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Daniela Oliveira. Concluiu o(a) Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional em 2015/11/12 pelo(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Licenciatura em Ciências da Saúde em 2013/07/05 pelo(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Licenciatura em Ciências da Saúde em 2013/07/05 pelo(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Dentária, Licenciatura em Ciências da Saúde em 2013/07/05 pelo(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Licenciatura em Ciências da Saúde em 2013/07/05 pelo(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia e Doctor of Philosophy em Computer Science em 2020/01/04 pelo(a) National University of Ireland - Galway College of Engineering and Informatics. É Professor Auxiliar Convidado no(a) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências. Publicou 2 artigos em revistas especializadas. Atua na(s) área(s) de Ciências Exatas com ênfase em Ciências da Computação e da Informação com ênfase em Ciências da Informação e Ciências Exatas com ênfase em Ciências da Computação e da Informação com ênfase em Bioinformática. No seu currículo Ciência Vitae os termos mais frequentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: Knowledge Graphs; Semantic Web; Linked Data; Ontologies; Biomedical Ontologies; .
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Identification

Personal identification

Full name
Daniela Oliveira

Citation names

  • Oliveira, Daniela

Author identifiers

Ciência ID
2F16-07DF-805D
ORCID iD
0000-0003-0559-8737

Email addresses

  • dpoliveira@fc.ul.pt (Professional)

Knowledge fields

  • Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Information Science
  • Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Bioinformatics

Languages

Language Speaking Reading Writing Listening Peer-review
Portuguese (Mother tongue)
English Proficiency (C2) Proficiency (C2) Proficiency (C2) Proficiency (C2) Proficiency (C2)
Spanish; Castilian Elementary (A2) Upper intermediate (B2) Beginner (A1) Intermediate (B1) Beginner (A1)
Education
Degree Classification
2020/01/04
Concluded
 Computer Science (Doctor of Philosophy)
National University of Ireland - Galway College of Engineering and Informatics, Ireland
"Generating and Ranking Candidate Data Models from Background Knowledge" (THESIS/DISSERTATION)
2015/11/12
Concluded
 Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Major in Bioinformática
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Compound Matching of Biomedical Ontologies" (THESIS/DISSERTATION)
2013/07/05
Concluded
 Ciências da Saúde (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Dentária, Portugal
Affiliation

Teaching in Higher Education

Category
Host institution 		Employer
2020/09/01 - Current Invited Assistant Professor (University Teacher) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Others

Category
Host institution 		Employer
2020/09/01 - Current Researcher/Investigadora Universidade de Lisboa Laboratório de Sistemas Informáticos de Grande Escala, Portugal
2016/01/01 - 2020/08/31 Junior Researcher National University of Ireland - Galway College of Engineering and Informatics, Ireland
2014/09/01 - 2015/11/30 Junior Researcher Universidade de Lisboa Laboratório de Sistemas Informáticos de Grande Escala, Portugal
Outputs

Publications

Conference paper
  1. Oliveira, Daniela; Mathieu d'Aquin. "ADOG - Annotating Data with Ontologies and Graphs". 2019.
    Published
  2. Oliveira, Daniela; Mathieu d'Aquin. "Leveraging Ontologies for Knowledge Graph Schemas". Paper presented in Knowledge Graph Building and Large Scale RDF Analytics, 2019.
    Published
  3. Oliveira, D.; Pesquita, C.. "Compound matching of biomedical ontologies". Paper presented in International Conference on Biomedical Ontology, 2015.
  4. Faria, D.; Martins, C.; Nanavaty, A.; Oliveira, D.; Balasubramani, B.S.; Taheri, A.; Pesquita, C.; Couto, F.M.; Cruz, I.F.. "AML results for OAEI 2015". Paper presented in Ontology Matching Workshop collocated with the 14th International Semantic Web Conference (ISWC 2015), 2015.
    Published
Conference poster
  1. Oliveira, Daniela; d'Aquin, M. "RICDaM: Recommending Interoperable and Consistent Data Models". Paper presented in International Semantic Web Conference, 2020.
  2. Oliveira, D.; Pesquita, C.. "Inferring logical definitions using compound ontology matching". Paper presented in International Conference on Biomedical Ontology, 2015.
Journal article
  1. Oliveira, Daniela; Butt, Anila Sahar; Haller, Armin; Rebholz-Schuhmann, Dietrich; Sahay, Ratnesh. "Where to search top-K biomedical ontologies?". Briefings in Bioinformatics 20 4 (2018): 1477-1491. http://dx.doi.org/10.1093/bib/bby015.
    Open access • Published • 10.1093/bib/bby015
  2. Oliveira, Daniela; Pesquita, Catia. "Improving the interoperability of biomedical ontologies with compound alignments". Journal of Biomedical Semantics 9 1 (2018): http://dx.doi.org/10.1186/s13326-017-0171-8.
    Open access • Published • 10.1186/s13326-017-0171-8
Thesis / Dissertation
  1. Oliveira, Daniela. "Generating and ranking candidate data models from background knowledge". PhD, National University of Ireland - Galway College of Engineering and Informatics, 2021. http://hdl.handle.net/10379/16394.
  2. Oliveira, Daniela. "Compound Matching of Biomedical Ontologies". Master, Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 2015. https://repositorio.ul.pt/bitstream/10451/20621/1/ulfc115854_tm_Daniela_Oliveira.pdf.
Activities

Supervision

Thesis Title
Role 		Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2020 - Current Linking patient data to scientific knowledge to support contextualized mining
Supervisor
 Bioinformática e Biologia Computacional (Master)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020 - Current Como as Limitações no Desenvolvimento do Cálculo e Linguagem Afetam a Aprendizagem da Programação?
Co-supervisor
 Ensino em Informática (Master)
Instituto de Educação da Universidade de Lisboa, Portugal
2020 - Current Solução cibersegurança através de dispositivos móveis
Supervisor
 Engenharia Informática (Master)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Conference scientific committee

Conference name Conference host
2021 - Current Extended Semantic Web Conference Online
2020 - Current International Semantic Web Conference Online

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2021 - Current Programação II (Licenciatura) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020 - 2020 Tecnologias de Informação (regente) Ciências da Documentação e Informação (Mestrado integrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Letras, Portugal
2020 - 2020 Programação I (Licenciatura) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - 2019 Programming II Computer Science (Bachelor (1st cycle)) National University of Ireland - Galway College of Engineering and Informatics, Ireland
2018 - 2018 Programming I Computer Science (Bachelor (1st cycle)) National University of Ireland - Galway College of Engineering and Informatics, Ireland
2017 - 2018 Linked Data Computer Science (Master) National University of Ireland - Galway College of Engineering and Informatics, Ireland
Distinctions

Other distinction

2019 3rd SemTab Challenge 2019