Identificação
Identificação pessoal
- Nome completo
- João Pedro Nogueira Marques
Nomes de citação
- Marques, João P.
- Marques, João Pedro
Identificadores de autor
- Ciência ID
- 9917-41DB-73E5
- ORCID iD
- 0000-0001-9834-1361
- AuthenticusID
- R-00H-AFE
- Google Scholar ID
- https://scholar.google.pt/citations?user=g3aEndwAAAAJ&hl=pt-PT
- Researcher Id
- M-6187-2013
- Scopus Author Id
- 56506389700
Endereços de correio eletrónico
- joao.marques@cibio.up.pt (Profissional)
Websites
- http://orcid.org/0000-0001-9834-1361 (Profissional)
- https://cibio.up.pt/people/details/jpnmarques (Profissional)
- https://www.researchgate.net/profile/Joao_Marques11 (Rede social)
Domínios de atuação
- Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies
- Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
- Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Genética e Hereditariedade
Idiomas
Idioma | Conversação | Leitura | Escrita | Compreensão | Peer-review |
---|---|---|---|---|---|
Português | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador proficiente (C1) | |
Inglês | Utilizador independente (B1) | Utilizador proficiente (C1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador independente (B1) | |
Espanhol; Castelhano | Utilizador elementar (A1) | Utilizador independente (B1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | |
Francês | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) | Utilizador elementar (A1) |
Formação
Grau | Classificação | |
---|---|---|
2017/10/01 - 2022/04/19
Concluído
|
Génétique et Génomique (Doctorat)
Université de Montpellier, França
"Utilisation des outils génomiques pour comprendre la différenciation et le mélange des
espèces chez les lièvres et les souris" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
|
2016/09 - 2022/04/19
Concluído
|
Doutoramento em Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal "Using genomic tools to understand species differentiation and admixture in hares and mice." (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
|
2015
Concluído
|
Bioinformatics in Health Sciences (Pós-Graduação)
Universidade do Minho Escola de Medicina, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
18 out of 20 |
2012
Concluído
|
Bioquímica, Ramo 1 - Especialização em Métodos Biomoleculares (Mestrado)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Identification of determinants of resistance in P.falciparum - Proteomics approach 17 out of 20" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
16 out of 20 |
2009
Concluído
|
Biochemistry (Licenciatura)
Universidade de Aveiro, Portugal
"Antioxidant effect of catalase- 16 out of 20" (TESE/DISSERTAÇÃO)
|
13 out of 20 |
Percurso profissional
Ciência
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2022/05 - Atual | Investigador Contratado (Investigação) | Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal |
2016/10 - 2022/04 | Investigador (Investigação) | Institut des sciences de l'évolution, França |
2014/01 - 2022/04 | Investigador (Investigação) | Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal |
2013/05/01 - 2014/01/31 | Investigador (Investigação) | Centro de Ciências do Mar, Portugal |
2010/06/30 - 2010/09/01 | Estagiário de Investigação (Investigação) | Universität Bremen, Alemanha |
Outros
Categoria Profissional Instituição de acolhimento |
Empregador | |
---|---|---|
2012/01/21 - 2012/12/31 | Science promoter in the environmental educational project "H20 Indaqua - Água limpa para beber dá saúde e faz crescer" | INDAQUA, Portugal |
Projetos
Projeto
Designação | Financiadores | |
---|---|---|
2023/03/01 - Atual | Biodiversity Genomics Europe
101059492
Investigador Pós-doutorado
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
|
European Commission
Em curso
|
2021/01/01 - Atual | Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology (InBIO)
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2020/01/01 - Atual | Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2020/01/01 - Atual | Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
Investigador
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2021/03/15 - 2022/02/28 | HybridChange - The potential of hybridization to promote rapid adaptation during climate change
Investigador Pós-doutorado
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
|
2019/01/01 - 2019/12/31 | Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
UID/BIA/50027/2019
Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal Universidade do Minho Laboratório de Paisagens Património e Território, Portugal |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
|
2015/06 - 2017/02 | HybridAdapt - Hybridization, adaptation and historical demography: a population genomics study
FCT-ANR/BIA-EVF/0250/2012
Bolseiro de Mestrado
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Institut des sciences de l'évolution, França |
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2014/02 - 2015/05 | Molecular and population genetic signatures of cytonuclear interactions: the Podarcis model
EXPL/BIA-EVF/1283/2012
Bolseiro de Mestrado
|
Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
2013/05 - 2014/01 | Parathyroid hormone-related protein and Stanniocalcin: new metabolic hormones?
Bolseiro de Mestrado
Centro de Ciências do Mar, Portugal
|
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia
Concluído
|
Produções
Publicações
Artigo em conferência |
|
Artigo em revista |
|
Poster em conferência |
|
Pré-impressão |
|
Tese / Dissertação |
|
Atividades
Apresentação oral de trabalho
Título da apresentação | Nome do evento Anfitrião (Local do evento) |
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---|---|---|
2024/09 | MyxoHares: uma perspectiva genómica do impacto da mixomatose em lebres-ibéricas. | CICARC 2024 - Congresso Ibérico de Ciência Aplicada aos Recursos Cinegéticos
Estação Biológica de Mértola (Mértola, Portugal)
|
2024/07 | MyxoHares: Unravelling the genomic landscape of myxomatosis susceptibility in Iberian hares | 7th World Lagomorph Conference
Queen’s University (Belfast, Reino Unido)
|
2024/07 | Exploring hybridization dynamics in Alpine hare species under climate-driven range shifts. | 7th World Lagomorph Conference
Queen’s University (Belfast, Reino Unido)
|
2024/07 | Using sister taxa to unravel the role of demography and adaptation promoting divergence and admixture. | 7th World Lagomorph Conference
Queen’s University (Belfast, Portugal)
|
2024/06 | Origins and admixture: The Iranian plateau as a house mouse arena. | 7th International Mouse Meeting
Associação BIOPOLIS (Vila do Conde, Portugal)
|
2022/07 | Inference of positive selection in the evolution of major Lagomorph lineages | 6th World Lagomorph Conference
Universite Montpellier (Montpellier, França)
|
2022/06 | A successful Y chromosome lineage in regions of admixture between house mouse subspecies. | VIth Mouse Symposium
Universite Montpellier (Montpellier, França)
|
Orientação
Título / Tema Papel desempenhado |
Curso (Tipo) Instituição / Organização |
|
---|---|---|
2023/10 - 2027/12 | The adaptive potential of sharks in a changing ocean: insights from comparative and
population genomics
Coorientador
|
Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Université de Montpellier, França Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal Centre pour la Biodiversité Marine l'Exploitation et la Conservation, França |
2023/03/01 - 2027 | The causes and consequences of ancient hybridization among hares (Lepus spp.)
Coorientador
|
Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2024/01 - 2026/07 | The dynamics of immune gene family evolution in Lagomorphs: a comparative genomics approach
Orientador
|
Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2025 - 2026 | The impact of genetic admixture between hare species in the Alps
Orientador de Pedro Lucas Assunção de Sousa
|
Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal |
2023/09/01 - 2024/07/26 | Understanding the genetic determinants of behaviour differences between the sister species Mus spicilegus and Mus macedonicus
using whole genome sequencing data
Orientador
|
Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2023/09/01 - 2024/06/26 | Studying the impact of climate change on genetic exchanges between hares across French Alps contact zone
Orientador
|
Biologia (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2021/09 - 2022/11/17 | Using genomics to dissect the history of divergence and hybridization in the sister broom and Corsican hares (Lepus spp.).
Coorientador
|
Mestrado em Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado)
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
|
Organização de evento
Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação) |
Instituição / Organização | |
---|---|---|
2024/08/27 - Atual | XX Encontro Nacional de Biologia Evolutiva (2024/12/19 - 2024/12/20)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
|
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal |
2024/09/20 - 2024/10/10 | Genome Applications Symposium - BGE and ERGA (2024/09/30 - 2024/10/01)
Simpósio (Outra)
|
Biodiversity Genomics Europe, Países Baixos European Reference Genome Atlas, Bélgica |
2024/03/03 - 2024/06/16 | 7th International Mouse Meeting (2024/06/04 - 2024/06/06)
Congresso (Coorganizador)
|
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal Universidade do Porto Departamento de Biologia, Portugal Université de Montpellier, França Institut des sciences de l'évolution, França |
2023/05 - 2023/06 | Workshop: "Introduction to Galaxy and VGP Assembly Pipeline".
Part of ERGA-Portugal knowledge transfer activities (2023/05/18 - 2023/06/15)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
|
European Reference Genome Atlas, Bélgica |
2016/05/03 - 2016/05/06 | Congenomics (2016/05/03 - 2016/05/06)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
|
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal |
Participação em evento
Descrição da atividade Tipo de evento |
Nome do evento Instituição / Organização |
|
---|---|---|
2019/06/17 - 2019/06/21 | Advanced Python for Biologists - by Dr. Martin Jones
Oficina (workshop)
|
Advanced Python for Biologists
PR Statistics, Reino Unido
|
2018/01/21 - 2018/02/03 | Workshop on Population and Speciation Genomics (WPSG) - Ceský Krumlov, Czech Republic - The WPSG brings together an international
faculty members and participants to study and discuss current ideas and techniques for the analysis of genomic data on the
level of populations and closely related species. Consists of a series of lectures, demonstrations and computer laboratories
that cover theory and practice of population and speciation genomics Link: https://evomics.org/people/participants/workshop-on-population-and-speciation-genomics/
Oficina (workshop)
|
Workshop on Population and Speciation Genomics
Universität Basel, Suiça
|
2017/03/04 - 2017/03/20 | Programming for Evolutionary Biology (PEB) - Leipzig. The PEB course brings together scientists broadly interested in applying
bioinformatic tools to answer evolutionary and ecological questions. Unlike other courses, it aims to serve as a platform
for discussing common programming pitfalls encountered during research and features workshops to further develop participants’
bioinformatic skills. Link: http://evop.bioinf.uni-leipzig.de/?page_id=199
Oficina (workshop)
|
Programming for Evolutionary Biology
Universität Leipzig Research Academy Leipzig, Alemanha
|
Júri de grau académico
Tema Tipo de participação |
Nome do candidato (Tipo de grau) Instituição / Organização |
|
---|---|---|
2024/11/21 | The evolutionary history of the yellow coat colour in the Iberian wolf
Arguente principal
|
Catarina Rafaela Magalhães Garcês (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
2022/12 | Using genomics to dissect the history of divergence and hybridization in the sister broom and Corsican hares (Lepus
spp.)
Orientador
|
João Manuel Meira do Souto (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
|
Arbitragem científica em revista
Nome da revista (ISSN) | Editora | |
---|---|---|
2018 - Atual | Reviewer for 4 journals |
Membro de associação
Nome da associação | Tipo de participação | |
---|---|---|
2022 - Atual | Associação Portuguesa de Biologia Evolutiva (APBE; Portuguese Society for Evolutionary Biology) | Member |
2022 - Atual | World Lagomorph Society | Member |
2021 - Atual | Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE) | Member |
2021 - Atual | The European Reference Genome Atlas (ERGA) initiative | Member |
2021 - Atual | The European Reference Genome Atlas - Portugal (ERGA-PT) | Executive coordinatinator |
2018 - Atual | European Society for Evolutionary Biology (ESEB) | Member |
Membro de comissão
Descrição da atividade Tipo de participação |
Instituição / Organização | |
---|---|---|
2022 - Atual | ERGA - Data Analysis Committee (Steering Committee)
Membro
|
European Reference Genome Atlas, Bélgica |
2022 - Atual | ERGA - Sequencing and Assembly Committee (Steering Committee)
Membro
|
European Reference Genome Atlas, Bélgica |
Tutoria
Tópico | Nome do aluno | |
---|---|---|
2024/07 - Atual | Master Student - Population Genomics - Studying the impact of climate change on genetic exchanges between hares across French Alps contact zone | Pedro Lucas Assunção de Sousa |
2023 - Atual | Visiting Postdoctoral Researcher: Transcriptomics in the Thoropa miliaris group | Ariadne Sabbag |
2023 - Atual | Research Technician | Joana Pinto |
2016 - Atual | Research Technician | Liliana Farelo |
2023/10 - 2027 | PhD Student - Genomics - PomeSafe: Improved sustainable management of Erwinia amylovora through integrative multi-omics, detection and green chemistry approaches | Laura Silva Ferreira Regalado |
2024 - 2024 | Visiting Postdoctoral Researcher: RNA sequencing data analysis - Impact of vaccination with the Anaplasma phagocytophilum MSP4 chimeric antigen on gene expression in the rabbit host | Marinela Contreras |
2021 - 2024 | PhD Student - Population Genomics - DrosuGreen: Controlling the quarantine pest Drosophila suzukii through epidemiological studies and new Green biocontrol techniques (PTDC/ASP-PLA/4477/2020) | Sara Judite Pais Sario |
2020 - 2021 | Master Student - FlexOmics: Flexible Toolkit for Genomic Statistical Analysis | Jorge Miguel Gonçalves Simões |
Distinções
Outra distinção
2016 | PhD grant
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
|