Dr Rui Figueira is the GBIF node manager for Portugal since 2013 and an Associate Professor of the Instituto Superior de Agronomia (ISA). After completing his PhD in Ecology by the University of Lisbon in 2002, he was Invited Assistant Professor of Instituto Superior Técnico, University of Lisbon (2004-2010). His research interests are on species¿ distribution modelling and biodiversity informatics, with integration of ecological niche modelling, geostatistics and multivariate data analysis. He was involved in 29 research projects, (four as coordinator). He published a total of 70 scientific papers, including 42 per-reviewed papers in international scientific journals. His experience in biodiversity informatics includes the development and management of information facilities (hardware and software) to support biodiversity data, installation and use of standards and protocols for biodiversity data mobilizing, integration and sharing (Darwin Core, GBIF IPT, Platform ALA, Specify 6) and training. In its professional activities, he co-authored scientific publications with 67 researchers.
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Identificação pessoal

Nome completo
Rui Figueira

Nomes de citação

  • Figueira, Rui

Identificadores de autor

Ciência ID
9D1D-412C-2FFF
ORCID iD
0000-0002-8351-4028
Google Scholar ID
OISJfdkAAAAJ
Researcher Id
C-4977-2009
Scopus Author Id
36051668100

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Ecologia

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A2)
Espanhol; Castelhano Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador elementar (A1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador elementar (A1)
Grau Classificação
1997/01/01 - 2002/07/06
Concluído
 Biologia (Doutoramento)
Especialização em Biologia. Ecologia e Biossistemática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Desenvolvimento de um Sistema de Biomonitorização Ambiental" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Aprovado com Louvor e Distinção
1993 - 1996
Concluído
 Mineralurgia e Planeamento Mineiro (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Modelação Geoestatística de um Sistema de Biomonitorização de Salinidade" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Aprovado
1988 - 1992
Concluído
 Biologia (Licenciatura)
Especialização em Ramo Científico Vegetal
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
 14

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2015/08/01 - 2020/12/30 Investigador Auxiliar Convidado (carreira) (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2013/09/01 - 2015/07/31 Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação) Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
2013/01/01 - 2013/08/31 Gestão de Ciência e Tecnologia Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal
2008/01/01 - 2012/12/31 Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação) Instituto de Investigação Científica Tropical, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2024/12/11 - Atual Professor Associado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2020/12/31 - 2024/12/10 Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2004/04/15 - 2010/04/14 Professor Auxiliar Convidado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Cargos e Funções

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2013/01/01 - Atual Coordenador do Nó Português do GBIF Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Bolsa

Designação Financiadores
2012/02 - 2015/01 Cashew in West Africa: socio-economic and environmental challenges of an expanding cash crop
117785
Provided by PTCRIS: 117785
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2010/02 - 2013/07 Maerua - Motivation and results of "Missão Botânica de Moçambique"
109402
Provided by PTCRIS: 109402
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2008/01 - 2011/12 IMBAMBA - Implementing Biodiversity Data Access and Management of Botanical Collections in Angola
66702
Provided by PTCRIS: 66702
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2008/01 - 2011/06 URBSOIL-LISBON_Geochemical survey of Lisbon urban soils: a baseline for future human health studies
68523
Provided by PTCRIS: 68523
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2008/01 - 2011/03 Recovering the past, recording the present, and preparing the future of zoological collections in Portugal.
71492
Provided by PTCRIS: 71492
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2007/01 - 2010/03 History of the scientific expeditions in S. Tomé Islands. Biodiversity characterisation based in the inventory bryophyte herbarium collections.
Provided by PTCRIS: 82615
82615
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2007/01 - 2009/11 Biomonitoring of tropospheric ozone and assessment of the ozone sensitivity of Medterranean vegetation
Provided by PTCRIS: 82563
82563
57228
Provided by PTCRIS: 57228
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2005/09 - 2008/07 Foetal exposure to lead as determined by human and environmental biomarkers - investigation of influence on human reproductive outcomes and autonomic nervous system in rats
62115
Provided by PTCRIS: 62115
Provided by PTCRIS: 82480
82480
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.

Projeto

Designação Financiadores
2024/04/01 - 2027/03/31 Harmonização de pipelines de metabarcoding de plantas na Europa para apoiar atividades de monitorização no domínio das plantas e das suas redes funcionais
BiodivMon/0005/2022
10.54499/BiodivMon/0005/2022
Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Lisboa Centro de Investigação em Agronomia Alimentos Ambiente e Paisagem, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2023/06/01 - 2025/06/30 Portuguese Biodiversity Data Portal and associated services to PORBIOTA RI user community
2022.15827.CPCA.A2
10.54499/2022.15827.CPCA.A2
Universidade de Lisboa, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/01/01 - 2024/12/31 Dammed Fish: Impact of structural and functional river network connectivity losses on fish biodiversity – Optimising management solutions
PTDC/CTA-AMB/4086/2021
Investigador
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Em curso
2018/10/19 - 2021/10/18 Impactos do comércio global de animais no estabelecimento de espécies invasoras
PTDC/BIA-ECO/30931/2017
Universidade de Évora, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2017/11/17 - 2019/05/16 Characterizing and monitoring cashew economically important diseases in West Africa as a prospective measure for sustainable production: a case study on Guinea-Bissau
PTDC/AGR-PRO/5727/2014
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2013/07 - 2015/07 ECOLOGICALLY SCALED EDGE RESPONSES: PATTERNS, MECHANISMS AND PREDICTIVE MODELLING
127853
Provided by PTCRIS: 127853
PTDC/BIA-BIC/2203/2012
Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Publicações

Artigo em conferência
  1. Paulo Branco; Florian Borgwardt; Jesse O’Hanley; Rui Figueira; Gonçalo Duarte; José Maria Santos; Pedro Segurado; Tamara Leite; Maria T. Ferreira. "Dammed Fish: Impact of Structural and Functional River Network Connectivity Losses on Fish Biodiversity—Optimizing Management Solutions". 2022.
    10.3390/blsf2022013119
  2. Patinha, Carla; Reis, Amélia; Silva, Eduardo Ferreira da; Dias, Ana; Bartolomeu, Sofia; Sousa, António; Cachada, Anabela; et al. "Introducing "UrbanEnviron@Lisbon 2008" a GIS-platform for environmental and human health data management". 2011.
  3. Reis, Amélia; Patinha, Carla; Silva, Eduardo Ferreira da; Dias, Ana; Bartolomeu, Sofia; Sousa, António; Cachada, Anabela; et al. "Environmental assessment of Ni and Cd in topsoil and ground-level dust from urban playgrounds, public gardens and parks from Lisbon, Portugal". 2011.
  4. Figueria, R.; Pacheco, A.M.G.; Sousa, A.J.; Branquinho, C.; Catarino, F.. "First studies in assessing cryptogamic epiphytes as biomonitors of sea-salt deposition density". 1995.
Artigo em revista
  1. Mameri, Daniel; Duarte, Gonçalo; Cabo, João; Figueira, Rui; Segurado, Pedro; Santos, J.M.; Ferreira, Maria Teresa; Branco, Paulo. "Fishspotting: freshwater fish species presence in European river basins – RivFISH database". Knowledge & Management of Aquatic Ecosystems 426 (2025): 7. https://doi.org/10.1051/kmae/2025002.
    Publicado • 10.1051/kmae/2025002
  2. João Canilho Santos; Paula Paes; Pedro Arsénio; Rui Figueira; José Carlos Costa; Margarida Dionísio Lopes; Helena Cotrim; Dalila Espírito-Santo. "The Marine Macroalgae Collection from Herbarium João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)—140 Years of History". Diversity (2024): https://doi.org/10.3390/d16080478.
    10.3390/d16080478
  3. SÉRGIO, CECÍLIA; SIM-SIM, MANUELA; GARCIA, CÉSAR AUGUSTO; PORLEY, RONALD; FIGUEIRA, RUI. "A morphological-taxonomic study of Frullania calcarifera Steph. (Frullaniaceae) in Portugal". Bryophyte Diversity and Evolution 47 1 (2024): 159-170. https://doi.org/10.11646/bde.47.1.11.
    10.11646/bde.47.1.11
  4. Quentin Groom; Mathias Dillen; Wouter Addink; Arturo H. Ariño; Christian Bölling; Pierre Bonnet; Lorenzo Cecchi; et al. "Envisaging a global infrastructure to exploit the potential of digitised collections". Biodiversity Data Journal (2023): https://doi.org/10.3897/BDJ.11.e109439.
    10.3897/BDJ.11.e109439
  5. Tainan Messina; Rui Figueira; José M.L. Santos. "Integrating local and ecological knowledge to assess the benefits of trees for ecosystem services: A holistic process-based methodology". Ecosystem Services (2023): https://doi.org/10.1016/j.ecoser.2023.101556.
    10.1016/j.ecoser.2023.101556
  6. Catarino, S.; Goyder, D.; Darbyshire, I.; Costa, E.; Figueira, R.; Duarte, M.C.; Romeiras, M.M.. "Species Diversity and Endemicity in the Angolan Leguminosae Flora". Frontiers in Ecology and Evolution 10 (2022): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85129339862&partnerID=MN8TOARS.
    10.3389/fevo.2022.871261
  7. Catarino, S.; Romeiras, M.M.; Pereira, J.M.C.; Figueira, R.. "Assessing the conservation of Miombo timber species through an integrated index of anthropogenic and climatic threats". Ecology and Evolution (2021): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85108251037&partnerID=MN8TOARS.
    10.1002/ece3.7717
  8. Silvia Catarino; Maria Manuel Romeiras; Rui Figueira; Valentine Aubard; João M. N. Silva; José M. C. Pereira. "Spatial and Temporal Trends of Burnt Area in Angola: Implications for Natural Vegetation and Protected Area Management". Diversity 12 8 (2020): 307-307. https://doi.org/10.3390/d12080307.
    10.3390/d12080307
  9. Miguel Monteiro; Luís Reino; Anna Schertler; Franz Essl; Rui Figueira; Maria Ferreira; César Capinha; et al. "A database of the global distribution of alien macrofungi". Biodiversity Data Journal 8 (2020): 1-13. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e51459.
    10.3897/BDJ.8.e51459
  10. Talhinhas, P.; Carvalho, R.; Figueira, R.; Ramos, A.P.. "An annotated checklist of rust fungi (pucciniales) occurring in Portugal". Sydowia 71 (2020): 65-84. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85082196711&partnerID=MN8TOARS.
    10.12905/0380.sydowia71-2019-0065
  11. Hardisty, Alex R.; Michener, William K.; Agosti, Donat; Alonso García, Enrique; Bastin, Lucy; Belbin, Lee; Bowser, Anne; et al. "The Bari Manifesto: An interoperability framework for essential biodiversity variables". Ecological Informatics 49 (2019): 22-31. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecoinf.2018.11.003.
    10.1016/j.ecoinf.2018.11.003
  12. Reino, Luís; Triviño, María; Beja, Pedro; Araújo, Miguel B.; Figueira, Rui; Segurado, Pedro. "Modelling landscape constraints on farmland bird species range shifts under climate change". Science of The Total Environment 625 (2018): 1596-1605. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.01.007.
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  13. Silva, A.S.; Groz, M.P.; Leandro, P.; Assis, C.A.; Figueira, R.. "Ichthyological collection of the museu oceanográfico D. Carlos I". ZooKeys 2018 752 (2018): 137-148. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85046156486&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/zookeys.752.20086
  14. Luís Reino; Rui Figueira; Pedro Beja; Miguel B. Araújo; César Capinha; Diederik Strubbe. "Networks of global bird invasion altered by regional trade ban". Science Advances 3 11 (2017): e1700783-e1700783. https://doi.org/10.1126/sciadv.1700783.
    10.1126/sciadv.1700783
  15. Cardador, Laura; Lattuada, Matteo; Strubbe, Diederik; Tella, José L.; Reino, Luís; Figueira, Rui; Carrete, Martina. "Regional Bans on Wild-Bird Trade Modify Invasion Risks at a Global Scale". Conservation Letters 10 6 (2017): 717-725. http://dx.doi.org/10.1111/conl.12361.
    10.1111/conl.12361
  16. Sosef, M.S.M.; Dauby, G.; Blach-Overgaard, A.; van der Burgt, X.; Catarino, L.; Damen, T.; Deblauwe, V.; et al. "Exploring the floristic diversity of tropical Africa". BMC Biology 15 1 (2017): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85014600196&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/s12915-017-0356-8
  17. Mori, E.; Grandi, G.; Menchetti, M.; Tella, J.L.; Jackson, H.A.; Reino, L.; van Kleunen, A.; Figueira, R.; Ancillotto, L.. "Worldwide distribution of non–native Amazon parrots and temporal trends of their global trade | Distribución en el mundo de los loros introducidos del género Amazona y tendencias temporales de su comercio a escala mundial". Animal Biodiversity and Conservation 40 1 (2017): 49-62. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85008967676&partnerID=MN8TOARS.
    10.32800/abc.2017.40.0049
  18. Monteiro, M.; Figueira, R.; Melo, M.; Mills, M.S.L.; Beja, P.; Bastos-Silveira, C.; Ramos, M.; et al. "The collection of birds from mozambique at the instituto de investigação científica tropical of the university of Lisbon (Portugal)". ZooKeys 2017 708 (2017): 139-152. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85032012559&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/zookeys.708.13351
  19. Dauby, G.; Zaiss, R.; Blach-Overgaard, A.; Catarino, L.; Damen, T.; Deblauwe, V.; Dessein, S.; et al. "RAINBIO: A mega-database of tropical African vascular plants distributions". PhytoKeys 74 1 (2016): 1-18. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85000501050&partnerID=MN8TOARS.
    10.3897/phytokeys.74.9723
  20. Monteiro, M.; Reino, L.; Melo, M.; Beja, P.; Bastos-Silveira, C.; Ramos, M.; Rodrigues, D.; et al. "The collection of birds from são tomé and príncipe at the instituto de investigação científica tropical of the university of lisbon (Portugal)". ZooKeys 2016 600 (2016): 155-167. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84976330778&partnerID=MN8TOARS.
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  21. Temudo, M.P.; Figueira, R.; Abrantes, M.. "Landscapes of bio-cultural diversity: shifting cultivation in Guinea-Bissau, West Africa". Agroforestry Systems 89 1 (2015): 175-191. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84921895958&partnerID=MN8TOARS.
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    10.1111/mam.12036
  23. Piairo, Helena; Menezes, Raquel; Sousa, Inês; Figueira, Rui; Sérgio, Cecília. "Spatial modeling of factor analysis scores". Environmental Science and Pollution Research 21 23 (2014): 13420-13433. http://dx.doi.org/10.1007/s11356-014-3125-z.
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  24. Conde, Patrícia; Figueira, Rui; Saraiva, Susana; Catarino, Luís; Romeiras, Maria; Duarte, Maria Cristina. "A Missão Botânica de Moçambique (1942-1948): contribuições para o conhecimento da flora medicinal de Moçambique". História, Ciências, Saúde-Manguinhos 21 2 (2014): 539-585. http://dx.doi.org/10.1590/s0104-59702014000200007.
    10.1590/s0104-59702014000200007
  25. Conde, P.; Figueira, R.; Saraiva, S.; Catarino, L.; Romeiras, M.; Duarte, M.C.. "The Botanic Mission to Mozambique (1942-1948): Contributions to knowledge of the medicinal flora of Mozambique | A Missão Botânica de Moçambique (1942-1948): Contribuições para o conhecimento da flora medicinal de Moçambique". Historia, Ciencias, Saude - Manguinhos 21 2 (2014): 539-585. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84904410090&partnerID=MN8TOARS.
    10.1590/S0104-59702014000200007
  26. Romeiras, M.M.; Figueira, R.; Duarte, M.C.; Beja, P.; Darbyshire, I.. "Documenting biogeographical patterns of African timber species using herbarium records: A conservation perspective based on native trees from Angola". PLoS ONE 9 7 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84904863144&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0103403
  27. Sérgio, C.; Garcia, C.A.; Vieira, C.; Hespanhol, H.; Sim-Sim, M.; Stow, S.; Figueira, R.. "Conservation of Portuguese red-listed bryophytes species in Portugal: Promoting a shift in perspective on climate changes". Plant Biosystems 148 4 (2014): 837-850. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84922216414&partnerID=MN8TOARS.
    10.1080/11263504.2014.949329
  28. Monteiro, M.; Reino, L.; Beja, P.; Mills, M.S.L.; Bastos-Silveira, C.; Ramos, M.; Rodrigues, D.; et al. "The collection and database of Birds of Angola hosted at IICT (Instituto de Investigação Científica Tropical), Lisboa, Portugal". ZooKeys 387 (2014): 89-99. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84896840533&partnerID=MN8TOARS.
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  29. Catarino, L.; Martins, E.S.; Abreu, J.A.; Figueira, R.. "Revision of the family Dipterocarpaceae in Angola". Blumea: Journal of Plant Taxonomy and Plant Geography 57 3 (2013): 263-274. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84875750890&partnerID=MN8TOARS.
    10.3767/000651913X664892
  30. Abreu, J.A.; Figueira, R.; Silva, M.I.; Martins, E.; Catarino, L.; Cardoso, J.F.. "Updates on the distribution of Capparaceae and Cleomaceae endemic to Angola". Biodiversity of Angola 50 (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84906706331&partnerID=MN8TOARS.
  31. Martins, A.; Figueira, R.; Sousa, A.J.; Sérgio, C.. "Spatio-temporal patterns of Cu contamination in mosses using geostatistical estimation". Environmental Pollution 170 (2012): 276-284. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84864337858&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2012.07.004
  32. Harmens, H.; Ilyin, I.; Mills, G.; Aboal, J.R.; Alber, R.; Blum, O.; Coskun, M.; et al. "Country-specific correlations across Europe between modelled atmospheric cadmium and lead deposition and concentrations in mosses". Environmental Pollution 166 (2012): 1-9. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84860491968&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2012.02.013
  33. Matos, P.; Cardoso-Vilhena, J.; Figueira, R.; Sousa, A.J.. "Effects of salinity stress on cellular location of elements and photosynthesis in Ramalina canariensis Steiner". Lichenologist 43 2 (2011): 155-164. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79957524967&partnerID=MN8TOARS.
    10.1017/S0024282910000757
  34. Hespanhol, H.; Séneca, A.; Figueira, R.; Sérgio, C.. "Microhabitat effects on bryophyte species richness and community distribution on exposed rock outcrops in Portugal". Plant Ecology and Diversity 4 2-3 (2011): 251-264. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84856202153&partnerID=MN8TOARS.
  35. Luis, L.; Bergamini, A.; Figueira, R.; Sim-Sim, M.. "Riparian bryophyte communities on Madeira: Patterns and determinants of species richness and composition". Journal of Bryology 32 1 (2010): 32-45. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77949510096&partnerID=MN8TOARS.
    10.1179/037366810X12578498135751
  36. Hespanhol, H.; Séneca, A.; Figueira, R.; Sérgio, C.. "Bryophyte-environment relationships in rock outcrops of North-western Portugal: The importance of micro and macro-scale variables". Cryptogamie, Bryologie 31 2 (2010): 147-161. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77952381671&partnerID=MN8TOARS.
  37. Reis, A.P.; Patinha, C.; Ferreira Da Silva, E.; Sousa, A.; Figueira, R.; Sérgio, C.; Novais, V.. "Assessment of human exposure to environmental heavy metals in soils and bryophytes of the central region of Portugal". International Journal of Environmental Health Research 20 2 (2010): 87-113. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77949419160&partnerID=MN8TOARS.
    10.1080/09603120903394649
  38. Holy, M.; Pesch, R.; Schröder, W.; Harmens, H.; Ilyin, I.; Alber, R.; Aleksiayenak, Y.; et al. "First thorough identification of factors associated with Cd, Hg and Pb concentrations in mosses sampled in the European Surveys 1990, 1995, 2000 and 2005". Journal of Atmospheric Chemistry 63 2 (2009): 109-124. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77955978973&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10874-010-9160-3
  39. Figueira, R.; Tavares, P.C.; Palma, L.; Beja, P.; Sérgio, C.. "Application of indicator kriging to the complementary use of bioindicators at three trophic levels". Environmental Pollution 157 10 (2009): 2689-2696. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-68049091011&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2009.05.001
  40. Sérgio, C.; Figueira, R.; Draper, D.; Menezes, R.; Sousa, A.J.. "Modelling bryophyte distribution based on ecological information for extent of occurrence assessment". Biological Conservation 135 3 (2007): 341-351. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33846038824&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.biocon.2006.10.018
  41. Figueira, R.; Sérgio, C.; Lopes, J.L.; Sousa, A.J.. "Detection of exposition risk to arsenic in Portugal assessed by air deposition in biomonitors and water contamination". International Journal of Hygiene and Environmental Health 210 3-4 (2007): 393-397. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34247378192&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ijheh.2007.01.003
  42. Figueira, R.; Ribeiro, T.. "Transplants of aquatic mosses as biomonitors of metals released by a mine effluent". Environmental Pollution 136 2 (2005): 293-301. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-17444419032&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.envpol.2005.01.003
  43. Figueira, R.; Sérgio, C.; Sousa, A.J.. "Distribution of trace metals in moss biomonitors and assessment of contamination sources in Portugal". Environmental Pollution 118 1 (2002): 153-163. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0036007798&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S0269-7491(01)00203-2
  44. Figueira, R.; Pacheco, A.M.G.; Sousa, A.J.; Catarino, F.. "Development and calibration of epiphytic lichens as saltfall biomonitors - Dry-deposition modelling". Environmental Pollution 120 1 (2002): 69-78. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035989658&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S0269-7491(02)00129-X
  45. Sérgio, Cecília; Carvalho, Palmira; Figueira, Rui. "Dados sobre os briófitos epifíticos no Litoral Alentejano". Portugaliae Acta Biologica 20 (2002): 75-85.
    Publicado
  46. Figueira, R.; Sousa, A.J.; Pacheco, A.M.G.; Catarino, F.. "Use of secondary information in space-time statistics for biomonitoring studies of saline deposition". Environmetrics 12 3 (2001): 203-217. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0035026223&partnerID=MN8TOARS.
    10.1002/env.457
  47. Pacheco, A.M.G.; Freitas, M.C.; Barros, L.I.C.; Figueira, R.. "Investigating tree bark as an air-pollution biomonitor by means of neutron activation analysis". Journal of Radioanalytical and Nuclear Chemistry 249 2 (2001): 327-331. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0034880345&partnerID=MN8TOARS.
    10.1023/A:1013293814789
  48. Sérgio, C.; Figueira, R.; Viegas Crespo, A.M.. "Observations of heavy metal accumulation in the cell walls of Fontinalis antipyretica, in a Portuguese stream affected by mine effluent". Journal of Bryology 22 4 (2000): 251-255. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-17144469253&partnerID=MN8TOARS.
  49. Figueira, R.; Sousa, A.J.; Pacheco, A.M.G.; Catarino, F.. "Saline variability at ground level after kriging data from Ramalina spp. biomonitors". Science of the Total Environment 232 1-2 (1999): 3-11. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0032767169&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/S0048-9697(99)00104-7
  50. Figueira, R.; Sousa, A.J.; Brown, D.H.; Catarino, F.; Pacheco, A.M.G.. "Natural levels of saline elements in lichens: Determination of cellular fractions and their importance as saline tracers". Lichenologist 31 2 (1999): 183-196. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033103294&partnerID=MN8TOARS.
    10.1006/lich.1998.0179
Capítulo de livro
  1. Costa, J. Miguel; Carvalho, Luísa; Figueira, Rui; Shimono, Hiroyuki; Marques da Silva, Jorge. "Molecular, Morpho-Functional, and Agronomic Phenotyping Tools for Grapevine Selection and Breeding". In Plant Speed Breeding and High-throughput Technologies, 294-317. CRC Press, 2024.
    10.1201/b23372-15
  2. Figueira, Rui; Lages, Fernanda; Figueira, R.; Lages, F.. "Museum and Herbarium Collections for Biodiversity Research in Angola". In Biodiversity of Angola, 513-542. Springer International Publishing, 2019.
    10.1007/978-3-030-03083-4_19
  3. Sérgio, Cecília; Figueira, Rui; Menezes, Rui; Tuba, Zoltan; Slack, Nancy G.; Stark, Lloyd R.. "Modeling the Distribution of Sematophyllum substrumulosum (Hampe) E. Britton as a Signal of Climatic Changes in Europe". In Bryophyte Ecology and Climate Change, 427-440. Cambridge University Press, 2011.
    10.1017/cbo9780511779701.022
Documento de trabalho
  1. Santana, Joana; Reino, Luís; Marcolin, Fabio; Sol, Daniel; Figueira, Rui; Capinha, César; Ducatez, Simon; Vall-llosera, Miquel. 2023. "From the jungle to the cage: why some species become targets for bird trade".
Livro
  1. Sérgio, Cecília; Sim-Sim, Manuela; Figueira, Rui. Quantificação da deposição de metais pesados em Portugal, através da análise de briófitos.. Lisboa, Portugal: DGQA. 1993.
    Publicado
Poster em conferência
  1. Catarino, Sílvia; Romeiras, Maria; Pereira, José Miguel Cardoso; Figueira, Rui. "Assessing the conservation of Miombo timber species in Angola". Trabalho apresentado em Encontro Ciência 2022, 2022.
  2. Catarino, Luís; Figueira, Rui; ana isabel correia; joana A. Abreu; Sousa, Filipe; dulce ferreira; joão tavares; et al. "Valuing and giving access to the botanical collections of Angola: The IMBAMBA project". Trabalho apresentado em Iº Encontro Nacional sobre a Flora e Vegetação de Angola, 2011.
Recurso online
  1. Mameri, Daniel; Duarte, Gonçalo; Cabo, João; Figueira, Rui; Segurado, Pedro; Santos, José Maria; Ferreira, Maria Teresa. RivFISH - An European database on fish species presence across river basins. 2024. https://zenodo.org/records/13848977.
    zenodo.13848977
  2. Catarino, Silvia; Romeiras, Maria M.; Pereira, José M. C.; Figueira, Rui. Transcription of selected miombo timber species of a floristic inventory in Cuando-Cubango, Angola.. 2021. https://doi.org/10.15468/qheeb2.
    10.15468/qheeb2
Relatório
  1. Mameri, Daniel; Duarte, Gonçalo; Cabo, João; Figueira, Rui; Segurado, Pedro; Santos, José Maria; Ferreira, Teresa; Branco, Paulo. 2025. RivFISH Maps – Presence of freshwater fish species in European river basins. https://zenodo.org/records/14884103.
    10.5281/zenodo.13891163
  2. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Berger, Frederik; Gierce, Peter; Von Mering, Sabine; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, Alexandra. 2021. Milestone 3.4 - Proposed Content for a DiSSCo Digital Maturity Tool. http://hdl.handle.net/10400.5/27084.
  3. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Giere, Peter; von Mering, Sabine; et al. 2021. Deliverable 3.1 Summary Insights and Recommendations on DiSSCo Competencies and Digital Maturity. http://hdl.handle.net/10400.5/27061.
  4. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Huybrechts, Pieter; Mergen, Patricia; Berger, Frederik; Giere, Peter; et al. 2021. Milestone 3.3 - DiSSCo Capabilities ¿ Additional Case Studies & Analysis. http://hdl.handle.net/10400.5/27082.
  5. Hardy, Helen; Koivunen, Anne; Groom, Quentin; Berger, Frederik; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, Alexandra. 2021. Milestone 3.2 - DiSSCo Digital Maturity Self -Assessment Tool - Design Blueprint. http://hdl.handle.net/10400.5/27080.
  6. Helen Hardy; Koivunen, A; Groom, Quentin; Patricia Mergen; Frederik Berger ; Figueira, Rui; Arsénio, Pedro; Cartaxana, Alexandra. 2021. DiSSCo Prepare Milestone report MS3.2 "DiSSCo Digital Maturity Self-Assessment Tool - Design Blueprint". https://know.dissco.eu/bitstream/item/159/1/DPP_WP3_MS3.3_DiSSCo%20Capabilities%20%E2%80%93%20Additional%20Case%20Studies%20%26%20Analysis%20%281%29.pdf.
    https://doi.org/10.34960/q1mz-zf45
Resumo em conferência
  1. Marie-Elise Lecoq; Anne-Sophie Archambeau; Rui Figueira; David Martin; Sophie Pamerlon; Tim Robertson; Régine Vignes Lebbe; Cristina Villaverde. "The Living Atlases Community of Practice". 2019.
    10.3897/biss.3.35779
  2. Villaverde, Cristina; Lecoq, Marie-Elise; Martin, David; Figueira, Rui; Robertson, Tim; García, Katia Cezón; Pamerlon, Sophie; Vignes Lebbe, Régine. "Improving The Documentation For End Users Of Living Atlases Around The World". 2019.
    10.3897/biss.3.37071
Website
  1. Figueira, Rui. Portal de Dados de Biodiversidade de Portugal - GBIF.pt. 2016. http://dados.gbif.pt.
  2. Figueira, Rui. Portal do Nó Português do GBIF. 2013. http://www.gbif.pt.
  3. Figueira, Rui. Catálogo de Coleções Biológicas do Jardim Botânico Tropical - IICT. 2012. http://colecoes.iict.ulisboa.pt/.
  4. Figueira, Rui. Portal Biomonitor. 2002. http://biomonitor.ist.utl.pt/biomonitor/.

Outros

Conjunto de dados
  1. Figueira, Rui. IICT Herbário LISC. https://www.gbif.org/dataset/231c5bcf-1b56-4905-a398-6d0e18f6de1a#description.
  2. Figueira, Rui. Bibliographic records of Angola mammals. https://www.gbif.org/dataset/2fea4042-5aba-4cda-bab9-adcfa2bbe97d.
  3. Figueira, Rui. IICT Colecção Zoológica. https://www.gbif.org/dataset/c690c2b5-8002-4d12-831c-9258dd618f78.
  4. Figueira, Rui. Checklist of rust fungi (Pucciniales) occurring in Portugal. https://www.gbif.org/dataset/fc5d3109-95a2-47ae-8bfd-1667fc2b12cc#description.
  5. Figueira, Rui. Occurrence records of rust fungi (Pucciniales) in Portugal. https://www.gbif.org/dataset/651c0bec-bd78-4300-bbb0-5ed172fc82af.
  6. Figueira, Rui. Ichthyological Collection of the Museu Oceanográfico D. Carlos I. https://www.gbif.org/dataset/6005f3b4-da6a-4d88-ac92-81f2e950eb24#description.
  7. Figueira, Rui. Ornithological Collection of the Museu Oceanográfico D. Carlos I. https://www.gbif.org/dataset/49576930-4b51-441e-9f4c-b20a4045e882.
  8. Figueira, Rui. EDP Baixo Sabor: Herpetology – Baseline Studies [2009]. https://www.gbif.org/dataset/611aea9f-9c55-4404-ac36-0d82c0b9edf9#description.
  9. Figueira, Rui. EDP Foz Tua: Arthropoda – Environmental Impact Assessment [2006-2008. https://www.gbif.org/dataset/85a3c886-3312-45c9-b040-4d7634653246.
  10. Figueira, Rui. Benthic marine diatoms from French coastal and transitional waters.
    10.15468/BYYHXU
  11. João Canilho Santos; Paula Paes; Pedro Arsénio; Figueira, Rui; José Carlos Costa; M.D. Lopes; Cotrim H, Cotrim, HM, Cotrim HMC, Cotrim HC; Maria Dalila Espírito Santo. Marine Macroalgae collection dataset from Herbarium João de Carvalho e Vasconcellos (LISI). 2023.
    10.15468/p7quz5
  12. Arsénio, Pedro; Cunha, Ana Raquel; Paes, Ana Paula; Vasconcelos, Teresa; Figueira, Rui. Herbário João de Carvalho e Vasconcellos, I.S.A./U.L.. https://www.gbif.org/installation/33f40aac-2870-454e-b8f4-9958e761d826. 2021.
    10.15468/olfpjv
Outra produção
  1. O contributo do Jardim Botânico de Lisboa para a Estratégia Global para a Conservação de Plantas (2003-2009). 2010. Martins-Loução, Maria Amélia; Sérgio, Cecilia; Melo, Ireneia; Correia, Ana Isabel; Escudeiro, Alexandra; Barata, Ana Raquel; SimSim, Manuela; et al. http://hdl.handle.net/10451/4052.
    El Botânico. Revista da AIMJB/Revista de la AIMJB. julio/julho 2010. 10-11

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2018 - Atual Mapeando o (des)conhecido: a memória de uma coleção enquanto reflexo da investigação botânica colonial na Universidade do Porto
Coorientador
 História e Filosofia das Ciências (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2023 - 2024/04/03 Contributo para a melhoria da classificação das culturas permanentes da região do Alqueva com imagens de satélite, através de aprendizagem automática
Orientador de Manuel Maria Maymone Martins Quintela
 Engenharia Agronómica (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2023 - 2024 Preenchimento inteligente de lacunas de dados sensoriais: Aplicação de Machine Learning em Sistemas de Rega
Orientador
 Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2018 - 2024 Synergies from local and ecological knowledge and the use of databases: enhancing ecosystem service assessment through holistic methodologies and multidisciplinary workflows in farmlands
Coorientador
 Alterações Climáticas e Políticas de Desenvolvimento Sustentável (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Sociais e Humanas, Portugal
2017 - 2022/02/09 Conservation planning in tropical regions under climate change: a case-study of Angola flora
Coorientador
 Biologia (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2009 - 2011 Interpolação geoestatística de Cu em musgos usando interpolação da distribuição local
Coorientador
 Engenharia do Ambiente (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2006 - 2010 Briófitos ripícolas de ecossistemas aquáticos da Ilha da Madeira. Biodiversidade, bioindicação e conservação
Coorientador
 Biologia (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2005 - 2010 Comunidades briofíticas saxícolas do Noroeste de Portugal Continental: Delimitação, caracterização ecológica e modelação preditiva
Coorientador
 Biologia (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2007 - 2008 Estudo da dinâmica das comunidades epifíticas na monitorização da poluição atmosférica da zona envolvente à CTRSU da Valorsul.
Coorientador
 Georrecursos (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2005 - 2008 Biomonitorização da deposição salina e de elementos traço no Sudoeste Alentejano
Coorientador
 Ecologia (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
2005 - 2007 Modelação Geoestatística da Deposição de Poluentes Atmosféricos em Sistemas de Informação Geográfica
Coorientador
 Sistemas de Informação Geográfica (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2004 - 2006 Desenvolvimento de uma metodologia de remediação ambiental: caso da mina de Sevilha
Orientador
 Georrecursos (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2004 - 2006 A contribuição dos Sistemas de Informação geográfica e da Detecção Remota para a análise de dados em líquenes
Coorientador
 Georrecursos (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2020 Terrestrial mammals of Mozambique: current knowledge and future challenges for conservation
Arguente principal
 Isabel Maria Queirós das Neves (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
2015 Spatio-temporal modelling of Environmental data
Arguente principal
 Luís Manuel dos Santos de Melo Margalho (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2010 Bryophytes communities from rock outcrops: ecological characterization and conservation Helena Canha Pinto Hespanhol (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria 		Instituição / Organização Entidade financiadora
2024 - 2025 Working Group “Interdisciplinary Data, Information and Computing Infrastructures”, by invitation of the German Science and Humanities Council (Wissenschaftsrat – WR). Prioritization of RIs based on the scientific evaluation of digital infrastructures, based on the following dimensions: 1 - scientific potential; 2 - scientific use; 3 - relevance for Germany, Europe and globally; 4 - feasibility from a scientific perspective.
Avaliador
2021 - 2021 Member of the scientific committee on the environment for the international assessment of large-scale research infrastructures in the Czech Republic, Czech Republic – Ministry of Education, Youth and Sports
Avaliador
 Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2023 - Atual Projecto Hackathon de Ciência de Dados Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022 - Atual Fundamentos da Ciência de Dados Agro-Ambientais Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022 - Atual Gestão e armazenamento de dados Ciência de Dados em Agricultura, Alimentação, Floresta e Ambiente (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2022 - Atual Ecoturismo e Valorização dos Recursos Naturais Gestão e Conservação de Recursos Naturais (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2021 - Atual Sistemas de Informação Geográfica Engenharia Agronómica (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2021 - 2023 Geomática Ciências de Engenharia - Engenharia do Ambiente (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2001/07/01 - 2006/02/28 Geoestatistica Engenharia dos Recursos Florestais (Mestrado) Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro, Portugal
2002/09/01 - 2005/02/28 Ecologia Enguenharia do Território (Licenciatura) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2003/09/01 - 2004/06/30 Ecotoxicologia Georrecursos (Mestrado) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2013/01/01 - Atual Nó Nacional do GBIF
Coordenador
2013 - Atual Portuguese delegate to the ESFRI Environmental Strategic Working Group
Membro
 Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2012 - Atual Portuguese delegate to the GBIF Governing Board
Membro
 Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal