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Ana Botelho. Publicou 38 artigos em revistas especializadas. Atua na(s) área(s) de Ciências Naturais com ênfase em Ciências Biológicas com ênfase em Microbiologia. No seu currículo Ciência Vitae os termos mais frequentes na contextualização da produção científica, tecnológica e artístico-cultural são: Diagnóstico; PCR; Tuberculose Bovina; .
Identification

Personal identification

Full name
Ana Rosa Pombo Botelho

Citation names

  • Botelho, Ana
  • Ana Rosa Botelho

Author identifiers

Ciência ID
C611-8E44-0E08
ORCID iD
0000-0002-1843-9455

Knowledge fields

  • Natural sciences - Biological Sciences - Microbiology
Education
Degree Classification
2002
Concluded
 Microbiologia Molecular (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Caracterização e detecção moleculares de Mycoplasma mycoides subsp. mycoides, agente etiológico da Peripneumonia Contagiosa Bovina" (THESIS/DISSERTATION)
 Aprovada por unanimidade
2002
Concluded
 Biologia (Doutoramento)
Major in Especialidade: Biologia Molecular
Universidade NOVA de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Caracterização e Detecção Moleculares de Mycoplasma Mycoides Subsp. Mycoides Sc, Agente da Peripneumonia Contagiosa Bovina" (THESIS/DISSERTATION)
1992
Concluded
 Mestrado em Biotecnologia - Especialidade Biologia Molecular (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Sondas de DNA Ribossomal específicas de Candida albicans" (THESIS/DISSERTATION)
 Muito Bom por unanimidade
1978
Concluded
 Biologia Ramo Científico (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Quebra de incompatibilidade em heterocários common-B de Coprinus cinereus" (THESIS/DISSERTATION)
 17 valores
Affiliation

Science

Category
Host institution 		Employer
2002 - Current Auxiliary Researcher (Research) Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Projects

Contract

Designation Funders
2020 - Current DISCOVER - Discovering the sources of Salmonella, Campylobacter, VTEC and antimicrobial resistance
info:eu-repo/grantAgreement/ARC/Discovery Projects/DP160100959/AU
Principal investigator
Ongoing
2020 - Current ADONIS- Assessing the determinantes of non decreasing Incidence of Salmonella
773830 H2020- GA-773830H2020
Researcher
Ongoing
2020 - Current IDEMBRU- Identification of emerging Brucella species: new threats for human and animals
773830 H2020- GA-773830H2020
Researcher
Ongoing
2018 - Current AquaRAM -Determinantes de resistencia antimicrobina em ambientes de aquacultura
ALG-01-0145-FEDER-028824
Principal investigator
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Ongoing
2018 - Current ONEHEALTHEJP -One Health EJP Promoting One Health in Europe through joint actions on foodborne zoonoses, antimicrobial resistance and emerging microbiological hazards CONSORTIUM AGREEMENT
773830 H2020- GA-773830
Principal investigator
N/A
Ongoing
2018 - Current CIAinVET -CIAINVET — ANIMAIS PRODUTORES DE ALIMENTOS COMO RESERVATÓRIOS DE RESISTÊNCIA A ANTIBIÓTICOS DE IMPORTÂNCIA CRÍTICA
PTDC/CVT-CVT/28469/2017
Researcher
Ongoing
2004 - Current VENoMYC - Veterinary European Network of of Laboratories Researching into Improved Diagnosis and Epidemiology of Mycobacterial Diseases
Co-ordination Action SSPE-CT-2004-501903
Principal investigator
Concluded
2000/10/01 - Current Study of Immunogenic Proteins of Mycoplasma Mycoides Subsp. Mycoides Small Colony Type
info:eu-repo/grantAgreement/FCT/POCI/36250/PT
 Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia
Concluded
1996 - Current Development of new and improved diagnostic tests for Contagious Bovine Pleuropneumonia (CBPP) in Europe
FAIR CT 095-0711
PhD Student Fellow
Concluded
1995 - Current Mycoplasmas of ruminants: pathogenicity, diagnostics, epidemiology and molecular genetics
COST Action 826
PhD Student Fellow
Concluded
2018/08/10 - 2022/12/31 ControlO de tubercuLOSe na interface bovinoS-faUna Silvestre com recurso a soluções inovadoras inspiradas na natureza
PTDC/CVT-CVT/29783/2017
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2018/10/30 - 2022/10/29 Determinantes de resistencia antimicrobina em ambientes de aquacultura
PTDC/BIA-MIC/28824/2017
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Instituto Português do Mar e da Atmosfera, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2018/10/01 - 2022/09/30 Animais produtores de alimentos como reservatórios de resistência a antibióticos de importância critica
PTDC/CVT-CVT/28469/2017
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2018/10/01 - 2022/09/30 Animais produtores de alimentos como reservatórios de resistência a antibióticos de importância critica
PTDC/CVT-CVT/28469/2017
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2018/10/30 - 2021/10/29 Determinantes de resistencia antimicrobina em ambientes de aquacultura
PTDC/BIA-MIC/28824/2017
Principal investigator
Instituto Português do Mar e da Atmosfera, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Instituto Português do Mar e da Atmosfera, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2018 - 2021/08/09 COLOSSUS - ControlO de tubercuLOSe na interface bovinoS-faUna Silvestre com recurso a soluções inovadoras inspiradas na natureza
02/SAICT/2017
PTDC/CVT-CVT/29783/2017
Researcher
FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
2013 - 2017 IB-BIOALERTNET - Iberian Network of Laboratories of Biological alert. Accreditation of methods for detection of highly pathogenic agents
HOME/2012/ISEC/AG/CBRN/4000003810
Principal investigator
Concluded
2012/02/01 - 2015/07/31 MyPATH- Elucidação da patogenia do complexo Mycobacterium tuberculosis por genómica comparativa: avaliação do benefício associado à estratégia de crescimento em biofilmes
PTDC/CVT/117794/2010
Laboratório Nacional de Investigação Veterinária, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2010 - 2015/07/31 MyPATH- Elucidação da patogenia do complexo Mycobacterium tuberculosis por genómica comparativa: avaliação do benefício associado à estratégia de crescimento em biofilmes.
FCT - PTDC/CVT/117794/2010
FCT - PTDC/CVT/117794/2010
PTDC/CVT/117794/2010
Researcher
Laboratório Nacional de Investigação Veterinária, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
N/A

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/04/01 - 2014/12/31 Febre Q - do diagnóstico à investigação eco-epidemiológica de Coxiella burnetii no contexto da infecção humana
PTDC/SAU-SAP/115266/2009
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal

Laboratório Nacional de Investigação Veterinária, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2009 - 2014/12/31 Febre Q- do diagnóstico à investigação eco-epidemiológica de Coxiella burnetii no contexto da infeção humana
PTDC/SAU-SAP/115266/2009
PTDC/SAU-SAP/115266/2009
Principal investigator
Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal

Laboratório Nacional de Investigação Veterinária, Portugal
N/A

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/03/01 - 2014/02/28 zoonTB - Novas abordagens moleculares para a detecção e discriminação de membros do Complexo Mycobacterium tuberculosis associados a tuberculose animal e avaliação do potencial zoonótico destas espécies em Portugal
PTDC/CVT/111634/2009
Laboratório Nacional de Investigação Veterinária, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2011/03/01 - 2014/02/28 zoonTB - Novas abordagens moleculares para a detecção e discriminação de membros do Complexo Mycobacterium tuberculosis associados a tuberculose animal e avaliação do potencial zoonótico destas espécies em Portugal
PTDC/CVT/111634/2009
Laboratório Nacional de Investigação Veterinária, Portugal

Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
2004 - 2008 AGRO medida 8 (projecto nº 786) - Estudo da paratuberculose ovina na região da Serra da Estrela
AGRO medida 8- 786
Researcher

Other

Designation Funders
2015 - 2019 ANTARES- Anthrax: Análise e rastreio em solos
CINAMIL
Principal investigator
Concluded
Outputs

Publications

Book chapter
  1. Botelho, Ana. "Trends and challenges of Q fever control in animal and human populations. In Simões, Anastácio & Silva (Eds.). The principles and practices of Q fever. The One Health Paradigm. Bacteriology Research Developments. Nova Science Publishers, Inc. New York. Chapter 25, 391-404.". 2017.
  2. Botelho, Ana. "Análise do número variável de repetições nucleotídicas em tandem em múltiplos loci (MLVA-VNTR): Elucidação da epidemiologia da tuberculose bovina". 2014.
  3. Bradley, Timothy J.. "Contagious Bovine Pleuropneumonia (Revision). In Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals. OIE, World Organization for Animal Health.". In Animal Osmoregulation, 111-132. Oxford University Press, 2014.
    10.1093/acprof:oso/9780198569961.003.0008
  4. Botelho, Ana. "• Botelho, A. 2001. “Molecular characterization and detection of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC, the etiological agent of CBPP” Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, 150 pp. (PhD Thesis).". 2001.
  5. Botelho, Ana. "• Botelho, A 1991. “Sondas de DNA ribossomal específicas de Candida albicans”. Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa, 110 pp. (Master of Science Thesis).". 1991.
  6. Botelho, Ana. "• Botelho, A. 1978. “Quebra de incompatibilidade em heterocários common-B de Coprinus cinereus: causas genéticas”. Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa. (Graduation Thesis).". 1978.
Conference paper
  1. Botelho, Ana. "Botelho, A ., Prata, A ., & Regalla, J., 2001. Use of Low Molecular Weight RNA Profiles to Characterize Members of the Mycoplasma mycoides Cluster. In COST Action 826. Agriculture and biotechnology. Mycoplasmas of ruminants: pathogenicity, diagnostics, epidemiology and molecular genetics. Vol 5, EUR 19693 EN, Luxembourg. pp. 50-53.". 2001.
  2. Botelho, Ana. "• Botelho, A ., Prata, A., Bashiruddin, J, & Regalla, J. 1999. Evaluation of colorimetric PCR for the diagnosis of CBPP. In COST 826. Agriculture and biotechnology. Mycoplasmas of ruminants: pathogenicity, diagnostics, epidemiology and molecular genetics. Vol. 3, EUR 18756 EN, Luxembourg. pp. 166-169.". 1999.
  3. Botelho, Ana. "• Botelho, A., Frey, J., Regalla, J. & Nicolet, J. 1998. DNA fingerprinting of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC isolates with the insertion element IS1296. In COST 826 Agriculture and biotechnology. Mycoplasmas of ruminants: pathogenicity,, diagnostics, epidemiology and molecular genetics. Vol. 2. Report EUR 18018, pp. 148-151.". 1998.
  4. Botelho, Ana. "• Botelho, A. & Regalla, J. 1996. PCR versus conventional methods in the diagnostic of CBPP in Portugal. In COST 826 Agriculture and biotechnology. Mycoplasmas of ruminants: pathogenicity, diag". 1996.
    Published
  5. Botelho, Ana. "• Brandão, E., Botelho, A., Deniz, S. & Johansson, K.-E. 1996. Contagious agalactiae of sheep and goats: evaluation of diagnostic procedures including PCR. In COST 826. Agriculture and biotechnology. Mycoplasmas of ruminants: pathogenicity, diagnostics, epidemiology and molecular genetics. Vol.1 Report 16934, pp. 122-124.". 1996.
Journal article
  1. Helena Sofia Salgueiro; Ana Cristina Ferreira; Ana Sofia Ribeiro Duarte; Ana Botelho. "Source Attribution of Antibiotic Resistance Genes in Estuarine Aquaculture: A Machine Learning Approach". Antibiotics (2024): https://doi.org/10.3390/antibiotics13010107.
    10.3390/antibiotics13010107
  2. Mónica Oleastro; Ana Botelho. "Editorial for Special Issue Foodborne Pathogens: Infections and Pathogenesis". Microorganisms (2023): https://doi.org/10.3390/microorganisms11061544.
    10.3390/microorganisms11061544
  3. Daniel G. Silva; Célia P. F. Domingues; João F. Figueiredo; Francisco Dionisio; Ana Botelho; Teresa Nogueira. "Estuarine Aquacultures at the Crossroads of Animal Production and Antibacterial Resistance: A Metagenomic Approach to the Resistome". Biology (2022): https://doi.org/10.3390/biology11111681.
    10.3390/biology11111681
  4. Teresa Nogueira; Daniel G. Silva; Susana Lopes; Ana Botelho. "Database of Metagenomes of Sediments from Estuarine Aquaculture Farms in Portugal—AquaRAM Project Collection". Data (2022): https://doi.org/10.3390/data7110167.
    10.3390/data7110167
  5. Catarina Albuquerque; Sandra Cavaco; Pedro Caetano; Sandra Branco; Helena Monteiro; Marcos Ramos; Anabel Usié Chimenos; Célia Leão; Ana Botelho. "Ovine footrot in Southern Portugal: Detection of Dichelobacter nodosus and Fusobacterium necrophorum in sheep with different lesion scores". Veterinary Microbiology (2022): https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2022.109339.
    10.1016/j.vetmic.2022.109339
  6. Ana C. Reis; Liliana C. M. Salvador; Suelee Robbe-Austerman; Rogério Tenreiro; Ana Botelho; Teresa Albuquerque; Mónica V. Cunha. "Whole Genome Sequencing Refines Knowledge on the Population Structure of Mycobacterium bovis from a Multi-Host Tuberculosis System". Microorganisms 9 8 (2021): 1585-1585. https://doi.org/10.3390/microorganisms9081585.
    10.3390/microorganisms9081585
  7. Teresa Nogueira; Ana Botelho. "Metagenomics and Other Omics Approaches to Bacterial Communities and Antimicrobial Resistance Assessment in Aquacultures". Antibiotics 10 7 (2021): 787-787. https://doi.org/10.3390/antibiotics10070787.
    10.3390/antibiotics10070787
  8. João S. Rebelo; Célia P. F. Domingues; Francisco Dionisio; Manuel C. Gomes; Ana Botelho; Teresa Nogueira. "COVID-19 Lockdowns May Reduce Resistance Genes Diversity in the Human Microbiome and the Need for Antibiotics". International Journal of Molecular Sciences (2021): https://doi.org/10.3390/ijms22136891.
    10.3390/ijms22136891
  9. V. Lorente-Leal; E. Liandris; M. Pacciarini; A. Botelho; K. Kenny; B. Loyo; R. Fernández; et al. "Direct PCR on Tissue Samples To Detect Mycobacterium tuberculosis Complex: an Alternative to the Bacteriological Culture". Journal of Clinical Microbiology 59 2 (2021): https://doi.org/10.1128/JCM.01404-20.
    10.1128/JCM.01404-20
  10. Rita Macedo; Joana Isidro; Maria Conceição Gomes; Ana Botelho; Teresa Albuquerque; Arlete Sogorb; Rui Bernardino; et al. "Animal-to-human transmission of Mycobacterium pinnipedii". European Respiratory Journal (2020): 2000371-2000371. https://doi.org/10.1183/13993003.00371-2020.
    10.1183/13993003.00371-2020
  11. Cunha, Mónica V.; Rosalino, Luís Miguel; Leão, Célia; Bandeira, Victor; Fonseca, Carlos; Botelho, Ana; Reis, Ana C.; Rosalino, L. M.. "Ecological drivers of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis detection in mongoose (Herpestes ichneumon) using IS900 as proxy". Scientific Reports 10 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-57679-3.
    Published • 10.1038/s41598-020-57679-3
  12. Domingues, Célia P. F.; Rebelo, João S.; Dionisio, Francisco; Botelho, Ana; Nogueira, Teresa. "The Social Distancing Imposed To Contain COVID-19 Can Affect Our Microbiome: a Double-Edged Sword in Human Health". (2020): http://hdl.handle.net/10451/45454.
    10.1128/mSphere.00716-20
  13. Branco, Sandra; Padre, Ludovina; Dias, Clara; Albuquerque, Catarina; Leão, Célia; Cavaco, Sandra; Botelho, Ana. "GEN-RES-ALENTEJO - Caracterização bacteriológica da peeira e do parasitismo gastrointestinal em ovinos na região do Alentejo". (2019): http://hdl.handle.net/10174/27943.
  14. Barbosa P; Leão C; Usié A; Amaro A; Botelho A; Pinto C; Inácio J; et al. "Draft Genome Sequence of a Rare Pigmented Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Type C Strain.". Genome announcements (2017): http://europepmc.org/abstract/med/29025941.
    10.1128/genomea.01066-17
  15. Cunha MV; Azorín B; Peñuela RG; Albuquerque T; Botelho A. "Exposure of Threatened Accipitridae to Mycobacterium bovis Calls for Active Surveillance.". EcoHealth (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28258525.
    10.1007/s10393-017-1226-0
  16. Leão C; Botelho A; Martins E; Aguiar C; Rebelo I; Nunes T; Bexiga R. "Presence of Mycobacterium avium subs. paratuberculosis DNA in milk used to feed calves in Portugal.". The Journal of dairy research (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28524015.
    10.1017/s0022029917000164
  17. Carvalho, C.L.; Duarte, E.L.; Monteiro, M.; Botelho, A.; Albuquerque, T.; Fevereiro, M.; Henriques, A.M.; et al. "Challenges in the rabbit haemorrhagic disease 2 (RHDV2) molecular diagnosis of vaccinated rabbits". Veterinary Microbiology 198 (2017): 43-50. http://dx.doi.org/10.1016/j.vetmic.2016.12.006.
    10.1016/j.vetmic.2016.12.006
  18. Cumbassá, Aminata; Barahona, Maria J.; Cunha, Mónica V.; Azórin, Beatriz; Fonseca, Carlos; Rosalino, Luís Miguel; Tilburg, Jeroen; et al. "Coxiella burnetii DNA detected in domestic ruminants and wildlife from Portugal". Veterinary Microbiology 180 1-2 (2015): 136-141. http://dx.doi.org/10.1016/j.vetmic.2015.07.030.
    10.1016/j.vetmic.2015.07.030
  19. Botelho A; Canto A; Leão C; Cunha MV; Botelho, Ana; Canto, Ana; Leão, Célia; Cunha, Mónica V.. "Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPRs) analysis of members of the Mycobacterium tuberculosis complex.". Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) (2015): 373-389. http://europepmc.org/abstract/med/25399110.
    10.1007/978-1-4939-2004-4_27
  20. Botelho, Ana. "Prevalência de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis nas fezes de bovinos sem sinais clínicos de doença: consequência para o controlo da paratuberculose. Revista Portuguesa das Ciências Veterinárias 110 (593-594) 69-73.". (2015):
  21. Costa P; Amaro A; Ferreira AS; Machado D; Albuquerque T; Couto I; Botelho A; Viveiros M; Inácio J. "Rapid identification of veterinary-relevant Mycobacterium tuberculosis complex species using 16S rDNA, IS6110 and Regions of Difference-targeted dual-labelled hydrolysis probes.". Journal of microbiological methods (2014): http://europepmc.org/abstract/med/25192844.
    10.1016/j.mimet.2014.08.017
  22. Leão C; Canto A; Machado D; Sanches IS; Couto I; Viveiros M; Inácio J; Botelho A. "Relatedness of Mycobacterium avium subspecies hominissuis clinical isolates of human and porcine origins assessed by MLVA.". Veterinary microbiology (2014): http://europepmc.org/abstract/med/25085520.
    10.1016/j.vetmic.2014.06.027
  23. Quintas H; Alegria N; Mendonça A; Botelho A; Alves A; Pires I; Quintas, Helder; et al. "Coexistence of tuberculosis and mammary carcinoma in a goat.". Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene (2014): http://europepmc.org/abstract/med/24888466.
    10.1111/rda.12332
  24. Botelho, A.; Perdigão, J.; Canto, A.; Albuquerque, T.; Leal, N.; Macedo, R.; Portugal, I.; Cunha, M.V.. "Pre-multidrug-resistant mycobacterium tuberculosis beijing strain associated with disseminated tuberculosis in a pet dog". Journal of Clinical Microbiology 52 1 (2014): 354-356. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84891383562&partnerID=MN8TOARS.
    10.1128/JCM.02800-13
  25. Costa P; Botelho A; Couto I; Viveiros M; Inácio J. "Standing of nucleic acid testing strategies in veterinary diagnosis laboratories to uncover Mycobacterium tuberculosis complex members.". Frontiers in molecular biosciences (2014): http://europepmc.org/abstract/med/25988157.
    10.3389/fmolb.2014.00016
  26. Meireles C; Costa G; Guinote I; Albuquerque T; Botelho A; Cordeiro C; Freire P. "Pseudomonas putida are environmental reservoirs of antimicrobial resistance to ß-lactamic antibiotics.". World journal of microbiology & biotechnology. (2013): http://europepmc.org/abstract/med/23420114.
    10.1007/s11274-013-1295-3
  27. Costa, P.; Ferreira, A.S.; Amaro, A.; Albuquerque, T.; Botelho, A.; Couto, I.; Cunha, M.V.; Viveiros, M.; Inácio, J.. "Enhanced detection of tuberculous mycobacteria in animal tissues using a semi-nested probe-based real-time PCR". PLoS ONE 8 11 (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84894258912&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0081337
  28. Gomes, J.; Soares, R.; Santos, M.; Santos-Gomes, G.; Botelho, A.; Amaro, A.; Inácio, J.. "Detection of Theileria and Babesia infections amongst asymptomatic cattle in Portugal". Ticks and Tick-borne Diseases 4 1-2 (2013): 148-151. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84872602437&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ttbdis.2012.07.002
  29. Carreira, A.C.; Clemente, L.; Rocha, T.; Tavares, A.; Geraldes, M.; Barahona, M.J.; Botelho, A.; Cunha, M.V.. "Comparative genotypic and antimicrobial susceptibility analysis of zoonotic campylobacter species isolated from broilers in a nationwide survey, portugal". Journal of Food Protection 75 12 (2012): 2100-2109. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84871335242&partnerID=MN8TOARS.
    10.4315/0362-028X.JFP-12-183
  30. Santos, A.S.; Tilburg, J.J.H.C.; Botelho, A.; Barahona, M.J.; Núncio, M.S.; Nabuurs-Franssen, M.H.; Klaassen, C.H.W.. "Genotypic diversity of clinical Coxiella burnetii isolates from Portugal based on MST and MLVA typing". International Journal of Medical Microbiology 302 6 (2012): 253-256. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84867850936&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.ijmm.2012.08.003
  31. Rodriguez-Campos, S.; Schürch, A.C.; Dale, J.; Lohan, A.J.; Cunha, M.V.; Botelho, A.; Cruz, K.D.; et al. "European 2 - A clonal complex of Mycobacterium bovis dominant in the Iberian Peninsula". Infection, Genetics and Evolution 12 4 (2012): 866-872. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84859918635&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.meegid.2011.09.004
  32. Cunha, M.V.; Matos, F.; Canto, A.; Albuquerque, T.; Alberto, J.R.; Aranha, J.M.; Vieira-Pinto, M.; Botelho, A.. "Implications and challenges of tuberculosis in wildlife ungulates in Portugal: A molecular epidemiology perspective". Research in Veterinary Science 92 2 (2012): 225-235. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84856564359&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.rvsc.2011.03.009
  33. Smith, N.H.; Berg, S.; Dale, J.; Allen, A.; Rodriguez, S.; Romero, B.; Matos, F.; et al. "European 1: A globally important clonal complex of Mycobacterium bovis". Infection, Genetics and Evolution 11 6 (2011): 1340-1351. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80955180122&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.meegid.2011.04.027
  34. Clemente, M.L.T.; Barahona, M.J.B.; Andrade, M.F.C.; Botelho, A.R.; Vicari, N.. "Diagnosis by PCR-REA of Chlamydophila species infections in late-term abortions of domestic ruminants". Veterinary Record 168 23 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79958841824&partnerID=MN8TOARS.
    10.1136/vr.d889
  35. Vieira-Pinto, M.; Alberto, J.; Aranha, J.; Serejo, J.; Canto, A.; Cunha, M.V.; Botelho, A.. "Combined evaluation of bovine tuberculosis in wild boar (Sus scrofa) and red deer (Cervus elaphus) from Central-East Portugal". European Journal of Wildlife Research 57 6 (2011): 1189-1201. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80855131612&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10344-011-0532-z
  36. Cunha, M.V.; Monteiro, M.; Carvalho, P.; Mendonça, P.; Albuquerque, T.; Botelho, A.. "Multihost Tuberculosis: Insights from the portuguese control program". Veterinary Medicine International 2011 (2011): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84863951021&partnerID=MN8TOARS.
    10.4061/2011/795165
  37. Matos F; Cunha MV; Canto A; Albuquerque T; Amado A; Botelho A; Matos, F.; et al. "Snapshot of Mycobacterium bovis and Mycobacterium caprae infections in livestock in an area with a low incidence of bovine tuberculosis.". Journal of clinical microbiology 48 11 (2010): 4337-4339. http://europepmc.org/abstract/med/20844227.
    10.1128/jcm.01762-10
  38. Matos, F.; Amado, A.; Botelho, A.. "Molecular typing of Mycobacterium bovis isolated in the first outbreak of bovine tuberculosis in the Azores Islands: a case report". Veterinární Medicína 55 No. 3 (2010): 133-136. http://dx.doi.org/10.17221/137/2009-vetmed.
    10.17221/137/2009-vetmed
  39. Varela, F.; Inácio, J.; Botelho, A.. "Molecular diversity assessed by VNTR and IS1296 typing of historical Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC strains". Veterinary Microbiology 146 3-4 (2010): 295-302. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-78650310301&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.vetmic.2010.05.030
  40. Costa, P.; Amaro, A.; Botelho, A.; Inácio, J.; Baptista, P.V.. "Gold nanoprobe assay for the identification of mycobacteria of the Mycobacterium tuberculosis complex". Clinical Microbiology and Infection 16 9 (2010): 1464-1469. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77956099473&partnerID=MN8TOARS.
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  41. Domingos M; Amado A; Botelho A. "IS1245 RFLP analysis of strains of Mycobacterium avium subspecies hominissuis isolated from pigs with tuberculosis lymphadenitis in Portugal.". The Veterinary record (2009): http://europepmc.org/abstract/med/19168882.
    10.1136/vr.164.4.116
  42. Clemente, L.; Barahona, M.J.; Andrade, M.F.; Botelho, A.; Clemente L; Barahona MJ; Andrade MF; Botelho A. "Diagnosis by PCR of Coxiella burnetii in aborted fetuses of domestic ruminants in Portugal". Veterinary Record 164 12 (2009): 373-374. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-65249158474&partnerID=MN8TOARS.
    10.1136/vr.164.12.373
  43. Domingos, M.; Amado, A.; Botelho, A.. "IS 1245 RFLP analysis of strains of Mycobacterium avium subspecies hominissuis isolated from pigs with tuberculosis lymphadenitis in Portugal". Veterinary Record 164 4 (2009): 116-120. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-59849096351&partnerID=MN8TOARS.
  44. Clemente L; Fernandes TL; Barahona MJ; Bernardino R; Botelho A; Clemente, L.; Fernandes, T.L.; et al. "Confirmation by PCR of Coxiella burnetii infection in animals at a zoo in Lisbon, Portugal.". The Veterinary record 163 7 (2008): 221-222. http://europepmc.org/abstract/med/18708658.
    10.1136/vr.163.7.221
  45. Amaro, A.; Duarte, E.; Amado, A.; Ferronha, H.; Botelho, A.; Botelho, Ana; Duarte, Elsa Leclerc; et al. "Comparison of three DNA extraction methods for Mycobacterium bovis, Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium avium subsp. avium". Letters in Applied Microbiology 47 1 (2008): 8-11. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-45249092106&partnerID=MN8TOARS.
    Published • 10.1111/j.1472-765X.2008.02372.x
  46. Amado A; Albuquerque T; Gonçalves A; Duarte E; Botelho A; Fernandes T; Bernardino R; et al. "Tuberculosis in mandrills at the Lisbon zoo.". The Veterinary record 159 19 (2006): http://europepmc.org/abstract/med/17088308.
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  47. Botelho, Ana. "• Amado A, Albuquerque T, Goncalves A, Duarte E, Botelho A, Fernandes T, Bernardino R, Lapao N. 2006.Tuberculosis in mandrills at the Lisbon zoo. Vet. Rec. 159: Letter 643.". (2006):
  48. Bashiruddin, John B.; Frey, Joachim; Königsson, Malin Heldtander; Johansson, Karl-Erik; Hotzel, Helmut; Diller, Roland; de Santis, Paola; et al. "Evaluation of PCR systems for the identification and differentiation of Mycoplasma agalactiae and Mycoplasma bovis: A collaborative trial". The Veterinary Journal 169 2 (2005): 268-275. http://dx.doi.org/10.1016/j.tvjl.2004.01.018.
    10.1016/j.tvjl.2004.01.018
  49. Vilei, E.M.; Abdo, E.-M.; Nicolet, J.; Botelho, A.; Gonçalves, R.; Frey, J.; Vilei EM; et al. "Genomic and antigenic differences between the European and African/Australian clusters of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC". Microbiology 146 2 (2000): 477-486. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-0033951273&partnerID=MN8TOARS.
    10.1099/00221287-146-2-477
  50. Botelho, Ana. "Botelho, A ., Prata, A ., & Regalla, J., 2000. Analysis of low-molecular-weight RNA profiles of members of the Mycoplasma mycoides cluster. In COST Action 826. Agriculture and biotechnology. Mycoplasmas of ruminants: pathogenicity, diagnostics, epidemiology and molecular genetics. Vol 4, EUR 19245 EN, Luxembourg. pp. 135-138.". (2000):
  51. Botelho AR; Planta RJ. "Specific identification of Candida albicans by hybridization with oligonucleotides derived from ribosomal DNA internal spacers.". Yeast (Chichester, England) (1994): http://europepmc.org/abstract/med/7975890.
    10.1002/yea.320100603
Magazine article
  1. Botelho, Ana. "Cunha, M. V., Botelho, A., Proença, J. S. 2019. Tuberculose Animal: A realidade em Portugal. A Revista do Caçador Português. Caça e Cães de Caça, 256: 40-43", 2019
  2. Botelho, Ana. "Cunha, M.V., Reis, A. C., Pereira, A. C., Ramos, B., Albuquerque, T., Santos, N., Botelho, A. 2019. Tuberculose animal: diagnóstico, epidemiologia, investigação e controlo. Vida Rural, Out 2019: 38-44", 2019
  3. Botelho, Ana. "• Botelho, A. 2018. Paratuberculose em ruminantes: diagnóstico precoce de uma doença insidiosa. Vida Rural, Julho-Agosto 2018: 36-38", 2018
  4. Botelho, Ana. "• Leão, C., Inácio J., Botelho, A. 2013. Highlights on paratuberculosis: Mycobacterium avium subsp paratuberculosis a fastidious yet insidious microorganism. Magazine of the Portuguese Society for Microbiology, No.5.", 2013
  5. Botelho, Ana. "• Amado, A., Albuquerque, T. & Botelho, A. 1996. Paratuberculose - Diagnóstico Laboratorial. Colectânea da Sociedade Portuguesa de Ovinotecnia e Caprinotecnia, 6 (1): 81-87.", 1996
Newspaper article
  1. Botelho, Ana; Heller M; Gicheru N; Tjipura-Zaire G; Muriuki C; Yu M; Botelho A; et al. "Development of a Novel Cocktail Enzyme-Linked Immunosorbent Assay and a Field-Applicable Lateral-Flow Rapid Test for Diagnosis of Contagious Bovine Pleuropneumonia.", Journal of clinical microbiology, 2016, http://europepmc.org/abstract/med/27053669.
    10.1128/jcm.03259-15
  2. Botelho, Ana. "• Vilei, E. M., Abdo, E.-M., Nicolet, J., Botelho, A ., Gonçalves, R. & Frey, J. 2000. Genomic and antigenic differences between the European and African/Australian clusters of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC. Microbiology. 146: 477-486.", 2000
Thesis / Dissertation
  1. Albuquerque, Catarina Almeida de. "Detection and characterization of Dichelobacter nodosus from sheep with different clinical manifestations of Ovine Footrot". Master, 2020. http://hdl.handle.net/10451/41853.
  2. Pereira, Vítor Emanuel Lopes. "Aplicação da técnica de MLVA para tipificação molecular de Mycoplasma bovis isolados, em Portugal, de doenças respiratórias bovinas". Master, 2017. http://hdl.handle.net/10451/31975.
  3. Oliveira, Ana João Azevedo de. "Deteção e tipificação moleculares de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis em amostras de fezes". Master, 2016. http://hdl.handle.net/10451/27317.
  4. Brás, Catarina Barreto. "Development of a PCR system for detection and differentiation of Bulkholderia mallei and B. pseudomallei in clinical and environmental matrices". Master, 2015. http://hdl.handle.net/10451/22565.
  5. Duarte, Elsa Maria Leclerc. "Tuberculose bovina: detecção molecular e genotipagem de Mycobacterium bovis". PhD, 2008. http://hdl.handle.net/10174/12147.
Activities

Oral presentation

Presentation title Event name
Host (Event location)
2019 • Botelho, A. 2019. EVOLUÇÃO DO CONCEITO “ONE HEALTH” (Orador Convidado). 1º Simpósio INIAV para a Segurança Alimentar Rumo à Alimentação do Futuro. INIAV, Vairão
2019 • Ana C. Reis, Liliana Salvador, Ana Botelho, Rogério Tenreiro, Mónica V. Cunha. 2019. Deciphering Mycobacterium bovis phylogeny using genome-wide SNP data. Microbiotec 2019, Coimbra
2019 • Cunha, M.V., Reis, A. C., Pereira, A., Ramos, B., Albuquerque, T., Botelho, A. 2019. INIAV, IP – Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Unidade Estratégica de Investigação e Serviços em Produção e Saúde Animal. Tuberculosis Animal: Encuentro de la Comunidad Científica y la Administración. “I Workshop Ibérico y II Nacional de Investigación en Tuberculosis” 4 e 5 Abril, 2019, Cáceres, Espanha
2017 • Botelho, A. 2017. Epidemiology of multi-host tuberculosis in Portugal revealed by spatiotemporal molecular analysis. 6th bTB EURL Workshop, UCM, Madrid
VISAVET, UCM (Madrid, Spain)
2017 • Reis, A, Botelho, A., Tenreiro, R., Cunha, Mónica V. 2017. Spatiotemporal analysis of animal-adapted members of Mycobacterium tuberculosis complex: epidemiological connections revealed by fine-scale genome analyses. ESM Congress
2015 • Botelho, A. 2015. Bovine tuberculosis in routine, research developments, current interests and perspectives for collaboration at INIAV. Bovine TB Workshop 2015. University of Glasgow, the Boyd Orr Centre for Population & Ecosystem Health, Glasgow, UK.
2015 • Botelho, A. 2015. Acreditação de um sistema de PCR para deteção e diferenciação de Burkholderia mallei e Burkholderia pseudomallei. Reunião final do projeto IB-BIOALERTNET. Instituto de Saúde Carlos III (ISCIII). Madrid, Espanha.
2014 • Botelho, A. 2014. What molecular typing can tell us about Mycobacterium bovis population structure: thereof outcomes. VI SPCV (Portuguese Society of Veterinary Sciences) Congress, Oeiras, Portugal
2014 • Botelho, A. 2014. Sources and routes of transmission of the Q fever agent: detection, identification and molecular typing of Coxiella burnetii in domestic and wild animals. VI SPCV (Portuguese Society of Veterinary Sciences) Congress, Oeiras, Portugal
2013 • Botelho, A.,Teresa Albuquerque, Ana Canto, Madalena Vieira - Pinto & Monica Cunha. 2013. National Framework for Tuberculosis in Hunting. II International Seminar on Tuberculosis in Wild Ungulates . Organization : WAVES - Euromed Society Surveillance wild animals. September . Idanha - a- Nova, Portugal.
2010 • Botelho, A. 2010 -. “Laboratory Diagnosis of tuberculosis in bovine and wildlife”. Task Force Meeting - Bovine Tuberculosis subgroup (Idanha a Nova, Portugal)
2010 • Matos, F., Cunha, M. V., Amado, A. & Botelho, A. 2010. Molecular analysis of Mycobacterium bovis and Mycobacterium caprae isolates from Portugal: a six-year survey of bovine tuberculosis. ESM 31st Congress 2010, Bled, Slovenia
2009 • Costa P., Baptista P., Amaro A., Botelho A., Inácio J. 2009. Identification of Mycobacterium bovis and other M. tuberculosis complex members using species-specific gold nanoprobes. 5th Med-Vet-Net Meeting, El Escorial, Madrid, Spain (3 – 6 Junho)
2006 • Botelho, A. 2006. FAO-OIE-AU/IBAR-IAEA. 4th Consultive Group Meeting on CBPP in Africa. Rome, Italy. “CBPP Research in Portugal: New outlooks in the post eradication era”.
2006 • Botelho, A. 2006. Co-ordination Action SSPE-CT-2004-501903. VENoMYC. WP7 Workshop. VNTR/MIRU and DVR-Spoligotyping for Mycobacterium bovis typing. Toledo, Spain –“Molecular Typing of M. bovis and M. caprae Portuguese strains: main challenges”.
2006 • Botelho, A. 2006. Co-ordination Action SSPE-CT-2004-501903 VENoMYC. WP4 Workshop. Laboratory Diagnosis of Mycobacterium spp. Jena, Germany. “Conventional vs. Molecular methods in the diagnosis of animal Mycobacterioses”.
2002 • Botelho, A. 2002. XIII Congresso Nacional de Bioquímica. Lisboa. “Surface Proteins of Mycoplasma mycoides subsp mycoides SC and their role in Diagnostics of Contagious Bovine Pleuropneumonia”.
1998 • Botelho, A.1998. Fifth FAIR1-CT95-0711 Meeting. Uppsala, Sweden “Development of mycoplasma low molecular weight RNA profiles”
1997 • Botelho, A. 1997. Fourth FAIR1-CT95-0711 Meeting: Development of new and improved diagnostic tests for CBPP in Europe”, Sintra, Portugal. “Evaluation of colorimetric PCR”.
1996 • Botelho, A. 1996. I Workshop “Mycoplasmas of Ruminants: Pathogenicity, Diagnostics, Epidemiology and Molecular Genetics” COST Action 826. Thessaloniki, Grécia. “PCR versus conventional methods in the diagnostic of CBPP in Portugal”.
1996 • Botelho, A. 1996. FAIR1-CT95-0711 Project Meeting “Development of new and improved diagnostic tests for CBPP in Europe”, Granada, Spain.
1994 • Botelho, A. 1994- 10th International Congress of the International Organization for Mycoplasmology. Bordeaux, France. “Use of polymerase chain reaction for identification of Mycoplasma mycoides subsp mycoides SC isolated from sheep and goats”.

Supervision

Thesis Title
Role 		Degree Subject (Type)
Institution / Organization
2016 - Current 2016-2017- Vitor Pereira - “Aplicação da técnica de MLVA para tipificação molecular de Mycoplasma bovis isolados, em Portugal, de doenças respiratórias bovinas ”Master Thesis in Applied Microbiology. FCUL. Approved with 17/20
Supervisor
2016 - Current 2016- Joana Rafael. Mestrado integrado Universidade de Évora e FMV. Epidemiologia da tuberculose bovina em Portugal.
Co-supervisor
2016 - Current 17 a 21 Outubro 2016- Monica Vanghele, Nicoleta Milita e Adriana Regalie, do Institute for Diagnosis and Animal Health, IDAH, Bucarestre, Romenia. Estágio profissional em diagnóstico serológico, bacteriológico e molecular da Peripneumonia Contagiosa Bovina (PPCB).
Supervisor
2016 - Current 14/06 a 15/07 e 5 a 30/09, 2016- Mahamadou Yansambou do Central Veterinary Laboratory of Niger e estudante de doutoramento da Universidade de Cheik Anta Diop, Dakar, Senegal, formação no diagnóstico serológico e bacteriológico da PPCB.
Supervisor
2016 - Current 2016- Mestrado Integrado em Medicina Veterinária da Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro. João Flores. “Diagnóstico laboratorial da paratuberculose bovina”.
Co-supervisor
2015 - Current 2015-2016- Ana João Oliveira- “Deteção e tipificação moleculares de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis em amostras de fezes”. Master Thesis in Applied Microbiology. FCUL. Approved with 16/20
Supervisor
2014 - Current 2014-2015 - Catarina Brás- “Development of a PCR system for detection and differentiation of Burkolderia mallei and B. pseudomallei in clinical and environmental matrices”. Master Thesis in Molecular Biology and Molecular Genetics FCUL. Approved with 17/20
Supervisor
2014 - Current 2014- Mestrado integrado em Medicina Veterinária, Universidade de Évora. Catarina Cruz. “Estudo da paratuberculose bovina em São Miguel, Açores.
Co-supervisor
2012 - Current 2012-2013 - Aminata Cumbassá - “Sources and routes of transmission of Q Fever: Detection, identification and molecular typing of Coxiella burnetii in domestic and wild animals" Master Thesis in Applied Microbiology FCUL. Approved with 17/20.
Supervisor
2010 - Current 2010-2015 Célia Leão - "New pan- genomic approaches for the characterization of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis". FCT - UNL and Morendum Institute, Edinburgh (co-supervisor)
Co-supervisor
2010 - Current 2010-2011- Filipa Dias - “Characterization of Mycobacterium bovis strains: growth studies and interaction with macrophages”. Master Thesis in Molecular Biology and Biomedicine FCT - UNL Approved with 19/20.
Supervisor
2009 - Current 2009-2014- Pedro Costa - "New molecular approaches for rapid detection and differentiation of Mycobacterium tuberculosis complex species and evaluation of zoonotic potential in Portugal." IHMT - FCT – UNL (co-supervisor)
Co-supervisor
2009 - Current 2009-2010 - Filipa Varela - “Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC typing and detection of its adherence to epithelial pulmonary cells.” Master Thesis, in Molecular Biology and Biomedicine FCT - UNL Approved with 17/20
Supervisor
2008 - Current 2008-2009- Filipa Matos - “Molecular typing of Mycobacterium bovis strains isolated from domestic and wild animals”. Master Thesis in Medical Microbiology, IHMT, FCT-UNL Approved with 18/20.
Supervisor
2017 - 2018 Catarina Albuquerque. 2017- Programa de Introdução à Investigação Científica (PIIC-UROP) (11012). 3 ECTS. 1º ciclo em Biologia Celular e Molecular, FCT-UNL – “Identificação e tipificação moleculares de Mycobacteria do grupo tuberculosis”
Supervisor
2010 - 2011 2010- Estágio de 6 meses em “Tipificação molecular de estirpes de Mycobacterium bovis e Mycobacterium caprae isoladas de animais silváticos e domésticos” (Molecular epidemiology of bovine tuberculosis by spoligotyping, MIRU-VNTR and DR analysis of M. bovis and M. caprae isolates from bovine, caprine and wild animal species) de uma licenciada em Medicina Veterinária pela Universidade de Zaragoza, Espanha, bolseira dos programas Leonardo da Vinci e ARGO, Global.
Supervisor
2010 - 2010 Estágio de duas semanas em “Diagnóstico bacteriológico da tuberculose animal: isolamento e identificação de Mycobacterium bovis de amostras clínicas” de uma licenciada em Medicina Veterinária pela Faculdade de Veterinária da Universidade Eduardo Mondlane, Moçambique.
Supervisor
2005 - 2009 2009- PhD thesis (Veterinary Science – Animal Health, Universidade de Èvora). “Epidemiological study of bovine tuberculosis by molecular typing”. Concluded, Approved with honor and distinction
Supervisor of Elsa Leclerk Duarte

Event organisation

Event name
Type of event (Role) 		Institution / Organization
2017 - Current INIAV - Auditório dos Serviços Florestais. 3/01/17. Liliana Salvador. “Disease Control at the Wildlife/Livestock interface: from risk-based surveillance models to phylodynamic analysis”. Institute of Biodiversity, Animal Health and Comparative Medicine. University of Glasgow, UK (2017) Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, Portugal
2015 - 2016 Participação no evento “Cientistas ao Luar”, promovido pelo INIAV e realizado a 3 de Julho de 2015 e a 23 de Setembro de 2016, programando as seguintes atividades: “VetQuiz-Veterinária sob investigação”, “ A impressão digital das bactérias”, “As 50 faces dos fungos”, “À caça de PokeBacs”, “Quem és tu bactéria?”. (2015 - 2016)
Festival (Co-organisor)

Event participation

Activity description
Type of event 		Event name
Institution / Organization
2016 - Current Participação na Reunião do Scientific Steering Board (SSB) do European Joint Programme (MED-VET-EJP), como representante do INIAV, para seleção de projetos científicos a submeter à candidatura final. ANSES, Maison-Alford, França.
Meeting
2016 - Current . Presence of Mycobacterium avium subs. paratuberculosis DNA in milk used to feed calves in Portugal. World Buiatrics Congress. Dublin 2016
Congress
2016 - Current Molecular characterization of a rare pigmented Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Type C strain. 13th International Colloquium on Paratuberculosis, Nantes, France
Congress
2015 - Current Workshop bienal dos Laboratórios de Referência Nacional (NRL) para a tuberculose bovina. Universidade Compultense de Madrid. VISAVET. Laboratório Europeu de Referência (EU-RL) para a tuberculose bovina.
Seminar
2015 - Current 18th Annual Conference of the European Biosafety Association (EBSA). Vienna, Austria..
Congress
2015 - Current European Melioidosis Congress. Downing College, Cambridge, UK.
Congress
2015 - Current Single tube molecular assay for detection and differentiation of Burkholderia pseudomallei and Burkholderia mallei in clinical matrices. European Melioidosis Congress. Downing College, Cambridge, UK
Congress
2014 - Current VI International M. bovis Conference. Cardiff, Wales, UK.
Congress
2014 - Current 24th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID2014). Barcelona, Espanha
Congress
2014 - Current VI Congresso da Sociedade Portuguesa de Ciências Veterinárias, INIAV, Oeiras
Congress
2014 - Current Semi-nested probe-based real-time PCR for the detection of Mycobacterium avium subsp paratuberculosis in goats. 12th International Colloquium on Paratuberculosis, Parma, Italy
Congress
2014 - Current Detection and identification of tuberculous mycobacteria in clinical samples using 16S rDNA, IS6110 and regions of difference-target dual-labeled probes. VI International M. bovis Conference. Cardiff, Wales, UK.
Conference
2014 - Current Animal reservoirs of Q fever: unveiling Coxiella burnetii population structure in Portugal. 24th ECCMID2014. – European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. Barcelona, Espanha
2012 - Current Responsável do Laboratório de Referência Nacional da Tuberculose Bovina. Neste âmbito participou em duas reuniões no EURL: 23 e 24 de Novembro de 2017; 23 e 24 de Outubro de 2019.
Meeting
2019 - 2019 • Laura Moura, Vanessa Guerra, Ivone Correia, Teresa Albuquerque, Ana Botelho, Ana Amaro, Lurdes Clemente. 2019. “Antibiotic Resistance in Escherichia coli Isolates from Poultry, Swine and Bovine Meat, Portugal 2016-2017”. 1st Annual Scientific Meeting OHEJP on foodborn zoonoses, antimicrobial resistance and emerging threats, Teagasc Conference Centre Ashtown, 22-24 Maio 2019, Dublin, Irlanda
Congress
 1st Annual Scientific Meeting OHEJP on foodborn zoonoses, antimicrobial resistance and emerging threats, Teagasc Conference Centre Ashtown, 22-24 Maio 2019, Dublin, Irlanda
2019 - 2019 Multidrug Resistant Escherichia coli with Reduced Susceptibility to Third Generation Cephalosporins and Cephamycins Isolated from Bovine and Swine. 1st Annual Scientific Meeting OHEJP on foodborn zoonoses, antimicrobial resistance and emerging threats, Teagasc Conference Centre Ashtown, 22-24 Maio 2019, Dublin, Irlanda
Congress
 1st Annual Scientific Meeting OHEJP on foodborn zoonoses, antimicrobial resistance and emerging threats, Teagasc Conference Centre Ashtown, 22-24 Maio 2019, Dublin, Irlanda
2019 - 2019 In Silico Metagenomic Comparison of Antimicrobial Resistance Profiles In Aquaculture Environments. AQUAIMPROVE Workshop, Leixões, Porto
Conference
 AQUAIMPROVE Workshop, Leixões, Porto
2019 - 2019 Diversity of Plasmid-Mediated Resistance to Critically Important Antibiotics In Escherichia Coli Isolated From Meat, Portugal. 1º Simpósio INIAV para a Segurança Alimentar Rumo à Alimentação do Futuro, INIAV, Vairão, Porto
Conference
 1º Simpósio INIAV para a Segurança Alimentar Rumo à Alimentação do Futuro, INIAV, Vairão, Porto
2019 - 2019 1º Simpósio INIAV para a Segurança Alimentar Rumo à Alimentação do Futuro, INIAV, Vairão
Symposium
2016 - 2016 Genome wide comparison between Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis non-pigmented and pigmented isolates. 5th Bioinformatics Open Days 2016 Congress. Braga, Portugal
Conference

Jury of academic degree

Topic
Role 		Candidate name (Type of degree)
Institution / Organization
2020 Membro do júri das provas de Mestrado em Biologia Molecular e Genética de Catarina Albuquerque, com o tema “Detection and characterization of Dichelobacter nodosus from sheep with different clinical manifestations of Ovine Footrot”. Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 4 de Fevereiro de 2020
Supervisor
 Catarina Albuquerque (Master)
2017 Arguente principal das provas de Doutoramento em Farmácia, especialidade Microbiologia de Mestre Carla Marisa Cerqueira da Silva, com o tema “Molecular and biological determinants associated with Mycobacterium tuberculosis strains prevalent in Portugal”. Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa, Reitoria da Universidade de Lisboa, 3 de Julho de 2017.
(Thesis) Main arguer
 Carla Silva (PhD)
2017 Membro do júri das provas de Mestrado em Microbiologia Aplicada de Vitor Pereira, com o tema “Aplicação da técnica de MLVA para tipificação molecular de Mycoplasma bovis isolados, em Portugal, de doenças respiratórias bovinas”. Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, 6 de Dezembro de 2017
Supervisor
 Vitor Pereira (Master)
2013 • 2013- Main external examiner of the jury of a PhD thesis in the field of Pharmacy, speciality Microbiology, Faculty of Pharmacy, University of Lisbon. João Perdigão- “Molecular and Genomic Epidemiology of Multidrug Resistant Mycobacterium tuberculosis Isolates in Lisbon, Portugal". João Perdigão (PhD)

Association member

Society Organization name Role
2005 - Current • Expert of OIE (World Organization for Animal Health) International Reference Laboratory for Contagious Bovine Pleuropneumonia (CBPP)
1998 - Current SPM - Sociedade Portuguesa de Microbiologia. Secretária Adjunta da Mesa da Assembleia Geral (até 2018) e Vogal da Comissão de Revisão de Contas

Committee member

Activity description
Role 		Institution / Organization
2018 - Current • Membro do SSB (Scientific Steering Board) do consórcio OHEJP (desde 2016). No triénio 2017-2020 participou nas seguintes reuniões de trabalho: Kick of Meeting 30 a 31 Janeiro 2018, ANSES, Maisons Alford, França; Experts Meeting, 4 a 5 de Junho 2018, RIVM, Bilthoven, Holanda; SSB Meeting 21 de Março de 2019, RIVM, Bilthoven, Holanda; SSB Meeting 19 de Setembro de 2019, UCM, Madrid.
Member
2014 - Current • 2014- Third Global Conference of OIE Reference Centres, Seoul, Korea (Rep. of)
Advisor / Consultant
 Office International des Epizooties (OIE), World Animal Health Organization, France
2010 - Current Member of the Coordination Committee of the Scientific Council of LNIV and INIAV, representant of Bacteriology Scientific Area
2004 - 2008 2004 - 2008 - Vice-President of Scientific Council of LNIV
President / Vice-president

Conference scientific committee

Conference name Conference host
2019 - 2020 Anual Scientific Meeting (ASM) do OHEJP Praga
2019 - 2019 • Membro do Comité Científico do evento: “I Workshop Ibérico y II Nacional de Investigación en Tuberculosis” - Tuberculosis Animal: Encuentro de la Comunidad Científica y la Administración. 4 e 5 Abril, 2019, Cáceres, Espanha
2019 - 2019 • Membro da Mesa Redonda “Avances en diagnóstico, mejoras en las técnicas vigentes” do “I Workshop Ibérico y II Nacional de Investigación en Tuberculosis”, 4 e 5 Abril, 2019, Cáceres, Espanha

Consulting

Activity description Institution / Organization
2016 - Current Abril 2016 - Avaliadora da candidatura de um estudante de doutoramento do UK, APHA, a uma bolsa financiada por Le Studium Research Fellowships (França) no tema “Establishment of the bovine lung basal inflammatory micro-environment’, trabalho a desenvolver em ANSES, França.
2014 - Current • 2014 – EFSA, WG meeting on Bovine TB with hearing experts, Parma, Italy European Food Safety Authority, Italy

Course / Discipline taught

Academic session Degree Subject (Type) Institution / Organization
2014 - Current 2014-2017 Lecturer in MMVM001 Veterinary Microbiology and Immunology (coord. Dr Jennifer Ritchie) of MSc COURSE IN VETERINARY MICROBIOLOGY, School of Veterinary Medicine, University of Surrey, Guildford, UK: “Fungi as animal pathogens” (2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019).
2003 - Current 2003 – 16 to 26/09 – “FAO / IAEA Workshop on the Diagnosis and Monitoring of Contagious Bovine Pleuropneumonia – Lecture on Bacteriological Diagnosis of CBPP”. Instituto de Investigação Veterinária de Angola, Laboratório Regional de Veterinária, Lubango, Angola.
2005 - 2008 Em 2005, 2007 e 2008 foram organizadas visitas de estudo de um dia, compostas por uma introdução teórica na área da micoplasmologia e acompanhamento prático nos laboratórios, a alunos do curso de licenciatura em Enfermagem Veterinária, da Escola Superior Agrária de Elvas do Instituto Politécnico de Portalegre.

Evaluation committee

Activity description
Role 		Institution / Organization Funding entity
2019 - 2019 • Presidente do júri do procedimento concursal de seleção internacional para contratação de doutorado no âmbito do projeto ALG-01-0145-FEDER-028824 ”Antimicrobial Resistance Determinants in Aquaculture Environments (AquaRAM)” (2019)
2018 - 2018 Membro do júri do procedimento concursal de seleção internacional para contratação de doutorado no âmbito do projeto PTDC/CVT-CVT/28469/2017, ”CIAinVet — Animais produtores de alimentos como reservatórios de resistência a antibióticos de importância crítica” (2018)
Evaluator

Journal scientific committee

Journal title (ISSN) Publisher
2019 - Current OIE Terrestrial Manual
2015 - Current Rev. Sci. Tech. Off. Int. Epiz
2019 - 2019 • Veterinary medicine and Science VMS3-2019-Jul-0157.R1, "A novel MLSA allelic profile "A15" of Mycoplasma mycoides subsp mycoides in Niger." (2019)
2019 - 2019 • Microbiology Open MBO3_2019_03_0119. “Applicability of using 15 MIRU-VNTR loci and QIAxcel Technology for genotyping of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis from two cattle farms in Egypt. (2019)
2018 - 2018 • Scientific Reports - SREP-18-24462 "High Resolution Melting (HRM) as a new tool for the simultaneous identification and differentiation of Mycobacterium tuberculosis complex samples" (2018)
2018 - 2018 • Drug Development Research DDR-18-0144 “Antibiotics as both friends and foes of the human gut microbiome: the microbial community approach.” (2018)
2017 - 2017 • Arquivos do Instituto Biológico ID AIB-2016-0065 “Comparison Among Tests For Tuberculosis Diagnosis In Slaughtered Cattle” (2017)
2017 - 2017 Journal of Microbiological Methods (0167-7012) Elsevier
2014 - 2017 Infection, Genetics and Evolution
2011 - 2017 PlosOne
2011 - 2017 BMC Research Notes
2016 - 2016 Emerging Infectious Diseases (1080-6059) Centers For Disease Control and Prevention
2016 - 2016 The Veterinary Journal (1090-0233) Elsevier
2008 - 2015 BMC Veterinary Research
2014 - 2014 Veterinary Research Communications
2014 - 2014 Open Veterinary Journal (2218-6050) African Journals Online
2011 - 2014 British Microbiology Research Journal (2231-0886) Sciencedomain International
2011 - 2014 BMC Microbiology
2011 - 2014 BioMed Research International- Neglected Zoonotic Diseases Caused by Bacteria and Protozoa
2011 - 2014 African Journal of Microbiology Research
2008 - 2014 Journal of Clinical Microbiology
2008 - 2014 Veterinary Microbiology (0378-1135) Elsevier

Other jury / evaluation

Activity description Institution / Organization
2019 - 2019 Presidente do júri do procedimento concursal de seleção internacional para contratação de doutorado no âmbito do projeto ALG-01-0145-FEDER-028824 ”Antimicrobial Resistance Determinants in Aquaculture Environments (AquaRAM)” (2019)
2018 - 2018 Membro do júri do procedimento concursal de seleção internacional para contratação de doutorado no âmbito do projeto PTDC/CVT-CVT/28469/2017, ”CIAinVet — Animais produtores de alimentos como reservatórios de resistência a antibióticos de importância crítica” (2018)
Distinctions

Title

2006 • Perito (Reference Expert) do Laboratório de Referência da OIE, Organização Mundial para a Saúde Animal, para a Peripneumonia Contagiosa Bovina (PPCB) (OIE World Organization for Animal Health Reference Laboratory for CBPP, LNIV, Lisbon, Portugal) desde
2005 • Chefe do Departamento de Bacteriologia e Micologia do INIAV