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Ana Rita Grosso gathered a Biology degree (FCUL, 2002), followed by a MSc in Bioinformatics (FCUL-IGC, 2006). Her multi-omics expertise in biomedical research was accomplished by gathering a PhD in Biomedical Sciences (iMM/FMUL, 2010), where she unveiled the existence of splicing-factors expression signatures responsible by the tissue-specific regulation of alternative splicing. During her PostDoc (iMM) she disclosed new mechanisms underlying epigenetics, transcription and splicing dynamics. In 2018, Ana Rita Grosso moved to NOVA School of Science and Technology (FCT-NOVA) and Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO) to foster her scientific independence and consolidate her research group: Computational Multi-Omics. Her main mission is to decipher pathological conditions using multi-omics approaches, identifying molecular events to be further used as biomarkers and therapeutic targets. Highlighting, she has been unveiling (epi)genome/transcriptome alterations that affects tumor evolution and metastasis development. To date, Ana Rita Grosso published 51 papers and 2 chapter books (enclosing 2401 citations). Also, she won in highly competitive schemes: 4 Salary Grants (PhD and PostDoc Fellowships, 2 Research Contracts); 11 Projects Grants (5 as PI/Co-PI and 7 as Team Member), 1 EMBO Workshop, as well as 3 Pfizer Awards for Basic Research. Finally, she has been fostering advance training in the computational biology field by supervising 4 PostDoc researchers, 4 PhD students, 3 MSc fellows, 10 MSc students, 7 BSc students and several short-term trainees. Additionally, she has been teaching MSc and BSc courses focused on Genomics and Computational Biology fields in FCT-NOVA.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Ana Rita Grosso

Nomes de citação

  • Grosso, Ana Rita

Identificadores de autor

Ciência ID
3D18-571E-133A
ORCID iD
0000-0001-6974-4209
Researcher Id
I-6656-2013
Scopus Author Id
26639262500

Endereços de correio eletrónico

  • argrosso@fct.unl.pt (Profissional)

Moradas

  • Faculdade de Ciências e Tecnologia - Universidade Nova de Lisboa, Campus de Caparica, 2829-516, Caparica, Almada, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Celular
  • Ciências Médicas e da Saúde - Medicina Básica

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2010
Concluído
 Ciências Biomedicas (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
"New insights into alternative splicing using microarray technology " (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Distinção e Louvor por unanimidade
2006
Concluído
 Bioinformatica (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Statistical Methodologies for the Analysis of DNA Microarray Data" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Muito Bom
2002
Concluído
 Biologia (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"“Estudo Filogenético de Populações Europeias de Columba palumbus (Pombo-Torcaz), Recorrendo à Análise de DNA Mitocondrial”" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 15
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2018/01/01 - 2022/03/31 Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2015/01/01 - 2017/12/31 Investigador Auxiliar (carreira) (Investigação) Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2010/03/01 - 2014/12/31 Pós-doutorado (Investigação) Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2002/10/01 - 2005/12/31 Investigador (Investigação) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2022/04/01 - Atual Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2023/12 - 2026/11 The cell of origin of Pancreatic Cancer: novel opportunities for the early diagnosis and treatment
HR23-00442
 Caixabank SA
2023/03/01 - 2026/02/28 Innovative approaches for pancreatic cancer: Decoding and manipulating immune response to short sialylated O-glycans
2022.04607.PTDC Abordagens inovadoras para cancro pancreático: Descodificando e manipulando a resposta imune a O-glicanos sialilados Innovative appro
Investigador
2023/02/15 - 2026/02/14 Dissecting the molecular mechanisms of X-chromosome inactivation using human embryonic stem cells
2022.01532.PTDC
Co-Investigador Responsável (Co-IR)
2023/02/13 - 2026/02/12 NANOHEAT – Gold nanoconjugates for improved photothermal ablation of colorectal cancer
2022.04315.PTDC
Investigador
2022 - 2024 Ovarian Cancer Avatars for personalized therapy, a combination of in vivo & ex-vivo models to guarantee a test for every patient
PTDC/BTM-SAL/3796/2021
Investigador
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2022 - 2024 Unveiling the signatures of convergent evolution in bee-associated microorganisms: a comparative multi-omics approach
PTDC/BIA-EVL/0604/2021
PTDC/BIA-EVL/0604/2021
Investigador
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2021 - 2023 Harnessing comparative genomics to understand the role of horizontal acquired genes in the evolution of yeast metabolism
PTDC/BIA-EVL/1100/2020
Investigador
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2021 - 2023 Unravelling evolutionary physiology landscapes of coastal marine fauna under extreme temperatures using a multi-layer Systems Biology approach
PTDC/BIA-BMA/1494/2020
Investigador
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2019 - 2022 The Portuguese biotechnological database for marine animal venoms and toxins
MARVEN
Investigador
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Em curso
2018/10/01 - 2021/09/30 Targeting Intra-Tumor heterogeneity as a promising therapeutic strategy for cancer
PTDC/MED-ONC/28660/2017
Investigador responsável
REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Em curso
2018/08/01 - 2021/07/31 A critical role for DNA damage in transcription that impacts cell differentiation and tumor development
PTDC/BIA-MOL/30438/2017
Investigador
Instituto de Medicina Molecular, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Em curso
2015/01/01 - 2019/12/01 Decoding pseudogene transcriptional regulation during cell differentiation
IF/00510/2014
Investigador responsável
Instituto de Medicina Molecular, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Em curso
2016/01 - 2018/12 Novel tumorigenic mechanisms of aberrant epigenetic regulation in clear cell renal cell carcinoma
Provided by PTCRIS: 138597
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2015/12 - 2018/11 Long non-coding RNAs as new diagnostic biomarkers for African Sleeping sickness.
Provided by PTCRIS: 145744
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2013/06 - 2015/11 SETD2 mediates a novel tumor suppressor mechanism that is misregulated in clear cell renal carcinoma
Provided by PTCRIS: 124736
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2011/02 - 2014/01 Splicing-coupled mechanisms of chromatin remodeling and their global role in transcription
Provided by PTCRIS: 111451
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2011/01 - 2013/12 The role of RNA polymerase II in splicing regulation
Provided by PTCRIS: 113440
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2007/09 - 2010/08 Mechanisms of splicing regulation by U2AF proteins
Provided by PTCRIS: 69739
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.

Projeto

Designação Financiadores
2021/01/01 - 2025/12/31 Institute for Health and Bioeconomy
LA/P/0140/2020
10.54499/LA/P/0140/2020
Investigador
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal

Universidade Nova de Lisboa, Portugal

INESC Microsistemas e Nanotecnologias, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/12/31 - 2025/12/30 Contract "FCT CEEC Individual" - Targeting Intra-Tumor heterogeneity as a promising therapeutic strategy for cancer
CEECIND/02699/2017
Investigador responsável
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Em curso
2020/01/01 - 2023/12/31 Applied Molecular Biosciences Unit
UIDB/04378/2020
10.54499/UIDB/04378/2020
Investigador
Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Universidade do Porto, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2015/01/01 - 2019/12/31 Decoding pseudogene transcriptional regulation during cell differentiation
IF/00510/2014
Investigador responsável
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Patricia Abrantes; G. Dimopoulos; Ana Rita Grosso; V.E. Do Rosário; Henrique Silveira. "Impacto da cloroquina nos mecanismos de defesa de Anopheles gambiae à infecção por Plasmodium berghei". 2007.
Artigo em revista
  1. Paulo Caldas; Mariana Luz; Simone Baseggio; Rita Andrade; Daniel Sobral; Ana Rita Grosso. "Transcription readthrough is prevalent in healthy human tissues and associated with inherent genomic features". Communications Biology (2024): https://doi.org/10.1038/s42003-024-05779-5.
    10.1038/s42003-024-05779-5
  2. Bruno A. Cardoso; Mafalda Duque; Ana Gírio; Rita Fragoso; Mariana L. Oliveira; James R. Allen; Leila R. Martins; et al. "CASZ1 upregulates PI3K-AKT-mTOR signaling and promotes T-cell acute lymphoblastic leukemia". Haematologica (2023): http://dx.doi.org/10.3324/haematol.2023.282854.
    10.3324/haematol.2023.282854
  3. Carlota Pascoal; Mylène A. Carrascal; Daniela F. Barreira; Rita A. Lourenço; Pedro Granjo; Ana R. Grosso; Paula Borralho; Sofia Braga; Paula A. Videira. "Sialyl LewisX/A and Cytokeratin Crosstalk in Triple Negative Breast Cancer". Cancers (2023): https://doi.org/10.3390/cancers15030731.
    10.3390/cancers15030731
  4. Peixoto, Carolina; Lopes, Marta B.; Martins, Marta; Casimiro, Sandra; Sobral, Daniel; Grosso, Ana Rita; Abreu, Catarina; et al. "Identification of biomarkers predictive of metastasis development in early-stage colorectal cancer using network-based regularization". BMC Bioinformatics 24 1 (2023): http://dx.doi.org/10.1186/s12859-022-05104-z.
    10.1186/s12859-022-05104-z
  5. Marta F Fidalgo; Catarina G Fonseca; Paulo Caldas; Alexandre ASF Raposo; Tania Balboni; Lenka Henao-Mišíková; Ana R Grosso; Francisca F Vasconcelos; Cláudio A Franco. "Aerocyte specification and lung adaptation to breathing is dependent on alternative splicing changes". Life Science Alliance (2022): https://doi.org/10.26508/lsa.202201554.
    10.26508/lsa.202201554
  6. Sobral, Daniel; Martins, Marta; Kaplan, Shannon; Golkaram, Mahdi; Salmans, Michael; Khan, Nafeesa; Vijayaraghavan, Raakhee; et al. "Genetic and microenvironmental intra-tumor heterogeneity impacts colorectal cancer evolution and metastatic development". Communications Biology 5 1 (2022): http://dx.doi.org/10.1038/s42003-022-03884-x.
    10.1038/s42003-022-03884-x
  7. Daniel Sobral; Rita Francisco; Laura Duro; Paula Alexandra Videira; Ana Rita Grosso. "Concerted Regulation of Glycosylation Factors Sustains Tissue Identity and Function". Biomedicines (2022): https://doi.org/10.3390/biomedicines10081805.
    10.3390/biomedicines10081805
  8. "A YAP/TAZ-TEAD signalling module links endothelial nutrient acquisition to angiogenic growth". Nature Metabolism 4 6 (2022): 672-682. http://dx.doi.org/10.1038/s42255-022-00584-y.
    10.1038/s42255-022-00584-y
  9. Ana P. Rodrigo; Ana Catarina Lopes; Ricardo Pereira; Sandra I. Anjo; Bruno Manadas; Ana Rita Grosso; P. V. Baptista; Alexandra Fernandes; Pedro M. Costa. "Endogenous Fluorescent Proteins in the Mucus of an Intertidal Polychaeta". Marine Drugs 20 4 (2022): https://novaresearch.unl.pt/en/publications/14662f2c-d707-44e4-8a35-44d17cf7ffc7.
    10.3390/md20040224
  10. Sabino, João C; de Almeida, Madalena R; Abreu, Patrícia L; Ferreira, Ana M; Caldas, Paulo; Domingues, Marco M; Santos, Nuno C; et al. "Epigenetic reprogramming by TET enzymes impacts co-transcriptional R-loops". eLife 11 (2022): http://dx.doi.org/10.7554/elife.69476.
    Acesso aberto • 10.7554/elife.69476
  11. Inês Moutinho Cabral; Carolina Madeira; Ana R. Grosso; Pedro M. Costa. "A drug discovery approach based on comparative transcriptomics between two toxin-secreting marine annelids: Glycera alba and Hediste diversicolor". Molecular Omics (2022): https://doi.org/10.1039/D2MO00138A.
    10.1039/D2MO00138A
  12. Vanda Póvoa; Cátia Rebelo de Almeida; Mariana Maia-Gil; Daniel Sobral; Micaela Domingues; Mayra Martinez-Lopez; Miguel de Almeida Fuzeta; et al. "Innate immune evasion revealed in a colorectal zebrafish xenograft model". Nature Communications (2021): https://doi.org/10.1038/s41467-021-21421-y.
    10.1038/s41467-021-21421-y
  13. Almeida, Afonso R. M.; Neto, João L.; Cachucho, Ana; Euzébio, Mayara; Meng, Xiangyu; Kim, Rathana; Fernandes, Marta B.; et al. "Interleukin-7 receptor a mutational activation can initiate precursor B-cell acute lymphoblastic leukemia". Nature Communications 12 1 (2021): http://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-27197-5.
    10.1038/s41467-021-27197-5
  14. Silva, Ana Patricia; Almeida, Afonso R.M.; Cachucho, Ana; Neto, João L; Demeyer, Sofie; Ramos de Matos, Mafalda; Hogan, Thea; et al. "Overexpression of wild type IL-7Ra promotes T-cell acute lymphoblastic leukemia/lymphoma". Blood (2021): http://dx.doi.org/10.1182/blood.2019000553.
    10.1182/blood.2019000553
  15. Andrade, Jorge; Shi, Chenyue; Costa, Ana S. H.; Choi, Jeongwoon; Kim, Jaeryung; Doddaballapur, Anuradha; Sugino, Toshiya; et al. "Control of endothelial quiescence by FOXO-regulated metabolites". Nature Cell Biology 23 4 (2021): 413-423. http://dx.doi.org/10.1038/s41556-021-00637-6.
    10.1038/s41556-021-00637-6
  16. Ana P. Rodrigo; Ana R. Grosso; Pedro V. Baptista; Alexandra R. Fernandes; Pedro M. Costa. "A Transcriptomic Approach to the Recruitment of Venom Proteins in a Marine Annelid". Toxins (2021): https://doi.org/10.3390/toxins13020097.
    10.3390/toxins13020097
  17. Ana P. Rodrigo; Vera M. Mendes; Bruno Manadas; Ana R. Grosso; António P. Alves de Matos; Pedro V. Baptista; Pedro M. Costa; Alexandra R. Fernandes. "Specific Antiproliferative Properties of Proteinaceous Toxin Secretions from the Marine Annelid Eulalia sp. onto Ovarian Cancer Cells". Marine Drugs (2021): https://doi.org/10.3390/md19010031.
    10.3390/md19010031
  18. Rita Francisco; Carlota Pascoal; Dorinda Marques-da-Silva; Sandra Brasil; Fernando M. Pimentel-Santos; Ruqaiah Altassan; Jaak Jaeken; et al. "New Insights into Immunological Involvement in Congenital Disorders of Glycosylation (CDG) from a People-Centric Approach". Journal of Clinical Medicine 9 7 (2020): 2092-2092. https://doi.org/10.3390/jcm9072092.
    10.3390/jcm9072092
  19. Prudêncio, Pedro; Rebelo, Kenny; Grosso, Ana Rita; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria. "Analysis of Mammalian Native Elongating Transcript sequencing (mNET-seq) high-throughput data". Methods (2019): http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2019.09.003.
    10.1016/j.ymeth.2019.09.003
  20. Cunha, M.; Martins, C.; Grosso, A.R.; Costa, P.M.. "Mytilus galloprovincialis CYP1A-like mRNAs reveal closer proximity of mytilid CYP1A to the eumetazoan CYP2 family". Aquatic Toxicology 214 (2019): 105260. http://dx.doi.org/10.1016/j.aquatox.2019.105260.
    Publicado • 10.1016/j.aquatox.2019.105260
  21. de Matos, Mafalda; Posa, Ioana; Carvalho, Filipa; Morais, Vanessa; Grosso, Ana; de Almeida, Sérgio. Autor correspondente: Grosso, Ana. "A Systematic Pan-Cancer Analysis of Genetic Heterogeneity Reveals Associations with Epigenetic Modifiers". Cancers 11 3 (2019): 391. http://dx.doi.org/10.3390/cancers11030391.
    Publicado • 10.3390/cancers11030391
  22. Vítor, Alexandra C.; Sridhara, Sreerama C.; Sabino, João C.; Afonso, Ana I.; Grosso, Ana R.; Martin, Robert M.; de Almeida, Sérgio F.. "Single-molecule imaging of transcription at damaged chromatin". Science Advances 5 1 (2019): eaau1249. http://dx.doi.org/10.1126/sciadv.aau1249.
    10.1126/sciadv.aau1249
  23. Nojima, Takayuki; Rebelo, Kenny; Gomes, Tomas; Grosso, Ana Rita; Proudfoot, Nicholas J.; Carmo-Fonseca, Maria. "RNA Polymerase II Phosphorylated on CTD Serine 5 Interacts with the Spliceosome during Co-transcriptional Splicing". Molecular Cell 72 2 (2018): 369-+. http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=WOS:000447630200017&KeyUID=WOS:000447630200017.
    10.1016/j.molcel.2018.09.004
  24. Mancio-Silva, Liliana; Slavic, Ksenija; Grilo Ruivo, Margarida T.; Grosso, Ana Rita; Modrzynska, Katarzyna K.; Vera, Iset Medina; Sales-Dias, Joana; et al. "Nutrient sensing modulates malaria parasite virulence". Nature 547 7662 (2017): 213-216. http://dx.doi.org/10.1038/nature23009.
    10.1038/nature23009
  25. Grosso, Ana Rita. "Introns Protect Eukaryotic Genomes from Transcription-Associated Genetic Instability.". Molecular cell (2017): http://europepmc.org/abstract/med/28757210.
    10.1016/j.molcel.2017.07.002
  26. Sridhara, Sreerama Chaitanya; Carvalho, Sílvia; Grosso, Ana Rita; Gallego-Paez, Lina Marcela; Carmo-Fonseca, Maria; de Almeida, Sérgio Fernandes. "Transcription Dynamics Prevent RNA-Mediated Genomic Instability through SRPK2-Dependent DDX23 Phosphorylation". Cell Reports 18 2 (2017): 334-343. http://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2016.12.050.
    10.1016/j.celrep.2016.12.050
  27. Machado, Miguel P.; Matos, Isa; Grosso, Ana R.; Schartl, Manfred; Coelho, Maria M.. "Non-canonical expression patterns and evolutionary rates of sex-biased genes in a seasonal fish". Molecular Reproduction and Development 83 12 (2016): 1102-1115. http://dx.doi.org/10.1002/mrd.22752.
    10.1002/mrd.22752
  28. Posa, Ioana; Carvalho, Silvia; Tavares, Joana; Grosso, Ana Rita. Autor correspondente: Grosso, Ana Rita. "A pan-cancer analysis of MYC-PVT1 reveals CNV-unmediated deregulation and poor prognosis in renal carcinoma". Oncotarget 7 30 (2016): http://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.9487.
    10.18632/oncotarget.9487
  29. Muñoz-Ruiz, Miguel; Ribot, Julie C; Grosso, Ana R; Gonçalves-Sousa, Natacha; Pamplona, Ana; Pennington, Daniel J; Regueiro, José R; Fernández-Malavé, Edgar; Silva-Santos, Bruno. "TCR signal strength controls thymic differentiation of discrete proinflammatory ¿d T cell subsets". Nature Immunology 17 6 (2016): 721-727. http://dx.doi.org/10.1038/ni.3424.
    10.1038/ni.3424
  30. Jesus, T.F.; Grosso, A.R.; Almeida-Val, V.M.F.; Coelho, M.M.. "Transcriptome profiling of two Iberian freshwater fish exposed to thermal stress". Journal of Thermal Biology 55 (2016): 54-61. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84951081833&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.jtherbio.2015.11.009
  31. Grosso, Ana R; Leite, Ana P; Carvalho, Sílvia; Matos, Mafalda R; Martins, Filipa B; Vítor, Alexandra C; Desterro, Joana MP; Carmo-Fonseca, Maria; de Almeida, Sérgio F. "Pervasive transcription read-through promotes aberrant expression of oncogenes and RNA chimeras in renal carcinoma". eLife 4 (2015): http://dx.doi.org/10.7554/elife.09214.
    10.7554/elife.09214
  32. Álvarez, P.; Arthofer, Wolfgang; Coelho, Maria M.; Conklin, D.; Estonba, A.; Grosso, Ana R.; Helyar, S. J.; et al. "Genomic Resources Notes Accepted 1 June 2015 - 31 July 2015". Molecular Ecology Resources 15 6 (2015): 1510-1512. http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12454.
    10.1111/1755-0998.12454
  33. Almeida-Val, Vera Maria Fonseca; Boscari, E.; Coelho, Maria Manuela; Congiu, L.; Grapputo, A.; Grosso, Ana Rita; Jesus, Tiago Filipe; et al. "Genomic Resources Notes accepted 1 April 2015 - 31 May 2015". Molecular Ecology Resources 15 5 (2015): 1256-1257. http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.12439.
    10.1111/1755-0998.12439
  34. Veigas, Bruno; Pedrosa, Pedro; Carlos, Fábio F; Mancio-Silva, Liliana; Grosso, Ana Rita; Fortunato, Elvira; Mota, Maria M; Baptista, Pedro V. "One nanoprobe, two pathogens: gold nanoprobes multiplexing for point-of-care". Journal of Nanobiotechnology 13 1 (2015): http://dx.doi.org/10.1186/s12951-015-0109-1.
    10.1186/s12951-015-0109-1
  35. Grosso, Ana Rita. "Mammalian NET-Seq Reveals Genome-wide Nascent Transcription Coupled to RNA Processing". Cell (2015):
    http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2015.03.027
  36. Nojima, Takayuki; Gomes, Tomás; Grosso, Ana Rita Fialho; Kimura, Hiroshi; Dye, Michael J.; Dhir, Somdutta; Carmo-Fonseca, Maria; Proudfoot, Nicholas J.. "Mammalian NET-Seq Reveals Genome-wide Nascent Transcription Coupled to RNA Processing". Cell 161 3 (2015): 526-540. http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2015.03.027.
    10.1016/j.cell.2015.03.027
  37. Grosso, A.R.; Leite, A.P.; Carvalho, S.; Matos, M.R.; Martins, F.B.; Vítor, A.C.; Desterro, J.M.P.; Carmo-Fonseca, M.; de Almeida, S.F.. Autor correspondente: Grosso, A.R.. "Pervasive transcription read-through promotes aberrant expression of oncogenes and RNA chimeras in renal carcinoma". eLife 4 NOVEMBER20 (2015): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84958191482&partnerID=MN8TOARS.
    10.7554/eLife.09214
  38. Dourado, C.G.; Duarte, M.A.; Grosso, A.R.; Bastos-Silveira, C.; Marrero, P.; Oliveira, P.; Paulo, O.S.; Dias, D.. "Phylogenetic origin of the endemic pigeons from Madeira (Columba trocaz) and Azores Islands (Columba palumbus azorica)". Journal of Ornithology 155 1 (2014): 71-82. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84891629909&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s10336-013-0988-6
  39. Lança, T.; Costa, M.F.; Gonca¸lves-Sousa, N.; Rei, M.; Grosso, A.R.; Penido, C.; Silva-Santos, B.. "Protective role of the inflammatory CCR2/CCL2 chemokine pathway through recruitment of type 1 cytotoxic ¿d T lymphocytes to tumor beds". Journal of Immunology 190 12 (2013): 6673-6680. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84879112769&partnerID=MN8TOARS.
    10.4049/jimmunol.1300434
  40. Rodrigues, R.; Grosso, A.R.; Moita, L.. "Genome-Wide Analysis of Alternative Splicing during Dendritic Cell Response to a Bacterial Challenge". PLoS ONE 8 4 (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84876265387&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0061975
  41. Carvalho, S.; Raposo, A.C.; Martins, F.B.; Grosso, A.R.; Sridhara, S.C.; Rino, J.; Carmo-Fonseca, M.; De Almeida, S.F.. "Histone methyltransferase SETD2 coordinates FACT recruitment with nucleosome dynamics during transcription". Nucleic Acids Research 41 5 (2013): 2881-2893. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84876365300&partnerID=MN8TOARS.
    10.1093/nar/gks1472
  42. Schmolka, N.; Serre, K.; Grosso, A.R.; Rei, M.; Pennington, D.J.; Gomes, A.Q.; Silva-Santos, B.. "Epigenetic and transcriptional signatures of stable versus plastic differentiation of proinflammatory ¿d T cell subsets". Nature Immunology 14 10 (2013): 1093-1100. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84886723991&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/ni.2702
  43. Grosso, A.R.; De Almeida, S.F.; Braga, J.; Carmo-Fonseca, M.. "Dynamic transitions in RNA polymerase II density profiles during transcription termination". Genome Research 22 8 (2012): 1447-1456. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84864577725&partnerID=MN8TOARS.
    10.1101/gr.138057.112
  44. De Almeida, S.F.; Grosso, A.R.; Koch, F.; Fenouil, R.; Carvalho, S.; Andrade, J.; Levezinho, H.; et al. "Splicing enhances recruitment of methyltransferase HYPB/Setd2 and methylation of histone H3 Lys36". Nature Structural and Molecular Biology 18 9 (2011): 977-983. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80052445151&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/nsmb.2123
  45. Gomes, A.Q.; Correia, D.V.; Grosso, A.R.; Lança, T.; Ferreira, C.; Lacerda, J.F.; Barata, J.T.; da Silva, M.G.; Silva-Santos, B.. "Identification of a panel of ten cell surface protein antigens associated with immunotargeting of leukemias and lymphomas by peripheral blood ¿d t cells". Haematologica 95 8 (2010): 1397-1404. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77956032245&partnerID=MN8TOARS.
    10.3324/haematol.2009.020602
  46. Mollet, I.G.; Ben-Dov, C.; Felício-Silva, D.; Grosso, A.R.; Eleutério, P.; Alves, R.; Staller, R.; Silva, T.S.; Carmo-Fonseca, M.. "Unconstrained mining of transcript data reveals increased alternative splicing complexity in the human transcriptome". Nucleic Acids Research 38 14 (2010): 4740-4754. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77955793696&partnerID=MN8TOARS.
    10.1093/nar/gkq197
  47. Albuquerque, S.S.; Carret, C.; Grosso, A.R.; Tarun, A.S.; Peng, X.; Kappe, S.H.I.; Prudêncio, M.; Mota, M.M.. "Host cell transcriptional profiling during malaria liver stage infection reveals a coordinated and sequential set of biological events". BMC Genomics 10 (2009): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-67650520138&partnerID=MN8TOARS.
    10.1186/1471-2164-10-270
  48. Correia, D.V.; D'Orey, F.; Cardoso, B.A.; Lança, T.; Grosso, A.R.; DeBarros, A.; Martins, L.R.; Barata, J.T.; Silva-Santos, B.. "Highly active microbial phosphoantigen induces rapid yet sustained MEK/Erk- and PI-3K/Akt-mediated signal transduction in anti-tumor human ¿d T-cells". PLoS ONE 4 5 (2009): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-66249119050&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0005657
  49. Grosso, A.R.; Martins, S.; Carmo-Fonseca, M.. "The emerging role of splicing factors in cancer". EMBO Reports 9 11 (2008): 1087-1093. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-55549143293&partnerID=MN8TOARS.
    10.1038/embor.2008.189
  50. Grosso, A.R.; Gomes, A.Q.; Barbosa-Morais, N.L.; Caldeira, S.; Thorne, N.P.; Grech, G.; von Lindern, M.; Carmo-Fonseca, M.. "Tissue-specific splicing factor gene expression signatures". Nucleic Acids Research 36 15 (2008): 4823-4832. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-50849145126&partnerID=MN8TOARS.
    10.1093/nar/gkn463
  51. Abrantes, P.; Dimopoulos, G.; Grosso, A.R.; do Rosario, V.E.; Silveira, H.. "Chloroquine mediated modulation of Anopheles gambiae gene expression". PLoS ONE 3 7 (2008): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-49749121787&partnerID=MN8TOARS.
    10.1371/journal.pone.0002587
  52. Amaral, A.J.; Silva, A.B.; Grosso, A.R.; Chikhi, L.; Bastos-Silveira, C.; Dias, D.. "Detection of hybridization and species identification in domesticated and wild quails using genetic markers". Folia Zoologica 56 3 (2007): 285-300. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-36048956045&partnerID=MN8TOARS.
  53. Grosso, A.R.; Bastos-Silveira, C.; Coelho, M.M.; Dias, D.. "Columba palumbus Cyt b-like Numt sequence: Comparison with functional homologue and the use of universal primers". Folia Zoologica 55 2 (2006): 131-144. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-33746876314&partnerID=MN8TOARS.
Capítulo de livro
  1. Pinto, Rui; Sobral, Daniel; Grosso, Ana Rita. Autor correspondente: Grosso, Ana Rita. "Comprehensive Detection of Pseudogenes Transcribed by Readthrough". 85-102. Springer {US, 2021.
    10.1007/978-1-0716-1503-4_6
  2. Grosso, Ana Rita; Carmo-Fonseca, Maria. "The Potential of Targeting Splicing for Cancer Therapy". In Nuclear Signaling Pathways and Targeting Transcription in Cancer, 313-336. Springer New York, 2013.
    Publicado • 10.1007/978-1-4614-8039-6_13
Poster em conferência
  1. Madeira, Carolina; Missionário, M.; Almeida, Célia; Cabral, Inês Moutinho; Nunes, Miguel; Fernandes, Joana F.; Travesso, Margarida; et al. "Molecular and phenotypic plasticity of temperate gobies in response to ocean warming and marine heatwaves.". Trabalho apresentado em Ciência 2023 - Encontro com a Ciência e Tecnologia em Portugal: Ciência e Oceano para Além do Horizonte, 2023.
  2. Gonçalves, C.; Moutinho Cabral, Inês; Rodrigo, Ana P.; Madeira, Carolina; Alves de Matos, A.P.; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. "Uncovering the potential of Cephalopoda and Polychaeta toxins for drug discovery". Trabalho apresentado em Ciência 2023 - Encontro com a Ciência e Tecnologia em Portugal: Ciência e Oceano para Além do Horizonte, 2023.
  3. Cabral, Inês Moutinho; Missionário, M; Nunes, Miguel; Mendonça, Vanessa; Fernandes, Joana F.; Travesso, Margarida; Vinagre, Catarina; et al. "How ocean warming is modulating marine host-parasite dynamics in the Anthropocene: Evidence for higher parasite incidence and effects in nonwarm adapted intertidal fish population". Trabalho apresentado em EcoSummit 2023 Building a sustainable and desirable future: Adapting to a changing land and sea-scape, 13-17 June 2023 | Gold Coast, Australia, 2023.
  4. Caldas, Paulo; Luz, Mariana; Simone Baseggio; Rita Andrade; Grosso, Ana Rita. Autor correspondente: Caldas, Paulo. "Transcription readthrough is prevalent in healthy human tissues and determined by inherent genomic features". Trabalho apresentado em RNA in Disease - RiboMed and IX ptRNA joint meeting, 2023.
  5. Caldas, Paulo; Grosso, Ana Rita; Luz, Mariana; Sobral, Daniel. Autor correspondente: Grosso, Ana Rita. "RNA in Disease - IX PT RNA Meeting". Trabalho apresentado em Transcription Readthrough is prevalent in healthy human tissues and determined by inherent genomic features, 2023.
  6. Moutinho Cabral, Inês; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. "Bioprospecting marine environments for unraveling novel drugs: Transcriptomics and interactome-directed analyses of two toxin-secreting Polychaeta". Trabalho apresentado em 1st Egas Moniz One Health Symposium Teaming up for a better Public Health, 2022.
  7. Moutinho Cabral, Inês; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. "A study on whole-transcriptomes of two Polychaeta for discovering novel bioproducts with potential biotechnological applications". Trabalho apresentado em ICYMARE International Conference for Young Marine Researchers, 2021.
  8. Rodrigo, Ana; Grosso, Ana Rita; Mendes, Vera M; Manadas, Bruno; Pedro V. Baptista; Alexandra R Fernandes; Costa, Pedro M.. "Unveiling venomous annelids by combining omics with ecological traits: The example of a phyllodocid". Trabalho apresentado em XII European Conference on Marine Natural Products, 2021.
  9. Gonçalves, C.; Cabral, I.M.; Rodrigo, Ana P.; Fonseca, D. ; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. "A stinging issue: omics and computational tools for the bioprospecting for novel marine toxins". Trabalho apresentado em XII ECMNP, 2021.
  10. Cátia Gonçalves; Diogo Fonseca; Francisca Silva; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. "New insights into cephalopods venoms ¿ A promising target for bioprospection". Trabalho apresentado em European Conference on Marine Natural Products (ECMNP2021), 2021.
  11. Sabino, João C.; Sridhara, Sreerama C.; Abreu, Patrícia L.; Domingues, Marco M.; Santos, Nuno C.; Grosso, Ana Rita; de Almeida, Sérgio F.. "Epigenetic determinants of transcription-coupled genomic instability". Trabalho apresentado em Trends in Genome Integrity & Chromosome Dynamics, 2020.
  12. Rodrigo, Ana P.; Grosso, Ana Rita; Baptista, Pedro; Alexandra R Fernandes; Costa, Pedro M.. "Toxins from an unsuspected invertebrate: a poisonous cocktail from a jawless predatory polychaete". Trabalho apresentado em XVI International symposium on marine natural products & XI European conference on marine natural products, 2019.
  13. Martins, Carla; Carvalho, L. M.; Grosso, Ana Rita; Saúde, Leonor; Costa, Pedro M.. "The interaction effects of carcinogenic toxicants and emerging pollutants in zebrafish embryos: A toxicopathological and genotoxicological approach". Trabalho apresentado em Ciência 2019, 2019.
  14. Paulino, Cathy; Fernandes, Alexandra R; Baptista, Pedro Viana; Soeiro, Cristina; Grosso, Ana Rita; Quintas, Alexandre. "Genetic predisposition for aggressive behaviour related with dopamine and serotonin pathways ¿ An overview". Trabalho apresentado em 4th International Congress of CiiEM Health, Well-Being and Ageing in the XXI Century, 2019.
  15. Gomes, AQ; Correia, DV; Grosso, Ana Rita; Lança, T; SILVA-SANTOS, Bruno. "Identification of a panel of cell surface protein antigens associated with immunotargeting of leukemias and lymphomas by peripheral blood gd T cells". Trabalho apresentado em 14th International Congress of Immunology, 2010.
  16. Patricia Abrantes; G. Dimopoulos; Ana Rita Grosso; V.E. Do Rosário; Henrique Silveira. "Impacto da cloroquina nos mecanismos de defesa de A. gambiae à infecção por P. berghei". 2007.
Pré-impressão
  1. Silvia Carvalho; Luna Zea-Redondo; Tsz Ching Chloe Tang; Philipp Stachel-Braum; Duncan Miller; Paulo Caldas; Alexander Kukalev; et al. "SRRM2 splicing factor modulates cell fate in early development". 2023. https://doi.org/10.1101/2023.12.15.571825.
    10.1101/2023.12.15.571825
  2. Marta F. Fidalgo; Catarina G. Fonseca; Paulo Caldas; Alexandre A. S. F. Raposo; Tania Balboni; Ana R. Grosso; Francisca F. Vasconcelos; Cláudio A. Franco. "Alternative splicing changes are associated with pre-birth adaptation during lung development". 2022. https://doi.org/10.1101/2022.01.19.476886.
    10.1101/2022.01.19.476886
Resumo em conferência
  1. Nunes, Miguel; Moutinho Cabral, Inês; Cátia Gonçalves; Fernandes, Joana F.; Missionário, M.; Travesso, M. ; Grosso, Ana Rita; et al. Autor correspondente: Nunes, Miguel. "Goby fish populations in intertidal environments: gene networks and epigenetic regulators modulating energy metabolism in response to seasonal warming and local climate regimes.". Trabalho apresentado em International Conference for YOUNG Marine Researchers (ICYMARE), Bremerhaven, 2022.
  2. Couceiro, Joana; Grosso, Ana Rita; Baptista, P V; Mendes, J J; Fernandes, A R; Quintas, Alexandre (ORCID: 0000-0002-5188-0453). "The genetic susceptibility linking preterm birth and periodontal disease ¿ a review.". 2021.
    Aceite para publicação
  3. Martins, Carla; Rodrigo, Ana P.; Madeira, Carolina; D' Ambrosio, Mariaelena; C. Gonçalves; A. J. Parola; Grosso, Ana Rita; et al. "Porphyrin pigments in polychaeta: explorations on the evolution of haem metabolism in marine eumetazoans". Trabalho apresentado em XVI International Symposium on Marine Natural Products|XI European Conference on Marine Natural Products, Peniche, 2020.
    Publicado
Tese / Dissertação
  1. Grosso, Ana Rita Fialho, 1979-; Fonseca, M. Carmo, 1959-; Tavaré, Simon. "New insights into alternative splicing using microarray technology". Doutoramento, 2009. http://catalogo.ul.pt/F/?func=item-global&doc_library=ULB01&type=03&doc_number=000576074.
  2. Grosso, Ana Rita. "Statistical Methodologies for the Analysis of DNA Microarray Data". Mestrado, Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, 2006.

Outros

Conjunto de dados
  1. Moutinho Cabral, Inês; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. Cysteine-rich venom protein from Glycera alba (Accession OL606744). GenBank.
  2. Moutinho Cabral, Inês; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. Serine protease inhibitor Kazal-type from Glycera alba (Accession OL606745). GenBank.
  3. Moutinho Cabral, Inês; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. Cysteine-rich secretory protein from Hediste diversicolor (Accession OL606746). GenBank.
  4. Moutinho Cabral, Inês; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. Thyrostimulin beta-5 subunit from Hediste diversicolor (Accession OL606747). GenBank.
  5. Moutinho Cabral, Inês; Madeira, Carolina; Grosso, Ana Rita; Costa, Pedro M.. Whole-transcritptome dataset for Glycera alba and Hediste diversicolor (Accession GSE196852). Gene Expression Omnibus.
Atividades

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2023/04 - Atual Unveiling the molecular and cellular mechanisms underlying the regeneration blastema in marine annelids
Coorientador de Ines Cabral
 Biology (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021 - Atual Multi-Omics approach to understand Congenital Disorders of Glycosylation
Coorientador de Cátia Neves
 Biology (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/01/01 - Atual Coleoid venoms: Predicting cephalotoxin function and biotechnological applications from ecological and evolutionary traits
Coorientador de Cátia Gonçalves
 Biotechnology (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/01/01 - Atual Decoding functional associations between genome organization and nuclear architecture
Coorientador de Silvia Carvalho
 Basic and Applied Biology (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
2022/09 - 2023/12 BIT by BIT: Associating Transcription to Ageing
Coorientador de Ian Teixeira
 Computational Biology and Bioinformatics (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022 - 2022 Depicting novel tumour cell states through single-cell transcriptome profiles
Orientador de Francisca Xara-Brasil
 Biomedical Engineering (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2021 - 2022 Assessing the Prevalence of Transcription Readthrough in Human Healthy Tissues
Orientador de Mariana Luz
 Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado)
Universidade NOVA de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/02/01 - 2021/06/01 Bevacizumab Biomarkers in Triple Negative Breast Cancer
Orientador de Ian Teixeira
 Biologia Celular e Molecular (Outra)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Médicas, Portugal
2020 - 2021 A computational approach to identify target receptors of marine toxins in the human proteome: Potential biotechnological applications
Coorientador de Ines Cabral
 Genética Molecular e Biomedicina (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/02/01 - 2020/06/01 Depicting drivers of intra-tumor heterogeneity
Orientador de João Milagaia
 Biologia Celular e Molecular (Outra)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/02/01 - 2020/06/01 Deciphering Transcriptome Alterations underlying Metastasis Development
Orientador de Joana Gabriel
 Biologia Celular e Molecular (Outra)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/02/01 - 2019/06/01 Deciphering expression-profiles of glycosylation factors through computational multi-omics
Orientador de Laura Duro
 Biologia Celular e Molecular (Outra)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019/02/01 - 2019/06/01 Unveil tissue-specific expression of glycosylation factors through computational multi-omics
Orientador de Valerio Fiori
 Biologia Celular e Molecular (Outra)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017 - 2018 Association of DNA modifications with somatic mutations in cancer
Orientador de João Sousa
 Bioquímica (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016 - 2017 Depicting epigenetic mechanisms involved in the regulation of pseudogene expression
Orientador de Ana Margarida Ferreira
 Biologia Molecular e Genética (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2014 - 2015 Assessing Pseudogene Expression during Neural Differentiation by RNA-seq
Orientador de Luis Simões
 Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2013 - 2015 LincRNA profile in clear cell Renal Cell Carcinoma using RNA-seq data
Orientador de Ioana Posa
 Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2013 - 2014 Genome-wide profiling of RNA polymerase II and associated co- transcriptional processes using advanced NET-seq data
Orientador de Tomás Gomes
 Bioinformática e Biologia Computacional
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2013 - 2014 LincRNA's Profile in SETD2 Downregulated Cells
Orientador de Joana Tavares
 Bioinformática e Biologia Computacional (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2012 - 2013 Study of the role of SETD2 mutations in clear renal Cell Carcinoma (ccRCC)
Coorientador de Catarina de Almeida
 Bioestatística (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2012 - 2013 Intragenic Initiation in SETD2 deficient cells
Coorientador de Miguel Pereira
 Bioestatística (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2020 - Atual 3 Monthly Seminar Series: leadingIDEAS@UCIBIO; BioSeminars@UCIBIO; GuestSeminars@UCIBIO (2020)
Seminário (Membro da Comissão Organizadora)
 REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2020/07/06 - 2020/07/10 EMBO Practical Course on "Deciphering tumour heterogeneity and evolution by integration of multi-omics data". (2020/07/06)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
 Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2012 - 2017 Seminar Series: Computational Biology and Bioinformatics (biweekly) (2012 - 2017)
Seminário (Membro da Comissão Organizadora)
 Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2015 - 2015 iMM Liboa Post-Doc Day (2015 - 2015)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2010 - 2010 EURASNET Network Meeting in Lisbon (2010 - 2010)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
 Instituto de Medicina Molecular, Portugal
2009 - 2009 iMM Lisboa PhD Day (2009 - 2009)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Instituto de Medicina Molecular, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2024/02 Unravelling the roles of proteotoxic stress on genome diversification and disease
Arguente
 Ines Sousa (Doutoramento)
Universidade de Aveiro, Portugal
2023/12 Characterization of malignant cell transformation induced by cancer-derived exosomes
Arguente principal
 Margarida Quaresma (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/11 Unveiling Novel Glioma Biomarkers through Multi-omics Integration and Classification
Arguente principal
 Francisca Vieira (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/04 Developing Web Apps for Analyses of Transcriptomes
Arguente
 Nuno Agostinho (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
2023/02/08 The Role of Muscle in Spondyloarthritis
Arguente
 Atlas Sardoo (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Portugal
2022/12/21 A systems approach to the mechanisms of neurodegeneration
Arguente
 Marina Garcia-Vaquero (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2022/11/02 Computational Biology for Modeling Oncological Omics Data: the way towards personalized medicine
Arguente principal
 Ana Carolina Peixoto (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2022/07/04 Harnessing complex metabolic signatures to predict drug efficacy in ovarian cancer
Arguente principal
 Rita Mendes (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2022/04/28 Dissecting the differential molecular signature in patients from african-origin with triple-negative breast cancer
Arguente principal
 Ana Teresa Matias (Doutoramento)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências Médicas, Portugal
2022 Unveiling the regulation of germinal centre responses and antibody production by follicular T cells
Vogal
 Saumya Kumar (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
2021 The transcriptional landscape of Alzheimer’s and Parkinson’s diseases
Arguente principal
 Marie Bordone (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
2020 RNA-seq analysis to unravel the molecular players involved in implantation/rejection of human tumor cells in zebrafish
Arguente principal
 Micaela Domingues (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2019 A systematic pan-cancer analysis of somatic variants reveals epigenetic drivers of intratumor heterogeneity
Vogal
 Mafalda de Matos (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal
2017 Splicing kinetics revealed by nascent transcript sequencing
Arguente principal
 Kenny Rebelo (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2016 Analysis of the contribution of alternative splicing to glioma subtype definition
Arguente principal
 Teresa Maia (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2015 Familial genetics of primary spontaneous pneumothorax
Arguente principal
 David Francisco (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014 Analysis of RNA-seq data from the interaction of Coffea spp. - Colletotrichum kahawae
Arguente principal
 Joana Fino (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2014 Transcriptome profiling of spinal muscular atrophy models using RNA-Seq
Arguente principal
 Francisco Brito (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2011 Statistical methodologies for the analysis and normalization of rip-chip data,
Arguente principal
 Emiliano Hernandez (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2010 In silico analysis of miRNA promoters
Arguente principal
 Fernando Martins (Mestrado)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2024 - Atual Communications Biology (2399-3642) Springer Nature

Comissão de avaliação

Descrição da atividade
Tipo de assessoria 		Instituição / Organização Entidade financiadora
2023 - Atual Marie-Curie PostDoctoral Fellowships
Avaliador
 European Commission Marie Sklodowska-Curie Actions, Bélgica

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2022 - Atual Applied Computational Multi-Omics MSc in Computational Biology and Bioinformatics (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022 - Atual Gene Expression Modulation MSc in Computational Biology and Bioinformatics (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022 - Atual Introduction to Bioinformatics BSc in Cell and Molecular Biology (Bacharelato) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022 - Atual Molecular Genetics BSc in Cell and Molecular Biology (Bacharelato) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021 - Atual Fundamentals of Computational Biology MSc in Computational Biology and Bioinformatics (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018 - Atual Molecular Genomics and Evolution MSc in Molecular Genetics and Biomedicine (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018 - Atual Bioinformatics in Biomedicine MSc in Molecular Genetics and Biomedicine (Mestrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2024/02/06 - 2024/02/06 Computational Biosciences using HPC (2nd Edition) (Outros) Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2022/09/12 - 2022/09/12 Computational Biosciences using HPC (Outros) Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2012 - 2015 Computational Biology in Biomedicine MSc in Bioinformatics and Computational Biology (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2012 - 2015 Bioinformatics MSc in Oncobiology (Mestrado) Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina, Portugal

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação 		Instituição / Organização
2021 - Atual Member of the UCIBIO Council at FCT-NOVA
Membro
 REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2020 - Atual Member of the Council of the Department of Life Sciences (DCV) at FCT-NOVA
Membro
 Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020 - Atual Member of the Working Group for Communication at UCIBIO
Membro
 REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Revisão ad hoc de artigos em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2024 - Atual Communications Biology (2399-3642) Springer Nature
2014 - Atual Bioinformatics Oxford University Press
2014 - Atual BMC Bioinformatics Springer Nature
2014 - Atual BMC Cancer Springer Nature
2014 - Atual BMC Genomics Springer Nature
2014 - Atual Epigenomics Future Medicine
2014 - Atual Oncotarget Impact Journals

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2021 - Atual PhD Committee Member (as external member) Rita Silva
2019 - Atual PhD Committee Member (as external member) Tânia Marques
2018 - Atual PhD Committee Member (as external member) Mariana Ferreira
2022 - 2024 Marie-Curie PostDoctoral Fellow Paulo Caldas
2018 - 2023 PhD Committee Member (as external member) Nuno Agostinho
2018 - 2023 PhD Committee Member (as external member) Catarina Mendes
2020 - 2022 Postdoctoral Researcher Supervision Paulo Caldas
2019 - 2021 Postdoctoral Researcher Supervision João Neto
2019 - 2020 Young Researcher Supervision (MSc Holder Fellow) Rui Pinto
2018 - 2019 Postdoctoral Researcher Supervision Mafalda de Matos
2016 - 2017 Young Researcher Supervision (MSc Holder Fellow) Ana Margarida Ferreira
2013 - 2017 PhD Committee Member (as external member) Miguel Machado
2013 - 2017 PhD Committee Member (as external member) Tiago Jesus
2015 - 2016 Young Researcher Supervision (MSc Holder Fellow) Ioana Posa
Distinções

Prémio

2021 Pfizer Award
Pfizer Portugal, Portugal
2017 Pfizer Award
Pfizer Biofarmacêutica Sociedade Unipessoal Lda, Portugal
2011 Pfizer Award
Pfizer Biofarmacêutica Sociedade Unipessoal Lda, Portugal

Outra distinção

2018 FCT CEEC individual
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., Portugal
2014 FCT Investigator
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., Portugal
2010 FCT Post-Doctoral Fellowship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., Portugal
2006 PhD Fellowship
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., Portugal