisboa Centro de Investigação em Ambiente e Sustentabilidade, Portugal Universidade NOVA de Lisboa, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2020/09/01 - 2022/03/31 | Programa de Potenciação de Transferência de Tecnologia do CEBAL-Reforço de Capital Humano Altamente Qualificado de Interface
ALT20-05-3559-FSE-000076
Investigador
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Agência de Desenvolvimento Regional do Alentejo
Concluído
|
2021/03/01 - 2021/06/30 | Link Me Up - 1000 ideas - Co-creation Project: Local & Digital
Mentor & Stakeholder representative
Instituto Politécnico de Beja, Portugal
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
Autoridade de Gestão do Programa Operacional Competitividade e Internacionalização
Concluído
|
2020/02/01 - 2020/08/31 | SelectPinea - Development of genetic markers for traits of interest in Stone Pine (Pinus pinea)
ALT20-03-0145-FEDER-000041
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Agência de Desenvolvimento Regional do Alentejo
Concluído
|
2016/09/01 - 2020/01/31 | SelectPorAl - Genomic selection and improvement of productive traits in the Alentejo Pig
ALT20-03-0145-FEDER-000032
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Agência de Desenvolvimento Regional do Alentejo
Concluído
|
2019/01/01 - 2019/12/31 | Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas
UID/AGR/00115/2019
Universidade de Évora, Portugal
Instituto Mediterrâneo para a Agricultura Ambiente e Desenvolvimento, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
2015/11/01 - 2016/08/31 | Genomics and Bioinformatics applied to Portuguese plant and animal genetic resources.
IF/01015/2013/CP1209/CT0001
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
2014/03/01 - 2015/06/30 | GenoSuber – sequencing cork oak’s genome
ALENT-57-2011-20
Investigador
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
|
Agência de Desenvolvimento Regional do Alentejo
Concluído
|
2010 - 2014/01/28 | METRES (METABOLIC RECONSTRUCTION SERVER DESARROLLO Y APLICACION EN EN ESTUDIO DE PRINCIPIOS DE DISEÑO BIOLOGICO
BFU2010-17704
Bolseiro de Doutoramento
|
España Ministerio de Ciencia e Innovación
Concluído
|
2009/10/15 - 2010 | Desarrollo y aplicacion de metodologias computacionales integradas para Biologia Molecular de Sistemas.
BFU2007-62772/BMC
Bolseiro de Doutoramento
Universitat de Lleida, Espanha
|
España Ministerio de Ciencia e Innovación
Concluído
|
Produções
Publicações
Artigo em conferência |
|
Artigo em revista |
|
Artigo em revista (magazine) |
|
Poster em conferência |
|
Pré-impressão |
|
Recurso online |
|
Resumo em conferência |
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Tese / Dissertação |
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Atividades
Apresentação oral de trabalho
Título da apresentação | Nome do evento Anfitrião (Local do evento) |
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2023/11/28 | Centro de Competências da Lã: Contributos do CEBAL para o Plano de Ação | Ciclo de webinars às terças
Direção Regional da Conservação da Natureza e Florestas do Alentejo (Online)
|
2023/11/24 | Utilização da genómica no estudo da peeira ovina no Alentejo | OviCapri - V Simpósio de Ovinos e Caprinos
IAAS-UTAD- Associação Internacional de Estudantes de Agricultura da Universidade (Vilareal, Portugal)
|
2023/10 | Estudio genómico de la raza ovina autóctona portuguesa churra algarvia | XXIV Simposio Iberoamericano CONBIAND sobre conservación y utiliación de recursos zoogenéticos
(Veracruz, México)
|
2023/05/16 | Genome-wide diversity and population structure analysis of four Portuguese native sheep breeds | International Seminar on Climate Change and Animal Genetic Improvement
(Online)
|
2022/12/01 | Charactericacion of the footrot micobiome in portuguese sheep breeds through metagenomics. | Congreso Hispano-luso de Ganadería Extensiva y Desarrollo Rural. "Sostenibilidad Garantizada"
(Cáceres, Espanha)
|
2022/09/30 | Caracterização do microbioma da peeira através da utilização de novas tecnologias de sequenciação | Do diagnóstico clínico da peeira à bioinformática: desafios e oportunidades; Patrimónios do Sul
CEBAL - Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-alimentar do Alentejo (Beja, Portugal)
|
2022/07/12 | Inovação no Montado: "Do ADN à rolha" | Ciclo de webinars às terças
Direção Regional da Conservação da Natureza e Florestas do Alentejo (Online, Portugal)
|
2022/05/26 | Kinship Analysis and Pedigree Reconstruction of a Natural Regenerated Cork Oak (Quercus suber) Population | Conselho Geral do Centro de Competências do Sobreiro e da Cortiça
Centro de Competências do Sobreiro e da Cortiça (Coruche, Portugal)
|
2022/04/01 | Whole genome analyses as a tool for improvement and valorisation of local livestock breeds | XIV Jornadas de Genética e Biotecnologia /IV Jornadas Ibéricas de Genética e Biotecnologia
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro (Portugal) & universidade de León (Spain) (Vila Real, Portugal)
|
2021/10/29 | Identification of high quality SNPs for traceability purposes in the pig using whole genome resequencing analyses. | XXII Congresso de Zootecnia
(Portugal)
|
2021/07/26 | Unveiling genomic regions that underlie footrot resistance in Portuguese sheep Merino | ISAG 2021 – 38th International Society for Animal Genetics Conference |
2020/12/01 | Analysis of the sheep footrot microbiome using whole-metagenome sequencing | 71st Annual Meeting of European Federation of Animal Science |
2020/02/20 | Characterization of genomic variation in Portuguese sheep breeds using whole genome resequencing | IX Bioinformatics Open Days
(Braga, Portugal)
|
2019/11/11 | Whole genome sequencing analysis as a powerful tool to dissect the genomic architecture of indigenous Portuguese pig and sheep breeds | IV Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura (EEDAA)
(Évora, Portugal)
|
2019/06/27 | Genoma do sobreiro | JORNADAS MED
Universidade de Évora, ICAAM (Évora, Portugal)
|
2016/10/07 | Sequenciação do genoma do sobreiro: projecto Genosuber | Simpósio Internacional do Montado
(Beja, Portugal)
|
2016/02/18 | The draft assembly and annotation of the cork oak (Quercus suber L.) genome | V Bioinformatics Open Days
(Braga, Portugal)
|
2015/06/14 | The draft assembly and annotation of the cork oak (Quercus suber L.) genome | XXI Meeting of the Spanish Society of Plant Physiology, XIV Iberian Meeting of Plant Physiology
Spanish Society of Plant Physiology (Toledo, Espanha)
|
2012/01/23 | Homol-MetReS: A web application for integration between molecular systems biol-ogy and evolutionary biology. | XI Jornadas de Bioinformática
(Barcelona, Espanha)
|
Orientação
Título / Tema Papel desempenhado |
Curso (Tipo) Instituição / Organização |
|
---|---|---|
2023/10 - Atual | Identification and characterization of long-non-coding RNAs in heat stress response in two Portuguese durum wheat (Triticum
durum) varieties
Orientador de Miguel Graça
|
Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
2023/09 - Atual | Comparative analysis of transcriptional response to heat stress in two Portuguese durum wheat (Triticum durum) varieties.
Orientador de Pedro Sequeira
|
Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
2021/08/01 - Atual | Genomic and bioinformatics methodologies for the identification of genetic markers in sheep
Coorientador de Daniel Gaspar
|
Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal |
2023/05/19 - 2023/07/14 | Bioinformática através da análise de dados de sequenciação do tipo RNA-Seq em Triticum durum
Orientador de Yole José Albino
|
Tecnologias Bioanalíticas (Licenciatura/Bacharelato)
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
Instituto Politécnico de Beja Escola Superior Agrária, Portugal |
2020/03/01 - 2021/03/22 | Variation detection in organelle genomes of Quercus species
Coorientador de Ana Rita Moreira Ferreira
|
Mestrado em Bioinformática e Aplicações às Ciências da Vida (Mestrado)
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2012 - 2012 | Biblio-MetReS: Contribucions per a la implantació de la precompilació
Coorientador de David Terés Carrillo
|
Technical Engineering in Computer Management degree (Licenciatura/Bacharelato)
Universitat de Lleida, Espanha
|
2011 - 2011 | Disseny i implementació de l'aplicació Protein-MetReS
Coorientador de Adrià Ramirez Trallero; Silvia Massot Esteve
|
Technical Engineering in Computer Management degree (Licenciatura/Bacharelato)
Universitat de Lleida, Espanha
|
Organização de evento
Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação) |
Instituição / Organização | |
---|---|---|
2023/04/28 - 2023/04/28 | QUIZZ "À descoberta do montado: quem sabe mais?". Este evento foi realizado no contexto da feira anual "OviBeja" de Beja.
(2023/04/28)
Outro (Outra)
|
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2022/09/30 - 2022/09/30 | Seminário "Do diagnóstico clínico da peeira à bioinformática: desafios e oportunidades". Este seminário foi realizado no contexto
da feira anual "Patrimónios do Sul" de Beja. (2022/09/30)
Seminário (Membro da Comissão Organizadora)
|
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2019 - 2019 | Colaboration in the organization of the institutional stand at the 36th OviBeja for the science outreaching of CEBAL’s projects
and main intervention areas. (2019/04/24 - 2019/04/28)
Exposição
|
|
2018/02 - 2018/05/18 | Commemoration of the 10th anniversary of CEBAL "Semana Aberta do CEBAL – Comemoração do 10º aniversário do CEBAL". Organization
of scientific activities for children, visits to experimental fields, talks with researchers, technological demonstrations,
technical scientific events. (2018/05/14 - 2018/05/18)
Outro (Coorganizador)
|
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2018 - 2018 | Colaboration in the organization of the institutional stand at the 35th OviBeja for the science outreaching of CEBAL’s projects
and main intervention areas. (2018/04/27 - 2018/05/01)
Exposição
|
|
2017 - 2017 | Colaboration in the organization of the institutional stand at the 34th OviBeja for the science outreaching of CEBAL’s projects
and main intervention areas. (2017/04/27 - 2017/05/01)
Exposição
|
|
2015/02 - 2015/03/18 | Workshop InovAgro: Inovação e Qualidade na Transformação de Produtos Agroalimentares (2015/03/18)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
|
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
2015/01 - 2015/02/25 | Workshop NewVal: Novas valorizações de matérias-primas e resíduos agro-industriais e agro-florestais (2015/02/25)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
|
Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal |
Júri de grau académico
Tema Tipo de participação |
Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização |
|
---|---|---|
2016 | Design principles in Two component Systems and His-Asp Phosphorelays
Arguente
|
Baldiri Salvadó (Doutoramento)
Universitat de Lleida, Espanha
|
Arbitragem científica em conferência
Nome da conferência | Local da conferência | |
---|---|---|
2022/06/27 - 2022/06/28 | III International Meeting of Portuguese Society of Genetics | Évora |
Arbitragem científica em revista
Nome da revista (ISSN) | Editora | |
---|---|---|
2023/09/01 - Atual | Forests (1999-4907) | MDPI |
2023/09/01 - Atual | Plants (2223-7747) | MDPI |
2023/09/01 - Atual | Animals (2076-2615) | MDPI |
Curso / Disciplina lecionado
Disciplina | Curso (Tipo) | Instituição / Organização | |
---|---|---|---|
2023/09 - 2024/01 | Bioinformatics and Systems Biology | Bachelor's degree Biomedical Sciences | Universitat de Lleida, Espanha |
2023/09 - 2024/01 | Bioinformatics | Bachelor's degree Biotecnology | Universitat de Lleida, Espanha |
2022/09 - 2023/01 | Bioinformatics and Systems Biology | Bachelor's degree Biomedical Sciences | Universitat de Lleida, Espanha |
2022/09 - 2023/01 | Bioinformatics | Bachelor's degree Biotecnology | Universitat de Lleida, Espanha |
2013 - 2014 | Bioinformatics and Systems Biology | Bachelor's degree Biomedical Sciences | Universitat de Lleida, Espanha |
2013 - 2014 | Bioestadistics | Bachelor's degree Medicine | Universitat de Lleida, Espanha |
2013 - 2014 | Bioinformatics | Bachelor's degree Biotecnology | Universitat de Lleida, Espanha |
2012 - 2013 | Bioinformatics | Bachelor's degree Biotecnology | Universitat de Lleida, Espanha |
2012 - 2013 | Bioinformatics and Systems Biology | Bachelor's degree Biomedical Sciences | Universitat de Lleida, Espanha |
Outro júri / avaliação
Descrição da atividade | Instituição / Organização | |
---|---|---|
2022/06/21 - 2022/06/21 | Member of the Jury at the Annual Monitoring & Evaluation Session of Ph. D. Students of the Interuniversity Doctoral Program in Bioinformatics of the Catalan University System; M. D. - (3rd year student); M. G. - (1st year student); S. S. - (1st year student); P. F. - (4th year student) | Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha Universitat de Girona, Espanha Universitat de Lleida, Espanha Universitat de Vic, Espanha Universitat Politècnica de Catalunya, Espanha Universitat Oberta de Catalunya, Espanha |
Tutoria
Tópico | Nome do aluno | |
---|---|---|
2024/01 - Atual | Mentor - Bioinformatics research trainee. | Catarina Macedo |
2018/04/01 - 2019/03/31 | Mentor - Bioinformatics research trainee. | Bruna Mendes |
2017/02/01 - 2018/01/31 | Mentor - Bioinformatics research trainee. | Célia Leão |
2015/10 - 2016/04 | Mentor - Bioinformatics research trainee. | Daniel Gaspar |
2015/10 - 2016/04 | Mentor - Bioinformatics research trainee. | Brigida Meireles |
2013/03 - 2013/10 | Mentor - Rotatorium Task - Bioinformatics. | Jorge Comas |
2013/01 - 2013/10 | Mentor - Rotatorium Task - Bioinformatics. | Joaquim Cruz |
Distinções
Prémio
2016 | Extraordinary award of Best Ph.D Thesis
Universitat de Lleida, Espanha
|
2015 | Empreendedorismo e Inovação do Crédito Agrícola, na categoria “Projetos de Elevado Potencial Promovido por Associado do Crédito Agrícola” - Projecto Genosuber |
2015 | Vida Rural Alqueva na categoria “Investigação e Desenvolvimento – Floresta” - Projecto Genosuber |
Outra distinção
2023 | Tenure lecturer acreditation for teaching staff
Agencia para la Calidad del Sistema Universitario de Cataluna, Espanha
|