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My name is João Gabriel Silva. I'm currently a PhD Fellow at Doctoral Program of Experimental Biology and Biomedicine at the Institute of Interdisciplinary Research at University of Coimbra, supported by a grant from Fundação para a Ciência e Tecnologia. My project focuses on working with a zebrafish model for hepatic fluxes in diet-induced NAFLD context, hosted by Center of Neurosciences and Cell Biology at University of Coimbra, CICECO at University of Aveiro, and CIVG at Escola Universitária Vasco da Gama in Coimbra. I have a BSc in Biology in 2019 (final classification of 17) and a MSc in Cellular and Molecular Biology in 2021 (final classification of 19), both by University of Coimbra. My thesis was titled "The Effects Of High Fat Feeding On The Metabolomics Of Heart, Kidney And Skeletal Muscle In C57BL6J Mice As Analysed By 1H NMR", supervised by Doctor Ludgero Tavares, Professor Ana Gil and Professor Rui Carvalho, and an article as a main author is being prepared from this work. Currently I have 4 articles published in international journals, accumulating 28 citations in the past 3 years, and 4 participations in a international and national conferences posters, one awarded the 3rd Best Poster and another with an Honourable Mention. Additionally, I have been awarded with the prize "3% Best Students" in 2017 and" Merit Board" in 2018, both at University of Coimbra, as well as multiple honour awards in basic and high-school. During my time at University of Coimbra, I was a Collaborator (2016-2018) and then the Coordinator (2018-2020) of Scientific Formation and Professional Goals at the Nuclei of Biology Students of the Academic Association of Coimbra, organizing several scientific events within the Student Association and the Research Centres of the Universities. Furthermore, I was also a participant in different workshops, courses, meetings and conferences, as well as a volunteer in different organizations. My current research interests focus on Metabolism, Metabolomics and Big Data tools to better understand and characterise diseases such as the Metabolic Syndrome, Non-alcoholic Fatty Liver Disease and Diabetes, employing Nuclear Magnetic Resonance (NMR), Stable Isotope Tracers, and Multivariate Analyse Tools. During my (still short) academic experience I had different learning periods: a summer internship in Escola Superior Agrária, working in horses reproduction; a long term internship in the Metabolic Control Center in the Center of Neurosciences and Cell Biology in Coimbra, studying fish and mice metabolism; and more recently, I secured a position as a fellowship researcher at the Metabolomics Lab in CICECO-Aveiro, in the project "The role of extrahepatic fructose metabolism in the development of non-alcoholic fatty liver disease", acquiring and analysing NMR data from mice with different energetic diets. From my past research work, I have experience techniques such as NMR Spectroscopy, stable isotope labelling, HPLC and sample processing in extraction and purification of mice tissues (tissue homogenizers, liquid nitrogen grinding, freeze-drying, MTBE and Folch extractions, solid phase extractions for triglycerides). Additionally, I had contact with statistical tools in Multivariate Analysis (PCA, PLS-DA and OPLS-DA), and well as software such as Python, R, GraphPad Prism, Excel, MATLAB, SIMCA, and NMR tools (TopSpin, Amix and Chenomx).
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
João Gabriel Silva

Nomes de citação

  • Silva, João Gabriel
  • Silva, J G

Identificadores de autor

Ciência ID
B61E-1EFB-F5A0
ORCID iD
0000-0002-1150-1893
Google Scholar ID
https://scholar.google.com/citations?user=mfk0C1AAAAAJ&hl=en
Researcher Id
ABG-1901-2021
Scopus Author Id
57218329674

Moradas

  • CNC University of Coimbra Rua Larga Faculty of Medicine, Pólo I, 1st floor, 3004-504, Coimbra, Coimbra, Portugal (Profissional)
  • Biocant Park - UC Biotech, Parque Tecnológico de Cantanhede, Núcleo 04, Lote 3, 3060-197, Cantanhede, Cantanhede, Portugal (Profissional)
  • Complexo de Laboratórios Tecnológicos Campus Universitário de Santiago, 3810-193, Aveiro, Aveiro, Portugal (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Molecular
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Biologia Celular
  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica
  • Ciências Médicas e da Saúde - Medicina Clínica - Endocrinologia e Metabolismo
  • Ciências Médicas e da Saúde - Ciências da Saúde

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Português (Idioma materno)
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Espanhol; Castelhano Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B2) Utilizador independente (B1) Utilizador independente (B2)
Formação
Grau Classificação
2022/09 - 2026
Em curso
Doctoral Program in Experimental Biology and Biomedicine (Doutoramento)
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
2023/09/11 - 2023/09/22
Concluído
Laboratory Animal Science Course - FELASA Accredited Course 020/08F (Outros)
Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal
2023 - 2023
Concluído
Advanced Course Proteomics Approaches in Life Sciences (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
19
2023 - 2023
Concluído
Advanced Course Neuroscience - Bioinformatics and Computational Biology (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
17
2023 - 2023
Concluído
Advanced Course Principles and Practices in Drug Development (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
19
2023 - 2023
Concluído
Advanced Course Ageing (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
17
2023 - 2023
Concluído
Advanced Course ONE HEALTH: A Metabolic Approach from the Cell to Society (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
18
2022 - 2022
Concluído
Advanced Course Connecting Researchers with the Society and Industry (Curso de mestrado (conclusão do curso de especialização))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
18
2022 - 2022
Concluído
Advanced Course Core Technologies (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
18
2022 - 2022
Concluído
Advanced Course Experimental Science Design (Curso de doutoramento (conclusão de unidades curriculares))
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
19
2019/09 - 2021/09
Concluído
Cellular and Molecular Biology (Mestrado)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
"The effects of high fat feeding on the metabolomics of heart, kidney and skeletal muscle in C57BL6J mice as analysed by 1H NMR" (TESE/DISSERTAÇÃO)
19
2016/09 - 2019/06
Concluído
Biology (Licenciatura)
Universidade de Coimbra Faculdade de Ciencias e Tecnologia, Portugal
17
2018/07 - 2019/03
Concluído
Quantification of adenine nucleotides by HPLC (Outros)
Universidade de Coimbra, Portugal
2015/06/29 - 2015/07/03
Concluído
Summer Internship - Ciência Viva no Laboratório - Ocupação Científica de Jovens nas Férias (Outros)
Instituto Politécnico de Coimbra Escola Superior Agrária de Coimbra, Portugal
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2022/09 - Atual Investigador (Investigação) Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal
Universidade de Coimbra Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal
(...)
2020/09 - 2021/06 Investigador (Investigação) Universidade de Aveiro CICECO, Portugal
Universidade de Aveiro Departamento de Química, Portugal
(...)
2018/07 - 2020/08 Estagiário de Investigação (Investigação) Universidade de Coimbra, Portugal
Universidade de Coimbra, Portugal
(...)
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2020/09/01 - 2021/01/01 VISCERAL: The role of extrahepatic fructose metabolism in the development of non-alcoholic fatty liver disease
POCI-01-0145-FEDER-028147
Bolseiro de Investigação
Universidade de Aveiro CICECO, Portugal

Universidade de Coimbra Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal

Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em revista
  1. Ivan Viegas; Giada Di Nunzio; Getachew D. Belew; Alejandra N. Torres; João G. Silva; Luis Perpétuo; Cristina Barosa; Ludgero C. Tavares; John G. Jones. "Integration of Liver Glycogen and Triglyceride NMR Isotopomer Analyses Provides a Comprehensive Coverage of Hepatic Glucose and Fructose Metabolism". Metabolites (2022): https://doi.org/10.3390/metabo12111142.
    10.3390/metabo12111142
  2. DiNunzio, Giada; Belew, Getachew D.; Torres, Alejandra N.; Silva, João Gabriel; Silva, Luis P.; Barosa, Cristina; Tavares, Ludgero; Jones, John G.. "Determining the contribution of a high-fructose corn syrup formulation to hepatic glycogen synthesis during ad-libitum feeding in mice". Scientific Reports 10 1 (2020): http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-69820-3.
    10.1038/s41598-020-69820-3
  3. Belew, Getachew D.; Di Nunzio, Giada; Tavares, Ludgero; Silva, Joao G.; Torres, Alejandra N.; Jones, John G.. "Estimating pentose phosphate pathway activity from the analysis of hepatic glycogen 13 C-isotopomers derived from [U- 13 C]fructose and [U- 13 C]glucose". Magnetic Resonance in Medicine 84 5 (2020): 2765-2771. http://dx.doi.org/10.1002/mrm.28286.
    10.1002/mrm.28286
  4. Palma, Mariana; Tavares, Ludgero; Rito, João; Henriques, Luís; Silva, João; Ozório, Rodrigo; Pardal, Miguel; Magnoni, Leonardo; Viegas, Ivan. "Metabolic Effects of Dietary Glycerol Supplementation in Muscle and Liver of European Seabass and Rainbow Trout by 1H NMR Metabolomics". Metabolites 9 10 (2019): 202. http://dx.doi.org/10.3390/metabo9100202.
    10.3390/metabo9100202
Poster em conferência
  1. Silva, João Gabriel; Tavares, L C; Belew, Getachew Debas; Gil, Ana; Jones, John. "Exploring the lipidomic profiles of mice extrahepatic tissues in high-fat-induced NAFLD using 1H-NMR". Trabalho apresentado em IV Metabolism Ageing and Disease Meeting, 2024.
  2. Silva, João Gabriel; Ludgero, L C; Belew, Getachew Debas; Carvalho, RA; Carvalho, R; Carvalho Rui; Gil, Ana; Jones, John. Autor correspondente: Silva, João Gabriel. "Tecidos extra-hepáticos e dFGNA induzida pela dieta: uma nova perspetiva através de metabolómica". Trabalho apresentado em 19º Congresso Português de Diabetes, 2023.
  3. Silva, João Gabriel; Ludgero, L C; Carvalho, RA; Carvalho, R; Carvalho Rui; Gil, Ana; Jones, John. Autor correspondente: Silva, João Gabriel. "Extrahepatic Tissue And Diet-induced NAFLD: A New Insight Through Metabolomics". Trabalho apresentado em BEBDay 2023, 2023.
  4. Silva, João Gabriel; Tavares, L C; Gil, Ana M.; Jones, John. Autor correspondente: Silva, João Gabriel. "Non-Alcoholic Fatty Liver Disease and Western Diet: A Tale of the Effects in the Metabolomics of the Heart". Trabalho apresentado em VI meet.Lab 2022, 2022.
  5. Palma, Mariana; Tavares, L C; Rito, Joao; Henriques, Luís; Silva, João Gabriel; Rema, P; Ozório, R.O.A.; et al. Autor correspondente: Palma, Mariana. "Effects of Dietary Glycerol Supplementation in Liver And Muscle Metabolome: Comparative Study In European Seabass And Rainbow Trout". Trabalho apresentado em Aquaculture Europe 2019 – Berlin, Germany, 2019.
Resumo em conferência
  1. Silva, João Gabriel; Ludgero C. Tavares; Belew, Getachew Debas; Gil, Ana; Jones, John. Autor correspondente: Jones, John. "Beyond the liver: Impact of high-fat-induced MASLD in the lipidomic profiles of mice extrahepatic tissues". Trabalho apresentado em 58th Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation, Barcelona, 2024.
    Aceite para publicação • https://doi.org/10.1111/eci.14220
  2. Silva, João Gabriel; Ludgero, L C; Belew, Getachew Debas; Gil, Ana; Jones, John. Autor correspondente: Jones, John. "Indo além do Fígado: Impacto de dFGNA induzida por dieta no perfil lipídico de tecidos extra-hepáticos de murganhos". Trabalho apresentado em 20º Congresso Português de Diabetes, Vilamoura, 2024.
    Publicado
  3. Silva, João Gabriel; Tavares, L C; Belew, Getachew Debas; Carvalho, R A; Gil, Ana; Jones, John. Autor correspondente: Jones, John. "Tecidos extra-hepáticos e dFGNA induzida pela dieta: uma nova perspectiva metabolómica". Trabalho apresentado em 19th Portuguese Diabetes Congress, Vilamoura, 2023.
    Publicado
  4. Belew, G D; Silva, João Gabriel; Rito, J; Viegas, I; Teixeira, J; Oliveira, P J; Tavares, L C; Jones, J G. "13C NMR of hepatic triglyceride from mice fed fructose plus [U-13C]glucose informs the contribution of glucose to de novo lipogenesis and elongation of specific fatty acid classes". Trabalho apresentado em 7th EASD NAFLD Study Group Meeting, Lisbon, 2019.
    Publicado
  5. Tavares, L C; Belew, G D; Silva, João Gabriel; Rito, J; Viegas, I; Teixeira, J; Oliveira, P J; Jones, J G. "The distribution of saturated, monounsaturated and polyunsaturated fatty acids in the sn2 and sn1,3 positions of hepatic triglyceride is not homogenous". Trabalho apresentado em 7th EASD NAFLD Study Group Meeting, Lisbon, 2019.
    Publicado
Tese / Dissertação
  1. "The effects of high fat feeding on the metabolomics of heart, kidney and skeletal muscle in C57BL6J mice as analysed by 1H NMR". Mestrado, Universidade de Coimbra, 2021. https://eg.uc.pt/handle/10316/96156.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2024/06/06 Beyond the liver: Impact of high-fat-induced MASLD in the lipidomic profiles of mice extrahepatic tissues 58th Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation
(Barcelona , Espanha)
2023/05/08 The effects of high fat feeding on the metabolomics of heart, kidney and skeletal muscle in C57BL6J mice as analysed by 1H NMR "Methodologies in Research and Development", class part of the Integrated Masters in Veterinarian Medicine at Escola Universitária Vasco da Gama
Escola Universitária Vasco da Gama (Coimbra, Portugal)

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação)
Instituição / Organização
2023/09/29 - 2023/09/29 Researcher at booth "68. Poder Sustentável e Inclusivo - As Nossas Mitocôndrias." (2023/09/29 - 2023/09/29)
Outro (Outra)
2019 - 2019 III meet.Lab - Encontro Nacional de Estudantes de Laboratório (2019 - 2019)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade de Coimbra, Portugal

Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2018 - 2018 II meet.Lab - Encontro Nacional de Estudantes de Laboratório (2018 - 2018)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
Universidade de Coimbra, Portugal

Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra, Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento
Nome do evento
Instituição / Organização
2023/03/16 - 2023/03/18 Portuguese National Congress on Diabetology for Fundamental, Applied and Medical Research.
Congresso
19º Congresso Português de Diabetes
Sociedade Portuguesa de Diabetologia, Portugal
2023/02/07 - 2023/02/08 Conference organized by senior PhD Students of the Doctoral Program in Experimental Biology and Biomedicine. Objetive is for younger and senior students to present their works and attend talks of national and international speakers.
Conferência
BEBDay 2023
Universidade de Coimbra Instituto de Investigação Interdisciplinar, Portugal
2022/11/08 - 2022/12/06 Training programme in Bioentrepreneurship, BioSTART, from the 8th of November to the 6th of December 2022, with the total duration of 16 hours
Outro
BioSTART (Bioentrepreneurship Course)
Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Universidade de Coimbra, Portugal

Biocant Associação de Transferência de Tecnologia, Portugal
2022/11/23 - 2022/11/28 2 day workshop in coding language R. Organized by Núcleo de Estudantes de Biologia
Oficina (workshop)
R Workshop, Part I and II
Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2022/11/10 - 2022/11/10 Identifying skills and strengths - Chaperone's Career Development Workshop
Oficina (workshop)
Identifying skills and strengths - Chaperone's Career Development Workshop
Chaperone, Portugal
2022/10/19 - 2022/10/19 Data Analysis | Python - European Code Week (Webinar)
Oficina (workshop)
Data Analysis | Python
2022/09/28 - 2022/09/28 Gibco - 60 Years loving your cells - Group of Seminars
Seminário
Gibco - 60 Years loving your cells
Thermo Fisher Scientific Inc Pittsburgh, Estados Unidos
2021/09/29 - 2021/09/29 Intermediate Benchtop NMR Spectroscopy (Webinar)
Seminário
Intermediate Benchtop NMR Spectroscopy
Oxford Instruments Magnetic Ressonance, Reino Unido
2021 - 2021 9th IberoAmerican NMR meeting
Congresso
Grupo Especializado de Resonancia Magnética Nuclear, Espanha
2019 - 2019 Fish Metabolism - Applications to Aquaculture (Flash Course)
Conferência
Universidade de Coimbra Departamento de Ciências da Vida, Portugal

Centro de Ecologia Funcional, Portugal

Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal
2019 - 2019 How to write a great research paper and get published - Researcher Academy On Campus
Seminário
Elsevier Inc, Estados Unidos

Universidade de Coimbra, Portugal
2018 - 2018 III Meet.Eco Coimbra - Encontro Nacional de Estudantes de Ecologia
Encontro
Universidade de Coimbra, Portugal

Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2017 - 2017 XX Encontro Nacional de Estudantes de Biologia
Encontro
Universidade de Aveiro, Portugal
2017 - 2017 I meet.Lab - Encontro Nacional de Estudantes de Laboratório
Encontro
Universidade de Coimbra, Portugal

Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2017 - 2017 Excel Workshop Level I and II
Oficina (workshop)
Universidade de Coimbra, Portugal

Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2017 - 2017 Computer Building Workshop
Oficina (workshop)
Universidade de Coimbra, Portugal

Núcleo De Engenharia Eletrotrotécnica e de Computadores da AssociaçãoAcadémica de Coimbra, Portugal

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2018 - 2020 Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra Coordinator of Scientific Formation and Professional Goals
2017 - 2018 AFS Training Novos Voluntários Volunteer
2016 - 2018 Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra Collaborator of Scientific Formation and Professional Goals
2008 - 2018 Liga Portuguesa Contra o Cancro and Banco Alimentar Contra a Fome while in the Scouts Volunteer
Distinções

Prémio

2023 Honourable Mention Poster - Poster in Fundamental Research
Sociedade Portuguesa de Diabetologia, Portugal
2022 3rd Best Poster Presentation at VI meet.Lab Coimbra
Núcleo de Estudantes de Biologia da Associação Académica de Coimbra, Portugal
2018 Merit Board at University of Coimbra
Universidade de Coimbra, Portugal
2017 3% Best Students at University of Coimbra
Universidade de Coimbra, Portugal
2016 Honour Student (All Years from 2008/2009 to 2015/2016)
Instituto Educativo de Souselas, Portugal

Outra distinção

2022 CIBB-CNC - FCT PhD Fellowship
Universidade de Coimbra Centro de Inovação em Biomedicina e Biotecnologia, Portugal

Centro de Neurociências e Biologia Celular, Portugal

Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal