Identification
Personal identification
- Full name
- Sofia Gonçalves Seabra
Citation names
- Seabra, Sofia
- Sofia G. Seabra
Author identifiers
- Ciência ID
- BA13-DAD2-4698
- ORCID iD
- 0000-0003-1413-2349
Email addresses
- sgseabra@ihmt.unl.pt (Professional)
Websites
- https://ghtm.ihmt.unl.pt/profiles/8236/ (Scholar)
Knowledge fields
- Natural sciences - Biological Sciences - Evolutionary Biology
Languages
Language | Speaking | Reading | Writing | Listening | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
English | Upper intermediate (B2) | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Upper intermediate (B2) | |
French | Intermediate (B1) | Upper intermediate (B2) | Intermediate (B1) | Intermediate (B1) | |
Spanish; Castilian | Beginner (A1) | Intermediate (B1) | Beginner (A1) | Beginner (A1) |
Education
Degree | Classification | |
---|---|---|
2007/06/22
Concluded
|
Biologia (Doutoramento)
Major in Especialidade: Biologia Evolutiva
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
"Patterns of Divergence in Populations of Two Mediterranean Species of Genus Cicada L. (hemiptera, Cicadidae) Based on Microsatellite
Genetic Markers and Acoustic Data" (THESIS/DISSERTATION)
|
Distinção e Louvor |
1998
Concluded
|
Biologia Aplicada aos Recursos Animais - ramo Terrestres (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
17/20 |
Affiliation
Science
Category Host institution |
Employer | |
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2020/04/01 - Current | Auxiliary Researcher (Research) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal | ||
2019/07/01 - 2020/03/31 | Researcher (Research) | Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal |
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal | ||
2015/12/01 - 2019/06/30 | Postdoc (Research) | Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal |
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal | ||
2014/02/01 - 2015/11/30 | Postdoc (Research) | Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal |
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal | ||
2007/09/01 - 2013/12/31 | Postdoc (Research) | Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal |
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal |
Teaching in Higher Education
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2016 - 2018 | Invited Assistant Professor (University Teacher) | Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal |
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal |
Others
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2005/03/01 - 2007/06/01 | PhD student/Associate member of Centro de Biologia Ambiental | Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal |
2000/11/01 - 2005/02/01 | PhD grant (SFRH/BD/1027/2000) | Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal |
1999/11/01 - 2000/10/01 | Grant from Fundação da Faculdade de Ciências de Lisboa | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
1999/02/01 - 1999/10/01 | Research Technician grant (PRAXIS XXI/BTI/17239/98) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
Projects
Contract
Designation | Funders | |
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2024/01 - Current | Respira-CV - Airway colonization and microbiome in relation to asthma and atopy in children from Cabo Verde
Respira-CV
Researcher
Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal
Fundação 'la Caixa', Portugal |
Fundação Calouste Gulbenkian Fundação la Caixa Ongoing
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2021/11/01 - Current | EuCARE: European Cohorts of Patients and Schools to Advance Response to Epidemics
Researcher
|
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2023/01/01 - 2024/06/30 | DREBI - Explorando a inibição de efluxo para o combate à resistência aos antimicrobianos e a biofilmes em estafilococos
2022.07931.PTDC
Researcher
Universidade Nova de Lisboa, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
|
2022/01/01 - 2024/01/01 | Minimizing the emergence and dissemination of HIV-1 drug resistance in PALOPs through an evidence-based portable high-throughput
sequencing and computational approach
PTDC/SAU-PUB/4018/2021
Researcher
Universidade Nova de Lisboa, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Saúde Global e Medicina Tropical, Portugal |
Ongoing
|
2022/05 - 2023/08 | WasteWaterVir - Integrating metavirome analysis of wastewaters into tools for surveillance of infectious diseases
GHTM funding
Principal investigator
Universidade Nova de Lisboa Saúde Global e Medicina Tropical, Portugal
|
Universidade Nova de Lisboa Saúde Global e Medicina Tropical
Ongoing
|
2020/01/01 - 2022/12/31 | Ecosystem services on horticulture: value of native mirid species
PTDC/ASP-PLA/29110/2017
Researcher
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
|
2018 - 2021 | Effect of EUtrophication and CLimate on POllinators and ecosystem service provision (EUCLIPO)
PTDC/BIA-ECO/28360/2017
Researcher
|
Ongoing
|
2014/02 - 2015/11 | History, chance and selection during local adaptation: a genome-wide analysis
Post-doc Fellow
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2010/04 - 2013/09 | Mealybug reproductive biology and pheromone-mediated interactions: a basis to develop ecological sound management tactics
for pest mealybugs
Researcher
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2010/03 - 2013/08 | FLYPRED - Has tiger-fly a role in biological control of protected crops?
Researcher
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2010/01 - 2013/06 | Adaptive significance and genetic basis of a balanced colour-polymorphism
Principal investigator
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
Outputs
Publications
Conference poster |
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Journal article |
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Activities
Oral presentation
Presentation title | Event name Host (Event location) |
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2023/04/20 | WasteWaterVir: Surveillance of viral genetic diversity in wastewaters from urban areas | 6º Congresso Nacional de Medicina Tropical
Instituto de Higiene e Medicina Tropical (Lisbon, Portugal)
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2021/11/23 | Molecular epidemiology of Zika virus: a worldwide characterization | MICROBIOTEC 21 - Congress of Microbiology and Biotechnology 2021
NOVA University (online, Portugal)
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2019/07/14 | Demographic history and population structure of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae), an insect vector of Xylella fastidiosa | Satellite meeting Dynamics and Mechanism of Insect-Transmitted, XVIII IS-MPMI Congress
(Glasgow, United Kingdom)
|
2019/07/12 | Geographic distributions and population genetics of the spittle bug Philaenus spumarius, the insect vector of X. fastidiosa in Europe | BRIGIT, 2nd consortium meeting
SASA (Edinburgh, United Kingdom)
|
2019/05/20 | Ocorrência de hibridação entre abelhões comerciais e nativos – potenciais riscos e medidas de gestão | World Bee Day: A Ciência das Abelhas
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal)
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2018/09/18 | Genomic signatures of introgression between commercial and native bumblebees, Bombus terrestris, in the Iberian Peninsula – implications for conservation and trade regulation | EurBee 2018 – 8th Congress of Apidology
(Ghent, Belgium)
|
2017/08/20 | Adaptive significance and genetic basis of the dorsal colour polymorphism of Philaenus spumarius | XVI Congress of the European Society for Evolutionary Biology
(Groningen, Netherlands)
|
2017/06/05 | The colour polymorphic meadow spittlebug as an ecological model species for the study of genomics of adaptation | Frontiers in E3: cE3c 2017 Annual Meeting
Complexo Científico do Campus de Ponta Delgada da Universidade dos Açores (Ponta Delgada, Açores, Portugal)
|
2016/09/05 | Using genomics to understand environmental adaptation of Iberian bumblebees and assess the impact of the use of commercial lineages for crop pollination | Super-B Meeting (5 – 6 September 2016) and 7th EURBEE Congress of Apidology (7 – 9 September 2016)
(Cluj – Napoca, Romania)
|
2016/09/05 | Genomic approaches to assess environmental adaptation and detect signatures of introgression between commercial and native pollinators in the Iberian Peninsula | XVII Congresso Ibérico de Entomologia
LNEC (Lisbon, Portugal)
|
2016/06/27 | Genomics of laboratory adaptation in clinal populations of Drosophila subobscura | 2nd Annual Meeting 2016 – Frontiers in E3
Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal)
|
2016/05/03 | Evolve and reseq: tracking genomic changes during adaptation of clinal populations | ConGenomics – Conference on Conservation Genomics
(Vairão, Portugal)
|
2013/08/19 | Experimental and genomic approaches in the study of the balanced colour-polymorphism of the meadow spittlebug (Philaenus spumarius) | XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology
Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa (Lisbon, Portugal)
|
2013/07/07 | Differential survival and reproduction of the colour morphs of the meadow spittlebug, Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) | 14th International Auchenorrhyncha Congress
(Yangling, China)
|
2013/03/22 | An ecological model species for the study of balanced colour polymorphism: use of genomic tools and experimental approaches | Population Genomics Retreat, Doctoral Program in Population Genomics funded by SNSF
(Gruyère, Switzerland)
|
2011/12/21 | Adaptive significance of a muti-allelic balanced colour-polymorphism – Experiments in captivity and population genomics approach | Encontro Nacional Biologia Evolutiva
(Coimbra, Portugal)
|
2010/08/31 | Adaptive significance and genetic basis of a balanced colour polymorphism | 2nd UK RAD Sequencing meeting
(Edinburgh, United Kingdom)
|
2007/12/21 | Padrões de divergência genética e acústica em espécies mediterrânicas do género Cicada L. (Hemiptera, Cicadidae) | III Encontro Nacional de Biologia Evolutiva
IGC (Oeiras, Portugal)
|
2002/10/07 | Microsatellite study on allopatric and sympatric populations of Cicada barbara and Cicada orni (Hemiptera, Cicadoidea) | VIIth European Congress of Entomology
(Thessaloniki, Greece)
|
1998/12/11 | Actividade de canto, características morfológicas e sucesso reprodutivo no Trigueirão (Miliaria calandra) | III Congresso Nacional da Sociedade Portuguesa de Etologia
(Coimbra, Portugal)
|
Supervision
Thesis Title Role |
Degree Subject (Type) Institution / Organization |
|
---|---|---|
2024 - Current | Fatores associados a baixa cobertura vacinal de tétano nas grávidas na Região Sanitária de Cacheu (Guiné-Bissau), 2017 a 2019.
Co-supervisor
|
Mestrado Saúde Pública e Desenvolvimento (Master)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
|
2024 - Current | Stress ocupacional e Burnout nos Profissionais de Saúde na Guiné-Bissau
Co-supervisor
|
Mestrado Saúde Pública e Desenvolvimento
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
|
2024 - Current | Evaluation of Ultrafiltration Membranes for Virus Removal from Synthetic Wastewater using Cross-Flow Filtration.
Co-supervisor
|
Mestrado em Engenharia Química (Master)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
|
2024/01 - 2024/11/27 | Application and development of viral identification tools for metavirome analysis of wastewaters.
Supervisor
|
Masters in Computational Biology and Bioinformatics (Master)
Universidade Nova de Lisboa, Portugal
|
2021 - 2022 | Fatores sociodemográficos e comportamentais associados à infeção por SARS-CoV-2 no Concelho de Cascais
Supervisor
|
Saúde Pública e Desenvolvimento (Master)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
|
2021 - 2022 | Fatores clínicos associados à serologia positiva ou autoreporte de teste PCR positivo para SARS-CoV-2 na população de Cascais
Co-supervisor
|
Saúde Pública e Desenvolvimento (Master)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
|
2016 - 2017 | Analysis of genomic changes during adaptive evolution in Drosophila subobscura populations of contrasting biogeographical
history
Co-supervisor of Marta Antunes
|
Bioinformática e Biologia Computacional (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2012 - 2017 | Evolutionary history of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) and the adaptive significance and genetic basis of
its dorsal colour polymorphism (Formal supervisor in FCT grant, informal supervisor in FCUL)
Co-supervisor of Ana Sofia Rodrigues
|
Biologia - Especialidade Biologia Evolutiva (PhD) |
2009 - 2010 | Estudo dos padrões filogenéticos e filogeográficos em Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) e espécies próximas
Co-supervisor of Ana Sofia Rodrigues
|
Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2008 - 2009 | Caracterização de microssatélites em espécies de ambientes humanizados. Master thesis in Human and Environmental Biology
Co-supervisor of Inês Satar
|
Biologia Humana e Ambiente (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
Event organisation
Event name Type of event (Role) |
Institution / Organization | |
---|---|---|
2018/10/11 - 2018/10/12 | Member of Organizing Committee of the XIV Encontro Nacional de Biologia Evolutiva, Museu Nacional de História Natural e da
Ciência, Lisboa, Portugal, 11– 12 October 2018. (2018/10/11 - 2018/10/12)
Meeting (Member of the Organising Committee)
|
|
2018/09/04 - 2018/09/07 | Member of Organizing Committee of the 14th Meeting of the IOBC-WPRS Working Group, INIAV, Oeiras, Portugal "Integrated control
in protected crops, Mediterranean climate" (4 – 7 September 2018). (2018/09/04 - 2018/09/07)
Meeting (Member of the Organising Committee)
|
|
2013/08/19 - 2013/08/24 | Member of the Organising Committee of XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology, FCUL, Lisbon, Portugal
(19 – 24 August 2013). (2018/08/19 - 2018/08/24)
Congress (Member of the Organising Committee)
|
Jury of academic degree
Topic Role |
Candidate name (Type of degree) Institution / Organization |
|
---|---|---|
2024 | A Genomic Perspective on Iberian Tettigettalna Species Evolution and Diversification
(Thesis) Main arguer
|
Mariana Mora (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2024 | Predictability of genomic evolution of populations with contrasting initial history
(Thesis) Main arguer
|
E. Barreira (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2023 | Genomics of adaptation to cadmium on a spatially heterogeneous environment
(Thesis) Main arguer
|
Marta Ferreira (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2023 | Analysis of population structure and local adaptation in Holm Oak
(Thesis) Main arguer
|
David Galhofa (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2020 | Olive fly management today: the role of predators
(Thesis) Main arguer
|
Inês Ramires (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2020 | Cigarrinhas-verdes da vinha em modo de produção biológico: dinâmica populacional e refúgios de inverno.
(Thesis) Main arguer
|
Oscar Alvarez (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2019 | African marine invertebrate data analysis and imaging: a dataset and digital platform for research, education and outreach
(Thesis) Main arguer
|
Henrique Niza (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2019 | Biodiversity informatics – Entomological data processing, analysis and visualization
(Thesis) Main arguer
|
Leonor Venceslau (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2018 | Employment of whole genome resequencing to reveal the evolutionary history and to develop molecular tools for Western European
honey bees (Apis mellifera subspecies)
(Thesis) Arguer
|
Dora Henriques (PhD)
Universidade do Minho Escola de Ciências, Portugal
|
2018 | Black seabream, Spondyliosoma cantharus: stock structure in the eastern Atlantic and characterisation of the biology and fishery
in the Portuguese coast
(Thesis) Arguer
|
Ana Neves (PhD)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2017 | Evolutionary history of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) and the adaptive significance and genetic basis of
its dorsal colour polymorphism
Thesis Member
|
Ana Sofia Rodrigues (PhD)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2017 | Diversity patterns of honey bee (Apis mellifera L.) populations from the archipelago of Azores: insights from mtDNA and wing
geometric morphometrics
(Thesis) Main arguer
|
Helena Ferreira (Master)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2017 | Analysis of genomic changes during adaptive evolution in Drosophila subobscura populations of contrasting biogeographical
history
Supervisor
|
Marta Antunes (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2011 | Morphological and genetic divergence of the mangrove gastropod Cerithidea decollata along the eastern coast of Africa
(Thesis) Main arguer
|
Sara Madeira (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2011 | On the evolutionary history of the iberian Sooty Copper butterflies
Thesis Member
|
Renata Martins (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2010 | Estudo dos padrões filogenéticos e filogeográficos em Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) e espécies próximas
Supervisor
|
Ana Sofia Rodrigues (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
2009 | Caracterização de microssatélites em espécies de ambientes humanizados
Supervisor
|
Inês Satar (Master)
Universidade de Lisboa - Faculdade de Ciências, Portugal
|
Association member
Society Organization name | Role | |
---|---|---|
2023/12 - Current | Associação Portuguesa de Biologia Evolutiva (APBE) | |
2023/01 - Current | Sociedade Portuguesa de Entomologia | |
2013/07 - Current | International Auchenorrhyncha Society | Member of Board of Administrators |
Conference scientific committee
Conference name | Conference host | |
---|---|---|
2024/12/12 - Current | XV Jornadas Científicas do IHMT | Instituto de Higiene e Medicina Tropical |
2024/11/26 - Current | Congresso Internacional de Microbiologia em Língua Portuguesa | https://microbiologia2024.com/ |
2023/12/18 - 2023/12/19 | XIX ENBE - Annual meeting of Portuguese Association for Evolutionary Biology | Instituto Superior de Agronomia / Universidade Lisboa |
2019/07/10 - 2019/07/13 | XVIII Congreso Ibérico de Entomologia | |
2016/09/05 - 2016/09/08 | XVII Congresso Ibérico de Entomologia | LNEC |
2015/12/21 - 2015/12/21 | XI Encontro Nacional de Biologia Evolutiva | Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa |
Course / Discipline taught
Academic session | Degree Subject (Type) | Institution / Organization | |
---|---|---|---|
2023 - 2024 | Epidemiologia Molecular | Biologia Computacional e Bioinformática (Mestrado integrado) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
2022 - 2024 | Saúde e Ambiente | Saúde Pública e Desenvolvimento (Mestrado integrado) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
2022 - 2024 | Saúde Ambiental e Ocupacional | Saúde Internacional (Especialização pós-licenciatura) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
2022 - 2024 | Python Aplicado às Ciências Biomédicas | (Outros) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
2021 - 2024 | Bioestatística I - Análise de Dados em Saúde | Saúde Internacional (Especialização pós-licenciatura) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
2020 - 2024 | Bioestatística | Ciências Biomédicas (Doutoramento) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
2022 - 2022 | Crash course: Utilização da linha de comandos | (Outros) | Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal |
2022 - 2022 | Unidade Curricular de Estatística (3 ECTs) do Curso Internacional de Saúde Pública (CIESP), Bissau, Guiné-Bissau, organizado pelo Instituto de Higiene e Medicina Tropical (Universidade Nova de Lisboa), inserido no Projeto IANDA Guiné Saúdi, 2022 | (Outros) | |
2017 - 2018 | Bioinformática Prática | Biologia Humana e Ambiente (Mestrado integrado) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
2016 - 2017 | Biologia Evolutiva | Biologia (Mestrado) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
2016 - 2017 | Filogenética | Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento (Mestrado) | Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
Evaluation committee
Activity description Role |
Institution / Organization | Funding entity | |
---|---|---|---|
2018 - 2018 | Project evaluation as a scientific expert
Evaluator
|
National Research Agency (ANR) |
Mentoring / Tutoring
Topic | Student name | |
---|---|---|
2024/06 - 2024/12 | Mentoring post-doctoral researcher | Filomena Manjate |
2021/07/12 - 2021/07/23 | Tutoring in internship "Curtos Estágios Científicos em Férias" organized by ANEM | Carolina Almeida |
2018 - 2018 | Training of students in Molecular Genetics in the laboratory of Genetics of DBA, FCUL: | Diogo Couceiro (graduate student in Biochemistry); Martina Panisi (PhD student in BIODIV) |
2010 - 2013 | Co-supervision of research technicians in several projects - field work, laboratory work and data analysis | Eduardo Marabuto; Sara Ema Silva; João Silva; Renata Martins; Patricia Brás; Ana Maria Tavares |
Distinctions
Other distinction
1993 | Menção Honrosa aos alunos caloiros que concluiram o 1º ano com melhores classificações
Fundação da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Portugal
|