Maria João Guia é doutora em Direito, Justiça e Cidadania no Século XXI da Universidade de Coimbra, com a tese Imigração, "Crimigração" e Crime Violento. Os Reclusos Condenados e as Representações sobre Imigração e Crime. Publicou dois livros em língua portuguesa, sobre Imigração e Crime (2008 e 2010) e foi organizadora do livro "A Emergência da Crimigração" (2012), co-editou os livros, em língua inglesa, "Social Control and Justice- Crimmigration in the Age of Fear" (2012). É editora e co-editora de publicações para a Springer: The Illegal Business of Human Trafficking (2014), Immigration, Detention, Risk and Human Rights (2016, com Robert Koulish e Valsamis Mitsilegas), Prison, State and Violence (2019, com Sílvia Gomes), New Forms of Human Trafficking: Global South highlights & local contexts on sexual and labor exploitation (2024, com Anabela Miranda Rodrigues). É Investigadora Integrada do Instituto Jurídico e Investigadora Associada do Ius Gentium Conimbrigae/Centro de Direitos Humanos, ambos da Faculdade de Direito da Universidade de Coimbra. Em 2012 foi galardoada com uma bolsa do programa Ryoichi Sasakawa Young Leaders Fellowship Fund (SYLFF), pelas suas capacidades de liderança e de organização de projetos académicos. A rede internacional CINETS Crimmigration Control International Net of Studies, (www.crimmigrationcontrol.com) que fundou, tem sido uma das suas prioridades académicas. Foi assistente convidada do Mestrado em Criminologia e da Licenciatura em Direito do ISBB em Coimbra (2013-2015). É assistente convidada no Mestrado em Direito na Universidade Autónoma de Lisboa (UAL), onde leciona a Unidade Curricular de Criminologia e tem orientando e co-orientando teses de mestrado, doutorandos e pós-doutorandos nas linhas temáticas em que trabalha: Criminologia; Imigração e Crime; Crimigração e Criminalização da imigração; Tráfico de pessoas e Direitos das vítimas; Criminalidade violenta e Reclusão; Criminalização da pobreza e acesso à justiça; Imigração ilegal/irregular e Direitos dos imigrantes. Dedicou-se a atividades de investigação académica e criminal (enquanto inspetora do SEF), tendo sido membro suplente do Grupo de Peritos para o Tráfico de Seres Humanos da União Europeia, até Agosto de 2011. Foi perita externa independente da Comissão Europeia no campo da Segurança, Liberdade e Justiça até Dez. de 2014 2007/S 140-172522. Desempenhou funções de Training Officer na Agência Europeia de Guarda de Fronteiras e Costeira (FRONTEX) em Varsóvia, Polónia, enquanto perita nacional destacada (Julho 2020-Fevereiro 2023). Desde 2023 é Administradora na Agência da União Europeia para a Formação Policial (CEPOL) onde desempenha funções de Oficial de Investigação e Gestão do Conhecimento. É membro de várias sociedades e projetos de investigação nacionais e internacionais.