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Inês Rodrigues Lopes graduated in Biochemistry at the University of Coimbra in 2014 and obtained her MSc degree in Biochemistry in 2016 at the University of Porto. Currently, she is a PhD student of the PhD Programme in Experimental Biology and Biomedicine (PDBEB), at the Center for Neuroscience and Cell Biology (CNC), University of Coimbra. Inês works in the areas of Microbiology and Cell Biology. Her studies focus on the virulence mechanisms and molecular processes operating in hosts infected with bacterial pathogens with high impact in human health, such as Staphylococcus aureus, Shigella flexneri, Salmonella Typhimurium, Escherichia coli and Group B Streptococcus. She has published 5 papers in peer-reviewed journals, mainly in the area of infectious diseases. During her PhD project, Inês characterized the infection profile of 191 Staphylococcus aureus clinical isolates within various host cell types. This comprehensive study was accomplished by integrating high-content, fluorescence microscopy-based and luminescence-based high-throughput screening approaches which established Staphylococcus aureus intracellular lifestyle as a prevalent feature of infection, with potential implications for the effective treatment of staphylococcal infections (Rodrigues Lopes I, et al., 2022). In addition, Inês screened a genome-wide collection of 1,920 transposon-mapped Staphylococcus aureus mutants (NTML collection), to identify bacterial factors that modulate different stages of Staphylococcus aureus intracellular infection within professional and non-professional phagocytes, to define novel therapeutic approaches.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Inês Rodrigues Lopes

Nomes de citação

  • Rodrigues Lopes, Inês
  • Lopes, Inês Rodrigues

Identificadores de autor

Ciência ID
4517-A68E-1EA0
ORCID iD
0000-0003-1527-543X

Endereços de correio eletrónico

  • ines.lopes13ns@gmail.com (Profissional)

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Microbiologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Celular

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2019 - 2022
Em curso
Experimental Biology and Biomedicine (Doutoramento)
Especialização em Biotecnologia e Saúde
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
"Staphylococcus aureus intracellular lifestyle: phenotypical profiles and underlying molecular determinants" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2014 - 2016
Concluído
Biochemistry (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Exploring the immunobiological basis of prospective strategies towards two human neonatal pathogens: Group B Streptococcus and Escherichia coli" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2010 - 2014
Concluído
Biochemistry (Licenciatura)
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal
"Chimeric studies: towards the non-invasive evaluation of renal grafts" (TESE/DISSERTAÇÃO)
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2017/09 - 2018/12 Investigador (Investigação) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2018/08 - 2018/09 Investigador visitante (Investigação) Universidade de São Paulo Hospital das Clínicas, Brasil
Universidade de São Paulo Hospital das Clínicas, Brasil
2017/01 - 2017/07 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2019/01 - Atual PhD student fellow Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2015/09 - 2016/12 Master student Fellow Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
2014/01 - 2014/07 Bachelor student Fellow Hospitais da Universidade de Coimbra Centro de Histocompatibilidade do Centro, Portugal
Hospitais da Universidade de Coimbra Centro de Histocompatibilidade do Centro, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2019/01 - Atual Staphylococcus aureus intracellular lifestyle: phenotypical profiles and underlying molecular determinants
PD/BD/146464/2019
Bolseiro de Doutoramento
Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/07 - 2022/12 Large-scale identification and functional characterization of host microRNAs regulating infection by clinically relevant Staphylococcus aureus strains
POCI-01-0145-FEDER-029999
Team member
Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2017/09 - 2018/12 Intracellular Staphylococcus aureus: deciphering bacterial and cellular factors involved in host cell invasion by clinically relevant strains to define new therapeutic approaches (StaphIn)
Infect-ERA/0001/2015
Bolseiro de Investigação
Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal
European Commission Seventh Framework Programme for Research and Technological Development Health
Em curso
2015/09 - 2016/12 Avaliação do impacto de uma nova vacina contra as doenças dos recém-nascidos causadas pelo estreptococos do grupo B na microbiota comensal
POCI-01-0145-FEDER-016607
Bolseiro de Mestrado
Universidade do Porto Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

European Regional Development Fund
Em curso
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Marta Ukleja; Lara Kricks; Gabriel Torrens; Ilaria Peschiera; Rodrigues Lopes, Inês; Marcin Krupka; Julia García-Fernández; et al. "Flotillin-mediated stabilization of unfolded proteins in bacterial membrane microdomains". Nature Communications 15 5583 (2024): https://doi.org/10.1038/s41467-024-49951-1.
    Publicado • 10.1038/s41467-024-49951-1
  2. Rodrigues Lopes, Inês; Alcantara, Laura Maria ; Silva, Ricardo Jorge; Josse, Jerome ; Vega, Elena Pedrero ; Cabrerizo, Ana Marina ; Bonhomme, Melanie ; et al. Autor correspondente: Eulalio, Ana. "Microscopy-based phenotypic profiling of infection by Staphylococcus aureus clinical isolates reveals intracellular lifestyle as a prevalent feature". Nature Communications 13 7174 (2022):
    Publicado • 10.1038/s41467-022-34790-9
  3. Aguilar, Carmen; Cruz, Ana Rita; Rodrigues Lopes, Ines; Maudet, Claire; Sunkavalli, Ushasree; Silva, Ricardo Jorge; Sharan, Malvika; et al. Autor correspondente: Eulalio, Ana. "Functional screenings reveal different requirements for host microRNAs in Salmonella and Shigella infection". Nature Microbiology 5 1 (2019): 192-205.
    Publicado • 10.1038/s41564-019-0614-3
  4. Rodrigues Lopes, Ines; Silva, Ricardo Jorge; Caramelo, Ines; Eulalio, Ana; Mano, Miguel. Autor correspondente: Mano, Miguel. "Shedding light on microRNA function via microscopy-based screening". Methods 152 (2019): 55-64.
    Publicado • 10.1016/j.ymeth.2018.09.011
  5. Tawk, Caroline; Nigro, Giulia; Rodrigues Lopes, Ines; Aguilar, Carmen; Lisowski, Clivia; Mano, Miguel; Sansonetti, Philippe; Vogel, Jörg; Eulalio, Ana. Autor correspondente: Eulalio, Ana. "Stress-induced host membrane remodeling protects from infection by non-motile bacterial pathogens". The EMBO Journal 37 23 (2018):
    Publicado • 10.15252/embj.201798529
  6. Cunha, Pedro P; Costa, Pedro M; Morais, Catarina M; Rodrigues Lopes, Inês; Cardoso, Ana M; Cardoso, Ana L; Mano, Miguel; Jurado, Amália S; Pedroso de Lima, Maria C. "High-throughput screening uncovers miRNAs enhancing glioblastoma cell susceptibility to tyrosine kinase inhibitors". Human Molecular Genetics 26 22 (2017): 4375-4387.
    Publicado • 10.1093/hmg/ddx323
Poster em conferência
  1. Rodrigues Lopes, Inês; Alcantara, Laura Maria ; Silva, Ricardo Jorge; Josse, Jerome; Vega, Elena Pedrero ; Cabrerizo, Ana Marina ; Bonhomme, Melanie ; et al. "Microscopy-based phenotypic profiling of infection by Staphylococcus aureus clinical isolates reveals intracellular lifestyle as a prevalent feature". Trabalho apresentado em EMBO| EMBL Symposium: New Approaches and Concepts in Microbiology, 2023.
  2. Rodrigues Lopes, Inês; Silva, Ricardo Jorge; Josse, Jerome; Vega, Elena P. ; Bonhomme, Melanie ; Lopez, Daniel ; Laurent, Frederic; et al. "Microscopy-based phenotypic profiling of infection by Staphylococcus aureus clinical isolates reveals intracellular lifestyle as a prevalent feature". Trabalho apresentado em BEB Day 2022- The Overview Effect, 2022.
  3. Rodrigues Lopes, Inês; Silva, Ricardo Jorge; Josse, Jerome ; Vega, Elena P. ; Bonhomme, Melanie ; Lopez, Daniel ; Laurent, Frederic; et al. Autor correspondente: Eulalio, Ana. "Microscopy-based phenotypic profiling of infection by Staphylococcus aureus clinical isolates reveals intracellular lifestyle as a prevalent feature". Trabalho apresentado em EMBO| EMBL Symposium: New Approaches and Concepts in Microbiology, 2021.
  4. Cunha, Pedro; Morais, Catarina; Rodrigues Lopes, Inês; Mestre, Beatriz; Jurado, Amália S; Pedroso de Lima, Maria C. "Differentiation therapy toward glioblastoma stem-like cells". Trabalho apresentado em XII Spanish-Portuguese Conference on Controlled Drug Delivery, 2018.
  5. Carvalho, Diana; Marques, Bruno ; Rodrigues Lopes, Inês; Simões, Olivia ; Gomes, José ; Gonçalves, Ana ; Mateus, Rosário; et al. "Potential molecular markers of chronic dysfunction in urine of kidney transplant patients". Trabalho apresentado em 29th European Immunogenetics and Histocompatibility Conference, 2015.
Tese / Dissertação
  1. Lopes, Inês. "Exploring the immunobiological basis of prospective strategies towards two human neonatal pathogens: Group B Streptococcus and Escherichia coli". Mestrado, Universidade do Porto Faculdade de Ciências, 2016.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2022/09 Microscopy-based phenotypic profiling of infection by Staphylococcus aureus clinical isolates reveals intracellular lifestyle as a prevalent feature Innovative Therapies Retreat 2022
Center for Innovative Biomedicine and Biotechnology (Coimbra, Portugal)
2022/02 Microscopy-based phenotypic profiling of infection by Staphylococcus aureus clinical isolates reveals intracellular lifestyle as a prevalent feature High-Throughput Screening for Target and Drug Discovery Course (PDBEB)
University of Coimbra (Coimbra, Portugal)
2021/09 Microscopy-based phenotypic profiling of infection by Staphylococcus aureus clinical isolates reveals intracellular lifestyle as a prevalent feature Innovative Therapies Retreat 2021
Center for Innovative Biomedicine and Biotechnology (Coimbra, Portugal)
2019/12 Interaction of Staphylococcus aureus with host cells: evaluation of the prevalence of the intracellular lifestyle Microbiotec 19
Sociedade Portuguesa de Microbiologia, Sociedade Portuguesa de Biotecnologia (Coimbra, Portugal)
2016/02 Deciphering the innate immune response of neonates to the pathogen Escherichia coli 9th IJUP | Investigação Jovem da Universidade do Porto
Universidade do Porto (Porto, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2019/12/09 - 2019/12/10 BEBDAY 2019 (2019/12/09 - 2019/12/10)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2021/02/01 - 2021/02/05 High-Throughput Screening for Target and Drug Discovery Course
Oficina (workshop)
High-Throughput Screening for Target and Drug Discovery
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2019/04/01 - 2019/04/05 Host and Microbe Interactions II (Biology at the Host Microbe Interface PHD Program)
Oficina (workshop)
Host and Microbe Interactions II (Biology at the Host Microbe Interface PHD Program)
Universidade de Lisboa Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica, Portugal
2019/03/18 - 2019/03/22 Fighting Infection Course (PDBEB)
Oficina (workshop)
Fighting Infection
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2017/09/14 - 2017/09/14 High Content Imaging and Complementary Techonologies
Oficina (workshop)
High Content Imaging and Complementary Techonologies
PerkinElmer Inc, Estados Unidos
2016/07/15 - 2016/07/15 GABBA Annual Symposium: Breaking Boundaries in Science
Simpósio
GABBA Annual Symposium: Breaking Boundaries in Science
Universidade do Porto, Portugal
2014/03/24 - 2014/03/24 Células Estaminais: da investigação básica à aplicação terapêutica
Oficina (workshop)
Células Estaminais: da investigação básica à aplicação terapêutica
Instituto Português do Sangue e da Transplantação IP, Portugal
2013/06/08 - 2013/06/08 2nd BEB Symposium: Seeding Curiosity, Harvesting Science
Simpósio
2nd BEB Symposium: Seeding Curiosity, Harvesting Science
Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal