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Cledir Santos é Químico pela Universidade Federal Rural de Pernambuco (Brasil, 2002) e Doutor em Química pela Universidade do Porto (Portugal, 2007). Atualmente, é Professor Associado nível A, com contrato permanente, do Departamento de Ciências Químicas e Recursos Naturais da Universidade de La Frontera (UFRO, http://www.ufro.cl/), Temuco, Chile. Foi o fundador e Diretor da Coleção Chilena de Cultivos Tipo-CCCT/UFRO (2015-2019), foi o fundador e é o Diretor do Banco de Recursos microBianos-BRmB da Facultad de Ingeniería y Ciencias UFRO. É Coordenador de Cooperação Internacional do Scientific and Technological Bioresource Nucleus BIOREN-UFRO (www.bioren.cl) e Membro dos Conselhos Executivos da Federação Mundial de Coleções de Culturas (WFCC, http://www.wfcc.info/) e da Federação Latino-Americana de Coleções de Culturas (http://felacc.cinvestav.mx/). Durante a sua carreira profissional tem trabalhado em colaboração com varias instituições de diferentes países. Sua área de pesquisa é a Química de Fungos, sendo as principais linhas de investigação o estudo de micotoxinas em produtos de origem agroalimentar e o impacto desses metabolitos na saúde humana; novos biofungicidas para controlar fungos patógenos; a quimiotaxonomía de fungos por métodos de espectrometria de massa e os métodos de preservação de fungos a longo prazo. Foi professor orientador de mais de 20 estudiantes internacionales de doutorado, de mestrado e de licenciatura. Atualmente orienta 2 teses de doutoramento e 1 dissertação de mestrado. Publicou mais 70 trabalhos como artigos em revistas indexadas ou como capítulos de livros, e apresentou mais de 20 conferências como conferencista convidado em congressos nacionais e internacionais. Cledir Santos é professor dos Programas de "Doctorado en Ciencias de Recursos Naturales" e de "Doctorado en Ciencias Mención Biología Celular y Molecular Aplicada" da UFRO e é professor externo permanente dos seguintes Programas de Pós-graduação brasileiros: Microbiologia Agrícola (Universidade Federal de Lavras), Biologia de Fungos (Universidade Federal de Pernambuco) e de Agronomia Tropical (Universidade Federal do Amazonas). Também é Membro Integrado do Centro de Engenharia Biológica da Universidade do Minho (Portugal). Atualmente é IP de 3 projetos de investigação, financiados por agencias nacionais e internacionais de fomento, contabilizando um financiamento total ao redor de meio milhão de euros (2021-2026).
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Cledir Santos

Nomes de citação

  • Santos, Cledir

Identificadores de autor

Ciência ID
731D-45D8-8A8F
ORCID iD
0000-0003-4681-0941
Scopus Author Id
8620996200

Telefones

Telefone
  • (+56) 452596726 (Profissional)

Moradas

  • Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales, Universidad de La Frontera, Av. Francisco Salazar, Francisco Salazar 01145, 4811230, Temuco, Temuco, Chile (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Micologia

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Espanhol; Castelhano Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2) Utilizador proficiente (C2)
Formação
Grau Classificação
2007
Concluído
Química (Doutoramento)
Especialização em Sem especialidade
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal
"Síntese e Reactividade de Potenciais Pró-fármacos Dipeptídicos Activados por Ciclização Intramolecular" (TESE/DISSERTAÇÃO)
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Costa, Jéssica; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Mycotoxin contamination in Capsicum pepper and Merkén: Implications for Human Health". 2021.
  2. Costa, Jéssica; Rodriguez, R.; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Fungi and mycotoxin contamination in Capsicum pepper and in its derivatives". 2019.
  3. Costa, Jessica; Rodriguez, Rodrigo; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia Maria Gonçalves; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Ochratoxigenic mycobiota in chilli Capsicum annuum L. and Chilean Merkén". 2019.
  4. Costa, Jéssica; Rodriguez, R.; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Hongos filamentosos y micotoxinas en ají merkén". 2019.
  5. Aranda, Camila; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Overview of potential mycotoxigenic fungi in Chilean buttery cheese". 2019.
  6. Costa, Jéssica; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Spoilage fungi and mycotoxins contamination risk in Capsicum products". 2019.
  7. Costa, Jéssica Souza da; Rodriguez, R.; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Mycobiota in Chilean Chili Capsicum annuum L. used for production of Merkén". 2019.
  8. Costa, Jéssica; Rodriguez, Rodrigo; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia Maria Gonçalves; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Mycobiota in chilli Capsicum annuum and Chilean merkén". 2019.
  9. Costa, Jéssica; Rodriguez, Rodrigo; Lopez, Sebastián; Battilani, Paola; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Mycobiota in Chilean traditional chilli used for Merkén production". 2018.
  10. Santos, Cledir; Rodriguez, Rodrigo; Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Lima, Nelson. "Polyphasic evaluation of long term preservation on Aspergillus (section Nigri) strains". 2018.
  11. Ouhibi, Salma; Rodriguez, Rodrigo; Decontardi, Simone; Souza, Jéssica; Lopez, Sebastián; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia Maria Gonçalves; et al. "Penicillia diversity from food identified polyphasically, including mycotoxin production". 2018.
  12. Ouhibi, Salma; Rodriguez, R.; Decontardi, Simone; Souza, Jéssica; Lopez, Sebastián; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia Maria Gonçalves; et al. "Penicillium species identification and new insights on mycotoxins in food commodities (apples, chilli and cheese)". 2018.
  13. Silva, Blenda; Bentes, Jânia; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Diversity of endophytic fungi from guarana seeds (Paullinia cupana) cultivated in Amazonia, Brazil". 2018.
  14. Aranda, Camila; Soto, Isabel; Montesinos, Carlos; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Potential mycotoxingenic fungi in Chilean buttery cheese". 2018.
  15. Córdoba-Fuzga, Angélica; Santos, Carla; Soares, Célia Maria Gonçalves; Gomez, Juan C.; Loiaza-Díaz, Natalia; Mesa-Arango, Ana C.; Refojo, Nicolás; et al. "Polyphasic identification and typing Trichophytum rubrum strains of clinical origin". 2017.
  16. Rodriguez, Rodrigo; Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Aged freeze-dried ampoules of preserved biotechnological important fungi". 2017.
  17. Martins, Maria Rosário; Lima, Nelson; Soares, Célia Maria Gonçalves; Santos, Cledir. "Mucorales strains with biotechnological use: a polyphasic approach identification". 2017.
  18. Soto, Isabel; Rodriguez, Rodrigo; Lopez, Sebastián; Burgos, Nicol; Rocha, Adonis; Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Will fungal strains preserved in culture collections maintain the same biotechnological performance after years of preservation?". 2017.
  19. Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Impact of MALDI-TOF MS in Clinical Mycology: Progress and Barriers in Diagnostics". 2017.
  20. Santos, Cledir; Rodriguez, Rodrigo; Soares, Célia Maria Gonçalves; Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Lima, Nelson. "Preserved freeze-dried and aged filamentous fungi of biotechnological importance". 2017.
  21. Martins, Maria Rosário; Dantas, Vânia; Soares, Célia Maria Gonçalves; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Identificação polifásica de Gongronella sp. e de Rhizopus sp. degradadores do fungicida sistémico metalaxil". 2016.
  22. Santos, Cledir; Godoy, Patricio; Lima, Nelson. "Limitations of MALDI-TOF MS in the fungal identification: could LC-MS/MS be a solution?". 2016.
  23. Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Public service culture collections of microorganisms: are they important for biotechnology?". 2015.
  24. Santos, Cledir; Klein, Nazareth; Schuenck, Ricardo; Lima, Nelson; Asensi, Marise. "Polyphasic identification of clinical multidrug-resistant bacteria isolated from blood cultures". 2015.
  25. Cisternas, Carla; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Rubilar, Olga. "Mechanism of extracellular silver nanoparticles synthesis by Stereum hirsutum and Fusarium oxysporum". 2015.
  26. Oliveira, Helena M. B.; Santos, Cledir; Paterson, R. R. M.; Gusmão, Norma B.; Lima, Nelson. "Filamentous fungi in free water and biofilms from Brazilian drinking water systems". 2015.
  27. Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Proteins on microbial identification: past achievements, present state-of-the-art, and future challenges". 2015.
  28. Couto, F.; Santos, Cledir; Souza, T.; Dias, E.; Lima, Nelson; Batista, L.. "Combining analytical methodologies for the identification of Aspergillus section Flavi strains isolated from Brazilian agricultural commodities". 2015.
  29. Martins,M. Rosário; Dantas, Vânia; Soares, Célia Maria Gonçalves; Santos, Cledir; Verkley, Gerard; Lima, Nelson. "Polyphasic identification of a Rhizopus species and a putative novel Gongronella which both degrade the fungicide metalaxyl". 2015.
  30. Silva, P. B. R.; Oliveira, H. M. B.; Santos, Cledir; Gusmão, N. B.; Lima, Nelson. "Filamentous fungi occurrence in free water and biofilms from drinking water storage tanks". 2015.
  31. Santos, Cledir; Francisco, Elaine; Mazza, Mariana; Padovan, Ana Carolina B.; Colombo, Arnaldo; Lima, Nelson. "MALDI-TOF MS and LC MS/MS: New insights for clinical fungal ID". 2015.
  32. Martins, M. Rosário; Santos, Cledir; Pereira, Pablo; Lima, Nelson. "Degradation of the fungicide metalaxyl by Mucorales strains". 2015.
  33. Santos, Cledir; Francisco, Elaine; Mazza, Mariana; Padovan, Ana Carolina B.; Colombo, Arnaldo; Lima, Nelson. "Advances in microbial diagnosis: using mass spectrometry for proteomics and genomics applications". 2015.
  34. Venâncio, Armando; Abrunhosa, Luís; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Tools and strategies to mitigate the effect of mycotoxins". 2014.
  35. Silva, M. C. A.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Bentes, J. L. S.. "Isolation, identification and characterisation of endophytic and pathogenic Colletotrichum guaranicola isolated from guarana leaves (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) in Brazilian Amazon". 2014.
  36. Santos, Cledir; Dias, Disney R.; Lima, Nelson; Schwan, Rosane F.. "Identificação de microrganimos isolados de processos fermentativos: uma abordagem polifásica que inclui a técnica de MALDI-TOF MS". 2014.
  37. Lima, Nelson; Santos, Cledir. "MALDI applications in mycology". 2014.
  38. Santos, Cledir; Lima, Nelson. "MALDI-TOF MS: uma década de experiência na aplicação em microbiologia, sempre olhando o futuro". 2014.
  39. Pinto, Juliana; Gervásio, Ivani; Dias, Disney R.; Dias, Eutásquio; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Schwan, Rosane F.. "Coleção de culturas de microbiologia agrícola da UFLA (CCMA-UFLA): da requalificação à certificação baseada na ISO 9001:2008". 2014.
  40. Antunes, André Guimarães Lemos; Santos, Cledir; Smith, David; Lima, Nelson. "Capacity building initiatives, training and education: the EMbaRC experience and beyond". 2013.
  41. Santos, Cledir; Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Ventura, José Aires; Lima, Nelson. "Uso e potencial do MALDI-TOF na detecção de fitopatógenos". 2013.
  42. Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Rampitsch, Christof; Lima, Nelson. "Proteomic analysis of Aspergillus niger type strain (MUM 03.01) after accelerated freeze-drying preservation". 2013.
  43. Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Desafios locais para a gestão global dos Centros de Recursos Microbiológicos". 2013.
  44. Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Implementation of a Quality Management System based on ISO9001:2008 and its importance on culture collections". 2013.
  45. Filho, Magno Rodrigues de Carvalho; Craveiro, Saluana Rocha; Martinhs, Irene; Lima, Nelson; Santos, Cledir; Miller, Robert Neil Gerard; Silva, Joseane Padilha da; Mello, Sueli Corrêa Marques de. "Identification and phylogeny of Trichoderma species by MALDI-TOF analysis and characterization of antagonistic activities against Sclerotinia scleroti". 2013.
  46. Filho, Magno Rodrigues de Carvalho; Craveiro, Saluana Rocha; Martinhs, Irene; Lima, Nelson; Santos, Cledir; Miller, Robert Neil Gerard; Silva, Joseane Padilha da; Mello, Sueli Corrêa Marques de. "Evaluation of inhibitory effects of Trichoderma asperellum metabolites on mycelial growth of Sclerotinia sclerotiorum". 2013.
  47. Antunes, André Guimarães Lemos; Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Microbial resources and applications: preliminary trends and insights for future economic impact estimates". 2013.
  48. Pereira, Leonel João Pais; Dias, Nicolina Marques; Fernandes, Sara; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Antifungal activity against Trichophyton rubrum of inorganic vs. biogenic silver nanoparticles produced by filamentous fungi". 2013.
  49. Antunes, André Guimarães Lemos; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Challenges, approaches and future work in the deep-sea anoxic Brine Lakes of the Red Sea". 2013.
  50. Rodrigues, Paula; Soares, Célia; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Taxonomy of Aspergillus: integration of methods for new and revisited species in section Flavi". 2012.
  51. Maciel, Marília; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Souza-Motta, Cristina Maria. "Polyphasic identification of Aspergillus isolates belonging to section Nigri with clinical relevance". 2012.
  52. Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Assessment of fungi stability by MALDI-TOF ICMS following preservation on alginate encapsulated samples". 2012.
  53. Santos, Cledir; Rodrigues, Paula; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "MALDI-TOF MS: improved methods for the identification/characterisation and authentication of fungal strains". 2012.
  54. Martins, Margarida Isabel Barros Coelho; Santos, Cledir; Machado, Diana; Maciel, M. H. C.; Lima, Nelson; Santos, Olívia; Rodrigues, Anabela; et al. "Application of MALDI-TOF MS to the identification of dialysis catheters associated microorganisms". 2012.
  55. Lima, M. Sanitá; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Polizeli, Maria de Lourdes T. M.. "Identification of Brazilian wild-type isolates of Aspergillus fumigatus based on polyphasic approach including MALDI-TOF MS technique". 2012.
  56. Pereira, Leonel João Pais; Santos, Cledir; Dias, Nicolina Marques; Lima, Nelson. "New insights for identification of clinical isolates of Trichophyton rubrum using MALDI-TOF MS". 2012.
  57. Rodrigues, Paula; Soares, Célia; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Taxonomy of Aspergillus: integration of methods for new and revisited species in section Flavi". 2012.
  58. Soares, Célia Maria Gonçalves; Santos, Cledir; Maciel, Marília; Souza-Motta, Cristina Maria; Lima, Nelson; Venâncio, Armando. "The importance of a quick identification of Aspergillus niger for a proper mycotoxin related diagnosis". 2012.
  59. Passamani, F. R. F.; Terra, M. F.; Couto, F. A.; Bastos, S. C.; Dias, D. R.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Batista, Luís R.. "The filamentous fungi culture collection of the Department of Food Science (CCDCA), Federal University of Lavras, Brazil". 2012.
  60. Cruz, Lidiane Roberta; Lima, Juliana Silva; Fonseca, Julyanna C.; Maciel, Marília H. C.; Venâncio, Armando; Lima, Nelson; Moreira, Keila Aparecida; Santos, Cledir; Souza-Motta, Cristina Maria. "Deteção da produção de ocratoxina A (OTA) por espécies de Penicillium isoladas de solos estocadas na Micoteca URM, Pernambuco, Brasil, através de HPLC". 2012.
  61. Oliveira, M. M. E.; Santos, Cledir; Sampaio, Paula; Pais, Célia; Lima, Nelson; Zancopé-Oliveira, R. M.. "Implementating a methodology for identification of Sporothrix complex isolates by MALDI-TOF ICMS". 2012.
  62. Lima-Neto, Reginaldo Gonçalves; Macêdo, Danielle P.C.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Sampaio, Paula; Pais, Célia; Neves, Rejane Pereira. "Rapid and reliable identification of intact Candida clinical isolates using MALDI-TOF ICMS". 2012.
  63. Siqueira, Virgínia M.; Oliveira, H. M. B.; Santos, Cledir; Paterson, R. R. M.; Gusmão, N. B.; Lima, Nelson. "Filamentous fungi in drinking water in relation to biofilm formation". 2011.
  64. Siqueira, Virgínia M.; Oliveira, Helena; Santos, Cledir; Paterson, R. R. M.; Lima, Nelson; Gusmão, Norma. "Fungos nas águas de consumo: qual a sua relevância?". 2011.
  65. Santos, Cledir; Lima, Nelson. "MALDI-TOF ICMS: avanços na identificação de fungos". 2011.
  66. Elgueta, S.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Diez, M. C.. "Ligninolytic enzymes activities and SEM analysis of fungal inoculum of Anthracophyllum discolour". 2011.
  67. Pereira, Leonel; Dias, Nicolina Marques; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Is MALDI-TOF ICMS able to discriminate dermatophyte clones?". 2011.
  68. Passarini, Michel Rodrigo Zambrano; Ottoni, C. A.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Sette, Lara Durães. "Avaliação da produção de lacase pela indução de íons cobre e detecção do gene em duas linhagens de ascomicetos isolados de esponjas marinhas". 2011.
  69. Klein, Nazareth M.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Asensi, Marise D.. "Establishment of a bacterial strain reference culture collection: university hospital Cassiano Antônio de Moraes (CCBR-HUCAM), Vitória (ES), Brazil". 2011.
  70. Pereira, Leonel João Pais; Dias, Nicolina Marques; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "MALDI-TOF ICMS vs molecular typing in the identification of dermatophyte strains". 2011.
  71. Fraga, Marcelo Elias; Lima, Nelson; Santos, Cledir; Souza, Francisco Adriano de. "Caracterização de estirpes de Trichoderma por análise morfologica, filogenética e por espectros de massa obtidos por MALDI-TOF". 2011.
  72. Passarini, Michel R. Z.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Sette, Lara D.. "Characterisation of filamentous fungal diversity of Trichoderma genus isolated from marine sponge by sequencing ITS-rDNA and MALDI-TOF ICMS". 2011.
  73. Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Micoteca da Universidade do Minho (MUM): 15 anos de funcionamento e sua recente certificação baseada na ISO 9001:2008". 2011.
  74. Rodrigues, Paula; Santos, Cledir; Kozakiewicz, Z.; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "MALDI-TOF ICMS as a modern approach to identify potential aflatoxigenic fungi". 2010.
  75. Ottoni, C. A.; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Utilization of white rot fungi for textile dye decolourisation under alkaline condition and high salt concentration in solid medium". 2010.
  76. Simões, Marta Filipa; Martins, Anabela; Dias, Nicolina; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Micoteca da Universidade do Minho (MUM): implementation of a Quality Management System based on ISO 9001:2008". 2010.
  77. Rodrigues, Paula; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Characterization and identification of aspergillus section flavi isolates from portuguese almonds using a polyphasic approach including MALDI-TOF ICMS". 2010.
  78. Lima, Nelson; Santos, Isabel M.; Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir. "Micoteca da Universidade do Minho (MUM): a culture collection preparing the future". 2010.
  79. Santos, Cledir; Lima, Nelson; Sampaio, Paula; Pais, Célia. "Use of MALDI-TOF ICMS on yeast identification : application on Candida species with clinical relevance". 2010.
  80. Rodrigues, Paula; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Integrated morphologic, metabolic, molecular and spectral methods for identification of Aspergillus section Flavi isolated from Portuguese almonds.". 2010.
  81. Lima, Nelson; Ottoni, C. A.; Santos, Cledir. "Fungos e biorremediação". 2010.
  82. Santos, Cledir; Lima, Nelson. "MALDI-TOF ICMS as a powerful technique for strain authentications in Culture Collections". 2010.
  83. Rodrigues, Paula; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "MALDI-TOF ICMS as a modern approach to identify potential aflatoxigenic fungi". 2010.
  84. Santos, Cledir; Lima, Nelson. "MALDI-TOF ICMS na microbiologia clínica : porquê começar a usar?". 2010.
  85. Rodrigues, Paula; Torres, A.; Nunes F.; Leirós, Ana Catarina Correia; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Portuguese isolates of Aspergillus section Flavi unraveled by the calmodulin gene". 2010.
  86. Rodrigues, Paula; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Calmodulin gene as good voucher as MALDI-TOF ICMS to identify Portuguese isolates of Aspergillus section Flavi". 2010.
  87. Oliveira, Helena Maria Bezerra de; Siqueira, Virgínia M.; Barbosa, Patrícia; Callou, Máira Judith A.; Lira, Diana D.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Gusmão, Norma. "Fungos em água de abastecimento". 2010.
  88. Rodrigues, Paula; Soares, Célia; Freitas-Silva, Otniel; Santos, Cledir; Paterson, Russell; Kozakiewicz, Zofia; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Contributions of Micoteca da Universidade do Minho to food mycology". 2010.
  89. Rodrigues, Paula; Torres, Aldara; Nunes, Florbela; Leirós, Catarina; Santos, Cledir; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Portuguese isolates of Aspergillus section Flavi unraveled by the calmodulin gene". 2010.
  90. Simões, Marta Filipa; Martins, Anabela; Dias, Nicolina; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Micoteca da Universidade do Minho: Implementação de um sistema de gestão da qualidade com base na ISO 9001:2008". 2010.
  91. Siqueira, Virgínia M.; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Contaminantes e biofilmes fúngicos presentes nos sistemas de distribuição das águas de abastecimento público". 2009.
  92. Pereira, Leonel; Santos, Cledir; Dias, Nicolina; Lima, Nelson. "Aplicação do MALDI-TOF ICMS na abordagem polifásicada da identificação de isolados clínicos de Trichophyton rubrum". 2009.
  93. Rodrigues, Paula; Soares, Célia; Santos, Cledir; Fraga, Marcelo; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "A polyphasic approach for black Aspergillus identification using MALDI-TOF MS.". 2009.
  94. Rodrigues, Paula; Soares, Célia; Freitas-Silva, Otniel; Santos, Cledir; Paterson, Russell; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Micotoxinas: contributos da Micoteca da Universidade do Minho (MUM) para a segurança alimentar.". 2009.
  95. Rodrigues, Paula; Santos, Cledir; Kozakiewicz, Zofia; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Polyphasic approach including maldi-tof mass spectrometry to characterise aflatoxigenic species of aspergillus section flavi". 2009.
  96. Rodrigues, Paula; Soares, Célia; Freitas-Silva, Otniel; Santos, Cledir; Paterson, Russell; Kozakiewicz, Zofia; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Micotoxinas: contributos da micoteca da Universidade do Minho (mum) para a segurança alimentar". 2009.
  97. Santos, Cledir; Okada, K.; Alves da Silva, C. A.; Gusmão, N. B.; Nascimento, A. E.; Lima, Nelson; Takaki, G. M. Campos; Messias, A. S.. "Environmental and industrial application criteria to establish the microbial culture collection of the Catholic University of Pernambuco (UCP)". 2008.
  98. Motta, Cristina Souza; Neves, Rejane P.; Araújo, J. M.; Calazans, G. M. T.; Santos, Cledir; Carneiro-da-Cunha, Maria G.; Lima-Filho, José. L.; Lima, Nelson. "The microbial culture collections of the Federal University of Pernambuco (UFPE) and the new consortium towards the establishment of BRC-UFPE". 2008.
  99. Santos, Cledir; Paterson, R. R. M.; Venâncio, Armando; Lima, Nelson. "Integration of MALDI-TOF MS data in the quality control of microbial culture collections". 2008.
  100. Rodrigues, Paula; Santos, Cledir; Kallow, Wibke; Erhard, Marcel; Welker, Martin; Kozakiewicz, Zofia; Lima, Nelson; Venâncio, Armando. "MALDI-TOF MS potentialities and limits to characterise aflatoxigenic species of Aspergillus Section Flavi". 2008.
  101. Lima, Nelson; Rodrigues, Paula; Soares, Célia; Santos, Cledir; Paterson, Russell; Venâncio, Armando. "Modern polyphasic methods that include MALDI-TOF analyses for fungal identifications and authentications". 2008.
  102. Pereira, Cláudia S.G.P.; Santos, Cledir; Barreira, João C.M.; Moreira, Rui; Ferreira, Isabel C.F.R.; Estevinho, Leticia M.; Gomes, Paula. "Synthesis and antimicrobial activity of dipeptide esters of the anti-rectroviral drug acyclovir". 2005.
Artigo em jornal
  1. Santos, Cledir; Tensol, Juliana; Gervasio, Ivani; Lima, Nelson; Schwan, Rosane F.. "Culture Collection of Agricultural Microbiology - UFLA, Brazil, is implementing a QMS based on ISO 9001:2008", 2014, http://hdl.handle.net/1822/36743.
Artigo em revista
  1. Jéssica Costa; Nelson Lima; Cledir Santos. "An overview on possible links between aflatoxin B1 exposure and gallbladder cancer". Mycotoxin Research 37 3 (2021): 205-214. https://doi.org/10.1007/s12550-021-00431-1.
    10.1007/s12550-021-00431-1
  2. Igor Moreira; Jéssica Costa; Leonardo Vilela; Nelson Lima; Cledir Santos; Rosane Schwan. "Influence of S. cerevisiae and P. kluyveri as starters on chocolate flavour". Journal of the Science of Food and Agriculture (2021): https://doi.org/10.1002/jsfa.11082.
    10.1002/jsfa.11082
  3. Jéssica Costa; Eugénio C. Ferreira; Cledir Santos. "COVID-19, Chikungunya, Dengue and Zika Diseases: An Analytical Platform Based on MALDI-TOF MS, IR Spectroscopy and RT-qPCR for Accurate Diagnosis and Accelerate Epidemics Control". Microorganisms (2021): https://doi.org/10.3390/microorganisms9040708.
    10.3390/microorganisms9040708
  4. Costa, Jéssica; Ferreira, Eugénio C.; Santos, Cledir. "COVID-19, Chikungunya, Dengue and Zika diseases: an analytical platform based on MALDI-TOF MS, IR spectroscopy and RT-qPCR for accurate diagnosis and accelerate epidemics control". (2021): http://hdl.handle.net/1822/71102.
    10.3390/microorganisms9040708
  5. Gómez-Velásquez, Juan C.; Mojica-Figueroa, Iván L.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Mesa-Arango, Ana C.. "MALDI-TOF MS: foundations and a practical approach to the clinically relevant filamentous fungi identification". (2021): http://hdl.handle.net/1822/74861.
    10.1007/s12281-021-00423-9
  6. Moreira, Igor; Costa, Jéssica; Vilela, Leonardo; Lima, Nelson; Santos, Cledir; Schwan, Rosane. "Influence of S. cerevisiae and P. kluyveri as starters on chocolate flavour". (2021): http://hdl.handle.net/1822/73406.
    10.1002/jsfa.11082
  7. Costa, Jéssica; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "An overview on possible links between aflatoxin B1 exposure and gallbladder cancer". (2021): http://hdl.handle.net/1822/73852.
    10.1007/s12550-021-00431-1
  8. Carla Santos; Blenda Naara Santos da Silva; Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e Ferreira; Cledir Santos; Nelson Lima; Jânia Lília da Silva Bentes. "Fungal Endophytic Community Associated with Guarana (Paullinia cupana Var. Sorbilis): Diversity Driver by Genotypes in the Centre of Origin". Journal of Fungi 6 3 (2020): 123-123. https://doi.org/10.3390/jof6030123.
    10.3390/jof6030123
  9. Maria Rosário Martins; Carla Santos; Célia Soares; Cledir Santos; Nelson Lima. "Gongronella eborensis sp. nov., from vineyard soil of Alentejo (Portugal)". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 5 (2020): 3475-3482. https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004201.
    10.1099/ijsem.0.004201
  10. Costa, Jéssica; Rodriguez, R.; Santos, Carla Isabel Arcanjo; Soares, Célia; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Mycobiota in Chilean chilli Capsicum annuum L. used for production of Merkén". (2020): http://hdl.handle.net/1822/66978.
    10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108833
  11. Santos, Carla Isabel Arcanjo; Santos da Silva, Blenda Naara; Amorim Ferreira e Ferreira, Ana Francisca Tibúrcia; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Silva Bentes, Jânia Lília da. "Fungal endophytic community associated with guarana (Paullinia cupana var. Sorbilis): diversity driver by genotypes in the centre of origin". (2020): http://hdl.handle.net/1822/66199.
    10.3390/jof6030123
  12. Matos, Aline M. F.; Moreira, Lucas M.; Barczewski, Bianca F.; Matos, Lucas X. de; Oliveira, Jordane B. V. de; Pimentel, Maria Ines F.; Almeida-Paes, Rodrigo; et al. "Identification by MALDI-TOF MS of Sporothrix brasiliensis isolated from a subconjunctival infiltrative lesion in an immunocompetent patient". (2020): http://hdl.handle.net/1822/65583.
    10.3390/microorganisms8010022
  13. Martins, M. Rosário; Santos, Carla; Soares, Célia; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Gongronella eborensis sp. nov., from vineyard soil of Alentejo (Portugal)". (2020): http://hdl.handle.net/10174/29713.
    https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004201
  14. Mario Henrique Paziani; Ludmilla Tonani Carvalho; Marcia de Souza Carvalho Melhem; Margarete Teresa Gottardo de Almeida; Maria Emilia Nadaletto Bonifácio da Silva; Roberto Martinez; Cledir Santos; Marcia Regina von Zeska Kress. "First Comprehensive Report of Clinical Fusarium Strains Isolated in the State of Sao Paulo (Brazil) and Identified by MALDI-TOF MS and Molecular Biology". Microorganisms 8 1 (2019): 66-66. https://doi.org/10.3390/microorganisms8010066.
    10.3390/microorganisms8010066
  15. Aline M. F. Matos; Lucas Machado Moreira; Bianca F. Barczewski; Lucas X. de Matos; Jordane B. V. de Oliveira; Maria Ines F. Pimentel; Rodrigo Almeida-Paes; et al. "Identification by MALDI-TOF MS of Sporothrix brasiliensis Isolated from a Subconjunctival Infiltrative Lesion in an Immunocompetent Patient". Microorganisms (2019): https://www.mdpi.com/2076-2607/8/1/22.
    10.3390/microorganisms8010022
  16. "TAXONOMIA POLIFÁSICA PARA IDENTIFICAÇÃO DE ASPERGILLUS SEÇÃO FLAVI: UMA REVISÃO". Revista Ifes Ciência (2019): http://dx.doi.org/10.36524/ric.v1i1.235.
    10.36524/ric.v1i1.235
  17. Rodrigo Rodriguez; Carla Santos; Marta F. Simões; Célia Soares; Cledir Santos; Nelson Lima. "Polyphasic, Including MALDI-TOF MS, Evaluation of Freeze-Drying Long-Term Preservation on Aspergillus (Section Nigri) Strains". Microorganisms 7 9 (2019): 291-291. https://doi.org/10.3390/microorganisms7090291.
    10.3390/microorganisms7090291
  18. "Fungal Planet description sheets: 868–950". Persoonia - Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi (2019): http://dx.doi.org/10.3767/persoonia.2019.42.11.
    10.3767/persoonia.2019.42.11
  19. "Fungal Community Ecology Using MALDI-TOF MS Demands Curated Mass Spectral Databases". Frontiers in Microbiology (2019): http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2019.00315.
    10.3389/fmicb.2019.00315
  20. Jéssica Costa; Rodrigo Rodríguez; Esther Garcia-Cela; Angel Medina; Naresh Magan; Nelson Lima; Paola Battilani; Cledir Santos. "Overview of Fungi and Mycotoxin Contamination in Capsicum Pepper and in Its Derivatives". Toxins 11 1 (2019): 27-27. https://doi.org/10.3390/toxins11010027.
    10.3390/toxins11010027
  21. Rodriguez, R.; Santos, Carla; Simões, Marta Filipa; Soares, Célia; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Polyphasic, including MALDI-TOF MS, evaluation of freeze-drying long-term preservation on Aspergillus (section Nigri) strains". (2019): http://hdl.handle.net/1822/61259.
    10.3390/microorganisms7090291
  22. Costa, Jéssica; Rodriguez, R.; Garcia-Cela, Esther; Medina, Angel; Magan, Naresh; Lima, Nelson; Battilani, Paola; Santos, Cledir. "Overview of fungi and mycotoxin contamination in capsicum pepper and in its derivatives". (2019): http://hdl.handle.net/1822/58402.
    10.3390/toxins11010027
  23. Igor Magalhães da Veiga Moreira; Leonardo de Figueiredo Vilela; Cledir Santos; Nelson Lima; Rosane Freitas Schwan. "Volatile compounds and protein profiles analyses of fermented cocoa beans and chocolates from different hybrids cultivated in Brazil". Food Research International 109 (2018): 196-203. https://doi.org/10.1016/j.foodres.2018.04.012.
    10.1016/j.foodres.2018.04.012
  24. Moreira, Igor Magalhães da Veiga; Vilela, Leonardo de Figueiredo; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Schwan, Rosane Freitas. "Volatile compounds and protein profiles analyses of fermented cocoa beans and chocolates from different hybrids cultivated in Brazil". (2018): http://hdl.handle.net/1822/55019.
    10.1016/j.foodres.2018.04.012
  25. "Metalaxyl Degradation by Mucorales Strains Gongronella sp. and Rhizopus oryzae". Molecules (2017): http://www.mdpi.com/1420-3049/22/12/2225.
    10.3390/molecules22122225
  26. "Impact of a Microbial Cocktail Used as a Starter Culture on Cocoa Fermentation and Chocolate Flavor". Molecules (2017): http://www.mdpi.com/1420-3049/22/5/766.
    10.3390/molecules22050766
  27. "MALDI-TOF MS for identification of food spoilage filamentous fungi". Current Opinion in Food Science (2017): http://dx.doi.org/10.1016/j.cofs.2017.02.002.
    10.1016/j.cofs.2017.02.002
  28. "Fermentation profile and identification of lactic acid bacteria and yeasts of rehydrated corn kernel silage". Journal of Applied Microbiology (2017):
    10.1111/jam.13371
  29. Martins, M. Rosário; Santos, Cledir; Pereira, Pablo; Cruz-Morais, Júlio; Lima, Nelson. "Metalaxyl degradation by Mucorales strains Gongronella sp. and Rhizopus oryzae". (2017): http://hdl.handle.net/1822/48441.
    10.3390/molecules22122225
  30. Martins, M. Rosário; Santos, Cledir; Pereira, Pablo; Crus-Morais, Júlio; Lima, Nelson. "Metalaxyl Degradation by Mucorales Strains Gongronella sp. and Rhizopus oryzae". (2017): http://hdl.handle.net/10174/22433.
  31. Moreira, Igor Magalhães da Veiga; Vilela, Leonardo de Figueiredo; Miguel, Maria Gabriela da Cruz Pedroso; Lima, Nelson; Santos, Cledir; Schwan, Rosane F.. "Impact of a microbial cocktail used as starter culture on cocoa fermentation and chocolate flavor". (2017): http://hdl.handle.net/1822/46316.
    10.3390/molecules22050766
  32. Miguel, M. G. C. P.; Reis, L. V. C.; Efraim, P.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Schwan, Rosane F.. "Cocoa fermentation: Microbial identification by MALDI-TOF MS, and sensory evaluation of produced chocolate". (2017): http://hdl.handle.net/1822/43316.
    10.1016/j.lwt.2016.11.076
  33. Lisboa, Dianny Silva; Santos, Cledir; Barbosa, Renan N.; Magalhães, Oliane; Paiva, Laura M.; Moreira, Keila A.; Lima, Nelson; Souza-Motta, Cristina M.. "Requalification of a Brazilian Trichoderma collection and screening of its capability to decolourise real textile effluent". (2017): http://hdl.handle.net/1822/46317.
    10.3390/ijerph14040373
  34. Cledir Santos. "The Chilean Network of Microbial Culture Collections: Establishment and Operation". Boletín Micológico (2016):
    10.22370/bolmicol.2016.31.2.491
  35. "Immobilization of the white-rot fungus Anthracophyllum discolor to degrade the herbicide atrazine". AMB Express (2016):
    10.1186/s13568-016-0275-z
  36. "High Laccase Expression by Trametes versicolor in a Simulated Textile Effluent with Different Carbon Sources and PHs". International Journal of Environmental Research and Public Health (2016): http://www.mdpi.com/1660-4601/13/8/778.
    10.3390/ijerph13080778
  37. "Establishment of a Quality Management System Based on ISO 9001 Standard in a Public Service Fungal Culture Collection". Microorganisms (2016): http://www.mdpi.com/2076-2607/4/2/21.
    10.3390/microorganisms4020021
  38. "Polyphasic Approach Including MALDI-TOF MS/MS Analysis for Identification and Characterisation of Fusarium verticillioides in Brazilian Corn Kernels". Toxins (2016):
    10.3390/toxins8030054
  39. "New insights for diagnosis of pineapple fusariosis by MALDI-TOF MS technique". (2016):
    10.1007/s00284-016-1041-9
  40. "Fungi from a groundwater-fed drinking water supply system in Brazil". (2016):
    10.3390/ijerph13030304
  41. "Atrazine dissipation in a biobed system inoculated with immobilized white-rot-fungi". (2016):
    10.1080/03650340.2016.1155699
  42. Sampaio, J.; Machado, Diana; Gomes, Ana Marta; Machado, Idalina; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Carvalho, Maria João; et al. "Deciphering the contribution of biofilm to the pathogenesis of peritoneal dialysis infections: characterization and microbial behaviour on dialysis fluids". (2016): http://hdl.handle.net/1822/42129.
    10.1371/journal.pone.0157870
  43. Ottoni, Cristiane [UNESP]; Simões, Marta F.; Fernandes, Sara; Santos, Cledir R.; Lima, Nelson. "High laccase expression by Trametes versicolor in a simulated textile effluent with different carbon sources and PHs". (2016): http://hdl.handle.net/11449/168892.
    http://dx.doi.org/10.3390/ijerph13080778
  44. Joana Sampaio; Diana Machado; Ana Marta Gomes; Idalina Machado; Cledir Santos; Nelson Lima; Maria João Carvalho; et al. "Deciphering the contribution of biofilm to the pathogenesis of peritoneal dialysis infections: Characterization and microbial behaviour on dialysis fluids". (2016): https://hdl.handle.net/10216/105021.
    10.1371/journal.pone.0157870
  45. Oliveira, Helena M. B.; Santos, Cledir; Paterson, R. R. M.; Gusmão, Norma B.; Lima, Nelson. "Fungi from a groundwater-fed drinking water supply system in Brazil". (2016): http://hdl.handle.net/1822/42137.
    10.3390/ijerph13030304
  46. Simões, Marta Filipa; Dias, Nicolina; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Establishment of a quality management system based on ISO 9001 standard in a public service fungal culture collection". (2016): http://hdl.handle.net/1822/42130.
    10.3390/microorganisms4020021
  47. Elgueta, Sebastian; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Diez, M. C.. "Immobilization of the white-rot fungus Anthracophyllum discolor to degrade the herbicide atrazine". (2016): http://hdl.handle.net/1822/42965.
    10.1186/s13568-016-0275-z
  48. Martins, Maria Rosário; Dantas, Vânia; Soares, Célia; Santos, Cledir Rodrigues; Lima, Nelson. "IDENTIFICAÇÃO POLIFÁSICA DE GONGRONELLA SP. E DE RHIZOPUS SP. DEGRADADORES DO FUNGICIDA SISTÉMICO METALAXIL". (2016): http://hdl.handle.net/10174/19940.
  49. Elgueta, Sebastian; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Diez, M. C.. "Atrazine dissipation in a biobed system inoculated with immobilized white-rot fungi". (2016): http://hdl.handle.net/1822/42359.
    10.1080/03650340.2016.1155699
  50. Ottoni, C. A.; Simões, Marta Filipa; Fernandes, S.; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "High laccase expression by Trametes versicolor in a simulated textile effluent with different carbon sources and pHs". (2016): http://hdl.handle.net/1822/42341.
    10.3390/ijerph13080778
  51. Chang, Susane; Carneiro-Leão, Mariele Porto; Oliveira, Benny Ferreira; Souza-Motta, Cristina; Lima, Nelson; Santos, Cledir; Oliveira, Neiva Tinti. "Polyphasic approach including MALDI-TOF MS/MS analysis for identification and characterisation of Fusarium verticillioides in Brazilian corn kernels". (2016): http://hdl.handle.net/1822/40708.
    10.3390/toxins8030054
  52. Santos, Cledir; Ventura, José Aires; Lima, Nelson. "New insights for diagnosis of Pineapple Fusariosis by MALDI-TOF MS technique". (2016): http://hdl.handle.net/1822/42162.
    10.1007/s00284-016-1041-9
  53. "Production and chemical characterization of pigments in filamentous fungi". (2015):
    10.1099/mic.0.000168
  54. "MALDI-TOF MS to identify the pineapple pathogen Fusarium guttiforme and its antagonist Trichoderma asperellum on decayed pineapple". (2015):
    10.1007/s40858-015-0027-7
  55. "Induction, expression and characterisation of laccase genes from the marine-derived fungal strains Nigrospora sp. CBMAI 1328 and Arthopyrenia sp. CBMAI 1330". AMB Express (2015): http://www.amb-express.com/content/5/1/19.
    10.1186/s13568-015-0106-7
  56. "Development and optimization of a new MALDI-TOF protocol for the identification of Sporothrix species complex". Research in Microbiology (2015):
    10.1016/j.resmic.2014.12.008
  57. "Use of polyphasic approach including MALDI-TOF MS for identification of Aspergillus section Flavi strains isolated from food commodities in Brazil". Annals of Microbiology (2015):
    10.1007/s13213-015-1050-0
  58. Amaral, Cledir de Araújo; Portela, Margareth Crisóstomo; Muniz, Pascoal Torres; Farias, Edson dos Santos; Araújo, Thiago Santos de; Souza, Orivaldo Florêncio de. "Associação da força de preensão manual com morbidades referidas em adultos de Rio Branco, Acre, Brasil: estudo de base populacional". (2015): https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/28484.
  59. Passarini, Michel Rodrigo Zambrano; Ottoni, Cristiane Angelica; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Sette, Lara Durães [UNESP]. "Induction, expression and characterisation of laccase genes from the marine-derived fungal strains Nigrospora sp. CBMAI 1328 and Arthopyrenia sp. CBMAI 1330". (2015): http://hdl.handle.net/11449/131261.
    http://dx.doi.org/10.1186/s13568-015-0106-7
  60. Amaral,Cledir de Araújo; Portela,Margareth Crisóstomo; Muniz,Pascoal Torres; Farias,Edson dos Santos; Araújo,Thiago Santos de; Souza,Orivaldo Florêncio de. "Associação da força de preensão manual com morbidades referidas em adultos de Rio Branco, Acre, Brasil: estudo de base populacional". (2015): http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-311X2015000601313.
  61. Silva, Fernanda Chaves da; Chalfoun, Sara Maria; Batista, Luis Roberto; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "TAXONOMIA POLIFÁSICA PARA IDENTIFICAÇÃO DE ASPERGILLUS SEÇÃO FLAVI: UMA REVISÃO". (2015): http://ojs.ifes.edu.br/index.php/ric/article/view/302.
  62. Passarini, Michel Rodrigo Zambrano; Ottoni, C. A.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Sette, Lara Durães. "Induction, expression and characterisation of laccase genes from the marine-derived fungal strains Nigrospora sp. CBMAI 1328 and Arthopyrenia sp. CBMAI 1330". (2015): http://hdl.handle.net/1822/35095.
    10.1186/s13568-015-0106-7
  63. Santos, Cledir; Ventura, José A.; Costa, Hélcio; Fernandes, Patrícia M.B.; Lima, Nelson. "MALDI-TOF MS to identify the pineapple pathogen Fusarium guttiforme and its antagonist Trichoderma asperellum on decayed pineapple". (2015): http://hdl.handle.net/1822/37758.
    10.1007/s40858-015-0027-7
  64. Silva, Fernanda Chaves da; Chalfoun, Sara Maria; Batista, Luis Roberto; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Taxonomia polifásica para a identificação de Aspergillus seção Flavi: uma revisão". (2015): http://hdl.handle.net/1822/70364.
    10.36524/ric.v1i1.235
  65. "Peritoneal dialysis infections: An opportunity for improvement". American Journal of Infection Control (2014):
    10.1016/j.ajic.2014.05.036
  66. "Application of MALDI-TOF MS for requalification of a Candida clinical isolates culture collection". Brazilian Journal of Microbiology (2014):
    10.1590/S1517-83822014005000044
  67. "Purification of polygalacturonases produced by Aspergillus niger using an aqueous two-phase system". Fluid Phase Equilibria (2014):
    10.1016/j.fluid.2014.03.018
  68. "Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) applied to diatom identification: influence of culturing age". Aquatic Biology (2014):
    10.3354/ab00548
  69. "Synthesis, characterisation and antifungal activity of chemically and fungal-produced silver nanoparticles against Trichophyton rubrum". Journal of Applied Microbiology (2014):
    10.1111/jam.12652
  70. Lima-Neto,Reginaldo; Santos,Cledir; Lima,Nelson; Sampaio,Paula; Pais,Célia; Neves,Rejane P.. "Application of MALDI-TOF MS for requalification of a Candida clinical isolates culture collection". (2014): http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000200020.
  71. Lima-Neto, Reginaldo; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Sampaio, Paula; Pais, Célia; Neves, Rejane P.. "Application of MALDI-TOF MS for requalification of a Candida clinical isolates culture collection". (2014): http://hdl.handle.net/1822/31883.
    10.1590/S1517-83822014005000044
  72. Rodrigues, Anabela; Maciel, Marília de Holanda Cavalcanti; Santos, Cledir; Machado, Diana Sofia Rodrigues; Sampaio, Joana Marisa Brito; Lima, Nelson; Carvalho, Maria J.; Cabrita, António; Martins, Margarida Isabel Barros Coelho. "Peritoneal dialysis infections : an opportunity for improvement". (2014): http://hdl.handle.net/1822/31542.
    10.1016/j.ajic.2014.05.036
  73. Ottoni, C. A.; Lima, Luís; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Effect of different carbon sources on decolourisation of an industrial textile dye under alkaline-saline conditions". (2014): http://hdl.handle.net/1822/27612.
    10.1007/s00284-013-0441-3
  74. Maciel, Marília de Holanda Cavalcanti; Ottoni, C. A.; Herculano, Polyanna N.; Porto, Tatiana Souza; Porto, Ana L. F.; Santos, Cledir; Lima, Nelson; Moreira, Keila; Motta, Cristina Maria de Souza. "Purification of polygalacturonases produced by Aspergillus niger using an aqueous two-phase system". (2014): http://hdl.handle.net/1822/31601.
    10.1016/j.fluid.2014.03.018
  75. Pereira, Leonel; Dias, Nicolina; Carvalho, Juliana; Fernandes, Sara; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Synthesis, characterisation and antifungal activity of chemically and fungal-produced silver nanoparticles against Trichophyton rubrum". (2014): http://hdl.handle.net/1822/31493.
    10.1111/jam.12652
  76. Pereira, Leonel João Pais; Dias, Nicolina; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "The use of MALDI-TOF ICMS as an alternative tool for Trichophyton rubrum identification and typing". (2014): http://hdl.handle.net/1822/28012.
    10.1016/j.eimc.2013.01.009
  77. "The importance of structural diversity of spores in the taxonomy of Aspergillus (section Nigri)". Microscopy and Microanalysis (2013):
    10.1017/S1431927613001001
  78. Kozakiewicz, Z.; Lima, N.; Ottoni, C.A.; Santos, C.. "White-rot fungi capable of decolourising textile dyes under alkaline conditions". Folia Microbiologica 58 3 (2013): 187-193. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84876429869&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s12223-012-0196-4
  79. Dias, N.; Lima, N.; Pereira, L.; Santos, C.. "The use of MALDI-TOF ICMS as an alternative tool for Trichophyton rubrum identification and typing". Enfermedades Infecciosas y Microbiologia Clinica (2013): http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84875027707&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.eimc.2013.01.009
  80. Lima, N.; MacIel, M.; Moreira, K.; Ottoni, C.; Santos, C.; Souza-Motta, C.. "Production of polygalacturonases by Aspergillus section Nigri strains in a fixed bed reactor". Molecules 18 2 (2013): 1660-1671. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84874589019&partnerID=MN8TOARS.
    10.3390/molecules18021660
  81. Berlinck, R.G.S.; Lima, N.; Passarini, M.R.Z.; Santos, C.; Sette, L.D.. "Filamentous fungi from the Atlantic marine sponge Dragmacidon reticulatum". Archives of Microbiology 195 2 (2013): 99-111. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84873701959&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s00203-012-0854-6
  82. Gusmão, N.B.; Lima, N.; Oliveira, H.M.B.; Paterson, R.R.M.; Santos, C.; Siqueira, V.M.. "Biofilms from a Brazilian water distribution system include filamentous fungi". Canadian Journal of Microbiology 59 3 (2013): 183-188. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84875642565&partnerID=MN8TOARS.
    10.1139/cjm-2012-0529
  83. Ottoni, C.; Lima, L.; Santos, C.; Lima, N.. "Effect of Different Carbon Sources on Decolourisation of an Industrial Textile Dye Under Alkaline-Saline Conditions". Current Microbiology (2013): 1-6. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84882502987&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s00284-013-0441-3
  84. Simes, M.F.; Santos, C.; Lima, N.. "Structural diversity of aspergillus (section nigri) spores". Microscopy and Microanalysis 19 5 (2013): 1151-1158. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84884561135&partnerID=MN8TOARS.
    10.1017/S1431927613001712
  85. Cruz, R.; Santos, C.; Silva de Lima, J.; Aparecida Moreira, K.; Maria de souza-Motta, C.. "Diversity of Penicillium in soil of Caatinga and Atlantic Forest areas of Pernambuco, Brazil: An ecological approach". Nova Hedwigia 97 3-4 (2013): 543-556. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84885895039&partnerID=MN8TOARS.
    10.1127/0029-5035/2013/0127
  86. Cruz, Roberta; Santos, Cledir; Lima, Juliana Silva de; Moreira, Keila; Motta, Cristina Souza. "Diversity of Penicillium in soil of Caatinga and Atlantic Forest areas of Pernambuco, Brazil: an ecological approach". (2013): http://hdl.handle.net/1822/28050.
    10.1127/0029-5035/2013/0127
  87. Simões, Marta Filipa Jesus Freitas; Santos, Cledir; Lima, Nelson. "Structural diversity of aspergillus (section nigri) spores". (2013): http://hdl.handle.net/1822/26071.
    10.1017/S1431927613001712
  88. "A utilização da técnica de MALDI-TOF MS na identificação de fitopatógenos e no diagnóstico de doenças de plantas". Revisão Anual de Patologia de Plantas (2012): http://repositorium.sdum.uminho.pt/handle/1822/20923.
  89. Fernandes, S.; Simões, M.; Dias, N.; Santos, C.; Lima, N.. "Fungicidal Activity of Microbicides". Russell, Hugo & Ayliffe's: Principles and Practice of Disinfection, Preservation and Sterilization (2012): 142-154. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-84887181342&partnerID=MN8TOARS.
    10.1002/9781118425831.ch7
  90. Dias, N.; Lima, N.; Portela, M.; Santos, C.. "Toenail Onychomycosis in a Portuguese Geriatric Population". Mycopathologia 172 1 (2011): 55-61. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79960586043&partnerID=MN8TOARS.
    10.1007/s11046-011-9402-1
  91. Dias, N.M.; Lima, N.; Oliveira, M.M.E.; Portela, M.A.; Santos, C.; Zancope-Oliveira, R.M.. "Sporotrichosis caused by Sporothrix mexicana, Portugal". Emerging Infectious Diseases 17 10 (2011): 1975-1976. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80053266463&partnerID=MN8TOARS.
    http://dx.doi.org/10.3201/eid1710.110737
  92. Lima, N.; Rodrigues, P.; Santos, C.; Venâncio, A.. "Species identification of Aspergillus section Flavi isolates from Portuguese almonds using phenotypic, including MALDI-TOF ICMS, and molecular approaches". Journal of Applied Microbiology 111 4 (2011): 877-892. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80052792324&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/j.1365-2672.2011.05116.x
  93. Lima, N.; Pais, C.; Sampaio, P.; Santos, C.. "Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight intact cell mass spectrometry to detect emerging pathogenic Candida species". Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 71 3 (2011): 304-308. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-80053927280&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.diagmicrobio.2011.07.002
  94. Gusmão, N.B.; Lima, N.; Oliveira, H.M.B.; Paterson, R.R.M.; Santos, C.; Siqueira, V.M.. "Filamentous fungi in drinking water, particularly in relation to biofilm formation". International Journal of Environmental Research and Public Health 8 2 (2011): 456-469. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-79953267048&partnerID=MN8TOARS.
    10.3390/ijerph8020456
  95. Martins, M. Rosário; Santos, Cledir; Pereira, Pablo; Simões, Fernanda; Cruz-Morais, Júlio; Lima, Nelson. "Characterisation by molecular biology and MALDI-TOF ICMS of zygomycete Gongronella sp. isolated from an Alentejo vineyard soil". (2011): http://hdl.handle.net/10174/3843.
  96. Fraga, M.E.; Kozakiewicz, Z.; Lima, N.; Santos, C.. "Fourier transform infrared as a powerful technique for the identification and characterization of filamentous fungi and yeasts". Research in Microbiology 161 2 (2010): 168-175. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77949916349&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.resmic.2009.12.007
  97. Lima, N.; Paterson, R.R.M.; Santos, C.; Venâncio, A.. "Filamentous fungal characterizations by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry". Journal of Applied Microbiology 108 2 (2010): 375-385. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-74049132252&partnerID=MN8TOARS.
    10.1111/j.1365-2672.2009.04448.x
  98. "Structure activity relationships for dipeptide prodrugs of acyclovir: Implications for prodrug design". European Journal of Medicinal Chemistry (2009):
    10.1016/j.ejmech.2008.08.009
  99. Santos, Cledir R.; Capela, Rita; Pereira, Claudia S. G. P.; Valente, Emilia; Gouveia, Luis; Pannecouque, Christophe; De Clercq, Erik; Moreira, Rui; Gomes, Paula. "Structure-activity relationships for dipeptide prodrugs of acyclovir". (2009): http://hdl.handle.net/10451/21170.
    http://dx.doi.org/10.1016/j.ejmech.2008.08.009
  100. Lima, N.; Paterson, R.R.M.; Santos, C.; Sariah, M.; Zainal Abidin, M.A.. "Mutagenic and inhibitory compounds produced by fungi affect detrimentally diagnosis and phylogenetic analyses". Current Bioactive Compounds 4 4 (2008): 245-257. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-65649092120&partnerID=MN8TOARS.
    10.2174/157340708786847906
  101. Santos, C.. "Intramolecular cyclization: A promising strategy in the prodrug conception | Ciclização intramolecular: Uma estratégia promissora no desenvolvimento de pró-fármacos". Revista Brasileira de Ciencias Farmaceuticas/Brazilian Journal of Pharmaceutical Sciences 44 3 (2008): 349-360. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-55849098881&partnerID=MN8TOARS.
    10.1590/S1516-93322008000300004
  102. De Clercq, E.; Gomes, P.; Gouveia, L.; Morais, J.; Moreira, R.; Nielsen, C.U.; Pannecouque, C.; Santos, C.; Steffansen, B.. "Dipeptide derivatives of AZT: Synthesis, chemical stability, activation in human plasma, hPEPT1 affinity, and antiviral activity". ChemMedChem 3 6 (2008): 970-978. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-48149103948&partnerID=MN8TOARS.
    10.1002/cmdc.200800012
  103. Santos,Cledir. "Ciclização intramolecular: uma estratégia promissora no desenvolvimento de pró-fármacos". (2008): http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-93322008000300004.
  104. Cledir Santos; Jose Morais; Luis Gouveia; Erik de Clercq; Christophe Pannecouque; Carsten Uhd Nielsen; Bente Steffansen; Rui Moreira; Paula Gomes. "Dipeptide derivatives of AZT: Synthesis, chemical stability, activation in human plasma, hPEPT1 affinity, and antiviral activity". (2008): https://repositorio-aberto.up.pt/handle/10216/82105.
    10.1002/cmdc.200800012
  105. Santos, Cledir; Morais, Jose; Gouveia, Luis; de Clercq, Erik; Pannecouque, Christophe; Nielsen, Carsten Uhd; Steffansen, Bente; Moreira, Rui; Gomes, Paula. "Dipeptide derivatives of AZT". (2008): http://hdl.handle.net/10451/21282.
    http://dx.doi.org/10.1002/cmdc.200800012
  106. De Oliveira, E.; Dos Santos, A.P.; Gomes, P.; Mateus, M.L.; Moreira, R.; Santos, C.. "Cyclization-activated prodrugs. Synthesis, reactivity and toxicity of dipeptide esters of paracetamol". Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 15 6 (2005): 1595-1598. http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-14644436965&partnerID=MN8TOARS.
    10.1016/j.bmcl.2005.01.065
Capítulo de livro
  1. Santos, Cledir; Galeno, Paula; Lima-Neto, Reginaldo; Oliveira, Manoel M. E.; Lima, Nelson. "MALDI-TOS MS and its requirements for fungal identification". CABI International, 2021.
  2. Costa, Jéssica; Lima, Nelson; Santos, Cledir. "Chilean pepper: Spoilage fungi and mycotoxins contamination risk in Capsicum products". Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, 2019.
  3. Santos, Cledir; Francisco, Elaine; Mazza, Mariana; Padovan, Ana Carolina B.; Colombo, Arnaldo; Lima, Nelson. "Impact of MALDI-TOF MS in clinical mycology: progress and barriers in diagnostics". John Wiley and Sons, 2016.
    10.1002/9781118960226.ch9
  4. "Polyphasic Identification and Preservation of Fungal Diversity: Concepts and Applications". 2013.
    10.1007/978-94-007-5931-2_5
Livro
  1. Oliveira, L. A.; Fernandes, O. C.; Jesus, M. A.; Bentes, J. L. S.; Andrade, S. L.; Souza, A. Q. L.; Santos, Cledir. Diversidade microbiana da Amazônia. Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. 2016.
  2. Biological resource centres : closing the gap between science and society. 2012.
Tese / Dissertação
  1. Almeida, Alex-Sandra Farias de. "Síntese de nanopartículas de prata por fungos endofíticos isolados de guaranazeiro e seu efeito contra fitopatógenos". Doutoramento, 2019. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7045.
  2. Silva, Blenda Naara Santos da. "Diversidade e atividade biológica de fungos endofíticos do guaraná (Paullinia cupana var. sorbillis)". Doutoramento, 2019. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7173.
  3. LISBOA, Dianny Carolyne Vasconcelos da Silva. "Biorremediação de efluentes de lavanderias têxteis por espécies de Trichoderma da Micoteca URM produtoras de enzimas oxidativas". Doutoramento, 2017. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/30756.
  4. Klein, Nazareth Magnago. "Estudo genômico e fenotípico, que inclui a abordagem de perfis proteômicos por MALDI-TOF MS, de isolados de hemoculturas para o estabelecimento de uma coleção de bactérias de referência". Doutoramento, 2015. http://hdl.handle.net/1822/36751.
  5. Medeiros, Luciane Martins. "Criação da Bacterioteca de Biomanguinhos, caracterização de estirpes bacterianas e desenvolvimento de um sistema integrado de identificação de micro-organismos e de rastreamento de fontes de contaminação". Doutoramento, 2015. https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40059.
  6. Simões, Marta Filipa Jesus Freitas. "Quality parameters in a culture collection - Micoteca da Universidade do Minho". Doutoramento, 2013. http://hdl.handle.net/1822/28820.
  7. SILVA, Lidiane Roberta Cruz da. "Espécies de Penicillium em solos de caatinga e Mata Atlântica, produção de tanase e detecção do potencial micotoxigênico". Doutoramento, 2013. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12804.
  8. Ottoni, C. A.. "Descoloração de corantes têxteis por fungos ligninolíticos em condições de pH e salinidade elevada". Doutoramento, 2012. http://hdl.handle.net/1822/20855.
  9. Sequeira, Lídia Sofia. "Study of new methods for the characterisation and the preservation of diatom cultures". Mestrado, 2011. http://hdl.handle.net/1822/20267.

Outros

Outra produção
  1. Fungal community ecology using MALDI-TOF MS demands curated mass spectral databases. Authors thank professors Marc-André Lachance and GregThorn for critical reading on initial drafts of this piece. Mariana Cereia, English teacher, kindly proofread the ¿nal version. Authors also thank Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), Conselho de Desenvolvimento Cientí¿co e Tecnológico (CNPq) and National System for Research on Biodiversity (Sisbiota-Brazil, CNPq 563260. 2019. Sanitá-Lima, Matheus; Lucas, Rosymar Coutinho de; Lima, Nelson; Polizeli, Maria de Lourdes T.; Santos, Cledir. http://hdl.handle.net/1822/59451.
    10.3389/fmicb.2019.00315