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Cláudia Patrícia Almeida Alves. Completed the Doutoramento in Biotecnologia e Biociências in 2021/05/14 by Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Mestrado in Mestrado Integrado em Engenharia Biológica in 2014 by Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico and Licenciatura in Mestrado Integrado em Engenharia Biológica in 2013 by Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico. Is Contracted Researcher in Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento. Published 11 articles in journals. Organized 1 event(s). Participated in 2 event(s). Participates and/or participated as PhD Student Fellow in 1 project(s). Works in the area(s) of Engineering and Technology with emphasis on Industrial Biotechnology, Engineering and Technology with emphasis on Industrial Biotechnology with emphasis on Bioprocessing Technologies, Engineering and Technology with emphasis on Industrial Biotechnology with emphasis on Fermentation, Natural sciences with emphasis on Biological Sciences with emphasis on Molecular Biology and Medical and Health Sciences with emphasis on Medical Biotechnology with emphasis on Gene-based Diagnostics and Therapeutic Interventions. In his curriculum Ciência Vitae the most frequent terms in the context of scientific, technological and artistic-cultural output are: Bactérias ácido lácticas; DNA plasmídico; Biologia sintética; Engenharia de estirpes; Celulose; Módulos de Ligação a Carbohidratos; Reconhecimento Biomolecular; Materiais Funcionais Avançados; 5'-UTR; Minicircle; Ribosome binding site; translational initiation rate; mRNA secondary structure; parA resolvase; Gene therapy; Hydrophobic interaction chromatography; Nicking endonuclease; Purification; Multimodal chromatography; Plasmid DNA; Supercoiling; Plasmid isoforms; Separation; minicircle DNA; non-viral DNA vector; biopharmaceuticals; chromatography; B-Z transition; Superhelically induced duplex destabilization; gene therapy; VEGF; angiogenesis; mesenchymal stem/stromal cells (MSC); minicircles; hydrophobic interaction chromatography; minicircle; nicking endonuclease; non-viral vector; purification; .
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Cláudia Patrícia Almeida Alves

Nomes de citação

  • Alves, Cláudia
  • Alves, CPA
  • Cláudia P.A. Alves

Identificadores de autor

Ciência ID
EE1A-A713-343E
ORCID iD
0000-0002-5626-9100
Scopus Author Id
57188665467

Domínios de atuação

  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial - Tecnologias de BioProcessamento
  • Ciências da Engenharia e Tecnologias - Biotecnologia Industrial - Fermentação
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
  • Ciências Médicas e da Saúde - Biotecnologia Médica - Diagnóstico e Terapias de Base Genética

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C1)
Formação
Grau Classificação
2016/09/12 - 2021/05/14
Concluído
 Biotecnologia e Biociências (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
""Escherichia coli Genome Engineering For Improved Minicircle Production"" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Pass with distinction
2014
Concluído
 Mestrado Integrado em Engenharia Biológica (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Development of a method for the purification of minicircles" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16
2013
Concluído
 Mestrado Integrado em Engenharia Biológica (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"n/a" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 13
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2024/04/22 - Atual Pós-doutorado (Investigação) FCiênciasID Associação para a Investigação e Desenvolvimento de Ciências, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas, Portugal
2021/11/01 - 2022/03/31 Investigador Contratado (Investigação) Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
2015/09/01 - 2016/08/31 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
2015/02/01 - 2015/05/31 Assistente de Investigação (carreira) (Investigação) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2016/09/01 - 2020/10/31 PhD scholarship Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2014/12/13 - 2015/01/31 Voluntary fellowship Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2016/09/01 - 2020/10/31 CRISPR/Cas9-based engineering of Escherichia coli for BioBrick based minicircles
PD/BD/116842/2016
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2018/10/01 - 2022/04/30 Lactic acid bacteria as cell factories: a Synthetic Biology approach for plasmid DNA and recombinant protein production
PTDC/BTM-SAL/28624/2017
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018/09/01 - 2021/12/31 Biorecognition as a Tool for the Functionalization of Cellulose-based Materials with Biomolecules and Nanostructures
PTDC/CTM-CTM/30790/2017
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 Institute for Bioengineering and Biosciences
UID/BIO/04565/2019
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Ulpiano, Cristiana; Alves, Claudia A. P.; Silva-Santos, A. Rita; Serra, Joana; da Silva, Claudia L.; Monteiro, Gabriel A.. "RNAi as a tool to inhibit the angiogenic potential of human Mesenchymal Stem/Stromal Cells in malignancy". Trabalho apresentado em 6th IEEE Portuguese Meeting on Bioengineering (ENBENG), 2019.
    10.1109/enbeng.2019.8692558
Artigo em revista
  1. Cláudia P.A. Alves; Duarte Miguel F. Prazeres; Gabriel A. Monteiro. "Recombination efficiency measurement by real-time PCR: A strategy to evaluate ParA-mediated minicircle production". Analytical Biochemistry 628 (2021): 114285-114285. https://doi.org/10.1016/j.ab.2021.114285.
    10.1016/j.ab.2021.114285
  2. Serra, Joana; Alves, Cláudia P. A.; Cabral, Joaquim M. S.; Monteiro, Gabriel A.; Silva, Cláudia L.; Prazeres, Duarte Miguel F.. "Minicircle-based expression of vascular endothelial growth factor in mesenchymal stromal cells from diverse human tissues". The Journal of Gene Medicine 23 (2021): e3342. http://dx.doi.org/10.1002/jgm.3342.
    10.1002/jgm.3342
  3. Alves, Cláudia P. A.; Prazeres, Duarte Miguel F.; Monteiro, Gabriel A.. "Minicircle Biopharmaceuticals-An Overview of Purification Strategies". Frontiers in Chemical Engineering 2 (2021): 612594. http://dx.doi.org/10.3389/fceng.2020.612594.
    Acesso aberto • Publicado • 10.3389/fceng.2020.612594
  4. Silva-Santos, A. Rita; Alves, Cláudia P.A.; Monteiro, Gabriel; Azevedo, Ana M.; Prazeres, Duarte Miguel F.. "Multimodal chromatography of supercoiled minicircles: A closer look into DNA-ligand interactions". Separation and Purification Technology 212 (2019): 161-170. http://dx.doi.org/10.1016/j.seppur.2018.11.015.
    Publicado • 10.1016/j.seppur.2018.11.015
  5. Serra, Joana; Alves, Cláudia P.A.; Brito, Liliana; Monteiro, Gabriel A.; Cabral, Joaquim M.S.; Prazeres, Duarte Miguel F.; da Silva, Cláudia L.. "Engineering of Human Mesenchymal Stem/Stromal Cells with Vascular Endothelial Growth Factor-Encoding Minicircles for Angiogenic Ex Vivo Gene Therapy". Human Gene Therapy 30 3 (2019): 316-329. http://dx.doi.org/10.1089/hum.2018.154.
    Publicado • 10.1089/hum.2018.154
  6. Alves, Cláudia P. A.; Šimcíková, Michaela; Brito, Liliana; Monteiro, Gabriel A.; Prazeres, Duarte Miguel F.. "Production and Purification of Supercoiled Minicircles by a Combination of In Vitro Endonuclease Nicking and Hydrophobic Interaction Chromatography". Human Gene Therapy Methods 29 4 (2018): 157-168. http://dx.doi.org/10.1089/hgtb.2018.046.
    Publicado • 10.1089/hgtb.2018.046
  7. Silva-Santos, A. Rita; Alves, Cláudia P.A.; Prazeres, Duarte Miguel F.; Azevedo, Ana M.. "A process for supercoiled plasmid DNA purification based on multimodal chromatography". Separation and Purification Technology 182 (2017): 94-100. http://dx.doi.org/10.1016/j.seppur.2017.03.042.
    Publicado • 10.1016/j.seppur.2017.03.042
  8. Šimcíková, Michaela; Alves, Cláudia P. A.; Brito, Liliana; Prather, Kristala L. J.; Prazeres, Duarte M. F.; Monteiro, Gabriel A.. "Improvement of DNA minicircle production by optimization of the secondary structure of the 5'-UTR of ParA resolvase". Applied Microbiology and Biotechnology 100 15 (2016): 6725-6737. http://dx.doi.org/10.1007/s00253-016-7565-x.
    Publicado • 10.1007/s00253-016-7565-x
  9. Alves, Cláudia P.A.; Šimcíková, Michaela; Brito, Liliana; Monteiro, Gabriel A.; Prazeres, Duarte Miguel F.. "Development of a nicking endonuclease-assisted method for the purification of minicircles". Journal of Chromatography A 1443 (2016): 136-144. http://dx.doi.org/10.1016/j.chroma.2016.03.035.
    Publicado • 10.1016/j.chroma.2016.03.035
  10. Alves, C.P.A.; Duarte, S.O.D.; Monteiro, G.A.; Prazeres, D.M.F.. "Use of an E. coli pgi Knockout Strain as a Plasmid Producer". BioPharm International 29 2 (2016): 38-42. https://www.biopharminternational.com/view/use-e-coli-pgi-knockout-strain-plasmid-producer.
    Acesso aberto • Publicado
  11. Silva-Santos, A.R.; Alves, C.P.A.; Prazeres, D.M.F.; Azevedo, A.M.. "Separation of plasmid DNA topoisomers by multimodal chromatography". Analytical Biochemistry 503 (2016): 68-70. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84964681172&partnerID=MN8TOARS.
    Publicado • 10.1016/j.ab.2016.03.012
Capítulo de livro
  1. Alves, Cláudia P. A.; Prazeres, Duarte Miguel F.; Monteiro, Gabriel A.. "Real-Time PCR Method for Assessment of ParA-Mediated Recombination Efficiency in Minicircle Production". In Methods in Molecular Biology, 117-131. Springer US, 2023.
    10.1007/978-1-0716-3358-8_10
Poster em conferência
  1. Cláudia P.A. Alves; Duarte Miguel F. Prazeres; Gabriel A. Monteiro. "Development of a real-time PCR method to evaluate ParA-mediated recombination efficiency in minicircle production". Trabalho apresentado em ESBES 2021, virtual conference, 2021.
  2. Cláudia P.A. Alves; Duarte Miguel F. Prazeres; Gabriel A. Monteiro. "Determination of recombination efficiency by real-time PCR - a strategy to evaluate minicircle production". Trabalho apresentado em Microbiotec'19 Congress of Microbiology and Biotechnology, 2019.
  3. Cláudia P.A. Alves; Duarte Miguel F. Prazeres; Gabriel A. Monteiro. "Improving minicircle DNA production by in silico re-design of the ParA resolvase untranslated region". Trabalho apresentado em ESBES 2018, 12th European Symposium on Biochemical Engineering Sciences, 2018.
  4. A. Rita Silva-Santos; Cláudia P. A. Alves; Gabriel A. Monteiro; Ana M. Azevedo; Duarte Miguel F. Prazeres. "Multimodal chromatography of supercoiled minicircles: a closer look into DNA-ligand interactions". Trabalho apresentado em ESBES 2018, 12th European Symposium on Biochemical Engineering Sciences, 2018.
  5. Cláudia P.A. Alves; Michaela Simcikova; Duarte Miguel F. Prazeres; Gabriel A. Monteiro. "Optimization of ParA resolvase untranslated region - a strategy to boost minicircle DNA production". Trabalho apresentado em Microbiotec'17 Congress of Microbiology and Biotechnology, 2017.
  6. Cláudia P.A. Alves; Michaela Simcikova; Liliana Brito; Kristala L. J. Prather; Gabriel A. Monteiro; Duarte Miguel F. Prazeres. "Development of a Nuclease-assisted Method for the Purification of Minicircles". Trabalho apresentado em Microbiotec’15 Congress of Microbiology and Biotechnology, 2015.
  7. A. Rita Silva-Santos; Cláudia P.A. Alves; Ana M. Azevedo; Duarte Miguel F. Prazeres. "Separation of plasmid DNA topoisomers by multimodal chromatography". Trabalho apresentado em Microbiotec’15 Congress of Microbiology and Biotechnology, 2015.
  8. Sofia O.D. Duarte; Cláudia P.A. Alves; Maria C. Martins; Diana Cipriano; Inês N. Silva; Leonilde M. Moreira; Duarte Miguel F. Prazeres; Gabriel A. Monteiro. "Is increased plasmid DNA production in the Escherichia coli pgi knockout GALG20 strain linked to unintentional genomic deletions?". Trabalho apresentado em Microbiotec’15 Congress of Microbiology and Biotechnology, 2015.
  9. Liliana Brito; Michaela Simcikova; Joana Boura; Ana Marisa Salgueiro; Cláudia Alves; António Fiarresga; Cláudia Lobato da Silva; et al. "Transient engineered human Mesenchymal Stem Cells to promote angiogenesis". Trabalho apresentado em iMed Lisbon, 2014.
Tese / Dissertação
  1. Alves, CPA. "Escherichia coli genome engineering for improved minicircle production". Doutoramento, Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, 2021.
  2. Alves, CPA. "Development of a method for the purification of minicircles". Mestrado, Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, 2014.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2019 Improving minicircle DNA production in E. coli - in vivo analysis of recombination efficiency after re-design of ParA resolvase 5'-UTR Microbiotec'19 Congress of Microbiology and Biotechnology
(Coimbra, Portugal)
2016 Purification of supercoiled minicircles by a nicking endonuclease-assisted hydrophobic interaction chromatography method BioIberoAmerica
(Salamanca, Espanha)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2017/06/02 - 2018/09/12 Participation in the Organizing Committee of the 12th Symposium of the European Society of Biochemical Engineering Sciences (ESBES2018) (2018/09/09 - 2018/09/12)
Simpósio (Membro da Comissão Organizadora)
 Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2018/09/18 - 2018/09/22 Cell Culture-based Viral Vaccines Course, 3rd Edition
Oficina (workshop)
European Society Of Animal Cell Technology, Alemanha
2017/09/24 - 2017/09/28 Animal Cell Technology course, 7th edition
Oficina (workshop)
European Society Of Animal Cell Technology, Alemanha

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2023/11/28 3D-Printed Matrices for the Purification of Plasmid DNA
Arguente
 Joana da Costa Silva (Mestrado)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal