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I am a researcher in at the Applied Molecular Biosciences Unit & i4HB Associated Laboratory-NOVA School of Science and Technology (UCIBIO-FCT-NOVA). I’m a member of the UCIBIO Macromolecular Crystallography and Functional Glycobiology Labs. I have been responsible for applying structural and sequence bioinformatics for the identification, construct design and recombinant expression of carbohydrate-binding and carbohydrate-active proteins. I have specialized in the analysis of these proteins using glycan-microarrays, x-ray crystallography and several biophysical characterization techniques such as Isothermal titration calorimetry (ITC) and Microscale Thermophoresis (MST). I also give assistance in molecular biology in both groups. PHD TRAINING My PhD was focused on the study at the molecular and atomic level of the cohesin-dockerin interaction, important for the assembly of a multi-enzymatic complex involved in the degradation of the plant cell wall by cellulolytic bacteria, the cellulosome. For this, I gained expertise in Molecular Biology essential for the recombinant production of the cohesin and dockerin proteins and mutational analysis of the function. In the initial study, I specially devised and implemented an essay using Non-Denaturing Gel Electrophoresis (NGE) for the study of cohesin-dockerin pairs and complemented with a thermodynamic analysis of the interaction by Isothermal Titration Calorimetry (ITC) and structurally characterization by X-ray Crystallography. In my PhD, I was also involved in the cloning and production of other protein modules constituents of the C. thermocellum cellulosome like esterases, glycohydrolases and carbohydrate-binding modules (CBM). POST-DOC TRAINING For my Post-Doc, I decided to deepen my knowledge in X-ray Crystallography moving to the group of Prof Maria João Romão. During this time, I initiated a collaboration with Dr Angelina Palma, having been introduced to glycan microarrays. I have also received training in HTP techniques for protein production (EMBO course) and Structural Bioinformatics (EMBL-EBI course). RESEARCH CONTRIBUTIONS I was involved in setting up molecular biology techniques and protocols in the Macromolecular Crystallography laboratory, which opened new avenues of research. I implemented the protein microarray technology in the Functional Glycobiology laboratory within the scope of a project grant funded by FCT to establish the proof-of-concept. I have been involved in several funded projects (2022.06104.PTDC, PTDC/BIA-MIB/31730/2017, PTDC/BIA-MIB/31730/2017, PTDC/QUI-QUI/112537/2009) where X-ray crystallography is combined with glycan microarray analysis, revealed the unique selective binding of several carbohydrate interacting proteins from bacteria from the rumen and from the human gut. I’m currently part of the internationally funded project GLYCOTwinning (HORIZON-WIDERA-2021-101079417). SUPERVISION, I have been the supervisor of three MSc student Thesis and was involved in the training of four PhD students, 3 MSc researchers and 7 undergraduate students. I have been involved in the tutoring of students for the program Verão com Ciência. TEACHING I have given regular support to Biochemistry and Structural Biology classes. I annually teach practical classes for the subject “Metabolismo e Regulação”. OUTREACH I participate in the FCT Open day and European Researcher Night. I am responsible for the Functional Glycobiology website (https://glycolab.webhost.fct.unl.pt/). Our divulgation videos are available at https://glycolab.webhost.fct.unl.pt/index.php/acucares-mais-do-que-apenas-doces-moleculas/.
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Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Benedita Pinheiro

Nomes de citação

  • Pinheiro, Benedita
  • Pinheiro, B. A.

Identificadores de autor

Ciência ID
CB17-E1B7-4EE7
ORCID iD
0000-0002-3045-077X

Endereços de correio eletrónico

  • b.pinheiro@fct.unl.pt (Profissional)

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Naturais - Ciências Biológicas - Bioquímica

Idiomas

Idioma Conversação Leitura Escrita Compreensão Peer-review
Inglês Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1) Utilizador proficiente (C1)
Francês Utilizador elementar (A1) Utilizador independente (B1) Utilizador elementar (A1) Utilizador elementar (A1)
Português (Idioma materno)
Crioulo e pídgin, baseada em Português (Outras)
Formação
Grau Classificação
2010
Concluído
 Tese de Doutoramento em Ciência e Tecnologia Animal/PhD in Animal Science and Technology (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
"Novel insight into the mechanism of cellulosome assembly and plant cell wall hydrolysis in anaerobic bacteria" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 Por unanimidade/By unanimity
2009
Concluído
 Certificate in Advanced English (Diploma de especialização)
Cambridge School Portugal, Portugal
 B
2008/04/08 - 2008/04/18
Concluído
 VII Course on Laboratory Animal Science (Outros)
Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
2004
Concluído
 Bioquímica (Licenciatura)
Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
"Adesão de Desulfovibrio alaskensis a superfícies de vidro" (TESE/DISSERTAÇÃO)
 16 (maximum 20)
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2018/12/19 - Atual Investigador Contratado (Investigação) REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Outros

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento 		Empregador
2010/10/01 - Atual Postdoctoral researcher REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2010/02/15 - 2010/09/30 FCT-UNL Requimte Research fellow. Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2006/01/01 - 2009/12/31 PhD student at the Laboratory of Nutrition under supervision of Prof Carlos Fontes Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
2009/01/09 - 2009/04/09 Traineeship (3 months) in the laboratory of Professor Harry Gilbert Newcastle University Institute for Cell and Molecular Biosciences, Reino Unido
2008/06/01 - 2008/09/30 Traineeship (3 months) in the laboratory of Professor Harry Gilbert. Consolidation of the calorimetric data of protein complexes under study. Newcastle University Institute for Cell and Molecular Biosciences, Reino Unido
2007/05/01 - 2007/07/30 Traineeship in the laboratory of Professor Harry Gilbert . Aim was to obtain calorimetric values of the formation of protein-protein complexes. Learned the handling of the isothermal calorimetry titra Newcastle University Institute for Cell and Molecular Biosciences, Reino Unido
2005/04/01 - 2006/12/31 Research Fellow at the Interdisciplinary Centre of Research in Animal Health (CIISA) Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
2004/11/01 - 2005/03/31 Technical Volunteer in Biocorrosion group Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
2003/09/01 - 2004/10/30 Final course trainee in the laboratory of Biocorrosion Universidade de Lisboa Faculdade de Ciências, Portugal
Projetos

Projeto

Designação Financiadores
2023/01 - 2027/12 CryoEM@NOVA: a cryo electron microscopy hub enabling drug discovery
101087571
 European Commission
2023/03/01 - 2026/02/28 Glicofoldameros como inibidores de toxinas bacterianas
2022.03561.PTDC
Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2023/03/01 - 2026/02/28 Descoberta de proteínas do microbioma humano selectivas para O-glicanos – ferramentas para novas abordagens na investigação em cancro
2022.06104.PTDC
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2021/01/01 - 2025/12/31 Institute for Health and Bioeconomy
LA/P/0140/2020
10.54499/LA/P/0140/2020
Universidade de Lisboa Instituto de Bioengenharia e Biociências, Portugal

Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

INESC Microsistemas e Nanotecnologias, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2022/12 - 2025/11 GLYCOTwinning: Building Networks to Excel in Glycosciences
101079417
 European Commission
2022/01/10 - 2023/07/09 Compreender as interações e modulação alostérica do transportador de norepinefrina NET
EXPL/BIA-BQM/0011/2021
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

REQUIMTE Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2018/09/01 - 2022/08/31 Interação do microbioma humano com hidratos de carbono: diversidade estrutural e reconhecimento de hidratos de carbono no intestino humano e impacto na saúde e nutrição
PTDC/BIA-MIB/31730/2017
Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2019/01/01 - 2019/12/31 Applied Molecular Biosciences Unit
UID/Multi/04378/2019
Universidade do Porto Faculdade de Ciências, Portugal

Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Universidade do Porto Instituto de Ciências Tecnologias e Agroambiente, Portugal

Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal

Universidade Nova de Lisboa Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2010/10/01 - 2018/12/18 THE CELLULOSOME ASSEMBLY: STRUCTURE, FUNCTION AND SPECIFICITY OF NEW CELLULASES AND SUPRAMOLECULAR COMPLEXES
SFRH/BPD/68563/2010
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2017/01 - 2018/12 Molecular determinants of bacterial cellulosome diversity in different ecological niches
Provided by PTCRIS: 144587
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2016/10 - 2017/09 An integrative structural biology approach to characterise the protein-carbohydrate microbial recognition
Provided by PTCRIS: 139494
Bolseiro de Pós-Doutoramento
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2013/07 - 2016/06 Modern Structural Biology: Resources for the advancement of in-house X-ray Crystallography
125363
Provided by PTCRIS: 125363
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2011/03/01 - 2014/08/31 Microarrays de hidratos de carbono para identificação de novos ligandos no reconhecimento de polissacáridos por módulos proteicos de bactérias.
PTDC/QUI-QUI/112537/2009
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2013/07 - 2014/06 Development of cohesin- microarrays for determining cohesin-dockerin specificities of novel cellulolytic species
Provided by PTCRIS: 126085
126085
Investigador responsável
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.
2013/07 - 2014/06 Pylori GlycoArrays: Development of microarrays from Helicobacter pylori cell surface glycome toward immunological and serological studies
127236
Provided by PTCRIS: 127236
EXPL/BBB-BQB/0750/2012
Investigador
Rede de Química e Tecnologia Laboratório Associado para a Química Verde, Portugal

Associação para a Inovação e Desenvolvimento da FCT, Portugal

Universidade de Aveiro, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P.

Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2009/01/01 - 2011/12/31 Estrutura e função de novos módulos de ligação a carbohidratos e complexos coesina-doquerina do Clostridium thermocellum
PTDC/BIA-PRO/69732/2006
Universidade de Lisboa Centro de Investigação Interdisciplinar em Sanidade Animal, Portugal

Universidade de Lisboa Faculdade de Medicina Veterinária, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2006/01/01 - 2009/12/31 DEVELOPING AND TESTING TAILOR-MADE CELLULASE AND XYLANASES MULTI-ENZYME COMPLEXES TO IMPROVE THE NUTRITIVE VALUE OF CEREAL-BASED DIETS FOR POULTRY
SFRH/BD/25439/2005
 Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Produções

Publicações

Artigo em conferência
  1. Correia, Viviana G.; Brás, Joana Luís Armada; Liu, Yan; Silva, Lisete; Zhang, Yibing; Pinheiro, Benedita; Romão, Maria João C.; et al. "An integrative strategy to decipher glycan recognition in the human gut microbiome.". Trabalho apresentado em Annual Meeting of the Society for Glycobiology, New Orleans, LA, 2016.
    Publicado
Artigo em revista
  1. Galrinho, Miguel; Silva, Lisete; Lopes, Guido R.; Bernardo A. C. Ferreira; Valente, Sara A.; Isabel Ferreira; Pinheiro, Benedita; et al. Autor correspondente: Passos, Claudia P.. "The study of galactomannans with different molecular weights and their ability to form microparticles suitable for pulmonary delivery". Carbohydrate Polymers (2024):
    Em revisão
  2. Sofia F. Reis; Susana Messias; Rita Bastos; Vítor J. Martins; Viviana G. Correia; Benedita A. Pinheiro; Lisete M. Silva; et al. "Structural differences on cell wall polysaccharides of brewer's spent Saccharomyces and microarray binding profiles with immune receptors". Carbohydrate Polymers 301 (2023): 120325-120325. http://dx.doi.org/10.1016/j.carbpol.2022.120325.
    10.1016/j.carbpol.2022.120325
  3. Sofia F. Reis; Vitor J. Martins; Rita Bastos; Tânia Lima; Viviana G. Correia; Benedita A. Pinheiro; Lisete M. Silva; et al. "Feasibility of Brewer’s Spent Yeast Microcapsules as Targeted Oral Carriers". Foods (2023): https://doi.org/10.3390/foods12020246.
    10.3390/foods12020246
  4. Trovão, Filipa; Correia, Viviana G.; Lourenço, Frederico M.; Ribeiro, Diana O.; Carvalho, Ana Luísa; Palma, Angelina S.; Pinheiro, Benedita A.. "The structure of a Bacteroides thetaiotaomicron carbohydrate-binding module provides new insight into the recognition of complex pectic polysaccharides by the human microbiome". Journal of Structural Biology: X 7 (2023): 100084. http://dx.doi.org/10.1016/j.yjsbx.2022.100084.
    10.1016/j.yjsbx.2022.100084
  5. Correia VG; Trovão F; Pinheiro BA; Brás JLA; Silva LM; Nunes C; Coimbra MA; et al. "Mapping Molecular Recognition of ß1,3-1,4-Glucans by a Surface Glycan-Binding Protein from the Human Gut Symbiont Bacteroides ovatus.". Microbiology spectrum (2021): http://europepmc.org/abstract/med/34817219.
    10.1128/spectrum.01826-21
  6. Gomes, Ana Sara; Ramos, Helena; Gomes, Sara; Loureiro, Joana B.; Soares, Joana; Barcherini, Valentina; Monti, Paola; et al. "SLMP53-1 interacts with wild-type and mutant p53 DNA-binding domain and reactivates multiple hotspot mutations". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects 1864 1 (2020): 129440. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2019.129440.
    10.1016/j.bbagen.2019.129440
  7. Pandeirada CO; Maricato É; Ferreira SS; Correia VG; Pinheiro BA; Evtuguin DV; Palma AS; et al. "Structural analysis and potential immunostimulatory activity of Nannochloropsis oculata polysaccharides.". Carbohydrate polymers (2019): http://europepmc.org/abstract/med/31320077.
    10.1016/j.carbpol.2019.06.001
  8. Gomes, Ana; Trovão, Filipa; Andrade Pinheiro, Benedita; Freire, Filipe; Gomes, Sara; Oliveira, Carla; Domingues, Lucília; et al. "The Crystal Structure of the R280K Mutant of Human p53 Explains the Loss of DNA Binding". International Journal of Molecular Sciences 19 4 (2018): 1184. http://dx.doi.org/10.3390/ijms19041184.
    10.3390/ijms19041184
  9. Pinheiro, B. A.; Bras, J. L.; Bule, P.; Pires, V. M.; Romao, M. J.; Alves, V. D.; Palma, A. S.; Fontes, C. M.; Carvalho, A. L.. "Probing the unique molecular mechanisms used by Clostridium thermocellum for Cellulosome function". European Biophysics Journal With Biophysics Letters 46 (2017): S170-S170. http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcAuth=ORCID&SrcApp=OrcidOrg&DestLinkType=FullRecord&DestApp=WOS_CPL&KeyUT=WOS:000416406201101&KeyUID=WOS:000416406201101.
  10. Brás JL; Pinheiro BA; Cameron K; Cuskin F; Viegas A; Najmudin S; Bule P; et al. "Diverse specificity of cellulosome attachment to the bacterial cell surface.". (2016): http://europepmc.org/abstract/med/27924829.
    10.1038/srep38292
  11. Pinheiro, Benedita Andrade; Armada Bras, Joana Luis; Najmudin, Shabir; Carvalho, Ana Luisa; Ferreira, Luis M. A.; Prates, Jose A. M.; Godinho Andrade Fontes, Carlos Mendes. "Flexibility and specificity of the cohesin-dockerin interaction: implications for cellulosome assembly and functionality". Biocatalysis and Biotransformation 30 3 (2012): 309-315.
    10.3109/10242422.2012.681854
  12. Najmudin, Shabir; Pinheiro, Benedita A.; Prates, Jose A. M.; Gilbert, Harry J.; Romao, Maria J.; Fontes, Carlos M. G. A.. "Putting an N-terminal end to the Clostridium thermocellum xylanase Xyn10B story: Crystal structure of the CBM22-1-GH10 modules complexed with xylohexaose". Journal of Structural Biology 172 3 (2010): 353-362.
    10.1016/j.jsb.2010.07.009
  13. Pinheiro, Benedita A.; Gilbert, Harry J.; Sakka, Kazutaka; Sakka, Kazuo; Fernandes, Vania O.; Prates, Jose A. M.; Alves, Victor D.; et al. "Functional insights into the role of novel type I cohesin and dockerin domains from Clostridium thermocellum". Biochemical Journal 424 (2009): 375-384.
    10.1042/BJ20091152
  14. Montanier, Cedric; Money, Victoria A.; Pires, Virginia M. R.; Flint, James E.; Pinheiro, Benedita A.; Goyal, Arun; Prates, Jose A. M.; et al. "The Active Site of a Carbohydrate Esterase Displays Divergent Catalytic and Noncatalytic Binding Functions". Plos Biology 7 3 (2009): 687-697.
    10.1371/journal.pbio.1000071
  15. Najmudin, Shabir; Pinheiro, Benedita A.; Romao, Maria J.; Prates, Jose A. M.; Fontes, Carlos M. G. A.. "Purification, crystallization and crystallographic analysis of Clostridium thermocellum endo-1,4-beta-D-xylanase 10B in complex with xylohexaose". Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications 64 (2008): 715-718.
    10.1107/S1744309108019696
  16. Pinheiro, Benedita A.; Proctor, Mark R.; Martinez-Fleites, Carlos; Prates, Jose A. M.; Money, Victoria A.; Davies, Gideon J.; Bayer, Edward A.; et al. "The Clostridium cellulolyticum dockerin displays a dual binding mode for its cohesin partner". Journal of Biological Chemistry 283 26 (2008): 18422-18430.
    10.1074/jbc.M801533200
Capítulo de livro
  1. Correia, Viviana; Costa, Raquel; Trovão, Filipa; Candeias, Alícia; Pinheiro, Benedita. "The bacterial toolkit for glycan recognition in the human gut". In Carbohydrate Chemistry, editado por Amélia Pilar Rauter; Yves Queneau; Palma, Angelina S., 175-191. Royal Society of Chemistry, 2024.
    Publicado • 10.1039/bk9781837672844-00175
  2. Ribeiro, Diana O.; Pinheiro, Benedita A.; Carvalho, Ana Luísa; Palma, Angelina S.. "Targeting protein-carbohydrate interactions in plant cell-wall biodegradation: the power of carbohydrate microarrays". In Carbohydrate Chemistry, 159-176. Royal Society of Chemistry, 2017.
    10.1039/9781788010641-00159
Poster em conferência
  1. Candeias, Alícia; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Marcelo, Filipa; Coelho, Helena. Autor correspondente: Coelho, Helena. "Mucin O-glycan recognition by Salmonella SiiE adhesin for targeted anti-adhesion therapy". Trabalho apresentado em 4th Meeting of Young Biophysicists - Biophysics Festival, 2024.
  2. Candeias, Alícia; Trovão, Filipa; Oliveira Soares, Cátia; Grosso, Ana Sofia; Marcelo, Filipa; Pinheiro, Benedita; Carvalho, Ana Luísa; Palma, Angelina S.. Autor correspondente: Candeias, Alícia. "Structural elucidation of a novel Carbohydrate-binding module from Bacteroides caccae targeting tumor-associated mucin O-glycans". Trabalho apresentado em How Time-Resolved X-ray Crystallography is driving Structural Biology forward – Workshop, 2024.
  3. Pinheiro, B. A.; Trovão, Filipa; Correia, V.G.; Costa, R.L.; Candeias, Alícia; Di Maio, A.; Feizi, Ten; et al. "Discovery and characterization of O-glycan selective proteins from the human gut microbiota". Trabalho apresentado em 7th Iberian Carbohydrate Meeting, 2024.
  4. Candeias, Alícia; Trovão, Filipa; Oliveira Soares, Cátia; Grosso, Ana Sofia; Marcelo, Filipa; Pinheiro, Benedita; Carvalho, Ana Luísa; Palma, Angelina S.. Autor correspondente: Candeias, Alícia. "A novel Carbohydrate-binding module from Bacteroides caccae targeting tumour-associated mucin O-glycans". Trabalho apresentado em 7th Iberian Carbohydrate Meeting, 2024.
  5. Leite, Marlene; Candeias, Alícia; Oliveira Soares, Cátia; Pinheiro, Benedita; Dias, Jorge S; Palma, Angelina S.; Marcelo, Filipa; Coelho, H.. Autor correspondente: Coelho, H.. "Decoding Salmonella adhesins: Unravelling molecular interactions for novel anti-infection strategies". Trabalho apresentado em 7 th Iberian Carbohydrate Meeting, 2024.
  6. Candeias, Alícia; Trovão, Filipa; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Carvalho, Ana Luísa. Autor correspondente: Candeias, Alícia. "Structural insights on the recognition of mucin O-glycans by a novel member of family 32 CBM from Bacteroides caccae". Trabalho apresentado em 1st GLYCOTwinning Summer School, 2023.
  7. Candeias, Alícia; Trovão, Filipa; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Carvalho, Ana Luísa. Autor correspondente: Candeias, Alícia. "Structural basis for recognition of mucin O-glycans by a novel member of family 32 CBM from Bacteroides caccae". Trabalho apresentado em XIII Jornadas de Carbohidratos (Spanish Carbohydrate Meeting), 2023.
  8. Lopes, Nuno; Trindade, Gonçalo; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Catarina Brito . Autor correspondente: Catarina Brito. "Profiling glycan epitopes in Triple Negative Breast Cancer to explore interactions with tumor-associated macrophages". Trabalho apresentado em 14th International Meeting of the Portuguese Carbohydrate Group, 2023.
  9. Candeias, Alícia; Trovão, Filipa; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Carvalho, Ana Luísa. Autor correspondente: Candeias, Alícia. "The 3D structure of BC16100-C, a novel protein from Bacteroides caccae, in complex with the Tn antigen reveals the molecular determinants that allow this bacterium to recognise host glycoproteins". Trabalho apresentado em GLUPOR14 - 14th International Meeting of the Portuguese Carbohydrate Group, 2023.
  10. Engrola, Filipa; Lora Denson; Pinheiro, Benedita; Ci Chu; Santos-Silva, Teresa; Manuel Etzkorn; Viegas, Aldino. "Production of human norepinephrine transporter - hNET - in insect cells". Trabalho apresentado em Joint Instruct-iNEXT Course: Integrating Structural Biology Techniques, 2022.
  11. Oliveira Soares, Cátia; Natasha Rodrigues; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Marcelo, Filipa; Coelho, Helena. Autor correspondente: Coelho, Helena. "Molecular recognition of host¬glycans by fimbrial adhesins of SalmonellaTyphimurium". Trabalho apresentado em Biochemistry Global Summit (IUBMB-FEBS-PABMB 2022) Lisboa (Portugal), 2022.
  12. Trovão, Filipa; Candeias, Alícia; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Carvalho, Ana Luísa. Autor correspondente: Candeias, Alícia. "Structural insights on the glycan-binding function of a novel protein from Bacteroides caccae, a commensal bacterium from the human gut". Trabalho apresentado em 2nd National Crystallographic Meeting, 2022.
  13. Oliveira Soares, Cátia; Natasha Rodrigues; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Marcelo, Filipa; Coelho, Helena. Autor correspondente: Coelho, Helena. "Decoding the adhesion step of Salmonella Typhimurium to host-glycans". Trabalho apresentado em First Summer School in Biomedical Glycoscience, 2022.
  14. Trovão, Filipa; Candeias, Alícia; Pinheiro, Benedita; Liu, Yan; Carvalho, Ana Luísa; Palma, Angelina S.. Autor correspondente: Trovão, Filipa. "Structural elucidation of novel glycan-binding proteins from Bacteroides caccae - a resident of the human gut microbiota". Trabalho apresentado em Diamond-CCP4 Data Collection and Structure Solution Workshop, 2021.
  15. Pereira, J. R. A.; Correia, V.G.; Carvalho, A. L.; Palma, A.S.; Romão, M. J.; Pinheiro, B. A.. "Cohesin microarrays: A tool to unveil new cellulosome species". Trabalho apresentado em National Meeting of Portuguese Students in Biochemistry (ENEBIOQ VII), 2014.

Outros

Conjunto de dados
  1. Trovão, Filipa; Pinheiro, Benedita; Correia, Viviana G.; Palma, Angelina S.; Carvalho, Ana Luísa. Structure of CBM BT0996-C from Bacteroides thetaiotaomicron. PDB database. 2023.
  2. Correia, Viviana G.; Trovão, Filipa; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Carvalho, Ana Luísa. Structure of SGBP BO2743 from Bacteroides ovatus in complex with mixed-linked gluco-nonasaccharide. 2021.
  3. Correia, Viviana G.; Trovão, Filipa; Pinheiro, Benedita; Palma, Angelina S.; Carvalho, Ana Luísa. Structure of SGBP BO2743 from Bacteroides ovatus. PDB database. 2021.
Outra produção
  1. Resistance to Aminoglycosides. Glycomics and the Link to the Human Gut Microbiome. 2019. Viviana Gomes Correia; Pinheiro, Benedita; Carvalho, Ana Luísa; Palma, Angelina S.. http://dx.doi.org/10.1002/9781119282549.ch1.
    10.1002/9781119282549.ch1
  2. The Structural Basis of the Recognition of Di-glucosylated N-glycans by the ER Lectin Malectin. Glycobiology. 2013. Ana Luísa Carvalho; Maria João Romão; Palma, Angelina S.; Pinheiro, Benedita; Liu, Yan; Takeda, Yoichi; Chai, Wengang; et al. https://novaresearch.unl.pt/en/publications/a3f0fd44-8cef-4765-a321-f549d44a6fa4.
Atividades

Apresentação oral de trabalho

Título da apresentação Nome do evento
Anfitrião (Local do evento)
2023/06/16 Molecular Characterization of O-glycan selective proteins from human commensal bacteria 15th Jenner Glycobiology and Medicine Symposium
Institute for Research and Innovation in Health (i3S) (Porto, Portugal)
2023/01/17 Mapping Molecular Recognition of beta-1,3-1,4-Glucans by a Surface Glycan-Binding Protein from the Human Gut Symbiont Bacteroides ovatus 14th International meeting of the Portuguese Carbohydrate Group (GLUPOR 14)
FCT-NOVA (Caparica, Portugal)
2020/12/16 Exploring the human microbiome for novel glyco-selective proteins acting on dietary and host glycans bioSeminars@UCIBIO
UCIBIO (Caparica)
2019 Structure of a novel CBM provides further insight into the bacterial degradation of complex pectic polysaccharides 13th International Meeting of the Portuguese Carbohydrate Group (Glupor 13)
i3S – Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Universidade do Porto (Porto, Portugal)
2017 Structural Basis for the Highly Selective Recognition of Di-Glucosylated N-glycans by Human Malectin in the Endoplasmic Reticulum Glupor12 - 12th International Meeting of Portuguese Carbohydrate Group
Universidade Aveiro (Aveiro, Portugal)
2015 A multi-disciplinary study of the cellulosome assembly. 6th European Conference Chemistry in the Life Sciences
REQUIMTE-FCT-NOVA (Lisbon, Portugal)
2011 Cohesin-dockerin interactions are determinant for efficient cellulose degradation in cellulolyticum bacteria 9th Carbohydrate Bioengineering Meeting
CIISA - FMV/UTL (Lisbon, Portugal)

Orientação

Título / Tema
Papel desempenhado 		Curso (Tipo)
Instituição / Organização
2023/02 - 2023/06 Discovery and Characterization of novel GlycO-selective mucinases
Orientador
 Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato)
Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/02 - 2023/06 Development Cancer Glycan Binding proteins
Orientador
 Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato)
Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/09/01 - 2022/09/30 Descoberta e caracterização de novas o-enzimas do microbioma para análise da glicosilação tipo mucina
Orientador
 Iniciação à Investigação em Ciências Biomoleculares (Iniciação científica)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/09/01 - 2022/09/30 Desenvolvimento de módulos de deteção de glicosilação aberrante em células cancerígenas
Coorientador
 Iniciação à Investigação em Ciências Biomoleculares (Iniciação científica)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022 - 2022 Glycan Binding Proteins for Cancer Glycan Recognition
Coorientador
 Erasmus research practical course (Iniciação científica)
Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021 - 2021 Structural and functional characterization of the human malectin glycan-binding pocket
Orientador
 Bioquímica para a Saúde (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019 - 2021 Structural and functional characterization of the human malectin glycan-binding pocket
Orientador
 Mestrado Bioquímica para saúde (Mestrado)
Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2017 - 2017 Assignment of new roles for malectin-like domains to understand their divergent evolution
Orientador
 Bioquímica (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2016 - 2017 Assignment of new roles for malectin-like domains to understand their divergent evolution
Orientador
 Bioquímica (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal
2015 - 2015 A organização molecular do Celulossoma: caracterização estrutural da proteína CipA e estudo da diversidade das interações coesina-doquerina
Orientador
 Bioquímica (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014 - 2015 Estudos da organização do celulossoma: caracterização estrutural da proteína CipA por Cristalografia de Raios-X e estudo da diversidade das interacções coesina-doquerina utilizando Microarrays
Orientador
 Bioquímica (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal
2014 - 2014 MSc Fellow hired under project EXPL/BBB-BEP/0506/2012
Orientador
2014 - 2014 Microarrays de coesina para decifrar o código de montagem do celulossoma a uma escala proteómica
Orientador
 Bioquímica
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014 - 2014 Malectina: Novo processo de purificação
Orientador
 Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2013 - 2013 Estudo da Interação coesina-doquerina e o seu papel na formação do celulossoma de C. thermocellum
Orientador
 Brazilian interchange program “Ciência sem fronteiras”, (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2012 - 2012 Caracterização bioquímica, por electroforese, de vários módulos proteicos do Celulossoma
Orientador
 Bioquímica (Licenciatura/Bacharelato)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Organização de evento

Nome do evento
Tipo de evento (Tipo de participação) 		Instituição / Organização
2023/01/16 - 2023/01/18 14th International Meeting of the Portuguese Carbohydrate Group The meeting is dedicated to discussing scientific advances in carbohydrate research by displaying various and cross-disciplinary areas within the field of glycosciences, with a focus on basic and applied applications. The meeting also provides a unique opportunity for the carbohydrate national and international community to form new collaborations and strengthen existing ones. (2023/01/16 - 2023/01/18)
Conferência (Membro da Comissão Organizadora)
 Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2019 - 2019 Local Organizing Committee (Volunteer) of the European Union Science Olympiad 2019 (EUSO 2019), FCT-NOVA, Caparica, Portugal. (https://www.euso2019.pt/) (2019 - 2019) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2018 - 2018 UCIBIO Annual Meeting (2018 - 2018) (2018 - 2018)
Encontro (Membro da Comissão Organizadora)
 Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal

Participação em evento

Descrição da atividade
Tipo de evento 		Nome do evento
Instituição / Organização
2020/11/23 - 2020/11/27 EMBL-EBI Structural Bioinformatics course
Oficina (workshop)
 EMBL-EBI Structural Bioinformatics
2017/07/06 - 2017/07/14 EMBO practical course on HTP techniques for protein production and crystallization.
Oficina (workshop)
 High-throughput protein production and crystallization, EMBO Course
University of Oxford Research Complex at Harwell, Reino Unido
2016/05/29 - 2016/06/04 Course on theoretical principles of crystallography
Oficina (workshop)
 3rd International Summer School of Crystallography
Center for Free-Electron Laser Science, Alemanha
2014/05/26 - 2014/05/30 EMBO course on GLycobiology and Glycochemistry
Oficina (workshop)
 Glycobiology and glycochemistry: Applications to human health and disease
NOVA Medical School - CEDOC, Portugal
2007/03/26 - 2007/03/30 Course on Protein Crystallography
Oficina (workshop)
 Protein Crystallography
Applied Molecular Biosciences Unit (UCIBIO), Portugal

Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2006/03/11 - 2006/03/15 Bioinformatic course sequence analysis
Oficina (workshop)
 SAHPC06: Sequence Analysis using High Performance Computing
Instituto Gulbenkian de Ciência, Portugal

Júri de grau académico

Tema
Tipo de participação 		Nome do candidato (Tipo de grau)
Instituição / Organização
2023/12/14 The impact of defective host cell glycosylation in bacterial infection
Arguente principal
 Patrícia Alexandra Nunes Mexia (Mestrado)
Universidade Nova de Lisboa Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier, Portugal
2023/07 The role of microbiota on the rate of horizontal gene transfer events in a mouse model of Inflammatory Bowel Disease
Arguente principal
 Maria Leonor Silva (Outro)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2022/07 Isolamento e caracterização Bioquímica da Peroxidase da Escherichia coli
Arguente principal
 Catarina Rosado Correia (Outro)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2021/07 Caracterização da interação do domínio C-terminal da endosina Twort com o peptidoglicano de S. aureus
Arguente principal
 Francisco Seco (Outro)
Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Consultoria / Parecer

Descrição da atividade Instituição / Organização
2023 - 2023 Analysis of the Pequi exocarp total extract for lectin activity using glycan microarrays. Universidade de Lisboa Faculdade de Farmácia, Portugal

Universidade de Lisboa Instituto Superior de Agronomia, Portugal
2021 - 2023 Pre-clinical characterization of antibodies for a clinical trial using carbohydrate microarrays for CellmAbs biopharmaceuticals.

Curso / Disciplina lecionado

Disciplina Curso (Tipo) Instituição / Organização
2020 - Atual Practical classes of Metabolism and Regulation curricular unit, a total of 28 hours (Licenciatura) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2023/09/25 - 2023/09/28 "Hands-on: Protein crystallization" module of the GlycoTwinning Summer School "Scientific Hands-on course in protein/glycan interactions: a structural perspective. NMR, X-ray crystallography, cryoEM and molecular modelling." (Pós-Graduação) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2020/07/27 - 2020/07/31 UCIBIO Summer School, Programa “Ciência no Verão” FCT-MCTES, Lesson on MST and ITC biophysical techniques, 29 July, FCT-NOVA (Mestrado) Unidade de Ciências Biomoleculares Aplicadas, Portugal
2019 - 2019 Practical classes of Metabolism and Regulation curricular unit, a total of 25 hours Biologia Celular e Molecular; Química Aplicada (Licenciatura) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2015/07/13 - 2015/07/19 International hands-on Course ISBio2015: Integrative Structural Biology tools for the study of protein-ligand interactions. INSTRUCT/COST supported training course. (co-organization and teaching; supervisor of the Isothermal Titration Calorimetry module). (Outros) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014/10/06 - 2014/10/12 Course ISBio2014: Integrative Structural Biology tools for the study of protein-ligand interactions. INSTRUCT/COST supported training course (co-organization and teaching in the Isothermal titration Calorimetry module). (Outros) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014 - 2014 Practical crystallization classes of the curricular unit Structural Biochemistry Bioquímica (Mestrado integrado) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2014 - 2014 Practical crystallization classes of the curricular unit Fundaments of Structural Biochemistry Bioquímica (Licenciatura) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal
2010 - 2014 Practical Classes of Metabolism and Regulation curricular unit, 15 hours per year Bioquímica (Licenciatura) Universidade Nova de Lisboa Faculdade de Ciências e Tecnologia, Portugal

Membro de associação

Nome da associação Tipo de participação
2015 - Atual Sociedade Portuguesa de Química Membro
2015 - Atual Portuguese Carbohydrate Group Membro

Tutoria

Tópico Nome do aluno
2024/01 - Atual Molecular Biology/Biochemistry/Carbohydrate Microarrays Ana Luísa Da Silva Ribeiro Benavente
2022 - Atual Molecular Biology Filipa Engrola
2017 - Atual Molecular Biology / Protein Biochemistry and Crystallography Filipa Trovão
2015 - Atual Molecular Biology / Protein Biochemistry and Crystallography Raquel Costa
2021 - 2024 Biochemistry / Protein microarrays Nuno Lopes
2016 - 2019 Molecular Biology / Protein Biochemistry and Crystallography Viviana Correia
2016 - 2019 Molecular Biology / Protein Biochemistry and Crystallography Diana Ribeiro
Distinções

Prémio

2014 Best Poster Award at the EMBO course "Glycobiology and glycochemistry: Applications to human health and disease"
NOVA Medical School - CEDOC, Portugal