Identification
Personal identification
- Full name
- Alexandra Isabel Cardoso Nunes
Citation names
- Nunes, Alexandra
- Nunes, A.
Author identifiers
- Ciência ID
- CE12-369F-B36D
- ORCID iD
- 0000-0001-6449-8053
- Google Scholar ID
- https://scholar.google.com/citations?user=VayjObQAAAAJ&hl=pt-PT&authuser=2
- Researcher Id
- ABE-3699-2020
- Scopus Author Id
- 13411244100
Email addresses
- alexandra.nunes@insa.min-saude.pt (Professional)
- p5825@ulusofona.pt (Professional)
Addresses
- Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge | Portuguese National Institute of Health, Avenida Padre Cruz, 1649-016, Lisboa, Lisboa, Portugal (Professional)
- Centro Universitário Lisboa, Campo Grande, 376, 1749-024, Lisboa, Lisboa, Portugal (Professional)
Websites
- https://www.researchgate.net/profile/Alexandra-Nunes-4 (Professional)
- https://www.ulusofona.pt/docentes/alexandra-isabel-cardoso-nunes-5825 (Scholar)
- https://cecav.pt/members/alexandra-isabel-cardoso-nunes/ (Professional)
Knowledge fields
- Medical and Health Sciences - Health Sciences - Infectious Diseases
- Exact Sciences - Computer and Information Sciences - Bioinformatics
- Natural sciences - Biological Sciences - Microbiology
- Natural sciences - Biological Sciences - Molecular Biology
- Natural sciences - Biological Sciences - Evolutionary Biology
- Medical and Health Sciences - Medical Biotechnology - Health-Related Biotechnology
- Agrarian Sciences - Veterinary Sciences
Languages
Language | Speaking | Reading | Writing | Listening | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Portuguese (Mother tongue) | |||||
English | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Advanced (C1) | Advanced (C1) | |
French | Intermediate (B1) | Advanced (C1) | Intermediate (B1) | Intermediate (B1) | |
Spanish; Castilian | Beginner (A1) | Beginner (A1) | Beginner (A1) |
Education
Degree | Classification | |
---|---|---|
2010 - 2015
Concluded
|
Tracking molecular interactions during host-cell invasion by Chlamydia trachomatis (Pós-doutoramento)
Major in Molecular Biology
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
|
|
2006 - 2010
Concluded
|
Biologia (Doutoramento)
Major in Genética Molecular (especialidade)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"Genomic and Transcriptomic Features of Chlamydia trachomatis: Tracking the Basis for the Ecological Success" (THESIS/DISSERTATION)
|
Aprovada por unanimidade |
2004
Concluded
|
Química aplicada (ramo Biotecnologia) (Licenciatura)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
"n/a" (THESIS/DISSERTATION)
|
16 (dezasseis) valores |
Affiliation
Science
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2015 - Current | Postdoc (Research) | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal | ||
2010 - 2015 | Postdoc (Research) | Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal |
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal | ||
2004 - 2006 | Research Trainee (Research) | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
Teaching in Higher Education
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2021 - Current | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal |
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal | ||
2018 - Current | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal | ||
2021 - 2022 | Assistant Professor (University Teacher) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Ciências e Tecnologias da Saúde, Portugal |
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Ciências e Tecnologias da Saúde, Portugal | ||
2015 - 2016 | Invited Assistant Professor (University Teacher) | Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal |
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal | ||
2011 - 2012 | Invited Assistant Professor (University Teacher) | Escola Superior de Saúde da Cruz Vermelha Portuguesa, Portugal |
Escola Superior de Saúde da Cruz Vermelha Portuguesa, Portugal |
Other Careers
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2015 - Current | Técnico Superior (Técnico Superior) | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Others
Category Host institution |
Employer | |
---|---|---|
2022 - Current | Responsible for the genomic surveillance of Campylobacter spp. at the Portuguese NIH | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal | ||
2021 - Current | Institutional liaison between the Infectious Diseases Department of INSA and the Faculty of Veterinary Medicine of Lusófona University on behalf of research studies under the One Health context | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal | ||
2020 - Current | Member of the Portuguese network for SARS-CoV-2 genomics (Consortium) | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2016 - Current | Responsible for the genomic research area on Human Papilloma Virus at the Portuguese NIH | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal | ||
2020 - 2022 | Member of the NIH Emergency Response to the Laboratory Diagnosis of COVID-19 in Portugal | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
Projects
Grant
Designation | Funders | |
---|---|---|
2025/03/01 - 2029/02/28 | Leveraging Campylobacter coli genomics for enhanced surveillance and antimicrobial resistance understanding: novel schemes
and applications
2024.05639.BDANA
Supervisor
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
|
2025/01/01 - 2028/12/31 | Dynamic evolution of Campylobacter jejuni resistance: Impact of subclinical antibiotic concentrations
2024.06414.BDANA
Supervisor
Universidade da Beira Interior Centro de Investigação em Ciências da Saúde, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
|
2024/10/01 - 2028/09/30 | Backyard animal production in Portugal: using microbial genomics in a One Health approach to explore associated risk factors
and antimicrobial resistance
2024.05032.BDANA
Supervisor
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Centro de Ciência Animal e Veterinária, Portugal Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
|
2024 - 2025 | Exploring the potential of whey-derived antimicrobial peptides: identification, production, and applications
FMVULusófona_MIMV2024_Peptides
Supervisor
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Cooperativa de Formação e Animação Cultural CRL
Ongoing
|
2024 - 2025 | Tracking Salmonella spp. and Antimicrobial Resistance in National and Imported Meats: Evaluating Food Safety Standards in
Portuguese Retail
FMVULusófona_MIMV2024_Meats
Supervisor
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Cooperativa de Formação e Animação Cultural CRL
Ongoing
|
2011 - 2015 | Tracking molecular interactions during host-cell invasion by Chlamydia trachomatis
SFRH/BPD/75295/2010
Post-doc Fellow
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2006 - 2010 | Evaluation of the Biological Role of Chlamydia trachomatis Polymorphic Membrane Proteins
SFRH/BD/25651/2005
PhD Student Fellow
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
Contract
Designation | Funders | |
---|---|---|
2023 - 2027 | DURABLE - Delivering a Unified Research Alliance of Biomedical and public health Laboratories against Epidemics
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Ongoing
|
2022/11 - 2026/10 | GENEO - Sustainable use and integration of enhanced infrastructure into routine genome-based surveillance and outbreak investigation
activities in Portugal
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Ongoing
|
2024 - 2025 | DryBeefA - Investigating the quality and microbiological parameters of dry-aged beef within the industry context
FMVULusófona_DryBeefA
Researcher
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Cooperativa de Formação e Animação Cultural CRL
Ongoing
|
2023 - 2025 | Food safety risks from backyard animals raised for non-commercial purpose - a pilot study
FMVULusófona_Backyard
Principal investigator
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Cooperativa de Formação e Animação Cultural CRL
Ongoing
|
2022/11 - 2024/12 | ResisCampyOH - Multidrug resistant Campylobacter jejuni and Campylobacter coli in Portugal: a One Health study to understand
the sources, transmission and persistence
FMVULusófona_ResisCampyOH
Principal investigator
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Cooperativa de Formação e Animação Cultural CRL
Ongoing
|
2023/01/02 - 2024/07/01 | NuMicroArt - The triad of nutrition, intestinal microbiota and Rheumatoid Arthritis - An exploratory pilot study
2022.07462.PTDC
Researcher
Associação para a Investigação e Desenvolvimento da Faculdade de Medicina, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Ongoing
|
2020/01/01 - 2022/12/31 | BeONE - Building integrative tools for OneHealth Surveillance
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Concluded
|
2020/01/01 - 2022/12/31 | TELE-VIR: Point-of-incidence toolbox for emerging virus threats
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Concluded
|
2020/01/01 - 2022/12/31 | FED-AMR: The role of free extracellular DNA in dissemination of antimicrobial resistance over ecosystem boundaries along the
food/feed chain
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Concluded
|
2020/01/01 - 2022/12/31 | DiSCoVer - Discovering the Sources of Salmonella, Campylobacter, VTEC and Antimicrobial Resistance
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Concluded
|
2020/01/01 - 2022/12/31 | COVRIN - One Health research integration on SARS-CoV-2 emergence, risk assessment and preparedness
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Concluded
|
2018/10/01 - 2022/09/30 | Clinical significance of Mycobacterium tuberculosis cell wall structural diversity: contribution to novel mechanisms of antibiotic
resistance and relevance towards tuberculosis progression and treatment.
PTDC/BIA-MIC/31233/2017
Researcher
Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2018/10/01 - 2022/09/30 | TITANGEL - Development and evaluation of a surfactant-hydrogel for preventing direct contact transmitted infections
PTDC/BIA-MIC/31561/2017
Principal investigator
Associação para a Investigação e Desenvolvimento da Faculdade de Medicina, Portugal
Universidade Nova de Lisboa, Portugal Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2021/09 - 2022/09 | HERA - Enhancing Whole Genome Sequencing (WGS) national infrastructures and capacities to respond to the Covid-19 pandemic
in Portugal
ECDC/HERA/2021/021 ECD.12236
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Concluded
|
2020/04 - 2021 | Genetic diversity of the novel coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19) in Portugal
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2015 - 2020/12/31 | ANTARES - Anthrax analysis and screening in soils
GRANT_NUMBER: ANTARES
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
Laboratory of Bromatology and Biological Defense of the Ministry of National Defense
Concluded
|
2017 - 2020/12 | NiPharmin: a new antibacterial scaffold and biological applications.
Decision 287954
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
Jane ja Aatos Erkon Säätiö
Concluded
|
2018 - 2020/05 | TraSyph - Tracing the Treponema pallidum genetic footprints associated with syphilis outcomes and stages
TraSyph
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
Concluded
|
2017 - 2020 | GenomePT - National Laboratory for Genome Sequencing and Analysis
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union
Concluded
|
2017 - 2018/05 | Genome-scale scrutiny of chlamydial antigens
Chlantigens
Researcher
|
Genocea Biosciences, Inc
Concluded
|
2015 - 2017/12 | EMERGE - Efficient response to highly dangerous and emerging pathogens at EU level
HP-JA-2014/JA-04-2014/677066
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
|
European Union,
Concluded
|
2014 - 2015/06 | Novel approach to "understand" syphilis
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2011 - 2014/08/31 | Characterisation of host cell pathways altered by effectors of Brucella, Chlamydia, and Coxiella: identification of novel
therapeutic targets
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2010 - 2013/07/31 | Functional analyses of inclusion membrane proteins of Chlamydia trachomatis
PTDC/SAU-MII/099623/2008
Researcher
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2010 - 2013/07/31 | A novel bacterial system involved in copper tolerance
PTDC/BIA-PRO/098882/2008
Researcher
Universidade de Lisboa Instituto Dom Luiz, Portugal
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2010 - 2013/03/31 | Tracking the synthesis of the Chlamydia cell wall - a biological paradox in intracellular and evasive bacteria
PTDC/BIA-MIC/100747/2008
Researcher
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
2008 - 2011/04/30 | Microarray-based surveying of Chlamydia trachomatis chromosomal mosaics
PTDC/BIA-BCM/71117/2006
Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluded
|
Other
Designation | Funders | |
---|---|---|
2022 - Current | A One Health study to understand the sources, transmission and persistence of foodborne zoonotic diseases.
FMVULusófona_FBZoonOH
Principal investigator
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
|
Ongoing
|
Outputs
Publications
Conference abstract |
|
Conference poster |
|
Journal article |
|
Journal issue |
|
Magazine article |
|
Preprint |
|
Thesis / Dissertation |
|
Intellectual property
Provisional application for patent |
|
Other
Dataset |
|
Other output |
|
Software |
|
Activities
Oral presentation
Presentation title | Event name Host (Event location) |
|
---|---|---|
2024/10/16 | Wildlife as key reservoirs of Staphylococcus aureus genetic variants | The 3rd International Electronic Conference on Diversity (IECD 2024 Conference): Biodiversity of Animals, Plants and Microorganisms (online), 15-17 October |
2024/09/17 | Genomics applied to infectious diseases | Dia Internacional do Microrganismo 2024
Faculdade de Ciências da Saúde, Universidade da Beira Interior (Covilhã, Portugal)
|
2024/07/17 | FROM SUBCLINICAL CIPROFLOXACIN CONCENTRATIONS TO INCREASED RESISTANCE: UNDERSTANDING THE EVOLUTIONARY PATHWAYS OF ARCOBACTER BUTZLERI | XIX Annual CICS-UBI Symposium
(Covilhã, Portugal)
|
2024/06/26 | Genetic characterization of Staphylococcus aureus isolates from hedgehogs: understanding wildlife microbial ecology | 1st Symposium Environmental cHANges, Conservation biology, and Evolution - ENHANCE
Molecular Phylogenetic lab of the Department of Life and Environmental Sciences of the Polytechnic University of Marche (Ancona,
Italy) (Ancona, Italy)
|
2024/05/02 | Importance of surveillance of infectious diseases on sheep farms | 36th Estremoz International Agricultural Fair (FIAPE 2024), within the scope of the Colloquium entitled “The importance of
sheep farming in the rural world”
(Estremoz, Portugal)
|
2023/12 | Probe-based Metagenomics: an added value for clinical decision? | Congress of Microbiology and Biotechnology 2023 (MICRO-BIOTEC'23)
(Covilhã, Portugal)
|
2023/11/03 | To kiss or not to kiss? That is the question... (Invited Speaker) | III Seminário One Health - Uma Só Saúde , Uma Só Medicina na prevenção, diagnóstico e tratamento
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária (Lisbon, Portugal)
|
2023/06 | Characterization of Campylobacter spp. Isolated from animals slaughtered for human consumption: A public health problem in Portugal? | Congresso de Saúde Pública 23
Sociedade Portuguesa de Saúde Pública (Lisbon, Portugal)
|
2023/05/19 | Multi-resistant zoonotic bacteria, from a “One Health” perspective (Invited Speaker) | FMVet Research Meetings 2023 - II Encontro de Investigação da FMV da Universidade Lusófona
(Lisbon, Portugal)
|
2023/05/02 | Genomic biotechnology applied to infectious diseases (Invited Speaker) | VII Ciclo de conferências em Biotecnologia
UBIOTEC - Núcleo de Estudantes de Biotecnologia da Universidade da Beira Interior (Covilhã, Portugal)
|
2023/04/15 | SARS-CoV-2 variants: should we still fear them? (Invited Speaker) | Jornadas da Saúde de Elvas - COVID-19, consequências e desafios
Sociedade Portuguesa de Esclerose Múltipla (SPEM) (Elvas, Portugal)
|
2023 | Performance of metagenomics NGS probe-based pathogen detection in clinical samples | 25º ESCV 2023
European Society for Clinical Virology (Milão, Italy)
|
2023 | Potential impact of low ciprofloxacin concentrations in the promotion of resistance in Aliarcobacter butzleri | 3rd International Electronic Conference on Antibiotics - Rise of Antibiotic Resistance: Mechanisms Involved and Solutions to Tackle it |
2023 | Uncovering Beta-Lactam Susceptibility Patterns in Clinical Isolates of Mycobacterium tuberculosis through Whole-Genome Sequencing. | Universidade de Coimbra Life Sciences Awards
(Coimbra, Portugal)
|
2022/11/08 | Multi-country outbreak of monkeypox virus: from the first viral genome sequence to phylogenomic characterization and microevolution | 3rd Day of INSA's Young Researcher
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP (Lisbon, Portugal)
|
2022/07/25 | Transmission dynamics of Clostridioides difficile - examples of One Health approaches (Invited Speaker) | FMVet Research Meetings
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária (Lisbon)
|
2022/06 | Genomic epidemiology study of multidrug resistant Campylobacter coli isolated in the context of One Health | the 4th Joint meeting on AMR for the FWD-Network and EURL-AR Network
European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) (Denmark)
|
2022/01/04 | How to combat antimicrobial resistance in STIs |
School of Psychology and Life Sciences, Lusófona University (Lisbon, Portugal)
|
2021/12/13 | Assessment of the diversity and dynamics of Clostridioides difficile in a farm environment reveals the presence of a dominant new toxigenic strain connected to swine production | INSA ConVida (13th session)
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP (Lisboa, Portugal)
|
2021/11/19 | Development of novel compounds for specific applications - The Importance of Antimicrobials in the One Health Era | I Webinar One Health Day Antimicrobial Awareness Week
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária (Lisboa, Portugal)
|
2021/10/29 | Development of new drug delivery vehicles |
School of Psychology and Life Sciences, Lusófona University (Lisbon, Portugal)
|
2021/10/13 | Biodegradable polymeric hydrogels as an effective vaginal microbicide delivery system | 3rd NMS Symposium. Chronic diseases and Translacional science
Nova Medical School, CEDOC (Lisboa, Portugal)
|
2021/01/14 | Microbiology importance in Veterinary - One Health perspective | Microbiology I Seminar
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária (Lisboa, Portugal)
|
2020/01/31 | Inhibition of Peptidoglycan Biosynthesis as a Strategy against Drug-resistant Mycobacterium tuberculosis | II Research Symposium on Tuberculosis and Non-Tuberculous Mycobacteria in Portugal
Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa (Lisboa, Portugal)
|
2020/01 | Whole-genome sequencing of infectious agents in the National Institute of Health - Towards a One Health approach |
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária (Lisboa, Portugal)
|
2017/12 | WGS-based laboratory workflows for diagnosing Tuberculosis | Journal Club
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal (Lisbon, Portugal)
|
2016/11/10 | Noval Genomic Approach to Decode the Causing Agent of Syphilis | Portuguese NIH Seminars
Portuguese National Institute of Health (INSA) (Lisbon, Portugal)
|
2016/11 | 3-years experience overview of using NGS in Infectious Diseases: WGS-based and RNA-Seq studies | 3rd Illumina NGS Platform Users Meeting, INSA
(Lisbon, Portugal)
|
2016/05/11 | Using NGS in Infectious Diseases | Next Generation Sequencing Workshop, SOQUÍMICA/Agilent
(Lisbon, Portugal)
|
2016/03 | Phylogenomic Characterization Of The Causative Strain Of One Of The Largest Worldwide Outbreaks Of Legionnaires' Disease Occurred In Portugal In 2014 | 11th International Meeting on Microbial Epidemiological Markers (IMMEM XI)
(Estoril, Portugal)
|
2016 | Resistance to imipenem in endemic clone of Clostridium difficile ribotype 017 | XIII National Congress for HIV, Infectious Diseases and Clinical Microbiology
(Coimbra, Portugal)
|
2015/03 | Genomic and transcriptomic evaluation of the tropism-specific adaptation of Chlamydia trachomatis to epithelial cells unveils the impact of CT135 loss on the expression of multiple virulence-associated genes | 7th Biennial Meeting of the Chlamydia Basic Research Society (CBRS)
(New Orleans, Louisiana, United States)
|
2015/01 | Disclosing molecular determinants of aminoglycosides resistance in Campylobacter spp. | 1st International Caparica Conference in Antibiotic Resistance
(Portugal)
|
2011/06 | Genomic and Transcriptomic Features of Chlamydia trachomatis: Tracking the Basis for the Ecological Success | 4th Congress of European Microbiologists, FEMS 2011
(Geneva, Switzerland)
|
2011/03 | Adaptive evolution of the Chlamydia trachomatis dominant antigen reveals distinct evolutionary scenarios for B- and T-cell epitopes: worldwide survey | 5th Biennial Meeting of the Chlamydia Basic Research Society (CBRS)
(Redondo Beach, California, United States)
|
2009/11 | Evolutionary dynamics of Chlamydia trachomatis key antigen | National Congress of Microbiology and Biotechnology (MICROBIOTEC-09)
(Vilamoura, Portugal)
|
2009/05/04 | Applications of Bioinformatics to Genomics | II Technology Journeys
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal (Monte da Caparica, Portugal)
|
2008/07/16 | Genomic and Transcriptomic Approaches for studying Outer Membrane Proteins of Chlamydia trachomatis | Department of Life Sciences, FCT/UNL
(Monte da Caparica, Portugal)
|
2008/03 | Genomic and Transcriptomic Approaches for studying Outer Membrane Proteins of Chlamydia trachomatis | 47th European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) Postgraduate Technical Workshop entitled "Gene
expression during infection"
(Siena, Italy)
|
2008/01/05 | Evolution of Chlamydia trachomatis: different "stories" per infected organ? | Journal Club
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal (Lisbon, Portugal)
|
Supervision
Thesis Title Role |
Degree Subject (Type) Institution / Organization |
|
---|---|---|
2024/10/01 - Current | Backyard animal production in Portugal: using microbial genomics in a One Health approach to explore associated risk factors
and antimicrobial resistance
Supervisor of Ana Filipa Marques do Carmo Correia Esteves
|
Saúde Integrada (One Health) (PhD)
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro Centro de Ciência Animal e Veterinária, Portugal Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2024 - Current | Investigation of multidrug-resistant enteric bacteria in pigs produced for human consumption – Is there a risk for Public
Health?
Supervisor of Carolina Simões Balbino
|
Bioquímica (Master)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
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2024 - Current | Food safety risks from backyard animals raised for non-commercial purposes
Supervisor of Bruno Morberck Baroni
|
Biotecnologia (Master)
Universidade da Beira Interior, Portugal
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2024 - Current | Exotic animal parks - A potential risk of zoonosis transmission?
Supervisor of Andreia Gabriela Lopes Rodrigues
|
Biologia Molecular e Genética (Master)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
|
2024 - Current | Exploring the potential of whey-derived antimicrobial peptides: identification, production, and applications
Co-supervisor of Tomás Gonçalves Pereira Moita
|
Veterinary Medicine (Master)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2024 - Current | Dynamic evolution of Campylobacter jejuni resistance: Impact of subclinical antibiotic concentrations
Co-supervisor of Inês Margarida Cardoso Martins
|
Biomedicina (PhD)
Universidade da Beira Interior Centro de Investigação em Ciências da Saúde, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2024 - Current | Leveraging Campylobacter coli genomics for enhanced surveillance and antimicrobial resistance understanding: novel schemes
and applications
Supervisor of Mónica Alexandra Gonçalves Azevedo
|
Biology (PhD)
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal |
2024 - Current | Tracking Salmonella spp. and Antimicrobial Resistance in National and Imported Meats: Evaluating Food Safety Standards in
Portuguese Retail
Co-supervisor of Inês Filipa Pinto da Cruz
|
Veterinary Medicine (Master)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2023 - Current | NiPharmins as prophylactic options in preventing bone infections
Supervisor of Sházia Majid Abdul
|
Biochemistry (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2022 - Current | Evaluation of multidrug resistance in Campylobacter jejuni and Campylobacter coli strains isolated from different poultry
species slaughtered for human consumption in Portugal.
Supervisor of Margarida Ferreira Penteado
|
Veterinary Medicine (Master)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2022 - Current | Phenotypic characterization of multidrug-resistant strains of Campylobacter coli and Campylobacter jejuni in pigs raised and
slaughtered for human consumption in Portugal.
Supervisor of Rute Alexandra Simões Rosa
|
Veterinary Medicine (Master)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2024/02 - 2024/07 | Phenotypic and genotypic characterization of Clostridioides difficile strains of clinical and environmental origin
Co-supervisor of Inês Alexandra Baptista Gonçalves
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2024/02 - 2024/07 | Detection and identification of nontuberculous mycobacterium (NTM) species in animals
Co-supervisor of Bruno Dinarte Mirrado de Sousa
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2024/02 - 2024/07 | Molecular characterization of genetic modifiers of kidney disease in sickle cell disease
Co-supervisor of Maria Manuel Pereira Mascarenhas dos Santos
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Genética Humana, Portugal |
2024/02 - 2024/07 | Surveillance of the SARS-CoV-2 virus in Portugal: genetic variability 4-years after the begining of the pandemic
Supervisor of Gonçalo Filipe Durão Gonçalves
|
Biologia (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2024/02 - 2024/07 | Effectiveness comparison in detecting drepanocytic mutation using various molecular biology methodologies
Co-supervisor of Maria Arraiolos e Grafanhate
|
Biologia (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Genética Humana, Portugal |
2024/02 - 2024/07 | One Health study on raw poultry and pork meat for human consumption
Supervisor of Matilde Mourato de Azevedo Cordas
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2024/02 - 2024/07 | Comparative assays of molecular biology methodologies in the implementation of metagenomics strategies to support clinical
decision-making.
Co-supervisor of Tatiana Alexandra Peceguina Catronga
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2023 - 2024 | Sub-clinical antibiotic concentrations on the promotion of Aliarcobacter butzleri resistance
Co-supervisor of Inês Margarida Cardoso Martins
|
Ciências Biomédicas (PhD)
Universidade da Beira Interior, Portugal
|
2023 - 2023 | DriVE - Development of novel drug delivery vehicles
Supervisor of Pedro Gil Matos da Cunha Cruz
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2023 - 2023 | One Health study to understand the sources, transmission and persistence of foodborne zoonotic diseases - focus on pigs
Supervisor of Sara Beatriz Ribeiro Costa
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2023 - 2023 | One Health study to understand the sources, transmission and persistence of foodborne zoonotic diseases - focus on broilers
Co-supervisor of Ana Catarina Ferreira Carolino
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2023 - 2023 | One Health study to understand the sources, transmission and persistence of foodborne zoonotic diseases - focus on turkeys
Co-supervisor of Bianca Bem Santo
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2023 - 2023 | Decoding the mechnisms of action of NiPharmins
Supervisor of João Pedro Nunes Carrilho
|
Bioquímica (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2023 - 2023 | Multidrug-resistant Campylobacter jejuni and Campylobacter coli in Portugal: a One Health study to understand sources and
transmission
Supervisor of Ludovica Di Bella (Eramus student)
|
Veterinary Medicine (Other)
Università degli Studi di Sassari Dipartimento di Medicina Veterinaria, Italy
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2020/09 - 2022/01 | Evaluation of quaternary ammonium surfactants as prophylatics options for Streptococcus Agalactiae infections
Supervisor of Carolina Borges Ferreira
|
Genética Molecular e Biomedicina (Master)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
|
2022 - 2022 | Bioinformatic analysis of Claudin gene expression profiles in patients with pancreatic adenocarcinoma
Supervisor of Miguel Santana
|
Biology (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2022 - 2022 | NiPharmins as prophylactic options in preventing bone infections
Supervisor of João Jorge
|
Biology (Degree)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2020 - 2022 | Evaluation of the genetics underlying a putative acquisition of antimicrobial resistance to novel antibacterial aminoalkylphenols
agents (NiPharmins)
Supervisor of Bárbara André Alves
|
Molecular Genetics and Biomedicine (Master)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
|
2020 - 2022 | Evaluation of Clostridium difficile in companion animals
Co-supervisor of Rita Castro
|
Veterinary Medicine (Master)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2019 - 2022 | TITANGEL: Development and evaluation of a surfactant-hydrogel for preventing direct contact transmitted infections
Supervisor of Rita Diogo Almeida Calado (Recruited Pos-Doc Researcher)
|
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal
|
2019 - 2020 | Isolation and characterization of Campylobacter spp and Clostridium difficile isolates from dogs and cats
Co-supervisor of Rita Castro
|
Veterinary Medicine (Scientific initiation)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2018 - 2019 | Nipharmin - a new antibacterial scaffold and biological applications: Evaluation of the
genetics underlying the putative antimicrobial resistance (AMR) to Nipharmins
Co-supervisor of Joana Andrade
|
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro de Investigação em Biociências e Tecnologias da Saúde, Portugal
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
2015 - 2017 | Molecular studies on HSV: replication rate, infection capacity and progeny
Co-supervisor of Aleksandra Inês Mazurek Vieira de Azevedo
|
Genética Molecular e Biomedicina (Master)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
|
Event organisation
Event name Type of event (Role) |
Institution / Organization | |
---|---|---|
2022/11/08 - 2022/11/08 | Organization of the 3rd Day of INSA's Young Researcher 2022 (2022/11/08 - 2022/11/08)
Meeting (Member of the Organising Committee)
|
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
2017 - 2017 | Organization of the course entitled "Sequenciação de Nova Geração/Bioinformática no estudo de Doenças Infecciosas: conceitos
gerais e aplicações" (2017 - 2017)
Workshop (Member of the Organising Committee)
|
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
Event participation
Activity description Type of event |
Event name Institution / Organization |
|
---|---|---|
2023/11/17 - 2023/11/17 | Attend to the different lectures about the advances and impact of WGS in different areas in Portugal
Symposium
|
3rd Symposium of the National Research Infrastructure for Genome Sequencing and Analysis - GenomePT Symposium 2023
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
|
2023/09/27 - 2023/09/29 | ECDC GenEpi-BioTrain (Block 3/wave 2) training on antimicrobial resistance (AMR) of MRSA, CRE and C. difficile. This course
aimed to strengthen the skills in genomic epidemiology and public health bioinformatics in the field of AMR focusing specifically
on carbapenem- and/or colistin- resistant Enterobacterales (CCRE), methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), and
Clostridiodes difficile.
Workshop
|
GenEpi-BioTrain: SARS-CoV-2 and influenza viruses (Block 3/wave 1)
European Centre for Disease Prevention and Control, Sweden
Statens Serum Institut, Denmark |
2016/11/14 - 2016/11/17 | Epidemiology and Biostatistics Course applied to health research (13th edition)
Workshop
|
EPISTAT
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal
|
2012 - 2012 | Biosafety Training Course in Laboratories of Level 2 (BSL-2) and 3 (BSL-3)
Workshop
|
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal
|
2008/04/16 - 2008/04/20 | European Surveillance of Sexually Transmitted Infections (ESSTI) Laboratory Training Course on Bacterial Sexually Transmitted
Infections Diagnostics
Workshop
|
Public Health England Sexually Transmitted Bacteria Reference Unit, United Kingdom
|
2008/03/02 - 2008/03/05 | Postgraduate Technical Workshop entitled "Gene expression during infection"
Workshop
|
European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Switzerland
|
Jury of academic degree
Topic Role |
Candidate name (Type of degree) Institution / Organization |
|
---|---|---|
2024/07/11 | One Health Study on Raw Meat for Human Consumption
Supervisor
|
Matilde Mourato de Azevedo Cordas (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2024/06/27 | Effectiveness comparison in detecting drepanocytic mutation using various molecular biology methodologies
Supervisor
|
Maria Arraiolos e Grafanhate (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2024/06/27 | Surveillance of the SARS-CoV-2 virus in Portugal: genetic variability 4-years after the begining of the pandemic
Supervisor
|
Gonçalo Filipe Durão Gonçalves (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2024/04/24 | O papel das bombas de efluxo na resistência aos antimicrobianos em isolados clínicos de Neisseria gonorrhoeae
(Thesis) Main arguer
|
Teresa Alexandra Dias Paulino (Master)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
|
2023/12/15 | Genomic diversity and resistance profile of Mycobacterium avium complex clinical isolates circulating in Portugal in the last
8 years
(Thesis) Main arguer
|
Joana Inês Conceição Rodrigues (Master)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
|
2023/07/27 | Development of novel drug delivery vehicles
Supervisor
|
Pedro Gil Matos da Cunha Cruz (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2023/07/10 | NiPharmins: novel low resistance-inducing antimicrobials with antibiofilm activity against Staphylococcus aureus
Supervisor
|
João Pedro Nunes Carrilho (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2023/07/10 | One Health study to understand the sources, transmission and persistence of foodborne zoonotic diseases - focus on pigs
Supervisor
|
Sara Beatriz Ribeiro Costa (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2023/02/08 | Drugs repositioning to decrease resistance mediated by efflux pumps in Neisseria gonorrhoeae and other Gram-negative bacteria
(Thesis) Main arguer
|
Inês Lima Vítor (Master)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
|
2022/12/29 | Endolysins encapsulation in lipid nanoparticles for targeting Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae
(Thesis) Main arguer
|
Tiago Marques Gonçalves (Master)
Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
|
2022/07/29 | NiPharmins as prophylactic options in preventing bone infections
Supervisor
|
João Miguel Jorge (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2022/07/06 | Bioinformatic analysis of Claudin gene expression profiles in patients with pancreatic adenocarcinoma
Supervisor
|
Miguel Arez Santana (Other)
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal
|
2022/06/22 | Expression studies of scwdA, scwdB and scwdC Staphylococcus aureus genes involved in response to cell Wall stress
(Thesis) Main arguer
|
Sara Filipa Tavares Cardoso (Other)
Universidade NOVA de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
|
2022/02/25 | Novel alkylaminophenols as antibacterial agents against Staphylococcus aureus infections
Supervisor
|
Bárbara André Alves (Master)
Universidade NOVA de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
|
2022/01/12 | Evaluation of Quaternary Ammonium Surfactants as Prophylactic options for Streptococcus agalactiae infections
Supervisor
|
Carolina Borges Ferreira (Master)
Universidade NOVA de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
|
Ad Hoc journal article review
Journal title (ISSN) | Publisher | |
---|---|---|
2024 - Current | Microorganisms | MDPI |
2024 - Current | Future Microbiology | |
2024 - Current | Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | |
2022 - Current | Life Sciences | |
2022 - Current | Environmental Microbiology | |
2020 - Current | BMC Microbiology | |
2020 - Current | Trends in Microbiology | |
2020 - Current | Infection and Drug Resistance | |
2020 - Current | Scientific Reports | |
2019 - Current | PLoS ONE | |
2019 - Current | Journal of Molecular Graphics and Modelling | |
2018 - Current | Evolutionary Bioinformatics | |
2018 - Current | Infection Genetics and Evolution (MEEGID) | |
2018 - Current | Frontiers in Microbiology | |
2017 - Current | Journal of Antimicrobial Chemotherapy | |
2017 - Current | Microbial Cell | |
2016 - Current | Austin Journal Infectious Diseases | |
2016 - Current | Genome Biology and Evolution | |
2016 - Current | BMC Infectious Diseases | |
2015 - Current | International Journal of STD &AIDS | |
2014 - Current | Scandinavian Journal Infectious Diseases |
Association member
Society Organization name | Role | |
---|---|---|
2024/03/07 - Current | European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) | Member |
2024/01 - Current | Animal and Veterinary Research Centre (CECAV), Faculty of Veterinary Medicine, Lusófona University - Lisbon University Centre, Portugal | Integrated member |
2024 - Current | International Association for Food Protection (IAFP) | Member |
2023 - Current | COST Action CA21145 "EURESTOP - European Network for diagnosis and treatment of antibiotic-resistant bacterial infections" | Working Group Member |
2010 - Current | Portuguese National Institute of Health Scientific Council | Member |
2020 - 2021 | Research Center for Biosciences & Health Technologies (CBIOS), Lusófona University | Research Member |
Committee member
Activity description Role |
Institution / Organization | |
---|---|---|
2021 - Current | Member of the "INSA ConVida" Committee, which organizes periodical scientific sessions and workshops with the main purpose
of promoting synergies between young researchers and encouraging the scientific spirit at the Portuguese National Institute
of Health (INSA).
Member
|
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
2021 - Current | Coordinator of the Human Genetics curricular unit of the Bachelor in Biology
Coordinator
|
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal |
2021 - Current | Coordinator of the Human Genetics curricular unit of the Bachelor in Biochemistry
Coordinator
|
|
2020/03 - Current | Member of the Task force in charge of monitoring the emergence and dissemination of SARS-CoV-2 genetic variants in Portugal
Member
|
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Portugal |
2019 - Current | Co-coordinator of the Microbiology I curricular unit of the Integrated Master's in Veterinary Medicine
Coordinator
|
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2018 - Current | Co-coordinator of the Microbiology II curricular unit of the Integrated Master's in Veterinary Medicine
Coordinator
|
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2022 - 2023 | Member of the Task force responsible for the genomic surveillance of the mpox virus on behalf of the 2022 multi-country outbreak.
Member
|
Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2021 - 2022 | Coordinator of the Human Genetics curricular unit of the Integrated Masters in Pharmaceutical Sciences
Coordinator
|
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Centro de Investigação em Biociências e Tecnologias da Saúde, Portugal |
2019/02 - 2019/02 | Portuguese Oficial Contact Point (OCP) for Molecular Surveillance Activities for the European Reference Laboratory Network for Tuberculosis (ERLTB-Net) - ECDC | European Centre for Disease Prevention and Control, Sweden |
Course / Discipline taught
Academic session | Degree Subject (Type) | Institution / Organization | |
---|---|---|---|
2023 - Current | Introduction to scientific research | Mestrado Integrado em Medicina Veterinária (Mestrado integrado) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2023 - Current | Project | Biologia (Licenciatura) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal |
2021 - Current | Human Genetics | Biologia (Licenciatura) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal |
2021 - Current | Human Genetics | Bioquímica (Licenciatura) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal |
2021 - Current | Project | Bioquímica (Licenciatura) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal |
2019 - Current | Microbiology I | Mestrado Integrado em Medicina Veterinária (Mestrado integrado) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2018 - Current | Microbiology II | Mestrado Integrado em Medicina Veterinária (Mestrado integrado) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2021 - 2022 | Human Genetics | Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas (Mestrado integrado) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Ciências e Tecnologias da Saúde, Portugal |
2021 - 2022 | Project | Biologia (Licenciatura) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Escola de Psicologia e Ciências da Vida, Portugal |
2019 - 2020 | Food Safety and Higiene I | Mestrado Integrado em Medicina Veterinária (Mestrado integrado) | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal |
2017 - 2017 | Trainer on the "Sequenciação de Nova Geração/Bioinformática no estudo de Doenças Infecciosas: conceitos gerais e aplicações" Course | Sequenciação de Nova Geração/Bioinformática (Curso de Especialização Tecnológica) | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Núcleo de Bioinformática, Portugal |
2015 - 2016 | Microbiology | Universidade NOVA de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal | |
2011 - 2012 | Microbiology | Enfermagem (Licenciatura) | Escola Superior de Saúde da Cruz Vermelha Portuguesa, Portugal |
Evaluation committee
Activity description Role |
Institution / Organization | Funding entity | |
---|---|---|---|
2024/07/03 - 2024/07/05 | Jury of the panel for evaluation of Best Poster at FMVet Research Meetings 2024 - III Encontro de Investigação da FMV da Universidade
Lusófona
Evaluator
|
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária |
2023/05/09 - 2023/05/19 | Jury of the panel for evaluation of Best Poster at FMVet Research Meetings 2023 - II Encontro de Investigação da FMV da Universidade
Lusófona (https://doi.org/10.60543/rlcmv.v15i.9271)
Evaluator
|
Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal | Universidade Lusófona de Humanidades e Tecnologias Faculdade de Medicina Veterinária |
Journal scientific committee
Journal title (ISSN) | Publisher | |
---|---|---|
2023 - Current | Guest Editor for Antibiotics Special Issue on "Antibiotic Resistance, Virulence Profile and Genomic Analysis Among Multidrug-Resistant Bacteria Isolated from Humans and Animals" | |
2022 - Current | Associate Editor for Frontiers in Microbiology (Evolutionary and Genomic Microbiology) | |
2016 - Current | Editorial Board Member of Annals of Infectious Disease and Epidemiology |
Other jury / evaluation
Activity description | Institution / Organization | |
---|---|---|
2018 - 2019 | Presidente de júri em procedimento concursal de seleção internacional para a contratação de doutorado para Projeto de investigação com referência PTDC/BIA/MIC/31561/2017, financiado pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., ao abrigo do Decreto-Lei n.º 57/2016, de 29 de agosto, alterado pela Lei n.º 57/2017 de 19 de julho. | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
2017 - 2018 | Membro de júri para atribuição da Bolsa de Investigação com a Ref.ª GenomePT (projecto 22184), a desenvolver no Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA, I.P.), Departamento de Genética Humana, Unidade de Tecnologia e Inovação, no âmbito do projecto GenomePT do Roteiro Nacional de Infraestruturas de Investigação, financiado pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT). | Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge IP Departamento de Doenças Infeciosas, Portugal |
Distinctions
Award
2024 | Best Oral Presentation Award for "Genetic characterization of S. aureus isolates from hedgehogs: understanding wildlife microbial
ecology", at 1st ENHANCE symposium of DISVA's Molecular Phylogenetic lab, Polytechnic University of Marche (Ancona, Italy)
1 st virtual symposium organized by the Molecular Phylogenetic lab of the Department of Life and Environmental Sciences of
the Polytechnic University of Marche (Ancona, Italy), Italy
|
2023 | Honorable Mention for best poster presented "Evaluation of multidrug resistant Campylobacter spp. strains isolated from poultry
slaughtered for human consumption in Portugal", at FMVet Research Meetings 2023
FMVet Research Meetings - Faculty of Veterinary Medicine, Lusófona University, Portugal
|
2023 | João Monjardino Prize 2022 for paper "Phylogenomic characterization and signs of microevolution in the multinational outbreak of the monkeypox virus in 2022" (best work in "Viral diseases", developed on a national scientific institution) |
2023 | UC-Life Sciences Award to F. Olivença for the paper "Uncovering Beta-Lactam Susceptibility Patterns in Clinical Isolates of
M. tuberculosis through WGS", recognizing PhD students who are authors of the best international article published in Biology
field
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
|
2022 | Gold Medal for Distinguished Services from the Ministry of Health for healthcare professionals during the COVID-19 pandemic
Ministério da Saúde, Portugal
|
2014 | International Award "2014 ASA Travel Award" for the poster "The role of inter-species recombination of the gene FTSI on the
dissemination of altered penicillin-binding protein 3 mediated resistance in Haemophilus influenzae and Haemophilus haemolyticus"
Australian Society for Antimicrobials, Australia
|
2011 | European PathoGenoMics PhD Award 2011 (that recognizes "up to three of the most remarkable and outstanding PhD theses in the
field of genome research on human-pathogenic microorganisms").
European Research Area (ERA-NET), Portugal
|