Pedro Prudêncio (7B1C-9F36-22C8)

Curriculum Vitae

Pedro Prudêncio

Pedro Prudêncio completed the Ph.D. in Ciências Biomedicas in 2020/07/23 by Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Mestrado in Mestrado Integrado em Engenharia Biologica in 2010 by Universidade do Algarve and Licenciatura in Engenharia Biotecnológica in 2007 by Universidade do Algarve. He is a Postdoc in Instituto de Medicina Molecular JLA at Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa. Published 14 articles in journals. Supervised 1 MSc dissertation. Participated as Post-doc in 1 project and collaborates on 3 other projects. Works in the area of Molecular Cell Biology with emphasis on Gene expression regulation more specifically Splicing regulation during RNA transcription. He has expertise in a vast type of techniques, namely: plasmid cloning techniques; CRISPR-Cas9 gene editing; RNA/DNA extraction from several cell types and tissues; preparation of libraries for RNA-seq and NET-seq; protein blot analysis; Co-immunoprecipitation of proteins; Chromatin immunoprecipitations; immunohistochemistry and the skills handling cell cultures and Drosophila flies

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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Pedro Prudêncio

Nomes de citação

Prudêncio, Pedro

Identificadores de autor

Ciência ID: 7B1C-9F36-22C8
ORCID iD: 0000-0003-1390-8491
Google Scholar ID: https://scholar.google.com/citations?hl=pt-PT&user=NnJJEewAAAAJ

Domínios de atuação

Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Celular

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Inglês	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)	Utilizador proficiente (C1)

Formação

	Grau	Classificação
2016/07/01 - 2020/07/23 Concluído	Ciências Biomedicas (Doutoramento) Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal "Pre-mRNA splicing and regulation of gene expression after egg fertilization" (TESE/DISSERTAÇÃO)	Muito Bom, com Distinção e Louvor
2010 Concluído	Mestrado Integrado em Engenharia Biologica (Mestrado) Universidade do Algarve, Portugal "Differential requirements of aPKC activity within different epithelial tissues" (TESE/DISSERTAÇÃO)	15
2007 Concluído	Engenharia Biotecnológica (Licenciatura) Universidade do Algarve, Portugal "Detecção de Ilarvirus por RT-PCR Multiplex em Real time" (TESE/DISSERTAÇÃO)	13

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2020/01/08 - Atual	Pós-doutorado (Investigação)	Instituto de Medicina Molecular, Portugal
	Instituto de Medicina Molecular, Portugal

Outros

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2015/12/01 - 2020/02/10	PhD student	Instituto de Medicina Molecular, Portugal

2010/04/01 - 2015/11/30	Graduate Researcher	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

2008/01/01 - 2010/04/01	Master student	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

2007/02/01 - 2007/11/01	Laboratory Technician	Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2022/01/01 - 2024/12/31	Mutação BRCA2 fundadora Portuguesa: impacto na transcrição e identidade de células estaminais Impact of the Portuguese BRCA2 founder mutation on transcription and tissue stem cell identity PTDC/MED-ONC/3921/2021 Investigador Instituto de Medicina Molecular, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2023/01/01 - 2024/06/30	Mapping the spatial organization of co-transcriptional splicing 2022.01836.PTDC Investigador responsável Instituto de Medicina Molecular, Portugal	Em curso
2022/01/01 - 2023/06/30	A new mechanism of nuclear compartmentalization in meiosis: from basic to clinical research in male infertility EXPL/MEC-AND/0676/2021 Investigador Instituto de Medicina Molecular, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2022/01/01 - 2023/06/30	Inativação do Cromossoma X no Lúpus Eritematoso Sistémico X-Chromosome Inactivation in Systemic Lupus Erythematosus EXPL/MED-OUT/1517/2021 Investigador Instituto de Medicina Molecular, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2018/09/29 - 2021/09/28	O despertar do oócito: reactivação transcricional após um estado quiescente prolongado. PTDC/BIA-BID/28441/2017 Bolseiro de Integração na Investigação Universidade do Algarve, Portugal Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal Universidade do Porto, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Em curso
2020/09/22 - 2021/01/31	Promoção do avanço significativo do conhecimento na área de medicina de precisão e sua translação para benefício da sociedade SAICTPAC/0021/2015 Investigador Pós-doutorado Instituto de Medicina Molecular, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2015/12/01 - 2019/12/01	Pre-mRNA splicing and regulation of gene expression after egg fertilization SFRH/BD/109689/2015 Bolseiro de Doutoramento Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2008/02/01 - 2011/03/31	Caracterização dos mecanismos moleculares responsáveis pela indução de transcrição zigótica após a fertilização do oócito. PTDC/BIA-BCM/69256/2006 Bolseiro de Integração na Investigação Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído
2008/01/01 - 2010/12/31	Caracterização da segregação da linha germinal durante o desenvolvimento embrionário de Drosophila melanogaster PPCDT/DG/BIA/82013/2006 Bolseiro de Integração na Investigação Fundação Calouste Gulbenkian, Portugal	Fundação para a Ciência e a Tecnologia Concluído

Projeto

	Designação	Financiadores
2022/02/06 - 2022/12/31	Cardiac Splicing as a Therapeutic Target 21CVD02 Investigador Pós-doutorado Instituto de Medicina Molecular, Portugal	Fondation Leducq Em curso

Produções

Publicações

Artigo em revista	Rion B. Correia; M. Almeida, Joana; Wyrwoll, Margot J.; Irene Julca; Sobral, Daniel; Misra, Chandra Shekhar; Guilgur, Leonardo G.; et al. Autor correspondente: Navarro-Costa, Paulo. "The conserved transcriptional program of metazoan male germ cells uncovers ancient origins of human infertility". bioRxiv (2022): Submetido • https://doi.org/10.1101/2022.03.02.482557 Prudêncio, Pedro; Savisaar, Rosina; Rebelo, Kenny; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria. "Transcription and splicing dynamics during early Drosophila development". RNA 28 2 (2022): 139-161. http://dx.doi.org/10.1261/rna.078933.121. 10.1261/rna.078933.121 Rathore, Om Singh; Silva, Rui D.; Ascensão-Ferreira, Mariana; Matos, Ricardo; Carvalho, Célia; Marques, Bruno; Tiago, Margarida N.; et al. "NineTeen Complex-subunit Salsa is required for efficient splicing of a subset of introns and dorsal–ventral patterning". RNA 26 12 (2020): 1935-1956. http://dx.doi.org/10.1261/rna.077446.120. 10.1261/rna.077446.120 Prudêncio, Pedro. "Analysis of Mammalian Native Elongating Transcript sequencing (mNET-seq) high-throughput data". Methods (2019): http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2019.09.003. 10.1016/j.ymeth.2019.09.003 Prudêncio, Pedro. "The Trithorax group protein dMLL3/4 instructs the assembly of the zygotic genome at fertilization". EMBO reports (2018): http://dx.doi.org/10.15252/embr.201845728. 10.15252/embr.201845728 Rathore, O.S.; Faustino, A.; Prudêncio, P.; Van Damme, P.; Cox, C.J.; Martinho, R.G.. "Absence of N-terminal acetyltransferase diversification during evolution of eukaryotic organisms". Scientific Reports 6 (2016): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84958074128&partnerID=MN8TOARS. 10.1038/srep21304 Navarro-Costa, P.; McCarthy, A.; Prudêncio, P.; Greer, C.; Guilgur, L.G.; Becker, J.D.; Secombe, J.; Rangan, P.; Martinho, R.G.. "Early programming of the oocyte epigenome temporally controls late prophase i transcription and chromatin remodelling". Nature Communications 7 (2016): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84981510292&partnerID=MN8TOARS. 10.1038/ncomms12331 Martinho RG; Guilgur LG; Prudêncio P. "How gene expression in fast-proliferating cells keeps pace.". (2015): http://europepmc.org/abstract/med/25823409. 10.1002/bies.201400195 Prudêncio, Pedro; Guilgur, Leonardo. "Protein Extraction from Drosophila Embryos and Ovaries". BIO-PROTOCOL 5 9 (2015): http://dx.doi.org/10.21769/bioprotoc.1459. 10.21769/bioprotoc.1459 Prudêncio, Pedro; Guilgur, Leonardo. "FLP/FRT Induction of Mitotic Recombination in Drosophila Germline". BIO-PROTOCOL 5 9 (2015): http://dx.doi.org/10.21769/bioprotoc.1458. 10.21769/bioprotoc.1458 Ferreira, Tania; Prudêncio, Pedro; Martinho, Rui Gonçalo. "Drosophila protein kinase N (Pkn) is a negative regulator of actin-myosin activity during oogenesis.". (2014): http://europepmc.org/abstract/med/25131196. 10.1016/j.ydbio.2014.08.008 Guilgur, Leonardo Gaston; Prudêncio, Pedro; Sobral, D.; Liszekova, D.; Rosa, A.; Martinho, Rui Gonçalo. "Requirement for highly efficient pre-mRNA splicing during Drosophila early embryonic development". eLife 2014 3 (2014): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84899657623&partnerID=MN8TOARS. 10.7554/eLife.02181.001 Alves E; Henriques BJ; Rodrigues JV; Prudêncio, Pedro; Rocha H; Vilarinho L; Martinho RG; Gomes CM. "Mutations at the flavin binding site of ETF:QO yield a MADD-like severe phenotype in Drosophila.". (2012): http://europepmc.org/abstract/med/22580358. 10.1016/j.bbadis.2012.05.003 Guilgur LG; Prudêncio, Pedro; Ferreira, Tania; Pimenta-Marques AR; Martinho, Rui Gonçalo. "Drosophila aPKC is required for mitotic spindle orientation during symmetric division of epithelial cells.". (2012): http://europepmc.org/abstract/med/22223679. 10.1242/dev.071027
Poster em conferência	Prudêncio, Pedro. "Dynamics of anti-sense transcription during iPSC differentiation". Trabalho apresentado em Cell Symposia – “The conceptual power of single cell biology”, 2023. Prudêncio, Pedro; Savisaar, Rosina; Rebelo, Kenny; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria. "The timing of co-transcriptional splicing in Drosophila embryos.". Trabalho apresentado em The 26th Annual Meeting of the RNA Society - RNA 2021, 2021. Prudêncio, Pedro; Savisaar, Rosina; Rebelo, Kenny; Martinho, Rui; Carmo-Fonseca, Maria. "“Immediate” co-transcriptional splicing in Drosophila is associated to S5P of the Pol II CTD". Trabalho apresentado em Splicecon 2021 Symposium. Virtual, 2021. Prudêncio, Pedro; Savisaar, Rosina; Rebelo K.; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria. "Impact of gene architecture on pervasive transcription in Drosophila embryos.". Trabalho apresentado em EMBO \| EMBL Symposium: The Complex Life of RNA. Virtual., 2020. Prudêncio, Pedro; Savisaar, Rosina; Rebelo K.; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria. "Links between RNA Pol II pausing and immediate splicing.". Trabalho apresentado em International Meeting of the Portuguese Society of Genetics. Universidade do Algarve Faro, Portugal, 2020. Prudêncio, Pedro; Rebelo K.; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria. "Genome-wide analysis of the nascent RNApolII transcriptome during Drosophila development. (short talk + poster)". Trabalho apresentado em EMBO\|EMBL Symposium The Complex Life of mRNA. Heidelberg, Germany, 2018. Prudêncio, Pedro; Guilgur, Leonardo Gaston; Lisekova D.; Sobral, Daniel; Martinho, Rui Gonçalo. "Avoidance of premRNA splicing during Drosophila early embryonic development.". Trabalho apresentado em 2nd Meeting Portuguese Society for Development Biology. Lisboa, Portugal, 2013. Prudêncio, Pedro; Guilgur, Leonardo Gaston; Lisekova D; Sobral, Daniel; Martinho, Rui Gonçalo. "Developmental constraints to splicing in early Drosophila embryo.". Trabalho apresentado em 7th Annual Meeting for Gulbenkian Students (AMeeGuS). Seia, Portugal, 2013. Prudêncio, Pedro; Guilgur, Leonardo Gaston; Lisekova D; Sobral, Daniel; Martinho, Rui Gonçalo. "Developmental constraints to pre-mRNA splicing during Drosophila early embryogenesis". Trabalho apresentado em EMBO\|EMBL Symposium The Complex Life of mRNA. Heidelberg, Germany, 2012. Prudêncio, Pedro; Guilgur, Leonardo Gaston; Lisekova D.; Ferreira, Tania; Martinho, Rui Gonçalo. "Drosophila aPKC is required for mitotic spindle orientation during symmetric division of epithelial cells". Trabalho apresentado em 22nd European Drosophila Research Conference. Lisbon, Portugal, 2011. Prudêncio, Pedro; Guilgur, L.G.; Lisekova D.; Ferreira, Tania; Martinho, Rui Gonçalo. "Tissue specific requirements of Drosophila NTC complex in pre-mRNA splicing.". Trabalho apresentado em Eukaryotic mRNA Processing meeting, Cold Spring Harbor Laboratory, 2011.
Tese / Dissertação	Prudêncio, Pedro. "Pre-mRNA splicing and regulation of gene expression after egg fertilization". Doutoramento, Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, 2020. Prudêncio, Pedro António Pereira. "Differential requirements of aPKC activity within different epithelial tissues". Mestrado, 2009. http://hdl.handle.net/10400.1/5508.

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2021/12/03	Splicing: astonishing facts and open questions.	Seminar for Mestrado em Biologia Molecular e Microbiana, Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas da Universidade do Algarve (Faro)
2020/03/09	Links between RNA Pol II Pausing and Immediate Splicing.	iMM Scientific Retreat Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes (Lisboa, Portugal)
2018/10/03	Genome-wide analysis of the nascent RNApolII transcriptome during Drosophila development. (short talk + poster)	EMBO\|EMBL Symposium The Complex Life of mRNA EMBO\|EMBL (Heidelberg, Alemanha)
2018/09/08	Genome-wide analysis of the nascent RNApolII transcriptome during Drosophila development	Portuguese Drosophila meeting. (Tomar, Portugal)

Orientação

	Título / Tema Papel desempenhado	Curso (Tipo) Instituição / Organização
2020/09/01 - 2021/12/21	The role of cyclin-dependent kinases (CDKs) on co-transcriptional splicing through phosphorylation of the RNA Pol II carboxyl-terminal domain (CTD). Orientador	Ciências Biofarmacêuticas (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal

Curso / Disciplina lecionado

	Disciplina	Curso (Tipo)	Instituição / Organização
2023/11 - 2023/11/16	"Junk code: The key for life complexity and diversity" Seminar for Master program in Biologia Molecular e Microbiana	Master program in Biologia Molecular e Microbiana	Universidade do Algarve Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Portugal
2020/09/14 - 2020/09/25	Laboratory practical course for medical students at the University of Lisbon Medical School	Medicina (Licenciatura)	Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal

Tutoria

	Tópico	Nome do aluno
2021/01/12 - 2021/02/04	Generation of APEX2 fusion proteins by CRISPR-Cas9 genome editing to study co-transcriptional splicing	Júlia Canning Clode Castro Neves
2018/01/01 - 2018/04/20	project CanSat Portugal 2018	Bernardo Alves and Francisco Alves
2016/09/01 - 2017/09/01	Mestrado, Splicing kinetics revealed by nascent transcript sequencing.	Kenny Patrick Figueira Rebelo

Distinções

Prémio

2020	Best Poster Sociedade Portuguesa de Genética Humana – SPGH, Portugal

Outra distinção

2018	Travel grant EMBO\|EMBL , Alemanha