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Identification

Personal identification

Full name
Hugo Filipe de Mesquita Costa Martiniano

Author identifiers

Ciência ID
1E13-00FA-3C8B
ORCID iD
0000-0003-2490-8913
Google Scholar ID
nnnhH7AAAAAJ
Researcher Id
N-9034-2019
Education
Degree Classification
2013
Concluded
 Doutoramento em Química (Doutoramento)
Major in Química Física
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Dinâmica Molecular ab initio: Aplicações ao Estudo de Propriedades Electrónicas de Sistemas Moleculares" (THESIS/DISSERTATION)
 18 Valores
2006
Concluded
 Licenciatura em Química - Ramo Científico (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Tansferência Protónica assistida por solvente em agregados PhOH(W)n (n=1,3;X=NO2,NH2,Cl)" (THESIS/DISSERTATION)
 15 valores
Projects

Grant

Designation Funders
2016 - 2018 Big Data Mining for Systems Biology.
UID/Multi/04046/2013
Researcher
2014/01 - 2015/06 Cystic fibrosis: Microscopic insights into the folding and gating mechanisms of F508del-CFTR through Molecular Dynamics simulations
Provided by PTCRIS: 133771
EXPL/BBB-BQB/0749/2013
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Foundation for Science and Technology
2011/01 - 2013/12 Specific Ion-Effects and the Stability of Macromolecules: A Combined Molecular Dynamics and Ab initio Approach
Provided by PTCRIS: 113376
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2012 - 2013 Efeitos Específicos de Iões e a Estabilidade de Macromoléculas: Um Estudo Combinado por Métodos Ab initio e Dinâmica Molecular
PTDC/QUI-QUI/113376/2009
Research Fellow

Contract

Designation Funders
2019/01/02 - Current Modelação do fluxo de estudantes no sistema de ensino Português
DSAIPA/DS/0039/2018
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2019 - Current Student flow modelling in the Portuguese educational system
DSAIPA/DS/0039/2018
Researcher
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2017/01/02 - Current Synaptic networks and Personalized Medicine Approaches to Understand Neurobehavioural Diseases Across the Lifespan
SAICTPAC/0010/2015
Researcher
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
Ongoing
2022/01/01 - 2023/06/30 Aproximações baseadas em apredizagem profunda em grafos para medicina personalizada
EXPL/CCI-BIO/0126/2021
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal

Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2019/10/01 - 2022/09/30 Interações Gene-Ambiente na Perturbação do Espetro do Autismo
PTDC/MED-OUT/28937/2017
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2018 - 2021/09/30 Fire4CAST: Fitting Immunocytometry and RNA-technologies for Epidemiological Modeling of Fire Blight
PTDC/ASP-PLA/28305/2017
Researcher
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2017/02/01 - 2021/01/31 Redes sinápticas e abordagens compreensivas de medicina personalizada em doenças neurocomportamentais ao longo da vida
SAICTPAC/0010/2015
Universidade de Coimbra, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal

Universidade do Minho, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2020/05 - 2020/11 Saúde Mental em Tempos de Pandemia COVID-19 (SM-COVID19)
279_596885124
Researcher
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2020 - 2020 Estudo da diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 (COVID-19) em Portugal
234_596874175
Researcher
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2019/01/01 - 2019/12/31 Instituto de Biosistemas & Ciências Integrativas
UID/Multi/04046/2019
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal

Universidade do Minho, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2019/01/01 - 2019/12/31 Biosystems & Integrative Sciences Institute
UID/Multi/04046/2019
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal

Universidade do Minho, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/01 - 2014/06 Thermochemistry of Oxygen Addition to Carbon-Centered Radicals
Provided by PTCRIS: 110542
Researcher
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2013 - 2014 Strategic Project - UI 208 - 2013-2014
PEst-OE/MAT/UI0208/2013
2011/01/01 - 2012/12/31 Projecto Estratégico - UI 208 - 2011-2012
PEst-OE/MAT/UI0208/2011
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal

Universidade de Lisboa Grupo de Física Matemática, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2007/05/01 - 2011/04/30 MOLECULAR MECHANISMS OF PHOTOACIDITY AND THE ENERGETICS OF BOND DISSOCIATION IN AROMATIC ENOLS
SFRH/BD/27577/2006
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2008/01/01 - 2011/03/31 Propriedades electrónicas de redes de ligação de hidrogénio. Implicações para a compreensão dos mecanismos moleculares da fotosíntese.
PTDC/QUI/68226/2006
Universidade de Lisboa Grupo de Física Matemática, Portugal

Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2008/01 - 2011/03 Electronic properties of hydrogen bond networks. Implications for the understanding of molecular mechanisms of photosynthesis.
grant.Provided by PTCRIS: 68226
 Foundation for Science and Technology
Outputs

Publications

Book chapter
  1. Joana Vilela; Muhammad Asif; Ana Rita Marques; João Xavier Santos; Célia Rasga; Astrid Vicente; Hugo Martiniano. "Biomedical Knowledge Graph Embeddings for Personalized Medicine". 2021.
    10.1007/978-3-030-86230-5_46
  2. Hugo F. M. C. Martiniano; Muhammad Asif; Astrid Moura Vicente; Luís Correia. "Network Propagation-Based Semi-supervised Identification of Genes Associated with Autism Spectrum Disorder". 239-248. Springer International Publishing, 2020.
    10.1007/978-3-030-34585-3_21
  3. Luís Cavique; Armando B. Mendes; Hugo F. M. C. Martiniano. "A Feature Selection Algorithm Based on Heuristic Decomposition". 525-536. Springer International Publishing, 2017.
    10.1007/978-3-319-65340-2_43
  4. Estácio, S. G.; Martiniano, H. F. M. C.; do Couto, P. C.; Cabral, B. J. C.. "Solvation Effects on Molecules and Biomolecules". In Solvation Effects on Molecules and Biomolecules, 115-131. Dordrecht: Springer Netherlands, 2008.
    Published • 10.1007/978-1-4020-8270-2_5
Conference abstract
  1. Costa, Alexandra; Fialho, Mónica; Rasga, Célia; Martiniano, Hugo; dos Santos, Osvaldo; Virgolino, Ana; Vicente, Astrid; Heitor, Maria João. Corresponding author: Costa, Alexandra. "Distress among healthcare professionals during the first two years of COVID-19 pandemic in Portugal". Paper presented in 16th European Public Health Conference, Dublin, 2023.
    10.1093/eurpub/ckad160.132
Conference paper
  1. Vilela, Joana; Martiniano, Hugo; Luzia, Sonija; Marques, Ana Rita; Santos, João; Asif, Muhammad; Rasga, Célia; Oliveira, Guiomar; Vicente, Astrid M.. "Identification of disease risk variants in neurotransmission and synaptic genes in Autism Spectrum Disorder". 2019.
  2. Marques, Ana Rita; Martiniano, Hugo; Santos, J.X.; Vilela, Joana; Asif, M.; Rasga, C.; Oliveira, G.; Romão, Luísa; Vicente, Astrid. "Autism Spectrum Disorder: gene variants involved in the nonsense-mediated mRNA decay pathway". 2019.
  3. Xavier Santos, João; Marques, Ana Rita; Martiniano, Hugo; Vilela, Joana; Rasga, Célia; Oliveira, Guiomar; Moura Vicente, Astrid. "Rare variants targeting genes that encode cytochrome P450 enzymes in Autism Spectrum Disorder". 2019.
  4. Vilela, Joana; Martiniano, Hugo; Marques, Ana Rita; Xavier Santos, João; Asif, Muhammad; Rasga, Célia; Oliveira, Guiomar; Vicente, Astrid M.. "Autism Spectrum Disorder: modulation of genomic variant effects on brain structure and function". 2018.
  5. Marques, Ana Rita; Martiniano, Hugo; Santos, J.X.; Vilela, Joana; Asif, M.; Oliveira, G.; Romão, Luísa; Vicente, Astrid. "miRNA and lncRNA gene variants in Autism Spectrum Disorder". 2018.
  6. Vilela, Joana; Martiniano, Hugo; Luzi, Sonija; Marques, Ana; Santos, João; Asif, Muhammad; Rasga, Célia; Oliveira, Guiomar; Vicente, Astrid. "Identification of molecular alterations in neurotransmission and synaptic genes in Autism Spectrum Disorder". 2018.
  7. Marques, Ana Rita; Martiniano, Hugo; Asif, Muhammad; Santos, João Pedro; M. Vicente, Astrid. "Exploratory analysis of mutations targeting noncoding RNAs in autism". 2017.
  8. M. Vilela, Joana; R. Marques, Ana; Martiniano, Hugo; P. Santos, João; Asif, Muhammad; Rasga, Célia; Oliveira, Guiomar; M. Vicente, Astrid. "Regulatory RNAs in Autism Spectrum Disorder: modulation of genomic variant effects on clinical phenotype and brain structure and function". 2017.
  9. Rasga, Célia; Marques, Ana Rita; Martiniano, Hugo; Vilela, Joana; Santos, João; Asif, Muhammad; Vicente, Astrid M.. "A Investigação na Perturbação do Espectro do Autismo". 2017.
Conference poster
  1. Costa, Alexandra; Caldas de Almeida, Teresa; Fialho, Mónica; Rasga, Célia; Martiniano, Hugo; dos Santos, Osvaldo; Virgolino, A.; Vicente, Astrid; Heitor, Maria João. Corresponding author: Costa, Alexandra. "Healthcare professionals’ psychological distress, risk and protective mental health factors after two years of COVID-19 pandemic in Portugal". Paper presented in 3º Dia do Jovem Investigador, 2022.
  2. Costa, Alexandra; Heitor, Maria João; Santos, Osvaldo; Rasga, Célia; Martiniano, Hugo; Virgolino, Ana; Fialho, Mónica; Vicente, Astrid; Caldas de Almeida, Teresa. "Mental health in times of COVID-19: Policy Brief". Paper presented in 14th European Public Health Conference, 2021.
  3. Marques, Ana R.; Martiniano, Hugo; Xavier Santos, João; Vilela, J.; Asif, Muhammad; Oliveira, G.; Enguita, F.; Romão, L.; Vicente, A. M.. "Regulatory RNAs in Autism Spectrum Disorder". Paper presented in Encontro Ciência 2018, 2018.
Journal article
  1. Joana Vilela; Célia Rasga; João Xavier Santos; Hugo Martiniano; Ana Rita Marques; Guiomar Oliveira; Astrid Moura Vicente. "Bridging Genetic Insights with Neuroimaging in Autism Spectrum Disorder—A Systematic Review". International Journal of Molecular Sciences (2024): https://doi.org/10.3390/ijms25094938.
    10.3390/ijms25094938
  2. Joana Vilela; Hugo Martiniano; Ana Rita Marques; João Xavier Santos; Muhammad Asif; Célia Rasga; Guiomar Oliveira; Astrid Moura Vicente. "Identification of Neurotransmission and Synaptic Biological Processes Disrupted in Autism Spectrum Disorder Using Interaction Networks and Community Detection Analysis". Biomedicines (2023): https://doi.org/10.3390/biomedicines11112971.
    10.3390/biomedicines11112971
  3. João Xavier Santos; Pedro Sampaio; Célia Rasga; Hugo Martiniano; Clarissa Faria; Cátia Café; Alexandra Oliveira; et al. "Evidence for an association of prenatal exposure to particulate matter with clinical severity of Autism Spectrum Disorder". Environmental Research (2023): https://doi.org/10.1016/j.envres.2023.115795.
    10.1016/j.envres.2023.115795
  4. Alexandra Costa; Teresa Caldas de Almeida; Mónica Fialho; Célia Rasga; Hugo Martiniano; Osvaldo Santos; Ana Virgolino; Astrid Moura Vicente; Maria João Heitor. "Mental Health of Healthcare Professionals: Two Years of the COVID-19 Pandemic in Portugal". International Journal of Environmental Research and Public Health (2023): https://doi.org/10.3390/ijerph20043131.
    10.3390/ijerph20043131
  5. Vítor Borges; Joana Isidro; Nídia Sequeira Trovão; Sílvia Duarte; Helena Cortes-Martins; Hugo Martiniano; Isabel Gordo; et al. "SARS-CoV-2 introductions and early dynamics of the epidemic in Portugal". Communications Medicine 2 1 (2022): https://doi.org/10.1038/s43856-022-00072-0.
    10.1038/s43856-022-00072-0
  6. Joana Vilela; Muhammad Asif; Ana Rita Marques; João Xavier Santos; Célia Rasga; Astrid Vicente; Hugo Martiniano. "Biomedical knowledge graph embeddings for personalized medicine: Predicting disease-gene associations". Expert Systems (2022): https://doi.org/10.1111/exsy.13181.
    10.1111/exsy.13181
  7. Vilela J; Martiniano H; Marques AR; Santos JX; Rasga C; Oliveira G; Vicente AM. "Disease similarity network analysis of Autism Spectrum Disorder and comorbid brain disorders.". Frontiers in molecular neuroscience (2022): http://europepmc.org/abstract/med/36061363.
    10.3389/fnmol.2022.932305
  8. Santos JX; Rasga C; Marques AR; Martiniano H; Asif M; Vilela J; Oliveira G; et al. "A Role for Gene-Environment Interactions in Autism Spectrum Disorder Is Supported by Variants in Genes Regulating the Effects of Exposure to Xenobiotics.". Frontiers in neuroscience (2022): http://europepmc.org/abstract/med/35663546.
    10.3389/fnins.2022.862315
  9. Ana Rita Marques; João Xavier Santos; Hugo Martiniano; Joana Vilela; Célia Rasga; Luísa Romão; Astrid Moura Vicente. "Gene Variants Involved in Nonsense-Mediated mRNA Decay Suggest a Role in Autism Spectrum Disorder". Biomedicines 10 3 (2022): 665-665. https://doi.org/10.3390/biomedicines10030665.
    10.3390/biomedicines10030665
  10. Vilela J; Martiniano H; Marques A; Santos J; Rasga C; Oliveira G; Vicente A. "Disease similarity network analysis of Autism Spectrum Disorder and comorbid brain disorders". Frontiers in molecular neuroscience (2022): http://europepmc.org/abstract/PMC/PMC9434349.
  11. Virgolino A; Santos O; Fialho M; Heitor M; Costa A; Rasga C; Martiniano H; et al. "Addictive behaviours during the COVID-19 pandemic: results from a nationwide study in Portugal". European journal of public health (2021): http://europepmc.org/abstract/PMC/PMC8574853.
  12. Santos O; Virgolino A; Heitor M; Fialho M; Costa A; Rasga C; Martiniano H; et al. "Mental health during the COVID-19 pandemic in Portugal". European journal of public health (2021): http://europepmc.org/abstract/PMC/PMC8574839.
  13. Amaral, V.; Norberto, B.; Goulão, M.; Aldinucci, M.; Benkner, S.; Bracciali, A.; Carreira, P.; et al. "Programming languages for data-Intensive HPC applications: A systematic mapping study". Parallel Computing 91 (2020): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85076201522&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.parco.2019.102584
  14. Asif, M.; Martiniano, H.F.M.C.; Marques, A.R.; Santos, J.X.; Vilela, J.; Rasga, C.; Oliveira, G.; Couto, F.M.; Vicente, A.M.. "Identification of biological mechanisms underlying a multidimensional ASD phenotype using machine learning". Translational Psychiatry 10 1 (2020): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85079631807&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/s41398-020-0721-1
  15. Muhammad Asif; Jianjun Hu; Hugo F. M. C. M. Martiniano; Astrid M. Vicente; Francisco M. Couto. "Identifying disease genes using machine learning and gene functional similarities, assessed through Gene Ontology". PLOS ONE (2018): https://doi.org/10.1371/journal.pone.0208626.
    10.1371/journal.pone.0208626
  16. Luís Cavique; Armando B. Mendes; Hugo F.M.C. Martiniano; Luís Correia. "A biobjective feature selection algorithm for large omics datasets". Expert Systems (2018): e12301-e12301. https://doi.org/10.1111/exsy.12301.
    10.1111/exsy.12301
  17. Martiniano, Hugo. "Fast and slow dynamics and the local structure of liquid and supercooled water next to a hydrophobic amino acid". Physical chemistry chemical physics : PCCP (2016): http://europepmc.org/abstract/MED/27711518.
    10.1039/c6cp04532d
  18. Martiniano, Hugo. "Thermal unfolding simulations of NBD1 domain variants reveal structural motifs associated with the impaired folding of F508del-CFTR". Molecular bioSystems (2016): https://pubs.rsc.org/en/Content/ArticleLanding/2016/MB/C6MB00193A#!divAbstract.
    10.1039/c6mb00193a
  19. Martiniano HF; Galamba N; Cabral BJ. "Ab initio calculation of the electronic absorption spectrum of liquid water.". (2014): http://europepmc.org/abstract/med/24784291.
    10.1063/1.4871740
  20. Martiniano HF; Galamba N. "Insights on hydrogen-bond lifetimes in liquid and supercooled water.". (2013): http://europepmc.org/abstract/med/24279452.
    10.1021/jp407768u
  21. Ferreira, Cristiane; Martiniano, Hugo F. M. C.; Cabral, Benedito J. Costa; Aquilanti, Vincenzo. "Electronic excitation and ionization of hydrogen peroxide-water clusters: Comparison with water clusters". International Journal of Quantum Chemistry 111 7-8 (2011): 1824-1835.
    Published • 10.1002/qua.22844
  22. Martiniano, Hugo F.M.C.; Cabral, Benedito J. Costa. "Electron binding energies of free base porphyrin and magnesium-porphyrin: A sequential Born–Oppenheimer molecular dynamics/quantum mechanics approach". Journal of Molecular Structure: THEOCHEM 946 1-3 (2010): 26-32.
    Published • 10.1016/j.theochem.2009.09.023
  23. Martiniano, Hugo F.M.C.; Costa Cabral, Benedito J.; Martinho Simões, José A.. "Substituent effects on water-assisted proton transfer in [p-XC6H4OH–(H2O)1–3]+ clusters". Chemical Physics Letters 442 4-6 (2007): 451-459.
    Published • 10.1016/j.cplett.2007.05.083
Newsletter article
  1. Costa, Alexandra; Rasga, Célia; Martiniano, Hugo; Vicente, Astrid; Virgolino, Ana; dos Santos, Osvaldo; Heitor, Maria João; Caldas de Almeida, Teresa. "Saúde mental em tempos da pandemia da COVID-19: abordagem metodológica utilizada no projeto SM-COVID19", Boletim Epidemiológico Observações, 2020, http://hdl.handle.net/10400.18/7250.
Preprint
  1. Borges V; Isidro J; Trovão N; Duarte S; Cortes-Martins H; Martiniano H; Gordo I; et al. "The early dynamics of the SARS-CoV-2 epidemic in Portugal". 2021. http://europepmc.org/abstract/PPR/PPR287079.
    10.1101/2021.02.22.21252216
Report
  1. Caldas de Almeida, Teresa; Heitor, Maria João; Santos, Osvaldo; Costa, Alexandra; Virgolino, Ana; Rasga, Célia; Martiniano, Hugo; Vicente, Astrid. 2020. Saúde mental em tempos de pandemia - SM-COVID-19: relatório final. http://hdl.handle.net/10400.18/7245.
  2. Caldas de Almeida, T; Maria João Heitor; dos Santos, Osvaldo; Costa, Alexandra; Ana Virgolino; Rasga, Célia; Martiniano, Hugo; Vicente, Astrid. 2020. Saúde mental em tempos de pandemia - SM-COVID-19: policy brief. http://hdl.handle.net/10400.18/7246.
Thesis / Dissertation
  1. Martiniano, Hugo Filipe de Mesquita Costa, 1978-. "Dinâmica molecular ab initio:aplicações ao estudo de propriedades electrónicas de sistemas moleculares". PhD, 2013. http://hdl.handle.net/10451/8427.

Other

Other output
  1. A role for gene-environment interactions in Autism Spectrum Disorder is suggested by variants in genes regulating exposure to environmental factors.. 2019. Joao Xavier Santos; Celia Rasga; Ana Rita Marques; Hugo F. M. C. Martiniano; Muhammad Asif; Joana Vilela; Guiomar Oliveira; Astrid Moura Vicente. https://doi.org/10.1101%2F520544.
    10.1101/520544
  2. Identification of biological mechanisms underlying a multidimensional ASD phenotype using machine learning: Additional file. 2018. Muhammad Asif; Hugo F.M.C. Martiniano; Ana R Marques; Joao X Santos; Joana Vilela; Celia Rasga; Guiomar Oliveira; Francisco M. Couto; Astrid M. Vicente. https://doi.org/10.1101%2F470757.
    10.1101/470757