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Eugénio C. Ferreira is the Vice-Rector (Research & Innovation) of the University of Minho (since Dec 2019), Chairman of TECMINHO - Associação Universidade Empresa para o Desenvolvimento, and Vice-President of CENTI - Centre for Nanotechnology and Smart Materials. Full Professor at the Department of Biological Engineering and former Director of the PhD program on Bioengineering (MIT Portugal Program). He served as Diretor of the Centre of Biological Engineering (2016-2020), a research unit with more than 400 researchers where he leads the BIOSYSTEMS research group on Bioprocess Engineering and Computational Biosystems. His research expertise relates to Process Systems Engineering in Biotechnological, Chemical and Environmental Applications with particular emphasis in the following areas of activity: Modelling, Monitoring, and Control of Bioprocesses; Systems Biology, Bioinformatics, and Metabolic Engineering; Image Analysis and Chemometrics in (Environmental) Biotechnology. From 2017-2019 he served as Counsellor Member at the General Council of the University Minho. From 2010 to 2013 he served as Associate Dean for Research of the School of Engineering at the University of Minho. From 2004 to 2010 he served as Associate Director of the Department of Biological Engineering and as Director of the Master program on Environmental Management. Professor Ferreira served as Chair of the Chemical & Biological Engineering Section of the Portuguese Engineers Institution (2010-2013), as the General-Secretary of the Portuguese Society of Biotechnology (2004-2019). He was the Portuguese Delegate at the Board of the European Federation of Chemical Engineering (2010-13) and is a member of the IFAC Technical Committee on Biosystems and Bioprocesses and the National Representative to the Technical Committee on Modelling, Monitoring, Measurement, and Control of the European Society of Biochemical Engineering Sciences. In addition, he is Associate Editor of Frontiers in Biotechnology and Bioengineering and Frontiers in Chemical Engineering, member of the Editorial Board of Chemical Product and Process Modeling, Brazilian Journal of Chemical Engineering, and Environmental Engineering and Management Journal and he was the Editor-in-Chief of Engenharia Química journal from 2006 to 2008. He was the Chair of the organization committee of the CHEMPOR2008 - International Chemical Engineering Congress. In addition, he integrated the organizing committees of several conferences (CAC2004, ESCAPE14, ESBES2) and the international program committees of more than 60 Congresses. He acted as Coordinator of the review panel for PhD fellowships in Bioengineering and Biotechnology at the Portuguese Foundation for Science and Technology and he is a coordinator/member of the Assessment Panel for Biotechnology and Bioengineering Academic Programs at the national Agency for the Assessment and accreditation of Higher Education. He also integrated review panels for Agência Nacional de Inovação, European Science Foundation and European Commission. His supervision of students has involved 14 PhD theses, with one of them being awarded the CUF Prize for the Best Chemical and Biological Engineering thesis in Portugal (2003). Professor Ferreira has published 10 books and is the author of more than 200 international refereed papers and book chapters. In addition, more than 325 papers and communications in conferences have been published by him. He graduated (1986) and received his PhD (1995) in Chemical Engineering from the Faculty of Engineering of the University of Porto. He did doctoral research at the Université Catholique de Louvain (Belgium), post-doctorate at the Universitat Autonoma de Barcelona (Spain) and sabbatical at the University of California, San Diego (USA).
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Eugénio Campos Ferreira
Género
Masculino

Nomes de citação

  • E. C. Ferreira
  • Ferreira, Eugénio C.
  • Ferreira, E.C.

Identificadores de autor

Ciência ID
CA10-0F06-E2A0
ORCID iD
0000-0002-5400-3333
Google Scholar ID
FXPpP8UAAAAJ
Researcher Id
B-5417-2009
Scopus Author Id
7103157456

Endereços de correio eletrónico

  • ecferreira@deb.uminho.pt (Profissional)

Moradas

  • Universidade do Minho. Departamento de Engenharia Biológica, Campus de Gualtar, 4710-057, Braga, Braga, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia Química
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Engenharia do Ambiente
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Ambiental
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
Formação
Grau Classificação
2022
Em curso
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Especialização em Sem especialidade
Universidade do Minho, Portugal
"An approach towards Zero-Waste wastewater technology: Sustainable AGS processes for safe valorization of urban wastewater for irrigation, with minimized ecological and agronomic impacts" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2004/07/23
Concluído
 Habilitation (Título de Agregado)
Universidade do Minho, Portugal
"Agregação em Engenharia Química e Biológica " (TESE/DISSERTAÇÃO)
1997 - 1998
Concluído
 Supervision and Control of Biological Wastewater Treatment Plants (Pós-doutoramento)
Universitat Autònoma de Barcelona, Espanha
1995/07/11
Concluído
 Doutoramento em Engenharia Química (Doutoramento)
Universidade do Porto, Portugal
"Identificação e Controlo Adaptativo de Processos Biotecnológicos" (TESE/DISSERTAÇÃO)
1981 - 1986/07
Concluído
 Engenharia Química (Licenciatura)
Universidade do Porto, Portugal
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
1986/09/01 - 1990/01/31 Investigador (Investigação) LNETI - Laboratório Nacional de Engenharia e Tecnologia Industrial, Portugal
LNETI - Laboratório Nacional de Engenharia e Tecnologia Industrial, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2010/11/11 - Atual Professor Catedrático (Docente Universitário) Universidade do Minho Departamento de Engenharia Biológica, Portugal
2004/08 - 2010/11 Professor Associado (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal
2001/07 - 2004/07 Professor Associado (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal
2000/08 - 2001/06 Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal
1991/03 - 1995/06 Assistente (Docente Universitário) Universidade do Minho, Portugal

Cargos e Funções

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2022/03 - Atual Vice-Presidente Centitvc Centro de Nanotecnologia e Materiais Técnicos Funcionais e Inteligentes, Portugal
Centitvc Centro de Nanotecnologia e Materiais Técnicos Funcionais e Inteligentes, Portugal
2020/01/06 - Atual Presidente TecMinho Associação Universidade-Empresa para o Desenvolvimento, Portugal
TecMinho Associação Universidade-Empresa para o Desenvolvimento, Portugal
2019/12/11 - Atual Vice-Reitor Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho, Portugal
2011 - 2021 Diretor do Programa Doutoral em Bioengenharia Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2020/03 - 2020/12 Presidente Spinpark – Centro de Incubação de Base Tecnológica, Portugal
Spinpark – Centro de Incubação de Base Tecnológica, Portugal
2016/01/26 - 2020/01/26 Director de Unidade Orgânica Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2017/09 - 2019/12/31 Membro da Comissão Diretiva do curso de Mestrado em Bioinformática Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2017/04/06 - 2019/12/10 Membro do Conselho Geral Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho, Portugal
2013/01/01 - 2019/12/10 Conselho Científico Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2010/03/03 - 2013/05/03 Vice-Presidente da Unidade Orgânica Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2004/09 - 2010/10 Diretor do curso de Mestrado em Gestão Ambiental Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2001/09 - 2003/09 Diretor de Curso da Licenciatura em Engenharia Biológica Universidade do Minho, Portugal
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2022/10/01 - 2025/09/30 GIATEX - Intelligent Water Management at ITV
C644943052-00000050
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Agência para a Competitividade e Inovação IP
Em curso
2021/07/01 - 2023/06/30 PortAberta - Portal de Investigação para a Ciência Aberta
POCI-05-5762-FSE-000431
Investigador
Universidade do Minho, Portugal
 AMA - Agência para a Modernização Administrativa
Em curso
2021/07/01 - 2023/06/30 Portal da Inovação da Universidade do Minho
POCI-01-0246-FEDER-181310
Investigador responsável
Universidade do Minho, Portugal
 Agência Nacional de Inovação SA
Em curso
2021/01/01 - 2022/12/31 MarPlas - Evaluation and valorization of plastics and microplastics in marine environment
NORTE-01-0145-FEDER-000080
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2020/01/01 - 2022/12/31 PAMWater - Predictive and Analytic Models for the Optimization of Multi-municipal Water Systems / Modelos Analíticos e Predictivos para Optimização de Sistemas Multimunicipais de Água
DSAIPA/AI/0099/2019
Investigador
Universidade do Minho, Portugal

Universidade do Minho Centro ALGORITMI, Portugal

Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/07/01 - 2022/06/30 DEEPBIO - Machine learning and deep learning approaches to industrial biotechnology applications
NORTE-01-0247-FEDER-039831
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Silicolife Lda., Portugal

Universidade Nova de Lisboa, Portugal
Agência Nacional de Inovação SA
Em curso
2018/07/01 - 2021/06/30 AGeNT - Aerobic granule technology combined with selected microbial agents for the degradation of toxic wastewater pollutants / Tecnologia de grânulos aeróbios combinada com agentes microbianos selecionados para a degradação de poluentes tóxicos de águas residuais
PTDC/BTA-BTA/31264/2017
Investigador responsável
Universidade Católica Portuguesa, Portugal

Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/07/01 - 2021/06/30 Easy Ride - Experience is Everything
POCI-01-0247-FEDER-039334
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Agência para o Investimento e Comércio Externo de Portugal, E.P.E.

Agência Nacional de Inovação SA
Em curso
2017/01/01 - 2020/12/31 Biomass and Bioenergy Research Infrastructure
PINFRA/22059/2016
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Laboratório Nacional de Energia e Geologia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/10/01 - 2020/09/30 Programa Doutoral em Bioengenharia
NORTE-08-5369-FSE-000053
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2016/10/01 - 2020/09/30 Doctoral Program in Chemical and Biological Engineering
NORTE-08-5369-FSE-000052
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2017/01/01 - 2020/06/30 MultiBiorefinery - Multi-purpose strategies for broadband agro-forest and fisheries by-products valorisation: a step forward for a truly integrated biorefinery
SAICTPAC/0040/2015
Investigador responsável
Universidade de Aveiro, Portugal

Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica, Portugal

Universidade Católica Portuguesa, Portugal

Universidade do Minho, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/07/01 - 2020/06/30 BIOTECNORTE - Underpinning Biotechnology to foster the north of Portugal bioeconomy
NORTE-01-0145-FEDER-000004
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Comissao de Coordenacao e Desenvolvimento Regional do Norte
Em curso
2017/06/01 - 2020/05/31 Biodata.pt - Portuguese Biological Data Network
POCI-01-0145-FEDER-022231
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/03/01 - 2020/02/29 Bioinformatics Services for Data-Driven Design of Cell Factories and Communities
info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/686070/EU
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 UK Research and Innovation
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 Centre of Biological Engineering - University of Minho
UID/BIO/04469/2019
Universidade do Minho, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2016/01/01 - 2018/12/31 SISBI - Intelligent decision support system for Industrial Biotechnology
NORTE-01-0247-FEDER-003381
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Silicolife Lda., Portugal
Agência Nacional de Inovação SA
Concluído
2015/01/01 - 2018/12/31 Centre of Biological Engineering - University of Minho
UID/BIO/04469/2013
Universidade do Minho, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2015/04 - 2018/03 DYNAMICS: Analysis and optimization of industrial microorganisms under dynamic process conditions
Provided by PTCRIS: 138757
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2014/03 - 2017/02 DeYeast Library - Designer yeast strain library optimized for metabolic engineering applications
Provided by PTCRIS: 137211
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2016/03/01 - 2016/05/31 Genome-scale Constraint-based Modeling of Metabolic and Microbial Community Interactions
SFRH/BSAB/114310/2016
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2012/07/01 - 2015/06/30 PEM - Plataforma tecnológica de suporte à Engenharia Metabólica / Platform for Metabolic Engineering
23060
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Silicolife Lda., Portugal
Agência Nacional de Inovação SA
Concluído
2010/05 - 2015/04 CamCon - Campylobacter control - novel approaches in primary poultry production
244547
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 European Commission
Concluído
2010/10 - 2014/03 Study of the operation of SBRs for enhanced phosphorous removal and for PHA production by image analysis and multivariable statistical techniques
103147
Provided by PTCRIS: 103147
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2010/05 - 2013/11 SYNBIOBACTHER - Synthetic biology approaches to engineer "therapeutic" bacteria / Construção de bactérias "terapêuticas" usando uma abordagem de biologia sintética
102863
Provided by PTCRIS: 102863
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2010/04 - 2013/09 AshByofactory - Ashbya gossypii: a systems metabolic engineered cell factory / Ashbya gossypii: uma fábrica celular manipulada por engenharia metabólica de sistemas
Provided by PTCRIS: 101985
101985
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2010/04 - 2013/09 HeliSysBio - Molecular Systems Biology Helicobacter pylori / Biologia Molecular de Sistemas em Helicobacter pylori
Provided by PTCRIS: 104235
104235
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2009/04 - 2012/09 Bridging Systems and Synthetic Biology for the development of Improved Microbial Cell Factories
84035
Provided by PTCRIS: 84035
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2008/12 - 2011/11 Systems Biology as a Driver for Industrial Biotechnology
212766
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 European Commission
Concluído
2007/01 - 2010/01 SuperETAR: Supervision and Intelligent Control of Wastewater Treatment Plants
82686
Provided by PTCRIS: 82686
60141
Provided by PTCRIS: 60141
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/05 - 2008/10 PHAGEVET-P - Veterinary phage therapies as alternatives to antibiotics in poultry production
7224
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 European Commission
Concluído
2005/07 - 2008/06 MOBioPro-Nature-based computation in the modeling and optimization of biotechnological processes / Computação inspirada na natureza para a modelação e optimização de processos biotecnológicos
59899
Provided by PTCRIS: 59899
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/05 - 2008/06 recSysBio - A Systems Biology approach for optimization of recombinant fermentation processes
Provided by PTCRIS: 60139
60139
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/10 - 2008/03 Monitoring of a Wastewater Treatment Plant by Image Analysis Techniques
57069
Provided by PTCRIS: 57069
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
2005/01 - 2006/12 Online control of fixed-bed reactors applied to aerobic wastewater treatment
6647
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 European Commission
1998/07 - 2003/07 Optimal management of wastewater systems
2335
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 European Commission
Concluído
1997/12 - 2001/11 BioToBio - Biological Removal of Nitrogen: from Biofilms to Bioreactors
FMRX970114
Investigador
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
 European Commission
Concluído
1998/10/01 - 2001/09/01 Simulação Modular e Optimização Integrada de Processos Industriais
3/3.1/CEG/2641/95
Investigador responsável
Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
JNICT - Junta Nacional de Investigação Científica e Tecnológica
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Forte, Ana Cristina Figueiras; Dourado, Fernando; Gama, F. M.; Ferreira, Eugénio C.. "Economic & environmental assessment of bacterial cellulose production". 2021.
  2. Lima, Diogo Batista; Lagoa, Davide Rafael Santos; Cruz, Fernando João Pereira da; Bastos, José; Capela, João; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Miguel; Dias, Oscar. "merlin v4: an updated platform for reconstructing genome-scale metabolic models". 2020.
  3. Melo, A. R. B.; Padrão, Jorge; Nicolau, Ana; Quintelas, Cristina; Ferreira, Eugénio C.; Mesquita, D. P.. "Toxicity assessment of ibuprofen on activated sludge by respirometric technique". 2019.
  4. Ferreira, Eugénio C.. "Biotecnologia para o desenvolvimento sustentado da bioeconomia do Norte de Portugal". 2019.
  5. Paulo, Ana M. S.; Costa, Joana; Amorim, Catarina L.; Mesquita, Daniela P.; Ferreira, Eugénio C.; Castro, Paula M.L.; Costa, Joana Sofia Gomes; Mesquita, D. P.; Castro, Paula M. L.. "Impact of industrial wastewater on aerobic granules morphology and nitrification process in bioreactors". 2019.
  6. Quintelas, Cristina Maria Catalão; Melo, António Renê Benevides de; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.; Amaral, António Luís Pereira do. "Rapid method for the quantification and identification of emerging compounds in wastewater based in nir spectroscopy and chemometrics". 2019.
  7. Forte, Ana Cristina Figueiras; Dourado, Fernando; Gama, F. M.; Ferreira, Eugénio C.. "Life cycle assessment (cradle-to-gate) of bacterial cellulose production". 2019.
  8. Soares da Silva, F. A. G.; Dourado, Fernando; Ferreira, Eugénio C.; Poças, F.; Gama, F. M.. "Optimization of bacterial nanocellulose fermentation using lignocellulosic residues and development of novel BNC-starch composites". 2019.
  9. Forte, Ana; Dourado, Fernando; Gama, F. M.; Ferreira, Eugénio C.. "Cradle-to-gate assessment of bacterial cellulose production". 2019.
  10. Silva, Francisco Almeida Garrett Soares; Carvalho, Ricardo Emanuel Silva; Ferreira, Eugénio C.; Dourado, Fernando; Poças, Maria Fátima; Gama, F. M.. "Optimization of bacterial nanocellulose fermentation using lignocellulosic residues and development of novel BNC-starch composites". 2019.
  11. Leal, Cristiano; Val, Angeles; Zlatkova, Anastasiya; Araújo, Bárbara; Mesquita, D. P.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.. "Density and sludge volume index estimation in mature aerobic granular sludge by quantitative image analysis and chemometrics tools". 2018.
  12. Lagoa, D.; Liu, Filipe; Ferreira, Eugénio C.; Faria, J.; Henry, C.; Dias, Oscar. "Towards a genome-wide transport systems encoding genes tracker". 2018.
  13. Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.; Amaral, A. Luís. "Quantification of pharmaceuticals contaminants in wastewaters by NIR spectroscopy". 2018.
  14. Leal, Cristiano; Val, Angeles; Zlatkova, Anastasiya; Araújo, Bárbara; Mesquita, D. P.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.. "Density and sludge volume index estimation in mature aerobic granular sludge by quantitative image analysis and chemometrics tools". 2018.
  15. Lagoa, D.; Liu, Filipe; Ferreira, Eugénio C.; Faria, J.; Henry, C.; Dias, Oscar. "Towards a genome-wide transport systems encoding genes tracker". 2018.
  16. Ferreira, V.; Cortez, Susana; Padrão, Jorge; Mesquita, D. P.; Dias, Nicolina M.; Duarte, Maria Salomé; Ferreira, Eugénio C.; et al. "Impact of professional cleaning agent used in fish-canning industry in wastewater treatment". 2018.
  17. Ferreira, Eugénio C.. "CEB: Centro de Engenharia Biológica [da] Universidade do Minho". 2018.
  18. Santos, Sílvio Roberto Branco; Brandão, Ana Catarina; Oliveira, A.; Melo, Luís Daniel Rodrigues; Pinto, Graça; Oliveira, Hugo Alexandre Mendes; Ferreira, Eugénio C.; Azeredo, Joana. "New bacterial biorecognition elements from phage origin". 2017.
  19. Mesquita, D. P.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.. "Quantitative Image Analysis: a monitoring tool in wastewater treatment". 2017.
  20. Oliveira, Ana; Mesquita, D. P.; Amorim, Catarina L.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.; Van Loosdrecht, Mark; Castro, Paula M. L.. "Extraction and characterization of extracellular polymeric substances from aerobic granular sludge from a full-scale sequencing batch reactor in Portugal". 2017.
  21. Amaral, A. Luís; Genisheva, Zlatina; Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.; Oliveira, José Maria. "Wine chemical characterization by near infrared spectroscopy and chemometric analysis". 2017.
  22. Quintelas, Cristina Maria Catalão; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.. "Application of near infrared spectroscopy as a process analytical technology". 2017.
  23. Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.. "Removal of paracetamol by an activated sludge bioreactor". 2017.
  24. Mesquita, D. P.; Quintelas, Cristina; Ferreira, Eugénio C.. "Characterization of the effects of pharmaceuticals in activated sludge using quantitative image analysis". 2017.
  25. Oliveira, Emanuel; Ferreira, Eugénio C.; Dias, Oscar. "Modelling interspecies interactions of syntrophic communities". 2017.
  26. Oliveira, Ana; Mesquita, Daniela P.; Amorim, Catarina L.; Amaral, A. L.; Ferreira, Eugénio C.; Loosdrecht, Mark V.; Castro, Paula M. L.. "Extraction and characterization of extracellular polymeric substances from aerobic granular sludge from a full-scale sequencing batch reactor in Portugal". 2017.
  27. Oliveira, Ana; Mesquita, D. P.; Amorim, Catarina L.; Amaral, A. Luís; Ferreira, Eugénio C.; Van Loosdrecht, Mark; Castro, Paula M. L.. "Extraction and characterization of extracellular polymeric substances from aerobic granular sludge from a full-scale sequencing batch reactor in Portugal". 2017.
  28. Dias, Oscar; Santos, Sophia Torres; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "Towards an improved version of Kluyveromyces lactis genome-scale metabolic model". 2016.
  29. Quintelas, Cristina; Mesquita, D. P.; Ferreira, Eugénio C.. "Remoção de ibuprofeno por um sistema aeróbio de lamas ativadas". 2016.
  30. Sargo, Cíntia R .; Silva, Adilson J.; Giordano, Roberto C; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.; Zangirolami, Teresa C.. "Produção e consumo de acetato em cultivos de Salmonella typhimurium em condições aeróbias". 2015.
  31. Amaral, A. L.; Mesquita, D. P.; Braga, Adelaide; Belo, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evaluation of dimorphic Yarrowia lipolytica strains growth in different culture media by quantitative image analysis". 2015.
  32. Dias, Oscar; Saraiva, João; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, I.. "Towards a genome-scale metabolic model of the Streptococcus pneumoniae R6 avirulent strain". 2015.
  33. Santos, Sílvio Roberto Branco; Martins, Ivone M.; Costa, Ana Rita Martins; Nóbrega, Franklin Luzia; Lavigne, Rob; Ferreira, Eugénio C.; Azeredo, Joana. "Exploiting the proteins encoded in the genome of the broad host range Salmonella phage PVP-SE1". 2015.
  34. Quintelas, C.; Mesquita, D. P.; Lopes, João A.; Ferreira, Eugénio C.; Sousa, Clara Cecília Santana. "Near-infrared spectroscopy for the detection and quantification of bacterial contaminations in pharmaceutical products". 2015.
  35. Silva, A.; Sargo, Cintia Regina; Zangirolami, Teresa Cristina; Giordano, Roberto de Campos; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Metabolic profiling of secreted fermentative byproducts by Salmonella typhimurium". 2014.
  36. Portela, C.; Villas-Bôas, S.; Rocha, I.; Ferreira, E.C.. "Genome scale metabolic network reconstruction of the pathogen Enterococcus faecalis". 2013.
    10.3182/20131216-3-IN-2044.00067
  37. Ferreira, Eugénio C.. "Bio-engineering Systems at MIT Portugal Program". 2013.
  38. Soons, Z.I.T.A.; Ferreira, E.C.; Rocha, I.. "Selection of elementary modes for bioprocess control". 2010.
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  3. Maria Salomé Duarte; G. Martins; Pedro Oliveira; Bruno Fernandes; Eugénio C. Ferreira; M. Madalena Alves; Frederico Lopes; Pereira MA; Paulo Novais. "A Review of Computational Modeling in Wastewater Treatment Processes". ACS ES&T Water (2023): http://dx.doi.org/10.1021/acsestwater.3c00117.
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Artigo em revista (magazine)
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  2. E. C. Ferreira. "Nova Formação em Gestão Ambiental na Universidade do Minho", Ambiente Magazine, 2004, http://hdl.handle.net/1822/3487.
  3. E. C. Ferreira. "A Formação de Ambiente em Portugal", CentroAtlântico.pt Magazine, 2003, http://hdl.handle.net/1822/3441.
  4. E. C. Ferreira. "A Internet como Fonte de Informação para Engenharia", Engenharia e Construção, 1998
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Capítulo de livro
  1. Eugénio Campos Ferreira. "Publicação Científica, Ciência Aberta e Avaliação de Investigação — Breve Análise Crítica". 2023.
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  2. Quintelas, Cristina; Mesquita, Daniela; Ferreira, Eugénio Campos. "CHAPTER 2. Impact of Industrial Wastewater Discharge on the Environment and Human Health". In Biological Treatment of Industrial Wastewater, 15-39. Royal Society of Chemistry, 2021.
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  3. Ferreira, Eugénio C.. "Foreword". Sciendo, 2020.
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  15. Evangelista, Pedro; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Miguel. "Evolutionary Approaches for Strain Optimization Using Dynamic Models under a Metabolic Engineering Perspective". In Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics, 140-151. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-01184-9_13
  16. Costa, Rafael S.; Machado, Daniel; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Large Scale Dynamic Model Reconstruction for the Central Carbon Metabolism of Escherichia coli". In Distributed Computing, Artificial Intelligence, Bioinformatics, Soft Computing, and Ambient Assisted Living, 1079-1083. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-02481-8_163
  17. Valente, Eduardo; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Modelling of Biotechnological Processes – An Approach Based on Artificial Neural Networks". In Computational Intelligence Techniques for Bioprocess Modelling, Supervision and Control, 311-332. Springer Berlin Heidelberg, 2009.
    Publicado • 10.1007/978-3-642-01888-6_11
  18. R. Mendes; I. Rocha; J. P. Pinto; E. C. Ferreira; M. Rocha. "Differential evolution for the offline and online optimization of fed-batch fermentation processes". In Advances in Differential Evolution, 299-317. Vienna, Áustria: Springer, 2008.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-68830-3_13
  19. E. Herrera; B. Castillo; J. Ramírez; E. C. Ferreira. "Takagi-Sugeno Fuzzy Controller for a Switching Bioprocess: Sector Nonlinearity Approach". In New Developments in Robotics, Automation and Control, 155-180. Vienna, Áustria: In-Tech Education and Publishing, 2008.
    Publicado
  20. E. C. Ferreira; S. Feyo de Azevedo. "Modelação, monitorização e controlo de reactores biológicos". In Reactores Biológicos - Fundamentos e Aplicações, 193-230. Lisboa, Portugal: Lidel, 2007.
    Publicado
  21. Rocha, Miguel; Pinto, José P.; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evaluating Evolutionary Algorithms and Differential Evolution for the Online Optimization of Fermentation Processes". In Evolutionary Computation,Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics, 236-246. Alemanha: Springer Berlin Heidelberg, 2007.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-71783-6_23
  22. Rocha, Miguel; Mendes, Rui; Maia, Paulo; Pinto, José P.; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evaluating Simulated Annealing Algorithms in the Optimization of Bacterial Strains". In Progress in Artificial Intelligence, 473-484. Alemanha: Springer Berlin Heidelberg, 2007.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-77002-2_40
  23. Espírito-Santo, I. A. C. P.; Fernandes, Edite M. G. P.; Araújo, M. M.; Ferreira, E. C.. "How Wastewater Processes can be Optimized Using LOQO". In Lecture Notes in Economics and Mathematical Systems, 435-455. Springer-Verlag, 2006.
    Publicado • 10.1007/3-540-28258-0_26
  24. A. C. Veloso; I. Rocha; E. C. Ferreira. "Identification of yield coefficients in an E. coli model - An optimal experimental design using genetic algorithms". In Computer Applications in Biotechnology, 43-48. London: Elsevier, 2005.
    Publicado
  25. Rocha, Miguel; Neves, José; Veloso, Ana C.A.; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Isabel. "Evolutionary Algorithms for Static and Dynamic Optimization of Fed-batch Fermentation Processes". In Adaptive and Natural Computing Algorithms, 288-291. Springer-Verlag, 2005.
    10.1007/3-211-27389-1_69
  26. Rocha, Miguel; Neves, José; Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. "Evolutionary Algorithms for Optimal Control in Fed-Batch Fermentation Processes". In Applications of Evolutionary Computing, 84-93. Springer Berlin Heidelberg, 2004.
    Publicado • 10.1007/978-3-540-24653-4_9
  27. E. C. Ferreira; J. A. Teixeira. "Biorreactores". In Biotecnologia: Fundamentos e Aplicações, 165-194. Lisboa, Portugal: Lidel Edições Técnicas, 2003.
    Publicado
  28. I. Rocha; E. C. Ferreira. "An integrated system for advanced monitoring and control of fed-batch fermentations of recombinant E. coli". In Computer Applications in Biotechnology, 349-354. Oxford: Pergamon Press, 2002.
    Publicado
  29. M. da Motta; A. L. Amaral; M. Casellas; M. N. Pons; C. Dagot; N. Roche; E. C. Ferreira; H. Vivier. "Characterisation of Activated Sludge By Automated Image Analysis: Validation on Full-Scale Plants". In Computer Applications in Biotechnology, 427-431. Oxford: Pergamon Press, 2002.
    Publicado
  30. E. C. Ferreira; M. Mota; M. N. Pons; J. M. S. Cabral; J. Tramper. "Image Analysis and Multiphase Bioreactors". In Multiphase Bioreactor Design, 25-52. London, Reino Unido: Taylor & Francis, 2001.
    Publicado
  31. S. Feyo de Azevedo; P. Pimenta; F. R. Oliveira; E. C. Ferreira. "Computer-Based Studies on Bioprocess Engineering, II - Tools for Process Operation". In Computer and Information Science Applications in Bioprocess Engineering, 27-49. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1996.
    Publicado
  32. R. Oliveira; E. C. Ferreira; S. Feyo de Azevedo. "Model-based estimation of reaction rates in stirred tank bioreactors". In Computer Applications in Biotechnology, 259-263. Oxford: Elsevier Science Publishers, 1996.
    Publicado
  33. S. Feyo de Azevedo; P. Pimenta; F. R. Oliveira; E. C. Ferreira; de Azevedo, S.Feyo; Pimenta, P.; Oliveira, F.; Ferreira, E.. "Studies on on-line state and parameter estimation through a real-time process simulator". In Modeling and Control of Biotechnical Processes 1992 (2nd IFAC Symposium) and Computer Applications to Fermentation Technology (5th International Conference), 453-458. Oxford: Pergamon Press, 1992.
    Publicado
  34. E. C. Ferreira; J. C. Duarte. "Dynamic modelling of complex enzymatic reactions". In Scientific Computing and Automation (Europe) 1990, 211-220. Amsterdam: Elsevier Science Publishers, 1990.
    Publicado
  35. Ferreira, E.C.; Duarte, J.C.. "Chapter 18 Dynamic Modelling of Complex Enzymatic Reactions". In Data Handling in Science and Technology, 211-220. Amsterdam: Elsevier, 1990.
    Publicado • 10.1016/S0922-3487(08)70168-0
  36. E. C. Ferreira; L. M. Pereira; S. Feyo de Azevedo; J. C. Duarte. "Parameter estimation of kinetics and modelling in methanogenic fermentation of Methanosarcina barkeri". In Computer Applications in Fermentation Technology: Modelling and Control of Biotechnological Processes, 217-220. London, Reino Unido: Elsevier Applied Science Publishers, 1989.
    Publicado
Edição de livro
  1. E. C. Ferreira. BOOK OF ABSTRACTS OF CEB ANNUAL MEETING 2017. Braga, Portugal: Universidade do Minho. 2017.
    Publicado • 10.21814/cebsam2017 • Editor
  2. E. C. Ferreira. Metabolic Pathway Analysis 2015 - Programme and Abstracts. Braga, Portugal. 2015.
    Publicado • Editor
  3. E. C. Ferreira. Book of Abstracts of the 2nd Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering. Braga, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2010.
    Publicado • Editor
  4. Teixeira, J.A.; Sanches, I.; Ferreira, E.C.; Fonseca, A.; Vicente, A.A.; Venâncio, A.; Oliveira, D.; et al. Book of Abstracts of MICROBIOTEC09. Braga; Vilamoura, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2009.
    Publicado • Editor
  5. Ferreira, E.C.; Mota, M.. Book of Abstracts of the 10th International Chemical and Biological Engineering Conference - CHEMPOR 2008. Braga: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2008.
    Publicado • Editor
  6. E. C. Ferreira. Proceedings of the 10th International Chemical and Biological Engineering Conference - CHEMPOR 2008 (CD-ROM). Braga, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2008.
    Publicado • Editor
  7. E. C. Ferreira. Engenharia Biológica – 20 Anos (1986-2006). Braga, Portugal: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica. 2006.
    Publicado
  8. E. C. Ferreira; M. Mota. BIOTEC'98 - Book of Abstracts (IV Iberian Congress on Biotechnology, I Ibero-American Meeting on Biotechnology). Braga, Portugal: Universidade do Minho. Departamento de Engenharia Biológica. 1998.
  9. E. C. Ferreira; S. Feyo de Azevedo; K. Ch. A. M. Luyben; P. Osseweijer. Proceedings of the 2nd European Symposium on Biochemical Engineering Science. Porto, Portugal: Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto. 1998.
    Publicado • Editor
Livro
  1. Ferreira, Eugénio C.; Sessão Comemorativa "20 anos da Licenciatura em Engenharia Biológica da Universidade do Minho", Braga, 2006. Passado, presente e futuro da Engenharia Biológica. Universidade do Minho. Departamento de Engenharia Biológica (DEB). 2006.
  2. E. C. Ferreira; E. Rodrigues. Fontes de Informação em Ambiente. Famalicão, Portugal: Edições Centro Atlântico. 2002.
    Publicado
Relatório
  1. Ferreira, Eugénio C.; Araújo, Emília Rodrigues; Ramos, Isabel; Gomes, Manuela E.; Maciel, P.; Jerónimo, Patrícia; Ramada, José António Seara Salgado; Isaías, Margarida. 2021. Proposta de plano para a igualdade de género da Universidade do Minho (IGUM 2022-2024). http://hdl.handle.net/1822/75031.
  2. Reis, R. L.; Rodrigues, Eloy; Ferreira, Eugénio C.; Palha, Joana Almeida; González-Méijome, José Manuel; Gomes, Manuela E.; Gonçalves, Miguel M.; et al. 2017. Estratégia institucional para a gestão dos dados de investigação: estudo e recomendações. http://hdl.handle.net/1822/63930.
Resumo em conferência
  1. S. Carneiro; P: Maia; M. Rocha; E. C. Ferreira; I. Rocha. "Constraint-based approach for in silico Escherichia coli combined regulatory/metabolic modelling". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  2. J. C. Costa; I. Moita; A. A. Abreu; E. C. Ferreira; M. M. Alves. "Use of morphological and physiological information to identify changes in anaerobic granular sludge during organic overloads". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  3. R. S. Costa; S. Carneiro; I. Rocha; E. C. Ferreira. "Effect of pH variation on the acetate “switch” and biomass growth in an Escherichia coli aerobic fermentation: global gene expression profiles analysis". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  4. A. Lourenço; A. Simões; J. J. Almeida; M. Rocha; I. Rocha; E. C. Ferreira. "Literature mining applied to systems biology information retrieval". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  5. D. P. Mesquita; O. Dias; E. C. Ferreira; A. L. Amaral. "Monitoring activated sludge systems from wastewater treatment plants: automated image analysis procedures and their relation with operating parameters". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  6. A. Nicolau; S. Santos; C. Carvalho; E. C. Ferreira; J. Azeredo. "Pitfalls and successes in phage therapy: the involvement of the UMinho Team in the European Project Phagevet-P". Trabalho apresentado em Congresso Micro '07 - Biotec '07 - XXIII JPG, Lisboa, 2007.
    Publicado
  7. P. Pimenta; S. Feyo de Azevedo; E. C. Ferreira; F. R. Oliveira. "Model-based identification and control on baker's yeast fed-batch fermentation". Trabalho apresentado em 6th European Congress on Biotechnology, Firenze, 1993.
    Publicado
Tese / Dissertação
  1. Fonseca, André Paço da. "A digital image based method to quantify intracellular polyphosphates in microbial aggregates". Mestrado, 2018. http://hdl.handle.net/1822/66151.
  2. Mota, Elisiária Maria Dias da. "Segurança no trabalho: riscos ambientais". Mestrado, 2017. http://hdl.handle.net/1822/54741.
  3. Miragaia, Ricardo Júdice. "Immune tolerance dissected by single-cell transcriptomics". Doutoramento, 2017. http://hdl.handle.net/1822/48631.
  4. Oliveira, Daniel Filipe Braga de. "Plataforma online para caracterizar comunidades microbianas de estações de tratamento de água e efluentes". Mestrado, 2017. http://hdl.handle.net/1822/57384.
  5. Souto, Maria Amélia Moreira. "Implementação do referencial BRC Food Safety versão 7 numa empresa transformadora de carne". Mestrado, 2016. http://hdl.handle.net/1822/47435.

Outros

Outra produção
  1. BioISO: an objective-oriented application for assisting the curation of genome-scale metabolic models. 2021. Fernando Cruz; João Capela; Eugénio C. Ferreira; Miguel Rocha; Oscar Dias. https://doi.org/10.1101/2021.03.07.434259.
    10.1101/2021.03.07.434259
  2. El título de ingeniero químico en el espacio europeo de educación superior. I Workshop de Ingeniería Química. 2013. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59530.
  3. A Comunidade do CEB no RepositóriUM. Intervenção convidada proferida por ocasião do 10º Aniversário do RepositóriUM. 2013. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59528.
  4. A Indústria Química Portuguesa. 12as Jornadas de Engenharia Química da Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto. 2012. Ferreira, Eugénio C.; Araújo, Luís. http://hdl.handle.net/1822/59531.
  5. Biologia de Sistemas para o desenvolvimento de fábricas celulares microbianas. Palestra no CTBE Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol. 2011. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59524.
  6. Biotecnologia. Introdução, Editorial. 2007. E. C. Ferreira.
  7. A alternativa energética. Introdução, Editorial. 2007. E. C. Ferreira.
  8. Potencial da Biotecnologia na Região. Palestra convidada no âmbito do seminário Vale do Ave, região do Conhecimento: Perspectivas e Realidades. 2007. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59548.
  9. Eco-Eficiência e Sustentabilidade Empresarial. Palestra para dirigentes de topo de empresas participantes no Projeto Valor Humano - Qualificação Avançada de Recursos Humanos. 2007. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59552.
  10. The BioProcess Systems Engineering group (BioPSEg) @ The Institute for Biotechnology and Bioengineering. Palestra convidada no Centro de Investigación y Asistencia en Tecnología y Diseño del Estado de Jalisco (CIATEJ). 2007. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59544.
  11. Specific growth rate regulation in a fed-batch E. coli fermentation. Invested Lecture at Automatic Control Unit of Cinvestav - Centro de Investigación y Estudios Avanzados. 2007. Rocha, Isabel; Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59534.
  12. Parabéns EQ!. Introdução, Editorial. 2006. E. C. Ferreira.
  13. Propostas de Leitura. Introdução, Editorial. 2006. E. C. Ferreira.
  14. A Pensar nos Leitores. Introdução, Editorial. 2005. E. C. Ferreira.
  15. Tendências Recentes no Ensino da Engenharia Química. 4º Encontro da Associação para o Ensino de Laboratórios de Engenharia Química. 2005. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59554.
  16. Image analysis applications in biological wastewater treatment processes. Palestra na Gheorge Asachi Technical University of Iasi, Faculdade de Química Industrial. 2005. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59532.
  17. Formação em Ambiente no Ensino Superior. 1.º Fórum Nacional de Estudantes de Engenharia do Ambiente. 2004. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59543.
  18. A Engenharia de Sistemas Processuais em Biotecnologia, Química e Ambiente. 2.º Workshop Anual de Engenharia de Processos e Sistemas. 2004. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59545.
  19. Proposta de reformulação do plano de estudos da Licenciatura em Engenharia Biológica da Universidade do Minho. VI Jornadas de Engenharia Biológica e IV Encontro de Jovens Biotecnólogos. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59458.
  20. Tratamento de efluentes por via anaeróbia. Palestra no Laboratório de Saneamento Ambiental do Departamento de Engenharia Civil da Universidade Federal de Pernambuco. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59457.
  21. Application of image analysis techniques in environmental biotechnology. IV Curso Internacional de Biotecnologia Industrial Tópicos de Biotecnologia Ambiental. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/58773.
  22. Análise de Imagem e Biotecnologia. Palestra no Departamento de Engenharia Química da Universidade Federal de Pernambuco. 2003. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59460.
  23. Tratamentos biológicos de efluentes e emissões gasosas. Semana Universidade Empresas: Como Valorizar a Inovação, Painel "Novas Oportunidades de Negócio A Bio-Economia. 2002. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/58695.
  24. Fontes de informação para ambiente. Acção de Formação em Qualidade e Ambiente no âmbito do Programa Operacional Emprego, Formação e Desenvolvimento Social Região Norte, Medida 3.3.1.4 Especialização Profissional de Quadros Superiores Desempregados. 2001. Ferreira, Eugénio C.. http://hdl.handle.net/1822/59088.
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2017/10 - 2022 The role of extracellular polymeric substances during the biodegradation of contaminants.
Coorientador de Antônio Renê Benevides de Melo
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2013/10/01 - 2017/09/23 Immune Tolerance Dissected by Single-Cell Transcriptomics
Coorientador de Ricardo Júdice Miragaia
 Bioengenharia (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2017/01 - 2017/06/12 Segurança no trabalho - Riscos ambientais
Orientador de Elisiária Maria Dias da Mota
 Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2017/01 - 2017/05/31 Desenvolvimentos em engenharia de produto de cremes abrasivos e produtos de detergência
Orientador de Cristina da Silva Rodriguez
 Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2016/10 - 2017/02/27 Plataforma online para caracterizar comunidades microbianas de estações de tratamento de água e efluentes
Orientador de Daniel Filipe Braga de Oliveira
 Bioinformática (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2016/01 - 2016/12/12 Implementação do referencial BRC food safety versão 7 numa empresa transformadora de carne
Orientador de Maria Amélia Moreira Souto
 Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2014/01 - 2014/12/04 Implementação de um Sistema de Gestão da Qualidade e Segurança Alimentar numa adega de vinhos verdes segundo os referenciais ISO 9001:2008, ISO 22000:2005 e BRC Food Issue 6
Orientador de Mariana Isabel Pimentel Antunes
 Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2014 - 2014/11/20 Image analysis of Saccharomyces cerevisiae cells : development of a plugin for IMAGEJ
Orientador de Vitor Damião Baixinho da Silva
 Bioinformática (Mestrado)
Universidade do Minho, Portugal
2009/01 - 2013/12/11 In vivo metabolic pathway analysis of Enterococcus faecalis for uncovering key pathogenicity factors
Coorientador de Carla Andreia Freixo Portela
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2009/01 - 2013/06/25 Reconstruction of the Genome-scale Metabolic Network of Kluyveromyces lactis
Orientador de Óscar Manuel Lima Dias
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2008/11 - 2012/01/23 Novel modeling formalisms and simulation tools in Computational Biosystems
Orientador de Carlos Daniel Moutinho Machado
 Bioengenharia (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/01 - 2011/12/21 Systems analysis and metabolic network modeling in Escherichia coli
Orientador de Rafael Sousa Costa
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/11 - 2011/03/24 Image analysis and chemometric techniques as monitoring tools to characterize aggregated and filamentous organisms in activated sludge processes
Orientador de Daniela Patrícia Bernardino Mesquita
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/01 - 2010/12/30 A Systems Biology approach for the characterization of metabolic bottlenecks in recombinant protein production processes
Orientador de Sónia Madalena Azevedo Carneiro
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
2006/11 - 2010/12/10 Characterization of a salmonella phage using omic tools and mathematical models to predict host-phage interaction
Orientador de Sílvio Roberto Branco dos Santos
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2004/04 - 2008/11/07 Supervision of Transient Anaerobic Granular Sludge Process Through Quantitive Image Analysis and Multivariate Statistical Techniques
Orientador de José Carlos Gomes da Costa
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2001/01 - 2008/02/26 Sistemas Inteligentes para Monitorização e Controlo de Processos Integrados de Tratamento Biológico de Efluentes
Orientador de Olga Cristina Pereira Pires
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2001/10 - 2007/02/12 Optimização de Estratégias de Alimentação para a Identificação de Parâmetros de um Modelo de E.coli. Utilização do Modelo em Monitorização e Controlo
Orientador de Ana Cristina Araújo Veloso
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
2003 - 2006/07/07 Técnicas de Análise de Imagem no Monitoramento de Sistemas de Tratamento por Lodos Activos
Coorientador de Yovanka Pérez Ginoris
 Tecnologia de Processos Químicos e Bioquímicos (Doutoramento)
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Brasil
1999/10 - 2003/09/29 Image Analysis in Biotechnological Processes: Applications to Wastewater Treatment
Orientador de António Luís Pereira do Amaral
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal
1998/04 - 2003/04/17 Model-based Strategies for Computer-Aided Operation of Recombinant E. coli Fermentation
Orientador de Isabel Cristina de Almeida Pereira da Rocha
 Engenharia Química e Biológica (Doutoramento)
Universidade do Minho, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2023 - 2023 CHEMPOR 2023 - 3th International Chemical and Biological Engineering Conference (2023 - 2023)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2023 - 2023 CISPEE 2023 - 5th International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education (2023 - 2023)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2021 - 2021 MicroBiotec 2021 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology (2021 - 2021)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2021 - 2021 ICEER 2021 - The 8th International Conference on Energy and Environment Research (2021 - 2021)
Congresso (Membro da Comissão Científica)
2017/07/06 - 2017/07/06 CEB Scientific Annual Meeting 2017, Braga, Conference Chair (2017/07/06 - 2017/07/06)
Encontro (Presidente da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2017 - 2017 CEB Talk 2017, GNRation, Braga (2017/11/23 - 2017/11/23)
Mesa-redonda (Presidente da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2016/07/06 - 2016/07/06 Sessão “Biotecnologia para uma Bioeconomia Sustentável” no CIÊNCIA’16 – Encontro com a Ciência e Tecnologia em Portugal, Lisboa (2016/07/06 - 2016/07/06)
Seminário (Coorganizador)
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
2016/06/30 - 2016/06/30 2016 MIT Portugal Annual Conference, Braga, Conference Chair (2016/06/30 - 2016/06/30)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal
2015/06/08 - 2015/06/12 MPA2015 - Metabolic Pathway Analysis, Braga (2015/06/08 - 2015/06/12)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal
2012 - 2012 “As Engenharias Química e Biológica - Que Futuro?”, Porto (2012/02/10 - 2012/02/10)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
 Ordem dos Engenheiros, Portugal
2011/01/01 - 2011/09/07 CHEMPOR 2011 - 11th International Chemical and Biological Engineering Conference, Caparica (2011/09/05 - 2011/09/07)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade Nova de Lisboa, Portugal
2011/01/01 - 2011/06/06 5th Annual Workshop on the Business-Government Interface: Systems and Synthetic Biology, Braga (2011/06/06 - 2011/06/06)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2010/01/01 - 2010/11/06 XVIII Congresso da Ordem dos Engenheiros - “A Engenharia no Século XXI - Qualificação – Inovação – Empreendedorismo”, Aveiro (2010/11/04 - 2010/11/06)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
 Ordem dos Engenheiros, Portugal
2010/01/01 - 2010/10/24 2nd Meeting of the Institute for Biotechnology and Bioengineering. Braga - www.ceb.uminho.pt/2nd_Meeting_IBB (2010/10/23 - 2010/10/24)
Encontro (Coorganizador)
 Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
2008/10/01 - 2009/11/30 MicroBiotec09. Vilamoura, Portugal - www.deb.uminho.pt/microbiotec09 (2009/11/28 - 2009/11/30)
Congresso (Coorganizador)
 Sociedade Portuguesa de Biotecnologia, Portugal
2007/01/01 - 2008/12/31 CHEMPOR 2008 - 10 th International Chemical Engineering Conference, Braga, Conference Chair - www.deb.uminho.pt/chempor2008 (2008/09/04 - 2008/09/06)
Conferência (Presidente da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal
2008/07/11 - 2008/07/11 Session “Nonlinear Control and Estimation in Bioprocesses” at 17th Triennial World Congress of the International Federation of Automatic Control (IFAC) (2008/07/11 - 2008/07/11)
Seminário (Coorganizador)
 International Federation of Automatic Control, Áustria
2008/01/01 - 2008/05/31 Semana da Biotecnologia, Braga: eventos “Encontros para a Competitividade: prioridades para a indústria da biotecnologia”; “BioEmpreenda’08 – Feira de Ideias e Financiamento para o sector das biotecnologias”; “Seminário Caminhos para a Inovação – o bioempreendedorismo”; apresentação do estudo ‘Global Entrepreneurship Monitor Portugal 2007’; Industrial Biotech Forum; Exposição ‘Dispositivos Médicos’; Conferência ’Estratégias de eficiência colectiva no sector agro-alimentar da região do Norte’; Workshop on Medical Devices. (2008/05/26 - 2008/05/31)
Exposição (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho, Portugal
2006/09/01 - 2007/07/27 REV 2007 - International Conference Remote Engineering and Virtual Instrumentation, Porto (2007/06/25 - 2007/06/27)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
2007 - 2007 Workshop “Introdução ao REACH – Registration, Evaluation, Authorization and Restriction of Chemicals”, Lisboa (2007/12/05 - 2007/12/05)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
 Ordem dos Engenheiros, Portugal
2006 - 2006 Comemorações dos 20 anos do curso de Engenharia Biológica, Braga, - www.deb.uminho.pt/20anos (2006/10/20 - 2006/10/21)
Outro (Presidente da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho Departamento de Engenharia Biológica, Portugal
2004/09/01 - 2005/09/18 CHEMPOR 2005 - 9th International Chemical Engineering Conference, Coimbra (2005/09/14 - 2005/09/18)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Coimbra, Portugal

Ordem dos Engenheiros, Portugal
2005 - 2005 Special session "Natural-computing Algorithms to Modeling and Optimization of Bioprocesses" (NAMOB-2005) at 7th International Conference on Adaptive and Natural Computing Algorithms (ICANNGA), Coimbra (2005/03/21 - 2005/03/21)
Seminário (Coorganizador)
 Universidade de Coimbra, Portugal
2003/06/01 - 2004/09/30 CAC-2004 - 9th Chemometrics in Analytical Chemistry Conference, Lisboa (2004/09/20 - 2004/09/23)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2003/01/01 - 2004/05/31 ESCAPE-14 - European Symposium on Computer Aided Process Engineering, Lisboa - www.deb.uminho.pt/escape14 (2004/05/16 - 2004/05/19)
Simpósio (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
1999/06/01 - 2000/10/10 CONTROLO’2000 - 4th Portuguese Conference on Automatic Control, Guimarães - www.deb.uminho.pt/controlo2000 (2000/10/06 - 2000/10/09)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade do Minho Escola de Engenharia, Portugal
1997/06/01 - 1998/09/19 ESBES2 - 2nd European Symposium on Biochemical Engineering Science. Porto - www.deb.uminho.pt/esbes2 (1998/09/16 - 1998/09/19)
Simpósio (Coorganizador)
 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal
1997/01/01 - 1998/07/31 BIOTEC'98 - IV Iberian Congress on Biotechnology, I Ibero-American Meeting on Biotechnology Guimarães - www.deb.uminho.pt/biotec98 (1998/07/12 - 1998/07/15)
Congresso (Coorganizador)
 Universidade do Minho Centro de Engenharia Biológica, Portugal
1996/03/01 - 1996/09 2nd General Meeting of Network in Chemical Process Control (Human Capital and Mobility Program), Porto (1996/09/27 - 1996/09/28)
Encontro (Coorganizador)
 Universidade do Porto Faculdade de Engenharia, Portugal

Arbitragem científica em conferência

Nome da conferência Local da conferência
2020/09/14 - 2020/09/18 CISPEE 2020 - 4th International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education Porto
2020/01/01 - 2020/09/18 ICEER 2020 - The 7th International Conference on Energy and Environment Research
2019/12/05 - 2019/12/07 MicroBiotec’19 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Universidade de Coimbra
2019/10/14 - 2019/10/19 FOSBE 2019 - 8th International Conference Foundations of Systems Biology in Engineering Valencia
2019/07/22 - 2019/07/25 ICEER 2019 - The 6th International Conference on Energy and Environment Research Universidade de Aveiro
2018/07/27 - 2018/07/29 CISPEE 2018 - 3rd International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education Aveiro
2018/07/23 - 2018/07/27 ICEER 2018 - The 5th International Conference on Energy and Environment Research Praga, Czech Republic
2017/12/07 - 2017/12/09 MicroBiotec’17 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Universidade Católica Portuguesa, Porto
2017/06/17 - 2017/06/20 ICEER 2017 - The 4th International Conference on Energy and Environment Research Porto
2016/10/20 - 2016/10/21 CISPEE 2016 - 2nd International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education: Thinking Higher Engineering Education UTAD, Vila Real
2016/06/30 - 2016/06/30 2016 MIT Portugal Annual Conference Universidade do Minho, Braga
2016/06/05 - 2016/06/08 Bio.Iberoamérica 2016 Salamanca, Spain
2015/12/10 - 2015/12/12 MicroBiotec’15 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Évora, Portugal
2015/11/10 - 2015/11/13 AD14 - 14th World Congress on Anaerobic Digestion Viña del Mar, Chile
2015/06/08 - 2015/06/12 MPA2015 - Metabolic Pathway Analysis Braga
2015/06/09 - 2015/06/09 5th MIT Portugal Program Conference - Light: Designed by Nature, Transformed by Science Lisboa
2014/09/10 - 2014/09/12 CHEMPOR 2014 - 12th International Chemical and Biological Engineering Conference Porto
2014/06/27 - 2014/06/27 4th MIT Portugal Program Conference - New Frontiers for a Sustainable Prosperity Coimbra
2014/02/26 - 2014/02/28 REV 2014 - 11th International Conference on Remote Engineering and Virtual Instrumentation Porto, Portugal
2013/12/16 - 2013/12/18 CAB 2013 - 12th International IFAC Symposium on Computer Applications in Biotechnology Mumbai, India
2013/12/06 - 2013/12/08 MicroBiotec’13 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Aveiro
2013/10/31 - 2013/11/01 CISPEE 2013 - 1st International Conference of the Portuguese Society for Engineering Education Porto (ISEP)
2012/09/26 - 2012/09/27 EES 2012 - 1st International Conference on Energy, Environment and Sustainability Porto (ISEP)
2011/12/01 - 2011/12/03 MicroBiotec’11 - Portuguese Congress of Microbiology and Biotechnology Universidade do Minho, Braga

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2020 - Atual Frontiers in Chemical Engineering (2673-2718) Frontiers Media S.A.
2015 - Atual Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (2296-4185) Frontiers Media S.A.
2014 - Atual Procedia Environmental Science, Engineering and Management National Society of Environmental Science and Engineering (Roménia)
2011/09/28 - Atual Brazilian Journal of Chemical Engineering Springer
2008/07/01 - Atual Chemical Product and Process Modeling De Gruyter
2005/09/01 - Atual Engenharia Química - Indústria, Ciência e Tecnologia Publindústria
2004/10/01 - Atual Environmental Engineering and Management Journal
2012/01/02 - 2022/03/31 BioMed Research International Hindawi

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria 		Instituição / Organização Entidade financiadora
2017 - 2020 Coordinator of the review panel for PhD fellowships in Bioengineering and Biotechnology
Avaliador
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2020/03 - 2020/07 Controlo e Instrumentation de Processos / Process Control and Instrumentation Engenharia Biológica (Mestrado integrado) Universidade do Minho, Portugal

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2005/01 - Atual ESBES - European Society of Biochemical Engineering Sciences National Delegate to the Technical Committee on Modelling, Monitoring, Measurement, and Control
2004/01 - Atual Associação Portuguesa de Engenharia Sanitária e Ambiental
2000/01 - Atual IWA - International Water Association
1998/06 - Atual Associação Portuguesa de Controlo Automático
1998/01 - Atual Federação Europeia de Biotecnologia
1995/01 - Atual IFAC - International Federation of Automatic Control National Delegate to the Technical Committee on Biosystems and Bioprocesses
1986/09 - Atual Ordem dos Engenheiros
2004/01 - 2019/12 Sociedade Portuguesa de Biotecnologia Secretário-Geral
2010/03 - 2013/04 Ordem dos Engenheiros Presidente do Conselho Nacional do Colégio de Engenharia Química e Biológica
2004/01 - 2010/03 Ordem dos Engenheiros
2002/01 - 2007/12 International Association of Science and Technology for Development
1999/01 - 2004/12 Society for Industrial Microbiology.
2000/01 - 2003/12 Sociedade Portuguesa de Biotecnologia
1993/01 - 2002/12 SCI - Society of Chemical Industry

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2018 - Atual Committee on Publication Ethics
Membro
 Committee on Publication Ethics, Reino Unido

Outro júri / avaliação

Descrição da atividade Instituição / Organização
2020/05/11 - 2020/05/11 Vogal do Júri do Concurso Documental para para recrutamento de um Professor Associado, de área disciplinar de Biomedicina, Edital n.º 1603/2019, de 27 de dezembro Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2020/05/11 - 2020/05/11 Vogal do Júri do Concurso Documental para para recrutamento de um Professor Associado, de área disciplinar de Bioquímica, Edital n.º 1639-S/2019, de 30 de dezembro Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Distinções

Título

2017 Membro Conselheiro
Ordem dos Engenheiros, Portugal

Outra distinção

2020 Medalha de Mérito Municipal
Câmara Municipal de Esposende, Portugal
2004 Melhor Tese de Doutoramento no país em Engenharia Química e Biológica (Orientador)
Companhia União Fabril Consultadoria e Serviços SA, Portugal