Daniela Kalafatovic (FD14-4381-F819)

Curriculum Vitae

Daniela Kalafatovic

Daniela Kalafatovic completed her PhD in Pure and applied chemistry in 2015 by University of Strathclyde and obtained her Laurea in Pharmaceutical Chemistry and Technology in 2010 by Università degli Studi di Trieste. Currently, she is Assistant Professor at University of Rijeka (Croatia), Department of Biotechnology . She published 8 articles in journals.

Identificação

Identificação pessoal

Nome completo: Daniela Kalafatovic

Nomes de citação

Kalafatovic, Daniela

Identificadores de autor

Ciência ID: FD14-4381-F819
ORCID iD: 0000-0002-9685-1162

Domínios de atuação

Ciências Exatas - Química - Química Física

Idiomas

Idioma	Conversação	Leitura	Escrita	Compreensão	Peer-review
Croata (Idioma materno)
Italiano (Idioma materno)
Inglês	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)	Utilizador proficiente (C2)
Espanhol; Castelhano	Utilizador independente (B1)	Utilizador independente (B2)	Utilizador elementar (A2)

Formação

	Grau	Classificação
2015 Concluído	Pure and applied chemistry (Doctor of Philosophy) University of Strathclyde, Reino Unido "Enzyme responsive nanomaterials for cancer applications" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2010 Concluído	Pharmaceutical Chemistry and Technology (Laurea) Università degli Studi di Trieste, Itália

Percurso profissional

Ciência

	Categoria Profissional Instituição de acolhimento	Empregador
2019/08/01 - Atual	Investigador principal (carreira) (Investigação)	University of Rijeka, Department of Biotechnology , Croácia

2016/03/09 - 2018/03/31	Pós-doutorado (Investigação)	Institut de Recerca Biomèdica, Espanha

2015/02/01 - 2016/02/01	Pós-doutorado (Investigação)	CUNY Advanced Science Research Center, Estados Unidos

2011/01/11 - 2014/06/30	Estagiário de Investigação (Investigação)	University of Strathclyde, Reino Unido

Projetos

Bolsa

	Designação	Financiadores
2020/02/01 - 2025/01/31	Design of short catalytic peptides and peptide assemblies UIP-2019-04-7999 Investigador responsável University of Rijeka, Department of Biotechnology , Croácia	Hrvatska Zaklada za Znanost Em curso
2020 - 2024	A COMPUTATIONAL MODEL OF FLOW, FLOODING AND POLLUTION DISPERSION IN RIVERS AND COASTAL MARINE AREAS KK.05.1.1.02.0017 Investigador Sveuciliste u Rijeci Tehnicki Fakultetu, Croácia Sveucili¿te u Rijeci, Croácia	European Regional Development Fund Em curso
2020 - 2021	SARS-COV-2 SUPRAMOLECULAR MIMETICS FOR DISCOVERY OF PEPTIDES THAT INDUCE VIRAL ENTRAPMENT Cov-01 Investigador responsável University of Rijeka, Department of Biotechnology , Croácia	Sveucili¿te u Rijeci Concluído
2013/04 - 2018/04	IRB Barcelona International Postdoctoral Programme 2.0 600404	European Commission

Produções

Publicações

Artigo em revista

Otovic, Erik; Njirjak, Marko; Kalafatovic, Daniela; Mausa, Goran. Autor correspondente: Mausa, Goran. "Sequential properties representation scheme for recurrent neural network based prediction of therapeutic peptides". Journal of Chemical Information and Modeling (2022):
Em revisão
Erjavac, Ivan; Kalafatovic, Daniela; Mausa, Goran. Autor correspondente: Mausa, Goran. "Coupled encoding methods for antimicrobial peptide prediction". Artificial Intelligence in the Life Sciences (2022):
Em revisão
Pina, Ana S.; Morgado, Leonor; Duncan, Krystyna L.; Carvalho, Sara; Carvalho, Henrique F.; Barbosa, Arménio J. M.; de P. Mariz, Beatriz; et al. "Discovery of phosphotyrosine-binding oligopeptides with supramolecular target selectivity". Chemical Science 13 1 (2021): 210-217. http://dx.doi.org/10.1039/d1sc04420f.
Publicado • 10.1039/d1sc04420f
"Exploiting Peptide Self-Assembly for the Development of Minimalistic Viral Mimetics". Frontiers in Chemistry 9 (2021): http://dx.doi.org/10.3389/fchem.2021.723473.
10.3389/fchem.2021.723473
Daniela Kalafatovic; Goran Mauša; Dina Rešetar Maslov; Ernest Giralt. "Bottom-Up Design Approach for OBOC Peptide Libraries". Molecules (2020): https://www.mdpi.com/1420-3049/25/15/3316.
10.3390/molecules25153316
Son, J.; Kalafatovic, D.; Kumar, M.; Yoo, B.; Cornejo, M.A.; Contel, M.; Ulijn, R.V.. "Customizing Morphology, Size, and Response Kinetics of Matrix Metalloproteinase-Responsive Nanostructures by Systematic Peptide Design". ACS Nano (2019): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85061232192&partnerID=MN8TOARS.
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Kalafatovic, Daniela. "Algorithm-supported, mass and sequence diversity-oriented random peptide library design". Journal of Cheminformatics 11 1 (2019): 25-25. https://doi.org/10.1186/s13321-019-0347-6.
10.1186/s13321-019-0347-6
Gawrzak, S.; Rinaldi, L.; Gregorio, S.; Arenas, E.J.; Salvador, F.; Urosevic, J.; Figueras-Puig, C.; et al. "MSK1 regulates luminal cell differentiation and metastatic dormancy in ER ⁺ breast cancer". Nature Cell Biology 20 2 (2018): 211-221. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85040774350&partnerID=MN8TOARS.
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Kalafatovic, D.; Nobis, M.; Son, J.; Anderson, K.I.; Ulijn, R.V.. "MMP-9 triggered self-assembly of doxorubicin nanofiber depots halts tumor growth". Biomaterials 98 (2016): 192-202. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84966713472&partnerID=MN8TOARS.
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Kalafatovic, D.; Nobis, M.; Javid, N.; Frederix, P.W.J.M.; Anderson, K.I.; Saunders, B.R.; Ulijn, R.V.. "MMP-9 triggered micelle-to-fibre transitions for slow release of doxorubicin". Biomaterials Science 3 2 (2015): 246-249. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84921633070&partnerID=MN8TOARS.
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Pappas, C.G.; Frederix, P.W.J.M.; Mutasa, T.; Fleming, S.; Abul-Haija, Y.M.; Kelly, S.M.; Gachagan, A.; et al. "Alignment of nanostructured tripeptide gels by directional ultrasonication". Chemical Communications 51 40 (2015): 8465-8468. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84928966482&partnerID=MN8TOARS.
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Frederix, P.W.J.M.; Scott, G.G.; Abul-Haija, Y.M.; Kalafatovic, D.; Pappas, C.G.; Javid, N.; Hunt, N.T.; Ulijn, R.V.; Tuttle, T.. "Exploring the sequence space for (tri-)peptide self-assembly to design and discover new hydrogels". Nature Chemistry 7 1 (2015): 30-37. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84963944295&partnerID=MN8TOARS.
10.1038/nchem.2122

Atividades

Apresentação oral de trabalho

	Título da apresentação	Nome do evento Anfitrião (Local do evento)
2015/04/17	MMP-9 responsive peptides for tumor associated formation of doxorubicin releasing nanofibres	BioDesign MegaMeeting, Center for Integrative Proteomics Research Rutgers University (New Yersey, Estados Unidos)
2013/10/29	MMP-9 triggered reconfiguration of supramolecular peptide amphiphiles for controlled release	Peptide Materials for Nanotechnology and Biomedicine (PepMat) (Sorrento, Itália)
2013/06/25	MMP-9 triggered reconfiguration of supramolecular peptide systems	Macro Group Young Researchers Meeting University of Nottingham (Nottingham, Reino Unido)

Organização de evento

	Nome do evento Tipo de evento (Tipo de participação)	Instituição / Organização
2017 - 2017	1st European PhD and Postdoc symposium ENABLE (Barcelona, Spain) (2017 - 2017) Conferência (Membro da Comissão Organizadora)	Institut de Recerca Biomèdica, Espanha

Participação em evento

	Descrição da atividade Tipo de evento	Nome do evento Instituição / Organização
2017/10/15 - 2017/10/20	Poster presentation: OBOC combinatorial peptide libraries for identification of targetable membrane proteins as bone metastasis mediators in breast cancer Conferência	12th Australian Peptide Symposium, Peppers Noosa Resort (Queensland, Australia)
2015/06/20 - 2015/06/25	Poster presentation: MMP-9 responsive peptides for tumor associated formation of doxorubicin releasing nanofibres Conferência	American Peptide Symposium, Orlando (Florida, USA)