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Lucía Pérez. Concluiu o(a) Doutoramento em genetics em 2010 pelo(a) Universidade de Santiago de Compostela, Mestrado em microbioloxia em 2006 pela Universidade de Santiago de Compostela e Licenciatura em Bioloxía em 2004 pela Universidade de Santiago de Compostela. É Pós-doutorado na Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos. Publicou 33 artigos em revistas especializadas. Recebeu 1 prémio(s) e/ou homenagens. Nas suas atividades profissionais interagiu com 98 colaborador(es) em coautorias de trabalhos científicos. No seu currículo Ciência Vitae os termos mais frequentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: cattle; contributions to diversity; genetic structure; mitochondrial DNA; Y-chromosome; Oral microbiome .
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Personal identification

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Lucía Pérez Pardal

Citation names

  • Pérez-Pardal, Lucía

Author identifiers

Ciência ID
8714-0238-F24E
ORCID iD
0000-0002-9751-6550
Google Scholar ID
https://scholar.google.com/citations?user=2WKazbMAAAAJ&hl=en
Scopus Author Id
24315247000

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  • Agrarian Sciences - Animal and Dairy Science
  • Agrarian Sciences - Veterinary Sciences
  • Natural sciences - Biological Sciences - Evolutionary Biology

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Projects

Contract

Designation Funders
2024/01/01 - 2026/12/31 FunDive: Monitoring and mapping Fungal Diversity for nature conservation
BiodivMon/0004/2022
Researcher
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Ongoing
2023/02/15 - 2026/02/14 Agindo sobre os grandes desafios do oceano, através da investigação do passado, presente e futuro. Promoting action on broad ocean challenges by delving into the past, present and future of European syngnathids
DivProtect/0004/2021
Research Fellow
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Ongoing
2021/01/01 - 2025/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology (InBIO)
LA/P/0048/2020
Researcher
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2023/02/01 - 2025/01/31 The bacterial and fungal microbiome of Portuguese dairy farms (MICRODAI)
2022.08540.PTDC
Principal investigator
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Ongoing
2020/01/01 - 2023/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
UIDB/50027/2020
Researcher
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2020/01/01 - 2023/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
UIDP/50027/2020
Researcher
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2018/07/07 - 2022/06/30 Genome Characterization of Native Portuguese Domestic Goats and its RUMEN (GERUCA)
POCI-01-0145-FEDER-028866
Researcher
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Ongoing
2018/06/01 - 2022/05/31 Genome and Rumen Characterization of Native Portuguese Domestic Sheep (GERUOVI)
POCI-01-0145-FEDER-028575
Principal investigator
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT
Ongoing
2019/01/01 - 2019/12/31 Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva
UID/BIA/50027/2019
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade do Minho Laboratório de Paisagens Património e Território, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2017/01 - 2019/12 CompGen: Comparative genomics (Bos taurus, B. indicus and Ovis aries) and genetic architecture of fitness and parasite resistance: validation in European Holstein
MICIIN-FEDER AGL2016-77813-R
MICIIN-FEDER AGL2016-77813-R
Researcher
Servicio Regional de Investigación y Desarrollo Agroalimentario, Spain
N/A
Concluded
2016 - 2018 The archaeogenetics of Iberian cattle: investigating their origins, evolution and improvement -ARCHAIC
PTDC/CVT-LIV/2827/2014
Researcher
Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
Concluded
Outputs

Publications

Conference abstract
  1. Cunha, Raquel; Duarte-Coimbra, Sofia; Amorim, Irina; Guimarães, Tiago; Lopes, Jordana; Marques, D; Pérez-Pardal, Lucía; Rocha, Antonio; Beja-Pereira, Albano. "Diversidade do microbioma do clitóris em éguas reprodutoras: Implicações em endometrites e na saúde reprodutiva da égua". Paper presented in VII Jornadas do Grupo de Trabalho de Investigação em Equídeos, Lisbon, 2023.
    Published
Conference paper
  1. Pérez-Pardal, Lucía; et al.,. "Análisis genómico comparativo entre cepas de los serotipos O1 y O2 de Vibrio anguillarum: identificación de elementos móviles y descripción de un nuevo plásmido.". Paper presented in VI Reunión del Grupo de Microbiología del Medio Acuatico, Valencia, 2006.
Conference poster
  1. Duarte-Coimbra, Sofia; Albano Beja-Pereira (401F-849E-A4A); Pérez-Pardal, Lucía. "Estudo preliminar do microbioma fecal de explorações leiteiras do norte do país". Paper presented in ZOOTEC’24: XXIV Congresso Nacional de Zootecnia, 2024.
  2. Duarte-Coimbra, Sofia; Pérez-Pardal, Lucía; Porto, Miguel; Pedro Rui Beja; Moreira, Francisco; Beja-Pereira, Albano. Corresponding author: Duarte-Coimbra, Sofia. "Monitorization of the Community Structure and Diversity of Soil Microbiome in a Young Florest". Paper presented in Environmental and Agronomical Genomics Symposium, 2024.
  3. Duarte-Coimbra, Sofia; Pérez-Pardal, Lucía; Porto, Miguel; Pedro Rui Beja; Moreira, Francisco; Beja-Pereira, Albano. Corresponding author: Duarte-Coimbra, Sofia. "Monitoring the Soil Microbial Diversity in Young Florests". Paper presented in Third Global Soil Biodiversity Conference, 2023.
  4. Duarte-Coimbra, Sofia; Lucía Pérez Pardal; Miguel Porto; Nuno Calado; Pedro Beja ; Francisco Moreira; Albano Beja Pereir. ""Monitoring the soil microbial diversity in young forest: a brenchmaking overview"". Paper presented in Global Soil Biodiversity Congress (GSBI), 2023.
  5. G. Forcina, S. Chalbi, L. Pérez-Pardal, A. Dos Santos, J.G. Vale Carvalheira, M. Djemali, A. Gaddour , S. Bedihaf-Romdha. "COMPARATIVE RUMEN MICROBIOMICS OF LIVESTOCK BREEDS FROM PORTUGAL AND AFRICA". Paper presented in 72nd EAAP Annual Meeting in Davos, 2021.
  6. Forcina, Giovanni; Dos Santos, A.; Pérez-Pardal, Lucía; Carvalheira, Julio Gil Vale; Beja-Pereira, Albano. Corresponding author: Forcina, Giovanni. "Rumen microbiome of domestic ruminants from extreme environments.". Paper presented in 71st Congress of the European Federation of Animal Sciences (EAAP), 2020.
  7. de Cara, M.A.R.; Pérez-Pardal, Lucía; Beja-Pereira, Albano. "SNP genotyping of Iranian wild boars reveals their uniqueness". Paper presented in Biodiversity Genomics 2020, 2020.
  8. Forcina G., A. Dos Santos, L. Pérez-Pardal, J.G.V. Carvalheira, and A. Beja-Pereira.. "Rumen microbiome of ruminants from extreme environments.". Paper presented in EAAP Annual Meeting, 2020.
  9. Balado, M; Pérez-Pardal, Lucía; Osorio, CR; Lemos ML.. "Identification of a gene cluster envolved in the biosíntesis of siderophore vanchrobactin in Vibrio anguillarum. Poster.". Paper presented in 7th Internacional symposium on microbial iron transport storage and metabolism., 2005.
  10. Juíz-Río ,S; Mouriño, S; Pérez-Pardal, Lucía; Lemos ML ; Osorio, CR.. "Identificación de un operón involucrado en la síntesis de sideróforos en Photobacterium damselae ssp. Piscicida: similitudes estructurales con el sistema de síntesis y transporte de yersiniabactina en Yersinia spp. Poster.". Paper presented in XX Congreso Nacional de Microbiología. Cáceres, Spain, 2005.
  11. Osorio, C; Juíz-Río, S; Pérez-Pardal, Lucía; Mouriño, S; Balado, M; Lemos, ML. "Análisis de la diversidad genética de bacterias marinas patógenas de peces mediante hibridación sustractiva entre genomas completos.". Paper presented in II Reunión Científica Red Nacional de Genómica Bacteriana. Santander, 2005.
Journal article
  1. Babiker, Hamza A; Al-Jardani, Amina; Al-Azri, Saleh; Petit, Robert A.; Saad, Eltaib; Al-Mahrouqi, Sarah; Mohamed, Reham A.H.; et al. "Mycobacterium tuberculosis epidemiology in Oman: whole-genome sequencing uncovers transmission pathways". Microbiology Spectrum 11 5 (2023): http://dx.doi.org/10.1128/spectrum.02420-23.
    10.1128/spectrum.02420-23
  2. Christoph Schwaiger. "Wine experts’ unique nasal microbiome may affect their smell and taste". NewScientist (2023): https://www.newscientist.com/article/2368212-wine-experts-unique-nasal-microbiome-may-affect-their-smell-and-taste/.
  3. Duarte-Coimbra, S; Forcina, G; Perez-Pardal, L; Beja-Pereira, A. "Characterization of tongue dorsum microbiome in wine tasters". FOOD RESEARCH INTERNATIONAL (2023):
    10.1016/j.foodres.2022.112259
  4. Evelyn T. Todd; Laure Tonasso-Calvière; Loreleï Chauvey; Stéphanie Schiavinato; Antoine Fages; Andaine Seguin-Orlando; Pierre Clavel; et al. "The genomic history and global expansion of domestic donkeys". Science (2022): https://doi.org/10.1126/science.abo3503.
    10.1126/science.abo3503
  5. Forcina, G; Pérez Pardal, L; Carvalheira, J; Beja Pereira, A. "Gut Microbiome Studies in Livestock: Achievements, Challenges, and Perspectives". Animals (2022):
    10.3390/ani12233375
  6. Goyache, F; Perez-Pardal, L; Fernandez, I; Traore, A; Menendez-Arias, NA; Arias, KD; Alvarez, I. "Identification and Characterization of Copy Number Variations Regions in West African Taurine Cattle". ANIMALS (2022):
    10.3390/ani12162130
  7. Goyache, Félix; Pérez-Pardal, Lucía; Fernández, Iván; Traoré, Amadou; Menéndez-Arias, Nuria A.; Álvarez, Isabel. "Ancient autozygous segments subject to positive selection suggest adaptive immune responses in West African cattle". Gene 803 (2021): 145899. http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2021.145899.
    10.1016/j.gene.2021.145899
  8. Almeida-Santos, Ana; Martins-Mendes, Daniela; Gayà-Vidal, Magdalena; Pérez-Pardal, Lucía; Beja-Pereira, Albano. "Characterization of the Oral Microbiome of Medicated Type-2 Diabetes Patients". Frontiers in Microbiology 12 (2021): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2021.610370.
    10.3389/fmicb.2021.610370
  9. Álvarez, Isabel; Fernández, Iván; Traoré, Amadou; Pérez-Pardal, Lucía; Menéndez-Arias, Nuria A.; Goyache, Félix. "Genomic scan of selective sweeps in Djallonké (West African Dwarf) sheep shed light on adaptation to harsh environments". Scientific Reports 10 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-59839-x.
    10.1038/s41598-020-59839-x
  10. Alvarez, I; Fernandez, I; Traore, A; Perez Pardal, L; Menendez Arias, NA; Goyache, F. "Ancient Homozygosity Segments in West African Djallonke Sheep Inform on the Genomic Impact of Livestock Adaptation to the Environment". ANIMALS (2020):
    10.3390/ani10071178
  11. Luzuriaga-Neira, Agusto; Pérez-Pardal, Lucía; O’Rourke, Sean M.; Villacís-Rivas, Gustavo; Cueva-Castillo, Freddy; Escudero-Sánchez, Galo; Aguirre-Pabón, Juan Carlos; et al. "The Local South American Chicken Populations Are a Melting-Pot of Genomic Diversity". Frontiers in Genetics 10 (2019): http://dx.doi.org/10.3389/fgene.2019.01172.
    10.3389/fgene.2019.01172
  12. Luzuriaga Neira, A; Perez Pardal, L; O'Rourke, SM; Villacis Rivas, G; Cueva Castillo, F; Escudero Sanchez, G; Ulloa Nunez, A; et al. "Genome scan for selection in South American chickens reveals a region under selection associated with aggressiveness". LIVESTOCK SCIENCE (2019):
    10.1016/j.livsci.2019.05.002
  13. Alvarez, I; Fernandez, I; Soudre, A; Traore, A; Perez Pardal, L; Sanou, M; Tapsoba, SAR; Menendez Arias, NA; Goyache, F. "Identification of genomic regions and candidate genes of functional importance for gastrointestinal parasite resistance traits in Djallonke sheep of Burkina Faso". ARCHIVES ANIMAL BREEDING (2019):
    10.5194/aab-62-313-2019
  14. Perez Pardal, L; Sanchez Gracia, A; Alvarez, I; Traore, A; Ferraz, JBS; Fernandez, I; Costa, V; et al. "Legacies of domestication, trade and herder mobility shape extant male zebu cattle diversity in South Asia and Africa". SCIENTIFIC REPORTS (2018):
    10.1038/s41598-018-36444-7
  15. Álvarez, I.; Pérez-Pardal, L.; Traoré, A.; Koudandé, D.O.; Fernández, I.; Soudré, A.; Diarra, S.; et al. "Differences in genetic structure assessed using Y-chromosome and mitochondrial DNA markers do not shape the contributions to diversity in African sires". Journal of Animal Breeding and Genetics (2017): n/a-n/a. http://dx.doi.org/10.1111/jbg.12278.
    10.1111/jbg.12278
  16. Pérez, Lucía; Perez Pardal, L; Chen, S; Costa, V; Liu, X; Carvalheira, J; Beja Pereira, A. "Genomic differentiation between swamp and river buffalo using a cattle high-density single nucleotide polymorphisms panel". Animal (2017): 1-8. https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-85026511532&doi=10.1017%2fS1751731117001719&partnerID=40&md5=b0cd2564d3e839f5075558dc3f056064.
    10.1017/S1751731117001719
  17. Álvarez I; Pérez-Pardal L; Traoré A; Fernández I; Goyache F. "African Cattle do not Carry Unique Mutations on the Exon 9 of the ARHGAP15 Gene.". (2016): http://europepmc.org/abstract/med/26515718.
    10.1080/10495398.2015.1053606
  18. Álvarez, I.; Pérez-Pardal, L.; Traoré, A.; Fernández, I.; Goyache, F.. "Lack of specific alleles for the bovine chemokine (C-X-C) receptor type 4 (CXCR4) gene in West African cattle questions its role as a candidate for trypanotolerance". Infection, Genetics and Evolution 42 (2016): 30-33. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84964989347&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.meegid.2016.04.029
  19. Álvarez, I.; Pérez-Pardal, L.; Traoré, A.; Fernández, I.; Goyache, F.. "Lack of haplotype structuring for two candidate genes for trypanotolerance in cattle". Journal of Animal Breeding and Genetics 133 2 (2016): 105-114. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84961178145&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/jbg.12181
  20. Pérez-Pardal L; Grizelj J; Traoré A; Cubric-Curik V; Arsenos G; Dovenski T; Markovic B; et al. "Lack of mitochondrial DNA structure in Balkan donkey is consistent with a quick spread of the species after domestication.". (2014): http://europepmc.org/abstract/med/23980868.
    10.1111/age.12086
  21. Druet T; Pérez-Pardal L; Charlier C; Gautier M. "Identification of large selective sweeps associated with major genes in cattle.". (2013): http://europepmc.org/abstract/med/23859468.
    10.1111/age.12073
  22. Ferencakovic M; Curik I; Pérez-Pardal L; Royo LJ; Cubric-Curik V; Fernández I; Alvarez I; et al. "Mitochondrial DNA and Y-chromosome diversity in East Adriatic sheep.". (2013): http://europepmc.org/abstract/med/22762153.
    10.1111/j.1365-2052.2012.02393.x
  23. Traoré A; Royo LJ; Kaboré A; Pérez-Pardal L; Álvarez I; Fernández I; Sawadogo L; Tamboura HH; Goyache F. "Prion protein gene polymorphism in four West African sheep populations.". (2012): http://europepmc.org/abstract/med/22290502.
    10.1007/s11250-012-0088-2
  24. Traoré, A.; Álvarez, I.; Fernández, I.; Pérez-Pardal, L.; Kaboré, A.; Ouédraogo-Sanou, G.M.S.; Zaré, Y.; Tambourá, H.H.; Goyache, F.. "Ascertaining gene flow patterns in livestock populations of developing countries: A case study in Burkina Faso goat". BMC Genetics 13 (2012): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84860580227&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/1471-2156-13-35
  25. Pérez-Pardal L; Ginja C; Royo LJ; Álvarez I; Fernández I; del Valle A; Traoré A; et al. "Genetic structure of the bovine Y-specific microsatellite UMN0103 reflects the genetic history of the species.". (2011): http://europepmc.org/abstract/med/21906111.
    10.1111/j.1365-2052.2011.02177.x
  26. Goyache F; Alvarez I; Fernández I; Pérez-Pardal L; Royo LJ; Lorenzo L. "Usefulness of molecular-based methods for estimating effective population size in livestock assessed using data from the endangered black-coated Asturcon pony.". (2011): http://europepmc.org/abstract/med/21257782.
    10.2527/jas.2010-3620
  27. Edwards, C.J.; Ginja, C.; Kantanen, J.; Pérez-Pardal, L.; Tresset, A.; Stock, F.; Gama, L.T.; et al. "Dual origins of dairy cattle farming - Evidence from a comprehensive survey of european Y-chromosomal variation". PLoS ONE 6 1 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79251570216&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0015922
  28. Álvarez, I.; Royo, L.J.; Pérez-Pardal, L.; Fernández, I.; Lorenzo, L.; Goyache, F.. "Assessing diversity losses due to selection for coat colour in the endangered bay-Asturcón pony using microsatellites". Livestock Science 135 2-3 (2011): 199-204. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78650851497&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.livsci.2010.07.007
  29. Pérez-Pardal L; Royo LJ; Beja-Pereira A; Chen S; Cantet RJ; Traoré A; Curik I; et al. "Multiple paternal origins of domestic cattle revealed by Y-specific interspersed multilocus microsatellites.". (2010): http://europepmc.org/abstract/med/20332805.
    10.1038/hdy.2010.30
  30. Pérez-Pardal L; Royo LJ; Beja-Pereira A; Curik I; Traoré A; Fernández I; Sölkner J; et al. "Y-specific microsatellites reveal an African subfamily in taurine (Bos taurus) cattle.". (2010): http://europepmc.org/abstract/med/19917042.
    10.1111/j.1365-2052.2009.01988.x
  31. Goyache, F.; Fernández, I.; Espinosa, M.A.; Payeras, L.; Pérez-Pardal, L.; Gutiérrez, J.P.; Royo, L.J.; Álvarez, I.. "Demographic and genetic analysis of the Mallorquina sheep flockbook | Análisis demográfico y genético de la raza ovina Mallorquina". ITEA Informacion Tecnica Economica Agraria 106 1 (2010): 3-14. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77953048494&partnerID=MN8TOARS.
  32. Álvarez, I.; Royo, L.J.; Pérez-Pardal, L.; Fernández, I.; Payeras, L.; Goyache, F.. "Assessing losses of genetic variability in the endangered Mallorquí horse". Czech Journal of Animal Science 55 10 (2010): 456-462. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78649243985&partnerID=MN8TOARS.
  33. Pérez-Pardal L; Royo LJ; Alvarez I; de León FA; Fernández I; Casais R; Goyache F. "Female segregation patterns of the putative Y-chromosome-specific microsatellite markers INRA124 and INRA126 do not support their use for cattle population studies.". (2009): http://europepmc.org/abstract/med/19392820.
    10.1111/j.1365-2052.2009.01870.x
  34. Pajares G; Balseiro A; Pérez-Pardal L; Gamarra JA; Monteagudo LV; Goyache F; Royo LJ. "Sry-negative XX true hermaphroditism in a roe deer.". (2009): http://europepmc.org/abstract/med/18524504.
    10.1016/j.anireprosci.2008.04.018
  35. Royo LJ; Alvarez I; Arranz JJ; Fernández I; Rodríguez A; Pérez-Pardal L; Goyache F. "Differences in the expression of the ASIP gene are involved in the recessive black coat colour pattern in sheep: evidence from the rare Xalda sheep breed.". (2008): http://europepmc.org/abstract/med/18384465.
    10.1111/j.1365-2052.2008.01712.x
  36. Royo LJ; Fernández I; Azor PJ; Alvarez I; Pérez-Pardal L; Goyache F. "Technical note: a novel method for routine genotyping of horse coat color gene polymorphisms.". (2008): http://europepmc.org/abstract/med/18310485.
    10.2527/jas.2007-0498
  37. Álvarez, I.; Royo, L.J.; Fernández, I.; Gutiérrez, J.P.; Pérez-Pardal, L.; Guerra, V.; Rincón, C.; Traoré, A.; Goyache, F.. "Genetic differentiation between two geographic subpopulations of Bermeya goat | Diferenciación genética entre dos subpoblaciones de cabra de raza Bermeya de Asturias". ITEA Informacion Tecnica Economica Agraria 104 2 (2008): 290-294. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-65649088153&partnerID=MN8TOARS.
  38. Traoré, A.; Royo, L.J.; Álvarez, I.; Fernández, I.; Gutiérrez, J.P.; Rincón, C.; Pérez-Pardal, L.; Goyache, F.. "Adjacent mutations to ovine PrnP codons 136 and 171 affect performance of the diagnostic protocol based on RT-PCR coupled to fluorescence probes | Mutaciones adyacentes a los codones 136 y 171 del gen PrnP ovino afectan al protocolo diagnóstico basado en RT-PCR acoplado a sondas fluorescentes". ITEA Informacion Tecnica Economica Agraria 104 2 (2008): 106-109. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77953689114&partnerID=MN8TOARS.
  39. Pajares, G.; Álvarez, I.; Fernández, I.; Pérez-Pardal, L.; Goyache, F.; Royo, L.J.. "A sexing protocol for wild ruminants based on PCR amplification of amelogenin genes AMELX and AMELY (short communication)". Archiv fur Tierzucht 50 5 (2007): 442-446. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-35348956017&partnerID=MN8TOARS.
Newspaper article
  1. Hugo Séneca. "Investigadores portugueses descobriram uma bactéria que ajuda a saborear o vinho - e isto pode alterar o modo como se fazem as provas", Expresso, 2023, https://expresso.pt/sociedade/ciencia/2023-02-02- Investigadores-portugueses-descobriram-uma-bacteria-que-ajuda-a-saborear- o-vinho---e-isto-pode-alterar-o-modo-como-se-fazem-as-provas-df9a0e66#.
Preprint
  1. Sofia Duarte Coimbra; Giovanni Forcina; Lucia Perez Pardal; Albano Beja-Pereira. "First insights into nasal microbiome in wine tasters". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.03.21.533426.
    10.1101/2023.03.21.533426
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Presentation title Event name
Host (Event location)
2021 Comparative rumen microbiomics of livestock breeds from Portugal and Africa 72ND ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE
EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE (Davos, Switzerland)
2020 "Rumen microbiome of domestic ruminants from extreme environments". 71st Congress of the European Federation of Animal Sciences (EAAP), 2020.
European Federation of Animal Sciences (Porto, Portugal)
2020 "Genomic signatures on differential adaptation in West African livestock". 71st Congress of the European Federation of Animal Sciences (EAAP), 2020.
European Federation of Animal Sciences (EAAP), (Porto, Portugal)

Supervision

Thesis Title
Role
Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2023/04/01 - Current The bacterial and fungal microbiome of Portuguese dairy farms
Co-supervisor
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2022 - Current Genetic characterization of livestock breeds native to Angola
Supervisor
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2020 - 2021 Characterization of tongue dorsum microbiome from wine tasters
Co-supervisor
Universidade do Porto Faculdade de Ciências da Nutrição e Alimentação, Portugal

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2024/10/27 - 2024/11/01 Whole Genome Sequence Data and Population Genomic Analysis Workshop Sultan Qaboos University, Oman, Oman
2023/04/17 - 2023/04/21 Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução. Análise Computacional de Dados Moleculares (Curso de mestrado (conclusão do curso de especialização)) Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2022 - 2023 Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional Sequenciação de Nova Geração (Curso de mestrado (conclusão do curso de especialização)) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2022 - 2023 DE2022_02_2223 (ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO (CURSO 2022-23)) Análisis de datos genómicos: Next Generation Sequencing (NGS) (Master) Universidad Pablo de Olavide, Spain
2022/04/17 - 2022/04/23 Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução. Análise Computacional de Dados Moleculares (Curso de mestrado (conclusão do curso de especialização)) Universidade do Porto Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Portugal
2021 - 2022 Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional Sequenciação de Nova Geração (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2021 - 2022 DE2021_04_2122 ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO (CURSO 2021-22) Análisis de datos genómicos: Next Generation Sequencing (NGS) (Master) Universidad Pablo de Olavide, Spain
2021/04 - 2021/04 Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução Análise Computacional de Dados Moleculares (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2020 - 2021 Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional Sequenciação de Nova Geração (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2020 - 2021 DE2020_06_2021 (ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO) Análisis de datos genómicos: Next Generation Sequencing (NGS) (Master) Universidad Pablo de Olavide, Spain
2020 - 2020 Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução Análise Computacional de Dados Moleculares (Mestrado) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019 - 2020 DE2019_06_1920 (ANALISIS BIOINFORMATICO (2019-2020) Análisis de datos genómicos: Next Generation Sequencing (NGS) (Master) Universidad Pablo de Olavide, Spain
2018 - 2019 DE2018_06_1819 (Diploma de Especialización en Análisis Bioinformático (2018-2019) Análisis de datos genómicos: Next Generation Sequencing (NGS) (Master) Universidad Pablo de Olavide, Spain

Journal scientific committee

Journal title (ISSN) Publisher
2019 - Current Scientific Reports (2045-2322) Springer Science and Business Media LLC
2013 - Current Animal Biotechnology (1532-2378) Informa UK (Taylor & Francis)
2012 - Current Livestock Science (1871-1413) Elsevier
2012 - Current Journal of Applied Animal Research
2010 - Current Animal Genetics (1365-2052) Wiley (Blackwell Publishing)
Distinctions

Other distinction

2014 Premio extraordinario de tese
Universidade de Santiago de Compostela, Spain