André Albuquerque (E517-EE05-6977)

Curriculum Vitae

André Albuquerque

André Albuquerque completed his PhD in Agricultural and Environmental Sciences in 2023/01/11 at the Universidade de Évora in association with the Universidade do Algarve. His thesis focused on exploring transcriptomics in Portuguese local pig breeds, establishing a link between gene expression and characterized phenotypes. In early 2018, completed ADER18F, a training programme in Bioinformatics, followed by a six-month internship at INIA (Madrid) under the guidance of Dr. Cristina Óvilo to further develop his skills. Coming from a background in Biochemistry and Biology, the opportunity to take a PhD programme in Agricultural and Environmental Sciences broadened his perspectives on the emerging issues regarding agricultural systems. In the past three years, he cumulatively held a temporary position as a senior technician in the Plant Virology and Mycology laboratories of MED and has been providing diagnostic services to various crop industry stakeholders including local farmers using microscopic and molecular tests to identify potential pathogens. This is also complemented with the effort of granting technical support and suggesting preventive measures for plant disease control. André has authorship of 17 peer-reviewed publications in journals indexed in the most common scientific databases and published two book chapters, translating into an h-index of 8 in Scopus and 9 in Scholar. Between ongoing and concluded, he participated in a total of 14 projects, has ad hoc reviewed eight article publications for six different journals and is currently guest editor for a special issue in one of these. Throughout the years, he engaged in both national and international meetings with 12 oral and 37 poster presentations and has contributed to the submission of two patents that are currently awaiting approval. Furthermore, he participated in six transfer of knowledge activities with dynamic public presentations and has received a total of four awards, two for best poster presentations (2022 and 2023), one for best exhibition (2023) and one for Applied R&D (2022). Finally, André is currently supervising one master student, co-supervising two others, has one co-supervision successfully concluded.

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: André Albuquerque
Data de nascimento: 1991/05/27
Género: Masculino

Nomes de citação

Albuquerque, André
Albuquerque, A.

Identificadores de autor

Ciência ID: E517-EE05-6977
ORCID iD: 0000-0002-1189-9803
Google Scholar ID: https://scholar.google.com/citations?hl=pt-PT&user=02CJdCQAAAAJ
Scopus Author Id: 57191863030

Websites

https://www.researchgate.net/profile/Andre_Albuquerque4 (Académico)

Domínios de atuação

Ciências Agrárias - Ciência Animal e dos Laticínios
Ciências Agrárias - Agricultura, Silvicultura e Pescas - Produção e Proteção de Plantas
Ciências Agrárias - Biotecnologia Agrária e Alimentar
Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão
Português (Idioma materno)
Inglês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)
Espanhol; Castelhano	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B1)
Francês	Utilizador elementar (A1)	Utilizador elementar (A1)	Utilizador elementar (A1)	Utilizador elementar (A1)

Formação

	Grau	Classificação
2023/01/11 Concluído	Agricultural and Environmental Sciences (in association) (Doutoramento) Universidade de Évora Instituto de Investigação e Formação Avançada, Portugal Universidade do Algarve, Portugal "Transcriptomics in Portuguese local pig breeds: an approach to explore the molecular mechanisms underlying lipid metabolism and muscle growth" (TESE/DISSERTAÇÃO)	Unanimously approved with distinction and praise
2014/12/03 Concluído	Biochemistry (Mestrado) Especialização em Sem especialização Universidade de Évora Escola de Ciências e Tecnologia, Portugal "Isolation and molecular characterization of the fatty acid synthase gene from an obese pig breed" (TESE/DISSERTAÇÃO)	17
2012/09/01 Concluído	Biology (Licenciatura) Universidade de Évora Escola de Ciências e Tecnologia, Portugal	14

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2024/04/01 - 2024/06/30	Investigador Auxiliar Convidado (carreira) (Investigação)	Universidade de Évora, Portugal
	Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal

Outras Carreiras

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2024/07/01 - Atual	Técnico Superior (Técnico Superior)	Universidade de Évora, Portugal
	Universidade de Évora, Portugal (...)
2021/04/01 - 2024/03/31	Técnico Superior (Técnico Superior)	Universidade de Évora, Portugal
	Universidade de Évora, Portugal (...)

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2020/04/07 - 2023/06	Member of the University's Taskforce that regularly tested the community for COVID19	Universidade de Évora, Portugal
	Universidade de Évora, Portugal
2017/09/01 - 2023/01/11	PhD student	Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal

2018/07 - 2018/12	Scientific intership in the Departamento de Mejora Genética Animal under the guidance of Dr. Cristina Óvilo. The training explored the area of next generation sequencing, particularly RNA-seq analysis	Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Espanha

2017/01/01 - 2017/12/31	Master fellowship under the project SelectPorAl - Seleção e melhoramento genómico de características produtivas do Porco Alentejano (ALT20-03-0145-FEDER-000032)	Universidade de Évora, Portugal

2013/09/01 - 2016/12/31	Scientific internship in the laboratories of Metabolism and Nutrition and Plant Virology. Meat quality studies of the Portuguese autochthonous Alentejano breed, applying methods of molecular biology.	Universidade de Évora, Portugal

2012/02/01 - 2012/06/01	Scientific internship in the laboratories of Palinology e Aerobiology. Monitoring spores of Alternaria spp. and Cladosporium spp. in air samples collected by volumetric air samplers.	Universidade de Évora, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2024 - Atual	AltF4 SUBMITTED Investigador Universidade de Évora, Portugal Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal
2018/01/01 - 2023/01/11	Biochemical and molecular bases of the lipid metabolism of Alentejano and Bísaro pig breeds SFRH/BD/132215/2017 Bolseiro de Doutoramento	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2021/04/01 - 2022/09/30	Molecular basis of resistance/susceptibility of Vitis vinifera L. to wood infection by fungal trunk pathogens in Alentejo region 04_2019 Investigador Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal	Concluído

Projeto

	Designação	Financiadores
2021/01/01 - 2025/12/31	CHANGE - Global Change and Sustainability Institute LA/P/0121/2020 10.54499/LA/P/0121/2020 Investigador Universidade de Évora, Portugal Universidade Nova de Lisboa, Portugal FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal Universidade Nova de Lisboa Centro de Investigação em Ambiente e Sustentabilidade, Portugal Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal Universidade do Algarve, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal Universidade de Lisboa Centro de Ecologia Evolução e Alterações Ambientais, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2020/01/01 - 2024/12/31	Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development UIDB/05183/2020 10.54499/UIDB/05183/2020 Investigador Universidade de Évora, Portugal Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal Universidade do Algarve, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2019/01/01 - 2019/12/31	Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas UID/AGR/00115/2019 Bolseiro de Investigação Universidade de Évora, Portugal Instituto Mediterrâneo para a Agricultura Ambiente e Desenvolvimento, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2017/01/01 - 2017/12/31	SelectPorAl ALT20-03-0145-FEDER-000032 Bolseiro de Mestrado Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal Universidade de Évora, Portugal	European Union Concluído

Outro

	Designação	Financiadores
2024/01/01 - Atual	SUMO - Sustentabilidade do Montado PRR-C05-i03-I-000066 Investigador Universidade de Évora, Portugal	European Union Em curso
2024/01/01 - Atual	TID4AGRO 0100_TID4AGRO_4_E Outra Universidade de Évora, Portugal Universidad de Extremadura, Espanha Universidade de Aveiro, Portugal	European Union Em curso
2023/08/28 - Atual	AlmondProtect PD23-00014 Investigador Universidade de Évora, Portugal	BPI Fundação 'la Caixa' Em curso
2023/07/01 - Atual	Protecting Mediterranean almond orchards: preventive based approach using innovative portable technologies to reduce disease incidence semreferencia Co-Investigador Responsável (Co-IR) Universidade de Évora, Portugal	Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas Em curso
2023/06/01 - Atual	INOVCIRCOLIVE - Inovação e Circularidade no Setor Oleícola PRR-C05-i03-I-000208 Outra Universidade de Évora, Portugal	European Union Em curso
2023/05/01 - Atual	Vine and Wine Portugal - Driving Sustainable Growth Through Smart Innovation (sub-projecto - B6.3PPP4Vine) AAC02/C05-i01/2022 Outra	European Union Em curso
2023/02/01 - Atual	Criação de polo no ALentejo para a VIgilância GENómica de doenças na agricultura (ALVIGEN) PD21-00081 Outra Universidade de Évora, Portugal	BPI Fundação 'la Caixa' Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2021/10/01 - 2023/06/30	PRO.VITA - Programa para a Valorização, Inovação e Transferência de Tecnologia no Alentejo POCI-01-0246-FEDER-181308 Outra Universidade de Évora, Portugal	European Union Concluído
2021/04/01 - 2023/06/30	BIOPROTOMATE ALT20-03-0246-FEDER-000056 Outra Universidade de Évora, Portugal	European Union Governo da República Portuguesa Concluído
2021/01/02 - 2023/06/30	ECO-PIG POCI-01-0247-FEDER-072226 Investigador Universidade de Évora, Portugal	Concluído
2020/07/01 - 2023/06/30	Alentejo Region Applied Research for COVID-19 (ARCO) SAICTCOVID/72547/2020 Outra Universidade de Évora, Portugal	Concluído
2021/04/01 - 2023/03/27	GESCERTOLIVE ALT20-03-0246-FEDER-000058 Outra Universidade de Évora, Portugal	European Union Governo da República Portuguesa Concluído
2021/11/01 - 2022/12/31	TECOLIVE PDR2020-101-031764 Investigador Universidade de Évora, Portugal	Concluído
2021/04/01 - 2022/10/14	GAFAPROTECT ALT20-03-0145-FEDER-028263 Outra Universidade de Évora, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia European Union Governo da República Portuguesa Concluído
2021/04/01 - 2022/10/14	TOMVIRPROTECT ALT20-03-0145-FEDER-028266 Outra Universidade de Évora, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2018/01/01 - 2019/03/31	TREASURE 634476 Outra Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal	European Commission Concluído
2015/01/01 - 2015/09/30	MITTIC - Modernización e Innovación Tecnológica con base TIC en sectores estratégicos y tradicionales 0606_MITTIC_4_E Technical and scientific support Universidade de Évora, Portugal	Concluído

Produções

Publicações

Artigo em conferência	Cachucho, L.; Albuquerque, André; Usié, A.; Leão, C.; Meireles, B.; Barbosa, P.; Gaspar, D.; et al. "Composição da carcaça e caracterização físico-química de músculo de porco Alentejano acabado em montanheira ¿ resultados preliminares". Trabalho apresentado em XX Congresso de Zootecnia, Vila Real, 2018. Publicado
Artigo em revista	Mariana Patanita; Campos, M. Doroteia; Albuquerque, André; Joana A. Ribeiro; Pimentel, Diana; Ramiro, Ricardo; Monteiro, Tomás; et al. "Transcriptome profiling of symptomatic vs. asymptomatic grapevine plants reveals insights for plant improvement against trunk diseases". BMC Plant Biology (2025): Acesso aberto • Submetido Albuquerque, André; Patanita, Mariana; Garrido, Nicolás; Campos, M. Doroteia; Ribeiro, Joana A. ; Santos, Filipa; Monteiro, Tomás; Margarida Basaloco-Fonseca ; Félix, Maria do Rosário. "Microbial populations associated with dieback and decline in the new Almond trees of Portugal". Scientific Reports - Nature (2025): Acesso aberto • Submetido Tomás Monteiro; Mariana Patanita; Maria do Rosário Félix; André Albuquerque; Joana A. Ribeiro; Filipa Santos; Margarida Basaloco; Augusto Maria da Rosa; Maria Doroteia Campos. "Organic vs. Integrated-Production Agriculture Farming: Which Grapevine Stress-Responsive Genes Are Affected by the Application of Resistance Inducers and Elicitors?". Agronomy (2024): https://doi.org/10.3390/agronomy14050892. Acesso aberto • Publicado • 10.3390/agronomy14050892 André Albuquerque; Nicolás Garrido; Rui Charneca; Conceição Egas; Luísa Martin; Amélia Ramos; Filipa Costa; Carla Marmelo; José Manuel Martins. "Influence of Sex and a High-Fiber Diet on the Gut Microbiome of Alentejano Pigs Raised to Heavy Weights". Veterinary Sciences (2023): https://doi.org/10.3390/vetsci10110641. 10.3390/vetsci10110641 Martins, José Manuel; Charneca, Rui; Garrido, Nicolás; Albuquerque, André; Jerónimo, Eliana; Guerreiro, Olinda; Lage, Patrícia; et al. "Influence of Sex on Meat and Fat Quality from Heavy Alentejano Pigs Finished Outdoors on Commercial and High Fiber Diets". Animals 13 19 (2023): 3099. http://dx.doi.org/10.3390/ani13193099. Acesso aberto • Publicado • 10.3390/ani13193099 Nicolás Garrido de la Osa; Albuquerque, André; Rui Charneca; Filipa Costa; Carla Marmelo; Maria Amelia Ramos; Luísa Martin; J.M. Martins. "Transcriptomic Profiling of Subcutaneous Backfat in Castrated and Intact Alentejano Pigs Finished Outdoors with Commercial and Fiber-Rich Diets". Genes (2023): https://www.mdpi.com/2073-4425/14/9/1722. Publicado • 10.3390/genes14091722 José Manuel Martins; Ricardo Varino; Rui Charneca; André Albuquerque; Nicolás Garrido; José Neves; Amadeu Freitas; et al. "Outdoor Finishing of Intact Male Portuguese Alentejano Pigs on a Sustainable High-Fiber Diet: Impacts on Blood, Growth, Carcass, Meat Quality and Boar Taint Compounds". Animals (2023): https://doi.org/10.3390/ani13132221. Acesso aberto • Aceite para publicação • 10.3390/ani13132221 Campos, Maria Doroteia; Varanda, Carla; Patanita, Mariana; Amaro Ribeiro, Joana; Campos, Catarina; Materatski, Patrick; Albuquerque, André; Félix, Maria do Rosário. "A TaqMan® Assay Allows an Accurate Detection and Quantification of Fusarium spp., the Causal Agents of Tomato Wilt and Rot Diseases". Biology 12 2 (2023): 268. http://dx.doi.org/10.3390/biology12020268. Acesso aberto • 10.3390/biology12020268 Joana A. Ribeiro; Albuquerque, André; Patrick Materatski; Mariana Patanita; Carla M. R. Varanda; Maria do Rosário Félix; Maria Doroteia Campos. "Tomato Response to Fusarium spp. Infection under Field Conditions: Study of Potential Genes Involved". Horticulturae 8 5 (2022): 433-433. https://doi.org/10.3390/horticulturae8050433. Acesso aberto • 10.3390/horticulturae8050433 Mariana Patanita; Albuquerque, André; Maria Doroteia Campos; Patrick Materatski; Carla M. R. Varanda; Joana A. Ribeiro; Maria do Rosário Félix. "Metagenomic Assessment Unravels Fungal Microbiota Associated to Grapevine Trunk Diseases". Horticulturae 8 4 (2022): 288-288. https://doi.org/10.3390/horticulturae8040288. Acesso aberto • 10.3390/horticulturae8040288 Maria Doroteia Campos; Maria do Rosário Félix; Mariana Patanita; Patrick Materatski; Albuquerque, André; Joana A. Ribeiro; Carla Varanda. "Defense Strategies: The Role of Transcription Factors in Tomato–Pathogen Interaction". Biology 11 2 (2022): 235-235. https://doi.org/10.3390/biology11020235. Acesso aberto • 10.3390/biology11020235 Albuquerque, André; Cristina Ovilo; Yolanda Núñez; RITA BENITEZ; Adrián López-Garcia; Fabián García; Maria do Rosário Félix; et al. Autor correspondente: Albuquerque, André. "Transcriptomic Profiling of Skeletal Muscle Reveals Candidate Genes Influencing Muscle Growth and Associated Lipid Composition in Portuguese Local Pig Breeds". Animals (2021): https://www.mdpi.com/2076-2615/11/5/1423. Acesso aberto • 10.3390/ani11051423 José Manuel Martins; David Silva; Albuquerque, André; José Neves; Rui Charneca; Amadeu Freitas. Autor correspondente: José Manuel Martins. "Physical Activity Effects on Blood Parameters, Growth, Carcass, and Meat and Fat Composition of Portuguese Alentejano Pigs". Animals (2021): https://doi.org/10.3390/ani11010156. Acesso aberto • Aceite para publicação • 10.3390/ani11010156 José Manuel Martins; Rita Fialho; Albuquerque, André; José Neves; Amadeu Freitas; José Tirapicos Nunes; Rui Charneca. Autor correspondente: José Manuel Martins. "Portuguese Local Pig Breeds: Genotype Effects on Meat and Fat Quality Traits". Animals 10 5 (2020): 905-905. https://doi.org/10.3390/ani10050905. Acesso aberto • 10.3390/ani10050905 Albuquerque, André; Cristina Óvilo; Yolanda Núñez; Rita Benítez; Adrián López-Garcia; Fabián García; Maria do Rosário Félix; et al. Autor correspondente: Albuquerque, André. "Comparative Transcriptomic Analysis of Subcutaneous Adipose Tissue from Local Pig Breeds". Genes (2020): https://doi.org/10.3390/genes11040422. 10.3390/genes11040422 J. M. Martins; R. Fialho; Albuquerque, André; J. Neves; A. Freitas; J. T. Nunes; R. Charneca. Autor correspondente: J. M. Martins. "Growth, blood, carcass and meat quality traits from local pig breeds and their crosses". animal (2019): 1-12. http://dx.doi.org/10.1017/s1751731119002222. Publicado • 10.1017/s1751731119002222 Charneca, Rui; Martins, José; Freitas, Amadeu; Neves, José; Elias, Miguel; Laranjo, Marta; Albuquerque, André. "Porco Ribatejano - um estudo inovador no projeto TREASURE". Revista Portuguesa de Zootecnia 4 2 (2019): 43-50. http://hdl.handle.net/10174/26918. Martins, J.M.; Neves, J.; Serrano, A.; Abecasis, I.; Albuquerque, André; Freitas, A.; Nunes, J.T.; Charneca, R.. "The ribatejano pig: Rebirth of a local population? First results on growth, and carcass parameters,O porco Ribatejano: Renascimento de uma população autóctone? Primeiros dados de crescimento e de carcaça". Archivos de Zootecnia 2018 (2018): 127-130. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85042021760&partnerID=MN8TOARS. Publicado • 10.21071/az.v67iSupplement.3222 J. M. Martins; A. Albuquerque; J. A. Neves; A. B. Freitas; R. Charneca; J. L. Tirapicos. "Influence of outdoor rearing and oleic acid supplementation on lipid characteristics of muscle and adipose tissues from obese Alentejano pigs". Journal of Animal Physiology and Animal Nutrition 102 2 (2017): e578-e590. https://doi.org/10.1111%2Fjpn.12799. 10.1111/jpn.12799 A. Albuquerque; José A. Neves; M. Redondeiro; M. Laranjo; M.R. Félix; Amadeu Freitas; José L. Tirapicos; José M. Martins. "Long term betaine supplementation regulates genes involved in lipid and cholesterol metabolism of two muscles from an obese pig breed". Meat Science 124 (2017): 25-33. https://doi.org/10.1016%2Fj.meatsci.2016.10.012. 10.1016/j.meatsci.2016.10.012
Capítulo de livro	Joana A. Ribeiro; Carla M. R. Varanda; Materatski, Patrick; Campos, Maria Doroteia; Mariana Patanita; Albuquerque, André; Nicolás Garrido; et al. "CRISPR/Cas13 for the control of plant viruses". In CRISPR and Plant Functional Genomics, 271-288. Boca Raton, Estados Unidos: CRC Press/Taylor & Francis Group, LLC, 2024. Aceite para publicação Patanita, Mariana; Félix, Maria do Rosário; Joana A. Ribeiro; Varanda, Carla; Albuquerque, André; Materatski, Patrick; Garrido, Nicolás; Campos, Maria Doroteia. "Insights into Grapevine Defence Response Against Fungal and Oomycete Diseases Towards a Sustainable Plant Breeding". In Plant Pathogen Interaction, 119-160. Springer, Singapura: Springer Nature Singapore, 2024. Publicado
Edição de número de revista	Albuquerque, André; Nicolás Garrido de la Osa. "Impact of Genetics and Feeding on Growth Performance of Pigs". Animals (2024): https://www.mdpi.com/journal/animals/special_issues/HGNQ69N292. Publicado • Editor convidado
Poster em conferência	Monteiro, Tomás; Félix, Maria do Rosário; Ribeiro, Joana A. ; Santos, Filipa; Albuquerque, André; Patanita, Mariana; Catarina Campos; et al. "Effects of Alternaria disease on olive cultivars: Preliminary insights of pathogen prevalence across cultivars, organs and growth stages". Trabalho apresentado em IX PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2024. Santos, Filipa; Campos, M. Doroteia; Maria Teresa Carvalho; Albuquerque, André; Patanita, Mariana; Joana A. Ribeiro; Monteiro, Tomás; Margarida Basaloco-Fonseca ; Maria do Rosário Félix. "Molecular and phylogenetic relationships between Colletotrichum species and related fungi based on partial DNA gene analysis". 2024. Inácio, Diogo; Monteiro, Tomás; Félix, Maria do Rosário; Campos, Catarina; Patanita, Mariana; Ribeiro, Joana Amaro; Albuquerque, André; et al. "Olive Endochitinase EP3-Like Gene Mediates Plant Responses against Colletotrichum nymphae Infection". Trabalho apresentado em The 3rd International Electronic Conference on Plant Sciences (IECPS), 2024. da Rosa, Augusto; Patanita, M.; Albuquerque, A.; Campos, M.D.; Ribeiro, J.A.; Santos, Filipa; Monteiro, Tomás; Félix, M.R.. "Quick and accurate diagnostic test for field detection of anthracnose and brown rot diseases in almond trees". Trabalho apresentado em VIII PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2023. Santos, Filipa; Campos, M.D.; Carvalho, M.T.; Albuquerque, A.; Patanita, M.; Ribeiro, J.A.; Monteiro, Tomás; da Rosa, Augusto; Félix, M.R.. "A new tool to protect olive trees against Collectotrichum spp., the causal agents of olive anthracnose". Trabalho apresentado em VIII PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2023. Campos, M.D.; Albuquerque, A.; Carvalho, M.T.; Patanita, M.; Ribeiro, J.A.; Santos, Filipa; Monteiro, Tomás; et al. "A new approach to detect Alternaria spp., an emerging pathogen on olive groves". Trabalho apresentado em VIII PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2023. Monteiro, Tomás; Félix, M.R.; Ribeiro, J.A.; Santos, Filipa; Albuquerque, A.; da Rosa, Augusto; Patanita, M.; Campos, M.D.. "Conventional vs organic agriculture farming: are there stress responsive genes linked to grapevine trunk diseases in different vine varieties?". Trabalho apresentado em VIII PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2023. Patanita, M.; Campos, M.D.; Albuquerque, A.; Ribeiro, J.A.; Santos, Filipa; Monteiro, Tomás; da Rosa, Augusto; Félix, M.R.. "Transcriptomic profiling of grapevine cultivars reveals candidate genes associated with trunk diseases symptomatology". Trabalho apresentado em VIII PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, 2023. Patanita, M.; Campos, M. Doroteia; Ribeiro, Joana Amaro; Albuquerque, André; Varanda, Carla; Materatski, P.; Garrido, N.; Félix, M.R.. "Fungos Endofíticos Associados às Doenças do Lenho: uma Informação Promissora para uma Viticultura Sustentável". Trabalho apresentado em 12º Simpósio da Vitivinicultura do Alentejo, 2023. Patanita, Mariana; Félix, M.R.; Ribeiro, J.A.; Albuquerque, A.; Varanda, C.; Materatski, P.; Garrido, N.; Campos, M.D.. "Doenças do Lenho da Videira: Novas Estratégias Sustentáveis de Mitigação". Trabalho apresentado em 12º Simpósio da Vitivinicultura do Alentejo, 2023. Gaspar, Daniel; Magalhães, H.; Mendes, B.; Leão, C.; Meireles, B.; Barbosa, P.; Cachucho, Liliana; et al. "Role of different "omics" as powerful tools to face climate change and enhance breeding programs". 2023. Joana A. Ribeiro; Varanda, Carla; Materatski, P.; Campos, Maria Doroteia; Albuquerque, A.; M. Patanita; Garrido, Nicolas; et al. "CRISPR/Cas13 system: A technology for the successful control of plant viruses". Trabalho apresentado em Science CHANGing Policy, 2023. Campos, M. Doroteia; Varanda, Carla; Patanita, M.; Ribeiro, Joana; Campos, Catarina; Materatski, P.; Albuquerque, A.; Osa, Nicolás; Félix, M.R.. "qPCR as a sensitive tool for detecting Fusarium spp. in tomato plants". Trabalho apresentado em Science CHANGing Policy, 2023. Diogo Inácio; Félix, Maria do Rosário; Catarina Campos; Mariana Patanita; Joana A. Ribeiro; Varanda, Carla; Materastki, Patrick ; et al. "Identification of Candidate genes involved in olive response to anthracnose for a sustainable disease management". Trabalho apresentado em I Applied Agro-Biotechnology International Meeting, 2023. Teresa Carvalho; Materatski, P.; Nicolas Garrido; M. Patanita; Carla M. R. Varanda; Joana A. Ribeiro; Albuquerque, A.; Campos, M. Doroteia; Félix, Maria do Rosário. "Alternaria alternata an emerging pathogen with great impact on olive groves.". Trabalho apresentado em I Applied Agro-Biotechnology International Meeting, Alentejo Biotechnology Center for Agriculture and Agro-Food, 2023. Patanita, M.; Campos, M. D.; Albuquerque, André; Carla M. R. Varanda; Materatski, P.; Ribeiro, J. A.; Ramiro, R. S.; Pimentel, D.; Félix, M. R.. "An overview of grapevine defence mechanisms and associated biological pathways during fungal and oomycete infections towards a sustainable management strategy". Trabalho apresentado em VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022. Patanita, M.; Campos, M.D.; Albuquerque, André; Materatski, P.; Varanda, C.M.R.; Ribeiro, J.A.; Ramiro, R.; Pimentel, D.; Félix, M.R.. Autor correspondente: Patanita, M.. "Grapevine molecular responses to trunk diseases infection in the Alentejo region.". Trabalho apresentado em III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022. Campos, M.D.; Cordeiro, A.; Patanita, M.; Materatski, P.; Varanda, C.M.R.; Albuquerque, André; Ribeiro, J.A.; Félix, M.R.. "Assessment of Fusarium spp. and Magnaporthiopsis maydis in maize in the Iberian Peninsula.". Trabalho apresentado em III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022. Varanda, C.M.R.; Patanita, M.; Ribeiro, J.A.; Félix, M.R.; Albuquerque, André; Materatski, P.; Campos, M.D.. "Detection and quantification of Fusarium spp., the causal agents of tomato root rot and wilt diseases.". Trabalho apresentado em III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022. Albuquerque, André; Patanita, M.; Varanda, C.M.R.; Campos, M.D.; Materatski, P.; Ribeiro, J.A.; Dias, A.B.; Félix, M.R.. Autor correspondente: Albuquerque, André. "Metabarcoding of the fungal and bacterial communities present in a compost of olive pruning residues.". Trabalho apresentado em III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics, 2022. Martins, J. M.; Charneca, R.; Varino, R.; Albuquerque, André; Freitas, A.; Neves, J.; Costa, F.; et al. "The ECO-PIG project: use of a new high fibre feed for outdoor finishing of intact male local pigs". Trabalho apresentado em 73rd Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, 2022. Martins, J. M.; Charneca, R.; Varino, R.; Albuquerque, André; Freitas, A.; Neves, J.; Marmelo, C.; et al. "Effect of a new fibre feed on blood biochemistry of outdoor finished male local pigs.". Trabalho apresentado em 73rd Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, 2022. Martins, J. M.; Charneca, R.; Varino, R.; Albuquerque, André; Freitas, A.; Neves, J.; Costa, F.; et al. "Outdoor finishing of intact male pigs of local breed on a high fibre diet: effects on growth, carcass, and some meat quality traits". Trabalho apresentado em XI International Symposium on the Mediterranean Pig, 2022. Osa, Nicolás; Albuquerque, André; Charneca, R.; Costa, F.; Marmelo, C.; Martin, L.; Ramos, A.; Martins, J. M.. "Backfat transcriptome of castrated and intact Alentejano pigs fed commercial and fibre-rich experimental diets.". Trabalho apresentado em VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022. Ribeiro, J. A.; Varanda, C. M. R.; Materatski, P.; Campos, M. D.; Albuquerque, André; Patanita, M.; Félix, M. R.. "An innovative tool based on CRISPR/Cas13 to protect tomato plants against ToBFRV". Trabalho apresentado em VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022. Albuquerque, André; Patanita, M.; Garrido, N.; Varanda, C.; Materatski, P.; Ribeiro, J. A.; Campos, M. D.; Félix, M. R.. "Bacterial and fungal communities associated to almond decline.". Trabalho apresentado em VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022. Campos, M. D.; Varanda, C.; Patanita, M.; Ribeiro, J. A.; Materatski, P.; Albuquerque, André; Félix, M. R.. "Establishment of a sensitive Taqman-based approach to monitor Fusarium spp. in tomato plants.". Trabalho apresentado em VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022. Inácio, D.; Félix, M. R.; Campos, C.; Patanita, M.; Ribeiro, J. A.; Varanda, C.; Materatski, P.; et al. "New tools to protect olive plants against anthracnose for a sustainable disease management: I. Candidate genes for new sources of resistance.". Trabalho apresentado em VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022. Correia, A.C.; Varanda, C.; Materatski, P.; Campos, M. D.; Patanita, M.; Albuquerque, André; Ribeiro, J. A.; et al. "Evaluation of the susceptibility of Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi strains to different antimicrobial peptides (AMPs).". Trabalho apresentado em VII Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2022. Campos, Maria Doroteia; Félix, M.R.; Patanita, M.; Materatski, P.; Albuquerque, André; Ribeiro, J.; Carla M. R. Varanda. Autor correspondente: Campos, Maria Doroteia. "Tomato transcription factors regulate defence response against biotic stress.". Trabalho apresentado em VI Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura, 2021. Usié, A.; Magalhães, H.; Antunes, M.; Leão, C.; Gaspar, D.; Meireles, B.; Barbosa, P.; et al. "Whole genome resequencing analysis of Alentejano pigs reveals differences associated with meat quality phenotypes". Trabalho apresentado em IX Bioinformatics open days, 2020. Chimenos, Ana Usié; Magalhães, H.; Leão, Célia; Gaspar, Daniel; B. meireles; Albuquerque, André. "Whole genome Analysis of Alentejano Pigs with Contrasting Meat Quality Phenotypes". Trabalho apresentado em International Plant & Animal Genome Conference XXVIII (PAGXXVIII), 2020. Albuquerque, André; Cristina Óvilo; Yolanda Núñez; Rita Benítez; Adrián López-Garcia; Jaime Ballesteros; Fabián García; et al. Autor correspondente: Albuquerque, André. "Identification of differentially expressed key genes of Longissimus lumborum samples from Portuguese Alentejano and Bísaro local pig breeds". Trabalho apresentado em X International Symposium on Mediterranean Pigs, 2019. Albuquerque, André; Óvilo, Cristina; Núñes, Yolanda; Benítez, Rita; Adrián López-Garcia; Fabián García; Laranjo, Marta; Charneca, Rui; Martins, José Manuel. Autor correspondente: Albuquerque, André. "Comparative transcriptomic analysis of dorsal subcutaneous fat from Portuguese local pig breeds". Trabalho apresentado em 37th International Society for Animal Genetics Conference, 2019. Martins, José Manuel; David Silva; Albuquerque, André; Neves, José Alberto; Charneca, Rui; Amadeu Freitas. "Effects of physical activity on blood, growth and carcass parameters of the Alentejano pig". Trabalho apresentado em 5th Fatty Pig International conference, 2019. Martins, José Manuel; Neves, José Alberto; Serrano, A.; Abecasis, Inês; Albuquerque, André; Freitas, Amadeu; J. L. Tirapicos Nunes; Charneca, Rui. Autor correspondente: Martins, José Manuel. "The Ribatejano Pig: a cross based on a fatty pig". Trabalho apresentado em 4th Fatty Pig Science & Utilization International Conference, 2017. Cachucho, Liliana; Chimenos, Ana Usié; Albuquerque, André; Leão, Célia; Meireles, B; Barbosa, P.; Gaspar, Daniel; et al. Autor correspondente: Jerónimo, Eliana. "Characterization of carcass composition and meat quality traits of Alentejano pigs finished under free-range conditions - Preliminary results.". Trabalho apresentado em 4th Fatty Pig Science & Utilization International Conference, 2017. Albuquerque, André; Félix, Maria do Rosário; Laranjo, Marta; Martins, José Manuel. Autor correspondente: Albuquerque, André. "Transcriptomic analysis of genes involved in the lipid metabolism of the Alentejano pig". Trabalho apresentado em 9th International Symposium on the Mediterranean Pig, 2016. Neves, José Alberto; Martins, José Manuel; Serrano, A.; Abecasis, Inês; Albuquerque, André; Freitas, Amadeu; J. L. Tirapicos Nunes; Charneca, Rui. Autor correspondente: Charneca, Rui. "The Ribatejano pig – rebirth of a local pig population? First results.". Trabalho apresentado em 9th International Symposium on the Mediterranean Pig, 2016. Albuquerque, André; Félix, Maria do Rosário; Laranjo, Marta; Neves, José Alberto; Martins, José Manuel. Autor correspondente: Albuquerque, André. "Fatty acid synthase gene sequence from Alentejano pig, an autochthonous obese breed". Trabalho apresentado em MicroBiotec15, 2015.
Resumo em conferência	Varanda, Carla; Castanho, Beatriz; Albuquerque, André; Joana A. Ribeiro; Mariana Patanita; Nicolás Garrido de la Osa; Campos, M. Doroteia; Félix, Maria do Rosário. "Role of Dicer-like 4 plant protein in OMMV and OLV-1 mixed infections". Trabalho apresentado em Impact Science 23, Santarém, 2023. Varanda, Carla; Materatski, Patrick; Albuquerque, André; Campos, Maria Doroteia; Patanita, Mariana; Félix, Maria do Rosário. "Proteção da oliveira contra vírus utilizando OMMV como vetor de silenciamento". Trabalho apresentado em IX Simpósio Nacional de Olivicultura, Oeiras, 2021. Mariana Patanita; Albuquerque, André; Félix, Maria do Rosário; Materatski, Patrick; Carla M. R. Varanda; Joana A. Ribeiro; Campos, Maria Doroteia; et al. "Grapevine responses to trunk pathogens: potential genes involved in plant-pathogen interactions". Trabalho apresentado em VI PhD Students Meeting in Environment and Agriculture, Évora, 2021. Patanita, M.; Campos, M.D.; Albuquerque, A.; Varanda, Carla; Materatski, Patrick; M.R. Félix. "Metagenomic analysis of fungal microbiota associated to grapevine trunk diseases in Alentejo region". Trabalho apresentado em V PhD Students Meeting in Environmental and Agriculture, Évora, Évora, 2020. Publicado Cachucho, Liliana; Albuquerque, André; Guerreiro, Olinda; Alves, Susana P.; Bessa, Rui J. B.; Usié, Ana; Gaspar, Daniel; et al. "Fatty acids composition of Longissimus lumborum muscle from Alentejano pigs finished under free-range conditions". Trabalho apresentado em 17th Euro Fed Lipid Congress and Expo, Sevilha, 2019. Publicado Charneca, Rui; Martins, J.M.; Albuquerque, A.; Fialho, R.; Neves, J.; Freitas, A.; Nunes, J.T.; et al. Autor correspondente: Martins, José Manuel. "Alentejano and Bísaro pigs and their crosses: genotype effect on loin traits". Trabalho apresentado em X International Symposium on Mediterranean Pig, 2019. Publicado
Tese / Dissertação	"Transcriptomics in Portuguese local pig breeds: an approach to explore the molecular mechanisms underlying lipid metabolism and muscle growth". Doutoramento, Universidade de Évora, 2023. Albuquerque, André Filipe Barreto. "Isolation and molecular characterization of the fatty acid synthase gene from an obese pig breed". Mestrado, 2014. http://hdl.handle.net/10174/13044.

Propriedade Intelectual

Pedido provisório de patente

2022. "Construct for inducing silencing in plants and method for protecting them against tomato spotted wilt virus".
2022. "Construct for inducing silencing in plants and method for protecting them against anthracnose disease".

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2024	Developing a RfxCas13d system for viral RNA interference against ToBRFV.	IX PhD Students Meeting in Environment and Agriculture Universidade de Évora (Évora, Portugal)
2023/05/30	Olive Viruses: Plant pathogens or plant protect agents?	I Applied Agro-Biotechnology International Meeting Alentejo Biotechnology Center for Agriculture and Agro-Food (CEBAL) (Beja, Portugal)
2022/11/16	Avaliação da variabilidade genética em suínos autóctones portugueses utilizando uma análise transcriptómica	MED às 4as Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development (Évora, Portugal)
2022/06/27	Development of a OMMV-based vector for gene expression in plants.	III International Meeting of the Portuguese Society of Genetics Universidade de Évora (Évora, Portugal)
2022/05/17	An RNA-based vaccine for tomato plants against Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV)	Encontro Ciência ‘22 FCT (Lisboa, Portugal)
2022/05/03	Transcriptomics in Portuguese local pig breeds: an approach to explore the molecular mechanisms underlying lipid metabolism and muscle growth.	EFFAB & FABRE TP Annual General Meeting 2022 Universidade de Évora (Évora, Portugal)
2022/04/26	Utilização de vírus modificados para proteção de plantas contra a Colletotrichum spp. e contra Xylella fastidiosa.	Programa de Empreendedorismo Qualificado Startup PhD Parque do Alentejo de Ciência e Tecnologia (PACT) (Portugal)
2022/04/22	Certificação e Proteção fitossanitária de material vegetal de variedades de oliveira portuguesa.	38th OVIBEJA (Beja, Portugal)
2021/10	Proteção da oliveira contra vírus através do desenvolvimento de OMMV como vetor de silenciamento	IX Simpósio Nacional de Olivicultura INIAV (Oeiras, Portugal)
2020/12/09	Differentially expressed genes involved in lipid metabolism in the muscle tissue of Alentejano and Bísaro pig breeds	V Encontro de estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura (Évora, Portugal)
2020/12/09	Metagenomic analysis of fungal microbiota associated to grapevine trunk diseases in Alentejo region	V Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura (Évora, Portugal)
2019/11/11	Comparative RNAseq analysis of backfat tissue from local pig breeds	IV Encontro de Estudantes de Doutoramento em Ambiente e Agricultura (EEDAA) MED - Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Ambiente e Desenvolvimento (Évora, Portugal)
2019/06/28	Innovative studies on Alentejano, Bísaro and Ribatejano genotype pigs	Jornadas MED Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development (Évora, Portugal)
2018/11/08	Influence of the genetic background on the meat quality of autochthonous pig breeds	Seminarios del Departamento de Mejora Genética Animal Instituto Nacional de Investigación y Tecnologia Agraria y Alimentaria (INIA) (Madrid, Espanha)
2018/04/05	Composição da carcaça e caracterização físico-química de músculo de porco Alentejano acabado em montanheira - resultados preliminares	XX Congresso de Zootecnia Associação Portuguesa de Engenharia Zootécnica (Vila Real, Portugal)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2024 - Atual	Composição química da carne e gordura de machos de raça suína Alentejana castrados e sujeitos a imunocastração pré- e pós-púbere Orientador	Engenharia Zootécnica (Mestrado) Universidade de Évora Escola de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/11/11 - Atual	Effect of sex and diet on the regulation of genes involved in lipid metabolism and muscle of Alentejano pigs raised in extensive. Orientador	Engenharia Zootécnica (Mestrado) Universidade de Évora, Portugal
2023/11/11 - Atual	Comparison of growth, carcass, and meat characteristics of castrated and pre- and post-puberty immunocastrated Alentejano pig males. Coorientador	Engenharia Zootécnica (Mestrado) Universidade de Évora, Portugal
2018/09/30 - Atual	Caracterização do perfil em ácidos gordos dos lípidos totais em diferentes tecidos de dois genótipos de raças suínas autóctones portuguesas e seus cruzamentos Coorientador	Bioquímica (Mestrado) Universidade de Évora, Portugal
2021/11/13 - 2023/06/19	Efeito da utilização de machos inteiros e de uma mistura alimentar com inclusão de subprodutos agroindustriais nos parâmetros de carcaça e qualidade de carne da raça suína Alentejana Coorientador	Engenharia Zootécnica (Mestrado) Universidade de Évora, Portugal

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2024/11/07 - 2024/11/07	Participation in the webinar entitled “Maximizing Genomic Insights: An In-Depth Look at Long Read Sequencing”, presented by Dr. Ruihan Bai. Seminário	Novogene Co Ltd, China
2024/10/16 - 2024/10/17	17 Hour workshop in NGS with Oxford Nanopore Technologies. Oficina (workshop)	VWR International LLC, Estados Unidos Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal Oxford Nanopore Technologies Plc, Reino Unido Gulbenkian Institute for Molecular Medicine, Portugal Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2024/09/27 - 2024/09/27	Exhibition organized by the lab members entitled “Fitodiagnosis: let’s diagnose plant diseases!”, in which the participants were invited to identify fungal pathogens present in different plants based on the visual symptoms and microscopic characteristics. The exhibition was performed in the event the European Researchers' Night (ERN), which is a science communication event that takes place annually in several European cities, with the aim of promoting awareness and the population's involvement in science, bringing researchers and civil society close Exposição	European Researchers Night Universidade de Évora, Portugal
2024/05/27 - 2024/05/30	Participation in the “1st course of R for population genetics and animal breeding”, organized and presented by professors Andreia Amaral and Nicolò Macciotta Oficina (workshop)	Universidade de Évora, Portugal Università degli Studi di Sassari, Itália
2024/05/23 - 2024/05/23	Participation in the online seminar entitled “Multiplex em qPCR e dPCR”, organized by Thermo Fisher and presented by Rui Baptista (PhD). Seminário	Thermo Fisher Scientific Inc, Estados Unidos
2024/05/15 - 2024/05/15	Participation in the I Technical Conference of olive groves entitled “Olival : Um setor em contínua transformação” Conferência	Universidade de Évora, Portugal Agriterra, França Induglobal, Unipessoal Lda, Portugal
2024/04/02 - 2024/04/02	Hands-on Digital PCR workshop, organized by Thermo Fisher Scientific and presented by Rui Baptista (PhD). Oficina (workshop)	QuantStudio Absolute Q Digital PCR SmartStart Orientation Thermo Fisher Scientific Inc, Estados Unidos
2024/03/25 - 2024/03/25	Participation in the Alltech seminar entitled: “Avanços em Biotecnologia para Nutrição, Proteção e Rendimento das Culturas”, presented by the engineer Rui Amante under the course unit “Agricultura em Modo de Produção Biológico”. Seminário	Alltech Inc, Estados Unidos
2024/03/06 - 2024/03/06	Participation in the CERTIS seminar entitled: “CERTIS, constituição, estrutura e funções de um organismo de controlo e certificação para a agricultura biológica”, presented by the engineer João Nuno Vaz-Freire under the course unit “Agricultura em Modo de Produção Biológico” Seminário	CERTIS - Controlo e Certificação, Unipessoal, Lda, Portugal
2024/01/19 - 2024/01/19	Demonstration/Workshop by Xloora about precision agriculture and the potential functionalities of the Baco equipment in detecting diseases in the fields, 5-hour hands-on course, 19, 2024 (Évora, Portugal) Oficina (workshop)	Universidade de Évora, Portugal
2023/11/23 - 2023/11/23	Visit to the Plant Virology Laboratory (MED/UÉvora) for winegrowers, to demonstrate the main techniques for diagnosing grapevine diseases and new technologies for controlling them. Outro	Universidade de Évora, Portugal
2023/10/30 - 2023/10/30	Demonstration/Workshop by STABvida of the potential functionalities of the Doctor Vida equipment, Lamp PCRs and molecular diagnostics: a 5-hour hands-on course, October 30, 2023 (Évora, Portugal) Oficina (workshop)	Universidade de Évora, Portugal
2023/10/26 - 2023/10/26	Webinar entitled “A Beginner's Guide to DNA Sequencing”, presented by Dr. Armaan Mehra. Seminário	Novogene Co Ltd, China
2023/10/11 - 2023/10/11	Event to raise awareness of the Smart Farm Hub Project and promote the Anipla Smart Farm Virtual Platform. Seminário	Tecnologia e Informação na Agricultura – Smart Farm Virtual Anipla - Associação Nacional da Indústria para a Proteção das Plantas, Portugal
2023/09/21 - 2023/09/21	Webinar entitled “Long Read Sequencing: Expanding Horizons in Genomic Research”, presented by Dr. Shiqi An. Seminário	Novogene Co Ltd, China
2023/07/03 - 2023/07/04	Exhibition organized by the lab members entitled "Molecular Diagnosis of Plant Pathogens in Mediterranean Crops" in the event "II MED Meeting - Healthy soils, for food, for life and for the future" that occurred between 3-4 July 2023. In this demonstration, the participants were invited to identify fungal pathogens present in olive trees, almond orchards and vineyards, based on the visual symptoms and microscopic characteristics. Encontro	II MED Meeting - Healthy soils, for food, for life and for the future Universidade de Évora, Portugal Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal Universidade do Algarve, Portugal Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
2023/06/01 - 2023/06/01	Webinar entitled “Enhancing NGS Applications: Exploring Novogene's Pre-made Library Sequencing Service and Illumina's NovaSeq™ X Plus System”, presented by Dr. Salah Azzi and Dr. Shiqi An. Seminário	Novogene Co Ltd, China
2023/04/27 - 2023/04/27	Workshop in the 38th OVIBEJA entitled "Da Investigação aos Mercados - A Ação da Universidade de Évora". Festival	Da Investigação aos Mercados - A Ação da Universidade de Évora
2023/04/19 - 2023/04/19	Day of the School of Science and Technology. Open lab to high school students and demonstration of common activities regarding plant protection. Activity named "Os agrónomos também curam plantas". In this activity, students were taken through the process of visual recognition of common symptoms and microscopic and molecular diagnostics to correctly identify the responsible plant pathogen and act accordingly. Festival	Festival da Ciência 2023 Universidade de Évora, Portugal Universidade de Évora Escola de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/01/19 - 2023/01/19	Webinar entitled "A Beginner's Guide to Next Generation Sequencing: Principles & Recent Developments”, presented by Dr. Raed Hmadi Seminário	Novogene Co Ltd, China
2022/11/24 - 2022/11/24	Webinar entitled "Introducing NovoMagic – Novogene’s Online RNA-seq Bioinformatics Analysis Tool", presented by Yue Zhou. Seminário	Novogene Co Ltd, China
2022/07/21 - 2022/07/21	Webinar entitled "ncRNA-seq Results Explained: What you can explore with non-coding RNA data?", presented by Carolina Jiang Zheng. Seminário	Novogene Co Ltd, China
2022/05/18 - 2022/05/18	Demonstration of the work of diagnosis of pathogenic agents in plants carried out by the Laboratories of Plant Virology, Mycology and Nematology of the University of Évora. Diagnosis of pathogens in diseased plants. Encontro	Encontro Ciência ‘22 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2021/11/23 - 2021/11/23	Laboratório aberto à comunidade ‘Doenças em plantas, como diagnosticar’ Encontro	Semana da Ciência e Tecnologia Universidade de Évora Escola de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018/11/14 - 2018/11/16	15 hour intensive course of AWK and SHELL scripting. Oficina (workshop)	AWK y SHELL Script Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Espanha
2018/04/09 - 2018/04/12	This course covered practical aspects of the analysis of differential gene expression by RNAseq. Participants were presented with real world examples and work with them in the training room, covering all the steps of RNAseq analysis, from planning the gathering of sequence data to the generation of tables of differentially expressed gene lists and visualization of results. 28 Hours of lectures and pratical exercises of intensive hands-on training. Oficina (workshop)	Analysis of Differential Expression with RNAseq (ADER18F), The Gulbenkian Trainning Programme in Bioinformatics Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal
2013/04/29 - 2013/05/03	Molecular Biotechnology by professor Bernard Glick from Waterloo University (Canada) - 10 hour theoretical course Seminário	Molecular Biotechnology Universidade de Évora, Portugal Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal
2013/02/18 - 2013/02/22	Technology of monoclonal antibodies - 40 hour intensive course Oficina (workshop)	Tecnologia de anticorpos monoclonais Laboratório Hercules Herança Cultural Estudos e Salvaguarda, Portugal Universidade de Évora, Portugal Universidade de Évora Instituto de Investigação e Formação Avançada, Portugal Instituto Politécnico de Lisboa Centro de Investigação de Engenharia Química e Biotecnologia, Portugal

Júri de grau académico

	Tema Tipo de participação	Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização
2024	Avaliação da susceptibilidade de estirpes de Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi a diferentes péptidos microbianos (AMPs) Arguente principal	Alice Correia (Mestrado) Universidade de Évora Escola de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/07/03	Papel da proteína de planta Dicer-like 4 nas infeções por OMMV e OLV-1 simples e mistas Arguente principal	Beatriz Castanho (Outro)

Consultoria / Parecer

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2021/04/01 - Atual	Optimization and performance of molecular diagnostic tests for the detection of phytopathogenic fungi and viruses in maize	Pioneer Hi-Bred International Inc Waimea, Estados Unidos Corteva Agriscience LLC, Estados Unidos Bayer CropScience Portugal Produtos para a Agricultura Lda, Portugal
2021/04/01 - Atual	Provided services of identification of almond pathogens using several microbiological and molecular tests. Technical support and prescription of preventive and control measures.	Duck River Agriculture, Portugal TREEMOND SA, Portugal Moragri-Sociedade Agricola S.A., Portugal Bolschare Agriculture Unipessoal Lda, Portugal
2021/04/01 - Atual	Provided services of identification of grapevine pathogens using several microbiological and molecular tests. Technical support and prescription of preventive and control measures.	Fundação Eugénio de Almeida, Portugal Sociedade Agrícola de Pias - Vinhos Margaça, Portugal Herdade da Malhadinha Nova - Relais & Châteaux, Portugal
2021/04/01 - Atual	Provided services of identification of olive pathogens using several microbiological and molecular tests. Technical support and prescription of preventive and control measures.	Olivais Do Sul - Sociedade Agro-Pecuária Lda, Portugal De Prado Portugal, SA, Portugal Bolschare Agriculture Unipessoal Lda, Portugal Innoliva, Espanha

Outro júri / avaliação

	Descrição da atividade	Instituição / Organização
2024/10 - 2024/11	Jury of a Master's fellowship in Agricultural Sciences regarding the project ALVIGEN: Criação de polo no ALentejo para a VIgilância GENómica de doenças na agricultura”, ref.ª nº PD21-00081, financed by Promove Program 2020 by Fundação “La Caixa”, in collaboration with BPI and in partnership with Fundação para a Ciência e Tecnologia, within the scope of the ‘Mobilising R&D Projects Competition’.	Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal Universidade de Évora, Portugal
2024/04 - 2024/05	Jury of a Master's fellowship in Agricultural Sciences regarding the project AlmondProtect - Diagnóstico, epidemiologia, monitorização e previsão das principais doenças que afetam o amendoal: Uma proposta sustentável e integrada, ref. PD23-00014, financed by national funds through Fundação “la Caixa”	Universidade de Évora, Portugal Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal

Revisão ad hoc de artigos em revista

	Nome da revista (ISSN)	Editora
2024/09/05 - Atual	Microbiome	BMC Part of Springer Nature
2023/09/16 - Atual	International Journal of Molecular Sciences (1422-0067)	MDPI
2023/07/28 - Atual	Meat Science (0309-1740)	Elsevier
2022/07/01 - Atual	Journal of Animal Science and Biotechnology (2049-1891)	BioMed Central Ltd.
2021/04/09 - Atual	Animals (2076-2615)	MDPI
2020/12/01 - Atual	PEERJ (2167-8359)	PeerJ
2020/04/19 - Atual	Genes (2073-4425)	MDPI

Tutoria

	Tópico	Nome do aluno
2023/06/05 - Atual	Transcriptomics of grapevipes produced in organic and integrated strategies and microbial composition of soils	Tomás Monteiro
2023/06/05 - Atual	Molecular and filogenetic analysis between different species of collectotrichum isolated from several olive orchards	Filipa Santos
2021/04/01 - Atual	Using RNA-seq and microbiome composition analysis to assess the intricate mechanisms ocurring in grapevine trunk diseases	Mariana Patanita
2023/10/01 - 2024/07/31	Lamp technology to rapid in field diagnose of antrachnose and moniliose diseases	Augusto da Rosa
2024/04 - 2024/05	Applications of Real-Time PCR quantification in plant diagnostics	Arnaud Wargnies
2023/01/02 - 2023/10/31	Isolation and molecular characterization of Colletotrichum species from olive orchards and study of several potential fungicides against them	Nicolás Garrido de la Osa
2023/02/01 - 2023/07/31	Real time PCR to assess the infection by Collectotrichum nymphae and main plant defence response genes	Diogo Inácio
2023/01/10 - 2023/03/31	Statistical analysis of real time data	Roukaya Ben Gaied
2022/06/01 - 2022/10/31	Assessment of the incidence of Fusariosis disease in tomato fields through qPCR	Joana Ribeiro
2022/09/11 - 2022/09/16	Program Erasmus + Teaching Mobility staff	Stella Lovelli
2022/05/01 - 2022/07/13	Development of an OMMV-based viral expression vector	Teerajet Laohasatian
2022/04/11 - 2022/04/30	Biological control using Bacillus sp.	Krissana Ruangrit
2017/09/20 - 2018/05/31	Physical and chemical characterization of subcutaneous fat and three economically important muscles of Alentejano and Bisaro pigs	Rita Fialho

Distinções

Prémio

2023	Best Exhibition award Universidade de Évora Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais Mediterrânicas, Portugal
2023	Best Poster award Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo, Portugal
2022	Prémio I&D Aplicada 2021 Universidade de Évora, Portugal
2022	Best Poster Award Instituto Mediterrâneo para a Agricultura Ambiente e Desenvolvimento, Portugal

Outra distinção

2017	Individual research grant to complete a PhD program in Agricultural and Environmental Sciences (SFRH/BD/132215/2017) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal