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Pedro T. Monteiro is an Associate Professor at the Department of Computer Science and Engineering of Instituto Superior Técnico (IST) - Universidade de Lisboa and a Senior Researcher at INESC-ID Lisboa (ARSR scientific area). His current research interests include formal and static analysis of qualitative models of biological regulatory networks. In particular, through the use of formal verification techniques like model checking and temporal logic, for the exploration of interesting dynamical behaviours of qualitative biological models. He is also interested in exploring the structure of Boolean functions to study how their choice impacts the dynamics of logical models, and to develop model revision procedures. In this context, he is involved on the development of http://ginsim.org, a computer tool for the modeling and simulation of genetic regulatory networks, and http://epilog-tool.org, a computer tool for the modeling, simulation and visualisation of logical models for epithelial pattern formation. He also belongs to http://CoLoMoTo.org (Consortium for Logical Models and Tools), a consortium of research groups interested in logical modelling. He is also deeply involved in the continuous maintenance and development of http://yeastract-plus.org, a portal of repositories of regulatory associations for S.cerevisiae, pathogenic Candida species and non-conventional yeast species, with new visualization and computational tools to enable cross-species comparison of regulatory networks.
Identificação

Identificação pessoal

Nome completo
Pedro T Monteiro

Nomes de citação

  • Monteiro, Pedro T

Identificadores de autor

Ciência ID
FD1C-1FB0-AF6F

Websites

Domínios de atuação

  • Ciências Exatas - Ciências da Computação e da Informação - Bioinformática
Formação
Grau Classificação
2006 - 2010
Concluído
Engenharia Informática e de Computadores (Doutoramento)
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
"Towards an integrative approach for the modeling and formal verification of biological regulatory networks" (TESE/DISSERTAÇÃO)
Approved unanimously
2006 - 2010
Concluído
Bioinformatique (Doutoramento)
Université Claude Bernard Lyon 1, França
"Towards an integrative approach for the modeling and formal verification of biological regulatory networks" (TESE/DISSERTAÇÃO)
Approved
Percurso profissional

Ciência

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2012/12 - Atual Investigador (Investigação) Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal

Docência no Ensino Superior

Categoria Profissional
Instituição de acolhimento
Empregador
2020 - Atual Professor Associado (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
2016/09 - 2020/08 Professor Auxiliar (Docente Universitário) Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal
Projetos

Bolsa

Designação Financiadores
2017/07 - Atual BioData.pt - Portuguese Biological Data Network
ROTEIRO/0098/2013
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2020/01/01 - 2023/06/30 LAIfeBlood - Inteligência Artificial para a Gestão do Sangue
Investigador responsável
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2019/01/01 - 2022/06/30 Data2Help: Ciência de Dados para Optimização de Serviços de Emergência Médica
DSAIPA/AI/0044/2018
Investigador
Instituto Nacional de Emergência Médica IP, Portugal

Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento, Portugal

Instituto Superior Técnico Centro de Estudos de Gestão, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2018/10 - 2021/09 MIXEDUP - Targeting pathogenesis and engineering cell factories: by developing mixed regulatory-metabolic genomic models in yeasts
PTDC/BII-BIO/28216/2017
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/07 - 2019/12 CoMEDy - A COmputational Modelling platform for Epithelial DYnamics to explore the role of epithelial-mesenchymal transition and stemness acquisition in cancer recurrence
PTDC/BEX-BCB/0772/2014
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/03 - 2019/08 CANTROL - Deciphering the mechanisms of transcriptional regulation that control antifungal drug resistance in the pathogenic yeast Candida glabrata: aiming the development of improved diagnosis and therapeutic approaches
PTDC/BBB-BIO/4004/2014
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Em curso
2016/07/01 - 2019/06/30 ERGODiC - Formal methods for the analysis of modular gEnetic ReGulatOry network DynamiCs
PTDC/EEI-CTP/2914/2014
Investigador responsável
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2014 - 2016 DATASTORM - Tratamento de Dados em Larga-escala em Ambientes Nuvem
EXCL/EEI-ESS/0257/2012
Investigador
Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2008/01/01 - 2010/12/31 Dyablo: Modelos para o Comportamento Dinâmico de Redes Biológicas
PTDC/EIA/71587/2006
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2006/01/02 - 2008/01/01 Elucidação das complexas redes de regulação que actuam na levedura sujeita a drogas/stresse químico: abordagens de expressão genómica e de bioinformática
PDCT/BIO/56838/2004
Bolseiro de Doutoramento
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
2005/01/01 - 2007/12/31 DBYeast: Infraestruturas e algoritmos para análise e identificação de redes de regulação genética
POSC/EIA/57398/2004
Bolseiro de Mestrado
Universidade de Lisboa Instituto Superior Técnico, Portugal

Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa, Portugal
Fundação para a Ciência e a Tecnologia
Concluído
Distinções

Prémio

2022 Prémios Científicos ULisboa/CGD - Menção Honrosa
Universidade de Lisboa, Portugal
2021 Prémios Científicos ULisboa/CGD - Menção Honrosa
Universidade de Lisboa, Portugal
2013 Investigador FCT 2013 - Starting grant
Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal