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Ana M Lopes completed her PhD in Biodiversity, Genetic and Evolution on June 2016 at the University of Porto in collaboration with INSERM-Nantes, where the work was partially developed. She was Post-Doc Fellow (FCT grant) from 2016-2019 in InBIO and in 2019 she started a Researcher position at the same institution (contract funded by FCT). She has been developing research on the co-evolutionary mechanisms that drive host-pathogen interactions, using rabbit hemorrhagic disease virus and the European rabbit as a model. She recently expanded her research to other viruses and models, e.g. adenovirus in squirrels and Hepatitis E virus in rabbits. She is PI of an FCT-funded project (RESTART) and was Co-PI of a PRIMA Foundation Project (LAGMED), both awarded in competitive calls. She supervised 3 BSc internships, 2 MSc student, 2 ERASMUS students, and gave tutoring to several other students (MSc and PhD) and research technicians. She authored or co-authored 40 papers in international peer-reviewed journals (11 as first author, 2 as co-first author and 1 as senior author), which were cited 1468 times (h-index of 19). The vast majority of these papers were published in first quartile (Q1) journals, such as Plos Pathogens (3), Scientific Reports (4) and Journal of Virology (2). She participated in several international conferences and organized three scientific meetings. She is a member of the Animal Welfare Ethics and Review Body of BIOPOLIS, and is a regular reviewer for 9 top journals in the field of Virology. She has also been engaged in outreach and science education activities, participating in several events for the general public, such as Bioblitz and International Microorganism Day in Centro de Ciência Viva.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
ANA MARGARIDA LIMA LOPES

Nomes de citação

  • Lopes, Ana M

Identificadores de autor

Ciência ID
2E16-D219-A9EC
ORCID iD
0000-0002-7176-0969

Telefones

Telefone
  • (+351) 252660400 (Profissional)

Moradas

  • Rua Padre Armando Quintas 7, 4460-485, Vairão, Vila do Conde, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Virologia
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia da Evolução das Espécies

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2)
Espanhol; Castelhano Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A2) Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A2)
Formação
Grau Classificação
2021/06 - 2021/06
Concluído
Pathogen Multiomics and Bioinformatics (Outros)
Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal
2019/06/11 - 2019/06/18
Concluído
Curso de Formação em Cultura de Células (Outros)
Universidade do Porto Faculdade de Medicina, Portugal
2018/11 - 2019/03
Concluído
Wildlife Epidemiology and Disease Control (Outros)
Instituto de Investigación de Recursos Cinegeticos, Espanha
2016/06/06
Concluído
Biodiversidade, Genética e Evolução (Doutoramento)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Insights into the host-pathogen interactions: Lagovirus in leporids" (TESE/DISSERTAÇÃO)
2011/12/07
Concluído
Biodiversidade, Genética e Evolução (Mestrado integrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Genetic variability in genes associated with physiological and adaptive functions in Lagomorphs" (TESE/DISSERTAÇÃO)
18
2010 - 2011
Concluído
The intriguing case of PP1 binding to Tctex1d4 of pika (Ochotona sp) (Outros)
Universidade de Aveiro, Portugal
2006 - 2009/07/08
Concluído
Biologia (Licenciatura)
Universidade do Porto, Portugal
16
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2019/06/01 - Atual Investigador Contratado (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2016/12/01 - 2019/05/31 Pós-doutorado (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
(...)
2016/03/01 - 2016/11/30 Estagiário de Investigação (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2010/06/15 - 2012/02/29 Estagiário de Investigação (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2016/12/01 - Atual Collaborator Universidade do Porto Unidade Multidisciplinar de Investigação Biomédica, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2016/12/01 - 2019/05/31 The impact of the new variant of rabbit hemorrhagic disease virus (RHDV2) in different European rabbit populations: a study of co-evolution, virulence and infection
SFRH/BPD/115211/2016
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade do Porto Unidade Multidisciplinar de Investigação Biomédica, Portugal

Anses Laboratoire de Ploufragan-Plouzané, França
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2012/03/01 - 2016/02/29 Insights into the host-pathogen interactions: Lagovirus in leporids
SFRH/BD/78738/2011
Bolseiro de Doutoramento
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

ERL Centre de Cancérologie et d'Immunologie Nantes-Angers, França
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/05/01 - 2012/02/29 Why the Myxoma virus infection is highly lethal for the European rabbit (Oryctolagus cuniculus), while in other leporids it is benign?
n.a.
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Projeto

Designação Financiadores
2019/06/01 - Atual CEECIND/01388/2017
CEECIND/01388/2017
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology (InBIO)
LA/P/0048/2020
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2020/01/01 - 2023/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
UIDB/50027/2020
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2020/01/01 - 2023/12/31 Research Network in Biodiversity and Evolutionary Biology
UIDP/50027/2020
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal

Fundação Gaspar Frutuoso, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído

Outro

Designação Financiadores
2023/12/23 - Atual Hepatitis E in rabbits (Oryctolagus cuniculus): a zoonotic risk for public health?
2023.00158.RESTART
Investigador responsável
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/05/17 - Atual ZoonoMed - Iberian species of the Mediterranean ecosystem as reservoirs for emerging zoonotic viruses
PTDC/CVT-CVT/0143/2021
Investigador
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022 - Atual BAGA-PT: BAGAza in PorTugal: epidemiological assessment of emergent flavivirus at environment-wildlife-livestock-human interface
2022.09263.PTDC
Investigador
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/09/01 - Atual LAGMED - Improvement of preventive actions to emerging LAGoviruses in the MEDiterranean basin: development and optimisation of methodologies for pathogen detection and control
PRIMA/0003/2018
Investigador
Partnership for Research and Innovation in the Mediterranean Area

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2017 - 2020 +Coelho: plano de acção para o controlo da doença hemorrágica viral dos coelhos
n.a.
Investigador
Fundo Florestal Permanente
Concluído
2015 - 2018/09/30 ECALEP - Emergence of highly pathogenic CAliciviruses in LEporidae through species jumps involving reservoir host introduction
Era-Net ANIHWA
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Concluído
2015 - 2017 SOS COELHO: Bases para a recuperação de uma espécie chave nos ecossistemas Ibéricos
n.a.
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundo para a Conservação da Natureza e da Biodiversidade
Concluído
2013/05/30 - 2016/04/30 Evaluation of the virulence of RHDV (Rabbit Hemorragic Disease Virus) and mechanisms of host resistance
n.a.
Bolseiro de Investigação
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Agence nationale de la recherche
Concluído
2010 - 2013 Host-pathogen interaction: the Rabbit Haemorrhagic Disease (RHD) and the European Brown Hare Syndrome (EBHS)
n.a.
Investigador
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
Universidade do Algarve Faculdade de Ciências e Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Joana Abrantes; Stéphane Bertagnoli; Patrizia Cavadini; Pedro Esteves; Dolores Gavier-Widen; Robyn Hall; antonio lavazza; et al. "Comment on Shah et al. Genetic Characteristics and Phylogeographic Dynamics of Lagoviruses, 1988–2021. Viruses 2023, 15, 815". Viruses (2024): https://www.mdpi.com/1999-4915/16/6/927.
    Publicado • 10.3390/v16060927
  2. Almeida, Tereza; Lopes, Ana M.; Estruch, Josep; Rouco, Carlos; Cavadini, Patrizia; Neimanis, Aleksija; Gavier-Widén, Dolores; et al. "A new HaCV-EBHSV recombinant lagovirus circulating in European brown hares (Lepus europaeus) from Catalonia, Spain". Scientific Reports 14 1 (2024): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-53201-1.
    Publicado • 10.1038/s41598-024-53201-1
  3. Lopes, Ana M.; Abrantes, Joana. "On the virome’s hidden diversity: lessons from RHDV". mBio 14 6 (2023): http://dx.doi.org/10.1128/mbio.01971-23.
    Publicado • 10.1128/mbio.01971-23
  4. Sahraoui, Lynda; Lahouassa, Hichem; Maziz-Bettahar, Samia; Lopes, Ana M.; Almeida, Tereza; Ainbaziz, Hacina; Abrantes, Joana. "First detection and molecular characterization of rabbit hemorrhagic disease virus (RHDV) in Algeria". Frontiers in Veterinary Science 10 (2023): http://dx.doi.org/10.3389/fvets.2023.1235123.
    Publicado • 10.3389/fvets.2023.1235123
  5. Lopes, Ana M.; Almeida, Tereza; Diz, Sílvia; Côrte-Real, João V.; Osório, Hugo C.; Ramilo, David W.; Rebelo, Maria Teresa; et al. "The potential role of scavenging flies as mechanical vectors of Lagovirus europaeus/GI.2". Virology Journal 20 1 (2023): http://dx.doi.org/10.1186/s12985-023-02065-4.
    Publicado • 10.1186/s12985-023-02065-4
  6. Alberto Moraga-Fernández; Marta Sánchez-Sánchez; João Queirós; Ana M. Lopes; Joaquín Vicente; Xosé Pardavila; Jorge Sereno-Cadierno; et al. "A study of viral pathogens in bat species in the Iberian Peninsula: identification of new coronavirus genetic variants". International Journal of Veterinary Science and Medicine (2022): https://doi.org/10.1080/23144599.2022.2139985.
    10.1080/23144599.2022.2139985
  7. Henrique Pacheco; Ana M. Lopes; Juan Bárcena; Esther Blanco; Joana Abrantes; Pedro Esteves; Rémi Choquet; Paulo Célio Alves; Nuno Santos. "Multi-event capture–recapture models estimate the diagnostic performance of serological tests for myxoma and rabbit haemorrhagic disease viruses in the absence of reference samples". Transboundary and Emerging Diseases (2022): https://doi.org/10.1111/tbed.14657.
    10.1111/tbed.14657
  8. Roser Velarde; Joana Abrantes; Ana M. Lopes; Josep Estruch; João V. Côrte-Real; Pedro J. Esteves; Ignacio García-Bocanegra; Jordi Ruiz-Olmo; Carlos Rouco. "Spillover event of recombinant Lagovirus europaeus /GI.2 into the Iberian hare (Lepus granatensis) in Spain". Transboundary and Emerging Diseases (2021): https://doi.org/10.1111/tbed.14264.
    Publicado • 10.1111/tbed.14264
  9. Ben Chehida, Faten; Lopes, Ana M.; Côrte-Real, João V.; Sghaier, Soufien; Aouini, Rim; Messadi, Lilia; Abrantes, Joana. "Multiple Introductions of Rabbit Hemorrhagic Disease Virus Lagovirus europaeus/GI.2 in Africa". Biology 10 9 (2021): 883. http://dx.doi.org/10.3390/biology10090883.
    Publicado • 10.3390/biology10090883
  10. Joana Abrantes; Ana M. Lopes. "A Review on the Methods Used for the Detection and Diagnosis of Rabbit Hemorrhagic Disease Virus (RHDV)". Microorganisms 9 5 (2021): 972-972. https://doi.org/10.3390/microorganisms9050972.
    10.3390/microorganisms9050972
  11. João Vasco Côrte-Real; Ana Margarida Lopes; Hugo Rebelo; João Paulo Lopes; Francisco Amorim; Ricardo Pita; Jorge Correia; et al. "Adenovirus emergence in a red squirrel ( Sciurus vulgaris ) in Iberian Peninsula". Transboundary and Emerging Diseases (2020): https://doi.org/10.1111/tbed.13627.
    10.1111/tbed.13627
  12. Abrantes, Joana; Droillard, Clément; Lopes, Ana M.; Lemaitre, Evelyne; Lucas, Pierrick; Blanchard, Yannick; Marchandeau, Stéphane; Esteves, Pedro J.; Le Gall-Reculé, Ghislaine. "Recombination at the emergence of the pathogenic rabbit haemorrhagic disease virus Lagovirus europaeus/GI.2". Scientific Reports 10 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-71303-4.
    10.1038/s41598-020-71303-4
  13. Joana Abrantes; Ana M. Lopes; Evelyne Lemaitre; Harri Ahola; Fereshteh Banihashem; Clément Droillard; Stéphane Marchandeau; et al. "Retrospective Analysis Shows That Most RHDV GI.1 Strains Circulating Since the Late 1990s in France and Sweden Were Recombinant GI.3P–GI.1d Strains". Genes (2020): https://doi.org/10.3390/genes11080910.
    10.3390/genes11080910
  14. Ana M. Lopes; Joana Abrantes. "Hepatitis E virus is likely circulating in wild rabbits from Iberian Peninsula". Transboundary and Emerging Diseases (2020): https://doi.org/10.1111/tbed.13702.
    10.1111/tbed.13702
  15. Neves, Fabiana; Abrantes, Joana; Lopes, Ana M.; Fusinatto, Luciana A.; Magalhães, Maria J.; van der Loo, Wessel; Esteves, Pedro J.. "Evolution of CCL16 in Glires (Rodentia and Lagomorpha) shows an unusual random pseudogenization pattern". BMC Evolutionary Biology 19 1 (2019): http://dx.doi.org/10.1186/s12862-019-1390-7.
    Publicado • 10.1186/s12862-019-1390-7
  16. Ana M. Lopes; Carlos Rouco; Pedro J. Esteves; Joana Abrantes. "GI.1b/GI.1b/GI.2 recombinant rabbit hemorrhagic disease virus 2 (Lagovirus europaeus/GI.2) in Morocco, Africa". Archives of Virology 164 1 (2019): 279-283. https://doi.org/10.1007/s00705-018-4052-y.
    10.1007/s00705-018-4052-y
  17. Neimanis, Aleksija S.; Ahola, Harri; Larsson Pettersson, Ulrika; Lopes, Ana M.; Abrantes, Joana; Zohari, Siamak; Esteves, Pedro J.; Gavier-Widén, Dolores. "Overcoming species barriers: an outbreak of Lagovirus europaeus GI.2/RHDV2 in an isolated population of mountain hares (Lepus timidus)". BMC Veterinary Research 14 1 (2018): http://dx.doi.org/10.1186/s12917-018-1694-7.
    Publicado • 10.1186/s12917-018-1694-7
  18. Esteves, Pedro J.; Abrantes, Joana; Baldauf, Hanna-Mari; BenMohamed, Lbachir; Chen, Yuxing; Christensen, Neil; González-Gallego, Javier; et al. "The wide utility of rabbits as models of human diseases". Experimental & Molecular Medicine 50 5 (2018): 1-10. http://dx.doi.org/10.1038/s12276-018-0094-1.
    Publicado • 10.1038/s12276-018-0094-1
  19. Silvério, D.; Lopes, A. M.; Melo-Ferreira, J.; Magalhães, M. J.; Monterroso, P.; Serronha, A.; Maio, E.; et al. "Insights into the evolution of the new variant rabbit haemorrhagic disease virus (GI.2) and the identification of novel recombinant strains". Transboundary and Emerging Diseases 65 4 (2018): 983-992. http://dx.doi.org/10.1111/tbed.12830.
    10.1111/tbed.12830
  20. Lopes, Ana M.; Breiman, Adrien; Lora, Mónica; Le Moullac-Vaidye, Béatrice; Galanina, Oxana; Nyström, Kristina; Marchandeau, Stephane; et al. "Host specific glycans are correlated with susceptibility to infection by lagoviruses, but not with their virulence". Journal of Virology (2017): JVI.01759-17. http://dx.doi.org/10.1128/jvi.01759-17.
    Publicado • 10.1128/jvi.01759-17
  21. Lopes, Ana M.; Blanco-Aguiar, Jose; Martín-Alonso, Aaron; Leitão, Manuel; Foronda, Pilar; Mendes, Marco; Gonçalves, David; Abrantes, Joana; Esteves, Pedro J.. "Full genome sequences are key to disclose RHDV2 emergence in the Macaronesian islands". Virus Genes 54 1 (2017): 1-4. http://dx.doi.org/10.1007/s11262-017-1523-2.
    10.1007/s11262-017-1523-2
  22. Rouco, C.; Abrantes, J.; Serronha, A.; Lopes, A. M.; Maio, E.; Magalhães, M. J.; Blanco, E.; et al. "Epidemiology of RHDV2 (Lagovirus europaeus /GI.2) in free-living wild European rabbits in Portugal". Transboundary and Emerging Diseases 65 2 (2017): e373-e382. http://dx.doi.org/10.1111/tbed.12767.
    Publicado • 10.1111/tbed.12767
  23. Lopes, Ana M.; Silvério, Diogo; Magalhães, Maria J.; Areal, Helena; Alves, Paulo C.; Esteves, Pedro J.; Abrantes, Joana. "Characterization of old RHDV strains by complete genome sequencing identifies a novel genetic group". Scientific Reports 7 1 (2017): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-13902-2.
    10.1038/s41598-017-13902-2
  24. Le Pendu, Jacques; Abrantes, Joana; Bertagnoli, Stéphane; Guitton, Jean-Sébastien; Le Gall-Reculé, Ghislaine; Lopes, Ana Margarida; Marchandeau, Stéphane; et al. "Proposal for a unified classification system and nomenclature of lagoviruses". Journal of General Virology 98 7 (2017): 1658-1666. http://dx.doi.org/10.1099/jgv.0.000840.
    Publicado • 10.1099/jgv.0.000840
  25. Lopes, Ana M.; Magalhães, Maria J.; Alves, Paulo C.; Esteves, Pedro J.; Abrantes, Joana. "An update on the rabbit hemorrhagic disease virus (RHDV) strains circulating in Portugal in the 1990s: earliest detection of G3-G5 and G6". Archives of Virology 162 7 (2017): 2061-2065. http://dx.doi.org/10.1007/s00705-017-3318-0.
    10.1007/s00705-017-3318-0
  26. Monterroso, Pedro; Garrote, Germán; Serronha, Ana; Santos, Emídio; Delibes-Mateos, Miguel; Abrantes, Joana; Perez de Ayala, Ramón; et al. "Disease-mediated bottom-up regulation: An emergent virus affects a keystone prey, and alters the dynamics of trophic webs". Scientific Reports 6 1 (2016): http://dx.doi.org/10.1038/srep36072.
    10.1038/srep36072
  27. Esteves, Pedro José; Abrantes, Joana; Bertagnoli, Stéphane; Cavadini, Patrizia; Gavier-Widén, Dolores; Guitton, Jean-Sébastien; Lavazza, Antonio; et al. "Emergence of Pathogenicity in Lagoviruses: Evolution from Pre-existing Nonpathogenic Strains or through a Species Jump?". PLOS Pathogens 11 11 (2015): e1005087. http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1005087.
    10.1371/journal.ppat.1005087
  28. Almeida, Tereza; Lopes, Ana M.; Magalhães, Maria J.; Neves, Fabiana; Pinheiro, Ana; Gonçalves, David; Leitão, Manuel; Esteves, Pedro J.; Abrantes, Joana. "Tracking the evolution of the G1/RHDVb recombinant strains introduced from the Iberian Peninsula to the Azores islands, Portugal". Infection, Genetics and Evolution 34 (2015): 307-313. http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2015.07.010.
    10.1016/j.meegid.2015.07.010
  29. Lopes, Ana M.; Dalton, Kevin P.; Magalhães, Maria J.; Parra, Francisco; Esteves, Pedro J.; Holmes, Edward C.; Abrantes, Joana. "Full genomic analysis of new variant rabbit hemorrhagic disease virus revealed multiple recombination events". Journal of General Virology 96 6 (2015): 1309-1319. http://dx.doi.org/10.1099/vir.0.000070.
    10.1099/vir.0.000070
  30. Nyström, Kristina; Abrantes, Joana; Lopes, Ana Margarida; Le Moullac-Vaidye, Béatrice; Marchandeau, Stéphane; Rocher, Jézabel; Ruvoën-Clouet, Nathalie; Esteves, Pedro J.; Le Pendu, Jacques. "Neofunctionalization of the Sec1 a1,2fucosyltransferase Paralogue in Leporids Contributes to Glycan Polymorphism and Resistance to Rabbit Hemorrhagic Disease Virus". PLOS Pathogens 11 4 (2015): e1004759. http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1004759.
    10.1371/journal.ppat.1004759
  31. Dalton, K. P.; Abrantes, J.; Lopes, A. M.; Nicieza, I.; Álvarez, Á. L.; Esteves, P. J.; Parra, F.. "Complete genome sequence of two rabbit hemorrhagic disease virus variant b isolates detected on the Iberian Peninsula". Archives of Virology 160 3 (2015): 877-881. http://dx.doi.org/10.1007/s00705-014-2329-3.
    10.1007/s00705-014-2329-3
  32. Lopes, Ana; Correia, Jorge; Abrantes, Joana; Melo, Pedro; Ramada, Margarida; Magalhães, Maria; Alves, Paulo; Esteves, Pedro. "Is the New Variant RHDV Replacing Genogroup 1 in Portuguese Wild Rabbit Populations?". Viruses 7 1 (2014): 27-36. http://dx.doi.org/10.3390/v7010027.
    10.3390/v7010027
  33. Lopes, Ana M.; Capucci, Lorenzo; Gavier-Widén, Dolores; Le Gall-Reculé, Ghislaine; Brocchi, Emiliana; Barbieri, Ilaria; Quéméner, Agnès; et al. "Molecular evolution and antigenic variation of European brown hare syndrome virus (EBHSV)". Virology 468-470 (2014): 104-112. http://dx.doi.org/10.1016/j.virol.2014.08.002.
    10.1016/j.virol.2014.08.002
  34. Lopes, Ana M; Marques, Sara; Silva, Eliane; Magalhães, Maria J; Pinheiro, Ana; Alves, Paulo C; Le Pendu, Jacques; et al. "Detection of RHDV strains in the Iberian hare (Lepus granatensis): earliest evidence of rabbit lagovirus cross-species infection". Veterinary Research 45 1 (2014): http://dx.doi.org/10.1186/s13567-014-0094-7.
    10.1186/s13567-014-0094-7
  35. Esteves, Pedro; Lopes, Ana; Magalhães, Maria; Pinheiro, Ana; Gonçalves, David; Abrantes, Joana. "Rabbit Hemorrhagic Disease Virus Detected in Pico, Azores, Portugal, Revealed a Unique Endemic Strain with More Than 17 Years of Independent Evolution". Viruses 6 7 (2014): 2698-2707. http://dx.doi.org/10.3390/v6072698.
    10.3390/v6072698
  36. Abrantes, Joana; Lopes, Ana M.; Dalton, Kevin P.; Melo, Pedro; Correia, Jorge J.; Ramada, Margarida; Alves, Paulo C.; Parra, Francisco; Esteves, Pedro J.. "New Variant of Rabbit Hemorrhagic Disease Virus, Portugal, 2012–2013". Emerging Infectious Diseases 19 11 (2013): http://dx.doi.org/10.3201/eid1911.130908.
    10.3201/eid1911.130908
  37. Korrodi-Gregório, Luís; Margarida Lopes, Ana; Esteves, Sara L. C.; Afonso, Sandra; Lemos de Matos, Ana; Lissovsky, Andrey A.; da Cruz e Silva, Odete A. B.; et al. "An Intriguing Shift Occurs in the Novel Protein Phosphatase 1 Binding Partner, TCTEX1D4: Evidence of Positive Selection in a Pika Model". PLoS ONE 8 10 (2013): e77236. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0077236.
    10.1371/journal.pone.0077236
  38. Abrantes, Joana; Lopes, Ana M.; Dalton, Kevin P.; Parra, Francisco; Esteves, Pedro J.. "Detection of RHDVa on the Iberian Peninsula: isolation of an RHDVa strain from a Spanish rabbitry". Archives of Virology 159 2 (2013): 321-326. http://dx.doi.org/10.1007/s00705-013-1808-2.
    10.1007/s00705-013-1808-2
  39. Lopes, Ana M.; Gavier-Widén, Dolores; Le Gall-Reculé, Ghislaine; Esteves, Pedro J.; Abrantes, Joana. "Complete coding sequences of European brown hare syndrome virus (EBHSV) strains isolated in 1982 in Sweden". Archives of Virology 158 10 (2013): 2193-2196. http://dx.doi.org/10.1007/s00705-013-1714-7.
    10.1007/s00705-013-1714-7
  40. Abrantes, J.; Lopes, A. M.; Esteves, P. J.. "Complete Genomic Sequences of Rabbit Hemorrhagic Disease Virus G1 Strains Isolated in the European Rabbit Original Range". Journal of Virology 86 24 (2012): 13886-13886. http://dx.doi.org/10.1128/jvi.02683-12.
    10.1128/jvi.02683-12
  41. Nyström, Kristina; Le Gall-Reculé, Ghislaine; Grassi, Paola; Abrantes, Joana; Ruvoën-Clouet, Nathalie; Le Moullac-Vaidye, Beatrice; Lopes, Ana M.; et al. "Histo-Blood Group Antigens Act as Attachment Factors of Rabbit Hemorrhagic Disease Virus Infection in a Virus Strain-Dependent Manner". PLoS Pathogens 7 8 (2011): e1002188. http://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1002188.
    Publicado • 10.1371/journal.ppat.1002188
Artigo em revista (magazine)
  1. Duarte, Margarida; Santos, F. A.; Carvalho, Carina; Fagulha, T.; Monteiro, J.; Esteves, Pedro; Abrantes, Joana; et al. "20 perguntas & respostas sobre mixomatose em lebre-ibérica", Caça e Cães de Caça, 2020
  2. Duarte, Margarida; Carvalho, Carina; Abade dos Santos, F.; Fagulha, T.; Albuquerque, T.; Gomes, J.; Waap, Helga; et al. "Objetivos e estratégia do projeto +Coelho: primeiro ano de implementação", Vida Rural, 2019
  3. Lopes, Ana M; Neves, Fabiana; Abade dos Santos, F.; Carvalho, C.; Cunha, M. V.; Duarte, M. D.; Esteves, Pedro; Abrantes, Joana. "Vigilância serológica – Uma abordagem na estratégia de recuperação das populações naturais de coelho-bravo", Veterinária Atual, 2018
Poster em conferência
  1. Carneiro, Filipa; Lopes, Ana M; CARNEIRO, JOÃO; Abrantes, Joana. "RHDV database: computational approaches to build a primer database". Trabalho apresentado em The International Meeting of the Portuguese Society of Genetics (IMPSG), 2023.
  2. Lopes, Ana M; Côrte-Real, João V.; Almeida, Tereza; Ramilo, David; Diz, Sílvia; Rebelo, Maria Teresa; Fonseca, Isabel M.; Santos, Nuno; Abrantes, Joana. "Analysis of the role of flies in the epidemiology of rabbit hemorrhagic disease virus Lagovirus europaeus/GI.2 in Portugal". Trabalho apresentado em XV SECEM Congress, 2021.
  3. Lopes, Ana M; Breiman, Adrien; Lora, Mónica; Le Moullac-Vaidye, Béatrice; Galanina, Oxana; Nyström, Kristina; Marchandeau, Stéphane; et al. "Are host glycans correlated with susceptibility to infection by lagoviruses?". Trabalho apresentado em TIBE: Host-parasite interactions, 2018.
  4. Lopes, Ana M; Correia, Jorge Manuel de Jesus; Melo, Pedro; Ramada, Margarida; Magalhães, M. J.; ALVES, Paulo C; Esteves, Pedro; Abrantes, Joana. "Replacement of rabbit hemorrhagic disease virus (RHDV) genogroup 1 by new variant RHDV2 in Portugal". Trabalho apresentado em 3rd European Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians Congress, 2014.
  5. Abrantes, Joana; Nyström, Kristina; Lopes, Ana M; Le Moullac-Vaidye, Béatrice; Marchandeau, Stéphane; Rocher, Jézabel; Ruvoën-Clouet, Nathalie; Esteves, Pedro; Le Pendu, Jacques. "Neofunctionalization of Sec1 in rabbits: the effect of Sec1 expression on Fut1 as a mechanism for RHDV resistance". Trabalho apresentado em 9th International Symposium on Glycosyltransferases, 2014.
  6. Lopes, Ana M; Gavier-Widén, Dolores; Le Gall-Reculé, Ghislaine; Le Pendu, Jacques; Esteves, Pedro; Abrantes, Joana. "From 1980s to our days: evolutionary history of European Brown Hare Syndrome Virus (EBHSV) in Sweden". Trabalho apresentado em 5th European Congress of Virology, 2013.
  7. Lopes, Ana M; Abrantes, Joana; Le Pendu, Jacques; Esteves, Pedro. "The a1,2-fucosyltransferase multigene family: distinct extent of gene conversion between leporids and other mammals". Trabalho apresentado em 17th Evolutionary Biology Meeting, 2013.
  8. Lopes, Ana M; Abrantes, Joana; Melo-Ferreira, José; Esteves, Pedro. "From host to pathogen: is the genetic diversity of a1,2-fucosyltransferase genes regulating European brown hare syndrome virus (EBHSV) infectious process in hare species (genus Lepus)?". Trabalho apresentado em 4th World Lagomorph Conference (WLC4), 2012.
  9. Lopes, Ana M; Abrantes, Joana; Melo-Ferreira, José; Esteves, Pedro. "European brown hare syndrome (EBHS): insights into the genetic diversity of the a1,2-fucosyltransferase genes Fut2 and Sec1 in hare species (genus Lepus)". Trabalho apresentado em Trends in Biodiversity and Evolution (TiBE), 2011.
Tese / Dissertação
  1. Lopes, Ana M. "Insights into the host-pathogen interactions: Lagovirus in leporids". Doutoramento, Universidade do Porto Faculdade de Ciências, 2016.
  2. Lopes, Ana M. "Genetic variability in genes associated with physiological and adaptive functions in Lagomorphs". Mestrado, Universidade do Porto Faculdade de Ciências, 2011.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2021/09 Decreased immunity of wild rabbits against rabbit hemorrhagic disease virus in Azores (2015-2019) 69th WDA /14th EWDA 2021 Joint Conference
(Cuenca, Espanha)
2019/11 Projeto LAGMED – Melhoria das ações preventivas contra LAGovírus emergentes na bacia do MEDiterrâneo: desenvolvimento e otimização de metodologias para deteção e controlo de agentes patogénicos XI Jornadas de Cunicultura da ASPOC
Associação Portuguesa de Cunicultura (Vila Real, Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado
Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2023/09 - Atual Genomic diversity and zoonotic potential of Hepatitis E Virus in European rabbits: implications for diagnostic and therapeutic approaches
Coorientador
2023/07 - Atual As espécies do Mediterrâneo como reservatório de poxvírus: onde, quando e como?
Orientador
2022/09 - 2023/06 A computational method to build an RHDV primer database: literature and in silico approaches
Coorientador
MSc in Biodiversity, Genetics and Evolution (Mestrado)
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/09 - 2020/06 Evolutionary study of the nucleolin (NCL) gene involved in the infection by the rabbit hemorrhagic disease virus
Coorientador
BSc in Biology
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
2019/09 - 2020/06 Evolutive study of the CD96 receptor in lagomorphs
Coorientador
BSc in Biology
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2022/07 - 2022/07 Present, past and future of (un)known lagoviruses affecting lagomorphs (2022/07)
Oficina (workshop) (Membro da Comissão Organizadora)
2018/12/05 - 2018/12/07 TiBE: Host-parasite interactions (2018/12/05 - 2018/12/07)
Congresso (Membro da Comissão Organizadora)
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2015/09/28 - 2015/09/29 1st European/Australian RHDV workshop (2015/09/28 - 2015/09/29)
Oficina (workshop) (Coorganizador)
Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2024/04 - Atual O Investigador Falador
Oficina (workshop)
2019/09/17 - Atual International Microorganism Day (Activity for high-school students)
Oficina (workshop)
International Microorganism Day
Galeria da Biodiversidade, Portugal
2019/06/01 - 2019/06/02 Monitor for the activity "Espalha Sementes"
Festival
Serralves em Festa
Fundação Serralves, Portugal
2019/04/04 - 2019/04/07 Monitor at the 17th University of Porto¿s Annual Science, Teaching and Innovation Fair
Exposição
Mostra UP
Universidade do Porto, Portugal
2019/04/01 - 2019/04/07 Monitor at Bioblitz
Outro
Bioblitz 2019
Fundação Serralves, Portugal

Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2017/04/20 - 2017/04/23 Monitor at the 15th University of Porto’s Annual Science, Teaching and Innovation Fair
Exposição
Mostra UP
Universidade do Porto, Portugal

Arbitragem científica em revista

Nome da revista (ISSN) Editora
2023 - Atual Viruses: Guest Editor of the Special Issue "Rabbit Viral Diseases" MDPI
2023 - Atual Frontiers in Microbiology Frontiers
2022 - Atual Veterinary Research Springer Nature
2022 - Atual Biology
2021 - Atual Viruses MDPI
2021 - Atual Journal of Wildlife Diseases Wildlife Disease Association
2021 - Atual Journal of Virological Methods Elsevier
2020 - Atual BMC Veterinary Research Springer Nature
2020 - Atual Biology: Guest Editor Special Issue "Infectious Diseases in Lagomorphs" MDPI
2019 - Atual Frontiers in Microbiology (1664-302X) Frontiers Media SA
2015 - Atual Transboundary and Emerging Diseases (1865-1682) Wiley (Blackwell Publishing)

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2021/06/07 - Atual How viruses work: principles and methods for their study (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares)) Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Membro de comissão

Descrição da atividade
Tipo de participação
Instituição / Organização
2023/10 - Atual ORBEA - Animal Welfare Ethics and Review Body
Membro
Associação BIOPOLIS - Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Outro júri / avaliação

Descrição da atividade Instituição / Organização
2019 - Atual Member of Jury for selection of a Technician for the Project +Coelho2 Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2019 - Atual Member of Jury for selection of a Research Technician for the Project LAGMED Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2019 - Atual Member of Jury for selection of a Post-Doc Researcher for the project 02966-02/SAICT/2017 Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal
2018 - Atual Member of Jury for selection of a Technician for the Project +Coelho Rede de Investigação em Biodiversidade e Biologia Evolutiva, Portugal

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2019 - Atual PhD in Biodiversity, Genetics and Evolution João Côrte-Real
2018/09 - 2019/06 Internship within the scope of BSc in Biology Karen Galle
2015/09/01 - 2016/12/06 MSc in Biodiversity, Genetics and Evolution Diogo Silvério
Distinções

Prémio

2013 Young Scientist Travel Award
European Society for Virology, Alemanha